DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dnah1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4684 Identity:1221/4684 - (26%)
Similarity:2079/4684 - (44%) Gaps:853/4684 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   323 KQALATVADYNPLMKDFPI-NDLLSATELEKI-----RPAVQQIFAHLRKVRNTKY-PIQRCLKL 380
            |..||......|:||.... :|:||...|:::     .|.:.|..  :|:....|: |......:
  Rat    64 KSPLAGTDKKYPIMKQRGFYSDILSPGTLDQLGDVCCGPYLSQNL--IRQADLDKFTPKAESFVI 126

  Fly   381 IEAISRDLSQQLLKVLGTRRLM---HIPFDEFERVMNQCFEIF--SC---WDDEYDKLQGLLRDI 437
            .|.....:.||.:..  |.||:   ..|...:|..:...|::.  .|   .:.|..|.|.|..||
  Rat   127 PEDFQERVEQQSIGT--TTRLLTQTDFPLQSYEPKVQVPFQVLPGRCPRKIEIERRKQQYLRLDI 189

  Fly   438 VKKKRDEHLKMVWRVSPAHKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQ 502
            .:...:|.:... ::.|.|..||.        .:..||.|..:..:..|.|..   |....:.:.
  Rat   190 EQLLANEGIDSN-KLMPRHPDLQQ--------PQTIEQGRDPLFPIYLPLKVF---DNEEFDCRT 242

  Fly   503 PYS---------------------LDAADANAIEEVNLAYENVKEVDCLDITKEGSEAW-EAAVK 545
            |..                     |...||       |.:|:.|       ::|....| |..|.
  Rat   243 PTEWLNMGLEPDAQYRKPVPGKALLPTDDA-------LGHEDPK-------SQELDYRWCEVGVL 293

  Fly   546 RYEEK-----IDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQR 605
            .|:|:     :.:.:.|  ..:||::|                    .|.:.|.:.         
  Rat   294 DYDEEKKLYLVQKTDKR--GLVRDEMG--------------------MPIVNGGVT--------- 327

  Fly   606 VKDDIEALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQL-------TMYLKRV--ED 661
                            |:.:          ||:..:..|..:|  ||       .::.:||  .:
  Rat   328 ----------------PEGR----------PPLLDTQYWVPRI--QLLFCAEDPRVFTQRVVQAN 364

  Fly   662 VLGKGWETHI-----------EGQKLKADGDSFRAKLSISDVFHEWARKVQERNFG--------S 707
            .|.|..|..:           |||::..:....:.|        :||........|        |
  Rat   365 ALRKNTEALLLYNLYVDCMPTEGQRVINEQSLSKIK--------QWALSTPRMRKGPSVLEHLSS 421

  Fly   708 TGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVNF------LPE---IITL-AKEVRNIKNLGF-RVP------ 755
            ..|...::..||        ..::||      .||   .:|| .||...:.|.|. .||      
  Rat   422 LAREVNLDYERS--------MNKINFDQIVSSKPETFSFVTLPEKEEEKVPNQGLVSVPEYPFRE 478

  Fly   756 ----------------LTIVNKAH-QANQIYPYAISLIES-VRTYER--TLEKLNNRSLAQNSVF 800
                            :|.::|.. :.|::  .::||..| :..|.|  ..|::.:::.:|..:|
  Rat   479 QKEDFTFVSLLTRSEVITALSKVRAECNKV--TSMSLFHSNLSKYSRLEEFEQIQSQTFSQVQMF 541

  Fly   801 ---------KIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEGIGLIWESYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDD 856
                     |:..|:|:    ..:.|...||....    ||.|.:.    :|.:.:...:..:.|
  Rat   542 LKDSWISTLKVAMRSSL----RDMSKGWYNLYETN----WEVYLMS----KLRKLMELIKYMLQD 594

  Fly   857 LL--VVEEQLDVDVRSLETCPYSAATFV-EILSKIQHAVDDLSLRQ------------------- 899
            .|  :|::.|.           |.|.|: :....:...:||:...:                   
  Rat   595 TLRFLVQDSLG-----------SFAQFIGDACCSVLECIDDMDWGEDLINSPYKPRKNPLFIVDL 648

