DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dnah5

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759046.2 Gene:Dnah5 / 294854 RGDID:1560828 Length:4621 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5008 Identity:1271/5008 - (25%)
Similarity:2221/5008 - (44%) Gaps:857/5008 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    65 LSDPQVQALYVQRNCIKEDD------------------------------SEQPAEGEDEKEQVT 99
            |:.|:|:...::.|.|:..|                              ...||.|:.:|.:|.
  Rat    50 LNKPEVEDALLEGNQIERIDQLFAVGGLRHLMFYYQDVEGAEAGQFGSSGGVNPASGKMKKPKVF 114

  Fly   100 YQISNDVHFTNSRMASLACIKRGLVVEADKS-------IHSQL--RLINFSDGSPYETLHAFISK 155
            .....||....      ||:   ....||.|       ||.::  ..::.:||....::...:|.
  Rat   115 VTEGKDVALMG------ACV---FFTRADPSKAITAENIHREVSFNTLDTADGGLLNSVRRLLSD 170

  Fly   156 SLAPYFKSYVKESGRADRDGDKMAPSVEKK-LAELE--MGLLHLQQNIDIPEITLTAHQTVNNVI 217
            ...|..::  ...|..:.:|.:.|.|:::: |:.||  :|:|...||        :..:.||  :
  Rat   171 IFIPALRA--SSHGWGELEGLQDASSIQQEFLSSLEGFVGILSGAQN--------SLKEKVN--L 223

  Fly   218 RKCAEENRKAKVADFGDKVEDSSFLNLLQNG---------VNRWIAEIKKV----TKLNRDPGSG 269
            :||       .:.:.....|...:|.|..|.         :..||.:::::    .:|.::....
  Rat   224 QKC-------DIVELKSLKEPMDYLALASNPETVEKVECCMRVWIKQMEQILAENNQLRKEADDV 281

  Fly   270 TALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGKRFHATVSFDTDTGLKQALATVAD--- 331
            ....|:..|.........:.::.:||:|...|.:|...|.....|..|.|..:..|.....|   
  Rat   282 GPRAELEHWKKRLSKFNYLLDQLKSPDVKAVLAMLAAAKSKLLKVWRDADIRVTDAANEAKDNVK 346

  Fly   332 --------YNPLMKDFPINDLLSATELEKIRPAVQQIFAHLRKVRNTKYPIQRCLKLIEAISR-- 386
                    .:||....|:      |.::.|...:..|                  |:|.:||.  
  Rat   347 YLYTLEKCCDPLYSSDPV------TMVDAIPTLINAI------------------KMIYSISHYY 387

  Fly   387 DLSQQLLKVLGTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSC------------WDDEYDKLQGLLRDIVK 439
            :.|:::..:             |.:|.||.  |.:|            |....|.:...:...:|
  Rat   388 NTSERITSL-------------FVKVTNQM--ISACKAHITNNGTATIWSQPQDIVMQKIAAAIK 437

  Fly   440 KKRD-----EHLKMVWRVSPAHKKLQ-TRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVV 498
            .|:.     :..|...:.:|:.|:.. :.|....||...|::|..::               ::.
  Rat   438 LKQGYQCCFQETKQKLKQNPSEKQFDFSEMYIFGKFETFHQRLAKIM---------------DIF 487

  Fly   499 ETKQPYS-LDAADANAIEEVNLAYENV------KEVDCLDITK-EGSEAWEAAVKRYEEKIDRVE 555
            .|.:.|| |..:....:|::...|::|      ||.:.||..| :..:.::...|:..|....::
  Rat   488 TTFKTYSVLQDSKIEGLEDMVTKYQDVVAGIKKKEYNFLDQRKMDFDQDYDEFCKQTNELHSELQ 552

  Fly   556 TRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDIE---ALHEKF 617
             |......:::.:.:.|....:.|.|.|.    |:: |...:||. :.|....||:   .|:.|.
  Rat   553 -RFMDTTFEKIQSTRQALSTLKKFERLNI----PNL-GIEAKYQI-VFQNFGTDIDMISKLYTKQ 610

