Protein Alignment Girdin and grdn-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001256816.1
• Gene: grdn-1 / 190137
• WormBaseID: WBGene00013082
• Length: 1319
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1525
• Identity: 345/1525 - (22%)
• Similarity: 619/1525 - (40%)
• Gaps: 386/1525 - (25%)

  Fly    23 WLESCL-----PRAELLAGYTSLLDGHIIHSVWLQIDPEPQNNPSELNDLNGKSLSIARAKNFEC 82
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 Worm    15 WLCDCAAIIPNPATQNFA-KNDFLDGLLMLNLMKFINP----HFSE-NEKNGQSL-------YEE 66

  Fly    83 VVRNLKSFFEEELGQTILV-LPDAFTLGHHPESKNGL-----EQMKTLLTLLLGAAVQCPNKELF 141
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 Worm    67 LLNQISQFYEKNLDQVIVCKMPEISIL----ESSGEIDEITFEELKKLLLLLLGCAIQSDHKKVF 127

  Fly   142 IARIKELDLETQHAIVGLIKQVTDSHSLVLTEDSLERLTPQSMYTHILRLTKERDVM-----YLK 201
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 Worm   128 VDRITGFDQTIQAELAACIQKLTESDEIVQNLEDFER-----------RKMKETDEVGGGGGSIE 181

  Fly   202 WIDLACVETEMTASDN----LVECGQGVSVTRSPSNGTATSTPSSSSNSESNHLAVECADLRSKN 262
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 Worm   182 DVDSDDMESSTTSSSNGEIAIKQQDQSFLMSR-----------STSPTSELRHQTLQIANLQHEM 235

  Fly   263 RKLRQELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAKRASAYRDEVDILRERAERADRL 327
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 Worm   236 RQMRTQAENRDEECQKLELDNEEKAQKIKILENERLKLVDFKKKWKSVNDDLQEANCKIEKLQNL 300

  Fly   328 EVEVQKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEEQLQRYRKRSEHAISLESEIIKYKQK 392
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 Worm   301 VGIEKKYREARDGKELYKSKYDIVVKKNLEMEETITTLEKNLKTLQMEMKEKFGVEDNLQRMRNT 365

  Fly   393 INDMALERDVDRSKLEELLEENSQLQLVARNLNSTMDLDKSFSENEDDCNSGD-----------N 446
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 Worm   366 IDDLEAEISKKNLEIEDFLDEKHR-------------MDREIKELKEIVHQMEVPSTTTTPRIMD 417

  Fly   447 SLSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTA-------------------------ALEQLKESSFHEST 486
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 Worm   418 SLADQLENAKQDEFEMMKAEIRKLRAQTEGATPETTIIQCNQDLDTLRSQLSTEQHQTAQLHLEI 482

  Fly   487 SKMLELEKEK-----KKLSLKIEQMQENINRLTQQNVELEGVFKNALEENKKLQDAVDNRQKSYD 546
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 Worm   483 QKM-QVEKEQIDGNMERIGIELEEMSAQVENL---NLERDEAVKQLLEARRKFGEF----QMGQS 539

  Fly   547 RQSLEREADRQKLSDAEQHVETLNKEKQRIQTLNESIQRRADDLERLAESKTK------ELEQYL 605
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 Worm   540 R-DLEEKWSKE--------VEKSNKISKKCEILEEKLQ-ESDFL--LAKSRDEAKKLQFELDEAL 592

  Fly   606 EK--------SRQYELTKQKLYEIEARVSTYERENASLL--KEVSKLKEGSEQKSVQLDDSIN-- 658
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 Worm   593 EETSHVTRSLSSEKNTLKAKLLELQDQV---EAQTLELLNQKNCGKRLEDRDQMISNLHNLKNEL 654

  Fly   659 ---------RLDVQSKELQKLGK--ALEDSE------QVHQKLVEL-------EKQNQELASQRI 699
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 Worm   655 ENDLKTCQTQLELESKKLQRLREDLVLEKSRRADLIGRIHSLCTTLSLNGANFEKINN------- 712

  Fly   700 IDQEMISTLRNDLVTGTLVTKKVRNNLEKLGLADEEPGEL-NVEHVVEKLVRNP-----ETFKTV 758
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 Worm   713 -DDELIDNIDDIMMNALVAVKRERDDLRIQG--NQQIQELHDLKRDIEKLRRSESESLNESDDRV 774

