DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc64C and Dnah9

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002727768.2 Gene:Dnah9 / 117251 RGDID:621799 Length:4484 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4822 Identity:1199/4822 - (24%)
Similarity:2185/4822 - (45%) Gaps:802/4822 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   175 GDKMAPSVE---KKLAELEMGLLHLQQN-IDIP-----EITLTAHQTVNNVIRKCAEENRKAK-- 228
            ||..|..:|   ..|:|:.:.:|..::| :|.|     :|...||...::::  ...|:.|.:  
  Rat   121 GDLPAVPLEHLAPLLSEVIIPVLDNEKNHLDWPHMVCQDIRHHAHSLQSDLL--VILEHMKGRTL 183

  Fly   229 --VADFGDKVE-------------DSSFLNLLQNGVNRWIAEIKKVTKLNRDPGSGTALQEISFW 278
              :....:|||             |.|.:..:::.|.:|..:::.|                   
  Rat   184 LPLPVGSEKVEFVDGQSEPVLDSIDKSTVYAMESAVIKWSHQVQVV------------------- 229

  Fly   279 LNLERALYRIQEKRESPEVALTL-----DILKHGKRFHATVSFDTDTGLKQALATVADYNPLMKD 338
            |..|.:...||.::.:|:|.|..     :.|:|......|:......||...|.  :.|.|..|.
  Rat   230 LKRESSQPLIQGEKPTPKVELEFWKSRCEDLEHIYNQLMTIKVRGMAGLLDKLQ--SSYLPAFKA 292

  Fly   339 FPINDLLSA-TELEKIRPAVQQIFAHLRKVRNTKYPIQRCLKLIEAISRDLSQQLLKVLG-TRRL 401
            . ..|:.:| ||.:.||       .||       .|:|:.|.::|      :.:..:|.| .|.|
  Rat   293 M-FQDVEAALTEAQDIR-------VHL-------LPLQQHLDILE------NMEFPEVKGRLRPL 336

  Fly   402 MHIPFDEFERVMNQCFEIFSC-WDDEYDKLQGLLR-----------------DIVKKKRDEHLKM 448
            :|:          .|....:| |.....:|..||:                 |:::.:.:|..:.
  Rat   337 LHV----------VCLIWANCKWYRSPGRLTVLLQEICNLLIQQASNYLSPEDLLRSEVEESQRK 391

  Fly   449 VWRVSPA----HKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRT-------VILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQ 502
            :..||..    .:..|.|.||:..:.::..::|.       |.:|:          ||.:...:.
  Rat   392 LQIVSDTLSFFKQAFQDRREHLHTYFKEDSEVRAWDFQASLVFVRL----------DGFLGRLRM 446

  Fly   503 PYSL--DAADANAIEEVNLA--------------YENVKE-----VDC-LDITKEGSEAWEAAVK 545
            ...|  .|.|.|.:|::..:              :|..:|     :|| .|.....|..:|..|.
  Rat   447 VEDLLKTALDFNKLEKLEFSGLRGNSLSQKVQQMHEEFEEMYKVFLDCSYDCLNPESMEFENDVC 511

  Fly   546 RYEEKIDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDI 610
            .:.::::.::.|:...|.............|::......|..||.:...:......||:....::
  Rat   512 GFNKRVEDLDRRLGTILIQAFDDVPEVEHAFKLLDITGTLVERPLVAQDVSHKYLALIRMFNTEL 576

  Fly   611 EALHEKFKVQYPQSKSCRLSSV-RDLPPVAGSIIWARQIDNQL--------------------TM 654
            :|:...:.....:......|.| :::|.:||.|.||:::..::                    ..
  Rat   577 DAVRIIYSQHIREEVEHGFSPVHKNMPTMAGGIRWAQELRQRIKGPFSNFKNIPHWCLQSAEGKR 641

  Fly   655 YLKRVEDVLGKGWETHIEGQKLKADGDSFRAKLSISDVFHEWARKVQERNFGSTGRIFTIESTRS 719
            .:::.||:|     |.:|..:.:              ::.:|.:.|.|:            |.|:
  Rat   642 MIQKYEDLL-----TLLEEYERR--------------LYEDWCQTVSEK------------SQRN 675

