DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dnah1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4684 Identity:1221/4684 - (26%)
Similarity:2079/4684 - (44%) Gaps:853/4684 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   323 KQALATVADYNPLMKDFPI-NDLLSATELEKI-----RPAVQQIFAHLRKVRNTKY-PIQRCLKL 380
            |..||......|:||.... :|:||...|:::     .|.:.|..  :|:....|: |......:
  Rat    64 KSPLAGTDKKYPIMKQRGFYSDILSPGTLDQLGDVCCGPYLSQNL--IRQADLDKFTPKAESFVI 126

  Fly   381 IEAISRDLSQQLLKVLGTRRLM---HIPFDEFERVMNQCFEIF--SC---WDDEYDKLQGLLRDI 437
            .|.....:.||.:..  |.||:   ..|...:|..:...|::.  .|   .:.|..|.|.|..||
  Rat   127 PEDFQERVEQQSIGT--TTRLLTQTDFPLQSYEPKVQVPFQVLPGRCPRKIEIERRKQQYLRLDI 189

  Fly   438 VKKKRDEHLKMVWRVSPAHKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQ 502
            .:...:|.:... ::.|.|..||.        .:..||.|..:..:..|.|..   |....:.:.
  Rat   190 EQLLANEGIDSN-KLMPRHPDLQQ--------PQTIEQGRDPLFPIYLPLKVF---DNEEFDCRT 242

  Fly   503 PYS---------------------LDAADANAIEEVNLAYENVKEVDCLDITKEGSEAW-EAAVK 545
            |..                     |...||       |.:|:.|       ::|....| |..|.
  Rat   243 PTEWLNMGLEPDAQYRKPVPGKALLPTDDA-------LGHEDPK-------SQELDYRWCEVGVL 293

  Fly   546 RYEEK-----IDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQR 605
            .|:|:     :.:.:.|  ..:||::|                    .|.:.|.:.         
  Rat   294 DYDEEKKLYLVQKTDKR--GLVRDEMG--------------------MPIVNGGVT--------- 327

  Fly   606 VKDDIEALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQL-------TMYLKRV--ED 661
                            |:.:          ||:..:..|..:|  ||       .::.:||  .:
  Rat   328 ----------------PEGR----------PPLLDTQYWVPRI--QLLFCAEDPRVFTQRVVQAN 364

  Fly   662 VLGKGWETHI-----------EGQKLKADGDSFRAKLSISDVFHEWARKVQERNFG--------S 707
            .|.|..|..:           |||::..:....:.|        :||........|        |
  Rat   365 ALRKNTEALLLYNLYVDCMPTEGQRVINEQSLSKIK--------QWALSTPRMRKGPSVLEHLSS 421

  Fly   708 TGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVNF------LPE---IITL-AKEVRNIKNLGF-RVP------ 755
            ..|...::..||        ..::||      .||   .:|| .||...:.|.|. .||      
  Rat   422 LAREVNLDYERS--------MNKINFDQIVSSKPETFSFVTLPEKEEEKVPNQGLVSVPEYPFRE 478

  Fly   756 ----------------LTIVNKAH-QANQIYPYAISLIES-VRTYER--TLEKLNNRSLAQNSVF 800
                            :|.::|.. :.|::  .::||..| :..|.|  ..|::.:::.:|..:|
  Rat   479 QKEDFTFVSLLTRSEVITALSKVRAECNKV--TSMSLFHSNLSKYSRLEEFEQIQSQTFSQVQMF 541

  Fly   801 ---------KIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEGIGLIWESYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDD 856
                     |:..|:|:    ..:.|...||....    ||.|.:.    :|.:.:...:..:.|
  Rat   542 LKDSWISTLKVAMRSSL----RDMSKGWYNLYETN----WEVYLMS----KLRKLMELIKYMLQD 594

  Fly   857 LL--VVEEQLDVDVRSLETCPYSAATFV-EILSKIQHAVDDLSLRQ------------------- 899
            .|  :|::.|.           |.|.|: :....:...:||:...:                   
  Rat   595 TLRFLVQDSLG-----------SFAQFIGDACCSVLECIDDMDWGEDLINSPYKPRKNPLFIVDL 648

