DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dnah2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001094146.1 Gene:Dnah2 / 303242 RGDID:1565087 Length:4508 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4951 Identity:1250/4951 - (25%)
Similarity:2227/4951 - (44%) Gaps:803/4951 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    39 PEDDVVPASLNDALDDPVNQDTIRKFLSDPQVQALYVQRNCIKEDDSEQPAEGEDEKEQVTYQIS 103
            |:..|.|....:....|:        :.:|:.:.:       ||:..:...|.|:.||.   .:|
  Rat    26 PQSTVAPGVEKETSQLPI--------IPEPEYEPM-------KEESEQDLEEPEEPKEP---DLS 72

  Fly   104 NDV---------------------------HFTNSRMASLACIKRGLVVEADKSIHSQLRLINFS 141
            .||                           ||.......:      |.:..|.....:|.|    
  Rat    73 TDVKPIFLSRAMLTGLADSTWTAEHDAVLEHFAQDPSVPV------LTIFVDPVFGLKLEL---- 127

  Fly   142 DGSPYETLHA---FISKSLAPYFKSYVKESGRADRDGDKMAPSVEKKLAELEMGLLHLQQNIDIP 203
             |.|.:|.:.   ||.::..|......:|:.:.........|:           ||.|...:.:|
  Rat   128 -GMPVQTQNQIVYFIRQAPVPITPENFEETVQYGTVRGAYIPA-----------LLRLLSGVYVP 180

  Fly   204 EITLT-------AHQTVNNVIRKCAE--ENR-------------KAKVADFGDKVEDSSFLNLLQ 246
            :|.:.       .:..|:::.|..|.  :.|             :|...|....::|...:..|:
  Rat   181 QIFMNKSWPESIRNHFVSHLHRFLASLTDTRYKLEGHTVLYIPAEAITMDPAVVIKDKELVQRLE 245

  Fly   247 NGVNRWIAEIKKVTKLNRDPGSGT---ALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGK 308
            ..:..|..:||:|........:|.   .|:||.||.|....|..|.::.....|.....||...|
  Rat   246 TSMIHWTRQIKEVLSAQESVDTGENLGPLEEIEFWNNRCMDLSGISKQLVKQGVKHIESILLLAK 310

  Fly   309 RFHAT----VSFDTDTGLKQALATVA-------DYNPL--MKDFPINDLLSATELEKIRPAVQQI 360
            ..:..    ::.....|.:||.:.:.       .|..|  ||...|:|     :|.|:...::.|
  Rat   311 SSYLAPFRKLAQQIQDGSRQAQSNLTFLSILREPYQELAFMKPKDISD-----KLPKLISLIRII 370

  Fly   361 FAH-------------LRKVRN----------------------TKYPIQRCLKLIEAISRDLSQ 390
            :.:             .||:.|                      :|..:|.|:....|    ..:
  Rat   371 WVNSPHYNTRERLTGLFRKMSNEIIRLCCHSVSLDRIFEGYVSSSKEDLQGCISCCHA----WKE 431

  Fly   391 QLLKVLGTRRLMHIPFDEFERVMNQ-------------CFEIFSCWDDEY------DKLQGLLRD 436
            ..|:.:    .||..|.....|::|             |.::....|.:|      |..||.|..
  Rat   432 HYLRAV----QMHTQFSNRGWVLDQTSIFAQVDAFVQRCKDLIEVCDCQYHFARWLDGTQGPLPC 492

  Fly   437 IVKKKRDEHLKMVWRVSPA-HKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVET 500
            ....:..:..:.:..:... ||.|||                   ||.:|         |.:::.
  Rat   493 FFGAQGPQITRNLLEIEDIFHKNLQT-------------------LRAVR---------GGILDV 529

  Fly   501 K-----QPYSLDAADANAIEEV--NL---AYENVKEVD----CLDITKEGSEAWEAAVKRYEEKI 551
            |     :.|:...|....:|.:  ||   |:|.|::|:    .|| |.......||.::.||:| 
  Rat   530 KNTSWHEDYNKFRAGIKDLEVMTQNLITSAFELVRDVEHGVLLLD-TFHRLANREAIMRTYEKK- 592

