DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kst and sma-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097492.2 Gene:kst / 38418 FlyBaseID:FBgn0004167 Length:4337 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_741632.2 Gene:sma-1 / 179629 WormBaseID:WBGene00004855 Length:4166 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:4305 Identity:1507/4305 - (35%)
Similarity:2365/4305 - (54%) Gaps:318/4305 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 EYNSVLRSNFSRNE-----YRRYISYERQSLASQYEPGGYS-------------ALQTPT---PS 45
            :|.:...:..|..|     ||.|..:::.....:....|.|             .::.||   |.
 Worm    56 DYQATSSTGLSSGEVKPYQYRDYHQHQKHEYYGEGVNDGVSEDNVEDKMRKYEMQVRVPTSGAPP 120

  Fly    46 NRNSANMTQRDGI----IKFENERIKTLQEERLHIQKKTFTKWMNSFLIKAKMEVEDLFTDLADG 106
            .|..||.|.:|..    :.||..||:|||:||:||||||||||.||||.:|.:|:.|||.|:.||
 Worm   121 VRADANGTDQDEFNNETLYFERSRIRTLQDERVHIQKKTFTKWCNSFLNRASLEIVDLFEDVGDG 185

  Fly   107 IKLLKLLEIISSEKLGKPNSGRMRVHKIENVNKSLAFL-HTKVRLESIGAEDIVDGNPRLILGLI 170
            |.|:|||||||.:||||||.|||||.|:||:||.|.|| ..|::||:||||||:|.|.|||||||
 Worm   186 IMLMKLLEIISGDKLGKPNRGRMRVQKVENLNKVLDFLKKKKIQLENIGAEDILDRNERLILGLI 250

  Fly   171 WTIILRFQIQEIEIDVDEENESSEKRSAKDALLLWCQRKTHGYPGVNITDFTNSWRSGLGFNALI 235
            |||||||||..|.|  ::|.|..|::.|||||||||||||.|||.|.|.:||.|||:||.|||||
 Worm   251 WTIILRFQIDTIVI--EDEEERGERKHAKDALLLWCQRKTAGYPNVRIENFTTSWRNGLAFNALI 313

  Fly   236 HSHRPDLFEYSTIVNSKNSNLDNLNHAFDTAANELGIPSLLDAEDIDSARPDEKSILTYVASYYH 300
            |||||||.:::.:  :.|.::||||||||.|..:|.|..||||||:|..|||||||:|||:.|||
 Worm   314 HSHRPDLVDFNRL--NPNEHVDNLNHAFDVAEKKLEIARLLDAEDVDVTRPDEKSIITYVSLYYH 376

  Fly   301 TFARMKNEQKSGKRIANIVGQLMDADRKKMQYEGLTTNLLSWIRQKTLELEQRDLPNSLEGIQRE 365
            .||:.|.|....:|||||||:||.::..:..||.:.:.||:|||.....||.|..||||.|::.|
 Worm   377 HFAKQKTEMTGARRIANIVGKLMVSETMEDDYEHIASELLNWIRVTIKTLESRRFPNSLNGMREE 441

  Fly   366 LLAFKEYRTIEKPPKYKERSEIEALYFTINTLLKALNQPPYNPQDGQLVNDIEKAWQILEYAEHH 430
            ...|.::||.||||||||:.|:|||:|||.|..||:::..|.|..|..::|||.||..|:|||:.
 Worm   442 HAKFNQFRTSEKPPKYKEKGELEALFFTIQTKRKAMSRKQYQPPQGLFMHDIESAWAQLDYAENE 506

  Fly   431 REVALRDELLRQEKLEQLNYKFEKKSVLREGYLKEMIQVLSDPRYLR---QVDATLKKHEAISAD 492
            |:||:..||.||||||||..:|.||:.||:.:|:.:..||.:..:.|   ||:.||||.:|||.|
 Worm   507 RQVAIIAELQRQEKLEQLAQRFHKKAKLRDSWLRSVQVVLEEMEHGRSASQVEKTLKKQQAISTD 571

  Fly   493 ILARVERFNDLTAMAEELDRENYHGKERVRRREQEVMAKWRQLLELLENQRLNLSQMSNLMNLLR 557
            ||||.:||..||||..||..|.||..::||..|:|::.:|.|||.|||.::..|..:::||:|||
 Worm   572 ILAREDRFKMLTAMCNELCTEKYHESDKVRGMEREIIDRWTQLLTLLEQRKRALMSLNDLMSLLR 636