  Fly   900 -YSNLSVWVTRLDEEVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQ 963
             ..|..|..:...|:.|..|......||.| |.|:...:|.|...:          .:.|||.::
  Rat   649 VLDNTGVHYSTPLEQFEVILLNLFDKGILA-THAVPQLEKLVMEDI----------FISGDPLLE 702

  Fly   964 N-AVHEIRITNQQMYLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTSQVRLQSTRYQVGLEKH-VSQTYRNL 1026
            : .:||           |.:||.|..|.....  :|::..|...:..|..:.|..: :|...:..
  Rat   703 SVGLHE-----------PLVEELRANITNAMH--KAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDISTFLKTY 754

  Fly  1027 LTKLPEGKILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRYQSLWD--LQADMLYGRLGEDVNLWIKCLNDI 1089
            .|:.|..:              |||..|...|:.:.:.|  |.:.::.|....:|       :::
  Rat   755 QTQCPSAE--------------EVREVVITHLKEKEILDNSLPSSIIIGPFYINV-------DNV 798

  Fly  1090 KQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKVTLKYDSWHKEALGKFGTLLGTEMTSFHSKVSKSRT 1154
            |||     .|..|:|....::|   :.||      :.|.|.     ..:..|..|...|:.:...
  Rat   799 KQS-----LSKKRKALATSMLD---ILAK------NLHNEV-----DSICEEFRSISRKIYEKPN 844

  Fly  1155 DLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFPNTWLHVDNIEG 1219
            .:|    |.|...|      :::.:.:.::..::::........:::...:.     |..|:...
  Rat   845 SIE----ELAELRD------WMKGIPEKLVILEERIVKVMSDYEVMDEFFYN-----LTTDDFND 894

  Fly  1220 EWSAFN---EIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVAEDKAVETRTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQ 1281
            :|:|.|   :|:.:.|...|..|..       |:|..:.:.:|..|..||             |:
  Rat   895 KWAANNWPTKILGQIDMVRQQHVED-------EEKFRKIQLMDQNNFQEK-------------LE 939

  Fly  1282 QLQIFESKYS------RLKEERDNVVKAKEAL-ELQESAVPNNSAER-----------MNVALEE 1328
            .||:..:.:|      |..|..:.|.:.|:.| :.|:.|:..|:.||           ::..::|
  Rat   940 GLQLVVAGFSTHVEIARAHEIANEVRRVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFGLPITNYDKLSRMVKE 1004

  Fly  1329 LQDLRGVWSELSKVWTQIDET-REKPWLSVQPRKLRQQ-------LEAMMAQLKELPA------- 1378
            .|....:|:..|. |.:..|: ...|..::...:|.:.       :...:.|.|::||       
  Rat  1005 FQPYLDLWTTASD-WLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVIESFKTMHKCVKQFKDIPACQDVALD 1068

  Fly  1379 -RLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRVN-WVLSDLSLGQVWDVN 1441
             |.|:.|...|:.           ||..|::..::.|||:.|:.::.:| ...::|:..:..::|
  Rat  1069 IRARIDEFKPYIP-----------LIQGLRNPGMRNRHWEVLSNEININVRPKANLTFARCLEMN 1122

  Fly  1442 LQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINY-QNKCRIIRGWDDLFNKVKEHIN 1505
            ||.....:..:..||..|.|:|:.|.::.:.|.:...:::.| :....|::..|:....:.:||.
  Rat  1123 LQDYIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWASILFNVLPYKETDTYILKSPDEASQLLDDHIV 1187

  Fly  1506 SVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSR 1570
            ...:|..|||.|.||:...:||.||.....:.:.|::.||.|:|||.||| |.||...||||:.|
  Rat  1188 MTQSMSFSPYKKPFEQRINSWETKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIFS-SEDITRQLPVESKR 1251

