DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dnah11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4922 Identity:1266/4922 - (25%)
Similarity:2162/4922 - (43%) Gaps:825/4922 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    62 RKFLSDPQVQAL---YVQRNCIKEDDSEQPAEGEDEKEQVTYQISNDVHFTNSRMASLAC----- 118
            ::|..||:|:.|   ..|.....|:...:..|.||.:     |:..| ...:|..|||..     
  Rat    32 QRFAVDPRVRFLGGRLQQALGFPEETWGEYLESEDHR-----QVLGD-FLESSGPASLVFSVAPG 90

  Fly   119 -----------IKRGLVVEADK-------SIHSQLRLINFSDGSPYETLHAFISKSLAPYF---K 162
                       :|..||..|.|       |..||..|......|.:..:.||:.:.|.|..   .
  Rat    91 LLSASPEIPRDVKHKLVYFAKKMTGSTGESDFSQTVLFGEIPRSLFTHVTAFLDEILVPILSNKN 155

  Fly   163 SYVKESGRADRDGDKMAPSVEKKLAELEMGLLHLQQNIDIP----EITLTAHQTVNNVIRKCAEE 223
            ::...|....:|.:.....::.|: .:..|.:..:.::.||    .|.|..|.:|.   |..::|
  Rat   156 NHESWSCFISQDVEHHTEIMKNKM-HIFRGKMSRRTHLPIPTIAENIDLDQHYSVT---RPQSDE 216

  Fly   224 NRKAKVADFGDKVEDSSFLNLLQNGVNRWIAEIKKVTKLNRDPG----SG---TALQEISFWLNL 281
            .|               .|:.:::.|.:|..:|:::  :.:|..    ||   |...|:.||...
  Rat   217 RR---------------ILHAIESVVIKWSHQIQEI--IEKDSAQPLLSGLHPTPETELDFWTMR 264

  Fly   282 ERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGKRFHATVSFDTDTGLKQALATVAD----YNPLMK----- 337
            ...|..|..:.::|.|...:.||:..:..:........|.::.||....|    ..||.|     
  Rat   265 HDNLKCIYHQLQAPIVLKMVKILRTRQSSYLPALKGIFTTVENALLEARDVELHLRPLRKHIQGL 329

  Fly   338 ---DFPINDLLSATELEKIRPAVQQ---IFAHLRKVRNTKYPI-----QRCLKLIEAISRDLS-Q 390
               |||...:|       |.|.:..   |::| .|..|:...:     :.|...|:.....|| :
  Rat   330 QEADFPQTGIL-------IAPLIHTICLIWSH-SKFYNSPARVIVLLQEFCNLFIDQARAYLSPE 386

  Fly   391 QLLK------------VLGTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSCWDDE---YDKLQGLLRDIVKK 440
            .|||            .:|..|:....|.::.|.:...|    ..|.|   :|....|:.....|
  Rat   387 DLLKGEIEDALEKVQVAIGVLRMFQNSFFKYRRGLTSYF----TGDTEQRPWDFQSHLVFSRFNK 447

  Fly   441 KRDEHLKMVWRVSPAHKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQPYS 505
            ..|..:|:                         |.:...||...:..:...|.....|...|.:|
  Rat   448 FLDRLVKI-------------------------EDMFVTILEFEKLERLEFGGSKGAVLNAQIHS 487

  Fly   506 LDAADANAIEEVNLAYENVKE-VDCLDITKEGSEAWEAAVKRYEEKIDRVETRITAHLRDQLGTA 569
            :   ....||..|:..:::.: .||      .|..:|:...:::.|....:.|:...|.:.|...
  Rat   488 M---KEEFIECCNVFRQSIYDPSDC------DSMEFESDYFQFKSKTLDFDRRLGTLLCEGLSNC 543

  Fly   570 KNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDIEALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRD 634
            ......|::.:.|.....:|.:......:.:.|:.....:::.....:.....|.:.......::
  Rat   544 SGLESAFKLLTIFGNFLEKPVVMEIFSPHYSTLLNMFNAELDMCKRLYDEHMKQIEHGHEILNKN 608

  Fly   635 LPPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWETHIEGQKLKADG-----------------DS 682
            :|..:|:|.|||.:..:|.|:           |........|..|.                 |.
  Rat   609 MPFTSGNIKWARMLLERLQMF-----------WSNFTSLHYLFPDSPDEAAVCQKYAEMTTLLDQ 662