  Fly   900 -YSNLSVWVTRLDEEVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQ 963
             ..|..|..:...|:.|..|......||.| |.|:...:|.|...:          .:.|||.::
  Rat   649 VLDNTGVHYSTPLEQFEVILLNLFDKGILA-THAVPQLEKLVMEDI----------FISGDPLLE 702

  Fly   964 N-AVHEIRITNQQMYLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTSQVRLQSTRYQVGLEKH-VSQTYRNL 1026
            : .:||           |.:||.|..|.....  :|::..|...:..|..:.|..: :|...:..
  Rat   703 SVGLHE-----------PLVEELRANITNAMH--KAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDISTFLKTY 754

  Fly  1027 LTKLPEGKILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRYQSLWD--LQADMLYGRLGEDVNLWIKCLNDI 1089
            .|:.|..:              |||..|...|:.:.:.|  |.:.::.|....:|       :::
  Rat   755 QTQCPSAE--------------EVREVVITHLKEKEILDNSLPSSIIIGPFYINV-------DNV 798

  Fly  1090 KQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKVTLKYDSWHKEALGKFGTLLGTEMTSFHSKVSKSRT 1154
            |||     .|..|:|....::|   :.||      :.|.|.     ..:..|..|...|:.:...
  Rat   799 KQS-----LSKKRKALATSMLD---ILAK------NLHNEV-----DSICEEFRSISRKIYEKPN 844

  Fly  1155 DLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFPNTWLHVDNIEG 1219
            .:|    |.|...|      :::.:.:.::..::::........:::...:.     |..|:...
  Rat   845 SIE----ELAELRD------WMKGIPEKLVILEERIVKVMSDYEVMDEFFYN-----LTTDDFND 894

  Fly  1220 EWSAFN---EIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVAEDKAVETRTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQ 1281
            :|:|.|   :|:.:.|...|..|..       |:|..:.:.:|..|..||             |:
  Rat   895 KWAANNWPTKILGQIDMVRQQHVED-------EEKFRKIQLMDQNNFQEK-------------LE 939

  Fly  1282 QLQIFESKYS------RLKEERDNVVKAKEAL-ELQESAVPNNSAER-----------MNVALEE 1328
            .||:..:.:|      |..|..:.|.:.|:.| :.|:.|:..|:.||           ::..::|
  Rat   940 GLQLVVAGFSTHVEIARAHEIANEVRRVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFGLPITNYDKLSRMVKE 1004

  Fly  1329 LQDLRGVWSELSKVWTQIDET-REKPWLSVQPRKLRQQ-------LEAMMAQLKELPA------- 1378
            .|....:|:..|. |.:..|: ...|..::...:|.:.       :...:.|.|::||       
  Rat  1005 FQPYLDLWTTASD-WLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVIESFKTMHKCVKQFKDIPACQDVALD 1068

  Fly  1379 -RLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRVN-WVLSDLSLGQVWDVN 1441
             |.|:.|...|:.           ||..|::..::.|||:.|:.::.:| ...::|:..:..::|
  Rat  1069 IRARIDEFKPYIP-----------LIQGLRNPGMRNRHWEVLSNEININVRPKANLTFARCLEMN 1122

  Fly  1442 LQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINY-QNKCRIIRGWDDLFNKVKEHIN 1505
            ||.....:..:..||..|.|:|:.|.::.:.|.:...:::.| :....|::..|:....:.:||.
  Rat  1123 LQDYIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWASILFNVLPYKETDTYILKSPDEASQLLDDHIV 1187

  Fly  1506 SVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSR 1570
            ...:|..|||.|.||:...:||.||.....:.:.|::.||.|:|||.||| |.||...||||:.|
  Rat  1188 MTQSMSFSPYKKPFEQRINSWETKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIFS-SEDITRQLPVESKR 1251

  Fly  1571 FQSISSEFLGLMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLAD---LLGKIQKALGEYLERERTSFPRF 1632
            :|::...:..:||...::   .:|:|:.:.||.|:.|.|   ||..:||.|.||||.:||:||||
  Rat  1252 YQTMERIWRKIMKNAYEN---REVINVCSDQRLLDSLRDCNKLLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRF 1313