  Fly   558 EIASTTEAVRELQQQFASEDVGPHLLGVEELLQAHSLQELQVNTYGETLKRFNRQALPYKSSEHK 622
            :|.:.:..:..|:....:.|||.||:|||:||..|.|.:.|:|.:|..|.:.::.|..|...:.:
 Worm   637 DIDTLSNELYSLEPAVRNRDVGKHLIGVEDLLGKHDLLDAQINAHGSLLSKLSQSANNYIRHKEE 701

  Fly   623 DAALLAQRLADLEEAYSELLRRSAARRARLEEARNFHHFMEDYDNEESWLVDKQRICKTGITAKD 687
            ...:|.::|.::...|:.|:....:||..||.||:...|::|::.|.:||.:|:::|.|.:.:.|
 Worm   702 QFDVLQRKLDEVTAQYNTLVELCRSRRLGLERARSLFQFVQDHEEEMAWLAEKEKLCTTALNSGD 766

  Fly   688 LRAVLSLQQKHKALEDEIKSRKPKSGQMSTAGKRLIGEQHPRSSE-IQSRIDSLAEHWQALEALV 751
            :.||......:|.:|.|:::...:|..|...|:||:  |:.:|.| ||.|:..:...|:.|...|
 Worm   767 ISAVPQTTLLYKNVEMEMQTHWARSKGMIAGGERLV--QNGQSKEDIQRRLTQMNHRWERLRVAV 829

  Fly   752 ELRRRQLEDAAEAYQFYTDANEAESWLNEKIALVNSRDYGNDEPSAQALLQRHRDLQGELNAYSG 816
            :.....|.:|..|.|::.||||||||:.||:.||.|.|.|.||.:|::|||||..|:.|:.||..
 Worm   830 DALGNWLSEARHAQQYFQDANEAESWIREKMPLVKSDDLGRDEGAAESLLQRHARLEEEIRAYKS 894

  Fly   817 DILNLNQQADKLIKAGICTLELSAAEPELPEVEQEEWVNETRLVPKEVWEDEWVEKLEHKKVTET 881
            ||..|.:...:|..:...|...|.:      |::.|.||                          
 Worm   895 DISRLEEMQSQLANSAFHTATTSQS------VQETEEVN-------------------------- 927

  Fly   882 KMLPHVKSLFPFEGQGMKMDKGEVMLLKSKTNDDWWCVRKDNGVEGFVPANYVREVEPRPVACIV 946
              :|.|:..:.:||.||::.||||:.|..|:..:||...|.:|.||:|||||.:         ||
 Worm   928 --VPQVEMSYNYEGNGMRVSKGEVLALLEKSTPEWWRALKRDGTEGYVPANYCK---------IV 981

  Fly   947 PKAEKVKSLQKVKKTILVRQVVPVKRIKPVSVAPKPLVQRRTSTQSINENADS-VEKRQQRINQT 1010
            |           .:|:.|.|.                .|:.|:|...||...| |..||.:|:..
 Worm   982 P-----------GETVTVTQT----------------TQKTTTTLEGNETKSSVVADRQHKISND 1019

  Fly  1011 YDELQEMAQKRHALLEDSIHLFGFYRECDDFEKWMKEKERMIKSDEG-EGVDNAKRKFEKFITDL 1074
            |.||:.:|..|..||.|:|.|..||||||:||:|.||.|..:..:.. |.|...:|||:|...|:
 Worm  1020 YRELKRLADVRRRLLSDNIKLLRFYRECDEFERWAKEIEVSLADEPSPEHVAAFRRKFDKLEADM 1084

  Fly  1075 SA-ASKRVEEIDGAVDTFRRQGHSQLDKIIARQRQIHQIWQRLNNAKAQREKSLEGASSVELFNR 1138
            .. ...:::.|:...:....:||.|..||..||.:|:.:|..|...:.||...||....|..|:.
 Worm  1085 KTNGGTQLKHINDIANDLISEGHGQSRKIEVRQHKINAMWDNLERLRKQRGVRLEATERVADFDT 1149