  Fly   683 FRAKLSISDVFHEWARKVQERNFGSTGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVNFLPEIITLAKEVRNI 747
            |.::     ::.||.|.|.:.      ..|.:.....:....|.| |.|||.|:::.:.:||:.:
  Rat   663 FESR-----IYSEWRRNVDKT------CEFNLNQPLVKFSPINGL-LSVNFDPKLVAVLREVKYL 715

  Fly   748 KNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERTLEKLNNRSLAQNSVFKIEDRASIVPLV 812
            ..|             :.:.|...|:.:.:....   .|:.:.|..|                ||
  Rat   716 LML-------------KKSNIPDSALGIFQKKNI---ILKHIGNLEL----------------LV 748

  Fly   813 AGLRKDVLNLVSEGIGLIWESYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDDLLVVEEQLDVDVRSLETCPYS 877
            .|..|....|:.....||                     ||  :|..::|||.|           
  Rat   749 QGYNKLKQTLLEVEYPLI---------------------EK--ELGAIDEQLRV----------- 779

  Fly   878 AAT-------FVEILSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRLDEEVEKKLALRLQAGIQAWTE---- 931
            |||       |...:.|:|.|..:|..|        |::....|:     .:|..:|||.|    
  Rat   780 AATWLTWQDDFWVYMEKVQVATAELERR--------VSQTQSNVQ-----TIQQTMQAWAEWPLL 831

  Fly   932 ALTGNKKEVDTSMDT--DAPAQPTHKLGGDP-QIQNAVHEIRITNQQMY-LYPSIEEARFQ---- 988
            .....::|...::|.  |..|:....:..|. :|.|.|.|    |:::: ..||::..:..    
  Rat   832 PRRETRREAALTLDDKGDLFAKKYKLIREDGYKIHNLVEE----NRKLFRADPSLDSWKIYVEFI 892

  Fly   989 ---IMQQFFAWQAIVTS-QVRLQSTRYQV---------------------GLEKHVSQTYRNLLT 1028
               :::.||  |.|:.. ...|::|..|:                     .||:.....:.||:.
  Rat   893 DDIVVEGFF--QTILHDLDFFLRNTEKQLKPAPFFQAQMLLMPPEIVFKPPLEREAGDGFYNLVE 955

  Fly  1029 KLPEGKI---------------------LENAYGAIEQK---VSEVRNYVDEWLRYQS------- 1062
            .:..|..                     ::|..|..|.:   ::.|.:.:|:.|.::|       
  Rat   956 AMLCGSFKVSAQMGRVAAHLDIPDYQNDMDNMLGLAEVRQEIMNRVADVIDKVLEFRSSLETYSY 1020

  Fly  1063 LW------DLQADMLYGR----------LGEDVNLWIKCLNDIKQ----------SRTTFDTSDT 1101
            ||      .|:..:|||.          .|||: |....|...|:          ..:.||....
  Rat  1021 LWVDDRVEILRQFLLYGHAVPSEEIDAPAGEDI-LQSPTLEQFKEQIDIYEALYVQMSKFDDFRV 1084

  Fly  1102 RRAYGPIIIDYAKVQAKVTLKYDSW-HKEALGKFGTLLGTEMTSFHSKVSKSRTDLEMQSIEAAS 1165
            ..::..|.:...|:.....:|..|| .:|.|.:|.....:|:..|   :.::...|:.|..| ..
  Rat  1085 FNSWFKIDMRPFKLSMLNVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSELQGF---IKQTNAGLQRQPHE-GD 1145

  Fly  1166 TSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFP-NTWLHVDNIEGEWSAFNEI-- 1227
            ....|..:.::.:::....|.|:..|..:|...:||....:.| ..:..::.:...|....:|  
  Rat  1146 HDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPLKETIMLLESYGQKMPEQVYAQLEELPERWETTKKIAA 1210

  Fly  1228 -IKRKDTAIQ-TQVASLQAKIVAEDKAVETRTVDFLNDWEKTKPTGGKIRP-----DDALQQLQI 1285
             ::.:.:.:| .:|..|:.|.:..|:    :..:|...:....|.|.|...     |.|.|:|:.
  Rat  1211 VVRHEVSPLQNAEVTLLRKKCILFDE----KQAEFRERFRSYAPLGFKAENPYSVLDKANQELEA 1271

