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Protein Alignment Dhc64C and dnah5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031759546.1 Gene:dnah5 / 100492041 XenbaseID:XB-GENE-854543 Length:4688 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:4920 Identity:1263/4920 - (25%)
Similarity:2208/4920 - (44%) Gaps:818/4920 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   129 KSIHSQL--RLINFSDGSPYETLHAFISKSLAPYFKSYVKESGRADRDGDKMAPSVEKK-LAELE 190
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 Frog   190 ENVHREVNFNMLDTSGNSLLGSVESLLSDIYIPALKT--MDNGWGELVDPQQAGNVKQDFLGSLE 252

  Fly   191 --MGLLHLQQNIDIPEITLTAHQTVNNVIRKC-AEENRKAK-VADFGDKVEDSSFLNLLQNGVNR 251
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 Frog   253 GFVGVLSGAQQSLMDKVNL----------KKCETYDLRTLKGPCDYLTVANSSEGLERIEEGMKV 307

  Fly   252 WIAEIKKV----TKLNRDPGSGTALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGK---- 308
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 Frog   308 WIKQIEQVLAESNQLRKEADDLGPRAELDHWKKRLSKFHYLLDQLKTPEVKAVLGVLTAAKSKLL 372

  Fly   309 ---RFHATVSFDTDTGLK---QALATVADY-NPLMKDFPINDLLSATELEKIRPAVQQIFAHLRK 366
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 Frog   373 KIWRLLDTRITDSANEAKDNVKYLYTLEKFCDPLYNSDPVSMIDSIPRL---------------- 421

  Fly   367 VRNTKYPIQRCLKLIEAISR--DLSQQLLKVLGTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSC------- 422
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 Frog   422 --------MNAIGMIHNISRYYNTSEKITSL-------------FVKVTNQM--ITACKSYITNN 463

  Fly   423 -----WDDEYDKLQGLLRDIVKKKRDEHLKMVWRVSPAHKKLQTRME-------------HMRKF 469
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 Frog   464 KTAKIWDQAQDVVVEKLKSAI--KLNEFYQHAF-----HKTKETREQIPTERQFDFSEVYIFGKF 521

  Fly   470 RRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQPY-SLDAADANAIEEVNLAYENV------KEV 527
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 Frog   522 DTFQRRLEKII---------------HIFETITTYSSLQNSKIEGLEMVTTKFQSTVATIKKKQY 571

  Fly   528 DCLDITK-EGSEAWEAAVKRYEEKIDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRFNALFVRPHI 591
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 Frog   572 DFLDQRRTEFDDDYEEFVKQTHD----LHTQLKTFMDSTFERNYNTERSIIMLEKFERLKI-PDL 631

  Fly   592 RGAIREYQTQLIQRVKDDIEALHEKFKVQYPQSKSCRLSSVRDLPPVAGSIIWARQIDNQLTMYL 656
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 Frog   632 -GIEEKYQ-KILQNYGHDIEMVS---KVYTKQKNEPPLG--RDLPPVAGKIVWARQLLHR----I 685

  Fly   657 KRVEDVL---GKGWETHIEGQKLKADGDSFRAKLSISDVFH-EWARKVQERNFGSTGRIFTIEST 717
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 Frog   686 QRPMDLFQQHSTALQTEEARRIIRNYNKVAKVLLEYEILFHRSWLKQMEVAKSGLHASLL-VKSP 749

  Fly   718 RSRIGRGNVLRLRVNFLPEIITLAKEVRNIKNLGFRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIESVRTY 782
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 Frog   750 ET-------LELFVNFDPLILTLIRETECMAKLGLEIP--------------PFAATLQQKQNVY 793

  Fly   783 ERTLEKLNNRSLAQNSVFKIEDRASIVPLVAGLRKDVLNLVSEG-IGLIWESYKLDPYVIRLSEC 846
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 Frog   794 KKNFDNL-QFMLMEDKRIKSKVHAPLEQLIAPHIAKIDEAIQPGLLSLNWTSLNIEKYLKNIAEK 857

  Fly   847 VTQFQ---EKVDDLLV------------------------------------------------- 859
            ....:   ::|:||:|                                                 
 Frog   858 HADLELLLDRVNDLVVFRIDAVLQDMSITPLCKLPEEEPVSCEQFLQMTKDLCAKGAVTLQAKSC 922

  Fly   860 -VEEQ--------LDVDVR------------------------SLETCPYSAATFV--------- 882
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 Frog   923 MVEEAANELINMLLDLDIHSGDEDAKSFVGHRIMEDSNDISGVSLQRSQTVSSTHVVSQATIGPP 987

