Protein Alignment Dhc64C and Dhc93AB

DIOPT Version :9

• Sequence 1: NP_001261432.1
• Gene: Dhc64C / 38580
• FlyBaseID: FBgn0261797
• Length: 4661
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001262793.1
• Gene: Dhc93AB / 42485
• FlyBaseID: FBgn0013812
• Length: 4496
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 4837
• Identity: 1236/4837 - (25%)
• Similarity: 2207/4837 - (45%)
• Gaps: 760/4837 - (15%)

  Fly   155 KSLAPYF-KSYVKESGRADRD-----GDKMAPSVEKKLAELEMGLLHLQQNID------------ 201
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  Fly  1000 VTSQVRLQSTRYQVGLEKHVSQTYRNLLTKLPEGK----ILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRY 1060
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            .     ..:.||       .::||    .|:|.:    |.|.:||....:|    |:...| :|:
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  Fly  1223 AFNEI---IKRKDTAIQ-TQVASLQAKIVAEDKAVET-----RTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDD 1278
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  Fly  1379 PAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHETTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSM 1443

  Fly  1463 EEFLKQVRESWQNYELD-LINYQNKCRIIRGWDDLFNKVKEHINSVAAMKL--SPYYKVFEEEAL 1524
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  Fly  1774 NNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSF 1838
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  Fly  1839 QWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLG 1903
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  Fly  1875 GAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVE 1939

  Fly  1969 MLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKL 2033
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  Fly  1940 VLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDK------FNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKAL 1998

  Fly  2034 FRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISA 2098
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  Fly  2164 FPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGL 2228
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  Fly  2221 DQA-NITGD--QPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRT 2282

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  Fly  2613 FSALRALPD-MEVVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRK----TPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDE 2672
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  Fly  2498 NEKLQSLSENYAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPG--------NKLLCYFVDD 2554

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  Fly  2681 ----IKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTEC----------LTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTD 2731

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  Fly  2796 SYNDLVAAMNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQL 2860

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  Fly  3101 FGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQAN 3165
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  Fly  2990 FHEWPQEALISVAMNFLAQ-----------------NKVLPEN--HRDSVAKFMAYVHTSVNTTS 3035

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  Fly  3036 KVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLYIKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLA 3100

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  Fly  3294 KRKALAA----ANAELAAA---QDKLAGIKRKVMSLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQ 3351

  Fly  3485 A-------LLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRLN-LFTTWS 3541
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  Fly  3666 KVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGD 3730

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            |.:|.||    ....|   :||:.|:.:....:..||.: ..||.|...:.:..:....|.:|.
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  Fly  3972 PE-QVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNAEQELDFTS 4035
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            ..: :.:.:||......||.:....|:             |:|...||:.
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  Fly  3949 AIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDSHPDYRMFLSAEPASTPSAHIIP 4013

  Fly  4142 VNLLRAGRIFVFEPPPGIRANLLRTFS--TVPAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVP 4204
            ..:|.:......|||.|:.|||.:...  |.....|....:|...:.|.|.:|||:|.||.::.|
  Fly  4014 QGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGP 4078

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            .||.|.|.||..||.::...|..:::..|         ||||:.|..|..:.:|||.|.:|:|:|
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  Fly  4180 AESPYLYGLHPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQ--------------PRDAGAGGGATVTREDKV 4230

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  Fly  4231 KQIVDEI---IEKLPEEFNMVEIMNKVEE-RTPYVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKG 4291

  Fly  4453 EKKQTNHHRSMLSELVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQ---LVSQAGAK 4514
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  Fly  4292 ELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPS----- 4351

  Fly  4515 ELQGFPVWLGGLLNPEAYITATRQCVAQANSWSLEELALDVTITDAGLKNDQKD---------CC 4570
                 .|||.|..||::.:||..|..|:.|...|:::.|...:|     ..||:         ||
  Fly  4352 -----CVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPLDKMCLQCDVT-----KKQKEEFTTAPRDGCC 4406

  Fly  4571 FGVTGLKLQGAQCKNNELLLASTIMMDL----PVTILKWIKISSEPRISKLTLPVYLNSTRTELL 4631
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  Fly  4407 --VHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVINIRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRGPTT 4469

  Fly  4632 FTVDLAVAAGQESHSFYERGVAVLTST 4658
            :..:|.:....:...:...|||:|..|
  Fly  4470 YVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALLLQT 4496

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Dhc64C	NP_001261432.1	DHC_N1	240..839	CDD:285571	120/647 (19%)
		DYN1	1022..4338	CDD:227570	985/3500 (28%)
		DHC_N2	1326..1724	CDD:285579	122/415 (29%)
		P-loop_NTPase	1870..2103	CDD:304359	122/232 (53%)
		P-loop_NTPase	2227..2367	CDD:304359	60/139 (43%)
		P-loop_NTPase	2572..2835	CDD:304359	66/288 (23%)
		Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B	2834..>2943	CDD:294426	33/114 (29%)
		P-loop_NTPase	2916..3194	CDD:304359	81/277 (29%)
		MT	3208..3544	CDD:289543	94/349 (27%)
		AAA_9	3569..3784	CDD:289547	76/220 (35%)
		Dynein_heavy	3925..4636	CDD:281078	188/769 (24%)
Dhc93AB	NP_001262793.1	DHC_N1	204..782	CDD:285571	120/646 (19%)
		DHC_N2	1295..1708	CDD:285579	122/416 (29%)
		P-loop_NTPase	1841..2071	CDD:304359	126/257 (49%)
		P-loop_NTPase	2155..2290	CDD:304359	59/138 (43%)
		P-loop_NTPase	2448..2720	CDD:304359	67/298 (22%)
		P-loop_NTPase	2797..3064	CDD:304359	81/286 (28%)
		MT	3076..3419	CDD:289543	94/351 (27%)
		AAA_9	3447..3659	CDD:289547	76/218 (35%)
		Dynein_heavy	3799..4486	CDD:281078	187/774 (24%)

Information from Original Tools

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
			BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
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Domainoid	1	1.000	230	1.000	Domainoid score	I503
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_COG5245
Homologene	0	0.000	Not matched by this tool.
Inparanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
Isobase	0	0.000	Not matched by this tool.
OMA	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoDB	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoFinder	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoInspector	1	1.000	-	-		otm47047
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_100025
Panther	1	1.100	-	-	P	PTHR10676
Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	0	0.000	Not matched by this tool.
SonicParanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
	7	6.740