  Fly   759 REIMLNVTREQLEEEER-------------EGGVKSDMCVLCHRQEIFTVEKNIELAATPAPAPA 810
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 Worm   775 REL----TRENMHTKEQVFMLQEKLRELNLELSTKND--------EIDMVKASIEELNRNSTASC 827

  Fly   811 QPSSQELRFEHKVRLSPARESAELTRIKDSNTQLQTENARLSVDVAALGSQITSLNTQHVALQLA 875
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 Worm   828 TSNAEIARLQVSIRNSQIQEDL----VKQENTKLRDE--------------------------LQ 862

  Fly   876 NSQLAAEKDSLLKEIDSLQQEHKHALQDQVTLQCLHDQLSAEYESLNKDKEQLKAAVRDL-RQEL 939
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 Worm   863 EMQKMSKKRS--QNLDELENMHKTLLVDHSRLQQLHNLLTRDYDEAKKESMELRQKVQNIPRQQA 925

  Fly   940 ----RDTREQQSALEQRIEELTIQNSNMKTCSEDLSILRTEHSKLTDDFRNLFATSDRFKNEYKN 1000
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 Worm   926 VFMNANIRELEAKLSEEISRREQLEKEHKMC-------RIHCENLRRDITELVQTRDELSLE--- 980

  Fly  1001 IQEQYKMVRMEHSSLKLQNT---ELSGELNAKSDQVRCLQMEYSKVQQRCEMLIQNNAELDSERK 1062
                   :|..|.:...:|.   ||..:||.|..:|       :|:..:.|.|.|.|...:.|.:
 Worm   981 -------LRRAHDTCHNKNNQIDELKKQLNQKISEV-------NKLSSKIEALSQLNRTYNEENR 1031

  Fly  1063 ALMDNVSQLLSQYQELLAISLEDKKHFHEEEKNYTERVHSLKRQKEKLEEKIMEHYKKSE---TT 1124
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 Worm  1032 NLSRQLEILLTQNKELLQRALHDKDQYHLEMKDFQDQLSALRRHKEKLEDKIMDQYRTMENKKST 1096

  Fly  1125 VHKKKPFASMLVRRVKKASSDLMNKVPSRNRRSWVDDARTNSQFVIGSES------GGNESDNSN 1183
            ..:|:|.       ||:|:..|:|    |.|.:....:.|....|..::.      .|...|..:
 Worm  1097 PERKQPL-------VKRAAKALIN----RRRATSNGGSTTEDSSVYSADERSSPPLAGTNEDVDH 1150

  Fly  1184 EEPLSIASDTHLLQRNVPLRQSLQRDLLDNSIQRGGAVRSSLQAQKRTDLNNSRRNSVHGSLEAP 1248
            ..|...:||.|              |::            |.....:..|..||.:.:.||:.:|
 Worm  1151 LPPTCSSSDDH--------------DVI------------SPDFSAKNPLLRSRNDFMGGSVRSP 1189

  Fly  1249 DVTGSSLTLGTAGSRRTVYLIDEH--------QKLPDGSTPGATQSQSVGGSGSVNAAPPTPAEP 1305
            ...|:.              .|.|        .::|..::|         .:.|:.:.||.|...
 Worm  1190 RRYGND--------------HDGHIYTSPFLPPRVPIRNSP---------MTSSLRSRPPPPPYN 1231

  Fly  1306 QTPQKSTENNA----PVGPAT----FLMYNRINTTIGGASNSGDQSPLLQASGSVSGTTM----- 1357
            ::|....|.|:    |:..:|    .|...|:   :|    .|::..|::........|:
 Worm  1232 RSPAHKIEQNSSFFEPIAHSTPNSSILEERRV---VG----EGEKRELVRDKEERIDKTLSYYEN 1289

  Fly  1358 ----QDDKSARKRTEDKSN--SIWYEYGCV 1381
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 Worm  1290 VNLPQNPPDLPENSDLKPNESTIWHEYGCV 1319

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	44/152 (29%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	204/904 (23%)
grdn-1	NP_001256816.1	HkD_SF	8..151	CDD:425405	44/152 (29%)
		SMC_prok_B	258..1079	CDD:274008	209/934 (22%)