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Protein Alignment Dhc64C and dnah5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_073781887.1 Gene:dnah5 / 100535326 ZFINID:ZDB-GENE-110411-177 Length:4648 Species:Danio rerio


Alignment Length:4920 Identity:1262/4920 - (25%)
Similarity:2178/4920 - (44%) Gaps:870/4920 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   172 DRDGDKMAPSVEKKLAELEMGLLHLQQNIDIPEITLTAHQTVNN----------VIRKCAEENRK 226
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Zfish   159 DTTGVGLLKSVEQLLSEIFIPTLR-KMNYGWGELASPQAQAVKQDFISSLDSFVSVLSGAQESLQ 222

  Fly   227 AKV----------------ADFGDKVEDSSFLNLLQNGVNRWIAEIKKV----TKLNRDPGSGTA 271
            .||                :|:......:..|..::..:..||.:|::|    .:|.::......
Zfish   223 EKVNLQECETFDLKTLKGPSDYTAVANSADALEKIEACMKTWIKQIEQVLAESDQLRKEADDLGP 287

  Fly   272 LQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGKRFHATVSFDTDTGLKQA----------L 326
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Zfish   288 RAELDHWKKRMSRFNYLLDQLKSPEVKAVLGVLLVAKSKLIKVWRELDIRITDAANEAKDNVKYL 352

  Fly   327 ATVADY-NPLMKDFPINDLLSATELEKIRPAVQQIFAHLRKVRNTKYPIQRCLKLIEAISR--DL 388
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Zfish   353 YTLEKFCDPLYNSNPV------SMVEAIPGLINAI------------------RMIHSISRYYNT 393

  Fly   389 SQQLLKVLGTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSC------------WDDEYDKLQGLLRDIVK-- 439
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Zfish   394 SEKITSL-------------FVKVTNQM--ITACKAYITNNGSATIWDQPQEVVSEKLKAAIRLN 443

  Fly   440 ---KKRDEHLKMVWRVSPAHKKLQ-TRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVET 500
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Zfish   444 QEYQKYFQKTKQKLEENPSERQFDFSEMYIFGKFDTFQRRLSKIL---------------NLFST 493

  Fly   501 KQPYSLDAADANAIEEVNLAYENVKEVDCLDITKEGSEAWEAAVKRYEEK----IDRVET----- 556
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Zfish   494 ITTY-------NALQDSKI--EGLETMATRFQTADMQGKWEAIVLTMKKKQYSFLDQRRTDFDQD 549

  Fly   557 -----RITAHLRDQLGT--------AKNANEMFRIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKD 608
                 :.|:.|.:||.|        .:|......:..:|..|.: |.: |...:|| :::|....
Zfish   550 YEEFCKQTSELHNQLKTFMDNTFDKIQNTERALYVLKKFERLGI-PDL-GISDKYQ-RILQNFGR 611

  Fly   609 DIE---ALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWETH 670
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Zfish   612 DIEMISRIYNKQKTDPPIAP--------DLPPTAGKILWARQLYSRIQEPMDLFQQLPG------ 662

  Fly   671 IEGQKLKADGDS---FRAKLSISDVF--------HEWARKVQERNFG----------STGRIFTI 714
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Zfish   663 -----LLSTPDAKPIIRNYNRVAKVLLEFEVLYHHSWMAQTEAVKAGLQASLLVKSPETGQLF-- 720

  Fly   715 ESTRSRIGRGNVLRLRVNFLPEIITLAKEVRNIKNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESV 779
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Zfish   721 ----------------VNFDPQILTQIRETDCMLGMGLDIP--------------PFAAILQQKK 755

  Fly   780 RTYERTLEKLNNRSLAQNSVFKIEDRAS----IVPLVAGLRKDVL-NLVSEGIGLIWESYKLDPY 839
            ..:::...|| ...:.:||..:.:.:|:    ::|.||.:.:.:| .|.|    |.|.|..:|.|
Zfish   756 EVFKKNYNKL-QLMVTRNSGVRSKIQAAFEQLLMPHVAKVDEAILPGLTS----LNWTSLNIDKY 815

  Fly   840 VIRLSECVTQFQ---EKVDDLLVVEEQLDVDVRSLETC---------PYSAATFVE--------- 883
            :.|::..:...:   .:|:||  ||.::|..::.:.|.         |.:...||:         
Zfish   816 LSRITAALDNLELLLHRVNDL--VEFRIDAVLQEMSTAMLCVLPEDEPCTCEEFVQTTKELCIKG 878

  Fly   884 --------------------ILSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRL--DEE------------- 913
                                :|.:::...:|...|..|.....|.::  |||             
Zfish   879 AQMLHTKSSLVEEAANELINMLLELEQKEEDDRNRDDSRTESKVEQMESDEEECKSEGRLFSRST 943