  Fly  1633 YFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEENNVILGISSREGEEVHF---MNPVS 1694
            ||:.|::||||:..:|:...:|.|.:|.|..:|.:|..|:.. |..:.|.|||||..   :.|.|
  Rat  1314 YFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARLLFQEDLE-ITHMYSAEGEEVKLSFSIYPSS 1377

  Fly  1695 TVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAY-----MEWCDKYQAQIVVL 1754
            .||     :||..||:.|:.::..::..|:             :||     .||...:..|:.:.
  Rat  1378 NVE-----DWLLEVERSMKASVHDIIEMAI-------------KAYPTMLRTEWVLSWPGQVTIA 1424

  Fly  1755 AAQILWSEDVESALQQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVH 1819
            ..|..|:.:|..||:.:|.::...|      .:...|:.|...|..:...::|..|..||...||
  Rat  1425 GCQTYWTLEVAQALEASSISSSLFP------QLSKQLSDLVALVRGKLSRMQRMVLSALIVIEVH 1483

  Fly  1820 KRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQT 1884
            .:.|..:|::..|.|...|:|:.::|:|:      ....|.|...||.|.||:||||...|||.|
  Rat  1484 AKDVVSKLIDENVVSVHDFEWISQLRYYW------TNNDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVIT 1542

  Fly  1885 PLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVG 1949
            |||||||||:|.||..:.||:|.|||||||||:.|.||..|....:||||.:..||.|||:.|.|
  Rat  1543 PLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKG 1607

  Fly  1950 LCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFI 2014
            |...|||.|||||||::..:||..:|||.|||:|.:..:    |....|  |.::.:.|..|:||
  Rat  1608 LASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRV----ERFMFE--GVEIPLVPSCAVFI 1666

  Fly  2015 TMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLS 2079
            |||||||||:.||||||.|||.:||..||..:|||:.|:|.||..|..||.||...|||..||||
  Rat  1667 TMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMIAEISLYSFGFNEANVLAKKITTTFKLSSEQLS 1731

  Fly  2080 NQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETM 2144
            :|.|||||:||:|:|:.:|||:||:.                      ..:.|:.|.::::.:..
  Rat  1732 SQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKREN----------------------PTMNEELICLRAIRDVN 1774

  Fly  2145 VPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGS 2209
            |||.:.||:.|...::||:||.......:...|.:.|||.|:::.|...||              
  Rat  1775 VPKFLQEDLKLFSGIVSDLFPTTKEEETDYGILDQAIRKACEKNNLKDVEG-------------- 1825

  Fly  2210 TWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVA---------HVIDPK 2265
             ::.|.:|||:.:.:.||||:|||:|||||..::.|..|:...:|...::         :|::||
  Rat  1826 -FLIKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSNCYRILAAAMTSLKGKPSISGGVYEAVNYYVLNPK 1889

  Fly  2266 AISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDN 2330
            :|:...|||..|..|.|||||:|..::|  ...:..:.||: |.:|||.||..|:||:|:|||||
  Rat  1890 SITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFPSLIR--AGAIASDTNKK-WYMFDGPVDAVWIENMNTVLDDN 1951

  Fly  2331 KLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPL 2395
            |.|.|.:||.:.|...:.:|||||||..|:.|||||||||:....:|......|.:|..|.||  
  Rat  1952 KKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFVECWLKHLPSI-- 2014

  Fly  2396 EDGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTL--EYAMDQEHIMDFTR 2458
                      |||.:::             ...|.:.|..:....|||.  |........:..:.
  Rat  2015 ----------IKPYEEQ-------------FKTLFVKFLESSIAFVRTTVKEVVASTNSNLTMSL 2056

  Fly  2459 LRALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFP------CSADQLEHYIPKAL----VYSVLWSFAGDA 2513
            |:.|...|.                |..|      ..:::|.| ||:.:    ::|::||.....
  Rat  2057 LKLLDCFFK----------------PFLPREGLKKIPSEKLSH-IPELIEPWFIFSLVWSVGATG 2104