  Fly  1139 TCDEAKVWMSEKMLQLDTAVITPDLRTVQALQRRHQNLERELAPVEDKVNRVTYLGNSVKNAYPA 1203
            ||:.|:.||..|..|||.   .|:  .|::|    |||||:|.|:|||:..:..|..:||..:|.
 Worm  1150 TCESAREWMLSKFEQLDR---NPN--DVKSL----QNLERDLKPLEDKIAALEKLAAAVKKDHPE 1205

  Fly  1204 EKDNVNARQQEVQDMWQQVQQRGSDLRNRIESEVGQQVFNNSAKVLLAWIDSVKDQLNADESARD 1268
            |...:..:..|::.:...:.:|..:.....|...|:::|.::.:.::.||:..:..:..|....|
 Worm  1206 EAAAIERKIAELRALHADLLRRAQEKMLLAEQTQGKEMFESALRDMIGWIEKTRKVMMEDVHPVD 1270

  Fly  1269 VETANNLLKKHNDLGDDI--RAHDTEFVEVIQLGKQLSDGKPNMAETVAVIERLKAEQDAIHRGW 1331
            |..|..|||||.:||:.|  :.::.|:.:  :||::|.:..|.|::....::.|.:|..::...:
 Worm  1271 VAEAEELLKKHYELGEQIKDKKYEVEYCQ--ELGRRLLERNPRMSKVEEQLQNLVSEMASLRDLY 1333

  Fly  1332 AEKQKWLLQCVDLQMFNREADKIDATTKSHEAFLEYNNLGASLDEVEAILKRHLDFEKSLMAQDK 1396
            ..:...|.|.:|||:||||:::|||.||.||||||::|||.|::.||.:||||.|.|..|.||:.
 Worm  1334 RRRDTILKQQLDLQLFNRESERIDAATKGHEAFLEFDNLGDSVESVENLLKRHRDLEAKLDAQEA 1398

  Fly  1397 ILKGFSDNADKLISNDHYDSKYIGDRRNQVLGKRKAVKDRAFERKRLLQASKDFHKFAAEADDLK 1461
            .|:.||..||.:|...|.||.||..||..||.:|:||:..|.:||:.|:||.::.:...|||::.
 Worm  1399 RLEAFSRTADDMIKAQHADSAYIEQRRRDVLARREAVRRAAAQRKKQLEASLEYQEMRREADEVV 1463

  Fly  1462 VWLQDKTRI--AGDENYRDLSNLPRKLQKHQAFERELRANEGQLRNVTKDGQALVQAGN-RVPEV 1523
            .|:.:|.::  :||::....|.:|.:|.||:|||.|:.|||.:::.:..:|..||...: ..|.|
 Worm  1464 GWMYEKAKLVMSGDDSALAPSAIPHRLLKHEAFEAEIIANEPRIQQINSEGDGLVSKKHYESPNV 1528

  Fly  1524 ESRVADLNKRWKDLLTLSEDKGRKLEQAASQREHNRSLEDAKKKVDELDSALRSGDVGNDLRSCK 1588
            |..|..:|.:|.||.....:||.:|.|||.|:..:|.||||..|:||:.:||.|.|.|.||||.|
 Worm  1529 EKIVRQVNAQWGDLKKQVWNKGLRLRQAADQKGLDRILEDAHAKLDEMQTALNSKDQGLDLRSVK 1593

  Fly  1589 DLINKQQILESEITIWDQKVAELVSTGDDMAHGGHFNAQNIEAGTKELQQRFKDLRDPTQRRRAK 1653
            ||:.|..:||.|:.::..|::::.:.|..||..||::|..|.:...:|.||:..::.|.|||:..
 Worm  1594 DLLQKHAVLEQEMGLYGNKLSDIENRGKKMAVDGHYDADRIHSTVGQLLQRYAAMKGPAQRRKGD 1658

  Fly  1654 LEESLNYHKFVFELDSEFQWINEHLPAAKSNELGQNLHQAQSLHKKHKKLEAEIKGHQPMINKAL 1718
            |:||..:|:.||::|.|.|||.|..|.|.|.:.|:.|.:|.::.||.::||||:..|...|:|.|
 Worm  1659 LDESRLWHQLVFDVDCELQWIAEKKPIASSQDCGRTLTEALNMVKKQEQLEAEVNQHGGQIDKVL 1723