  Fly   720 ----RIGRGNVLR-LRVNFLPEIITLAKEVRNIKNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPY---AISLI 776
                .:.|..:.: |.|||..::|::.||:..:                |..::.|.   |.::.
  Rat   676 LSLPLLHRDPITKQLSVNFNSQLISVLKEMNYL----------------QPTEVKPIPETAAAMF 724

  Fly   777 ESVRTYERTLEKLNNRSLAQNSVFK---------IEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEGIGLIWE 832
            .|...|.:.:..|...:...|.|..         :|:....:.|.....::.|:..:||   ||:
  Rat   725 SSREFYRQLVANLELMANWYNKVITTLLEVEFPLVEEELQNIDLRLRAAEETLSWKTEG---IWD 786

  Fly   833 SYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDDLLVVEEQLDVDVRS-----------LETCPYSAATFVEILS 886
                  |.::::..:...:.::.......|::...:::           .:.||.|.....::|.
  Rat   787 ------YAMQITNSIHDLERRIQKTKDNVEEIQTIMKTWVSPIFKRKDGKKECPLSLDDQQDLLE 845

  Fly   887 KIQHAVDDLSLRQYS----NL---------SVW---VTRLDEEVEKKLALRLQAGIQAWTEALTG 935
            |....:.:..|:.::    ||         |.|   |..:|..:.....|.::..::...|    
  Rat   846 KYYSLIRESGLKIHALVQENLVLFAADPASSTWKSYVGHIDSMLLDGFFLAIECSLKYLLE---- 906

  Fly   936 NKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQNAVHEIRITNQQMYLYPSIEE----ARFQIMQ----Q 992
                     :|:.      |.|..|..:   .::.:...::..|||::.    ..:.|:|    .
  Rat   907 ---------NTEC------KPGLTPIFE---AQLNLVTPELVFYPSLDSGVKGGLYDIVQSLVTS 953

  Fly   993 FFAWQAIVTSQVRLQ----STRYQVGLEKHVS------------QT-------YRNLLTKLPEGK 1034
            .||..::|.   ||.    |..||..||:...            ||       |||.|::     
  Rat   954 IFAVPSLVP---RLSPHSGSPHYQGDLEEMADLASLRSLLLERVQTMMTLCCSYRNTLSQ----- 1010

  Fly  1035 ILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRYQSLWDLQADMLYGRL--GEDVNLWIK--------CLNDI 1089
                 |..:         ||::  |.::|...   :|||.:  .|::...::        .|:..
  Rat  1011 -----YSYL---------YVED--RKEALGQF---LLYGHVLTPEEIEAHVEDGIPESPPLLHHF 1056

  Fly  1090 KQSRTTFDTSDTRRAYGPII-IDYAKVQAKVTLKYDSWHKEALGKF-GTLLGT----------EM 1142
            |....:::     :.|..:: ::.:||       :|.|.:..:..| .:||.|          .:
  Rat  1057 KDQIDSYE-----KLYEDVVSLEPSKV-------FDGWMRVDVRPFKASLLNTIKKWSLMFKQHL 1109

  Fly  1143 TSFHSKVSKSRTDLE----------MQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQ 1197
            ..|   |:.|..||:          ::.:|.......|..:.::.:||:...:.|...|..::..
  Rat  1110 VDF---VTNSLADLDSFIKSTECGLLKRVEKGDFQGLVEIMGHLVTLKERQSSTDDMFEPLKQTI 1171

  Fly  1198 RILERQRFQFPNT-WLHVDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVA----EDKAVETRT 1257
            .:|:....:.|.| :..::.:..:|    :.:|:....::.|||.|||..||    ...|.:...
  Rat  1172 ELLKSYEQELPETVFKQLEELPEKW----KNVKKMAITVRQQVAPLQANEVALLRQRCSAFDDEQ 1232

  Fly  1258 VDFLNDWEKTKP-TGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEALELQESAVPNNSAER 1321
            ..|...:.|..| ....|.|.   |.|.::..:...::.....:.|:.:..|:.   ||:  .::
  Rat  1233 QQFQERFHKEAPFRFDSINPH---QMLDVWHMEIQHMESTMATISKSADLFEVN---VPD--YKQ 1289

