DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dync2h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063122173.1 Gene:Dync2h1 / 65209 RGDID:71042 Length:4313 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4871 Identity:1311/4871 - (26%)
Similarity:2198/4871 - (45%) Gaps:890/4871 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    57 NQDTIRKFLSDPQVQALYVQRNCIKEDDSEQPAEGEDEKEQVTYQISNDVHFTNSRMASLACIKR 121
            |...:..||.|.....|.|||:                  ......||.:.|.:::...|...|.
  Rat    35 NCPEVNNFLDDGNQMLLRVQRS------------------DAGLAFSNTIDFDDTKDKVLVFFKL 81

  Fly   122 GLVVEADKSIHSQLRLINFSDGSPYETLHAFISKSLAPYFKSYVKESGRADRDGDKMAPSVEKKL 186
            ...|..|.::|:.: |::....||..:|:..:.:..||......:.|...|       |.::..|
  Rat    82 RPEVITDGNLHTNI-LVSSMLESPINSLYQAVRQVFAPMLLKDQEWSRNFD-------PKLQNLL 138

  Fly   187 AELEMGLLHLQQNIDIPEITLTAHQTVNNVIRKCAEENRKAKVADFGDKVEDSSFLNLLQNGVNR 251
            :|||.||                    ..|:||                 .|::...|       
  Rat   139 SELEAGL--------------------GVVLRK-----------------SDTNLPKL------- 159

  Fly   252 WIAEIKKVTKLNRDPGSG--TALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGKRFHATV 314
                     ||..|...|  |...|..||:.        |..|.|.:                 :
  Rat   160 ---------KLKEDDTRGILTPSDEFQFWIE--------QAHRGSKQ-----------------I 190

  Fly   315 SFDTDTGLKQALATVADYNPLMKDFPINDLLSATE----LEKIRPAVQQIFAHLRKVRNTKYPIQ 375
            |.:..:..|:...|:|      ::|...|.||..|    :|..|..|..::   |:..:..||..
  Rat   191 SKERASYFKELFETIA------REFYNLDSLSLLEVVDLVETTRDVVDDVW---RQTEHDHYPES 246

  Fly   376 RCLKLIEAISRDLSQQLLKVLGTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSCWDDEYDKLQGLLRDIVKK 440
            |.|.|::.|.....:.:.|.||:.:|...|:...:..:.....|...|......|.|        
  Rat   247 RMLHLLDVIGGSFGRFVQKKLGSLKLWEDPYYLVKENLKAGISICEQWVIVCSHLTG-------- 303

  Fly   441 KRDEHLKMVWRVSPAH------------KKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGD 493
                   .||:....|            .:|..|:|.:...|..||:|.                
  Rat   304 -------QVWQRYVPHPWKSEKYFPETLDRLGKRLEEVLAIRTIHEKLL---------------- 345

  Fly   494 DGNVVETKQPYSLDAADANAIEEVNLAYENVKEVDCLDITKEGSEAWEAAVKRYEEKIDRVETRI 558
                      |.|.|:: ..|..::..:|....|:.:.........|:|||.:||:.|...|.:|
  Rat   346 ----------YFLPASE-ERIVCLSRVFEPFTGVNPVQYNPYTEPLWKAAVSQYEKIIAPAEQKI 399

  Fly   559 TAHLRDQLGTAKNA-NEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDIEALHEKFKVQ-- 620
            ...|::.:...::: .::.:.|.::..|..||.|...:...:..|:.|:.|..:.....|:.:  
  Rat   400 AGKLKNYISEIQDSPQQLLQAFLKYKELVKRPTISKELMLERETLLARLGDSAKDFRLDFENRCR 464

  Fly   621 -YPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLG--KGWET-HIEGQKLKADGD 681
             .|...|..||. ::|..|..:|:|.||::.::...:|..|.:|.  .|:.: |...:.|.   |
  Rat   465 GIPGDASGPLSG-KNLSEVVNNIVWVRQLELKVDDTIKIAEALLSDLSGFRSFHRSAEDLL---D 525