  Fly   618 KVQYPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWETH------IEGQK- 675
            |...|.:        ||.||:||.|:||||:.::|...::.        ::.|      :|.:. 
  Rat   611 KYDPPLA--------RDQPPIAGKILWARQLFHRLEQPMQL--------FQQHPFVLRTVEAKPV 659

  Fly   676 LKADGDSFRAKLSISDVFHE-WARKVQERNFG----------STGRIFTIESTRSRIGRGNVLRL 729
            :::.....:..|....::|. |.::::|.:.|          .||::|                 
  Rat   660 IRSYNRIAKVLLEFEVLYHRAWLQQIEEIHVGLEASLLVKAPGTGQLF----------------- 707

  Fly   730 RVNFLPEIITLAKEVRNIKNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERTLEKLNNRSL 794
             |||.|:|:.|.:|.:.:..:|..|.              |:|.:|.|....|::....: ...|
  Rat   708 -VNFDPQILILFRETQCMSQMGLPVS--------------PFAAALFEKRDMYKKNFSDM-KMML 756

  Fly   795 AQNSVFKIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEGIG-----LIWESYKLDPYVIRLSECVTQFQ--- 851
            ::....|::    :.|.:..|....|..|.|.:.     |.|.|..:..|:....|.:...:   
  Rat   757 SEYQRVKLK----MPPAIEQLMLPHLARVDEALQPGLAVLTWTSLNIGTYLENAFEKIKDLELLL 817

  Fly   852 EKVDDLL------VVEEQLDVDVRSL-ETCPYSAATFVEIL---------------SKIQHAVDD 894
            ::::||:      ::||...|.:..| :..|.:...|:::.               |.::.||::
  Rat   818 DRINDLIEFRIHAILEEMSSVALCQLPQDDPLTCEEFLQMTKDLCVNGAQKLHFKSSLVEEAVNE 882

  Fly   895 LSLRQYSNLSVWVTRLDEEVEKKL------------------ALRLQAGIQAWTEAL-----TGN 936
            |     .|:.:.|..|.||..:|:                  |..|.:...|.|.:|     ...
  Rat   883 L-----INMLLDVDVLPEEASEKVRHENASPNGDTSGGGEGCAEALASSFNAGTSSLPLTTIARK 942

  Fly   937 KKEVD------------TSMDTDAPAQPT--------------HKL------GGDPQIQN----- 964
            |||::            ...:|||..:.|              |.:      |.....||     
  Rat   943 KKEMEVLEEARELLSYFNHQNTDALLKVTRNTLEAIRRRIHFSHMINFRDSKGASKVKQNHLPIF 1007

  Fly   965 ------AVHEIRITNQQMYLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTSQVRLQSTRYQVGLEKHVSQTY 1023
                  |:..|.:|       |::|:.:                |...::....:.:.|.|.|..
  Rat  1008 RASVTLAIPNISMT-------PALEDIQ----------------QTLNKAVECIISVPKGVRQWS 1049

  Fly  1024 RNLLTKLPEGKILENAYGAIEQKV-----SEV-RNYVDEWLRYQSL---WDLQADMLYGRLGEDV 1079
            ..||:|   .|:.|....|::...     :|| .:.:.|.|...|:   ..:|....|..:.::.
  Rat  1050 SELLSK---RKMRERKMAAVQSNEDSDSDTEVEESELQETLELASVNLPIPVQTQNYYKNISDNK 1111

  Fly  1080 NL-----------------------WIKCLNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDY--------- 1112
            .:                       ..||.|.|.|.... ||..|..|..|::.::         
  Rat  1112 EIVKLVSVLSTVISSTKKEVITSMDRFKCYNHIWQKEKE-DTIMTFIAQNPLLSEFESRILYFQS 1175

  Fly  1113 ---------------------AKVQAKVTLKYDSWHKEALGKFGTL--------LGTEMTSFHSK 1148
                                 |.::..:|.:..:| ...||:....        :.|.:..|..|
  Rat  1176 LEQEINAEPEYICVGSIALYTADLKFSLTAETKAW-MMVLGRHCNRKYRSEMENIFTVVEEFQKK 1239

  Fly  1149 VSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFPNTWL- 1212
            :::...||:...|..|:          ::.:::..|:.|.||....|:..:|.:.........: 
  Rat  1240 LNRPIKDLDDIRIAMAA----------LKEIREQQISTDFQVGPIEESYALLNKYGLLVAKEEMD 1294