  Fly  1322 MNVALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETREKPWLSVQPRKLRQQLEAMMAQLKELPARLRMYESY 1386
            :....:|...|:.:|..:..|.:.|.......|.::....:..:.:....|::.|....|.::::
  Rat  1290 LRQCRKEACQLKELWDTIGMVTSSIQAWEATSWRNISVEAMDSECKQFARQIRNLDKEFRTWDAF 1354

  Fly  1387 EYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRVNWVLS-DLSLGQVWDVNLQKNEGIVK 1450
            ..::..:.:.:.....:.||::.|::||||:||.:...||:.:. |.:|..:..:.|...|..|:
  Rat  1355 TGLESTVLNTLTSLRAVAELQNPAIRERHWRQLMQATGVNFTMDRDTTLAHLLQLQLHHFEDEVR 1419

  Fly  1451 DIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINYQNKCR----IIRGWDDLFNKVKEHINSVAAMK 1511
            ||:..|..||::|:.||:::.:|.:.|   ..|:...|    :::..:||...::::...:..:.
  Rat  1420 DIVDRAVKEMSMEKTLKELQTTWASME---FQYETHARTHIPLLQSDEDLIEVLEDNQVQLQNLM 1481

  Fly  1512 LSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRFQSISS 1576
            :|.|...|.||..:|::||:..:::..:|.:|||.|.:||.||.||.||:..||.:..||:||.|
  Rat  1482 MSKYVAFFLEEVSSWQKKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPQDAKRFESIDS 1546

  Fly  1577 EFLGLMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERTSFPRFYFVGDEDLL 1641
            :|..|:....|:|.|::..|...:...||.:...|...:|||.|||:.:|.:||||||:...|||
  Rat  1547 DFRELVYDAQKTPNVVEATNKSGLYEKLEDIQSRLCLCEKALAEYLDTKRLAFPRFYFLSSSDLL 1611

  Fly  1642 EIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAI--LLNEENN---VILGISSREGEEVHFMNPVSTVEHPKI 1701
            :|:.|.....::|:|..|:|..:|.:  .|:...|   ..||:.|:|.|.|.|..|.......:|
  Rat  1612 DILSNGTAPQQVQRHLSKLFDNMAKMQFQLDASQNPTKTSLGMYSKEEEYVAFSEPCDCSGQVEI 1676

  Fly  1702 NEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQF-RDGKIDPQAYMEWCDKYQAQIVVLAAQILWSEDVE 1765
              ||:.|.:.|:.|:...:.:||...::. ||         :|...|.||:.:...||.|:.:|.
  Rat  1677 --WLNRVLRHMKATVRHEMTEAVTAYEEKPRD---------QWLFDYPAQVALTCTQIWWTTEVG 1730

  Fly  1766 SA---LQQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRL 1827
            .|   |::..||......::.:..:::.:.:|...:.:..    |:|:..:....||.|.|..::
  Rat  1731 IAFARLEEGYENAMKDYYKKQVAQLKTLITMLIGQLSKGD----RQKIMTICTIDVHARDVVAKM 1791

  Fly  1828 LNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYL 1892
            :...|.:.::|.||.::|..:|    :..:....::.:|:|.|.:||||...|||.||||||||:
  Rat  1792 IAQKVDNAQAFLWLSQLRHRWD----DEAKHCFANICDAQFLYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYI 1852

  Fly  1893 TMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWG 1957
            |:||:|...:.|:|.|||||||||:.|.||..||..|.||||.|..|:::.|.|:.||.|.||||
  Rat  1853 TLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGIMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWG 1917

  Fly  1958 CFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPGYAG 2022
            |||||||:...:||..:.|:::||:|::    ..|:..:  .:|:::.:.|.:.|||||||||||
  Rat  1918 CFDEFNRISVEVLSVVAVQVKSIQDAIR----DKKQRFS--FLGEEISLDPSVGIFITMNPGYAG 1976

  Fly  2023 RSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFG 2087
            |:.||:|||.|||..||..||.:||.|:||.::||..|..||.|.:..::||.|.||.|.|||:|
  Rat  1977 RTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFIEARLLARKFITLYRLCKELLSKQDHYDWG 2041