  Fly   552 DRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVR------PHIRGAIREYQTQ-----LIQR 605
                                |.:::.:|:...||..|      |::...:.:|..|     :::|
  Rat   593 --------------------AVDLYMLFNSELALVNRELNKKWPYLEPYMAQYSGQAHWVRILRR 637

  Fly   606 VKDDIEALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWET- 669
            ..|.:              .:| ||....||.:                         |.|.|| 
  Rat   638 RIDRV--------------MNC-LSGAHFLPHI-------------------------GTGEETV 662

  Fly   670 HIEGQKLKADGDSFRAKLSISDVFHEWARKVQERNFGSTGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVNFL 734
            |...|.::|..:..|      ..|.||...:.:      ..|..::....||.:.....|.|||.
  Rat   663 HTYQQMVQAIDELVR------KTFQEWTATLDK------DCIRRLDMPLLRISQEKAGMLDVNFD 715

  Fly   735 PEIITLAKEVRNIKNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERTLEKLNNRSLAQNSV 799
            ..::.|..|:...:.|.|..|..::|.|.:|..:.....:|:...|.|.|.:..|   |..:.::
  Rat   716 KTLLILFVEIDYWERLLFETPHYVMNVADRAEDLRILRENLLLVARDYNRIIAML---SPDEQAL 777

  Fly   800 FKIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEGIGLIWESYKLDPYVIRLSEC----------VTQFQ--- 851
            ||...|.....:..||:|  ||...:|....:           ::||          |..|:   
  Rat   778 FKERIRFLDKKIHPGLKK--LNWALKGASAFF-----------ITECRIHASKVQMIVNDFKAST 829

  Fly   852 -------EKVDDLLVVE---EQLDVDVRSLET-CPYSAATFVEILSKIQHAVDDL--SLRQYSN- 902
                   :::.:||:|.   :|:..|:...|. ..:..|...::::..|..::.|  |...:.| 
  Rat   830 LTIGWKAQEMSELLLVHITGKQVYRDLEFEEAQREHRMAVQQKLVNLHQDVINILTNSFEVFKND 894

  Fly   903 -------LSVWVTRLDEEVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKK-------EVDTSMDTDAPAQPT 953
                   ..::..|||..:|..|.|.::..:...::|:.|:.|       .|...:.:|..    
  Rat   895 GPEIQQQWLLYTIRLDHMMEDALRLNVKWSLLELSKAINGDGKTSPNPLFRVLVILQSDVQ---- 955

  Fly   954 HKLGGDPQIQNAVHEIRITNQQM-YLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTSQVRLQSTRYQVGLEK 1017
               ||..|:     |...|.|.: .:...|....|..:..|.....|:|.:   :.||..:.:..
  Rat   956 ---GGGAQV-----EFSPTLQTLASVVNDIGSHLFSTISVFRHLPDILTKR---KMTREPIHVVV 1009

  Fly  1018 HVSQTYRNLLTKLPEGKILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRYQSLWDLQADML---YGRLG--- 1076
            ...:..|.:..::..| :..||        |.::||:..|..|:.:|::..|..   |.||.   
  Rat  1010 ERDEDIRKIQAQISSG-MTNNA--------SLLQNYLKTWDMYREIWEINKDSFIRRYQRLNPPV 1065

  Fly  1077 ----EDVNLWIKCLNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKVTLKYDSWHKEALGKFGTL 1137
                .|:..:.:..|::::..|..:...       :::|.:.::..:....:.|.    .||.||
  Rat  1066 SSFDADIARYTEVANNVQKEETVLNIQF-------VMLDCSHLKFSLVQHCNEWQ----NKFTTL 1119

  Fly  1138 LGTEMTS-----FHS--KVSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFRE 1195
            | .||.:     .|:  |.:..:.....|::|....|     :..:.:|:.|:...:.|:....|
  Rat  1120 L-KEMAAGRLMDLHTYLKDNAEKISRPPQTLEELGVS-----LQLMDTLQHDLPNLETQIPPIHE 1178

