DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dhc93AB

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4837 Identity:1236/4837 - (25%)
Similarity:2207/4837 - (45%) Gaps:760/4837 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   155 KSLAPYF-KSYVKESGRADRD-----GDKMAPSVEKKLAELEMGLLHLQQNID------------ 201
            ||...|| |.|.....|.|..     ||....::::..|.:|..|:.|..|.|            
  Fly    87 KSKGVYFIKRYALPIPREDCGNFIIYGDLATRTIDQLSALVEEVLVPLLSNEDNYRNWPIMVAQD 151

  Fly   202 ----IPEITLTAHQTVNNV--------------IRKCAEENRKAKVADFGDKVEDSSFLNLLQNG 248
                :..:..|.||....|              |.|.|:|..:.:...|     |....:.::..
  Fly   152 VQKHVHSLKSTVHQVKGQVSGETILAMPVGVEKIVKAAKELVETEQCQF-----DLYLKSAIEGV 211

  Fly   249 VNRWIAEIKKVTKLNRDPGSG-------TALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKH 306
            |.:|..:|.:|.|  ..|.:.       |...|.:||.|..:.|..|.::..:..:.....||::
  Fly   212 VIKWATQIHEVIK--ESPSNAFANGQNPTPHTEFTFWNNRLKNLSFIYDQLRNERIRAMALILEY 274

  Fly   307 G-KRFH---ATVSFDTDTGLKQALATVADYNPLMKDFPINDLLSATELEKIRPAVQQIFAHLRKV 367
            . ..:|   .|:..:..|.|.:|.......|||.:  |:.. |...:..:.:|.   :...:..|
  Fly   275 SMSAYHPCFQTLFKNVVTALAEAKDITLYLNPLKR--PLQH-LEEIDFAECKPL---LIPFMNTV 333

  Fly   368 ----RNTKYPIQ--RCLKLIEAISRDLSQQLLKVLGTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSCWDDE 426
                .|::|..|  :...|::.|...:..|..:.|....:.|...||..:.:....:|...:.:.
  Fly   334 GILWGNSRYYCQSAKITVLLQEICNLIIHQAKRYLDPSSIFHSDIDEAMQRLTLSIQILKFFREL 398

  Fly   427 YDKLQGLLRDIVKKKRDEHLKMVWRVSPAHKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTV------ILRVLR 485
            :|..:..|.....:. :|...::|...|        ....::|....|:|.|:      ::..|:
  Fly   399 FDYYKERLATFFTEP-EERPPILWTFHP--------NSVFKRFNAFLERLTTIQWFFFTVIEFLK 454

  Fly   486 PTKPAVGD-DGNVVETKQPYSLDAADANAIEEVNLAYENV------KEVDCLDITKEGSEAWEAA 543
            ..|..:|. .|..:.|:            |.:|.:.:...      |..|.||   .....::..
  Fly   455 LEKVEIGGLRGRQLSTR------------ITDVYVEFNQYFTAFASKSYDVLD---PDDHEFDED 504

  Fly   544 VKRYEEKIDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKD 608
            .|.::.:|..::.::.|.|........|...:|::.|...::..||.|:....:...::::.:.|
  Fly   505 FKGFQTRILELDMKLAAILCQAFDDCHNLESIFKLISIVGSVLDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDD 569

  Fly   609 DI---EALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRD-------LPPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVL 663
            ::   |::::         |...|..|.|       .||||..|.|..|::.::|..:|..:.:.
  Fly   570 EMTICESIYD---------KQMELKKVGDNLYPNYNCPPVAAFIRWCHQLETRITAPVKNFKALQ 625

  Fly   664 GKGWETHIEGQKLKADGDSFRAKLSI--SDVFHEWARKVQ---ERNFGSTGRIFTIESTRSRIGR 723
            .:..:|. :.|::....:....||..  :..|.:||.::.   |.|..        :|..:|..|
  Fly   626 HEITKTE-KSQEIVERYEILMVKLGSCKTQFFDDWAGQLDGQIEENLK--------KSLIARDRR 681