  Fly  1213 HVDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVAE-DKAVETRTVD---FLNDWEKTKPTGGK 1273
            .||.:...|    |.:..:.:.:|.::.:||.....| ...||....|   |..|::...|....
  Rat  1295 KVDTLRYAW----EKLLARASDVQNELGALQPSFRKELISTVEVFLQDCQQFYLDYDLNGPMVSG 1355

  Fly  1274 IRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEALELQESAVPNNSAERMNVALEELQDLRGVWSE 1338
            ::|.:|..:|.||::::..:..:.......:|...|..:..|     ::....::|..|:.::|.
  Rat  1356 LKPQEASDRLIIFQNQFDNIYRKYITYTGGEELFGLPVTQYP-----QLLEIKKQLNLLQKIYSL 1415

  Fly  1339 LSKVWTQIDETREKPWLSVQPRKLRQQLEAMMAQLKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLI 1403
            .:.|...::..::..|..|...|:..:|.....:.::||..|:.::::..:||.|..:.:...|:
  Rat  1416 YNNVIETVNSYQDTLWSEVNIEKINSELLEFQNRCRKLPRALKDWQAFLDMKKTIDDFSECCPLL 1480

  Fly  1404 VELKSDALKERHWKQLT----KQLRVNWVLSDLSLGQVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEE 1464
            ..:.|:|:.||||:::|    ..|.|.  .....|..:.:|.|.|.:..::||.:.|..|..:|:
  Rat  1481 EYMASNAMVERHWQRITTLTGHSLDVG--NETFKLRNIMEVPLLKYKEEIEDICISAVKERDIEQ 1543

  Fly  1465 FLKQVRESWQNYELDLINYQNKCRIIRGWD---DLFNKVKEHINSVAAMKLSPYYKVFEEEALTW 1526
            .||||...|.|..|...:::.:..::...|   ::...:::.:..:.::..:.|...|:.:...|
  Rat  1544 KLKQVINEWDNKTLTFSSFKTRGELLLRGDSTSEVIASMEDSLMLLGSLLSNRYNMPFKAQIQNW 1608

  Fly  1527 EEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSPKV 1591
            .:.|:....:.:.|:.||..|:|||.:|.| .||...||.|..||.:|...::.:|.:..:.|.|
  Rat  1609 VQCLSNSTDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVG-GDIAKQLPKEAKRFSNIDKSWVKIMTRAHEIPNV 1672

  Fly  1592 MD-VLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQK 1655
            :. .:....:.:.|..|.|.|...||:|..|||::|..||||:||.|..||||:|.:.:...:|.
  Rat  1673 VQCCVGDETMGQLLPHLLDQLEICQKSLTGYLEKKRLCFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQA 1737

  Fly  1656 HFKKMFAGVAAILLNEE-NNVILGISSREGEEVHFMNPVSTVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASL 1719
            |...:|..:..:..::: .:.||.|||||||.:....||  :....:..||:.:.::.:.:|..:
  Rat  1738 HLLNVFDNIKTVKFHDKIYDRILSISSREGETIELDKPV--MAEGNVEVWLNSLLEESQSSLHLV 1800

  Fly  1720 LAQAVQDIKQ--FRDGKIDPQAYMEWCDKYQAQIVVLAAQILWSEDVESALQQASENNQSKPMQR 1782
            :.||..:|::  |:        .:|:...:.||:.:|..|:||:.|.|.|||.|..:  .|.||:
  Rat  1801 IRQAAANIQESGFQ--------LIEFLSSFPAQVGLLGIQMLWTRDSEEALQNAKFD--KKIMQK 1855

  Fly  1783 VLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFY 1847
            ...:....||:|.:...::...:.|.|.|.||...||:|.:...|.:..|.||..|:||.:.|||
  Rat  1856 TNQSFLELLNMLIEMTTKDLSSMERVKYETLITIHVHQRDIFDDLCHMHVKSPTDFEWLKQCRFY 1920