  Fly  1196 AQRILERQRFQFPNTWLH-VDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVAEDKAVETRTVD 1259
            ...|||:.....|:|.|. ::::.|||..|.:|:...:..::......:..::......:.:..:
  Rat  1179 QFTILEKYEVPVPDTVLEMLESLNGEWLTFQQILLDSEQMLKKHKEKFKTGLIHAADDFKKKAHN 1243

  Fly  1260 FLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEALELQESAVPNNSAERMNV 1324
            .|.|:|...|....:....||.|:....:....::||..|:.......::::..    |.:..|:
  Rat  1244 LLEDFELKGPFTSNVGHTAALDQIAQVRAMLMAMREEESNLRSNLGIFKIEQPI----SKDLQNL 1304

  Fly  1325 ALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETREKPW--------LSVQPRKLRQQLEAMMAQLKELPARL- 1380
            . :||..|:.|| |:::.|       |:.|        |::|...:......:..:|..|.... 
  Rat  1305 E-KELDALQQVW-EITRDW-------EESWNQWKTGCFLTLQTEAMESMAHGLFRRLTRLAKEYK 1360

  Fly  1381 -RMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLR--VNWVLSDLSLGQVWDVNL 1442
             |.:|..|..:..|:.:.:...||.:|::.||:||||.|:.::::  .:......:|.|:..:.:
  Rat  1361 DRNWEVIETTRAKIEQFKRTMPLISDLRNPALRERHWDQVKEEIQREFDQESESFTLEQIVKLGM 1425

  Fly  1443 QKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINYQNK-CRIIRGWDDLFNKVKEHINS 1506
            .::...:.:|...|..|:|:|..|:.:.::|.:.:||::.|::| ...:||.:::|..::::..:
  Rat  1426 DQHVEKIAEISASATKELAIEVGLQNIAKTWDSTQLDIVPYKDKGHHRLRGTEEVFQALEDNQVA 1490

  Fly  1507 VAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRF 1571
            ::.||.|.:.|.||::...||..|:.|..:.::.:.|||:|:|||.||.|. ||:..||.|::.|
  Rat  1491 LSTMKASRFVKAFEKDVDHWERCLSLILEVIEMVLTVQRQWMYLENIFLGE-DIRKQLPNESALF 1554

  Fly  1572 QSISSEFLGLMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERTSFPRFYFVG 1636
            ..:::.:.|:|.::.|....:...:.|.:..:|..:..:|..|||:|..|||.:|..||||||:.
  Rat  1555 DQVNNNWKGIMDRMNKDNNALRSTHYPGLLETLIEMNTILEDIQKSLDMYLETKRHMFPRFYFLS 1619

  Fly  1637 DEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEENN-----VILGISSREGEEVHFMNPVSTV 1696
            ::|||||:|.|:|...:|.|.||.|..:..:.:.:...     ..:|:.|.:||.:.|::||  :
  Rat  1620 NDDLLEILGQSRNPEAVQPHLKKCFDNIKLLKIQKVGGSSSKWEAVGMFSGDGEYIDFLHPV--L 1682

  Fly  1697 EHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQF---RDGKIDPQAYMEWCDKYQAQIVVLAAQI 1758
            ....:..||..||:.||.||..||......:|:|   ||         :|...:..|:|:.|:||
  Rat  1683 LEGAVESWLGDVERAMRMTLRDLLRNCRMALKKFLNKRD---------KWVKDWAGQMVITASQI 1738

  Fly  1759 LWSEDVESALQQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTV 1823
            .|:.||...|..|.|.:..|.::.:.....|.||..::::......:.|.|:..|:...:|.|.|
  Rat  1739 QWTADVTKCLMTAKERSDKKILKVMKKKQVSILNKYSEAIRGNLTKIMRLKIVALVTIEIHARDV 1803

  Fly  1824 TRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTD 1888
            ..:|...|:....:|.||.::|||::    :.:....|...|.:|.||:||||...|||.|||||
  Rat  1804 LEKLYKGGLMDVNAFDWLSQLRFYWE----KDVDDCIIRQTNTQFQYGYEYLGNSGRLVITPLTD 1864