  Fly   724 GNVLRLRVNFLPEIITLAKEVRNIKNLGFR-VPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERTLE 787
            .|.|.|  ||...:.::.:||..::.:... :|...::.|.:::....|.::|       |:|::
  Fly   682 HNSLIL--NFSAALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYTLNL-------EKTID 737

  Fly   788 KLNNRSLAQNSVFKIEDRASIVP--LVAGLRKDVLNLVSEGIG-LIWESYKLDPYVIRLSECVTQ 849
            ..|:          |::.:|.|.  |:....|.:.:||..|:. |:|.|..:..|:.:|.:.|..
  Fly   738 WYNS----------IQEGSSPVELRLIEPEIKMIDDLVEIGVNQLVWNSSDILSYLDKLRKPVAA 792

  Fly   850 FQE------------------------------KVDDLLVVEEQLDVDVRSLETCPYSAATFVEI 884
            .|.                              |.|.:|.::|:.|   |:.:......|..:||
  Fly   793 LQNRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFERRDCKKDTVLSIDERPD---RTSKRYAEIQAASIEI 854

  Fly   885 LSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRLD-------EEVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKKEVDT 942
            ...:|..:....:....:.:||::.:|       |.:.|.:.  :..|..|             .
  Fly   855 HKLLQDNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIVYENILKTVG--VSVGYLA-------------E 904

  Fly   943 SMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQNAVHEIRITNQQMYLYPSIE--------EARFQIMQQFFAWQAI 999
            :||.:....|..:           ..:.:....:...||::        ....::|:......::
  Fly   905 NMDPENNYAPLFE-----------SRLELVEPNLVFVPSLDPEDPMGFNNMLIELMRDIMKMGSL 958

  Fly  1000 VTSQVRLQSTRYQVGLEKHVSQTYRNLLTKLPEGK----ILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRY 1060
            :.   ||:..      ||      ||.:..:.|.:    :.......::..:.|...:..::.||
  Fly   959 IK---RLKPN------EK------RNYVEMIKENQDIIDMRREILNGVDLVMEEASRFCRQFERY 1008

  Fly  1061 QSLW-DLQADML-----YGRLGEDVNLWIKCLNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKV 1119
            ..|| |.:.:.:     |||:.:...:.:..:||..|.... ....|..|:...|.:|..:..::
  Fly  1009 SYLWLDDREECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQ-PCQPTIEAFREQIDNYESLFNEI 1072

  Fly  1120 T-----LKYDSW-------HKEAL----GKFGTL----LGTEMTSFHSKVS----KSRTDLEMQS 1160
            .     ..:.||       .::||    .|:|.:    |.|.:||....:|    |:...| :|:
  Fly  1073 EDIGPFQVFSSWFQVDVRPFRQALLNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSLMNLSHFIRKADEGL-LQT 1136

  Fly  1161 IEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFP---NTWLHVDNIEGEWS 1222
            ::.......||.:.|:..:|:.....|:..|..:|..::|:......|   |..|  ..:..:|:
  Fly  1137 VKEKDYEGLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMDIPEEVNVLL--QELPEQWA 1199

  Fly  1223 AFNEI---IKRKDTAIQ-TQVASLQAKIVAEDKAVET-----RTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDD 1278
            ...:|   :|::.:.:| |:|.|::.||...:..::.     :|.||.. ::..||   .:..|.
  Fly  1200 NTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALFESHIQLFREVFKTYDFFR-FDCYKP---YLLMDR 1260

  Fly  1279 ALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEALELQESAVPNNSAERMNVALEELQDLRGVWSELSKVW 1343
            ....:.:.||      |.||    .:|:..|.|..:|....  :....:||:.|:.:|..::.|.
  Fly  1261 INDDMFLCES------EMRD----IQESGSLFEVNIPEFKV--LKQCRKELRMLKQLWDYVNIVA 1313

  Fly  1344 TQIDETREKPWLSVQPRKLRQQLEAMMAQLKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKS 1408
            |.||:.:..||..|....:..:.:.....::.|...:|.::::..::..:::.:.....:.||::
  Fly  1314 TSIDDWKTTPWRKVDVENMDIECKKFAKDIRLLDKEMRPWDTFINLESTVKNMLTSLRAVGELQN 1378