  Fly  1719 VAGQSLISQQHPEREQVESLCQQLEQAWQDLERHCGERSRKLDMSLKAQQYLFDAGEIESWLGER 1783
            :....||.:.|....|:::...:||.||.:|::....|...:|..:|.|||||||.|:|||:.|:
 Worm  1724 LQAGELIKRHHSASSQIKAKSSELETAWSELKKLLRLRRAVVDWGVKEQQYLFDAAEVESWMNEK 1788

  Fly  1784 NNVLRSTEYGRDRDSAAKLLTKHKTIELELDTYSGIVTEMGHSCAAMVAANHPDSKVLAAKQQLI 1848
            .|.|.|.:||.|.|:|.|||:||:.:..::.||...:.::...|..:|.:|.|..:....:|..:
 Worm  1789 RNALASEDYGNDEDAARKLLSKHRALCEDMTTYRQWLEKLEVKCVELVESNRPHVERFQKRQDEL 1853

  Fly  1849 EKMLKSLHKLASQRQGRLMESLYKHEYFLESDEVEQWIREQEQAASSEDYGQDFEHLQLLQNKFD 1913
            .:...:|.|||..|:..|.:::..:||..||.::.|.|.|..:.|.||::.:|:|||:.||:|||
 Worm  1854 VREFDALSKLAEDRRNALEDAVCLYEYMRESADLGQSIEENLRVAMSEEFAEDYEHLKELQSKFD 1918

  Fly  1914 DLKHRVEVGADRVDQCELLAKKLIDSESPYANEVEKRQEQLRTSWENLLQLLNQREQKLHAAGEI 1978
            :.|.:|:.|::|...||..|..::....|:|.:|.|:||.|||:|..|.:.:..|:.||..|.|:
 Worm  1919 EFKQKVKNGSERFTSCETAANAILRRNPPFARDVVKKQEALRTAWNTLCEYIEARDSKLAVAEEL 1983

  Fly  1979 HRFHRDVAEALFRIQDKNAALSQELGRDLNSALALLRKHEGFENDLVALEAQLQVLVEDSVRLQA 2043
            |||||||.|....:.||.|.:.::||||:....:|.:.||..:.::...:.:|..|||::.||:.
 Worm  1984 HRFHRDVDEFEQWMADKMANMPRDLGRDVKHVHSLWQHHEALDKEIHNSQPRLAKLVEEAERLKK 2048

  Fly  2044 KYP-SNASAIAQQQDKVVAAWNDLKERSTARGDRLAASSDLQTFLTDVRDIVSWSSNLRAALQAE 2107
            .|| .||..|..:|..:...|.:||..:..|.|.|.|:.||.||...|||:::|:....:.:|::
 Worm  2049 TYPGGNAEQIGGRQQTLEQEWEELKNATDDRKDMLRAAFDLHTFNGKVRDLLAWTDLTISDIQSD 2113

  Fly  2108 EHVSDAAGATALKIQHDAIYGEIEAREDKFRYLNELSDSMVQTGHYAAADVEEKCAAMLDERQKL 2172
            .|::|...|..|:.:|..:..|::|||.:|..|....:.|:...|||:.:::.|...:....::|
 Worm  2114 LHINDLQQAEWLQTEHSRLSHEMDAREPEFARLVNDGEKMITAQHYASEEIKNKTHLLKSALERL 2178

  Fly  2173 HAAWNKKKIMLEQKIDLFCFLRDAKQIDNLSSSQQAALSSSDFGQTVEDVQNKIRKHDEFERLIQ 2237
            .:.|..:...|.|.:....|.|:||||.....|::..|.|...|.:|.||:::.::.|.||:.:.
 Worm  2179 RSEWALRNGFLSQAVQWHAFQREAKQIIASIGSKRTTLRSLAVGGSVADVESQTKRLDTFEKALS 2243

  Fly  2238 TQEEKVSLLQEHGRKLIEQRHYDSANIQTILQGVLARRQKVKDLCAVRRYKLEDALLYAKFVRDC 2302
            |.:|:.:.|.....:|::.||.:|.||......|....:.::.....|...|:||...|.|..|.
 Worm  2244 TLDERTATLDHTANELMKARHMESKNISMWQSNVHEELKLLRQDIEARHAMLKDAFALASFDSDV 2308