  Fly  1848 FDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGT 1912
            |    .|...:..||:.:..|.|..|:||..||||.||||||||:|:.|||...:||:|.|||||
  Rat  1921 F----KEDSDKTMIHITDVAFTYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPAGPAGT 1981

  Fly  1913 GKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQI 1977
            ||||:.|.:|..||::|:||||.:..||:.:||||.||.|.|:|||||||||::..:||..:|||
  Rat  1982 GKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIDLPVLSVAAQQI 2046

  Fly  1978 QTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTP 2042
            ..|   |..:.:..|..|..:  |..|.::|:..:|:|||||||||..||:|||..|||:||..|
  Rat  2047 SII---LTCKKEHKKSFIFTD--GDNVTMNPEFGLFLTMNPGYAGRQELPENLKINFRSVAMMVP 2106

  Fly  2043 DRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIM 2107
            |||:|..|.|.|.||.....||.|....::||:||||.|.|||||||.:.|||.:.|..||    
  Rat  2107 DRQIIIRVKLASCGFIDNVVLARKFFTLYQLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKR---- 2167

  Fly  2108 KIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRA 2172
                            ||..:.  |..|:::.:.:..:.||:.||.||..||:.|:|||:...:|
  Rat  2168 ----------------ASHTDT--ESTIVMRVLRDMNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPNILLDKA 2214

  Fly  2173 EMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSG 2237
            ....|:..|.|..:|..|:               ....|..||:||::...:.||:|.:||||||
  Rat  2215 GYPELETAISKQVEEAGLI---------------NHPPWKLKVIQLFETQRVRHGMMTLGPSGSG 2264

  Fly  2238 KSTAWKTLLKALERFEGVEGVAH---VIDPKAISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNV 2299
            |::...||:||:...    |..|   .::||||:...::|.||..|.:||||:|:.:.||.:...
  Rat  2265 KTSCIHTLMKAMTDC----GKPHREMRMNPKAITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLKAK 2325

  Fly  2300 RGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATV 2364
            :||   ..||:.||.||..|:|||||||||||.|||.||:|:.:.||.:::||..::..|:.|||
  Rat  2326 KGE---HIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIDNASPATV 2387

  Fly  2365 SRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPLEDGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALL 2429
            ||.|||:.|..||....|.|.:|.| ||                  .:|.|:...|..:      
  Rat  2388 SRNGMVFMSSSVLDWSPILEGFLKR-RS------------------PQEAEILRQLYAE------ 2427

  Fly  2430 LLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTR-LRALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFPCSADQL 2493
              .|.......::.||:.|:.......|: ...|..|.....||                 .|..
  Rat  2428 --TFPDLYRFSIQNLEFKMEILEAFVITQSTHMLQGLIPTKEQA-----------------GDVD 2473

  Fly  2494 EHYIPKALVYSVLWSFAGDAKL--KVRIDLGDFVRSVTTVPLPGAA--GAPIIDYEVNMSGDWVP 2554
            ..::.:..|::::||.....:|  :.|::|....|...|:.||...  |..:.||.|...|.|..
  Rat  2474 PEHLGRLFVFAMMWSVGAVLELEGRRRMELWLRSREGPTLHLPQLTDPGDTMFDYYVAPDGTWRH 2538

  Fly  2555 WSNKVPVIEVETHKVASPD-------IVVPTLDTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTL 2612
            ||..:|      ..|..||       |:||.:|.||.:.|:.|...:.|.::|.|..|:.||:.:
  Rat  2539 WSMCIP------EYVYPPDTTPEYGSILVPNVDNVRTDFLIKTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTVII 2597

  Fly  2613 FSALRAL-PDMEVV-GLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINL 2675
            ...:... |:...| .|||||||||.:..:|.:.|.:.|.   |....| ..||.:.:|.|::|:
  Rat  2598 KGFMSKFDPESHTVKNLNFSSATTPLMFQRTIESYVDKRM---GTTYGP-PAGKKMAVFIDDLNM 2658

  Fly  2676 PDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQA-WVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVP 2739
            |.::.:|.|.....:|||:|..|||...... :.|:..|||:.|...| ..||..:..|..|...
  Rat  2659 PVINEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFYNLEKPGEFTSIVDIQFLAAMIHP-GGGRNDIPQRLKRQFS 2722

