DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4546 Identity:1542/4546 - (33%)
Similarity:2335/4546 - (51%) Gaps:705/4546 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    20 DKLRRKRTLH------------LPRVSQAQKKGEKRQLNDCPFYNLTYGFDQLPLDPVKEFLQEK 72
            :.|:||:.|.            |||.|..::.....:.:..|.|...   |:      :|.::..
  Rat   136 EALKRKQVLRPSADVFSLSPSKLPRTSIGRRGLFGMRSSTYPKYTFN---DR------EEVVKAN 191

  Fly    73 I-SHMQTDKIVGHCNREFDFHRYDLDNVKDEYDECDDDSLQELQLEDIIMPEQFEMLRDAKDHLY 136
            | ..:|..||| |.|....| .|.:..|.....|.|..:|:.:..|:|...:.:.:.:||..|::
  Rat   192 IRDPLQIIKIV-HENEHLGF-LYMIPAVPKSSIEYDTYNLKVVSYENINKNDYYTISKDAVTHVF 254

  Fly   137 NFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSEQE-IYEMTSHLLEIY-CNRRVRIFYPGCGTSSSLWTNQLRR 199
            |.|.    ::...::|       ||| :|......:.|: ..|:.:.|        |:|...:|.
  Rat   255 NDDI----EYIETERW-------EQEYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAF--------SVWRKNVRS 300

  Fly   200 QH--GSPSEL------IGAYRTPSARHMRVNNM------RGPPKKEKFTAGDHYAFRTPQECRNE 250
            :.  |....|      :..|..|:.  :::|:|      .|....|||.......|:..|     
  Rat   301 KKITGCRKALRKNLFIVNPYLRPAL--LKINDMCYQLSFMGLCYIEKFHTYTLQEFKAAQ----- 358

  Fly   251 LMRVGKIIDEL------IEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDPPSCKDNTNRILRSAGILVGKKKNCYV 309
            ::||.::.:.|      .:.|::                .||:    ..||:||.:   ..:|.|
  Rat   359 VVRVQEVTERLEYFRFEAKDVVR----------------KSCR----FALRAAGFI---PDDCEV 400

  Fly   310 GKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEATHFPYMQPLQPVD-PDDQKIKMLAKYRVELARAEKL-FTL 372
                      .|:|::.    ::....|        :| |.|     |..|    ..:||: :|.
  Rat   401 ----------ETHEDYF----KINIASF--------IDAPSD-----LPTY----GESEKMTYTE 434

  Fly   373 KIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEVILMD 437
            :..||:.|:..:                .|.|:|                              |
  Rat   435 QASKRHHCMRLT----------------CFIRLN------------------------------D 453

  Fly   438 YLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQLEREPPEFPILTIS 502
            ||      ::..|.:|.:            ....|.||| ||..::|.                 
  Rat   454 YL------IQNTLHVLTV------------NTASSLLNY-LSDKLKRT----------------- 482

  Fly   503 PPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDL--VVVDLGQLLLAQRPLDADTVQV 565
                                    |:...:.: |  :.||.  |:...|..::.::..|...:.:
  Rat   483 ------------------------PSADVIQK-W--ITEDKPEVIEKKGAPMMEKQEEDESLIPM 520

  Fly   566 FIEKSCADVRDLL----LNDWLPRCADLMNEMRGT---WKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMS 623
            |:.:....|:.||    |.|:|...:.::|....|   ..:|||.|                   
  Rat   521 FLTELILTVQSLLFEPSLEDFLDGISGIINHFENTVLSVPNLVPDS------------------- 566

  Fly   624 RHLNSLISKSINYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGV 688
             :.|:..|..||                         |::                |....||| 
  Rat   567 -YFNAFTSPFIN-------------------------KKV----------------EEKTCGPG- 588

  Fly   689 RPASNIYVYDEDDADPFQQPQVNQFVENVPDIDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQELPRIFTEHFKS 753
             |:.:. |:::|          ..|:..:..|.:......| |.:||...:  |..:||.:..:|
  Rat   589 -PSLSA-VFEDD----------RNFLTIIQQIKETIHSAFD-SARLYAATF--EKFQIFFKENES 638

  Fly   754 --ILAVGYEIPRLEFVMSGGEPETKGFLHFIDEDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYK 816
              :.|:..|.|.:||..|..|...|        .|.|                   .|.|||...
  Rat   639 LDLEALKEEEPDVEFFSSQLEKYHK--------QHKD-------------------SVALKPTRN 676