  Fly   914 -----------VEKKLALRLQAGIQAWTEALTG--NKKEVDTSM--------------------- 944
                       :.||..|.|...::.....|..  |.:.||..:                     
Zfish   944 MAPSLGPSSPLLRKKKKLDLMKVMEEEARELLSHFNHRNVDALLRLTRNTLETLRKRIHASSLMH 1008

  Fly   945 ---DTDAPAQPTHKLGGDPQ-IQNAVHEIRITNQQMYLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTSQVR 1005
               :.|:|::   :.|..|| |..|...:.|.|  :.:.|.::|.:..:.               
Zfish  1009 FLAEADSPSR---QKGSGPQPIFRAGVCLAIPN--IIMVPGLDEVQHALN--------------- 1053

  Fly  1006 LQSTRYQVGLEKHVSQTYRNLLTKLPEGKILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRYQSLWDLQADM 1070
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Zfish  1054 -RAVDYVVSVSKGVGQWSKERISK---RKMSERRMAALKQNSQESESE-------------DADS 1101

  Fly  1071 LYGRLGE----------------DVNLWIKCLNDIKQ-----SRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAK 1114
            .|....|                .:..:.|.:::.|:     |..:...:.|::       :...
Zfish  1102 TYHSFAEGSTSDISASANQAIPFQIKNYHKSISENKEIVKLVSVLSTSINSTKK-------EIMN 1159

  Fly  1115 VQAKVTLKYDSWHK---EALGKFGTLLGTE-MTSFHSKVSKSRTDLEMQ---------------- 1159
            ...:.::.:..|.|   |.:.||  :.|.. ::.|.|::...| |||::                
Zfish  1160 ALERFSMYHHIWKKDREETIQKF--IQGNPFLSEFESQILYYR-DLELEINAEPEFISVGALALY 1221

  Fly  1160 --SIEAASTSDAVSFI-------------------TYVQSLKKDMIAWDKQVEVFREAQRILERQ 1203
              .::.|.||:..|::                   |::....|.:....|.::..|.|...|:..
Zfish  1222 TVDLKLALTSETKSWMVDFGQYCNRKYRMEMEQIFTFIDEASKKLNRQIKDLDDIRIAMATLKEI 1286

  Fly  1204 R-------FQF-----PNTWLH-------------VDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQ 1243
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Zfish  1287 REHQISIDFQVGPIEESYSMLHKYGLLIAKEEAEKVDTLRYTW----EKLLSRSTEVQNELVSLQ 1347

  Fly  1244 AKIVAE-DKAVETRTVD---FLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAK 1304
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Zfish  1348 PKFRGELIKNVETFVEDCQHFYHDYDRDGPMVVGLAPQDASDRLIMFQNRFDNLFRKYITFTGGE 1412

  Fly  1305 EALELQESAVPNNSAERMNVALEELQDLRGVWSELSKVWTQIDETR---EKPWLSVQPRKLRQQL 1366
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Zfish  1413 ELFGLPVTQHPQLLEIRKQLTL--LQKLYGLYNSV------IDTVNGYYDISWADIHIDRINNEL 1469

  Fly  1367 EAMMAQLKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRVNWVL-- 1429
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Zfish  1470 LDFQARCRKLPRGLKEWQAFMDLKKTIDEFSECCPLLDLMTNKAMMTRHWKRITEVTGHTFEVET 1534

  Fly  1430 SDLSLGQVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINYQNKCRIIRGWD 1494
            .:..|..:.:..|.|.:..::||.:.|..|..:|:.||||...|.|.......::.:..::...|
Zfish  1535 DNFKLRNIMEAPLLKYKEEIEDICISAVKERDIEQKLKQVIAEWDNKTFTFAQFKTRGELLLRGD 1599

  Fly  1495 ---DLFNKVKEHINSVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSG 1556
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Zfish  1600 STSEIITNMEDSLMVLGSLMSNRYNTPFKAQIQKWVQNLSNTTDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVG 1664

  Fly  1557 SADIKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSPKVM-DVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGE 1620
             .||...||.|..||.:|...::.:|.:..:.|.|: ..:....:.:.|..|.:.|...||:|..
Zfish  1665 -GDIAKQLPKEAKRFSNIDKSWVKIMTRAHEMPNVVQSCVGDETMGQLLPHLLEQLEMCQKSLTG 1728

  Fly  1621 YLERERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEE-NNVILGISSREG 1684
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Zfish  1729 YLEKKRLLFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQAHLLNIFDNIKCVRFHEKMYDKILAISSREG 1793