  Fly  1571 FQSISSEFLGLMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLAD---LLGKIQKALGEYLERERTSFPRF 1632
            :|::...:..:||...::   .:|:|:.:.||.|:.|.|   ||..:||.|.||||.:||:||||
  Rat  1252 YQTMERIWRKIMKNAYEN---REVINVCSDQRLLDSLRDCNKLLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRF 1313

  Fly  1633 YFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEENNVILGISSREGEEVHF---MNPVS 1694
            ||:.|::||||:..:|:...:|.|.:|.|..:|.:|..|:.. |..:.|.|||||..   :.|.|
  Rat  1314 YFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARLLFQEDLE-ITHMYSAEGEEVKLSFSIYPSS 1377

  Fly  1695 TVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAY-----MEWCDKYQAQIVVL 1754
            .||     :||..||:.|:.::..::..|:             :||     .||...:..|:.:.
  Rat  1378 NVE-----DWLLEVERSMKASVHDIIEMAI-------------KAYPTMLRTEWVLSWPGQVTIA 1424

  Fly  1755 AAQILWSEDVESALQQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVH 1819
            ..|..|:.:|..||:.:|.::...|      .:...|:.|...|..:...::|..|..||...||
  Rat  1425 GCQTYWTLEVAQALEASSISSSLFP------QLSKQLSDLVALVRGKLSRMQRMVLSALIVIEVH 1483

  Fly  1820 KRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQT 1884
            .:.|..:|::..|.|...|:|:.::|:|:      ....|.|...||.|.||:||||...|||.|
  Rat  1484 AKDVVSKLIDENVVSVHDFEWISQLRYYW------TNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVIT 1542

  Fly  1885 PLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVG 1949
            |||||||||:|.||..:.||:|.|||||||||:.|.||..|....:||||.:..||.|||:.|.|
  Rat  1543 PLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKG 1607

  Fly  1950 LCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFI 2014
            |...|||.|||||||::..:||..:|||.|||:|.:..:    |....|  |.::.:.|..|:||
  Rat  1608 LASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRV----ERFMFE--GVEIPLVPSCAVFI 1666

  Fly  2015 TMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLS 2079
            |||||||||:.||||||.|||.:||..||..:|||:.|:|.||..|..||.||...|||..||||
  Rat  1667 TMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMIAEISLYSFGFNEANVLAKKITTTFKLSSEQLS 1731

  Fly  2080 NQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETM 2144
            :|.|||||:||:|:|:.:|||:||:.                      ..:.|:.|.::::.:..
  Rat  1732 SQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKREN----------------------PTMNEELICLRAIRDVN 1774

  Fly  2145 VPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGS 2209
            |||.:.||:.|...::||:||.......:...|.:.|||.|:::.|...||              
  Rat  1775 VPKFLQEDLKLFSGIVSDLFPTTKEEETDYGILDQAIRKACEKNNLKDVEG-------------- 1825

  Fly  2210 TWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVA---------HVIDPK 2265
             ::.|.:|||:.:.:.||||:|||:|||||..::.|..|:...:|...::         :|::||
  Rat  1826 -FLIKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSNCYRILAAAMTSLKGKPSISGGVYEAVNYYVLNPK 1889

  Fly  2266 AISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDN 2330
            :|:...|||..|..|.|||||:|..::|  ...:..:.||: |.:|||.||..|:||:|:|||||
  Rat  1890 SITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFPSLIR--AGAIASDTNKK-WYMFDGPVDAVWIENMNTVLDDN 1951

  Fly  2331 KLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPL 2395
            |.|.|.:||.:.|...:.:|||||||..|:.|||||||||:....:|......|.:|..|.||  
  Rat  1952 KKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFVECWLKHLPSI-- 2014

  Fly  2396 EDGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTL--EYAMDQEHIMDFTR 2458
                      |||.:::             ...|.:.|..:....|||.  |........:..:.
  Rat  2015 ----------IKPYEEQ-------------FKTLFVKFLESSIAFVRTTVKEVVASTNSNLTMSL 2056

