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Protein Alignment Dhc64C and dnhd1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_073772643.1 Gene:dnhd1 / 110437768 ZFINID:ZDB-GENE-120709-97 Length:4507 Species:Danio rerio


Alignment Length:4936 Identity:958/4936 - (19%)
Similarity:1783/4936 - (36%) Gaps:1394/4936 - (28%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   469 FRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQPYSLDAADANAIEEV--NLAYENVKEVDCLD 531
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Zfish    45 FKSEPSPFRTLSLRTLSPAH----NDLSAVKLPQLVSQVGTEL-AVREIVWNEGASCVTPVK--- 101

  Fly   532 ITKEGSEAWEAAVKRYEEKI----------------DRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFS 580
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Zfish   102 -TTQNSSVRQFNVENDKEKITTGKDNQARNKPLTGTDVVEV---------LAKKKHLGEL--DFY 154

  Fly   581 RFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDIEALHEKFKVQ-------------------YPQSKS 626
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Zfish   155 CLKASEDPPY-----GPYNLQVISR--SDACADHYIFSPTTVIHMQDGCSIELWTLAEWYREAVL 212

  Fly   627 CRLSSVRDLPPVAGSII------WARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWETHIEGQKLKADGDSFRA 685
            |  .:||::|.....::      |.|.: :::|  :||..|:|        ..|.|.|......|
Zfish   213 C--EAVREIPFFRDCLLRKIFKRWHRNV-HKVT--VKRRIDIL--------PSQLLIAVPQFRNA 264

  Fly   686 KLSISDVFHEWARKVQERNFGSTGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVNFLPEIITLAKEVRNIKNL 750
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Zfish   265 LLHL-------ARLIEELK-------------------------QVRWLPQ-----DPLRTYTLL 292

  Fly   751 GFRVPL-----------------------TIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTYERT------- 785
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Zfish   293 DFQTALLEKKRTAQASLDRFLHCQAAVLNTVKDKSYQACQDLQME---VENVKLYQSSQSLHLQV 354

  Fly   786 --LEKLNNR-SLAQNSVFKIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEGIGLIWESYKLDPYVIRLSECV 847
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Zfish   355 SYLRKLQKELSQAEQAIQWLGNLASLAD-----HMTVQNLVTISKGEI---------TAFLNNVL 405

  Fly   848 TQFQEKVDDLLVVEEQLDVDVRSLETCPYSAATFVEILSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRLDE 912
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Zfish   406 NRKREEQSGLFQVEIIFGTD-GQLSVFP-PLHLFQEVLHEAVLSVEDSILQVFDSCSL------- 461

  Fly   913 EVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGG----DPQIQNAVHEIRITN 973
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Zfish   462 SYDSKGCLPTSC-VEDPIEEFKDKVFEV-TGPDSESSLKELERMSSQKDRSPQ---SIRPVKMNS 521

  Fly   974 QQMYLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTSQVRLQSTRYQVGLEKHV-SQTYRNLLTKLPEGKILE 1037
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Zfish   522 LR------VQAQRVQGHYQPLPWRLL------------EWNLKVHVETQEIQN-----EQDKITQ 563

  Fly  1038 NAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRYQSLWDLQ--------ADMLYGRLGEDVNLWIKCLNDIKQ--- 1091
            :|...:.| :.|..:::.:...:.|.|...        :.:.|..|.:.:..|:..::::.|   
Zfish   564 DAITEVFQ-LCENHSWLIDVHLFTSQWGSDSPKTLRGCSPLKYEELIKKLQFWMDKVHNVPQFFN 627

  Fly  1092 ---SRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKVTLKYD----------SWHKEALGKFGTLLGTEMT 1143
               ...|.:.|:.::..|..:...||...|  |.|:          |..|.|:    .::.:|..
Zfish   628 TSNKLFTVEISNIKKQIGSKLNIIAKDVPK--LLYEDLQIRSKNLISQLKRAV----EIMQSEPN 686

  Fly  1144 SFH---------SKVSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKKDMIA-------WDKQVEV 1192
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Zfish   687 SFHKFTVFADMVKQSEKMSGNMQQELKDLHSLQESVR-QNYTQVALNDMISMKQVVDLWDCLVPL 750