  Fly  1286 FESKYSRLKEERDNVVKAKEALELQESAVPNNSAERMNVALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETR 1350
            .|          :.||:.:....|.|..:|  ..::|.....|::.|:.:|..:..|...||...
  Rat  1272 LE----------EEVVQMQNCARLFEVVLP--EYKQMKQCRREVRLLKELWDIIVYVRRSIDNWT 1324

  Fly  1351 EKPWLSVQPRKLRQQLEAMMAQLKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERH 1415
            |..|..|...::..:|.....::..|...:|::::|..::..::........:.||::.||::||
  Rat  1325 ETRWRQVNMEQMDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAVAELQNPALRDRH 1389

  Fly  1416 WKQLTKQLRVNWVLSD-LSLGQVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELD 1479
            |:|||..:.|.:.::| .:|..:..|.|.:.|..|:||:..|..|:..|:.:..|..:|:..|..
  Rat  1390 WQQLTNAIGVRFSINDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVITDVSHTWEALEFS 1454

  Fly  1480 L-INYQNKCRIIRGWDDLFNKVKEHINS----------------------------VAAMKLSPY 1515
            . ::::....:::..:.||..: ||..|                            :..:..|.|
  Rat  1455 YEVHHRTGTPLLKSDEQLFETL-EHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLLQSKY 1518

  Fly  1516 YKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRFQSISSEFLG 1580
            .:.|.::.|:|:.|||..:|:...|:.|||.|.:||.||..|.||:..|..:..||..:.:||..
  Rat  1519 VEYFIDQVLSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDAEFKE 1583

  Fly  1581 LMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIG 1645
            ||.|..|...|::....|.:...|:.....|...:|||.||||.:|.:|.||||:...|||:::.
  Rat  1584 LMFKTAKIKNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTFSRFYFISSADLLDLLS 1648

  Fly  1646 NSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEENNV----ILGISSREGEEVHFMNPVSTVEHPKINEWLS 1706
            ......::.:|..|:|..::.:...:...|    .:|:.|:|.|.|.|......:.|  :..||.
  Rat  1649 KGAQPKQVTRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSFQAGCECIGH--VESWLL 1711

  Fly  1707 LVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAYME-----WCDKYQAQIVVLAAQILWSEDVES 1766
            .:|:.|:.|:...:|:|:             .||.|     |...:.||:.:..:||.|:.||..
  Rat  1712 QLEQTMKETVRLAIAEAI-------------AAYEEKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTTDVGI 1763

  Fly  1767 ALQQASENNQS--KPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLN 1829
            |..:..|..::  |...:   ...|.||.|...:|.|..|..|:|:..:....||.|.|..:|::
  Rat  1764 AFSRLEEGYETALKDFHK---KQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKLIS 1825

  Fly  1830 NGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYLTM 1894
            ..|.||::|.||.::|..::    |..:...:::.:|.|.|.:||||...|||.||||||||:|:
  Rat  1826 QKVVSPRAFTWLSQLRHEWE----ESRKHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYITL 1886

  Fly  1895 TQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCF 1959
            ||:|...:.|:|.|||||||||:.|.||..||..|.||||.|..|::::|.|:.||.|.||||||
  Rat  1887 TQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWGCF 1951

  Fly  1960 DEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPGYAGRS 2024
            |||||:...:||..:.|::.|.:|::    |.:....  .:|:.:.:.|.:.||||:|||||||:
  Rat  1952 DEFNRIAVEVLSVVAVQVKMIHDAIR----SRRRRFV--FLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRT 2010

  Fly  2025 NLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFGLR 2089
            .||:|||.|||..||..||.:||.|:||.::||..|..||.|.:..:.||||.||.|.|||:|||
  Rat  2011 ELPENLKALFRPCAMVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLR 2075

  Fly  2090 ALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIP 2154
            |:||||:.||::|             |||         :|.||.::|::::.:..:||:|.:|:|
  Rat  2076 AIKSVLVVAGSLK-------------RGD---------KNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVP 2118