  Fly   817 YYFGLF--------QKLILPMVQKVWTEN-NLPELGAVQELLKKLQAV----SDTTYYLRDFIPL 868
              .||.        :|||...::.:...| .||.|..     ||:.|:    .|..|.| :|:|.
  Rat   677 --VGLLLIDTKQLKEKLIPSPLRCLEVLNLMLPRLSK-----KKVDAIISEAQDAEYKL-EFVPT 733

  Fly   869 -------NLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIIDFYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEET 926
                   :|..||....::..   :.|..:.::..||.:   |...:....|:.::.|..:    
  Rat   734 TTIEYVNSLVFLDEIQERIET---LEEEGNTVVQMYKLI---EQYQVLTPPEDFAVFATMK---- 788

  Fly   927 PEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDL 991
            |.:.|::|.|:.....|..:||.          |.|   :|..|...||:       |:.||   
  Rat   789 PSITAVRNAIDKSVGDRESSIKQ----------FCL---HLGRDLEDLNN-------EVNEV--- 830

  Fly   992 SAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKRTMDGFRIREIRDVLTLEELKERVDTV--DLLFT 1054
                                    |||||:.:.:|            :....|::.|:  ||. :
  Rat   831 ------------------------KLLAQDPQILD------------ISADPEKIKTMLSDLQ-S 858

  Fly  1055 TIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAEIIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLN 1119
            .:::|.:.|....:.:...:::||.|..|.|:..::...:.||.:..|::|....|:..:|:||:
  Rat   859 VLDDLQKRAFQYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRLKQLLWDSLSEWDKLQQEWLKSKFDCLD 923

  Fly  1120 ADGVREQVENMHKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQI 1184
            .:.:..||....|.:.:|.:.|..|.|    ..|::.|:|:.:..|||::.:....|:.|||..|
  Rat   924 PEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSV----VPQLKQKVERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAI 984

  Fly  1185 SKIL-GRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQ 1248
            .:.: ...|:.::..||:.:.::.:.....::::|:..|..|..|...|:.::..|:...|.:|.
  Rat   985 EQTVDALLVDIEIPLTLERLSELHVFDFAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEFVILP 1049

  Fly  1249 YRDS-DTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQI 1312
            :||| |..||...||||.||||..:....:..|.::..|.::.|||:.:|.|....::.|...|.
  Rat  1050 HRDSKDVFILGGTDDIQVLLDDSTINVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQR 1114

  Fly  1313 TWMYLEPIFSSEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDL 1377
            .|:|||.||::.||.||:|.|.:.|..|||.|::||:...:..:.:.|...|.:||.|......|
  Rat  1115 NWLYLESIFNAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNALL 1179

  Fly  1378 ETVTKGLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF------- 1435
            :.:.|.|..|||.||:.|.||:|||||||||||::|::|..|||||||||:.|..|.|       
  Rat  1180 DQIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFALMPPTE 1244

  Fly  1436 ------DDNME------IVEMVSDEEERVALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMRE 1488
                  |...|      |:.|:|.|.|||.|.:.:.   |.|.||.||.:||..|..|::...:.
  Rat  1245 GKIPGIDTEPEKVFTNDILAMLSPEGERVGLGKGLK---ARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRRLCKA 1306

  Fly  1489 AWEDYAMVERISWVVS-WPGQVVQGISCMAWTYEVEEAIETKE--LPAY--LEKSNLQ-IADLVQ 1547
            |..||....|..||:: .|.||:..||.:.|..::.|::|.::  |.|.  .|:.|.: :..|..
  Rat  1307 AIADYQGKLRTEWVIAGHPSQVILTISQIMWCRDLTESLECEDNHLEALEKFEQVNFERLNALAA 1371

  Fly  1548 LVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVS 1612
            :||..|....|..:.|||.:|||.||:|..|...::.:.:.|||..||||||.|:..|    ||:
  Rat  1372 IVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWDVDLDN----CVA 1432

  Fly  1613 -MVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVA 1676
             |.::...|..||||..||||:||||||||..|||||:|.|||||.||||||||||.||||||:|
  Rat  1433 RMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALA 1497

  Fly  1677 KKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKF 1741
            .:|||||||||||||.:|:||.||||||||.||||||||::|||||:|||::||:.|...|:.:|
  Rat  1498 IQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRNAKAAKLSRF 1562