  Fly  2088 LRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAED 2152
            |||:||||:.||::|             |||         .:.||.::|::|:.:..:||:|.:|
  Rat  2042 LRAIKSVLVVAGSLK-------------RGD---------PDRPEDQVLMRSLRDFNIPKIVTDD 2084

  Fly  2153 IPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWVDKVLQ 2217
            :|:...|:||:||.:...|......:..:||...:               ::......:|.||:|
  Rat  2085 MPVFMGLISDLFPALDVPRKRDLDFEAVVRKAIVD---------------LKLQAEDNFVLKVVQ 2134

  Fly  2218 LYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVAHVIDPKAISKEALYGVLDPNTRE 2282
            |.::..:.|.:.:||.:|:|||...|:|.|..:... ...|...::|||::.:.|:|:::|.|||
  Rat  2135 LEELLAVRHSVFIVGGAGTGKSQVLKSLHKTYQIMR-CRPVWTDLNPKAVTNDELFGIINPATRE 2198

  Fly  2283 WTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNV 2347
            |.||||:.|:|::. |:..:..|  ||:.|||:||.|:|:||:|:||||:|||.:.||:.|.|.:
  Rat  2199 WKDGLFSSIMRELA-NISHDGPK--WILLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNPTM 2260

  Fly  2348 RVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIPLEDGDEDFVGVIKPAKDK 2412
            |::||:..|:.||.|||||.|:::.:...|.......:::                       |:
  Rat  2261 RLLFEISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPPVNSWI-----------------------DQ 2302

  Fly  2413 EEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTRLRAL-----SSLFSMLNQA 2472
            .|       ||.:.|.|.:.|.......:.||.           ||.:.:     .|:..||...
  Rat  2303 RE-------VQTERANLTILFDKYLPTCLDTLR-----------TRFKKIIPVPEQSMIQMLCYL 2349

  Fly  2473 ARNVLTFNAQHPDFPCSADQLEHYIPKALVYSVLWSFAG----DAKLKVRIDLGD-FVRSVTTVP 2532
            ...:||..|...|  |..:..|.|    .|::.:|:|..    |..:..|.:... ::....||.
  Rat  2350 LECLLTKEAVPAD--CPKEIYELY----FVFAAIWAFGSSMVQDQLVDYRAEFSKWWLTEFKTVK 2408

  Fly  2533 LPGAAGAPIIDYEVNM-SGDWVPWSNKVPVIEVETHKVASPDI-----VVPTLDTVRHESLLYTW 2591
            .|  :...:.||.::. :..:.||...:|..|.:      |::     :|.|.:|:|....:...
  Rat  2409 FP--SQGTVFDYYIDQETKKFEPWGKLIPQFEFD------PEMPLQACLVHTSETIRVCYFMERL 2465

  Fly  2592 LAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDME--VVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRK---- 2650
            :...:|::|.|..||||::.:.:.|.:|...|  |..:.|:..||..:|....:...|.:.    
  Rat  2466 MERRRPVMLVGSAGSGKSVLVGAKLSSLNPEEYMVKNVPFNYYTTSAMLQAVLEKPLEKKAGRNY 2530

  Fly  2651 TPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQAWVSLERIQF 2715
            .|.|        .:.|:.|.|::|:|::|:|||.:..:.:||.:::..:|..:..:...:..:|:
  Rat  2531 GPPG--------NRKLIYFIDDMNMPEVDAYGTVQPHTVIRQHLDYGHWYDRNKLSLKEIMNVQY 2587

  Fly  2716 VGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIY----------GTFSRAMLRLMPALR 2770
            :...||..  |...::.|..||..:..:.:||..:|..||          |.|...:.:.:|:|.
  Rat  2588 ISCMNPTA--GSFTINPRLQRHFSVFALCFPGADALSSIYSTILTHHLKLGNFPTTLQKSIPSLI 2650

  Fly  2771 GYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQPHYVYSPREMTRWVRGI----CEAIRPLDSLPVEGLVRL 2831
            ..|......:...:|.:..:|      ||:::.|:.....:||    .|.::     ..:.||:|
  Rat  2651 NLAVTFHQKIATTFLPTAIKF------HYIFNLRDFANIFQGILFSSTECVK-----STQDLVKL 2704