  Fly  2155 LLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKE-------EIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWV 2212
            :...|:||:||.:...|......::       |:|...:|.:::                     
  Rat  2119 VFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQMVKQSTLELRLQPEESFIL--------------------- 2162

  Fly  2213 DKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVAHVIDPKAISKEALYGVLD 2277
             ||:||.::..:.|.:.:||.:|:|||...:||.:.....: .:.|.:.::|||::.:.|:|.:.
  Rat  2163 -KVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVNMK-QKPVWNDLNPKAVTTDELFGFIH 2225

  Fly  2278 PNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQ----WIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNG 2338
            ..||||.|||.:.|||:       :.|...    ||:.|||:||.|:|:||:|:||||:|||.:.
  Rat  2226 HATREWKDGLLSSILRE-------QANLTHDGPTWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDDNKVLTLASN 2283

  Fly  2339 ERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPLEDGDEDFV 2403
            ||::|.|::|::||...|:.||.|||||.|:::.:...|.......:::.|.|.           
  Rat  2284 ERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNPYVASWIDRRRH----------- 2337

  Fly  2404 GVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTRLRALSSL-FS 2467
                               |.:.|.|.:.|.....:.:..|.           |..:|::|: .|
  Rat  2338 -------------------QSEKANLTILFDKYIPVCLEKLR-----------TSFKAITSVPES 2372

  Fly  2468 MLNQAARNVLTFNAQHPDFPCSA--DQLEHYIPKALVYSVLWSFAGDAKLKVRIDLGDFV----- 2525
            .|.|....:|.......:.|..:  :..|.|    .|::.:|:|.|..   :|..|.|:.     
  Rat  2373 SLVQTICTLLECLLTPENIPSDSPKETYEVY----FVFACVWTFGGTL---LRDQLSDYQADFSR 2430

  Fly  2526 ---RSVTTVPLPGAAGAPIIDYEV-NMSGDWVPWSNKVPVIEVETHKVASP--DIVVPTLDTVRH 2584
               :.:..|..|  :...|.||.: :.:..::||::|||...::..   :|  .::|.|.:|.|.
  Rat  2431 WWHKEMKAVKFP--SQGTIFDYYLDHKTKKFLPWTDKVPQFTMDAD---APLKTVLVHTPETTRL 2490

  Fly  2585 ESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDMEVVG---LNF--SSATTPELLLKTFDH 2644
            .......|.:.|||:|.|..|.|||:.|...|.::.:..:|.   .|:  :||....:|.|..:.
  Rat  2491 RYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVFLSDTLASISEDYIVSRVPFNYYTTSADLQRILEKPLEK 2555

  Fly  2645 YCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQAWVS 2709
            .......|.|        .|.||.|.|::|:|::|.|||.:..:.|||.:::..:|   |:..|.
  Rat  2556 KAGRNYGPRG--------NKKLVYFIDDLNMPEVDLYGTVQPHALLRQHIDYGHWY---DRHKVM 2609

  Fly  2710 LERI---QFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIYG----------TFSRA 2761
            |:.|   |:|...||..  |...:..|..||..::..::|...:|..|||          .|..:
  Rat  2610 LKEIRNCQYVACMNPMA--GSFTVDPRLKRHFTVLAFNFPSLDTLTTIYGQIFSFYLQQQAFCPS 2672

  Fly  2762 MLRLMPALRGYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQPHYVYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLPVE 2826
            :||..|:|..........|.|.::.:..:|      ||.::.|:::...:||..|.......| |
  Rat  2673 VLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKF------HYNFNLRDLSNIFQGILFASPECLKCP-E 2730

  Fly  2827 GLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRWTNENIDLVGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLS--KD-- 2887
            .|.|||.||..|::.|||||.::.......:.....|:|.|.:.....|:|::|.::.|  :|  
  Rat  2731 DLARLWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKMLEAAHKYFKGADANTLQQQPLVYCHFASGREDPC 2795

  Fly  2888 YMPV-NREELREYVHARLKVFYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKT 2951
            |.|| :.|.|:..:...:..:.|...::.||||::.:.||.||.||.|.||||.||:||.|:||.
  Rat  2796 YEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHSEMHLVLFEDAMQHVCRISRILRTPQGHALLVGVGGSGKQ 2860