  Fly  2303 AEAKYWINEKQKKLEADAASYAEVTNLDEKIKKLQKHQAFQAEVAANQGRIQEIQDTGVILLSKQ 2367
            |:.:.||:||...:.......:|..::|||:|:||.|||.:|||.||:..:.:|...|..|  |.
 Worm  2309 AQIEAWIDEKTNGVRKAQDLSSESISIDEKMKRLQTHQALEAEVTANKPVVDQILQRGNQL--KN 2371

  Fly  2368 HESSPEIKRAIEIVLEAWQGLLAELEQRGRGLEEAQDSLEFNSQLDKIEAWIRDKEMMVQASDTG 2432
            ...:|:|....:.:...|..|......:...||||:|.|.|...::.:.|||.:||::|..:|.|
 Worm  2372 LHRNPKIANRCDELSYKWNQLSGACADQSLALEEARDLLRFKQLVENVLAWINEKEVLVSTADMG 2436

  Fly  2433 RDLEHCNALMRKLDDVDSDMRVDDQRVKHINQLADKLINQAQVPADTQSVDKRRKDFNYNWRQLQ 2497
            :|:|||..|:.:||...||..||:|.:..||:|.:||:.|.:...|  .|.|.::..|..||.|.
 Worm  2437 KDMEHCRLLLERLDGTRSDSIVDEQTLDEINRLGEKLVKQGRSSRD--QVQKEQQHLNEKWRLLL 2499

  Fly  2498 GALNAYRALLGGANEIHVFNRDVDDTADRIAEKSLAMSSTDTGRDLAAVEALIRREEALERDMSA 2562
            |.|..||..|..|.|:|.|||||:||.:||.||..||.|.|.|:|.|:||.|:|::.||||||||
 Worm  2500 GQLAHYRTELLAAMEVHTFNRDVEDTDERIHEKVAAMKSDDYGKDFASVELLVRKQSALERDMSA 2564

  Fly  2563 VKQKIDQHETAAEFLIKKYPERGAQHIERKLEELHKSWGNLQALSVKRQSILNEAYLAHKFVSDV 2627
            :.||:..|:..|:.:::|.|.. .:.:...|::|.:||..|...:..|...||.::..:|::.||
 Worm  2565 IHQKLIAHDKDAQKILEKRPPL-RETVLDSLKKLEESWEQLSKAAELRNEKLNRSFKLYKYLDDV 2628

  Fly  2628 KELELWVNDMIKKMNNTQSPSTINDCETQLELHQERKVEIEGRQEAFAGLKQQGEQLSKRPQQQQ 2692
            |::|.|.|.:..||.:.|:|...|.....||.|.|||.||:||.|....|.::|:.|::...:.:
 Worm  2629 KKVEQWANQVRNKMTSHQTPKDSNGARKILEQHHERKAEIDGRSEELRLLHEEGQALNQEQPEHK 2693

  Fly  2693 PDNVRKYLLVLEELHQTLNEAWSERARDLTEAHQLQLFKAQVEQVEIWLANKEAFLNNDDLGDSY 2757
            .:..|.:..|....|| |.:.|......|.:..:..|:..:..|.|.||::||..:...:|||:.
 Worm  2694 AEVQRAHKRVQNSEHQ-LRQTWESEKGTLQKLLEWMLWCDEAVQCEQWLSDKETQVARGELGDTT 2757

  Fly  2758 TAVERLLKKHDEFEKLL--HADHVDTLQKFANSILE-GEPKDADLIREKLAYILRRKQKLLELSE 2819
            .|||.|:|.|..||:.:  .::.:|.|.|.|::::. |....||:: .:...:..|...||:..|
 Worm  2758 DAVEMLIKGHSAFEETVRKQSEKIDALTKNADALVSGGNNYRADIV-TRSEEVTARHALLLKSME 2821

  Fly  2820 ERKQRLTQSHQLQEFLRSLYEIDRWLVQKLQVALDENYREPSNLQSKIQKHAAFDAELLSNSPRV 2884
            :|...|..|.:..||:|...|:..|:..|||:|.||::.:.:||:||:|||.|||:||:.|..|:
 Worm  2822 KRGHMLEDSKKYHEFIRQCGELIIWITAKLQLAYDESFLDHTNLRSKLQKHMAFDSELVENEKRL 2886

