DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG43367 and Nbeal2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001189048.2 Gene:CG43367 / 38505 FlyBaseID:FBgn0263110 Length:2754 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414249.1 Gene:Nbeal2 / 316014 RGDID:1306501 Length:2752 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2943 Identity:928/2943 - (31%)
Similarity:1445/2943 - (49%) Gaps:437/2943 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 IYNLWVQYTTKNDETHFRQFVARFVAIWRSQLQLDFQAENCPMWHEVQPDSGPHLGRLPDELLPA 71
            :|.||:.|..:.|..:.:|::..||.::...:.|.......|      .::|..:..||.:.|..
  Rat     7 LYELWLLYYAQKDLGYLQQWLKAFVGVFEKTISLSSLEPRRP------EEAGAEVPLLPLDALHV 65

  Fly    72 IGKFIIVARDVCETEGKLEEQAIEEVAILVDCLVIVCRHFDNILSIIKYEYKPNLIAILSRVFKQ 136
            :.:             :|::..:|:..:|:...:|:||:.:|:.:.......|.::|:|:.:   
  Rat    66 LAE-------------QLDQDNLEQALLLLKLFIILCRNLENVEAGWGQVLVPRVLALLTGL--- 114

  Fly   137 QMELPQSVPA-------ISHLFSSFSAFLEVMYDPYLTWRSFVRGQ---SADYSRLSYKPHSVHV 191
            ..||..|.|:       :.::........|.::|||.|||....|:   |.:.|:..:.|.::..
  Rat   115 MAELKGSPPSQEDRSTQLENVALHALLLCEGLFDPYQTWRRQHSGEAISSKEKSKYKFPPAALPC 179

  Fly   192 EIVPFIYDCFQEEK------LIRYAEIGESLLNILGAVICGSQLQLKVQKSLNSTSTLTNRNTNA 250
            |...|..:..|:.:      |:|       |:::.|||:.|.:                      
  Rat   180 EFGAFFQESLQDAEHLPPTLLLR-------LIHLFGAVLAGGK---------------------- 215

  Fly   251 LTTSSLAPCSGDGLLDCDNLRNGMKAICPATVSITMSILRQW--ESANNLRRVALQCYALM--VI 311
                                .||..|:...:|...:.:||.|  ..|.:..::.|...||:  |.
  Rat   216 --------------------ENGQMAVSSGSVQGLLGVLRGWGRGPAQDPHKMQLALRALVGAVH 260

  Fly   312 VLQKSSPEERQIDLVTLVQLYCDALQELLATKHFDSGDANFDITSDADQDVAIDMAALSSTVAAV 376
            ||..|....|..:|.||::.|...|            :|::..:..:..:.|:....:|...|..
  Rat   261 VLHASRAPPRGPELRTLLEGYFHIL------------NADWPASPSSSPEEALVALRVSMLDAIP 313

  Fly   377 KFFVTGDAGVSEAV----------------------------SDSNLLELLTNLPKLIKPWHISH 413
            ......|..|.:|.                            .||:|...|...|.:.|......
  Rat   314 MMLACEDRPVLQATFLSNNCFEHLIRLIQNSKLYLQARAPPEGDSDLATRLLTEPDVQKVLDQDT 378

  Fly   414 SSSLCSTMEALAILARHSPQSASQLRQGERIERLFTSLQEYGSPTVELLDTCFMLGYDESEHFLL 478
            .:.....:..|..:...||.:....::....:.|...||.:|.||..||.....:.. |.:|.:.
  Rat   379 DAIAVHVVRVLTCIMSGSPSAKEVFKERIGYQHLQEVLQSHGPPTHRLLQELLNMAV-EGDHSMH 442

  Fly   479 LP------EVMLRLLNWVPTLQERE-QLHVTSLVLKGCTDNYRTKTVACGSHIIKAVCGCLLTAE 536
            .|      :.:|.|..|:|.|...| :|.:...:...|.....::.....:.::..:...|.|..
  Rat   443 PPPPIRNEQPVLVLTQWLPALPTAELRLFLAQRLWWLCDSCPASRATCVQAGLVSYLLETLNTGT 507