  Fly   883 --------------------EILSKIQHA-VDDL---------SLRQYSNLSVWVTRLD------ 911
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 Frog   988 SPPTKKKKKDMMEILEEEACELLSHFNHRNVDALLKVTRNTLETIRKRIQMSSMISFLDGNAISK 1052

  Fly   912 --------------------------EEVEKKL------ALRLQAGIQAWTE------------- 931
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 Frog  1053 QKINGQPIFKANITLAIPNIIMVPALDEVQQTLNKAVENIVNVSKGVGQWSKERMSKKNILERKI 1117

  Fly   932 -ALTGNKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQNAVHEIRITNQQMYLYPSIEEARFQIMQQFFA 995
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 Frog  1118 TAMRGNSNDSD-SEDVIVEA------GG-----------RSTHENISEVASISTVAFVHNKNYFK 1164

  Fly   996 WQAIVTSQVRLQSTRYQVGLEKHVSQTYRNLLTKLPEGKILENAYGAIEQKVSEVRNYVDEWLRY 1060
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 Frog  1165 NVSENKEIVKLCSV-----LSTSINSTKKEVLTALERFK----SYHHIWQKDRD--NVIEKFVSG 1218

  Fly  1061 QSLW-DLQADMLYGRLGEDVNLWIKCLNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGPIIIDYAKVQAKVTLKYD 1124
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 Frog  1219 SPLLSEFESQILHFR---DLELAI-------------NTEPEYICVGIIALFTADLKLALTSETK 1267

  Fly  1125 SWHKEALGKF-GTLLGTEMTS-------FHSKVSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSFITYVQSLKK 1181
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 Frog  1268 AWMVD-LGRHCNKKYRSEMENIFVFIEEINKKLNRQIKDLDDIRIAMAA----------LKEIRE 1321

  Fly  1182 DMIAWDKQVEVFREAQRILERQRFQFPNTWLH-VDNIEGEWSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQAK 1245
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 Frog  1322 HQITLDFQVGPIEESYAMLNKYELLVAKEETEKVDTLRYTW----EKLLVRGNEVQNELMAIQPN 1382

  Fly  1246 IVAE-DKAVETRTVD---FLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEA 1306
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 Frog  1383 FRGELISTVQTFIQDCSEFYSDYEMNGPMIVGLAPQEASDRLIMFQNRFDNLHRKYITYTGGEEL 1447

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 Frog  1448 FGLQVTQYPQLLEIKKQLNL----LQKLYGLYNNVIEI---VNGYYDILWSDVNIEKINSELLEF 1505

  Fly  1370 MAQLKELPARLRMYESYEYVKKLIQSYIKVNMLIVELKSDALKERHWKQLTKQLRVNWVLSD--L 1432
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 Frog  1506 QNRCRKLPRALKEWQAFLDLKKTIDDFSECCPLLELMSNKAMMARHWKRITDVTGHSFDVENETF 1570

  Fly  1433 SLGQVWDVNLQKNEGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINYQNKCRIIRGWD--- 1494
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 Frog  1571 KLRNIMEAPLLKCKEEIEDICISAVKEKDIEQKLKQVIAEWDNKTFTFANFKTRGELLLRGDSTS 1635

  Fly  1495 DLFNKVKEHINSVAAMKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSAD 1559
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 Frog  1636 EIIASMEDSLMILGSLMSNRYNTPFKAQIQKWVHYLSNTTDIIESWMTVQNLWIYLEAVFVG-GD 1699

  Fly  1560 IKTLLPVETSRFQSISSEFLGLMKKVTKSPKVMD-VLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLE 1623
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 Frog  1700 IAKQLPKEAKRFSNIDKSWVKIMTRAHEMPNVVQCCVGDETMGQLLPHLLEQLEICQKSLTGYLE 1764

  Fly  1624 RERTSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEE-NNVILGISSREGEEV 1687
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 Frog  1765 KKRLLFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQAHLLNVFDNIKSVRFHEEVYDRILSISSREGETI 1829

  Fly  1688 HFMNPVSTVEHPKINEWLSLVEKQMRFTLASLLAQA---VQDIKQFRDGKIDPQAYMEWCDKYQA 1749
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 Frog  1830 ELEKHV--MAEGNVEVWLNSLLKESQSSLHLVIRQAAIGIQD-SGFQ--------LIEFLSSFPA 1883