  Fly  2459 LRALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFP------CSADQLEHYIPKAL----VYSVLWSFAGDA 2513
            |:.|...|.                |..|      ..:::|.| ||:.:    ::|::||.....
  Rat  2057 LKLLDCFFK----------------PFLPREGLKKIPSEKLSH-IPELIEPWFIFSLVWSVGATG 2104

  Fly  2514 KLKVRIDLGDFVR---SVTTVPLPGAAGAPIIDYEVNMSG-----------------DWVPWSN- 2557
            ....|::...:::   ....:.|.......:.||.::.:|                 .||.|.: 
  Rat  2105 DHSSRLNFSQWLKIKMVFEQIKLAFPEEGLVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEESKQVAWVKWMDY 2169

  Fly  2558 KVPVIEVETHKVASPD-----IVVPTLDTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFS-AL 2616
            .||.       ...||     |:|||:||::...||...:..|||::..||.|:|||:|:.: .|
  Rat  2170 SVPF-------TMMPDTNYCNIIVPTMDTMQMSYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGKTLTVSNKLL 2227

  Fly  2617 RALPDMEVVG--LNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMD 2679
            :.|| :|.:.  |.||:.|:........|...:.|:  .||...|  :|:..:.|.|::|:|.::
  Rat  2228 KNLP-LEYISHFLTFSARTSANQTQDLIDSKLDKRR--KGVFGPP--LGRNFIFFIDDLNMPALE 2287

  Fly  2680 SYGTQRVISFLRQLVEHKGFY-RASDQAWVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYV 2743
            :||.|..|..|||.::|.|:| |....|:.:|..|.||.|..|| ..||..::.|..||...:..
  Rat  2288 TYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPP-GGGRNAITPRLTRHFNYLSF 2351

  Fly  2744 DYPGETSLKQIYGTFSRAMLRLMPALRGY-------------AEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDM 2795
            ....|.|.|:|:.......:..:...:.|             .|||.||.:..|..    .|..:
  Rat  2352 IEMDEVSKKRIFSIILGCWMDGLLGEKSYREPVPGAPNIVHMTEPLVNATISIYAI----ITSQL 2412

  Fly  2796 QP-----HYVYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLPVEG---LVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRW 2852
            .|     ||.::.|::::..:||..|    :...||.   |:|||.||..|:|:||||::.:|.|
  Rat  2413 LPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGILMA----EPAKVEDKVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRGW 2473

  Fly  2853 TNENIDLVGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLS-----KDYMPVNREE-----LREYVH------ 2901
            .:..:::..:......|:....| ||||.:::|     |.|..:..|.     :.||:.      
  Rat  2474 FDGLLEMKMEDLGVAFNKVCPFQ-PILYGDFMSPGSDVKSYELITSENKMMQVIEEYMEDYNQIN 2537

  Fly  2902 -ARLKVFYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSI 2965
             |:||          ||||.:.:.|:.||.|..||..|:.||:||.|:|:::|:|..:.|.....
  Rat  2538 TAKLK----------LVLFVDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYEC 2592

  Fly  2966 FQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEG 3030
            ||:::...|...::.||::.:|.::|.::..|.|:..::.:.:..|||.:|.:|.:|::|.|:..
  Rat  2593 FQVELSKNYGMSEWREDVKKILLKAGMQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNILNSGDIPNLYSA 2657

  Fly  3031 DEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNR 3095
            ||...::...:...|.:||. .:...|...:|.:|..|:|:|..|:|..:..:.|....|:|.|.
  Rat  2658 DEQDQIVNTMRPYIQEQGLQ-PTKANLMAAYTGRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNC 2721

  Fly  3096 CVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQT 3160
            |.::||.:|...||..|...|...:                 |.:..:....:.:|:.|||:||:
  Rat  2722 CTIDWFNEWPAEALQSVATRFLHEI-----------------PELECSSEVIEGLIHVCVYIHQS 2769

  Fly  3161 LHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEM 3225
            :.:..........|...|||:.||:.::.|..|..:|:.:|:..:..:..||:|:..|.|.|.:|
  Rat  2770 VAKKCVEYLAELARHNYVTPKSYLELLNIFSILIGQKKMELKTAKHRMKSGLDKLLRTSEDVAKM 2834