  Fly  1409 DALKERHWKQ----------LTKQLRVNWVLS-DLSLGQVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMAL 1462
            .|::||||.|          |.|::.|.:::. :.:|.::..:||.:.|..||:|:..|..||::
  Fly  1379 PAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHETTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSM 1443

  Fly  1463 EEFLKQVRESWQNYELD-LINYQNKCRIIRGWDDLFNKVKEHINSVAAMKL--SPYYKVFEEEAL 1524
            |:.|:.:..:|...|.| .::.:..|.:::..::|...:::  |.|....|  |.|...|.||..
  Fly  1444 EKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEELIETLED--NQVCLQNLITSKYIAHFLEEVS 1506

  Fly  1525 TWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSP 1589
            ||:.||...:.:..||.:|||.|.:||.||..|.||:..|||::.||.:|.:||..||.:::.|.
  Fly  1507 TWQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEMSVSS 1571

  Fly  1590 KVMDVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQ 1654
            .|:...|...:...||.|...|...:|||.||||.:|.:|||||||...|||:::.|......:.
  Fly  1572 NVVASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVT 1636

  Fly  1655 KHFKKMFAGVAAILLN----EENNVILGISSREGEEVHFMNPVSTVEHPKINEWLSLVEKQMRFT 1715
            ||..|:|..:|.:..|    .|.|...|:.:::||.|.| |.::::..| :..||:.::..||.:
  Fly  1637 KHLTKLFDSIARLKFNRDESNEINTASGMYAKDGEYVEF-NELASIRGP-VEVWLNRIQAAMRAS 1699

  Fly  1716 LASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAYME-----WCDKYQAQIVVLAAQILWSEDVESALQQASE-- 1773
            |...:.:||             .||.|     |...|.||:.:..:||.||.:|..|..:..|  
  Fly  1700 LRHYVMEAV-------------IAYEEKQREQWLFDYPAQVSLCGSQIWWSTEVNIAFSRLEEGY 1751

  Fly  1774 NNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSF 1838
            :|..|...:   ...|.|::|...:|.|.....|:|:..:....||.|.|..:::...:.|..:|
  Fly  1752 DNAIKDYYK---KQISQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRDVVAKMIQAKLDSGSAF 1813

  Fly  1839 QWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLG 1903
            .|..::|..||    :|.:....::.:|.|.|..||||...|||.||||||||:|:||:|...:|
  Fly  1814 MWQSQLRHRFD----DVEKDCFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMG 1874

  Fly  1904 GSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEER 1968
            |:|.|||||||||:.|.||..:|..|.||||.|..|:|:.|.|:.||.|.|||||||||||:...
  Fly  1875 GAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVE 1939

  Fly  1969 MLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKL 2033
            :||..:.|::::|:|::.:.|.      ...:|:.:...|.:.||||||||||||:.||:|||.|
  Fly  1940 VLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDK------FNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKAL 1998

  Fly  2034 FRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISA 2098
            ||..||..||.:||.|:||.::||:.|..||.|.:..:.||.|.||.|.|||:||||:||||:.|
  Fly  1999 FRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVA 2063

  Fly  2099 GNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDV 2163
            |::|             |||         ...||:|:|::::.:..:||::.:|:|:...|:||:
  Fly  2064 GSLK-------------RGD---------PGRPEEEVLMRALRDFNIPKIITDDMPVFMGLISDL 2106

  Fly  2164 FPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGL 2228
            ||.:...|...:..:..:::.. .|.|:..|              ..::.||:||.::..:.|.:
  Fly  2107 FPALDVPRKRDQDFERTVKQAA-SDLLLQPE--------------DNFILKVVQLEELLEVRHSV 2156

  Fly  2229 MMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVAHVIDPKAISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILR 2293
            .:||.:|:||:..|||||:..:..:. :.:.:.::|||::.:.|:|:::|.||||.||||:.::|
  Fly  2157 FIVGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNIKR-KPIFNDLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMR 2220

  Fly  2294 KIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKF 2358
            ... |:.|:  :.:||:.|||:||.|:|:||:|:||||:|||.:.||::|.|::|::||:.:|:.
  Fly  2221 DQA-NITGD--QPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRT 2282