  Fly  1750 QIVVLAAQILWSEDVESALQQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLRRRKLEHLI 1814
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 Frog  1884 QVGLLGIQMIWTRDAEDALTNAKYD--KKIMQKTNQSFLDLLNTLIDMTTKDLSSIERVKYETLI 1946

  Fly  1815 NEFVHKRTVTRRLLNNGVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQD 1879
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 Frog  1947 TIHVHQRDIFDDLCRMHIKTPTDFEWLKQCRFYFN----EDSDKMFINITDVTFIYQNEFLGCTD 2007

  Fly  1880 RLVQTPLTDRCYLTMTQALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMG 1944
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 Frog  2008 RLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLG 2072

  Fly  1945 RIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPD 2009
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 Frog  2073 RIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIDLPVLSVAAQQIAIV---LTCKKERKKNFIFTD--GDNVEMNPE 2132

  Fly  2010 MAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLC 2074
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 Frog  2133 FGLFLTMNPGYAGRQELPENLKINFRSVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFIDNIVLARKFFTLYKLC 2197

  Fly  2075 DEQLSNQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQS 2139
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 Frog  2198 EEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKR--------------------ANPTDT--ESTIVMRV 2240

  Fly  2140 VCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWME 2204
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 Frog  2241 LRDMNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPSIQLDKAGYPELEAAIIKQVEGAGLIC------------ 2293

  Fly  2205 KGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVAH---VIDPKA 2266
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 Frog  2294 ---HPPWKLKVIQLFETQRVRHGMMTLGPSGAGKTTCIHTLMKAMTDC----GEPHREMRMNPKA 2351

  Fly  2267 ISKEALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNK 2331
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 Frog  2352 ITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLRAKRGE---HIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDDNK 2413

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 Frog  2414 TLTLANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLTWSPILEGWLKK------- 2471

  Fly  2397 DGDEDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSAD-----GIVVRTLEYAMDQ-EHIMD 2455
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 Frog  2472 ----------RSPQD---------------ANILRKLYSASFAELYRFSVQSLEYKMEMVEAFII 2511

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 Frog  2512 MQSINMLQGLIPSKDQGGE-------------ISAEHLE----RLYVFSLMWSIGAMLELDDRIK 2559

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 Frog  2560 MEQWLRSLDSVHLDLPKIPPGSDDTMFDYYVTTEGKWMHWNTSVE--EYVYPSDSTPEYGSILVP 2622

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 Frog  2623 NVDNVRTDFLIQTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTVIIKGFMSKYNPERYVTKCLNFSSATTPLMFQR 2687

  Fly  2641 TFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGTQRVISFLRQLVEHKGFYRASDQ 2705
            |.:.|.:.|.   |....| ..||.:.:|.|:||:|.::.:|.|.....:|||:|..|||.....
 Frog  2688 TIESYVDKRM---GTTYGP-PTGKKMSVFIDDINMPVINEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFYNLEKP 2748

  Fly  2706 A-WVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIYGT------------ 2757
            . :.::..:||:.|...| ..||..:..|..|...:.....|..||:.:|:|.            
 Frog  2749 GEFTNIIDVQFLAAMIHP-GGGRNDIPQRLKRQFSVFNCTLPSNTSIDKIFGVIGVGHFCSQRGF 2812

  Fly  2758 ---FSRAMLRLMPALRGYAEPLTNAMVEFYLASQDRFTQDMQPHYVYSPREMTRWVRGI----CE 2815
               ...|:.:|:|..|...:...:.|    |.:..:|      ||:::.|:::|..:|:    .|
 Frog  2813 LVDIKEAVKKLIPMTRKLWQMTKSKM----LPTPAKF------HYIFNLRDLSRIWQGMLNSTSE 2867

  Fly  2816 AIRPLDSLPVEGLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSERRWTNE-NIDLV------GQK--------HF 2865
            .|:     ....|::||.||..|:..||.....:..|.:: .:.||      |||        :|
 Frog  2868 VIK-----DTTVLIKLWKHECKRVIADRFTTAEDVDWFDKTQLKLVEDDFYQGQKSGDFAVDYYF 2927

  Fly  2866 ----------PGINQEEAL--QRPILYSNWLSKDYMPVNR-EELREYVHARLKVFYE--EELDVP 2915
                      .|...|.|:  :.|......:.|.|.|:.. .:|::.::..|::|.|  ....:.
 Frog  2928 VDFLRDAPEATGREGERAVKGEEPEDADFDMPKIYEPIESFNQLKDRLNMFLQIFNESIRGAGMD 2992