  Fly   682 SFRAKLSISDVFHEWARKVQERNFGSTGRIFTIESTRSRIGR--GNVLRLRVNFLPEIITLAKEV 744
            .|  ||...:.|.:|:|:||.....|...: .||: .|||..  .|...|:|::...::.|.:||
  Rat   526 QF--KLYEQEQFDDWSREVQSGLSDSRSGL-CIEA-NSRIMELDPNDGALKVHYSDRLVILLREV 586

  Fly   745 RNIKNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERTLEKL--NNRSLAQNSVFKIEDRAS 807
            |.:..|||.:|..|...|:.|.:....||.|.:....|....:::  :.|.:...|....|    
  Rat   587 RQLSALGFVIPAKIQQVANVAQKFCKQAIILKQVAHFYNSIDQQMIQSQRPMMLQSALAFE---- 647

  Fly   808 IVPLVAGLRKDVLNLVSEGIG----LIWESYK-LDPYVIRLSECV--------------TQFQEK 853
                      .::.....|.|    :.|::.| |:.|:.:|....              |.|.||
  Rat   648 ----------QIIKNSKAGSGGKSQITWDNPKELEGYIQKLQNAAERLATENRRLRKWHTTFCEK 702

  Fly   854 V-----DDLLVVEEQLDVDVRSLET--CPYSAATFVEILSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRLD 911
            |     .|||..:::....::.|.|  ...:|..|                 |.|::..|....:
  Rat   703 VVILMNIDLLRQQQRWKDGLQELRTGLASVAAQGF-----------------QPSDMRAWRQHWN 750

  Fly   912 EEVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQNAVHEIR------ 970
            .::.|.|..:.|.|:    |||..|..|::..:        |:| .|..|.:....|||      
  Rat   751 HQLYKALEHQYQMGL----EALNENLPEINVDL--------TYK-QGRLQFRPPFEEIRAKYYRE 802

  Fly   971 ------ITNQQMYLYPSIEEARFQIM--------------------------QQFFAWQAIVTSQ 1003
                  |.||...:..:.:|:.|.:|                          .|...|  :|..|
  Rat   803 MKRFIGIPNQFKGVGEAGDESIFSVMIDRNASGFLTIYSKAEDLFRRLSAVLHQHKEW--VVIGQ 865

  Fly  1004 VRLQSTRYQVGLEKHVSQTY---RNLLTKLPEGKILENAYGAIEQ-----KVSEVRNYVDEWLRY 1060
            |.:::.     :||::|..:   :|......:||.:|....|::.     ..|.|:..:|:.:  
  Rat   866 VDMEAL-----VEKNLSTVHDWEKNFKALKIKGKEVERLPSAVKVDCLNINCSPVKTVIDDLI-- 923

  Fly  1061 QSLWDLQADMLYGRLGEDVNLWIKCLNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAK-VQAKVTLKYD 1124
            |.|:||                                         :::...| :|..:     
  Rat   924 QKLFDL-----------------------------------------LVLSLKKSIQTHI----- 942

  Fly  1125 SWHKEALGKFGTLLGTEMTSFHSKVSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQ 1189
              |             |:.:|.::..|..|.:. ||:|....::    :.| .:|:      |::
  Rat   943 --H-------------EIDTFVTEAMKVLTVIP-QSVEEIGDTN----LQY-SNLQ------DRR 980

  Fly  1190 VEV---FREAQ---RILERQRFQFPNTWLHVDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVA 1248
            .|:   |:||:   |:|.........|   |.|:..:|..|..:::.....|:.|:..::..:.:
  Rat   981 PEILPLFQEAEDKNRLLRTVAGGGVET---VSNLRAKWDKFELMMESHQLMIKDQIEVMKGNVKS 1042

  Fly  1249 EDKAVETRTVDFLNDWEKTKP------TGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEAL 1307
            ..:........|...|::.||      ||.:...|.:.:.::..:.::..|:..|..:|......
  Rat  1043 RLQIYYQELDKFKARWDQLKPGDDIIETGQQNTMDQSAKSIKEKKIEFDDLEVIRKKLVDDCHHF 1107