  Fly  2514 KLKVRIDLGDFVR---SVTTVPLPGAAGAPIIDYEVNMSG-----------------DWVPWSN- 2557
            ....|::...:::   ....:.|.......:.||.::.:|                 .||.|.: 
  Rat  2105 DHSSRLNFSQWLKIKMVFEQIKLAFPEEGLVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEESKQVAWVKWMDY 2169

  Fly  2558 KVPVIEVETHKVASPD-----IVVPTLDTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFS-AL 2616
            .||.       ...||     |:|||:||::...||...:..|||::..||.|:|||:|:.: .|
  Rat  2170 SVPF-------TMMPDTNYCNIIVPTMDTMQMSYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGKTLTVSNKLL 2227

  Fly  2617 RALPDMEVVG--LNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMD 2679
            :.|| :|.:.  |.||:.|:........|...:.|:  .||...|  :|:..:.|.|::|:|.::
  Rat  2228 KNLP-LEYISHFLTFSARTSANQTQDLIDSKLDKRR--KGVFGPP--LGRNFIFFIDDLNMPALE 2287

  Fly  2680 SYGTQRVISFLRQLVEHKGFY-RASDQAWVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYV 2743
            :||.|..|..|||.::|.|:| |....|:.:|..|.||.|..|| ..||..::.|..||...:..
  Rat  2288 TYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPP-GGGRNAITPRLTRHFNYLSF 2351

  Fly  2744 DYPGETSLKQIYGTFSRAMLRLMPALRGY-------------AEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDM 2795
            ....|.|.|:|:.......:..:...:.|             .|||.||.:..|..    .|..:
  Rat  2352 IEMDEVSKKRIFSIILGCWMDGLLGEKSYREPVPGAPNIVHMTEPLVNATISIYAI----ITSQL 2412

  Fly  2796 QP-----HYVYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLPVEG---LVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRW 2852
            .|     ||.::.|::::..:||..|    :...||.   |:|||.||..|:|:||||::.:|.|
  Rat  2413 LPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGILMA----EPAKVEDKVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRGW 2473

  Fly  2853 TNENIDLVGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLS-----KDYMPVNREE-----LREYVH------ 2901
            .:..:::..:......|:....| ||||.:::|     |.|..:..|.     :.||:.      
  Rat  2474 FDGLLEMKMEDLGVAFNKVCPFQ-PILYGDFMSPGSDVKSYELITSENKMMQVIEEYMEDYNQIN 2537

  Fly  2902 -ARLKVFYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSI 2965
             |:||          ||||.:.:.|:.||.|..||..|:.||:||.|:|:::|:|..:.|.....
  Rat  2538 TAKLK----------LVLFVDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYEC 2592

  Fly  2966 FQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEG 3030
            ||:::...|...::.||::.:|.::|.::..|.|:..::.:.:..|||.:|.:|.:|::|.|:..
  Rat  2593 FQVELSKNYGMSEWREDVKKILLKAGMQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNILNSGDIPNLYSA 2657

  Fly  3031 DEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNR 3095
            ||...::...:...|.:||. .:...|...:|.:|..|:|:|..|:|..:..:.|....|:|.|.
  Rat  2658 DEQDQIVNTMRPYIQEQGLQ-PTKANLMAAYTGRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNC 2721

  Fly  3096 CVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQT 3160
            |.::||.:|...||..|...|...:                 |.:..:....:.:|:.|||:||:
  Rat  2722 CTIDWFNEWPAEALQSVATRFLHEI-----------------PELECSSEVIEGLIHVCVYIHQS 2769

  Fly  3161 LHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEM 3225
            :.:..........|...|||:.||:.::.|..|..:|:.:|:..:..:..||:|:..|.|.|.:|
  Rat  2770 VAKKCVEYLAELARHNYVTPKSYLELLNIFSILIGQKKMELKTAKHRMKSGLDKLLRTSEDVAKM 2834

  Fly  3226 QKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQ---DQQEAE--KKKIQSQEIQIRLADQTVKIEEKRKYV 3285
            |:.|.:.:..|:   |||...|..|.|   |...||  :|.:|::||         |..||....
  Rat  2835 QEELEIMRPLLE---EAAKDTLLTMDQIKVDTAIAEETRKSVQAEEI---------KANEKASKA 2887

