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Protein Alignment Dhc64C and dnah5l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002666734.3 Gene:dnah5l / 335340 ZFINID:ZDB-GENE-091204-287 Length:4667 Species:Danio rerio


Alignment Length:4894 Identity:1259/4894 - (25%)
Similarity:2189/4894 - (44%) Gaps:796/4894 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    94 EKEQVTYQISNDVHFTNSRMASLACIKRGLVVEADKSIHSQLRLINFSDGSPYETLHAFISKSLA 158
            :|...|..||.:|:|                           .:::.|:.|....|...:::.:.
Zfish   234 DKAITTTNISQEVNF---------------------------GMLDCSESSILHNLEFLLTQVMN 271

  Fly   159 PYFKSYVKESGRADRDGDKMAPSVEKKLAELEMGLLHLQQNIDIPEITLTAHQTVNNV------- 216
            ...||  :|...|.:|| :|.|.|:..|..::             :.|.|....:.|:       
Zfish   272 QALKS--QEDWGAIKDG-QMNPDVQNFLRSVD-------------KFTFTLSSVMRNMEEKFKLH 320

  Fly   217 -IRKCAEENRKAKVADFGDKVEDSSFLNLLQNGVNRWIAEIKKV----TKLNRDPGSGTALQEIS 276
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Zfish   321 HIPSAPDLSHIQKPEDYSYAANNSELVEDLEAVLVYWAKQIEQVLTESERIRRESDDIGPSAELA 385

  Fly   277 FWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGKRFHATVSFDTDTGL----KQALATVADYNPLMK 337
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Zfish   386 HWKRRMITFCSLMDEIKDPYVKKIIGILHAAKSKTMSKWKELDASITIVANEAKDNVKYLSTLDK 450

  Fly   338 DFPINDLLSATELEKIRPAVQQIFAHLRKVRNTKYPIQRCLKLIEAISRDLSQQLLKVL------ 396
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Zfish   451 FFEL--------LEKSTPT--SMLKHIPKLMNSIHMIHRVSQFYNT-SEHMTSLFVKVTNQMVTT 504

  Fly   397 -------GTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSCWDDEYDKLQGLLRDIVKKKRDEHLKMVWRVSP 454
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Zfish   505 SKAYLCQGVTKVWELDRKELLKRMKECIEL----NQEYQQCFRQMKEKIQQ------------NP 553

  Fly   455 AHKKLQTRMEHM-RKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQPYS-LDAADANAIEEV 517
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Zfish   554 HERQLELSENYIFGKFDTFCKRLEKIT---------------DMATTLEDFSVLQFMKFEGVEKI 603

  Fly   518 NLAYENV------KEVDCLDITK-EGSEAWEAAVKRYEEKIDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEM 575
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Zfish   604 YMRYQNIVSTIKSKTYNVLDHRKLEFDNDYIEFRNQIQVLYQSVDALIDTWLQRPLTT----EQV 664

  Fly   576 FRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQ-----LIQRVKDDIEALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRDL 635
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Zfish   665 LELLSRFE--------NGVGRQMDLNQKYMVVLQRYECDLEFVRK----CYQKEKD---NPVSQL 714

  Fly   636 PPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWETHI----EGQKLKADGDSFRAKLSISDVFHE- 695
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Zfish   715 TPLAGKIEWSKHLFKKIELPMQILKDKL------DILQMPDRRKIIRSYNRLAAVLLEYEMIHQK 773

  Fly   696 -WARKVQERNFGSTGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVNFLPEIITLAKEVRNIKNLGFRVPLTIV 759
             |...|:....|....:.|...|..        ...||..|.::.:.:|..|:..||..||..|.
Zfish   774 AWVEGVELGLSGLNASLLTRHPTTK--------EFYVNLDPLVLEVLQEANNMYKLGALVPDGIH 830

  Fly   760 NKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERTLEKLNNRSLAQNSVFKIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVS 824
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Zfish   831 DMAAKEPQLKEYRYKLQMMLKEFHAVVKKI-------PGVLK----SPMKPFI----RSVETALS 880

  Fly   825 EGIGLI-WESYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDDLL-VVEEQLDVDVR---------SLETCP--- 875
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Zfish   881 PGLTILSWTSLNIDYFI----GCVYKALQELEQVLKVVTDILDCRINHTLESMCSTTLLTLPENE 941

  Fly   876 ---------YSAAT---------------------FVEILSKIQHAVDDLSLRQYSNL---SVWV 907
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Zfish   942 PVTPEMFLTHTAATISTERETLKVASQQVERSMLEIAEELNRMLKPSERVNLKKCSCLHPDAKQM 1006