  Fly  2359 ATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPLEDGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQ 2423
            ||.|||||.|:::.:...|.......::: ..|.||.|  ..:.|.:.      ::.:.|||:..
  Fly  2283 ATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVTSWV-ETRKIPAE--KSNLVMLF------DKYIPPSLETI 2338

  Fly  2424 RDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTRLRALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFPC 2488
            |              :..:.:....:..||.....|              .|.....|..| ..|
  Fly  2339 R--------------VRFKKITPVAEMAHIQMLCHL--------------LNCFLIPANTP-ADC 2374

  Fly  2489 SADQLEHYIPKALVYSVLWSFAG----DAKLKVRIDLGD-FVRSVTTVPLPGAAGAPIIDYEVNM 2548
            ..:..|.|    .|::.:|:|..    |..:..|::... :|....||..|  .|..:.||.::.
  Fly  2375 PKEWHELY----FVFACIWAFGSAMFQDQAIDYRVEFSKWWVNEFKTVKFP--PGGTVFDYFLDS 2433

  Fly  2549 -SGDWVPWSNKVPVIEVETHKVASPDIVVPTLDTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTL 2612
             :..::||:.|:|..|::: .:....::|.|.:::|....|...:.:..|::|.|..|.|||:.:
  Fly  2434 ETKTFLPWTEKIPKFELDS-DLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLV 2497

  Fly  2613 FSALRALPD-MEVVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRK----TPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDE 2672
            ...|::|.: ..|..:.|:..||.|:|.|..:...|.:.    .|.|        .|.|..|.|:
  Fly  2498 NEKLQSLSENYAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPG--------NKLLCYFVDD 2554

  Fly  2673 INLPDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQAWVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRH 2737
            ||:|::|:|||.:..:.:||.:::..:|..:......:...|:|...||.:  |...::.|..||
  Fly  2555 INMPEVDAYGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQYVACMNPTS--GSFTINPRLQRH 2617

  Fly  2738 VPIIYVDYPGETSLKQIYGT------------FSRAMLRLMPALRGYAEPLTNAMVEFYLASQDR 2790
            ..::.|.:||..|:..:|.:            |:..:.|:.|.:......|.|..::.:|.:.  
  Fly  2618 FCVLAVSFPGPESITVMYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVFLPTA-- 2680

  Fly  2791 FTQDMQPHYVYSPREMTRWVRGI------CEAIRPLDSLPVEG---LVRLWAHEALRLFQDRLVD 2846
                ::.||:::.|:::...:|:      |          :.|   |:|||.||..|::.|:|.|
  Fly  2681 ----IKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTEC----------LTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTD 2731

  Fly  2847 DSE-RRWTNENIDLVGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWL----SKDYMPVNR-EELREYVHARLK 2905
            |.: ..:|....|:| :|.|..|::.....:|.:|.::.    ...|||:.. .||.:.:...:.
  Fly  2732 DKDIDSFTKMQHDIV-KKSFEEIDESVIFDKPNIYCHFAGGIGDPKYMPIKGWPELHKLLQEAMS 2795

  Fly  2906 VFYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSIFQIKV 2970
            .:.:....:.||||::.:.||.||:||...|:|..||:||.|:||.:|:|..|:::.|.:.||::
  Fly  2796 SYNDLVAAMNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQL 2860

  Fly  2971 HNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTT 3035
            ...|...|...:...:..::|.|:..|.|::.::.:....||..:|.:||.||:|.||..||...
  Fly  2861 KKGYGVNDLKNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIEN 2925

  Fly  3036 LMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNRCVLNW 3100
            ::...:...:..|| :|:.:..:|:|..:|.:.|.:|...:|....|:.|:...||:.|...:||
  Fly  2926 IIAGVRNEVKGAGL-VDTRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINW 2989

  Fly  3101 FGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQAN 3165
            |.:|...||..|...|..:                 ..::|.|  |||:|.....|||.:::..:
  Fly  2990 FHEWPQEALISVAMNFLAQ-----------------NKVLPEN--HRDSVAKFMAYVHTSVNTTS 3035