  Fly  1193 FREAQRILERQRFQFPNTWLHVDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVAEDKAVETRT 1257
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Zfish   751 TKQA-----------------ADKVSQQLPSMLE-------TLDSNVSSLVNKL---DNLVSRAT 788

  Fly  1258 VDFLNDWEKTKPTGGKIRPD----DALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEAL---ELQESAVP 1315
                        :|..:.||    :.|.||....|::..:.|:.::..:|.|.|   :|..:.| 
Zfish   789 ------------SGPYLDPDQNAMEMLVQLNTLCSQFYVIAEQFNDQSRASEILRGHQLDLTFV- 840

  Fly  1316 NNSAERMNVALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETREKPWLSVQPRKL----RQQLEAMMAQLKEL 1376
                   .|..:.::..:|:|..:|...|||.|     |..:..||.    .|.:.....|..|.
Zfish   841 -------GVGQQRIEARKGLWELMSISSTQIQE-----WKLLHFRKFVVTKAQDVVGSWIQKAET 893

  Fly  1377 PARLRMYESYEYVKKL--IQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRV----NWVLSDLSLG 1435
            .|::..:......|.|  :|::.:...::.:|.|..||.:||:.::|.:.:    .|   .|::.
Zfish   894 FAKVIPFHDALLQKNLQILQAFKQFLSVLSKLISPTLKHKHWRNISKAIGLVYDPEW---KLTVA 955

  Fly  1436 QVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYEL------------------DLIN 1482
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Zfish   956 DLLSKDLQRHQNKINKICLDSKAETDMEQMFRALQRQWETAEFHHKRFIIAVQQQQTPQLGDVLP 1020

  Fly  1483 YQNKCR---------IIRGWDDLFNKVKEHINSVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFD 1538
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Zfish  1021 -QNAPKHHISDGGTFTITGIETLLAHSKESVLILSDMLRSQYVDEFQKDVEHWHLFLQELDELLD 1084

  Fly  1539 VWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSPKVMDVLNI------ 1597
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Zfish  1085 IFERYQQKWIFISRTFNENVHQKFEL---QDKFHPADKLFREIIEITVNDPHVCSFVHLSTRTEF 1146

  Fly  1598 -PAVQRSLERLADLLG-----KIQKALGEYLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNI---ARL 1653
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Zfish  1147 SDTLQGQSLHAAFLNGFTTMEEISNHFLNVLESARSQFPRLYCLSDGELIKLL--SLQLPAPSSL 1209

  Fly  1654 QKHFKKMFAGVAAILLNEENNV---------------ILGISSREGEEVHFMNPVSTVEHPKINE 1703
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Zfish  1210 LQIIQKCFTGVKQLDVQVEGNVCSTHDLAALTNERMLVHGIYGEFDEYVPFICPLKSNLNPV--A 1272

  Fly  1704 WLSLVEK------QMRFTLASLLAQAVQDIKQFRD-----------GKIDPQAYMEWCDKYQAQI 1751
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Zfish  1273 WLGLFEQKLNQAVKLRFEKCLAIQQKSKHRKLSRDPDLIGHNKSNSSEVAHEELLKLISQYPLQC 1337

  Fly  1752 VVLAAQILWSEDVESA-------------------------LQQASENNQSKPMQRVLGNVESTL 1791
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Zfish  1338 LLVAEEVLWFSRIQESNCTTADMWKTIKCQKAAQLQYLCQLINDNSTDSNKNPSRRILTALRALI 1402

  Fly  1792 ------NVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDP 1850
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Zfish  1403 MLTLKHSCQADGLVKVKGDLE-----------------------------TSFEWQKLMKYYLIP 1438

  Fly  1851 RQTEVL---------QQLTIHMANARFFYGFEYLGVQD-RLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLGGS 1905
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Zfish  1439 NANAIASDLLPSPEDQSVCVDILRTQLPYGYEYIGPENWTMVNTPSTEQAYMGIILALSSFKCAF 1503