  Fly   908 TRLDEEVEKKLALRLQAGIQAWTEAL-TGNKKEVD----------TSMDTDAPAQPTHKLGGDPQ 961
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Zfish  1007 TRCLQCLPCAFYIMMGQLCQRNTEALVTATKSSLNALHRRLLAASSSYRSSSPSGATIQV---PL 1068

  Fly   962 IQNAVHEIRITNQQMYLYPSIEEAR----------FQIMQQFFAWQAIVTSQVRLQSTRYQVGLE 1016
            .:.:| |:.|.|  :...||.|..:          ..:.:....|......|.:||:.  ||...
Zfish  1069 FRVSV-ELAIPN--IVFRPSFEHIQGILNKGVNMVLSMAKDIPLWNYFHLQQDQLQAE--QVAAR 1128

  Fly  1017 KHVSQT-------YRNLLTKLPEGKILENAYGAIEQKVSEVR----NYVDEWLRYQSLWD----- 1065
            :|..:|       .|:|...:.|.|.:..:...:...||.::    :.:::..::.:||:     
Zfish  1129 EHGDETVVSKPILLRSLDRHVTEHKDVNKSLSQLVPLVSSLKADAGDILEDLSQFSALWNQDPAE 1193

  Fly  1066 -----LQADMLYGRLGEDVNLWIKC---LNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKVTLK 1122
                 ||.:.:.......::|:...   ::::.|:.|.          |||:.:...::..:..:
Zfish  1194 QVKAFLQTNPILADFSTQLSLYSAYETQIHELPQTCTV----------GPILFETESLKMSLIQE 1248

  Fly  1123 YDSWHKEALGKFGTLLG-------TEMTSF----HSKVSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSFITYV 1176
            ..:|.:|    ||..|.       ||::||    :.::.:..:||:          |....:..:
Zfish  1249 CHTWKRE----FGAALNQQASAGMTEISSFVDGVNRQLQRPISDLD----------DVRESMGAL 1299

  Fly  1177 QSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFPNTWLHVDNIEGEWSAFNEI-IKRKDTAIQTQVA 1240
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Zfish  1300 RELREEEIRIETIMGPVEESFALLNRHDLFFNDG--NAERIDGVVYAWKELKVMAKET--QKKLS 1360

  Fly  1241 SLQAKIVAE--------DKAVETRTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEER 1297
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Zfish  1361 DVEPHMKAELIAGVEVFQKSVES----FYGDYDNSGPGVTGLPPREASDRLQVYQAKFDELWRKY 1421

  Fly  1298 DNVVKAKEALELQESAVPNNSAERMNVALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETREKPWLSVQPRKL 1362
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Zfish  1422 VTFSSGEELFGLPVGEYPD-----LHRIKRELNLLSKLYSLYNSVIDSVSGYYDILWADLNIEKI 1481

  Fly  1363 RQQLEAMMAQLKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRVNW 1427
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Zfish  1482 NNELLDFQNRIRKLPAALKEWQAFNDLKKTIDDFNETCPLLYMMANKAMMARHWERITDLTKHKF 1546

  Fly  1428 VLS--DLSLGQVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINYQNKCRII 1490
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Zfish  1547 EVEAPNFSLRNVMEAPLLKCKEDIEDVCISAVKERDIEAKLKDVVTEWSGHQFTFATFRNRGELL 1611

  Fly  1491 RGWDDLFNKV---KEHINSVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEG 1552
            ....|...||   ::.:..:.::..:.|...|:.....|.:||:..:.:.:.|:.||..|:|||.
Zfish  1612 LKGSDTSEKVALMEDSLMVLGSLMSNRYNAPFKPTIQQWVQKLSNSSEVIEKWLTVQNLWLYLEA 1676

  Fly  1553 IFSGSADIKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSPKVMD-VLNIPAVQRSLERLADLLGKIQK 1616
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Zfish  1677 VFVG-GDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWQRIMQRAHEIPGVVQCCVGDETLQQLLPHLLEQLEVCQK 1740

  Fly  1617 ALGEYLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEEN-NVILGIS 1680
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Zfish  1741 SLSGYLEKKRLVFPRFFFVSDPVLLEILGQASDSHTIQAHLLNLFDNVNRVVFHEKNYDQILSFQ 1805

  Fly  1681 SREGEEVHFMNPVSTVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAY--MEW 1743
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Zfish  1806 SQEGETVNMSEPINA--QGNVEAWLGMLLDGVKKTLHSIIRQAAM--------VIGDQGFKLVEF 1860

  Fly  1744 CDKYQAQIVVLAAQILWSEDVESALQQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRR 1808
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Zfish  1861 QSMFPAQVGLLGIQFIWTRDAEEALQQSKAD--KKIMQTTNQKFLDLLNELIDMTTHDLTKMERT 1923