  Fly   537 SLAENCVQNLIKLIEELSKLSIVPAELKCIFSLLRQ---------GTKFPQFKQLQQTLVVIALQ 592
            :|...|.:.|..|::.|.::|:.|.||:   .|||.         ||:  ..|......::.||.
  Rat   508 ALGARCQEQLFALLQALGRVSLRPLELR---RLLRPPPGLDSESCGTE--SQKAQHAGAIIRALS 567

  Fly   593 SL---RGSNSCAEFFSIEQPTDGILVPDIRNWTISGSYGFIFHILVRFNQLKEQSNS-------R 647
            .:   ||......:|.:.....||:||.::.|.   ..||.||..:.....:....|       |
  Rat   568 GMARHRGPARALRYFDLTPSMAGIMVPPVQRWP---GPGFTFHAWLCLQSTEAAPTSAPSRPLQR 629

  Fly   648 RMLLTLQTASGSGFEVFVQPNGNVVVAALTRREYLTSSTATKTLMDGQWHYLTVAITPPKRPFSY 712
            :.|.:..|:||||||.|....|.:|||..||:||:|.|....:..|..||.:.:...|.:||||.
  Rat   630 KQLYSFFTSSGSGFEAFFTAAGTLVVAVCTRKEYMTLSLPEVSFADSAWHSVAIVHVPGRRPFSQ 694

  Fly   713 SQINIYVDFVQKLSATLKVQAVNEPFTVCSIGAVVAPPQPGE--VAKTGNMPRSSSQESGSSGYK 775
            :.:|::.|.....:|.|:..:::|||:.|.||:.      |.  ...|..:|.||...:.|..: 
  Rat   695 NLVNVFKDGHLVKTAPLRFPSLSEPFSSCCIGSA------GHRTTTTTTGLPVSSVSTALSHTH- 752

  Fly   776 GMLPSLLERTLSANVSNYFTLPMRTQTAFDP---------NVKNFPIGMQDTVFGEQTCLNGHLG 831
               |||   |.|.:|      |..|...:.|         ::.:...|.|||.:|..|.|.|.||
  Rat   753 ---PSL---TRSQSV------PASTGLGWGPGLGAPPQEGSISSTLAGTQDTRWGSPTSLEGELG 805

  Fly   832 GVLL---ADPTTSLKTIFDAGANFSSIFSQDNDLLELNSRFVFCYAPGAIWHGTCQDLIPGGKYP 893
            .|.:   |...::|:.:...|.|..:.|..:.:|.||.::.:..|:|.|..:..|.||.||....
  Rat   806 TVAIFHEALQASALRILCILGPNEPAPFKPEGELHELGAKLLLHYSPQACKNNICLDLSPGHGLD 870

  Fly   894 GRINAQHCKIVKIQETINSIGGISAILPMLHRLITLDQTTDISIGSVSEESLSCAPTPSAEEFTD 958
            ||:.....:...:::.:|.:||:.|:||:|.|:..  |..:...|......| ..|..::...|.
  Rat   871 GRLTGHRVETWDVKDVVNCVGGMGALLPLLERVAV--QPQEAEAGPCETHDL-VGPELTSGHNTQ 932

  Fly   959 WEMLSSNSYTEWKMLQHPLASFLCLLRYLTHEHETNQEQLLSSECLAIVGTMLQRCPPSLFDVNA 1023
            ..:|.....:|.:|.::.:|:||.:||.....|..|||.|:..:..||:|.:|::.|....|:|.
  Rat   933 GLLLPLGKSSEERMERNAVAAFLLMLRNFLQGHTVNQESLVQCQGPAIIGALLRKVPSWAMDMNV 997

  Fly  1024 LMATHLLMESLQGHKAEAGGQLLDALYAHIVFDFAIWSRLQFQITLGHAQYLSAMIKNDRKFFRK 1088
            ||:..||||.:   .|::.|.||..||.|::|:|.:|:...|.:.|||.||:|::|:..|:..||
  Rat   998 LMSAQLLMEQV---AADSSGPLLYLLYQHLLFNFHLWTLSDFAVRLGHIQYMSSIIREHRQKLRK 1059

  Fly  1089 RYGVQFVLDVVRQYYSTPDS--ISDDDAKTIRATLFGIIKFYLQKDVNIKEVNSMITFLASVRQD 1151
            :|||||:||.:|.:||....  ::.||.:|::.:|.|:::.:|.:::::.::..:::|||:..:|
  Rat  1060 KYGVQFILDALRTHYSPQRERPLAADDLRTVQTSLLGLVREFLVRNLSVDDMQVVLSFLAAANED 1124