  Fly  2740 IIYVDYPGETSLKQIYGTFSRAMLRLMPALRGYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQ----DMQP--- 2797
            |.....|.:.|:.:|:|.....   ...|.||:::.:.:|:::....:: |..|    .|.|   
  Rat  2723 IFNCTLPSDASMDKIFGVIGEG---YYCAQRGFSKEVQDAVIKLVPLTR-RLWQMTKLKMLPTPA 2783

  Fly  2798 --HYVYSPREMTRWVRGI----CEAIRPLDSLPVEGLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRWTNEN 2856
              |||::.|:::|..:|:    .|.|:..|.     |:|||.||..|:..||....|:..|.::.
  Rat  2784 KFHYVFNLRDLSRIWQGMLNITSEVIKDTDE-----LLRLWKHECKRVIADRFSMSSDVTWFDKA 2843

  Fly  2857 -IDLV----GQKHFPGIN----------------------QEEALQRPILYSNWLSKDYMPVNRE 2894
             :.||    |::..|.::                      :|...:.|.||....|.:::     
  Rat  2844 VVSLVEEEFGEEKTPVVDCGVDAYFVDFLRDAPEATGETPEETDAEMPKLYEPIASLNHL----- 2903

  Fly  2895 ELREYVHARLKVF---YEEEL---DVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTL 2953
                  ..||.||   |.|.:   .:.:|.|.:.:.|:::|.|:.|.|:|:.||:||.|:||.:|
  Rat  2904 ------QERLSVFLQLYNESIRGTGMDMVFFRDAMVHLVKISRVIRTPRGNALLVGVGGSGKQSL 2962

  Fly  2954 SRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTL 3018
            :|..:::.|.:.|||.:...|.:.:..|||:.:.|.:|.:.:.|.||..::.:.:..|||.||.:
  Rat  2963 TRLASFIAGYTSFQITLTRSYNTSNLMEDLKVLYRTAGQQGKGITFIFTDNEIKEESFLEYMNNV 3027

  Fly  3019 LANGEVPGLFEGDE-------YTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMN 3076
            |::|||..||..||       .|::|.  ||..:|.    .::|.||::|..:|..|||:|...:
  Rat  3028 LSSGEVSNLFARDEIDEINSDLTSIMK--KEHPKRP----PTNDNLYEYFMSRVRGNLHIVLCFS 3086

  Fly  3077 PSTDGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVC---- 3137
            |..:..::||...|||.:.|.::||..|...||..|.:.|.:..:::             |    
  Rat  3087 PVGEKFRNRALKFPALISGCTIDWFSRWPKDALVAVSEHFLSSYNID-------------CTAEI 3138

  Fly  3138 --PLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSD 3200
              .||....:.:|.|...|           |...:|..|:..|||:.||.||..:..:|.||..:
  Rat  3139 KKELVQCMGSFQDGVAEKC-----------ADYFQRFRRSTHVTPKSYLSFIQGYKFIYEEKHVE 3192

  Fly  3201 LEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQ 3265
            ::.....:|.||.|:.|..|.|..:.:.||||::|||..||.|:..||::....|.|||.|.:.|
  Rat  3193 VQSLANRMNTGLEKLKEASESVAALSQELAVKEKELQVANEKADMVLKEVTMKAQAAEKVKAEVQ 3257

  Fly  3266 EIQIRLADQTVKIEEKRKYVMADLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALES 3330
            :::.:.......|.:.:......|...:||:.:|:||:::|:...:..|||:..||.::...::.
  Rat  3258 KVKDKAQAIVDSISKDKAIAEEKLEAAKPALEEAEAALQTIKPSDIATVRTLGRPPHLIMRIMDC 3322

  Fly  3331 ICLL-----------LGENAT--DWKSIRAVIMRENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSN 3382
            :.||           |.::.|  .|:....::...||:.:: ..|..:.|.::|.|.: |.|...
  Rat  3323 VLLLFHRRVNAVKIDLDKSCTVPSWQESLKLMTAGNFLQNL-QQFPKDTINEEVIEFL-SPYFEM 3385

  Fly  3383 PDYNFEKVNRASMACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKETKDLVEQ 3447
            .|||.|...|.......:..|..|...:..:.|.|.||:..|...|.:..:.:...::.:..::.
  Rat  3386 SDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMASFFSINKEVLPLKANLIVQENRHALAMQDLQKAQAELDD 3450

  Fly  3448 LERSIAAYKEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTII 3512
            .:..:...:.||.|.:::.|.:..|.:..:.|:..:..|:..|..|:|||...|:.|.:|:..::
  Rat  3451 KQAELDVVQAEYEQAMTEKQTLLEDADRCRHKMQTASTLISGLAGEKERWTEQSKEFAAQIKRLV 3515

  Fly  3513 GDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRLNLFTTWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPT 3577
            |||||:.||::|.|.|:|.:|..|...|.:.::|..|.:..|:...|.|.:......|....||.
  Rat  3516 GDVLLATAFLSYSGPFNQEFRDLLLNDWKKEMKARKIPFGNDLNLNEMLIDAPTISEWNLQGLPN 3580

  Fly  3578 DDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLL 3642
            |||..:|.|::.:.:|.||:|||..|...::.|:.:..::..||.....||.:||.:|..|.|||
  Rat  3581 DDLSIQNGIIVTKASRSPLLIDPQTQGKIWIRNKESQNELQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLL 3645

  Fly  3643 VQDV-ENYDPILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTF 3706
            ::|| |..||.|:.||.:...:||....:.:||:::|:...|.::::|:.|...:.|:|.:|...
  Rat  3646 IEDVGEELDPALDNVLEKNFIKTGSTFKVKVGDKEVDVMDGFKLYITTKLPNPAYTPEISARTAI 3710

  Fly  3707 VNFTVTRSSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDD 3771
            ::||||...|:.|.|.:|:..|:.:::::|:.||:.....:.|.::||.:||..|...:|.:::|
  Rat  3711 IDFTVTVKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLLEEVTANKRRTKELEDNLLYRLTSTQGSLVED 3775

  Fly  3772 DSVITTLETLKKEAYDINQKVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYS 3836
            :|:|..|...||.|.::.||::.:.:...:|.:..::|.|::...|.:||.:..:..|:.:||.|
  Rat  3776 ESLIVVLSNTKKTAEEVTQKLEISGETEIQINSAREEYRPVATRGSILYFLITEMRLVNEMYQTS 3840

  Fly  3837 LKMFLDIFSTVLYNNPKLEGRTDHSERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMCKIHLK 3901
            |:.||.:|...|..:.|   ....|:|:|.:...:....::...:|:....:..|.||:.   ||
  Rat  3841 LRQFLGLFDLSLARSVK---SPITSKRIGNIIEHMTYEVFKYAVQGLYEEHKFLFTLLLT---LK 3899

  Fly  3902 GTSESNLDAEFNFFLRSREGLLANPTPVEGLSAEQIESVNRLAL----RLPIFRKLLEKVRSIPE 3962
            ...:.||.....|....:.|...:........::.|..:..|.|    :|..|..:|:::....:
  Rat  3900 IDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPHKPSKWILDMTWLNLVELSKLKQFSDILDQISRNEK 3964

  Fly  3963 L-GAWLQQSSP-EQVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMP 4025
            | ..|..:.:| |:.:|..:|:|      .....:||||:::.|||.||.|...:...:||::..
  Rat  3965 LWRIWFDKENPEEEPLPNAYDKS------LDCFRRLLLIRSWCPDRTIAQARKYIMDSMGENYAE 4023

  Fly  4026 NAEQELDFTSVVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQNKQISSIAIGSAEGFNQAERAI 4090
            ....:|:.|.   ::.:..||.:.....|.|.:..:..|......:...:::|..:..: |.:.:
  Rat  4024 GVILDLEKTW---EESDPRTPLICLLSMGSDPTDSIIALGKRLKIETRYVSMGQGQEVH-ARKLL 4084

  Fly  4091 NMACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSLQP-HSGFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFE 4154
            :.....|.||||:|.||...:|.:|...:...:. |..|||::|.|::.:.|:.||:....|..|
  Rat  4085 HQTMANGGWVLLQNCHLGLDFLDELMDVVTETETVHDTFRLWITTEVHKQFPITLLQMSIKFANE 4149