  Fly  1809 KLEHLINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFE 1873
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Zfish  1924 KYETLITIHVHQKDIFDDLVQMNIRSPLDFEWQKQSRFYFIDDTDRCIIQIT----DVEFDYCNE 1984

  Fly  1874 YLGVQDRLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETF 1938
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Zfish  1985 YLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQM 2049

  Fly  1939 DFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQ 2003
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Zfish  2050 DFRGLGRIYKGLAQSGAWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLQCKK-----NKKSQFIFTDGDV 2109

  Fly  2004 VRVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIV 2068
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Zfish  2110 VDMDKEFGIFLTMNPGYAGRQELPENLKIQFRTVAMMVPDRAIIMRVKLASAGFRENQVLSRKFY 2174

  Fly  2069 PFFKLCDEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQ 2133
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Zfish  2175 TLYKLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAVKR---------------SNPTE-------PEK 2217

  Fly  2134 EILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQ 2198
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Zfish  2218 TVVMRVLRDMNLSKLVDEDEPLFMSLINDLFPGIMLDKAGYPDLEAAITKQAEEAGLIA------ 2276

  Fly  2199 GAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVAHV-- 2261
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Zfish  2277 ---------HPPWILKLVQLYETQRVRHGMMTLGPSGTGKTTCIHTLMKAMTDC----GNPHKEM 2328

  Fly  2262 -IDPKAISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNS 2325
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Zfish  2329 RMNPKAITASQMFGTLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLKSKKGE---HIWIVLDGPVDAIWIENLNS 2390

  Fly  2326 VLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRL 2390
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Zfish  2391 VLDDNKTLTLANGDRIPMAPNCKVVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLDWQPILQAW---L 2452

  Fly  2391 RSIPLEDGD----------EDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQ------VQRDIALL--LLPFFSAD 2437
            :.||....|          :|.:..:..|      |||.:|      :::.|.||  |||     
Zfish  2453 KKIPPMQADVLLAAFNSIYQDLMNFVFTA------VSPKMQLLECMYIKQTIDLLQGLLP----- 2506

  Fly  2438 GIVVRTLEYAMDQEHIMDFTRLRALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFPCSADQLEHYIPKALV 2502
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Zfish  2507 ---------AVEEKNL--------------------------NAAH-------------INRLFI 2523

  Fly  2503 YSVLWSFAGDAKLKVRIDLGDFVRSVTT-VPLPGAAG-APIIDYEVNMSGDWVPWSNKVPVIEVE 2565
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Zfish  2524 FAVMWSAGALMELEDRAKMEVFLKKHNARLDLPSTQGEQTIFEFLVSSTGEWDLWATRVP--EYI 2586

  Fly  2566 THKVASPD---IVVPTLDTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDMEV--- 2624
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Zfish  2587 YPKDSVPDYASILVPNVDNIRTDFLMQTIMKQGKAVLLIGEQGTAKTV-MIKGYTSKYDPETNLS 2650

  Fly  2625 VGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGTQRVISF 2689
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Zfish  2651 KSLNFSSATQPGMFQQTIESYIDKRM---GTTYGPPG-GKKMTVFVDDINMPVINEWGDQITNEI 2711

  Fly  2690 LRQLVEHKGFYRASDQAWVSLER---------IQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDY 2745
            :|||:...|||        ||||         :|.|.|...| ..||..:..|..|...:.....
Zfish  2712 VRQLMVQGGFY--------SLERPGEFTTVVDLQLVAAMIHP-GGGRNDIPQRLKRQFCVFNCTL 2767

  Fly  2746 PGETSLKQIYGT-----------FSRAMLRLMPALRGYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQPHY 2799
            |..:|:.:|:.|           |...:..|..||......:..|:....|.|..:|      ||
Zfish  2768 PSNSSIDKIFHTLASGYFCVERGFPEEVCSLAAALVPTTRKVWQAVKAKMLPSPAKF------HY 2826

  Fly  2800 VYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLPVEGLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRWTNENID-----L 2859
            :::.|:::|..:||......:...| :.|..|:.||..|:..||.:|:.:|    |..|     :
Zfish  2827 IFNLRDLSRIWQGILTVGSEVCQTP-QLLASLFRHECSRVIADRFIDEKDR----ETFDGILERI 2886

  Fly  2860 VGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLSKDYM----------PVNREELREYVH----------ARL 2904
            ..|.|.|.:.::...|...:       |::          |.:.||....|:          .||
Zfish  2887 TAQDHGPSLLEQGPWQGYFV-------DFLRDAPEMTGEEPEDAEEETPKVYEPIPTFKALSERL 2944

  Fly  2905 KVFYEEELD------VPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGL 2963
            .:|.|:..:      :.||.|::.:.|:::|.||.|..:|:.||:||.|:||.:|:|..:::.|.
Zfish  2945 SMFQEQYNEAVRGAAMDLVFFEDAMIHLMKISRIIRTARGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGY 3009