  Fly  1685 EEVHFMNPVSTVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAYMEWCDKYQA 1749
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Zfish  1794 ETIELDKPV--IAEGNVEVWLNALLKESQRSLHLVIRQAALAI---QDSGFE---LIEFLDSFPA 1850

  Fly  1750 QIVVLAAQILWSEDVESALQQASENNQ--SKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEH 1812
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Zfish  1851 QVGLLGIQMIWTKDSEDALSNARYDRKIMSKTNQFFL----ELLNNLIDMTTKDLGAVERTKYET 1911

  Fly  1813 LINEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGV 1877
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Zfish  1912 LITIHVHQRDIFDDLCRLHIKSPTDFEWLKQCRFYFN----EDSDKMMINITDVGFVYQNEFLGC 1972

  Fly  1878 QDRLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQA 1942
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Zfish  1973 TDRLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRG 2037

  Fly  1943 MGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVS 2007
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Zfish  2038 LGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIDLPVLSVAAQQIAIV---LTCKKERRKNFIFTD--GDNVEMN 2097

  Fly  2008 PDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFK 2072
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Zfish  2098 PEFGIFLTMNPGYAGRQELPENLKINFRSVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFIDNIELARKFFTLYK 2162

  Fly  2073 LCDEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILI 2137
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Zfish  2163 LCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKR----------------------ANPNDTESTIVM 2205

  Fly  2138 QSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAW 2202
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Zfish  2206 RVLRDMNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPGIQLDKAGYPDLESAIDKQVTEAGLI----------- 2259

  Fly  2203 MEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVAH---VIDP 2264
                ....|..||:|||:...:.||:|.:||||:||:|...||:||:...    |..|   .::|
Zfish  2260 ----NHPPWRLKVIQLYETQRVRHGMMALGPSGAGKTTCIHTLMKAMTDC----GQPHREMRMNP 2316

  Fly  2265 KAISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDD 2329
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Zfish  2317 KAITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLRAKKGE---HIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDD 2378

  Fly  2330 NKLLTLPNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRLRSIP 2394
            |:.|||.||:|:.:.||.:::||..:::.|:.|||||.|||:.|..||:...|.|.:|..     
Zfish  2379 NRTLTLANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIENASPATVSRNGMVFMSSSVLNWSPILEGWLKN----- 2438

  Fly  2395 LEDGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTRL 2459
             ....|..|     .||......|.|.           .||     :::|:|.|  |.:..|..:
Zfish  2439 -RSAQEGMV-----LKDLFSSSFPELY-----------RFS-----IQSLQYKM--EMLEAFIIM 2479

  Fly  2460 RALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFPCSADQLEHYIPKALVYSVLWSFAGDAKLKVRIDLGDF 2524
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Zfish  2480 QCINMLQGLIQPKEQ--------------GGELSREHMERLYVFALMWSVGALLELDDRMKLERW 2530

  Fly  2525 VRSVTTVPL-----PGAAGAPIIDYEVNMSGDWVPWSNKVPVIEVETHKVASPD-------IVVP 2577
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Zfish  2531 LRNHDSIHLDLPNIPPHSEDTMFDFYVTNDGHWVHWNTRV------EEYIYPPDSTPEYGSILVP 2589

  Fly  2578 TLDTVRHESLLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRAL-PDMEVV-GLNFSSATTPELLLK 2640
            .:|.||.:.|:.|...:.|.::|.|..|:.||:.:...:... |:.... .|||||||||.:..:
Zfish  2590 NVDNVRTDFLIQTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTVIIKGYMSKYDPESHTAKSLNFSSATTPLMFQR 2654

  Fly  2641 TFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQ 2705
            :.:.|.:.|.   |....|: .||.:.:|.|:||:|.::.:|.|.....:|||:|..||:.....
Zfish  2655 SVESYVDKRM---GTTYGPL-AGKKMSIFIDDINMPVINEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFFNLEKP 2715

  Fly  2706 A-WVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIYGTFSRAMLRLMPAL 2769
            . :.::..|||:.|...| ..||..:..|..|...|.....|...|:.:|:|......   ..:.
Zfish  2716 GEFTNIVDIQFLAAMIHP-GGGRNDVPQRLKRQFSIFNCTLPSNASIDKIFGVIGTGH---YCSH 2776

  Fly  2770 RGYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQ----DMQP-----HYVYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLPV 2825
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Zfish  2777 RGFSEEVRNTVARLVPLTR-RLWQMTKVKMLPTPANFHYIFNLRDLSRIWQGMLGVTAEVISTP- 2839