  Fly  1308 ELQESAVPNNSAERMNVALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETREKPWLSVQPRKLRQQLEAMMAQ 1372
            .|:|   ||.|. ..::: ::::....:|:...:....:.|..::.|::     .|.::......
  Rat  1108 GLEE---PNFSL-AYSIS-KDIESCAQIWALYEEFQQGLQEMAKEDWIT-----YRTKIYIFEEF 1162

  Fly  1373 LKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVEL----KSDALKERHWKQLTKQLRV--NWVLSD 1431
            |.....|||..|.:..:...:||.:....:|:.:    :.:.|...||..|.:.|.:  ...|..
  Rat  1163 LINWHERLRKVEEHSVMTVKLQSEVDRYKIIIPILKYVRGEHLSPDHWLDLFRLLGLPRGTSLEK 1227

  Fly  1432 LSLG---QVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESW-QNYELDLINY---QNK-CR 1488
            |..|   :|.|..::|...: ||:...||||:.:.|.|::: :.| ......||:|   ||: .:
  Rat  1228 LLFGDLLRVADTIVEKASDL-KDLNSRAQGEVTIREALREL-DLWGVGAVFSLIDYEDSQNRTIK 1290

  Fly  1489 IIRGWDDLFNKVKEHINSVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGI 1553
            :|:.|.|:.|:|.::...:.::|.|||||.||::...||.||.:::........:||:|||||.|
  Rat  1291 LIKDWKDIVNQVGDNRCLLQSLKDSPYYKGFEDKVSIWERKLAQLDEYLQNLNHIQRKWVYLEPI 1355

  Fly  1554 FSGSADIKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKAL 1618
            |...|     ||.|.:||..:..:|..:|..:.|..:|..:.....::.:|..:.|.|.:.||:|
  Rat  1356 FGRGA-----LPKEQTRFNKVDEDFRSIMMDIRKDSRVTTLTTHAGIRNTLLTILDQLQRCQKSL 1415

  Fly  1619 GEYLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEENNVILGISSRE 1683
            .|:||.:|::||||||:||:|||||:|.|.|.:.:|.|.||:|||:.::..:||:..|..:.|.|
  Rat  1416 NEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQSTNPSVIQSHLKKLFAGINSVCFDEESKHITAMRSLE 1480

  Fly  1684 GEEVHFMNPVSTVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAYMEWCDKYQ 1748
            ||.|.|.:.|....:  :..||:.:..:|:.||..||.:.| ...:...|.|||..       :.
  Rat  1481 GEVVPFKSKVLLSNN--VEAWLNDLALEMKQTLKQLLKECV-TAGRSSQGAIDPSL-------FP 1535

  Fly  1749 AQIVVLAAQILWSEDVESALQQAS----ENNQSKPMQRVL---------GNVESTLNVLADSVLQ 1800
            :||:.||.||.::||||.|::..|    |...:..::|..         ||.||.:..|      
  Rat  1536 SQILCLAEQIKFTEDVEDAIRDHSLHQIEAQLAAKLERYTSVDTSSEDPGNSESGILEL------ 1594

  Fly  1801 EQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMAN 1865
                    ||:.||.:.:|...:.::|....|.:...:.|..::|||.....|..:|     |.:
  Rat  1595 --------KLKALILDIIHNIDIVKQLNQAQVHTTDDWAWKKQVRFYMKSDHTCYVQ-----MVD 1646

  Fly  1866 ARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVL 1930
            :...|.:||.|...:||.|||||:||||:|||::..|||:|:|||||||||||||||..|||.||
  Rat  1647 SELQYTYEYQGNAPKLVYTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGKTESVKALGGLLGRQVL 1711

  Fly  1931 VFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESI 1995
            ||||||..|.::||||||||.:.||||||||||||||.:|||.|.||||||:|||     |..|:
  Rat  1712 VFNCDEGIDVKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEEAVLSAVSMQIQTIQDALK-----NHRSV 1771