  Fly  2952 TLSRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMN 3016
            :|||..|::..|.:|||.:...|.::|...||..:..|:|.|:....|:|.:::|||..||..:|
  Rat  2861 SLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFLLTDAHVLDESFLVLIN 2925

  Fly  3017 TLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDG 3081
            .|||:|::||||..::...:::..:...:..|: .||.:..:.:|..:|...|.:||..:|....
  Rat  2926 DLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRGLGI-TDSRENCWAFFLARVRLQLKMVFCFSPVGHT 2989

  Fly  3082 LKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPANPTH 3146
            |:.||...|||.|...::||..|...||..|.:.|...::                   ...|.|
  Rat  2990 LRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFIEEIE-------------------GIEPQH 3035

  Fly  3147 RDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVG 3211
            :|::.....|||.::.:.:|...:...|....|||.:|:.|..|..|..:||.:::.::.||..|
  Rat  3036 KDSISLFMAYVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYTTPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNG 3100

  Fly  3212 LNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQM-FQDQQEAEKKKIQSQEIQIRLADQT 3275
            :.|:..|..||..::..||.::.|||.:|:.|.|.:.:: .|.::.:.:|.|...|.:...|.||
  Rat  3101 IQKLQTTASQVGNLKARLASQEAELQLRNQDAEALITKIGLQTEKVSREKAIADAEERKVAAIQT 3165

  Fly  3276 VKIEEKRKYVMADLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLLGENA- 3339
             :..:|::...|||.:.|||::.|.||:.::.:..|.|::|..|||:.|.....::.:||.... 
  Rat  3166 -EASQKQRECEADLLKAEPALVAATAALNTLNRVNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLAPRGR 3229

  Fly  3340 ----TDWKSIRAVIMR-ENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMACGP 3399
                ..||:.|..:.: ::|:.::: |:..|:|.::..:.:..:||.:|::|...:...|.|...
  Rat  3230 VPKDRSWKAARIFMGKVDDFLQALI-NYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAG 3293

  Fly  3400 MVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKE--------TKDLVEQLERSIAAYK 3456
            :..|.|..|::.::...|||.|:.|    .|.:::||:|.|        ..||...|.|..|:::
  Rat  3294 LCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRQAL----AQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFE 3354

  Fly  3457 EEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAF 3521
            :..|:.:    ..:.::......:|.:..|:..|..|:.||..:.::|::|..|:.|||||:|||
  Rat  3355 KATAEKV----RCQEEVNQTNKTIDLANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAF 3415

  Fly  3522 IAYGGYFDQHYRLNLF-TTWSQHL-QAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTEN 3584
            ::|.|.|.:.||..|. ..|...| |..||.....:.....|::......|....||:|.:.|||
  Rat  3416 VSYIGSFTRQYRQELVDCKWIPFLQQKVSIPIAEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTEN 3480

  Fly  3585 AIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-EN 3648
            |.:|....|:||:|||..|...::.|:| |..:..|......|...:|.||.||:.:|:::: |.
  Rat  3481 ATILTHCKRWPLMIDPQQQGIKWIKNKY-GPDLKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKET 3544

  Fly  3649 YDPILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTR 3713
            .||:|.|:|.|...:.|  ..|.:||::.:.:.:|.:.|.|:.....:.|::.::.|.:|||||.
  Rat  3545 VDPVLGPLLGRNTIKKG--KYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTE 3607

  Fly  3714 SSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSVITTL 3778
            ..|:.|.|.:|:..||||::..:..|.|.|.:|::.||.||:.||..|:.|:|..|||..::..|
  Rat  3608 DGLEGQLLAEVVSVERPDLERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERL 3672

  Fly  3779 ETLKKEAYDINQKVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKMFLDI 3843
            ||.|..|.:|..||.|..:...:|....:.|.|::...|.:||.:..|.:::.:||:|||.|..:
  Rat  3673 ETTKATAAEIEHKVIEARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTL 3737

  Fly  3844 FSTVLYNNPKLEGRTDHSERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMC--------KIHL 3900
            |...:....|:|   |..||:..:...:....:...::.:...|:|||...|.        :|| 
  Rat  3738 FHRAIEQADKVE---DTQERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIH- 3798