  Fly  1742 FFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARN 1806
            .||...:||..||:.|||||||||||||||||||.|||.:|||||:||:|.|:.|||.||:.::.
  Rat  1563 MFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPMAMMVPNYALIAEVILYSEGFESSKI 1627

  Fly  1807 LSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFL 1871
            |::|:.|.|||||||||.|.|||:|||||||||:.:.||:|...||.|..:::||:.|.||||||
  Rat  1628 LARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRENPDLSEDVVLIRALRDSNLPKFL 1692

  Fly  1872 EQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRGDILKWLHINLAD----RNLQATPWYLEKILQIYEMLLVR 1932
            ..|..||.||..||||||::|....|    .||..:.|    :|||.....::|::|:||.:|||
  Rat  1693 TDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYG----ILHSTIVDVMISQNLQPEICMVKKVIQLYETMLVR 1753

  Fly  1933 HGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHE 1997
            ||:|:||.:.|||||.|||||:||.|:...........||...::|||:||||:|||..:.|:.|
  Rat  1754 HGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGNPFYQPVKTFVLNPKSITMGELYGEVNNVTLE 1818

  Fly  1998 WYDGVLAKTFREQVQGPKGERAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMM 2062
            |.||::|.:.|..|.....:..|::.||||||:||||:||||||||.|||.:.|.:::|..::|:
  Rat  1819 WKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALWIENMNTVLDDNKMLCLANSERIKLTPQVHML 1883

  Fly  2063 FEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGWRALHKSFINVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWL---- 2123
            ||..||:.|||||||||||::::|.:|.|....|::::.|..|         |.|::.|:|    
  Rat  1884 FEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMSTLSKK---------LSEEIREYLLNLF 1939

  Fly  2124 ---VPAALEFL-PQCKQMLELSPIYQYQTFSRFFLHFLEKHKQFNQAWFQQM---------FLFC 2175
               |...|.|: .:|.|.:....|.:..|.. ..|..|...|..|....:||         |:||
  Rat  1940 NRYVDDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTLC-CLLESLLLSKDGNILSLEQMKLNTVVCQTFVFC 2003

  Fly  2176 FAWAYCSALTGQGQKTFDALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFDEAENWWT 2240
            :.|:....||.....:||..:| ..:..|.:...|     :.|.::.   :.:|:.....:.|  
  Rat  2004 YLWSLGGNLTENHWDSFDTFIR-TQFDDNPDARLP-----SSGDLWS---IHVDFDTKRLDPW-- 2057

  Fly  2241 WQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNL 2305
                 :....|..:.......|::|||.:|....|..|..::..:::|..|.||.|||.|....|
  Rat  2058 -----ERIIPTFKYSREVPFFEMLVPTADTVRYGYLMEKLLAVRHSVLFTGTTGVGKSVIAKGLL 2117

  Fly  2306 LAMPKFANLVNV-INFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYG 2369
            ..:.:.|..|.| :||||:||:...|:.|.|||:|:||.:.|....|:..:|.||:.||..|.||
  Rat  2118 NRIQESAGYVPVYLNFSAQTSSARTQEIIESKLERKRKNILGAPGNKQVVIFVDDLNMPRLDRYG 2182

  Fly  2370 SQAPLELLRTWLDHG--------YWSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVV 2426
            ||.|:||||.:.|.|        :|.::.|.|.:.      .||... ||.|.:.||..||..::
  Rat  2183 SQPPIELLRQYQDFGGFYDRNKLFWKEIQDVTIVS------ACAPPG-GGRNPVTPRFIRHFSML 2240

  Fly  2427 AVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFSKGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSL 2491
            .:....:.::.:||..|.: .|...:.|.|...|..:.||.|.:|.......|||||||||.|:|
  Rat  2241 CLPMPSEHSLKQIFQAILN-GFLADFTEAVKQTSSNIVEAAVEIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNL 2304

  Fly  2492 RDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPL 2556
            ||:::..|||:...|..:.:..::.||:.||..|||:|||::.:|:....|:..:....:     
  Rat  2305 RDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLFCHECQRVFHDRLINNEDKHYFHVILTEMANKH----- 2364