  Fly  1996 TVELVGKQVRVSPDMAIFITMNP---GYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGF 2057
             .||:||:|.::.:..|||||||   ||.||..||||||:|||.:||:.||..|||||:|:|:||
  Rat  1772 -CELLGKEVEINANSGIFITMNPAGKGYGGRQKLPDNLKQLFRPVAMSRPDNDLIAEVILYSEGF 1835

  Fly  2058 RSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENID 2122
            :.|::|..|:|..|.|..|.|:.|.|||:||||||:||..:||:.|        |:|:.|.:   
  Rat  1836 KDAKELGRKLVAIFNLSRELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGSGNLLR--------QLKKSGTK--- 1889

  Fly  2123 EASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQE 2187
                 :::.|..|::|::....:.|....|.....:|:.||||.:.:...|...|...:::|.:|
  Rat  1890 -----QDVNENHIVVQALRLNTMSKFTFADCTRFDALIKDVFPGIDFKEVEYNELSSALKQVFEE 1949

  Fly  2188 -DYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALER 2251
             :|.|.                ...:.|.|:||:......|:::|||||:||||.|:.|..||.:
  Rat  1950 ANYEVI----------------PNQMKKALELYEQLRQRTGVVIVGPSGAGKSTLWRMLRAALCK 1998

  Fly  2252 FEGVEGVAHVIDPKAISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVD 2316
            . |.....:.::|||:.:..|.|.:|.:||||:||:.|:..|::   ||...:...|||.|||:|
  Rat  1999 I-GKVVKQYTMNPKAMPRHQLLGHIDMDTREWSDGVLTNSARQV---VREPQDVSSWIICDGDID 2059

  Fly  2317 PEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEM 2381
            |||:|:||||||||:|||:|:|||:...|||..:||..||..|:.||:||.||::.|::......
  Rat  2060 PEWIESLNSVLDDNRLLTMPSGERIQFGPNVNFVFETHDLSCASPATISRMGMIFLSDEETDLNS 2124

  Fly  2382 IFENYLSRLRSIPLE--DGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQ---VQRDIALLLLPFFSADGIVV 2441
            :.:::   ||:.|:|  ...|:::|         :..|.:||   .|.|..:..    |..|.|:
  Rat  2125 LIKSW---LRNQPVEYRSNLENWIG---------DYFSKALQWVLKQNDYVVET----SLVGTVM 2173

  Fly  2442 RTLEYAMDQEHIMDFTRLRALSSLFSMLNQAARNVLT---FN---AQHPD--------FPCSADQ 2492
            ..|.:....::...|. :..:..|...||..:|...|   ||   ...||        |.|...|
  Rat  2174 NGLSHLHGCKYHDQFI-INLIRGLGGNLNMKSRLEFTKEVFNWARETPPDSHRPMDTYFDCDRGQ 2237

  Fly  2493 LEHYI---PKALVYSVLWSFAGDAKLKVRIDLGDFVRSVTTVPLPGAAGAPIIDYEVNMSGDWVP 2554
            |..|:   |::|.                  ..||                       .||..:|
  Rat  2238 LASYVLKKPESLT------------------ADDF-----------------------SSGHSLP 2261

  Fly  2555 WSNKVPVIEVETHKVASPDIVVPTLDTVRHESLLYTWLAEH--KPLVLCGPPGSGKTMTLFSALR 2617
                                |:.|.|..|.......||:..  :|.:|.||.|.||.|.|..|..
  Rat  2262 --------------------VIQTPDMQRGLDYFKPWLSSETKQPFILVGPEGCGKGMLLRYAFS 2306

  Fly  2618 ALPDMEVVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYG 2682
            .|...|:..::.|:.||...||:.....|....|..|.|..|....: |||:..:||||.:|.:|
  Rat  2307 QLRSTEIATIHCSAQTTSRHLLQKLSQTCMVISTNTGRVYRPKDCER-LVLYLKDINLPKLDKWG 2370