  Fly  1152 VVLVEFLEMMTFYVRGKNCKDQMVLLLHEPQSANLLYNFFVDKSYSNEIQEAAIRFISGLLATSR 1216
            ..:|..|:::...::|...::.:.:.|.||.:..:|....|....:..:.:...:.:..|....|
  Rat  1125 CQVVGTLDLLLALLQGSPAQEPLAIFLLEPGNLEVLLTLLVRPKSTPLLSDRVCKILRRLQQNER 1189

  Fly  1217 VHQKYKQVLRLYD---QTTEQSMFPGFFS-----------------FITPLSLSSTILFHLVDEM 1261
            :.::.:|.|||:|   |....|:..|..|                 .::|..|:.:.|..:|  .
  Rat  1190 LPERNRQRLRLHDCGLQGLVASLPEGIASPQLCQGLYKLFVGTVPQVVSPDCLNLSDLLAVV--Q 1252

  Fly  1262 LGLQPDYAGLIFLVYHVSSCDLPVKLEIAKRLLQTTFVKQQSTVAMAKQTGWQESIARLLIRKPI 1326
            |.||               .||.|:|:|.::|....:.:......:|:|.|||:.:.||.:.:..
  Rat  1253 LSLQ---------------ADLSVRLDICRQLFHLIYGQPDVVRLLARQAGWQDVLTRLYVLEAT 1302

  Fly  1327 T--SSPPDEEKRRSFGINLDVLLEDNSNFLAQADLITFSEQEIGLAQLQQQQQEELSDSGLILNE 1389
            .  |.||                    .|:.:..    :..|:.|:....:...|.||       
  Rat  1303 ATDSGPP--------------------RFVPELP----TSSELALSPPPTELPAESSD------- 1336

  Fly  1390 IQASVTEAATVIESEIKELAESVSGAVVENANSLFSVIRQTTHDLQDTFESLTQGSST--DTADG 1452
                     ..:.||    :.........:|.|.||:    ..||.....|:..|::.  .:::|
  Rat  1337 ---------VFLPSE----SPCPDPDAFYHALSPFSM----PFDLGLERASVDSGNTAGGSSSNG 1384

  Fly  1453 SQTPSIQREESLSSDTSSQSPHGPPKK------------SDSLESTSAFDFVADGDVDT------ 1499
            :.||        :|...:.||...|:.            |:.||..|..:....|| ||      
  Rat  1385 TITP--------ASQPGTPSPLDGPRPFPTTQGRHSSSLSNVLEDGSLLEPTISGD-DTSNTSNP 1440

  Fly  1500 ----EEQLVYLVSNTLFNIFWRGIPNDHPQCWQERGQVLGCINLLALNNELITSHLSLRLRILEM 1560
                ||:|..|::|.||::.|||:.......|:|||||...:..|..:..|:.|...::..:|||
  Rat  1441 QQTPEEELCNLLTNVLFSVTWRGVEGSDEAAWRERGQVFSVLTQLGASAMLVRSPDCIKRSLLEM 1505

  Fly  1561 AVQASLFDLSEHGSQTLVN-QENASHILRMVYELVVLGSNEDESKKCSTKLLDGVLALLDALMIF 1624
            .::::|.|:.|.....|.| .:.|..:||::.:. :........:..|.||.:||..|||.|..:
  Rat  1506 MLESALTDIKEAPPGGLANLSQQALWLLRLLQDF-LCAEGHGNQELWSEKLFEGVCNLLDRLGAW 1569

  Fly  1625 QQ--GSSDDWSDM----IRLCLGLLLKCSHHPNPGIVAMATAKLHAILQSRSTEDPAELSYLLYS 1683
            ..  .|..|..:|    :||.||.:|.    .:|.:.|.|..|||.:||:.......|..|:|..
  Rat  1570 PHLANSIADLREMAQIGLRLVLGYILL----EDPQLHAQAYVKLHTLLQTAVPTRREEACYVLSK 1630

  Fly  1684 INRALDNAIEVGN------------PEEYSFLMPVMKALLEKCRVAFNLDSTLPDLPSTSSGPVF 1736
            :..||..|:...:            .|..|:|:|:::.||::......|...||.||.|:..|.|
  Rat  1631 LEAALSRALTASSSETEHSCAAMAASERCSWLVPLVRTLLDRAYGPLGLQWGLPSLPPTNGSPTF 1695