  Fly  3166 ARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLA 3230
            ....:...|....||:.||:.|:.::||.|.|..||:.:...|..||.|:..|..||.:::..||
  Fly  3036 KVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLYIKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLA 3100

  Fly  3231 VKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQEIQIRLADQTVKIEEKRKYVMADLAQVEPA 3295
            |::.||:.|||||:|.::.:..:.::.:.:|..:.|.::::|....::.:|::....||.:.|||
  Fly  3101 VQEIELKEKNEAADALIEIVGIETEKVQTEKAVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPA 3165

  Fly  3296 VIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLLGENA-----TDWKSIRAVIMR-ENF 3354
            ::.||.|:.::.|..|.|:::..:||..|.....::.:||.:..     ..||:.:..:.: :.|
  Fly  3166 LMAAQDALNTLNKANLTELKSFGSPPGAVTNVTAAVMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTF 3230

  Fly  3355 INSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEP 3419
            ::|:: |:..|||..::.:.:: .||.:|::..|.|...|.|...:..|.|..|::.::...|||
  Fly  3231 LDSLI-NYDKENIHPEITKAIQ-PYLKDPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEP 3293

  Fly  3420 LREELRSLEEQADVNLASAKETKDLVEQLERSIAAYKEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSI 3484
            .|:.|.:    |:..||:|   :|.:..::|.:.:.:|:..:|.:..:....|....|.:.|.:.
  Fly  3294 KRKALAA----ANAELAAA---QDKLAGIKRKVMSLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQ 3351

  Fly  3485 A-------LLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRLN-LFTTWS 3541
            |       |:..|..|..||......|..|..|:.||:||..|||:|.|.|.:.:|:: |...|:
  Fly  3352 ATIALANRLVGGLASENVRWAEAVNNFVKQGITLPGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWT 3416

  Fly  3542 QHLQAASIQYRADIARTEYLS-----NPDERLR-WQANALPTDDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDP 3600
            ..|::..    ..|..||.|.     ..|..:. |....||:|.:..|||.:|...:|:||:|||
  Fly  3417 PFLKSID----PPIPTTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNEGLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDP 3477

  Fly  3601 SGQATTFLLNEYAGK----KITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ENYDPILNPVLNRE 3660
            ..|...::..:|...    ::.:.|:||     .:|.::..|..:|:::: ||.||:|:.:|.|.
  Fly  3478 QLQGVKWIKQKYGEDLKVIRLGQRSYLD-----IIEKSINAGCNVLIENIDENLDPVLDSLLGRN 3537

  Fly  3661 LRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNQVL 3725
            |.:.|  ..|.:||::|:.:.:|.:.|.|:.....:.|::.::.|.:||||||..|:.|.|.:|:
  Fly  3538 LIKKG--KAIKIGDKEIEYNSNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVV 3600

  Fly  3726 KAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVITTLETLKKEAYDINQ 3790
            ||||||::|.::||.|.|.:|::.|::||..||..|:.|...||.|.:::..|||.|..|.:|.|
  Fly  3601 KAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDTALVENLETTKSTASEIEQ 3665

  Fly  3791 KVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKMFLDIFSTVLYN---NP 3852
            ||.|......||:...:.|.|.:...|.:||.::.||.::.:||:|||.|..:|...:..   ..
  Fly  3666 KVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGD 3730

  Fly  3853 KLEGRTDHSERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFA-------LLMCKIHLKGTSESNLDA 3910
            .|:.|.  |..:..:|..:||.    .:||:...|:|.||       |||        :|....|
  Fly  3731 TLDLRV--SNLIDCITYSVFQY----TSRGLFECDKLIFASQMTFQILLM--------NEEVTSA 3781

  Fly  3911 EFNFFLRSREGLLANP---TPVEGLSAEQIESVNRLALRLPIFRKLLEKVRSIPELGAWLQQSS- 3971
            |.:|.||    ....|   :||:.|:.:....:..||.: ..||.|...:.:..:....|.:|. 
  Fly  3782 ELDFLLR----FPIKPHVTSPVDFLTNQSWGGICSLASK-DEFRNLDRDIETSSKRWKKLVESEL 3841