  Fly  1889 RCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQV 1953
            |||:|:|.||....||||.|||||||||:||.||..||.:|:|.||.|..|:::|||::.||.|.
  Rat  1865 RCYMTLTTALHLHRGGSPKGPAGTGKTETVKDLGKALGTYVIVVNCSEGLDYKSMGRMYSGLAQT 1929

  Fly  1954 GAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNP 2018
            |||||||||||:...:||..:|||.:|..||    .:|......|  |.::.:.....|||||||
  Rat  1930 GAWGCFDEFNRINIEVLSVVAQQILSILSAL----TANLTRFYFE--GFEINLVWSCGIFITMNP 1988

  Fly  2019 GYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSH 2083
            |||||:.||:|||.:||.:||..||..||||::||.:||.:.:.||.|:...:.|..:|||.|.|
  Rat  1989 GYAGRTELPENLKSMFRPIAMVVPDSTLIAEIILFGEGFGNCKILAKKVYTLYSLAVQQLSRQDH 2053

  Fly  2084 YDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKL 2148
            ||||||||.|:|..||..:|                      :..:|.::|:|:.|:.:..:.||
  Rat  2054 YDFGLRALTSLLRYAGKKRR----------------------LQPDLTDEEVLLLSMRDMNIAKL 2096

  Fly  2149 VAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGST--W 2211
            .:.|:||..:::.|:|||:.....:...|::.|.:..:                 |.||..|  .
  Rat  2097 TSVDVPLFNAIVQDLFPNIELPVIDYGKLRDTIEQEIR-----------------EMGLQITPFT 2144

  Fly  2212 VDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKAL--------ERFEGVEGVAHVIDPKAIS 2268
            :.||||||:..|..|..|:||.:||.|:|:|:.|..:|        ..|..|:  ...::|||:|
  Rat  2145 LTKVLQLYETKNSRHSTMIVGGTGSSKTTSWRILQASLTSLCRAGEPNFNIVK--EFPLNPKALS 2207

  Fly  2269 KEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLL 2333
            ...|||..|.||.|||||:.:.::|....:.:.:   .:||:|||.||..|:|::|||:||||:|
  Rat  2208 LGELYGEYDLNTNEWTDGILSSVMRAACADEKPD---EKWILFDGPVDTLWIESMNSVMDDNKVL 2269

  Fly  2334 TLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPLEDG 2398
            ||.||||:::|..|.::|||::|..|:.|||||||||:.....|......:::|.:.....:|..
  Rat  2270 TLINGERIAMPEQVSLLFEVENLAVASPATVSRCGMVYTDYVDLGWTPYVQSWLEKRPKAEIEPL 2334

  Fly  2399 DEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTRLRALS 2463
            ...|          |:.::..|..::|....|:|.....||:                    :|.
  Rat  2335 QRMF----------EKFINKILTFKKDNCNELVPVTEYSGII--------------------SLC 2369

  Fly  2464 SLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFPCSADQLEHYIPKALVYSVLWSFAGDAKLKVRIDLGDFVRSV 2528
            .|:::|......|         .|...:.....:....|:|::||.........|..:..::|.:
  Rat  2370 KLYTVLATPENGV---------NPADTENHAFMVEMTFVFSMIWSVCASVDEDGRKKIDSYLREI 2425

  Fly  2529 TTVPLPGAAGA-----PIIDYEVN-MSGDWVPWSNKVPVIEVETHKVASPDIVVPTLDTVRHESL 2587
                    .|:     .:.:|.|| ....|..:..::|.............|:|||:||||:..|
  Rat  2426 --------EGSFPNKDTVYEYYVNPKMRTWSSFEEQLPKSWRYPPNAPFYKIMVPTVDTVRYNYL 2482

  Fly  2588 LYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDME--VVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRK 2650
            :.|.:|...|::|.||.|:|||....|.|::||..:  |:.:|.|:.||...:....:...|.|.
  Rat  2483 VSTLVANQNPVLLVGPVGTGKTSIAQSVLQSLPSSQWSVLVVNMSAQTTSNNVQSIIESRVEKRT 2547

  Fly  2651 ----TPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQAWVSLE 2711
                .|.|        ||.::.|.|::|:|..|.:|:|..:..:|..::: ||:....:..:...
  Rat  2548 KGVYVPFG--------GKSMITFMDDLNMPAKDMFGSQPPLELIRLWIDY-GFWYDRVKQTIKHI 2603