  Fly  2916 LVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSIFQIKVHNKYTSEDFD 2980
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 Frog  2993 MVFFKDAMVHLVKISRIIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTKLASYIAGYKTFQITLSRSYNTSNLM 3057

  Fly  2981 EDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQC----- 3040
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 Frog  3058 EDLKVLYRTAGQQGKGISFIFTDNEIKDESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEIDEITSDLIPFMK 3122

  Fly  3041 KEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWS 3105
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 Frog  3123 KEYPRRP----PTNENLYEYFMSRVRQNLHVVLCFSPVGEKFRNRALKFPALISGCTMDWFSRWP 3183

  Fly  3106 DSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSV-CPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLA 3169
            ..||..|.:.|.:..|:        |..|.: ..:|....:.:|.|...||...|          
 Frog  3184 KDALVAVSQHFLSSYDI--------DCTPEIKKEVVECMGSFQDGVAEKCVEYFQ---------- 3230

  Fly  3170 KRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVGLNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQ 3234
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 Frog  3231 -RYRRSTHVTPKSYLSFIQGYKAIYKEKHAEVQTLANRMNTGLQKLKEASESVAALSKELEVKEK 3294

  Fly  3235 ELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKKIQSQEIQIRL--------ADQTVKIEEKRKYVMADLAQ 3291
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 Frog  3295 ELQIANQKADMVLKEVTVKAQAAEKVKAEVQKVKDKAQAIVDNISADKAV-AEEK-------LEA 3351

  Fly  3292 VEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLL-------------GENATDW- 3342
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 Frog  3352 AKPALEEAEAALQTIKPTDIATVRTLGRPPHLIMRIMDCVLLLFQRKVNPVKLDQEKGCTIPSWQ 3416

  Fly  3343 KSIRAVIMRENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEKVNRASMACGPMVKWAIAQ 3407
            :|::  :|..||:.:: ..|..:.|.::|.|.:: .|....|||.|...|.......:..|..|.
 Frog  3417 ESLK--LMIGNFLQNL-QQFPKDTINEEVVELLQ-PYFEMQDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAM 3477

  Fly  3408 IEYADMLKRVEPLREELRSLEEQ---ADVNLASAKETKDLVEQLERSIAAYKEEYAQLISQAQAI 3469
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 Frog  3478 ASFYSINKEVLPLKANLAIQESRLATANLDLQKAQAELD-AKQAELDVV--QAEYEKAMIEKQTL 3539

  Fly  3470 KTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDVLLSAAFIAYGGYFDQHYRL 3534
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 Frog  3540 LEDADRCRHKMQTASSLISGLAGEKERWTEQSKEFAAQTKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRN 3604

  Fly  3535 NLFTTWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDLCTENAIMLKRFNRYPLIID 3599
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 Frog  3605 FVLTDWRREMKARKIPFGVNLNLNEMLIDTPTISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKAARYPLLID 3669

  Fly  3600 PSGQATTFLLNEYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ENYDPILNPVLNRELRR 3663
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 Frog  3670 PQTQGKIWIKNKEIRNELQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIK 3734

  Fly  3664 TGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLSTRDPTVEFPPDICSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNQVLKAE 3728
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 Frog  3735 TGSTYKVKVGDKEVDVMNGFRLYITTKLPNPAYTPEISARTSIIDFTVTMKGLEDQLLGRVILTE 3799

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 Frog  4461 IDRMQRIISLVRTTLTDLKLAIDGTIIMSENLRDALDCMYDARIPERWKKASWESS-TLGFWFTE 4524

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 Frog  4582 T-KWMKDDITAPASEGVY-VYGLYLDGAGWDRRNLKLMESKPKVLFEIMPV-----IRIYADNTS 4639

  Fly  4615 SK----LTLPVYLNSTRTELLFTVDLAVAAGQESHSFYERGVAVL 4655
            :|    .:.|:|....||:|.:...:.:...|....:..||||:|
 Frog  4640 TKDNRFYSCPIYKKPVRTDLNYIAAVDLKTVQSPDHWILRGVALL 4684

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 131/651 (20%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 984/3453 (28%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 74/330 (22%)
dnah5XP_031759546.1 DHC_N1 298..850 CDD:462457 131/651 (20%)
DHC_N2 1458..1863 CDD:462462 103/414 (25%)
DYN1 <1699..4343 CDD:227570 861/2843 (30%)
AAA_6 1998..2325 CDD:463697 158/368 (43%)
Dynein_C 4393..4685 CDD:465677 74/327 (23%)

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