  Fly  1737 FNDFQMYSTSKKWRNFIERMVKPLYDRYQRDIELHLWEPINRFWAECYEACKAASKQRATNQAEN 1801
            |.|||.:..:.:||:||::.|:|...:::.|......:.::.||..||:...::.::...::.::
  Rat  1696 FEDFQAFCATPEWRHFIDKQVQPTMSKFEMDTYAKSHDLMSGFWNACYDTLMSSGQRLQRDRIQS 1760

  Fly  1802 RRLFQQKIYMPWKVRQVEEMQR----LQAAALQHKTIDSHIRKRWKTAKRFLYGPRGPWYTGEVD 1862
            ||.||:.:..|.:.|...|..|    |:..|.||.|...|    |....|.|..|.|.|......
  Rat  1761 RRAFQELVLEPAQRRARLEGLRYASVLKQQAAQHSTALLH----WGALWRQLSSPCGAWALRVPP 1821

  Fly  1863 EEFWKLSQHENVARMRLKLEPQLYPNKHENAANLRDNATSA--YDTKEISEFDSTIKNAVV---- 1921
            ...||||..|..:||||||.|..:.:.|..|:.||||...|  ..|:|.|...:..|.|.:    
  Rat  1822 TPHWKLSSAETYSRMRLKLVPNHHFDPHLEASALRDNLGEAPMTPTEEASLPLAVTKEAKISAPP 1886

  Fly  1922 RDFLADDESSQLEEELRQLIDT---QAQQDVALEKLVMSQDCELITLMTKVKGRIEVNQSVFTFV 1983
            .:.|.|    ||.||...:::|   .|:.|...||||:|.:|:|:|::..|.|.:||......|.
  Rat  1887 EELLED----QLGEEELAVLETLMEAAELDEQREKLVLSAECQLVTVVAVVPGLLEVTTQHVYFY 1947

  Fly  1984 DLSP---PTEDGSKYDFRFSTNKIREVHLRKYNLRRSALEIFLVDQTSYFLNFT----------- 2034
            |.|.   .||:|..:|||....::||||||::||||||||:|.:||::|||||.           
  Rat  1948 DGSTERVETEEGIGHDFRRPLAQLREVHLRRFNLRRSALELFFIDQSNYFLNFPHKVAGASASPP 2012

  Fly  2035 --------------TKTRNKVFTKIVGLPLPNILYGSGRSPAELLRASGLTQRWINREISNFEYL 2085
                          |:.||:|::.::.|..|...|.|.|||.|:||||||||:|:.|||||||||
  Rat  2013 CQAPRPQLYPIPPHTQVRNQVYSLLLRLRPPTQGYLSSRSPQEMLRASGLTQKWVQREISNFEYL 2077

  Fly  2086 MYLNTIAGRSYNDLSQYPVFPWILADYTSDVLDLTDPKSFRDLSKPIGCINPKNEAEVRGKYDSF 2150
            |.|||||||:||||||||||||:|.||.|.||||.:|..|||||||||.:|||:...||.||:||
  Rat  2078 MQLNTIAGRTYNDLSQYPVFPWVLQDYVSPVLDLNNPAVFRDLSKPIGVVNPKHAQLVREKYESF 2142

  Fly  2151 EDPSGAIPKFHYGTHYSNSAGVLHYLLRVEPFTSLHIDLQSGRFDVADRQFHSIPQTWKLLMDNP 2215
            |||:|.|.||||||||||:|||:|||:|||||||||:.|||||||.:||||||:...|:..:::|
  Rat  2143 EDPAGTIDKFHYGTHYSNAAGVMHYLIRVEPFTSLHVQLQSGRFDCSDRQFHSVAAAWQARLESP 2207

  Fly  2216 NDVKELIPEFFYFPEFLKNMNKFDLGHLQITKEKVDDVILPAWATTPEEFIAIHRRALESEYVSQ 2280
            .|||||||||||||:||:|.|.||||.||:|.|||.||:||.||::||:||..|||||||||||.
  Rat  2208 ADVKELIPEFFYFPDFLENQNGFDLGCLQLTNEKVGDVVLPPWASSPEDFIQKHRRALESEYVST 2272