  Fly  2712 RIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIYGTFSRAMLRLMPALRGYAE-- 2774
            |..|:.|...|...||..:|.|......||.:.:|.|:.:.:|:||.      :...|:.:.|  
  Rat  2604 RDMFLMAAMGPPGGGRTVISPRLQSRFNIINMTFPTESQIIRIFGTM------INQKLQDFEEEV 2662

  Fly  2775 -PLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQP-----HYVYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLPVEGLVRLWA 2833
             |:.|.:.|..|...:...|...|     ||:::.|::::..:|:..|.:....... .:.|||.
  Rat  2663 KPIGNVVTEATLDVYNTVVQRFLPTPAKIHYLFNLRDISKVFQGMLRANKDFHDTKA-SITRLWI 2726

  Fly  2834 HEALRLFQDRLVDDSERRWTNENIDLVGQKHFPGINQEE-------------ALQRPILYSNWLS 2885
            ||..|:|.|||||.::            .:.|.||..::             ..:||.::.::|.
  Rat  2727 HECFRVFSDRLVDTTD------------MEAFIGILSDKLGTFFDLTFHHLCPNKRPPIFGDFLK 2779

  Fly  2886 KDYMPVNREELREYVHARLKVFYEEELD----------VPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHL 2940
            :   |...|:|.:.  :.||...|..|:          :.||||.|.::|:.||.|:..||:|::
  Rat  2780 E---PKVYEDLVDL--SVLKTAMETALNEYNLSPSVVQMQLVLFREAIEHITRIVRVIGQPRGNM 2839

  Fly  2941 LLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESN 3005
            ||:|:.|:|:.:|:|..:.:...:.|||:|...|..::|.:|::.:.|::|.:.:..:|:..::.
  Rat  2840 LLVGIGGSGRQSLARLASSICEYNTFQIEVTKHYRKQEFRDDIKRLYRQAGVELQATSFLFVDTQ 2904

  Fly  3006 VLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLH 3070
            :.|..|||.:|.:|::||||.|::.||:..:..|..:.|:.|.:. :|||.|:.:..::|..|||
  Rat  2905 IADESFLEDINNILSSGEVPNLYKADEFEEIQNQIIDQARAEQIS-ESSDSLFAYLIERVRNNLH 2968

  Fly  3071 VVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDL-EKPNWHAPDFFP 3134
            :|..::|..|..::.....|||.|...:|||.:|...||.:|.:::...||| .:.|.|.     
  Rat  2969 IVLCLSPVGDPFRNWIRQYPALVNCTTINWFSEWPREALLEVAEKYLVGVDLGTQENIHR----- 3028

  Fly  3135 SVCPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRS 3199
                          .|....|.:|.::.|.:.::.....|...|||.:||:.:..:.||..|||.
  Rat  3029 --------------KVAQIFVTMHWSVAQYSQKMLLELRRHNYVTPTNYLELVSGYKKLLGEKRQ 3079

  Fly  3200 DLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQS 3264
            :|.:|...|..||.||.||.|:||.|...|...|:::....:.....|..:.|.::||::     
  Rat  3080 ELLDQANKLRTGLFKIDETREKVEVMSLELEDAKKKVAEFQKQCEEYLVIIVQQKREADE----- 3139

  Fly  3265 QEIQIRLADQTVKIEEKRKYVMADLAQVE-----PAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVV 3324
            |:..:....:.:.|||.:...:||.||.:     ||:.:|..|::|:.|:.:.|:::...||:.|
  Rat  3140 QQKAVTANSEKIAIEEVKCQALADNAQKDLEEALPALEEAMRALESLNKKDIGEIKSYGRPPAQV 3204

  Fly  3325 KLALESICLLLGENATDWKSIRAVIMRENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEK 3389
            ::.::::.:|.|...| |...:..:..:|||.|:: .|..:||:|.|.:|: ..|.:.||:..:.
  Rat  3205 EIVMQAVMILRGNEPT-WAEAKRQLGEQNFIKSLI-YFDKDNISDKVLKKI-GAYCAQPDFQPDI 3266