  Fly  2557 EQAFGERIEPGEKLTDNDLRNLFYGNYME--PDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSST 2619
               ||..|:....|:    :.:.:|::::  .|...:.||:....||:|.:::.||.:||..:..
  Rat  2365 ---FGIAIDLEYFLS----KPIIFGDFIKFGADKADRIYDDLPDIEKIENVLQDYLDDYNLTNPK 2422

  Fly  2620 PMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTIT 2684
            .:.||.|:.|||||||::|:::..|||.|:||:||:|::|..||||:|...:.:.:::|:.|...
  Rat  2423 EVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHICGYKCLQIELSRGYNYD 2487

  Fly  2685 DWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMAN 2749
            .:.:||:|:...|.....:.||||:|.|...|.::||||.|||:|::|||::.::...::.....
  Rat  2488 SFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEKDELEQVLAATRP 2552

  Fly  2750 VAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPE 2814
            .||::| |.:....||:.|:|.|:|::|||.|..||:|::|:.|.|::|||:|||||||::.||.
  Rat  2553 KAKEVG-ISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPR 2616

  Fly  2815 EALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMY 2879
            |||..|...|.|                    ..|...||:        :|:..|.     || .
  Rat  2617 EALLSVSKSFFS--------------------VVDTGNEEL--------KEKLSLM-----CV-N 2647

  Fly  2880 FHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQ 2944
            .|.||...:::.|.||.||.|.||::||||:..:.|..|.|..::...|||.|.||.||......
  Rat  2648 VHLSVSHMADRYYSELRRRYYTTPTSYLELINLYLTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNIL 2712

  Fly  2945 VGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCE 3009
            |.:|:.:|..|:|.|...|::.:.:|..:..:...|::.:.||..|||.|...|...|||.||.:
  Rat  2713 VDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEALMEKLVVDQESADQVRNVVQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQ 2777

  Fly  3010 TDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVE 3074
            .||.||:||:|||.:||::|..|||..::....||..|...|||:.::...|||           
  Rat  2778 RDLEEALPALEAANKALDSLDKADISEIRVFTKPPDLVMTVMEAISILLNAKPD----------- 2831

  Fly  3075 DYWGPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVR 3139
              |..:.::|.|..||..|..:||:||.|.|:.:: ::||.:.||||||::..|.||:.:|.|||
  Rat  2832 --WPTAKQLLGDSNFLRRLLEYDKENIKPQILSKL-QRYINNPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVR 2893

  Fly  3140 AMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLE 3204
            |||:|.:|.:.|.||:..|..|:.||...:..|..|:|.|:.:.::::.|.:.:.:...||:.|.
  Rat  2894 AMDLYSRVVKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLKQVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLA 2958

  Fly  3205 DEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVN 3269
            ..:...:.:|.||.||...||.|:.||.|:.:...|.|:||||:|.:|..|.||.|.||.:||..
  Rat  2959 KTMALTKARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANIVGNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQL 3023

  Fly  3270 ILDDWNALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDP 3334
            :::.|...|....||...:|||..|||.|..||.|:..|||.|..|.||||:||...|:.|:|||
  Rat  3024 LIECWIDSCLALDIPIDPSFSLINTLGDPYEIRQWNADGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDP 3088

  Fly  3335 QVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKH 3399
            |.|||:||:|.|..:.|||||.:|.|::::||.:|..|.|||:|.:.|.||..|.|||.|.....
  Rat  3089 QDQANRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLGLPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMS 3153

  Fly  3400 KGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHER 3464
            .|.|.|:.||..|:|:.:||.|:||.:.||.|.|||.:.||::||.:|:.||.:|||:.||..|:
  Rat  3154 GGRLLIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEK 3218

  Fly  3465 PDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVI 3529
            |:|:.::.|||:....:::.|.:||.|||::|.|||||:|::|..|:.|..|||.|..|:.:...
  Rat  3219 PELEGQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGNILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKE 3283

  Fly  3530 AVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSE 3594
            |.:||:.|:.||::|.||:...::::|.|:.|:.:||||||||.:|..||..||..:.|||.|.|
  Rat  3284 AESTELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPMYQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQE 3348

  Fly  3595 RLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGY-KTIPP 3658
            ||..|......:.||||.|.|||:.||:.|.::|:.|:..|.::.:|...|||.|..|. |..||
  Rat  3349 RLAILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIMRQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPP 3413