  Fly  2281 HLHHWIDLIFGYKQKGPKAAEALNVFYYCSYEGAVDLDKITNPVEREAVEGMINNFGQVPSQLLR 2345
            |||.||||||||||:||.|.|||||||||:||||||||.:.:..||:|:||:|:||||.|.|||:
  Rat  2273 HLHEWIDLIFGYKQRGPAAEEALNVFYYCTYEGAVDLDHVADERERKALEGIISNFGQTPCQLLK 2337

  Fly  2346 EPHPRRLTQDETALKLVRAELRRPDLTQFLDKVVQYYCELSTPKDPIVYLSPPRSPPRSFL-QLS 2409
            ||||.||:.:|.|::|.|.:...|.:.|.||::..::.|:.:...|::....|.....||: |.:
  Rat  2338 EPHPPRLSAEEAAIRLARLDTHSPSIFQNLDQLKAFFAEVVSEGVPLLLALVPHRQTHSFITQSA 2402

  Fly  2410 PDVLVSISKSTILGCNSWLSFDK--DQGFLLEIDATTANLKNRKRIFGPFHSSQQPHSQLFAVST 2472
            .|:||::|.|.:||.:|||.:|:  :..|....|.|..|.|.:|.:.||:........|..||:.
  Rat  2403 SDMLVTVSASGLLGTHSWLPYDRNINNYFSFSKDPTMGNPKVQKLLSGPWAPGSGVRGQALAVAP 2467

  Fly  2473 DGKLLYAGGIWDNSLRVYNLNKGKAVASVTRHLDIITCIALDNCGSYLVTGSRDCTCIVWSIQTN 2537
            |||||::||.||.||||..|::|:.::.::||||::||:|||.||.||::||||.||:||.:.  
  Rat  2468 DGKLLFSGGHWDGSLRVTLLSRGRLLSQLSRHLDVVTCLALDTCGIYLISGSRDTTCMVWRLL-- 2530

  Fly  2538 QQGGGSTNNIPVHALTGQSHLQAITQLNTQNSYSPKPLTVLYGHDDAISSVAIYTELDLVVSGSL 2602
            ||.|.|.                        ..:|||:.|||||:.|:|.|||.||||:.||||.
  Rat  2531 QQNGLSA------------------------GLAPKPVQVLYGHEAAVSCVAISTELDMAVSGSE 2571

  Fly  2603 DGTVNVYTLQEGQFVRTLKPIGCTESCVQISFVTLSYHGHIAF--SALD----DTSHSVHVYSIN 2661
            ||||.::|::.||||..|:|.|.|.. ..||.:.|...|.|..  ||.:    ..::|:|:||:|
  Rat  2572 DGTVIIHTVRRGQFVAALRPPGATLP-GPISHLALGSEGQIVVQSSACERPGAQVTYSLHLYSVN 2635

  Fly  2662 GCSLGSKYVSGRVTGLASASDYLVVADDAGDITMSRLHGLKP-VFDIPLHVPIQTVVVTPGNTHI 2725
            |....|..::.:.|.|..|.|::::......:.:..|:.|:| |..:|:.||:.:|.||...:|:
  Rat  2636 GRLRASLTLTEQPTALTVAEDFVLLGTAQCSLHILHLNKLRPAVPPLPMKVPVHSVSVTKERSHV 2700

  Fly  2726 LAPLRDGRLAVIAVQLPS 2743
            |..|.||:|.|:....||
  Rat  2701 LVGLEDGKLIVVGAGQPS 2718

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG43367NP_001189048.2 Laminin_G_3 644..752 CDD:463865 39/114 (34%)
DUF4704 906..>1162 CDD:464870 82/257 (32%)
DUF4800 1646..1899 CDD:464996 79/268 (29%)
PH_BEACH 1952..2046 CDD:275391 47/121 (39%)
Beach 2072..2351 CDD:460459 202/278 (73%)
NBCH_WD40 2395..2742 CDD:466575 135/356 (38%)
WD40 repeat 2465..2503 CDD:293791 18/37 (49%)
WD40 repeat 2509..2580 CDD:293791 26/70 (37%)
WD40 repeat 2585..2621 CDD:293791 21/35 (60%)
Nbeal2NP_001414249.1 None

Return to query results.
Submit another query.