  Fly  2832 WAHEALRLFQDRLVDDS--------ERRWTNENIDLVGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLSK-D 2887
            :.||:.|:::|::|::.        :..:..:|.|  ..|..  :.|.:.|.....::|.:.: .
  Rat  2705 YLHESDRVYRDKMVEEKDFNLFDKLQTEFLKKNFD--DSKGM--LEQTQNLNMYCHFANGIGEPK 2765

  Fly  2888 YMPVNREEL--REYVHARLKVFYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGK 2950
            ||||...:|  :..|.| |:...|....:.||||::.:.|:..|:||...|:|:.||:||.|:||
  Rat  2766 YMPVQSWDLLSQTLVEA-LESHNEVNAVMDLVLFEDAIHHICHINRILESPRGNALLVGVGGSGK 2829

  Fly  2951 TTLSRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERM 3015
            .:|:|..|:::.:.:|||.:...|...||..||..:..::|.|:....|::.:::|.|..||..:
  Rat  2830 QSLTRLAAFISSMDVFQITLRKGYQIPDFKVDLASLCLKAGVKNLSTVFLMTDAHVADERFLVLI 2894

  Fly  3016 NTLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTD 3080
            |.|||:||:|.|:..:|...::...:...:.:|| :||.:..:|:|.::|.|.|.|....:|..:
  Rat  2895 NDLLASGEIPDLYSEEEEENIINNVRNEVKSQGL-IDSRENCWKFFIERVRRQLKVTLCFSPVGN 2958

  Fly  3081 GLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEF---TTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPA 3142
            .|:.|:...||:.|...:|||.:|...||..|...|   |..::                     
  Rat  2959 KLRIRSRKFPAIVNCTAINWFHEWPQEALESVSLRFLQNTKNIE--------------------- 3002

  Fly  3143 NPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLH 3207
             |..:.::.....:||.::::.:........|....||:.:|:||..:..|......:|:.:...
  Rat  3003 -PAVKQSISKFMAFVHISVNKISQSYLINEQRYNYTTPKSFLEFIRLYQSLLERNGKELQSKVER 3066

  Fly  3208 LNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQEIQIRLA 3272
            |..||.|:..|..||::::..||.::.||:.|||..:..::.:..:..:..::|..:.|.:.::|
  Rat  3067 LENGLLKLHSTSAQVDDLKAKLATQEVELRQKNEDTDKLIQVVGVETSKVSREKAIADEEEQKVA 3131

  Fly  3273 DQTVKIEEKRKYVMADLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLL-- 3335
            ...:::::|:|....|||:.|||:..||||:.::.|..|.|:::..:||..|.....::.:|:  
  Rat  3132 LIMLEVQQKQKDCEEDLAKAEPALTAAQAALNTLNKTNLTELKSFGSPPLAVSNVSAAVMVLMAP 3196

  Fly  3336 -GENATD--WKSIRAVIMR-ENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMA 3396
             |:...|  ||:.:..:.: ::|::|:: :|..|||.::..:.:: .||.:|.:|.|.|...|.|
  Rat  3197 GGKVPKDRSWKAAKITMTKVDSFLDSLI-HFDKENIHENCLKAIR-PYLQDPAFNPEFVATKSYA 3259

  Fly  3397 CGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSLEEQADVNLASAKE----TKDLVEQLERSIAAYKE 3457
            ...:..|.|..:.:.::...|||.|:.|    .:|..:|.:|:|    .|..:..|..::|....
  Rat  3260 AAGLCSWVINIVRFYEVFCDVEPKRQAL----NKATSDLTAAQEKLAAIKAKITHLNENLAKLTT 3320

  Fly  3458 EYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFI 3522
            ::.:..::....:.:.|.....:..:..|:..|..|..||....:.|:.|..|:.||:||:.|||
  Rat  3321 KFEKATAEKLKCQQEAEVTAGTISLANRLVGGLASENVRWAEAVQNFRQQERTLCGDILLTTAFI 3385