  Fly  3972 PE-QVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNAEQELDFTS 4035
            || :..||.|....||       .:|.:|:|.||||:..|..:.:...||..::.:  :.::|..
  Fly  3842 PEKEKFPQEWKNKTAL-------QRLCMIRALRPDRMTYALADFIEEKLGSKYVES--RAMEFAK 3897

  Fly  4036 VVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQNKQISSIAIGSAEGFNQ--------------- 4085
            ..: :.:.:||......||.:....|:             |:|...||:.               
  Fly  3898 SYE-EASPSTPIFFILSPGVNPLKDVE-------------ALGKQMGFSMDLGNFHNVSLGQGQE 3948

  Fly  4086 --AERAINMACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKM--HSLQPHSGFRLFLTME--INPK---VP 4141
              ||.|::.|.|.|.||:|:|:||..:||..||||:  ::...|..:|:||:.|  ..|.   :|
  Fly  3949 AIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDSHPDYRMFLSAEPASTPSAHIIP 4013

  Fly  4142 VNLLRAGRIFVFEPPPGIRANLLRTFS--TVPAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVP 4204
            ..:|.:......|||.|:.|||.:...  |.....|....:|...:.|.|.:|||:|.||.::.|
  Fly  4014 QGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGP 4078

  Fly  4205 LGWAKKYEFNESDLRVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQR 4269
            .||.|.|.||..||.::...|..:::..|         ||||:.|..|..:.:|||.|.:|:|:|
  Fly  4079 QGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANA---------KVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRR 4134

  Fly  4270 LLTSFLK----------KLFTARSFEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTD 4324
            |..::|:          :||.|.||.|                    |..|....:..:::.:..
  Fly  4135 LCITYLEEYMQPDLVDGELFLAPSFPA--------------------PPNTDYQGYHTYVDEMMP 4179

  Fly  4325 RQTPSWLGLPNNAEKVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWM 4389
            .::|...||..|||...||||..::...:.:||              ..:..|.|.....|...:
  Fly  4180 AESPYLYGLHPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQ--------------PRDAGAGGGATVTREDKV 4230

  Fly  4390 KTLHNSATAWLELLPK--NLQVLKRTVENIKDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQG 4452
            |.:.:..   :|.||:  |:..:...||. :.|......:|....:.|...:...|:::.|..:|
  Fly  4231 KQIVDEI---IEKLPEEFNMVEIMNKVEE-RTPYVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKG 4291

  Fly  4453 EKKQTNHHRSMLSELVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQ---LVSQAGAK 4514
            |...|:....:.:.|....:|..|.:...|:...:..|..|...|:::|:..|.   |.|     
  Fly  4292 ELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPS----- 4351

  Fly  4515 ELQGFPVWLGGLLNPEAYITATRQCVAQANSWSLEELALDVTITDAGLKNDQKD---------CC 4570
                 .|||.|..||::.:||..|..|:.|...|:::.|...:|     ..||:         ||
  Fly  4352 -----CVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPLDKMCLQCDVT-----KKQKEEFTTAPRDGCC 4406

  Fly  4571 FGVTGLKLQGAQCKNNELLLASTIMMDL----PVTILKWIKISSEPRISKLTLPVYLNSTRTELL 4631
              |.|:.::||:....:.::..:.:.:|    ||..::.|....:...:....|||...||....
  Fly  4407 --VHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVINIRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRGPTT 4469

  Fly  4632 FTVDLAVAAGQESHSFYERGVAVLTST 4658
            :..:|.:....:...:...|||:|..|
  Fly  4470 YVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALLLQT 4496

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 120/645 (19%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 985/3500 (28%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 69/330 (21%)
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 205..782 CDD:462457 120/645 (19%)
DHC_N2 1292..1707 CDD:462462 122/418 (29%)
DYN1 1305..4143 CDD:227570 902/3071 (29%)
AAA_6 1841..2167 CDD:463697 152/368 (41%)
MT 3076..3419 CDD:463699 94/351 (27%)
Dynein_C 4198..4494 CDD:465677 69/330 (21%)

Return to query results.
Submit another query.