  Fly  2885 QSVIHEGERLIRGDHFAKDEIAQQVQLLEGDWLKLKGASQTKKDKLQQAYDALAFNRSVDEFNNW 2949
            .:|..:||:|:..:||..:::..|:..|...|.:|:..|..|..:|::|::..:..|.|::...|
 Worm  2887 STVERQGEQLVTDNHFMSEQVKAQLVELRSGWDELRTKSALKTQRLREAFELHSLQRKVEDIEKW 2951

  Fly  2950 MDEVELQLSSEDYGKDLAAVSNLLKKHERLEADVAHHGELADQLKQKDEQFFQAEHFLRHEIHER 3014
            :|:||.:|||:|:|:|:.:...|:||.:.|:.::|...:...::.:|..:..........:..::
 Worm  2952 LDKVEGELSSDDHGRDILSTELLIKKLDTLQTEIAGRSDAVVEMMKKARELRVQGSAAADDCLKQ 3016

  Fly  3015 ATVSIRRYNTLHEPLGIRRENLEDSLSLQQFLRDAEDELQWLAEKQLVAGSQDLGTSLLSVQGLQ 3079
            |.....||:.|.||:.||||||.|:.:..|:::.||::|:||:::.::|.|.:.|.||.|...||
 Worm  3017 AEQVEARYSGLDEPVQIRRENLVDAQAFFQWVKAAEEDLEWLSDRMMLASSGESGDSLQSALSLQ 3081

  Fly  3080 KKHNSLEAELTSQEPLIQALLQRGQQMIRDNHFASEQLQYKSELLQKQLVQLRDLAAIRRLRLLD 3144
            |||.:||.||.:::..:....|||:.|||..||||..:|...:.|...::.|::...:||..|.:
 Worm  3082 KKHATLEKELDTRQSAMNDTEQRGKDMIRQRHFASTHIQKILDRLSSAMLTLKESCGLRRDLLQE 3146

  Fly  3145 AVESQLFYVEANEADAWMREKRPVLSSSDYGRDEVSVQGHQKKLEVLQRELTAFKPSIEKVAKLA 3209
            |:::..:|.|..||:.|:||:.|:..|.:.|||:...:.|.::|.||.:|:..||..|:::.|.|
 Worm  3147 AIDAHEYYTEETEAEQWLREQMPLAMSQEMGRDQAGAESHLRRLTVLDKEVELFKNEIDRLKKRA 3211

  Fly  3210 TGLIERNHFDSSNIAEKNAQVGQEYEDLLRLAKERESRLGECKKLFEYLRETEELHEWVGDQMAV 3274
            .||:.|.|.|:.:||.|..::...:.||.|....|.:::.:..|..:::|:.::|.:|:.::...
 Worm  3212 DGLLAREHHDAMSIAAKQRKLEALFGDLCRECARRRTQIVDASKYHKFVRQADDLSDWLREKERS 3276

  Fly  3275 TASEDYGEDVEHVEQLILAFESFVSNLNANEARVEACLERGDRLIQENNPYRSSIKSKRDETKQL 3339
            .::||||:|:|..:|:|..|||.|..|.|...||.|.....:.|::..:||.:||.:|..:.::|
 Worm  3277 ASAEDYGQDLEDCQQIIEQFESTVRELAAAGERVAAVQRAQEDLLRSGHPYGASITAKGADVQRL 3341

  Fly  3340 WEELKDLVHARQDALAGAKQVHVYDRVADETIQLINEKDASLIS---EDYGQ-DLESIQALGRKH 3400
            |..:.::.:.|:.||.||:|||.:|:.||:.:..:.:|:|:.::   ||..: ||.|::|..::|
 Worm  3342 WTHVNEVANERKQALNGARQVHRFDQEADQILNWLQDKEATGVAMEQEDLSRADLASVKAQLQRH 3406

  Fly  3401 QVFESELVGIQGQVDSVLAEAAKLGEIYPDAKEHIEVKRDETVEAWTDLKEKTAARKNKLSQAEQ 3465
            ..|...:..::.||..:..||.:|...:||.:.|:||:|.:..|...|:.|.......||...:.
 Worm  3407 DEFMHGMKAVEKQVAELCHEAERLWNSFPDTRHHLEVRRLDMEEQLKDILEAAKKHLEKLRHMQS 3471