  Fly  3523 AYGGYFDQHYRLNLFT-TWSQHLQAASIQYRADIART------EYLSNPDERLRWQANALPTDDL 3580
            :|.|:|.:.||.:|.. ||..:|.    |.:..|..|      :.|::..:...||...||.|.:
  Rat  3386 SYLGFFTKKYRKSLMDGTWKPYLS----QLKVPIPTTPTLDPLKMLTDDADVATWQNEGLPADRM 3446

  Fly  3581 CTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQD 3645
            ..|||.:|....|:||::||..|...::.|:| |:::..|........:.:|.||..|:.:|:::
  Rat  3447 SMENATILINCERWPLMVDPQLQGIKWIKNKY-GEELRVTQIGQKGCLQTIERALEAGDVVLIEN 3510

  Fly  3646 V-ENYDPILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNF 3709
            : |:.||:|.|:|.||:.:.|.  .|.:||::.:.:|.|.:.|.|:.....:.|::.::.|.:||
  Rat  3511 LEESIDPVLGPLLGREVIKKGR--FIKIGDKECEFNPKFRLILHTKLANPHYQPELQAQATLINF 3573

  Fly  3710 TVTRSSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILDDDSV 3774
            ||||..|:.|.|..|:..|.||::..:|||.|.|..|::.|:.||.:||..|:.|.|..|.:.::
  Rat  3574 TVTRDGLEDQLLAAVVSMEIPDLEHLKSDLTKQQNGFKITLKTLEDNLLSRLSSASGNFLGETAL 3638

  Fly  3775 ITTLETLKKEAYDINQKVDETDKVIAEIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVHFLYQYSLKM 3839
            :..||..|:.|.::.:||.|......:|....:.|.|.:...|.:||.|:.|:::|.:||:|||.
  Rat  3639 VENLEVTKQTAAEVQEKVQEAKLTEVKINEAREHYRPAAARASLLYFIMNDLSKIHPMYQFSLKA 3703

  Fly  3840 FLDIFSTVLYNNPKLEGRTDHSERL-GIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLMCKIHLKGT 3903
            |..:|...:   .|.....|..||: .::....|.| |:...||:...|:||:...:....|...
  Rat  3704 FSIVFQKAV---EKAAPSEDVKERVTNLIDSITFSV-YQYTTRGLFECDKLTYLAQLTFQILLVN 3764

  Fly  3904 SESNLDAEFNFFLRS--REGLLANPTPVEGLSAEQIESVNRLALRLPIFRKLLEKVRSIPELGAW 3966
            .|.|. ||.:|.||:  :.|   .|:|:|.||.:...|:..|: .:..|..|...:....:  :|
  Rat  3765 QEVNA-AELDFLLRAPVQAG---TPSPMEFLSHQAWGSIKALS-SMEEFCNLDRDIEGSAK--SW 3822

  Fly  3967 ---LQQSSPE-QVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNVVNTVLGEDFMPNA 4027
               ::...|| :..||.|.....|       .:|.:::|.||||:..|..:.|...||..::.. 
  Rat  3823 KKFVESECPEKEKFPQDWKNKTGL-------QRLCMMRAMRPDRMTYAMRDFVEEKLGSKYVMG- 3879

  Fly  4028 EQELDFTSVVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAE-----QNKQISSIAIGSAEGFNQAE 4087
             :.|||.|..::. ...||......||.|....|::...:     .|:...::::|..:.. .||
  Rat  3880 -RPLDFVSSFEES-GPATPMFFILSPGVDPLKDVENQGKKLGYTFNNRNFHNVSLGQGQEV-VAE 3941

  Fly  4088 RAINMACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSL--QPHSGFRLFLTMEINPK-----VPVNLL 4145
            .|:::|.|.|.||:|:|:||..:||..||||:..|  :.|..||:|::.|..|.     :|..:|
  Rat  3942 AALDLAAKKGHWVILQNIHLVAKWLSTLEKKLEELSEESHPDFRVFISAEPAPSPEGHIIPQGIL 4006

  Fly  4146 RAGRIFVFEPPPGIRANLLRTFS--TVPAARMMKTPSERARLYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWA 4208
            ........|||.|:.|||.:...  |.....|....:|...:.|.|.:|||:|.||.::.|.||.
  Rat  4007 ENSIKITNEPPTGMHANLHKALDNFTQDTLEMCSRETEFKTILFALCYFHAVVAERRKFGPQGWN 4071