  Fly  4155 PPPGIRANLLRTFSTVPAARM-MKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWAKKYEFNESDL 4218
            ||.|:||.|.||:..|....: :...::...:.:.:|:.|:.||||.::.||||...||||::|.
  Rat  4150 PPQGLRAGLRRTYGGVSQDLLDVSVGAQWKPMLYAVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADF 4214

  Fly  4219 RVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTSFLKKLFTARS 4283
            ......:...:|...:      .:.|.|..:..::.:..|||::.:|:|:|||.:|.|..|:...
  Rat  4215 NATVQFIQNHLDDMDI------KKGVSWTTVRYMIGEIQYGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENM 4273

  Fly  4284 FEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAEKVLLTTRGTD 4348
            |..||......:          :|..:..|.:|::|::|....:|...||..||:....:....|
  Rat  4274 FGPDFTFYQGYN----------IPKCSTVDGYLQYIQSLPAYDSPEVFGLHPNADITYQSKLAKD 4328

  Fly  4349 LVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLELLPKNLQ--VLK 4411
            ::..:|.:|.           :|.|     |.|::.|.:.:..|   |...||.||::..  .:|
  Rat  4329 VLDTILGIQP-----------KDSS-----GGGDETREAVVARL---ADDMLEKLPEDYSPFEVK 4374

  Fly  4412 RTVENIK--DPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSELVRGIIPK 4474
            ..::.:.  .|:..:..:|:....|:|..|...|.::.|...|....:::.|..|..:....||.
  Rat  4375 ERLQKMGPFQPMNIFLRQEIDRMQRVLSLVRSTLTELKLAVDGTIIMSDNLRDALDCMFDARIPA 4439

  Fly  4475 GWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFP--VWLGGLLNPEAYITATR 4537
            .||:.:. ...|:..|.|:.      |::..|..|...    .|.|  .|:.|..||:.::||.|
  Rat  4440 RWKKASW-VSSTLGFWFTEL------LERNCQFTSWVS----NGRPHCFWMTGFFNPQGFLTAMR 4493

  Fly  4538 QCVAQAN-SWSLEELALDVTITDAGLKND----QKDCCFGVTGLKLQGAQC-KNNELLLAS--TI 4594
            |.:.:|| .|:|:.:.|...:|.. :|:|    ..:..: |.||.|:||.. |.|..|:.|  .:
  Rat  4494 QEITRANKGWALDNMVLCNEVTKF-MKDDISAPPTEGVY-VYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKV 4556

  Fly  4595 MMDL-PVTILKWIKISSE------PRISKLTLPVYLNSTRTELLFTVDLAVAAGQESHSFYERGV 4652
            :.:| ||     |:|.:|      ||:  ...|:|....||:|.:...:.:...|....:..|||
  Rat  4557 LFELMPV-----IRIFAENNTARDPRL--YCCPIYKKPVRTDLNYIAAVDLKTAQAPEHWILRGV 4614

  Fly  4653 AVL 4655
            |:|
  Rat  4615 ALL 4617

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 240..839 CDD:285571 124/676 (18%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 979/3500 (28%)
DHC_N2 1326..1724 CDD:285579 106/406 (26%)
P-loop_NTPase 1870..2103 CDD:304359 123/232 (53%)
P-loop_NTPase 2227..2367 CDD:304359 65/142 (46%)
P-loop_NTPase 2572..2835 CDD:304359 83/285 (29%)
Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B 2834..>2943 CDD:294426 31/141 (22%)
P-loop_NTPase 2916..3194 CDD:304359 87/290 (30%)
MT 3208..3544 CDD:289543 93/348 (27%)
AAA_9 3569..3784 CDD:289547 70/215 (33%)
Dynein_heavy 3925..4636 CDD:281078 182/739 (25%)
Dnah5XP_008759046.2 DHC_N1 250..802 CDD:400611 121/665 (18%)
DHC_N2 1399..1804 CDD:400618 105/409 (26%)
DYN1 <1640..4282 CDD:227570 853/2835 (30%)
AAA_6 1939..2266 CDD:403853 161/368 (44%)
Dynein_C 4326..4618 CDD:408026 82/331 (25%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.