  Fly  1906 PFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERML 1970
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Zfish  1504 VSGPYMSGKQHAAVQLGYALGRQVVILKCCSSTRSSVISQTLLGALQNGAWLVLDSVDLLEQGTL 1568

  Fly  1971 SACSQQIQTIQEALK-------------YEMD---SNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPG 2019
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Zfish  1569 SDLGQHLTEIHQNLSAVQRQTQEKEHEFFEVECHIAGKKNIPVKLTYGCITISAN---------G 1624

  Fly  2020 YAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQ--LSN-- 2080
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Zfish  1625 YS--TKMPENLRAAVRPVTLMKPHYRIIAEVMLLSYGFSEAADLSRRLECLFRLAKDLHCLPDFV 1687

  Fly  2081 QSHYDFGLRALKSVLISAG---NVKR-----DRI---MKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQE 2134
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Zfish  1688 SGHQTSWLVLLRNVISSSGTHLNLFRHLKETDKFREHFKFANQPKKIMNADLEEQATIKG----- 1747

  Fly  2135 ILIQSVCETMV--PKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDE 2197
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Zfish  1748 --VLSVMQNTVSDPKRATK----FHKIFEETFPKVRHFASLQQIIDEEEQNILRN--AVKDELQH 1804

  Fly  2198 QGAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTL---LKALERFEGVEGVA 2259
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Zfish  1805 QGF-----HADAQMLDNVLILHQALKVSNVIVLLGPAGCGKTTLYQTIASTFQKLSRILDVESTG 1864

  Fly  2260 -----------------------HVIDPKAISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRG 2301
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Zfish  1865 QHKGDFKDDYHELPMPCCPPVSIEVIFPNALTHKQFFGGYFDMDSSWFDGAFTKALRR-----SG 1924

  Fly  2302 EI--NKRQ---------WIIFDGDV--DPEWVENLNSVLD-DNKLLTLPNGERLSLPPNVRVMFE 2352
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Zfish  1925 QITPSKRKKAVQTQYVNWIVLDGDPVGEPAWLDSLTTLRDLEHPHLYLSSGEKVE-PSKLKILTE 1988

  Fly  2353 VQDLKFATLATVSRCGM-----------VWFSE-DVLSTEMIFENYLSRLRSIPLEDGDEDFVGV 2405
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Zfish  1989 ITNLGDSTPSVVAHCSLVYVSGENLWRSVWESEMDVLSREHIVDQITLKMWRQLSEDLFSDTLVF 2053

  Fly  2406 IKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTR-LRALSSLFSML 2469
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Zfish  2054 LKNT-------------------VLSPLMASGGCEGK--QASRITEGLQEITSFIKILCALLEHS 2097

  Fly  2470 NQAARNVLTF-------NAQHPDFPCS-ADQLEHYIPKALVYSV--LWSFAGDAKLKVRIDLGDF 2524
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Zfish  2098 GKGGASKFTSRETQTEDSAQVLQPPCTDAMAIQWGLQARNIFFVAYIWGFGGHLHPRHWLHFDLF 2162

  Fly  2525 VRSV-------TTVPLPGAAGAPIIDYEVNMSGDWVPWSNKVPVIEVETHKVASPDIV---VPTL 2579
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Zfish  2163 AREALYKSCCKVETPPEGTVFEHFFEFSEEM-GDTTNF------LDCSTRK--SPPLFFTSVPQY 2218

  Fly  2580 DTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTM---TLFSALRA---LPDMEVVGLN-FSSATTPEL 2637
            :  ||..||...|...:|.:|.|..||||||   :|.|..||   ||...  ||: |....|.|.
Zfish  2219 E--RHAYLLDMLLDVQQPALLVGEVGSGKTMLCKSLVSQARAHTHLPTSP--GLHPFDFCKTVEK 2279

  Fly  2638 LL--KTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYG-TQRVISFLRQLVEHKGF 2699
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Zfish  2280 VRYEKTQLHNSKVSKKPD------------LILFIDDLHEAPFDACGKTSKTLETLRQCIS-RGE 2331