  Fly  4209 KKYEFNESDLRVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTS 4273
            :.|.||..||.::.:.|..:::...         |||:|.|..|..:.:|||.|.:|:|:||..:
  Rat  4072 RSYPFNTGDLTISVNVLYNFLEANT---------KVPYDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRT 4127

  Fly  4274 FLKKLFTARSFEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAE 4338
            :|::.......|.:.:|      |.|    ..:|.......:.::|:.....::|...||..|||
  Rat  4128 YLEEFIRPEMLEGELSL------APG----FPLPGNMDYSGYHQYIDAELPPESPYLYGLHPNAE 4182

  Fly  4339 KVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLELL 4403
            ...||.....|...:|:||             .:..|:..|.|        .|......|:||  
  Rat  4183 IGFLTQTSEKLFRTVLEMQ-------------PRDSQAGDGAG--------STREEKVKAFLE-- 4224

  Fly  4404 PKNLQVLKRTVE--NIKDPLYRYFER---------EVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQT 4457
                ::|.|..:  ||.:.:.:..||         |....:.|.:.:...|:::.|..|||...|
  Rat  4225 ----EILDRVTDEFNIPELMAKVEERTPYIVVALQECERMNILTREIQRSLRELHLGLQGELTMT 4285

  Fly  4458 NHHRSMLSELVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQK-VSQLVSQAGAKELQGFPV 4521
            :...::.:.|...::|:.|.|...|:...:..|..|..||:::|:. ....|..:        .|
  Rat  4286 SEMENLQNALYLDVVPEPWARRAYPSTAGLAAWFLDLLNRIKELETWTGDFVMPS--------TV 4342

  Fly  4522 WLGGLLNPEAYITATRQCVAQANSWSLEELALDVTITDAG---LKNDQKDCCFGVTGLKLQGAQC 4583
            ||.|..||::::||..|.:|:.|.|.|:::||...:|...   .::..::..: :.||.::||..
  Rat  4343 WLTGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDQMALQCDVTKKNREEFRSPPREGAY-IYGLFMEGACW 4406

  Fly  4584 KNNELLLASTIMMDL----PVTILKWIKISSEPRISKLTLPVYLNSTR-TELLFTVDLAVAAGQE 4643
            .....::|...:.||    ||..||.|....:...|....|||....| ...::|.:|...  :.
  Rat  4407 DTQAGIIAEAKLKDLTPPMPVMFLKAIPAEKQDCRSIYACPVYKTCQRGPTYVWTFNLKTK--EN 4469

  Fly  4644 SHSFYERGVAVL 4655
            ...:...|||:|
  Rat  4470 PSKWVLAGVALL 4481

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 240..839 CDD:285571 119/694 (17%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 946/3463 (27%)
DHC_N2 1326..1724 CDD:285579 115/407 (28%)
P-loop_NTPase 1870..2103 CDD:304359 122/232 (53%)
P-loop_NTPase 2227..2367 CDD:304359 61/139 (44%)
P-loop_NTPase 2572..2835 CDD:304359 63/287 (22%)
Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B 2834..>2943 CDD:294426 31/119 (26%)
P-loop_NTPase 2916..3194 CDD:304359 78/280 (28%)
MT 3208..3544 CDD:289543 92/346 (27%)
AAA_9 3569..3784 CDD:289547 73/215 (34%)
Dynein_heavy 3925..4636 CDD:281078 191/748 (26%)
Dnah9XP_002727768.2 DHC_N1 210..787 CDD:285571 119/694 (17%)
DHC_N2 1293..1697 CDD:285579 115/408 (28%)
P-loop_NTPase 1830..2060 CDD:304359 126/257 (49%)
P-loop_NTPase 2144..2279 CDD:304359 60/138 (43%)
P-loop_NTPase 2437..2708 CDD:304359 64/297 (22%)
P-loop_NTPase 2786..3053 CDD:304359 79/289 (27%)
MT 3065..3408 CDD:289543 92/348 (26%)
AAA_9 3435..3648 CDD:289547 73/215 (34%)
Dynein_heavy 3785..4474 CDD:281078 192/759 (25%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.710

Return to query results.
Submit another query.