  Fly  2964 SIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLF 3028
            ..|||.:...|...:..|||:.:.|.:|.:.:.:.||..::::.|..|||.||.:||:|||..||
Zfish  3010 QSFQITLTRTYNVSNLIEDLKALYRIAGLEGKGVTFIFTDNDIKDEAFLEYMNNVLASGEVSNLF 3074

  Fly  3029 EGDEYTTLMTQCKEGAQREGL--MLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPA 3091
            ..||...: ||....|.::.|  ...:.|.||.:|..:|..||||....:|..:.|:.||...|.
Zfish  3075 ARDEVDEI-TQSLIPAMKKDLPRCPPTIDNLYNYFLSRVRSNLHVALCFSPVGEKLRSRALKFPG 3138

  Fly  3092 LFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVC------PLVPANPTHRDAV 3150
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Zfish  3139 LISGCTVDWFQRWPRDALVAVAQHFLSNYSLR-------------CSDEVKRSVVQTMGTFQDMV 3190

  Fly  3151 INSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKI 3215
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Zfish  3191 AEICTEYFQ-----------RFRRQTYVTPKSYLTFIKGYQMIYTEKIENVGVLAERMNTGLERL 3244

  Fly  3216 AETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQEIQIRLADQTVKIEE 3280
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Zfish  3245 MEAELSVNELRVELREKEKVLEVAKQKAGEVLLEVTAKAQAAEKVKAQVQKVKDKAQAIVDEIEG 3309

  Fly  3281 KRKYVMADLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLLGENATD---- 3341
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Zfish  3310 DKKVAESKLEAAKPALEASEAALKTIKPADIATVRKLGKPPHLIMRIMDCV-LLLFQRRVDGVTM 3373

  Fly  3342 ----------WKSIRAVIMRENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMA 3396
                      |.....::....|: |::.||..:.||::|.| :.|.||:..|||.|...|....
Zfish  3374 DPERPCVKPSWGEALKLMNNSGFL-SMLLNFNKDTITEEVVE-LLSPYLAMEDYNLETAKRTCGN 3436

  Fly  3397 CGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADV---NLASAKETKDLVE-QLERSIAAY-- 3455
            ...:..|..|.:|:..:.|.|.||:..|:..|.:..|   .|:.|:|..|..: :|:.:.|.|  
Zfish  3437 VAGLCSWTEAMVEFFGINKEVLPLKANLKLQEARLTVAQDELSRAQEQLDAKQKELDDAQAMYDA 3501

  Fly  3456 -KEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSA 3519
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Zfish  3502 AMKEKQDLLDDAEACKKKMSN-------AVALIDGLGGEKIRWTESSAQFERQIKDMVGDVLLAT 3559

  Fly  3520 AFIAYGGYFDQHYRLNLFTTWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTEN 3584
            .|::|.|.|:|.||..|...|.:.:.:..|.|..::.....|.:......|....||.|||..:|
Zfish  3560 GFLSYSGPFNQEYRTLLMQQWKKEMDSRHIPYSENLNLINMLVDNATIGEWNLQGLPNDDLSIQN 3624

  Fly  3585 AIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-EN 3648
            .|::.:.:||||:|||.||...::.|......:..||.....||.:||..|..|.|||::|| |.
Zfish  3625 GIIVTKASRYPLLIDPQGQGKIWIKNREQSNDLQVTSLNHKYFRTHLEDCLSQGKPLLLEDVGEE 3689

  Fly  3649 YDPILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTR 3713
            .||:|:.:|.:...:||....:.:||:::|:..:|.::::|:.....:.|:|.::...|:||||.
Zfish  3690 LDPVLDNILEKNFIKTGKTSKVKVGDKEVDVMETFTLYITTKLANPAYSPEINAKTGVVDFTVTM 3754

  Fly  3714 SSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVITTL 3778
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Zfish  3755 KGLEDQLLGRVILIEKKEMEAERVKLLEEVTSNKRKMQELESNLLYRLTSIQGSLVEDESLIEVL 3819

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Zfish  4580 DGAGWDKRNVKLTESSPKVLFNLLPVVHVYAVSSTTESKKPAMNLYSCPVYKKPRRTDLTYIFSL 4644

  Fly  4637 AVAAGQESHSFYERGVAVL 4655
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Zfish  4645 FLRSSQNPDHWTLRGVALL 4663

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 112/638 (18%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 990/3499 (28%)
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dnah5lXP_002666734.3 DHC_N1 347..896 CDD:462457 112/638 (18%)
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AAA_6 1981..2308 CDD:463697 162/368 (44%)
Dynein_C 4360..4664 CDD:465677 85/344 (25%)

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