  Fly  3286 MA-------DLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLL-------- 3335
            .|       ||.:..||:..|.|:::::.|..:.|||.|..||..|||.:|::|::.        
  Rat  2888 QAIADDAQKDLDEALPALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVP 2952

  Fly  3336 ----GENATD-WKSIRAVIMRE-NFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRAS 3394
                |....| |:..:.::... .|:.|:. .|..:||.:.|.:.:: .|:.|.::....:.:.|
  Rat  2953 GEKPGSKVDDYWEPGKGLLQDPGRFLESLF-KFDKDNIGEAVIKAIQ-PYIDNEEFQPAAIAKVS 3015

  Fly  3395 MACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKETKDLVEQLERSIAAYKEEY 3459
            .||..:.:|..|..:|..:.|.|||.|:.||..::..:|.....:|.|..:.::|..|:..:.:|
  Rat  3016 KACTSICQWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALREAQDDLEVTQRILEEAKHHLREVEDGISTLQAKY 3080

  Fly  3460 AQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAY 3524
            .:.:::.:.::...|..:.::.|:..|:..|..|:.||:.|.|..::.:..|.||||::|.|:||
  Rat  3081 RECVTKKEELEMKCEQCEQRLGRADKLINGLADEKVRWQDTVENLENMLDNIFGDVLVAAGFVAY 3145

  Fly  3525 GGYFDQHYRLNLFTTWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTENAIMLK 3589
            .|.|...||..|:..|...|....:.:.:.......|.||.:...||...||.|.|..||.::.:
  Rat  3146 LGPFTGQYRAALYEYWVNQLTVYGVPHTSKPTLISTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQ 3210

  Fly  3590 RFNRYPLIIDPSGQATTFLLN--EYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ENYDP 3651
            ...|:...|||.|||..::.|  :.:|..:.|.|  |..|.:::|:|:|||.|.|:::| |..||
  Rat  3211 FSQRWTHFIDPQGQANKWIKNMEKESGLDVFKLS--DRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEELDP 3273

  Fly  3652 ILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSL 3716
            .|.|||.::..:..|..::.|||..|.....|.::::|:.|...:.|::.:::|.:|||::.|.|
  Rat  3274 ALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYSPEVSTKLTLINFTLSPSGL 3338

  Fly  3717 QSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVITTLETL 3781
            :.|.|.||:..||||::|.::.|:....:.|..|:.:|..:|..|:.::|..:||..:|..||..
  Rat  3339 EDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYRLSSSEGNPVDDVELIKVLEAS 3403

  Fly  3782 KKEAYDINQKVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKMFLDIFST 3846
            |.:|.:|..||...::...:|:....:|:|::|....::|.:..|..|..:|||||:.||:||.:
  Rat  3404 KMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAVRTQILFFCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLS 3468

  Fly  3847 VLYNNPKLEGRTDH-SERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMCKIHLKGTSESNLDA 3910
            .:.|:.    |.|: .:|:..:.|.|....|..|.|.:....:|.||.|:|...:....:.| ..
  Rat  3469 GIANSE----RADNLKKRIVNINRYLTFSLYSNVCRSLFEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKIN-QG 3528

  Fly  3911 EFNFFLR--SREGLLANPTPVEGLSAEQIESVNRLAL-RLPIFRKL-LEKVRSIPELGAWLQQSS 3971
            |:.:.|.  |.:.:..||.| ..||......:  ||| .||.|... .:.|:.:|:..|....:.
  Rat  3529 EWRYLLSGGSIQTMSENPAP-HWLSDRAWRDI--LALSNLPAFSTFSTDFVQHLPKFQAIFDSAE 3590

  Fly  3972 P-EQVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNAEQELDFTS 4035
            | .:.:|.:|      :.......:||:::..|.|:|..|..:.|...|...|:   |.:....|
  Rat  3591 PHREPLPGIW------NTYLDEFQKLLILRCLRGDKVTNAMQDFVANHLEPRFI---EPQTANLS 3646