  Fly  2700 YRASDQAWVSL---ERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIYGTFSRA 2761
            ...||.:...|   ..|.::..|:.|.......:|.|..|...|:.:  |..|| |.::...|. 
Zfish  2332 VLVSDGSHFKLFQSRSINYLATCSVPETSDSYWISPRLSRLFVILTL--PSMTS-KTLFSIHSS- 2392

  Fly  2762 MLRLMPALR---------GYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQPHYVYSPREMTRWVRGIC--- 2814
              :|.|.||         ..|..:..:.::.|||.::.:.....|::::|..::.:..:|:.   
Zfish  2393 --KLQPWLREIQPTLSLADRANCIITSTLDVYLAVRECYAVTSSPYFIFSLHDIHKVFQGMYLWR 2455

  Fly  2815 ------EAIRP--------LDSLPVE-------------GLVRLWAHEALRLFQDRL-------- 2844
                  :|:|.        ..|...|             .:||||.||.||.|.|||        
Zfish  2456 SRLDGQQALRSSLQSSFGFRSSTSTERSVSSPSVLEHDLNIVRLWMHECLRTFGDRLDSEAACQK 2520

  Fly  2845 ----------------------------------------------------------------- 2844
                                                                             
Zfish  2521 LISIIAEVSEKNFSTMLSTESQTLPADNSSLTDMLSVTRTYVNQQLDSSSSQMDETLNPWIVKAE 2585

  Fly  2845 --------------------VDDSERRWTNENIDLVGQ-KHFPG----INQEEALQRPILYSNWL 2884
                                :|:....:||:|:...|. :..||    |::..:...|:|:|:..
Zfish  2586 VQTESEETNVESNSSLYSTGIDEDGFSYTNDNVKKAGNFESDPGTSELISESSSCSFPMLFSSLS 2650

  Fly  2885 SK------DYMPVNREE----LRE---------------------YVHARLK---VFYEEELDVP 2915
            |.      ::.|.:.||    |:|                     .:|...|   |:.|..:|  
Zfish  2651 SHSVGNDVNHKPSSHEEFLQRLQETASSIQNVIFSPELCETSKNILLHHNFKRTCVYQERNVD-- 2713

  Fly  2916 LVLFDEVLDHVLR------------------------------IDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGK 2950
             ||.|::: |.|:                              :.|.|..|.||..|.|  ||.|
Zfish  2714 -VLVDQLV-HTLKREESNEEKSENTLYNPTWAVHHQNVHQLVHVIRAFLIPGGHGALFG--GAKK 2774

  Fly  2951 T---TLSRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFL 3012
            |   |:.|..|.:.|..:.::...|:.......:|   :..::|.....:..::.|:.  .....
Zfish  2775 TGRKTIVRLAAALTGYQLVEVHSGNETKIWGMMKD---IWSQTGVNAGDLVLLVHENT--SQAVK 2834

  Fly  3013 ERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDS-----SDELYKWFTQQVMRNLHVV 3072
            :::..::|||..|||:..:|...:..:.|      .||.|:     .|::.:.:.:.:.|:.||.
Zfish  2835 DQLLVMMANGSFPGLYSDEELKNVTLRMK------ALMKDAHCYMKDDQVLEIYFRNIQRSTHVF 2893

  Fly  3073 ----FTMNPSTDGLKDRAAT-----SPALFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWH 3128
                |..:.|.:.:..::.:     :.||...|.:..|..|:..||            :|...:|
Zfish  2894 LLYPFPWDKSEEKILVKSCSFLPHITKALSICCCVEVFQPWTSEAL------------VESALYH 2946

  Fly  3129 --APDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTP---RHYLD--- 3185
              |....|.....|        |..|....:.:.:.:.:...:|.....:.:.|   |.|::   
Zfish  2947 LKASQQIPETAGTV--------AKDNLAASISKAMARIHLLASKYAVTLLHLQPFGCRSYVELMV 3003

  Fly  3186 ----FIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQEL---QAKNEAA 3243
                |.||   |:.:.|           |..:::.:.:..|::|..:.|...|::   :||.|..
Zfish  3004 QFFFFCHH---LFEKNR-----------VQDSRLGKVLAHVKDMTDTAARHTQKVLTFRAKCEEK 3054