  Fly  3466 LQSYFDEYRDLIAWINEMLAKITAPELANSVAGAELLLASTKDHDTEIRTRDETFAKFAANGQQL 3530
            |||||.|||:::.|:..|.:.:|:.:|...||..|.|:....:::.|::.|......||..|:::
 Worm  3472 LQSYFQEYREMMQWMKNMQSTMTSEQLPRDVASCESLVRRHDEYNLEMQGRKPFVDDFARQGRRM 3536

  Fly  3531 IKEKHFLAHEVEDKIKVLQARHELLKHTLNKRREIYELNLDTQLFLKDAEILEQWISSREPQL-K 3594
            |:..|.|:.|:::|:.:|:....:|......|.|:||.|:|.|.:.::||.|:.|:..|...| .
 Worm  3537 IQSSHVLSQEIQEKVDILEKSWAMLCEIWKDRAELYEENMDVQKWKQNAEQLDSWLEERAGLLGD 3601

  Fly  3595 DTKLGDSIPQVEDLLRRHEDFEKTVAAQEEKFQAIKRITMLEQLFRHQLEQEKISKLQEKERLEK 3659
            |.::.||:...|..||..:||..|:.||.||...:||:|::||.|         |:|:.|| :::
 Worm  3602 DWRMVDSVEMAETHLRDFDDFLVTLEAQSEKCDMVKRLTLVEQNF---------SRLRSKE-IDR 3656

  Fly  3660 ERL--EQLKQRELQRLADERRRAEKQHEHRQNAASQEKTPIFSSPM-------VTP-------AQ 3708
            .|:  :..|:|:..::.::......:.:.|:...:||.:.:..||.       ..|       |:
 Worm  3657 ARIAEDDQKRRDTIKIVEKGNILANRRQERERRKTQEISLLRPSPSGEEFSTHTMPRKERKDRAK 3721

  Fly  3709 TSGPQSPALSQVQLRPPFGDDNEHLALQKSSSSGMFGDRLRRGSADANVKRAESMKVQPKQA--- 3770
            |:...:|...|:                        ||.|           |.|..|.|.|:   
 Worm  3722 TTADLAPGAIQI------------------------GDIL-----------ASSSTVAPLQSGVE 3751

  Fly  3771 -KRTPSFTTRRRAQSFRKNQKGEGFDLPPVEIQGSLERKHGLQSGGKKAPVRSWKQFHTVLCGQL 3834
             .:||||.| ||.||.||..:.|  |:..::::|..:||...|||||:|.:||||.::.:|||||
 Worm  3752 MTKTPSFNT-RRTQSIRKGSRWE--DMGAIDMKGFFDRKQCQQSGGKRATIRSWKNYYGILCGQL 3813

  Fly  3835 VCFFKDENDFLQQKTATAPVNILGAKCERADDYTKKKYVFRLKLPDGSEFLFEAPSLDILNDWVR 3899
            :||||||..||:...|..||.|.||:||:..:|.|:|..|||.|.|||||:|..|....:.:||.
 Worm  3814 LCFFKDEQQFLENVAAAPPVYIYGAQCEQYPEYAKRKNSFRLLLQDGSEFIFSCPDERQMLEWVA 3878

  Fly  3900 KISFHASLPPNMQLLS--YDESMKQQSSSSP-----------DIKVTSSVESPV----------- 3940
            ||.|||.|.|:.||.|  |::.:.|.....|           |:....|..|.|           
 Worm  3879 KIKFHAHLTPSNQLKSYAYNDDLFQSPDQPPMVAPRRNIGGHDVANRMSHASSVFTTSDDLEQHE 3943

  Fly  3941 --SSRNSSPDSQRRTSGAQVLDGTATPQMAFLQRQMQQQQQQQQSQPSSPTGGFDQKPPIPPRGA 4003
              .||..|...:.:.||...:...||....|....|:||          ||..|   ||..|..|
 Worm  3944 LDYSRRCSSLPRGKHSGQITMRDCATLPRGFGSDVMEQQ----------PTAFF---PPSGPLLA 3995

  Fly  4004 APVASHRQSQENLVVMRNRQSSNDLQQSATLPAGLTGVQQNGN-----------GKDDNALLTRN 4057
            .|           .|:....||.......|:.....||.:..:           |:.:.|:...|
 Worm  3996 TP-----------SVLTMSSSSMTANVMPTVVTRKIGVVRRASRRQSVYAESIYGEVEQAIAEAN 4049