  Fly  4036 VVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQ--NKQISSIAIGSAEGFNQAERAINMACKTGR 4098
            .|.|:.|..||.:....||.|.:..:...|.|.  :|::|:|::|..:| .:||..:..:.:.|:
  Rat  3647 AVFKESNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFSKKLSAISLGQGQG-PRAEAMMRNSIERGK 3710

  Fly  4099 WVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSLQP---HSGFRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGIR 4160
            ||..:|.||||.|:..||:.:..:.|   |..|||:||...:.|.||::|:.|.....|||.|::
  Rat  3711 WVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLWLTSLPSNKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVK 3775

  Fly  4161 ANLLRTFSTV------PAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWAKKYEFNESDLR 4219
            ||||::::::      ...::::..|    |...|..||....||.::.|||:...|||.:.|||
  Rat  3776 ANLLKSYNSLSDDFLHSCQKVVEFKS----LLLSLCLFHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLR 3836

  Fly  4220 VACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTSFLKKLFTARSF 4284
            :....|..::|..         |.:|:..|.....:..|||::.:|:|:|.:.:.|:..:.....
  Rat  3837 ICISQLKMFLDEY---------EDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTDDWDRRCVMNILEDFYNPAVL 3892

  Fly  4285 EADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAEKVLLTTRGTDL 4349
            ..:...      :..|:.| .:|.....:.:|.:|::|.....|...||.:||...........|
  Rat  3893 SPEHRY------SKSGIYH-QIPPTYDLNGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFAL 3950

  Fly  4350 VSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLELLPKNL---QVLK 4411
            ...:|::|....      |:..||.:..|   ||           .|...|..:||.:   :|:.
  Rat  3951 FGAILQLQPKSS------SMGGQSREELV---ED-----------VAEDILVQVPKPVDLEEVVN 3995

  Fly  4412 RTVENIKDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSELVRGIIPKGW 4476
            :.....::.:.....:||...::||..:...|.|::...:|....:.....|.:.|....:|:.|
  Rat  3996 KYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNKLLMVITQTLSDMLKAIKGLVVMSLELELMSTSLYNNAVPELW 4060

  Fly  4477 KRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFP--VWLGGLLNPEAYITATRQC 4539
            |....|:...:..||.|...|:..|....:          .|.|  .|:.|...|:|::|.|.|.
  Rat  4061 KSKAYPSLKPLASWIMDLLQRLNFLHSWIK----------NGIPSVFWISGFFFPQAFLTGTLQN 4115

  Fly  4540 VAQANSWSLEELALD---VTITDAGLKNDQKDCCFGVTGLKLQG----------AQCKNNELLLA 4591
            .|:....|::.:..|   ::...:.:.......|: :.||.|:|          |:.:..||...
  Rat  4116 FARKFVISIDTITFDFKVLSYASSEIAERPSTGCY-IYGLFLEGARWDPFDFQLAESRPKELYTE 4179

  Fly  4592 STIMMDLPVTILKWIKISSE-----PRISKLTLPVYLNSTRTELLFTVDLAVAAGQESHSFYERG 4651
            ..::..|||...   |:.::     |....||....|::|.....:.:.:.:.:.|....:.:||
  Rat  4180 MAVIWLLPVANR---KVQNQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAVEIPSNQPQRHWIKRG 4241

  Fly  4652 VAVL 4655
            ||::
  Rat  4242 VALI 4245

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 240..839 CDD:285571 116/631 (18%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 1001/3502 (29%)
DHC_N2 1326..1724 CDD:285579 125/421 (30%)
P-loop_NTPase 1870..2103 CDD:304359 130/232 (56%)
P-loop_NTPase 2227..2367 CDD:304359 65/148 (44%)
P-loop_NTPase 2572..2835 CDD:304359 87/292 (30%)
Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B 2834..>2943 CDD:294426 37/125 (30%)
P-loop_NTPase 2916..3194 CDD:304359 76/277 (27%)
MT 3208..3544 CDD:289543 99/361 (27%)
AAA_9 3569..3784 CDD:289547 73/217 (34%)
Dynein_heavy 3925..4636 CDD:281078 176/747 (24%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:400618 125/424 (29%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 872/2865 (30%)
AAA_6 1528..1854 CDD:403853 166/368 (45%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:408026 66/336 (20%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.710

Return to query results.
Submit another query.