  Fly  3226 QKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQ---DQQEAE--KKKIQSQEIQIRLADQTVKIEEKRKYV 3285
            |:.|.:.:..|:   |||...|..|.|   |...||  :|.:|::||         |..||....
  Rat  2835 QEELEIMRPLLE---EAAKDTLLTMDQIKVDTAIAEETRKSVQAEEI---------KANEKASKA 2887

  Fly  3286 MA-------DLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLL-------- 3335
            .|       ||.:..||:..|.|:::::.|..:.|||.|..||..|||.:|::|::.        
  Rat  2888 QAIADDAQKDLDEALPALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVP 2952

  Fly  3336 ----GENATD-WKSIRAVIMRE-NFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRAS 3394
                |....| |:..:.::... .|:.|:. .|..:||.:.|.:.:: .|:.|.::....:.:.|
  Rat  2953 GEKPGSKVDDYWEPGKGLLQDPGRFLESLF-KFDKDNIGEAVIKAIQ-PYIDNEEFQPAAIAKVS 3015

  Fly  3395 MACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKETKDLVEQLERSIAAYKEEY 3459
            .||..:.:|..|..:|..:.|.|||.|:.||..::..:|.....:|.|..:.::|..|:..:.:|
  Rat  3016 KACTSICQWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALREAQDDLEVTQRILEEAKHHLREVEDGISTLQAKY 3080

  Fly  3460 AQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAY 3524
            .:.:::.:.::...|..:.::.|:..|:..|..|:.||:.|.|..::.:..|.||||::|.|:||
  Rat  3081 RECVTKKEELEMKCEQCEQRLGRADKLINGLADEKVRWQDTVENLENMLDNIFGDVLVAAGFVAY 3145

  Fly  3525 GGYFDQHYRLNLFTTWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTENAIMLK 3589
            .|.|...||..|:..|...|....:.:.:.......|.||.:...||...||.|.|..||.::.:
  Rat  3146 LGPFTGQYRAALYEYWVNQLTVYGVPHTSKPTLISTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQ 3210

  Fly  3590 RFNRYPLIIDPSGQATTFLLN--EYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ENYDP 3651
            ...|:...|||.|||..::.|  :.:|..:.|.|  |..|.:::|:|:|||.|.|:::| |..||
  Rat  3211 FSQRWTHFIDPQGQANKWIKNMEKESGLDVFKLS--DRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEELDP 3273

  Fly  3652 ILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSL 3716
            .|.|||.::..:..|..::.|||..|.....|.::::|:.|...:.|::.:::|.:|||::.|.|
  Rat  3274 ALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYSPEVSTKLTLINFTLSPSGL 3338

  Fly  3717 QSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVITTLETL 3781
            :.|.|.||:..||||::|.::.|:....:.|..|:.:|..:|..|:.::|..:||..:|..||..
  Rat  3339 EDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYRLSSSEGNPVDDVELIKVLEAS 3403

  Fly  3782 KKEAYDINQKVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKMFLDIFST 3846
            |.:|.:|..||...::...:|:....:|:|::|....::|.:..|..|..:|||||:.||:||.:
  Rat  3404 KMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAVRTQILFFCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLS 3468

  Fly  3847 VLYNNPKLEGRTDH-SERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMCKIHLKGTSESNLDA 3910
            .:.|:.    |.|: .:|:..:.|.|....|..|.|.:....:|.||.|:|...:....:.| ..
  Rat  3469 GIANSE----RADNLKKRIVNINRYLTFSLYSNVCRSLFEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKIN-QG 3528

  Fly  3911 EFNFFLR--SREGLLANPTPVEGLSAEQIESVNRLAL-RLPIFRKL-LEKVRSIPELGAWLQQSS 3971
            |:.:.|.  |.:.:..||.| ..||......:  ||| .||.|... .:.|:.:|:..|....:.
  Rat  3529 EWRYLLSGGSIQTMSENPAP-HWLSDRAWRDI--LALSNLPAFSTFSTDFVQHLPKFQAIFDSAE 3590