  Fly  3390 VNRASMACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKETKDLVEQLERSIAA 3454
            :.|.|:|...:..|..|...|..:.:.|||.|..:.:...|.....|:..|.::.:.::...:..
  Rat  3267 IGRVSLAAKSLCMWVRAMELYGRLYRVVEPKRIRMNAAIAQLQEKQAALAEAQEKLREVAEKLEM 3331

  Fly  3455 YKEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSA 3519
            .|::|.:.::|.:.::...|.::.|::|:..|:..|..|:.|||.|.:..:..:..::||.|::|
  Rat  3332 LKKQYDEKLAQKEELRKKSEEMELKLERAGMLVSGLAGEKARWEETVQGLEEDLGYLVGDCLIAA 3396

  Fly  3520 AFIAYGGYFDQHYRLNLFT-TWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTE 3583
            ||::|.|.|..:||..:.. .|.:.:....:......|...:|:||.:...|....||:|...||
  Rat  3397 AFLSYMGPFLTNYRDEIVNQIWIKKIWELQVPCSPRFAIDNFLTNPTKVRDWNIQGLPSDSFSTE 3461

  Fly  3584 NAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLLNEYA--GKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV 3646
            |.|::.|.||:.|:|||..||..::.|...  |.||......|  :.:.||.|::||.|:|:|:|
  Rat  3462 NGIIVTRGNRWALMIDPQAQALKWIKNMEGNQGLKIIDLQMHD--YLRVLEHAIQFGFPVLLQNV 3524

  Fly  3647 ENY-DPILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFT 3710
            :.| ||.||||||:.:.|.|||:|:.:.|::::.:|:|..:|:|:.....:.|:..::.|.|||.
  Rat  3525 QEYLDPSLNPVLNKSVARIGGRMLMRIADKEVEYNPNFRFYLTTKLSNPHYSPETSAKTTIVNFA 3589

  Fly  3711 VTRSSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVI 3775
            |....|::|.|..|::.|||:::|::..|:......:.:|::||..:|:.||:|.|.:|||..::
  Rat  3590 VKEQGLEAQLLGIVVRKERPELEEQKDSLVINIAAGKRKLKELEDEILRLLNEATGSLLDDVQLV 3654

  Fly  3776 TTLETLKKEAYDINQKVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKMF 3840
            .||:|.|..|.::.::::.::.....|:...:.|.|.:...|.::|.::.:.::..:||:||..:
  Rat  3655 NTLQTSKITATEVTEQLETSETTEINIDLAREAYRPCAQRASVLFFVLNDMGRIDPMYQFSLDAY 3719

  Fly  3841 LDIFSTVL---YNNPKLEGRTD-----HSERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMCK 3897
            :.:|...:   :.:.|||.|.:     |:           ...|....|.:....:|.|:..||.
  Rat  3720 ISLFILSIDKSHRSNKLEDRIEYLNDYHT-----------YAVYRYTCRTLFERHKLLFSFHMCA 3773

  Fly  3898 IHLKGTSESNLDAEFNFFLR-----SREGLLANPTPVEGLSAEQIESVNRLALRLPIFRKLLEKV 3957
            ..|:.:.:.|:| |:|||||     .|||.:.||. ...|:....:::..|. :|..|..|:...
  Rat  3774 KILETSGKLNMD-EYNFFLRGGVVLDREGQMDNPC-TSWLADAYWDNITELD-KLTNFHGLMNSF 3835

  Fly  3958 RSIP-ELGAWLQQSSPEQ-VVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLG 4020
            ...| :...|...|:||: ::|..|:.:      .:.:.::|::::.|.|||.....:.:.:.||
  Rat  3836 EQYPRDWHLWYTNSNPEKAMLPGEWENA------CNEMQRMLIVRSLRQDRVAFCVTSFIVSNLG 3894

  Fly  4021 EDFMPNAEQELDFTSVVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQN--KQISSIAIGSAEGF 4083
            ..|:   |..:....:|.:.....:|.:....||.|.:..:..||....  .:..::::|..:. 
  Rat  3895 SRFI---EPPVLNMKLVMEDSTPRSPLVFILSPGVDPTSALLQLAEHTGMAHRFHALSLGQGQA- 3955