  Fly  3901 KGTSESNLDAEFNFFLR-SREGLLANPTPVEGLSAEQIESVNRLALRLPIFRKLLEKVR-SIPEL 3963
                    ..|.:|.|| :.|...:  :||:.|:|:...:|..:|| :..||.|...|. |..:.
  Rat  3799 --------PLELDFLLRFTVEHTYS--SPVDFLTAQSWSAVKAVAL-MEEFRGLDRDVEGSAKQW 3852

  Fly  3964 GAWLQQSSPE-QVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNA 4027
            ..|::...|| :.:||.|.:.       |.:.:|::::|.||||:..|..|.|...||..::...
  Rat  3853 RKWVESECPEKEKLPQEWKKK-------SLIQKLIILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERT 3910

  Fly  4028 EQELDFTSVVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQNKQISS-----IAIGSAEGFNQAE 4087
              .||......:. :..||......||.||...::.|.......|.|     :::|..:.. .||
  Rat  3911 --RLDLGKAFGES-SPGTPVFFILSPGVDALKDLEVLGKRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQEL-VAE 3971

  Fly  4088 RAINMACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMH--SLQPHSGFRLFLTMEI-----NPKVPVNLL 4145
            .|:..|...|.||.|:||||..:||..|||.:.  |...|..:|:||:.|.     .|.:|..||
  Rat  3972 MALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKWLGTLEKLLEKFSQGSHRDYRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLL 4036

  Fly  4146 RAGRIFVFEPPPGIRANL---LRTFSTVPAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGW 4207
            ........|||.|:.|||   |..|.. ....|.....|...:.|.|.:||..|..|||:.|.||
  Rat  4037 ENSIKITNEPPTGMLANLHAALYNFDQ-DTLEMCSKDQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGW 4100

  Fly  4208 AKKYEFNESDLRVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLT 4272
            ::.|.|:..||.:..:.|...::..         ..|||:.|..|..:.||||.|.:.:|::|..
  Rat  4101 SRSYPFSPGDLTICTNILYNHLEAN---------PHVPWEDLRYLFGEIIYGGHITDAWDRKLCR 4156

  Fly  4273 SFLKKLFTARSFEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNA 4337
            .:|::.......|.:..|      |.|    ...|..:....:.::||::...::|:..||..||
  Rat  4157 VYLEEFMNPSLIEDELML------APG----FAAPPYSDYSGYHQYIEDMLPPESPALYGLHPNA 4211

  Fly  4338 EKVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLEL 4402
            |..|||.....|...||:||                .::||...|.|:.:..| :.|.....||.
  Rat  4212 EIELLTVTSNMLFRTLLEMQ----------------PRNAVSNEEQGQSTEDK-VKNILDDILER 4259

  Fly  4403 LPKNLQVLKRTVEN-IKDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSE 4466
            ||:...:.:...:| .:.|......:|....:.||:.:.:.||.:.|..:||...:....:.||.
  Rat  4260 LPEEFNMAEIMQKNPNRSPYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSA 4324

  Fly  4467 LVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFPVWLGGLLNPEA 4531
            |....:|..|.:...|:...:.||..|...|.::|...:|.::....       |||.||.||::
  Rat  4325 LSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLTLPAV-------VWLSGLFNPQS 4382

  Fly  4532 YITATRQCVAQANSWSLEELALDVTITDAGLKNDQKDCCFG--------VTGLKLQGAQ--CKNN 4586
            ::||..|.:|:.|.|.|:.:.|.:.:|    |..::|  :|        :.||.|:||:  .::.
  Rat  4383 FLTAIMQTMARKNEWPLDRMCLTIDVT----KKTKED--YGHPPREGAYLHGLHLEGARWDIQSG 4441

  Fly  4587 ELL------LASTIMMDLPVTILKWIKISSEPRISKLTLPVYLNSTR 4627
            .|:      |.||    :||...|.|....:........|||....|
  Rat  4442 ALVDARLKELTST----MPVIFAKAIPADRQEVKHAYECPVYKTKAR 4484

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 116/657 (18%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 985/3516 (28%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 74/302 (25%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..791 CDD:462457 126/707 (18%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:462462 110/428 (26%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 851/2835 (30%)
AAA_6 1862..2188 CDD:463697 152/375 (41%)
MT 3095..3439 CDD:463699 97/353 (27%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:465677 74/302 (25%)

Return to query results.
Submit another query.