  Fly  4058 SEARQSDNPPPLPTTMPPVGGQHQ--------HPQNS--------HSHQNQHQAQVQQRINAFNA 4106
               |.|.:.|         .|.|.        ||.:|        ..|.:.:...:::.::..| 
 Worm  4050 ---RVSTSRP---------NGDHAELRHTIQVHPGSSGYTETLMYKEHTSSNYQPMERSVSPRN- 4101

  Fly  4107 AASQQHQPDYFN--NNTARQQPQRIPSGRIDSTRKFIEMEAHNNNGGTSSSPKRSTINYSSSGAS 4169
                |...::..  .:..:.||...|.||..|.........::::....||.||           
 Worm  4102 ----QQNGEFITWVESNQQNQPMNTPDGRSTSASVVSTPSNYDDSDSIKSSSKR----------- 4151

  Fly  4170 SNGNGNV-KIGSGNS 4183
             .|.|:: |.||.:|
 Worm  4152 -KGFGSLFKRGSKHS 4165

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kstNP_001097492.2 CH_beta_spectrin_rpt1 61..176 CDD:409042 81/115 (70%)
CH_beta_spectrin_rpt2 196..302 CDD:409043 69/105 (66%)
SPEC 450..640 CDD:238103 74/192 (39%)
SPEC 658..832 CDD:238103 63/174 (36%)
SH3 885..935 CDD:214620 23/49 (47%)
SPEC 1030..1236 CDD:238103 67/207 (32%)
SPEC 1134..1341 CDD:238103 56/208 (27%)
SPEC 1343..1551 CDD:238103 90/210 (43%)
SPEC 1449..1658 CDD:238103 78/211 (37%)
SPEC 1555..1764 CDD:238103 78/208 (38%)
SPEC 1765..1975 CDD:238103 79/209 (38%)
SPEC 1873..2080 CDD:238103 78/207 (38%)
SPEC 1979..2185 CDD:238103 65/206 (32%)
SPEC 2188..2402 CDD:238103 63/213 (30%)
SPEC 2407..2618 CDD:238103 86/210 (41%)
SPEC 2514..2725 CDD:238103 78/210 (37%)
SPEC 2726..2934 CDD:238103 70/210 (33%)
SPEC 2935..3145 CDD:238103 68/209 (33%)
SPEC 3042..3251 CDD:238103 72/208 (35%)
SPEC 3149..3357 CDD:238103 66/207 (32%)
SPEC 3359..3567 CDD:238103 62/211 (29%)
SPEC 3465..3680 CDD:238103 67/217 (31%)
PH_beta_spectrin 3801..3904 CDD:269975 52/102 (51%)
sma-1NP_741632.2 SAC6 155..642 CDD:227401 277/490 (57%)
CH_beta_spectrin_rpt2 274..378 CDD:409043 69/105 (66%)
SPEC 634..732 CDD:197544 29/97 (30%)
SPEC 737..916 CDD:238103 64/180 (36%)
SH3 928..979 CDD:214620 23/50 (46%)
SPEC 1039..1237 CDD:238103 66/206 (32%)
SPEC 1242..1450 CDD:238103 81/209 (39%)
SPEC 1453..1553 CDD:197544 32/99 (32%)
SPEC 1562..1762 CDD:238103 76/199 (38%)
SPEC 1664..1874 CDD:238103 75/209 (36%)
SPEC 1770..1980 CDD:238103 79/209 (38%)
SPEC 1982..2192 CDD:238103 66/209 (32%)
SPEC 2194..2407 CDD:238103 64/214 (30%)
SPEC 2408..2618 CDD:238103 88/212 (42%)
SPEC 2620..2830 CDD:238103 64/211 (30%)
SPEC 2832..3041 CDD:238103 69/208 (33%)
SPEC 3044..3253 CDD:238103 72/208 (35%)
SPEC 3255..3466 CDD:238103 64/210 (30%)
SPEC 3361..3574 CDD:238103 63/212 (30%)
SPEC 3472..3689 CDD:238103 68/226 (30%)
PH_beta_spectrin 3780..3883 CDD:269975 52/102 (51%)

Return to query results.
Submit another query.