  Fly  4084 NQAERAINMACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSLQ---PHSGFRLFLTMEINPKVPVNLL 4145
            ..|.|.:......|.||.|.|.||:..|:..|:|.:..||   ||..|||:|:...:|..|:::|
  Rat  3956 PIAARLLREGVNQGHWVFLANCHLSLSWMPNLDKLVEQLQVEDPHPSFRLWLSSSPHPDFPISIL 4020

  Fly  4146 RAGRIFVFEPPPGIRANLLRTFSTVPAARM--MKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWA 4208
            :|......|||.|::||:.|.:..:..|:.  ...|::..:|.|.|.:||:|:.||.:::.|||.
  Rat  4021 QASIKMTTEPPKGLKANMTRLYQLMTEAQFTHCSKPTKYKKLLFALCFFHSILLERKKFLQLGWN 4085

  Fly  4209 KKYEFNESDLRVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTS 4273
            ..|.||:||..|:.:.|..::|..         |:.|||||..|::...|||.:.:|:|:||||:
  Rat  4086 IIYGFNDSDFEVSENLLSLYLDEY---------EETPWDALKYLIAGVNYGGHVTDDWDRRLLTT 4141

  Fly  4274 FLKKLFTARSFEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAE 4338
            ::...|...|.......::.:|      .:....||:... :.::|..|.....|...|...||:
  Rat  4142 YINDYFCDLSLTTPSYRLSVLD------TYYIPKDGSLAS-YKEYISLLPSMDPPEAFGQHPNAD 4199

  Fly  4339 KVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLELL 4403
            .....|....|...||             |::.|...:.:|    |:....|.|..:|.. .:.:
  Rat  4200 VASQITEARTLFETLL-------------SLQPQITPTRIG----GQSREEKVLELAADV-KQKI 4246

  Fly  4404 PK--NLQVLKRTVENIKDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSE 4466
            |:  :.:..::.:.....||.....:|:...::|::|::..|.|:....||....:.....:.:.
  Rat  4247 PEMIDYEGTRKLLALDPSPLNVVLLQEIQRYNKLMKTILFSLTDLEKGIQGLIVMSTSLEEIFNC 4311

  Fly  4467 LVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFPV--WLGGLLNP 4529
            :....:|..|.: ..|:...:..|..|.:.||:|.:..:.....         ||  ||.|...|
  Rat  4312 IFDAHVPPLWGK-VYPSQKPLASWTRDLAVRVEQFETWANRAHP---------PVLFWLSGFTFP 4366

  Fly  4530 EAYITATRQCVAQANSWSLEELALDV---TITDAGLKNDQKDCCFGVTGLKLQGA--QCKNNELL 4589
            ..::||..|..|:.|:.|::.|:.:.   |:.|:.|....||..: |.||.|:||  ..||:.|:
  Rat  4367 TGFLTAVLQSAARQNNISVDSLSWEFIVSTVDDSNLVYPPKDGVW-VRGLYLEGAGWDRKNSCLV 4430

  Fly  4590 LASTIMMDLPVTILKWIKISSEPRISK--LTLPVYL------NSTRTELLFTVDLAVAAGQESHS 4646
            .|..:.:...:..:.:....|..:.:|  .:.|.|.      ::.|...:..:||...|....| 
  Rat  4431 EAEPMQLVCLMPTIHFRPAESRKKSAKGMYSCPCYYYPNRAGSADRASFVIGIDLRSGAMTSDH- 4494

  Fly  4647 FYERGVAVLTS 4657
            :.:||.|:|.|
  Rat  4495 WIKRGTALLMS 4505

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 133/693 (19%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 966/3439 (28%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 69/329 (21%)
Dnah2NP_001094146.1 DHC_N1 241..798 CDD:462457 131/676 (19%)
DHC_N2 1301..1709 CDD:462462 120/419 (29%)
DYN1 1368..4189 CDD:227570 890/3036 (29%)
AAA_6 1846..2172 CDD:463697 159/370 (43%)
Dynein_C 4204..4504 CDD:465677 69/329 (21%)

Return to query results.
Submit another query.