  Fly  2683 TQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQAWVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPG 2747
            |..:::||:|::.::||| ..:..||.||.||.|.:.:.....||..|:.||...|.:..||||.
  Rat  2371 TSTLVAFLQQVLTYQGFY-DENLEWVGLENIQIVASMSAGGRLGRHKLTTRFTSIVRLCAVDYPE 2434

  Fly  2748 ETSLKQIYGTFSRAMLRLMPALRGYA--------EPLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQPHYVYSPR 2804
            ...|:.|||.:..|:|.  ..|:.::        ..|..:||:.|...:.:||.|...||.::|.
  Rat  2435 REQLQTIYGAYLEAVLH--KNLKNHSIWGSSSKIYLLAGSMVQVYEQVRAKFTVDDYSHYFFTPC 2497

  Fly  2805 EMTRWVRGIC-------EAIRPLDSLPVEGLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERR----------- 2851
            .:|:||.|:.       .:..|||.     ::.:.|:||.|||:|::|...|..           
  Rat  2498 ILTQWVLGLFRYDLEGGSSNHPLDY-----VLEIVAYEARRLFRDKIVGVKELHLFDNILTSVLQ 2557

  Fly  2852 --WTNENIDLV--------GQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLSKDYMPVNREELREYVHARLKV 2906
              |.::.:|.:        |.:|..|.........| .:...|.|    ::..:|::.:...|..
  Rat  2558 GDWGSDILDNMADSFYVTWGAQHISGAKIAPGQPLP-PHGKPLGK----LSSADLKDVIKKGLIH 2617

  Fly  2907 FYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSIFQIKVH 2971
            :..:..::.::||.|||:::.||||:...|.|.|||.|.||.|:.|::..|:.|:|..:|..|:.
  Rat  2618 YGRDNQNLDILLFQEVLEYMSRIDRVLSFPGGSLLLAGRSGVGRRTVTSLVSHMHGAVLFSPKIS 2682

  Fly  2972 NKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTTL 3036
            ..|..:.|..||:.||..:|.:.:::..:|::...:...|||.:|:||::||||||:..:|...|
  Rat  2683 RGYEPKQFRTDLKHVLHLAGIEAQQVVLLLEDYQFVHPTFLEMINSLLSSGEVPGLYTLEELEPL 2747

  Fly  3037 MTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNRCVLNWF 3101
            :...|:.|.::|..    ..::.:||.::.:|||:|..|:.:.........::|||..:|.:.|.
  Rat  2748 LLPLKDQASQDGFF----GPVFNYFTYRIQQNLHIVLIMDSANLNFIINCESNPALHKKCQVLWM 2808

  Fly  3102 GDWSDSALFQVGKEFTTRVDLE-----------KPNWHAPDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSCV 3155
            ..||||::.::.:...:..|:|           |.:...|||                  |.|.:
  Rat  2809 EGWSDSSMKKIPEMLFSEADIEEKYEKKRKDEKKKSSVDPDF------------------IKSFL 2855

  Fly  3156 YVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVE 3220
            .:|::.            :....||..|:.|:..:..:.:.||.:|.::|.||..|::|:.|...
  Rat  2856 LIHESC------------KAYGATPSRYMTFLRVYSAISSSKRKELLKRQSHLQAGVSKLNEAKA 2908

  Fly  3221 QVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQEIQIRLADQTVKIEEKRKYV 3285
            .|:|:.:....:...|:.|.:.|::.|:::....|:|.::|.:.:.::.|:|::.|||||::..:
  Rat  2909 LVDELNRKAGEQSILLRIKQDEADSALQEITVSMQDASEQKTELERLKHRIAEEVVKIEERKSKI 2973

  Fly  3286 MADLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLLGENATDWKSIRAVIM 3350
            ..:|.:|:|.|.:|:.||.:||.:.|.|:|::..||.|::..||.:..|:|...|.|.|:::.:.
  Rat  2974 DDELKEVQPLVNEAKLAVGNIRPESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGIFDTSWVSMKSFLA 3038

  Fly  3351 RENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSN-PDYNFEKVNRASMACGPMVKWAIAQIEYADML 3414
            :.. :...::.|...||..::||.::.....| ..::.:...|||.|..|:..|..|.::|:.:|
  Rat  3039 KRG-VREDIATFDARNIPKEIRESVEELLFKNKASFDPKNAKRASTAAAPLAAWVKANVQYSHVL 3102

  Fly  3415 KRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKETK----DLVEQLERSIAAYKEEYAQLISQAQAIKTDLEN 3475
            :|::||..|...||    :||...::.|    ||:..:.:.::..||::....|:|..::.::..
  Rat  3103 ERIQPLETEQSGLE----LNLKKTEDRKRKLEDLLNSVGQKVSELKEKFQSRTSEAAKLEAEVSK 3163

  Fly  3476 VQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRLNLFTTW 3540
            .|..:..:..|:..|:.|..||.:.......:::|:.....|:||||.|.....:..|.|....|
  Rat  3164 AQETIKAAEVLISQLDREHRRWNAQVAEIAEELATLPKRAQLAAAFITYLSAAPEGLRKNCLEEW 3228

  Fly  3541 SQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTENAIM------LKRFNRY-PLII 3598
            :   :||.:: :.|:.|  :|....|:|.|::..||:|||..|||::      ||.::|. |.:|
  Rat  3229 T---KAAGLE-KFDLRR--FLCTESEQLIWKSEGLPSDDLSIENALVILQIIGLKSWSRVCPFLI 3287

  Fly  3599 DPSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDVENYDPILNPVLNRELRR 3663
            |||.|||.:|........:...:..|.:|...||.|:|||..|::|:::..:|:|.|:|.|:|..
  Rat  3288 DPSSQATEWLKTHLKDSHLEVINQQDSNFITALELAVRFGKTLIIQEMDGVEPVLYPLLRRDLVA 3352

  Fly  3664 TGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNQVLKAE 3728
            .|.|.::.:||:.||.:..|.:|||||:|....|||..|.||.||||.|||.|:.|.|...::.|
  Rat  3353 QGPRYVVQIGDKIIDYNEDFRLFLSTRNPNPFIPPDAASIVTEVNFTTTRSGLRGQLLALTIQHE 3417

  Fly  3729 RPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVITTLETLKKEAYDINQKVD 3793
            :||::|:::.||:.:.:.:::|.:||:|||:.|..::|.||::..:|.:|...|..:..|...:.
  Rat  3418 KPDLEEQKTKLLQQEEDKKIQLARLEESLLETLATSQGNILENKDLIESLNQTKASSALIQDSLK 3482

  Fly  3794 ETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKMFLDIFSTVLYNNPKLEGRT 3858
            |:.|:...::.....||||:.:.|.:||.:..|::::.:|::||..||.:|...|.|....|.. 
  Rat  3483 ESYKLQISLDQERDAYLPLAESASKMYFIISDLSKINNMYRFSLASFLRLFQRALQNKQDSEST- 3546

  Fly  3859 DHSERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMCK-IHLKGTSESNLDAEFNFFLRSREGL 3922
              .:|:..:...|..:.||.:.|.:...|:|.|||...: :|.:...|:..|        :..|:
  Rat  3547 --EQRIQCLVNSLKHMVYEYICRCLFKADQLMFALHFVRGMHPEFFQENEWD--------TFTGV 3601

  Fly  3923 LANPTPVEGLSAEQIESVNRLALRLPIFRKLLEKVR---------SIPEL------------GAW 3966
                  |.|....:.:|..|:..:||.:   :::.|         |:|.|            ..:
  Rat  3602 ------VVGDMLRKADSQQRIRDQLPSW---IDQERSWAVATLKISLPGLYQTLCFEDGTLWRTY 3657

  Fly  3967 LQQSSPEQVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNAEQEL 4031
            ...|..||..|.:      |:...|...|:|::||.||||:.:|........||       .:||
  Rat  3658 YHHSMCEQEFPSI------LAKKVSLFQQVLVVQALRPDRLQSAMALFACKALG-------LKEL 3709