  Fly  3244 NAKLKQMFQDQQEAEK-------KKIQSQEIQIRLADQTVKIEEKRKYVMADLAQVEPAVIDAQA 3301
            ...:.|:.:....|:|       :.:|.::....|.|..::::::   |.....||.|....|..
Zfish  3055 QKCIDQLQKLVNPAQKIWEQKHHQSVQEEKWLSNLEDNLLRVQQQ---VQDAFKQVSPLYQAALE 3116

  Fly  3302 AVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLLGENATDWKSIRAVIMRENFINSIVSNFGTEN 3366
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Zfish  3117 ALQALSQSDLDEIRHYRMPPDGVVMVMDIICMLF-NRPCGWDSSRQLMVQSSFFQEL-EFFDCSK 3179

  Fly  3367 ITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEPLREELRSL---- 3427
            :|::..:|: ...:..|.:..:.|...|.||..:.:|..|..:||.:|:.:.|.:.:.:.|    
Zfish  3180 LTNETIQKL-GHIIQAPSFQPDSVRDMSRACESLCRWVRAVYQYACILRHIAPQKAKKQDLYNLM 3243

  Fly  3428 ---EEQADVNLASAKETKDLVEQLERSIAAYKEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKS 3489
               :|:..|.....:..::.:::|||.....|::       .:.:|..|...:|:...|.|:||.
Zfish  3244 AESQERLSVLRLQMESERERLDELERQQEFNKQD-------MELLKAQLSTAEAQERESCAVLKL 3301

  Fly  3490 LNIERERW--ESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRLNLFTTWSQ---------- 3542
            .....:.|  |....|..:|  :|.||.|:.||.:.|.|.|....|..|...|.:          
Zfish  3302 AEHHIKDWVLEGKEATLANQ--SIPGDALILAAAVTYLGPFGPDVRQELLLKWHKLCLTGEMNMT 3364

  Fly  3543 ------------------HLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTENAIMLK 3589
                              |..|..:.....||..:.|......:...::     ||.....:..|
Zfish  3365 LEDPRATLLDDVPFATCDHYVAIPVSKTFQIAFNQILGLDLHHIHGDSS-----DLVRSVLLWGK 3424

  Fly  3590 RFNRYPLIIDPSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSF---RKNLESALRFGNPLLVQDVENYDP 3651
            |        |...|....|.|.:..::....:.....|   :....:..::|     ..|.:.||
Zfish  3425 R--------DTRAQRCHLLANCHKDEEPNSQTLFSPVFFVGQSKSHAEAKYG-----LTVSSDDP 3476

  Fly  3652 ILNPVLNRELRRTGGRVLI--------------------TLGDQDIDLS--PSFVIFLSTRDP-- 3692
            .|...||...:. |.|||:                    |.|:.....|  |.|.:.:||..|  
Zfish  3477 ELLDKLNHGAKE-GLRVLVKHIERAISNLQVLQAFVTPETCGNSHTVQSAHPDFHLIMSTSLPIR 3540

  Fly  3693 --TVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNQVLKAE-------RPDIDEKRSDLLKLQGEFRL 3748
              ..|..|.....|..::.:.:.|.::...|.::::.|       ...:..|:..|       :.
Zfish  3541 TLIQEIHPSFLEEVQMIDLSPSTSEVRDLILTELMQTECSALWTLHHRVQTKKQIL-------QH 3598

  Fly  3749 RLRQLEKSLLQALNDAKGKILDD----------DSVITTLETLKKEAYDINQKVDETDKVIAEIE 3803
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Zfish  3599 KLSENKFSLMEYVMHASTPLFQDPQFLPQVYMCQSVSLGLET---EIKALSQQIDQHKPLMTDFY 3660

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Zfish  4327 SRLETRAELLRSYL---WEE----------------SSRI-----TPHVYRLAAFHNPRGF---L 4364

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Zfish  4365 AALIRDEAHI--------QNKEISLYCLNFKV------LHNMVPPQWGIC--LSGLELQGA 4409

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 87/445 (20%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 783/4034 (19%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 55/262 (21%)
dnhd1XP_073772643.1 None

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