  Fly  2826 EGLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRW----------------TNENIDLVGQKHF--------- 2865
            :.|::||.||..|:..||.....:..|                ..|.:||....:|         
Zfish  2840 QLLLQLWKHECKRVIADRFTAPEDVAWFDSTLAKLVEEQLGEEEREVVDLGVDSYFVDFLRDAPE 2904

  Fly  2866 -PGINQEEA-LQRPILYSNWLSKDYMPVNR-EELREYVHARLKVFYE--EELDVPLVLFDEVLDH 2925
             .|...||. ...|        |.|.|:.. :.|.|.::..|..|.|  ....:.:|.|.:.:.|
Zfish  2905 ATGDEPEETDFDMP--------KVYEPIESFDSLMERLNMFLSHFNESIRGASMDMVFFRDAMIH 2961

  Fly  2926 VLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFDEDLRCVLRRS 2990
            :::|.||.|.|:|:.||:||.|:||.:|:|..:::.|...|||.:...|.:.:..|||:.:.|.:
Zfish  2962 LIKISRIIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGYKTFQITLTRSYNTANLMEDLKGLYRTA 3026

  Fly  2991 GCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSD 3055
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Zfish  3027 GQQGKGISFIFTDNEIKDESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEIDEIISDLIPVMKREFPRRPPTN 3091

  Fly  3056 E-LYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSDSALFQVGKEFTTR 3119
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Zfish  3092 ENLHEYFMSRVRQNLHVVLCFSPVGERFRNRALKFPALISGCTMDWFSRWPKDALIAVSEHFLST 3156

  Fly  3120 VDLEKPNWHAPDFFPSVCPL------VPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAV 3178
            .|::             |.|      |....:.:|.|...|           |...:|..|:..|
Zfish  3157 YDID-------------CTLEVKSEVVQCMGSFQDGVAEKC-----------ADYFQRYRRSTHV 3197

  Fly  3179 TPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAA 3243
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Zfish  3198 TPKSYLSFIHDYKTIYKEKHSEVQTLADRMNTGLQKLKEASESVAALSKELEVKEKELQIANAKA 3262

  Fly  3244 NAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQEIQIRL--------ADQTVKIEEKRKYVMADLAQVEPAVIDAQ 3300
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Zfish  3263 DMVLKEVTVKAQAAEKVKVEVQKVKDKAQAIVDSISADKAI-AEEK-------LEAARPALEEAE 3319

  Fly  3301 AAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLL-----------GENAT--DWKSIRAVIMRE 3352
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Zfish  3320 AALQTIKPSDIATVRTLGRPPHLIMRIMDCVLLLFQRRVNTVKTDPEKNCTMPSWQESLKLMTAG 3384

  Fly  3353 NFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMACGPMVKWAIAQIEYADMLKRV 3417
            ||:.|: ..|..:.|.::|.|.: |.|....|||.|...|.......:..|..|...:..:.|.|
Zfish  3385 NFLGSL-QQFPKDTINEEVVEFL-SPYFDMVDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMAAFFSINKEV 3447

  Fly  3418 EPLREELRSLEEQ---ADVNLASAKETKDLVEQLERSIAAYKEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAK 3479
            .||:..|...|.:   |:::|..|:...| .:|.|..:.  :.||.:.:.:.|.:..|.|..:.|
Zfish  3448 LPLKANLAVQENRLTIANLDLQKAQAELD-AKQAELDVV--QAEYEKAMMEKQTLLEDAERCRHK 3509

  Fly  3480 VDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRLNLFTTWSQHL 3544
            :..:.:|:..|..|:|||...|:.|.:|...::|||||:.||::|.|.|:|.:|..|.|.|.:.:
Zfish  3510 MQTASSLISGLAGEKERWTQLSKEFAAQTKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRNLLLTDWQREM 3574

  Fly  3545 QAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLL 3609
            :...|.:|.::..||.|.:......|....||.|||..:|.|::.:..|:||:|||..|...::.
Zfish  3575 KFRQIPFRTNLNLTEMLIDAPTVSEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKAARFPLLIDPQTQGKIWIK 3639

  Fly  3610 NEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ENYDPILNPVLNRELRRTGGRVLITLG 3673
            |:.:..::..||.....||.:||.:|..|.|||::|| |..||.|:.||.:...:||....:.:|
Zfish  3640 NKESKNELQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIKTGFTYKVKIG 3704

  Fly  3674 DQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSD 3738
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Zfish  3705 DKEVDVMKGFRLYVTTKLPNPAYTPEISARTSIIDFTVTMRGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTD 3769

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Zfish  4600 VKDARLYSSPIYKKPVRTDLNYIAAVDLRTSHPPEYWILRGVALL 4644

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 129/682 (19%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 995/3523 (28%)
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dnah5XP_073781887.1 None

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