  Fly  4032 DFTSVVDKQLNCNT----PALLCSVPGFDASGRVDDLA-AEQNKQ-ISSIAIGSAEGFNQAERAI 4090
            ....:..|:|...|    |.|:...||.|.|..:.:|| ||::.: ...:|:|.    .||:.||
  Rat  3710 SPLPLNLKRLYKETLEIEPILIIISPGADPSQELQELANAERSSECYHQVAMGQ----GQADLAI 3770

  Fly  4091 NM---ACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSLQPHSGFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFV 4152
            .|   ..:.|.|:.|||:||...||..|||::::|||...|||:||.|::|.....||::.....
  Rat  3771 QMLKECARNGDWLCLKNLHLVVSWLPVLEKELNTLQPKESFRLWLTAEVHPNFTPILLQSSLKIT 3835

  Fly  4153 FEPPPGIRANLLRTF-STVPAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWAKKYEFNES 4216
            :|.|||::.||:||: |..|.....|....||...|.||||||..|||..::|.||.|.|||:.|
  Rat  3836 YESPPGLKKNLMRTYESWTPEQISKKDNIHRAHALFSLAWFHAACQERRNFIPQGWTKFYEFSLS 3900

  Fly  4217 DLRVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTSFLKKLFTA 4281
            |||.....:|...|.:         :.|.|:.:..||..|||||:|||.||.|:|.|:||:.|.:
  Rat  3901 DLRAGYHVIDRLFDGS---------KDVQWEFVHGLLENSIYGGRIDNYFDLRVLQSYLKQFFNS 3956

  Fly  4282 RSFEADFALVANVDGASGGLRH-ITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAEKVLLTTR 4345
            ...:     |.|.........: |::|:......:...||.|.:...||:.|||.|..:......
  Rat  3957 SIID-----VLNQRNKKSIFPYSISLPNSCSILDYRAVIEKLPEDDKPSFFGLPANIARSSQRMT 4016

  Fly  4346 GTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRG-----EDGRPSWMKTLHNSATAWLELLPK 4405
            .:.::|:|                      ..:||.     :..|..|...|......| :.|.:
  Rat  4017 SSQVISQL----------------------RILGRSVTAGCKFDREIWSNELSPVLNLW-KKLNQ 4058

  Fly  4406 NLQVLKRTVENIKD----PLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSE 4466
            |..::.:.|....|    |:..:...|..:..||:|:|...|..:..:.:|....::..:.:.|.
  Rat  4059 NSNLIHQKVSPPNDRQGSPILSFIILEQFNAIRLVQSVHQSLAALSKVIRGTTLLSSEVQKLASA 4123

  Fly  4467 LVRGIIPKGWK-RYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFPVWLGGLLNPE 4530
            |:....|..|: ::..|.  ..:|::.....|...:|   ..|.:|..:.|....:.|..|.:|:
  Rat  4124 LLNQKCPLTWQSKWEGPE--DPLQYLRGLVARTLAIQ---NWVEKAEKQALLADTLDLSELFHPD 4183

  Fly  4531 AYITATRQCVAQANSWSLEELALDVT----ITDAGLKNDQKDCCFGVTGLKLQGAQCKNNELLLA 4591
            .::.|.||..|:|...|::.|....:    :.:|.|:       ..::||.|:|.....:.|   
  Rat  4184 TFLNALRQETARATGCSVDSLKFVASWKGRLQEAKLQ-------IKISGLLLEGCSFDGSRL--- 4238

  Fly  4592 STIMMDLPVT------ILKWIKISSEPRISK---LTLPVYLNSTRTELLFTVDLAVAAGQE 4643
            |....|.|..      .:.|....|....|.   ::||||.::.|..::..:|:.....|:
  Rat  4239 SENQHDSPSVSSVLPCYMGWTPQGSYGPYSPDECISLPVYTSAERDCVVTNIDVPCGGNQD 4299

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 132/630 (21%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 1036/3483 (30%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 61/324 (19%)
Dync2h1XP_063122173.1 None

Return to query results.
Submit another query.