  Fly  3659 NPLGAWLPDKSWASVCKAAD----LEGLKNLPQM---------METY--SDEWHNFYDASNPDQL 3708
            .|...|||.:.|.|.|...:    .|||.....:         .|||  ...|..:....:.::.
  Rat  3414 KPEAPWLPIQMWFSCCDLEEWFPIFEGLTRHILLHPISISLGSFETYINPQSWEGYPKQRHEEEK 3478

  Fly  3709 QLPAPH---NTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSPKIP 3770
            :    |   :..:..:.||::|..:.:|:|.|:..|:..||.:.|:|.||.|||..:.|.|...|
  Rat  3479 E----HVWGSNFSSFHKLILVKCCKEEKVVFALTDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSSSTP 3539

  Fly  3771 LVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNMYDKLKTISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAIS 3835
            |||:||.|||||.:...||::....:::::|||||||||.|||||.:|.:.|.||.|||||:|:|
  Rat  3540 LVFILSTGSDPMGAFQRFARESGYAERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQNCHLAVS 3604

  Fly  3836 WMGDLERICNDTTLTD---GANHDYRLWCTSYPSAVFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHRSFT 3897
            ||..:|.:..  |.||   .....:||:.:|.|.:.|||:|||||||:|||||||||||:.|:||
  Rat  3605 WMLAMEELIK--TFTDPNQSIKDTFRLFLSSMPCSTFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFT 3667

  Fly  3898 SDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLL 3962
            .   |...||....|     ...|.:.:|.:.||||::|||::||||||||.||||:||.:.:||
  Rat  3668 E---MTPSFFEENIL-----GMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALL 3724

  Fly  3963 QLKMFINQSQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQSGTY 4027
            .|.::.::.: ||:...:|:|||..|||||||..|:|.:.::|...::|.|: ||.|..|:||.|
  Rat  3725 NLNLYCHEGK-IPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPETL-EDEYTYSESGIY 3787

  Fly  4028 RVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQTDLMASVKASSS 4092
            ..||:.:.....:|:...||...||::|:||||::....||||.||:.:|..|.      ::||.
  Rat  3788 FAPLADSLQEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLVFQYKETNTLITTILEVQP------RSSSG 3846

  Fly  4093 GGAKEDPAIA--ICKQVLKQLPEEFNIDEVSKTY----PVIYTNSMNTVLRQELIRFNRLLSYIR 4151
            |..|.:..|.  :...:..::||...::..|:|.    |....||:.|||.||:.|||.||..|.
  Rat  3847 GEGKSNDEIVQELVASIRTRVPESLQMEGASETLFVKDPQGRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIH 3911

  Fly  4152 KSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWI 4216
            .||..:.||:.|.:.|..|:|:.:.|.:..::|:.|...:|||||||||:|.||:.|.||...|:
  Rat  3912 ISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLWL 3976

  Fly  4217 DNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQID---------------MILIEFAV-TKFEV 4265
            ..|:|..:|||||:|.|.|:||.|||::||....||               .::||.|. .:|..
  Rat  3977 KRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHARKYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGT 4041

  Fly  4266 QVP-----GTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLRPVLKALEDLPRST 4325
            ::|     .||:.|..:.|:|::.:||:.|...::::....:...|||::..|           .
  Rat  4042 ELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMIIEDALPGQMNPMLPVVHFEP-----------Q 4095

  Fly  4326 AGGEP-ETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTACLCQLDD 4385
            ...|| :|:|..|:|||..|.|.|||||||||||:.:.|...|...:||.:|:|.||||.:
  Rat  4096 QNYEPIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRPSDYWIAKGSALLCQLSE 4156

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1086..1489 CDD:285579 140/423 (33%)
P-loop_NTPase 1620..1847 CDD:304359 159/226 (70%)
P-loop_NTPase 1934..2079 CDD:304359 73/144 (51%)
P-loop_NTPase 2264..2522 CDD:304359 93/266 (35%)
P-loop_NTPase 2613..2916 CDD:304359 112/302 (37%)
MT 2929..3272 CDD:289543 126/342 (37%)
AAA_9 3304..3519 CDD:289547 102/214 (48%)
Dynein_heavy 3659..4373 CDD:281078 289/762 (38%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:400618 142/426 (33%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 1120/2767 (40%)
AAA_6 1441..1767 CDD:403853 205/329 (62%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:408026 121/341 (35%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56321
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000321
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
54.820

Return to query results.
Submit another query.