  Fly  3972 P-EQVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNAEQELDFTS 4035
            | .:.:|.:|      :.......:||:::..|.|:|..|..:.|...|...|:   |.:....|
  Rat  3591 PHREPLPGIW------NTYLDEFQKLLILRCLRGDKVTNAMQDFVANHLEPRFI---EPQTANLS 3646

  Fly  4036 VVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQ--NKQISSIAIGSAEGFNQAERAINMACKTGR 4098
            .|.|:.|..||.:....||.|.:..:...|.|.  :|::|:|::|..:| .:||..:..:.:.|:
  Rat  3647 AVFKESNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFSKKLSAISLGQGQG-PRAEAMMRNSIERGK 3710

  Fly  4099 WVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSLQP---HSGFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGIR 4160
            ||..:|.||||.|:..||:.:..:.|   |..|||:||...:.|.||::|:.|.....|||.|::
  Rat  3711 WVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLWLTSLPSNKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVK 3775

  Fly  4161 ANLLRTFSTV------PAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWAKKYEFNESDLR 4219
            ||||::::::      ...::::..|    |...|..||....||.::.|||:...|||.:.|||
  Rat  3776 ANLLKSYNSLSDDFLHSCQKVVEFKS----LLLSLCLFHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLR 3836

  Fly  4220 VACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTSFLKKLFTARSF 4284
            :....|..::|..         |.:|:..|.....:..|||::.:|:|:|.:.:.|:..:.....
  Rat  3837 ICISQLKMFLDEY---------EDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTDDWDRRCVMNILEDFYNPAVL 3892

  Fly  4285 EADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAEKVLLTTRGTDL 4349
            ..:...      :..|:.| .:|.....:.:|.:|::|.....|...||.:||...........|
  Rat  3893 SPEHRY------SKSGIYH-QIPPTYDLNGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFAL 3950

  Fly  4350 VSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLELLPKNL---QVLK 4411
            ...:|::|....      |:..||.:..|   ||           .|...|..:||.:   :|:.
  Rat  3951 FGAILQLQPKSS------SMGGQSREELV---ED-----------VAEDILVQVPKPVDLEEVVN 3995

  Fly  4412 RTVENIKDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSELVRGIIPKGW 4476
            :.....::.:.....:||...::||..:...|.|::...:|....:.....|.:.|....:|:.|
  Rat  3996 KYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNKLLMVITQTLSDMLKAIKGLVVMSLELELMSTSLYNNAVPELW 4060

  Fly  4477 KRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFP--VWLGGLLNPEAYITATRQC 4539
            |....|:...:..||.|...|:..|....:          .|.|  .|:.|...|:|::|.|.|.
  Rat  4061 KSKAYPSLKPLASWIMDLLQRLNFLHSWIK----------NGIPSVFWISGFFFPQAFLTGTLQN 4115

  Fly  4540 VAQANSWSLEELALD---VTITDAGLKNDQKDCCFGVTGLKLQG----------AQCKNNELLLA 4591
            .|:....|::.:..|   ::...:.:.......|: :.||.|:|          |:.:..||...
  Rat  4116 FARKFVISIDTITFDFKVLSYASSEIAERPSTGCY-IYGLFLEGARWDPFDFQLAESRPKELYTE 4179

  Fly  4592 STIMMDLPVTILKWIKISSE-----PRISKLTLPVYLNSTRTELLFTVDLAVAAGQESHSFYERG 4651
            ..::..|||...   |:.::     |....||....|::|.....:.:.:.:.:.|....:.:||
  Rat  4180 MAVIWLLPVANR---KVQNQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAVEIPSNQPQRHWIKRG 4241

  Fly  4652 VAVL 4655
            ||::
  Rat  4242 VALI 4245

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 116/631 (18%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 1001/3502 (29%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 66/336 (20%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:462462 125/424 (29%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 872/2865 (30%)
AAA_6 1528..1854 CDD:463697 166/368 (45%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:465677 66/336 (20%)

Return to query results.
Submit another query.