DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Girdin and Girdin

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647780.1 Gene:Girdin / 38385 FlyBaseID:FBgn0283724 Length:1381 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_312411.5 Gene:Girdin / 1273435 VectorBaseID:AGAMI1_008250 Length:1411 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1439 Identity:781/1439 - (54%)
Similarity:1034/1439 - (71%) Gaps:100/1439 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 EIDEFVNSSIISWLESCLPRAELLAGYTSLLDGHIIHSVWLQIDPEPQNNPSELNDLNG--KSLS 73
            ||:||||.:::||:||||||.|::|||.|||||.|:|:|:||||||||::|:::.....  .||:
Mosquito     5 EIEEFVNGALVSWIESCLPRHEIIAGYVSLLDGTILHTVYLQIDPEPQHHPAKIRGTAEVLTSLA 69

  Fly    74 IARAKNFECVVRNLKSFFEEELGQTILVLPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLLGAAVQCPNK 138
            .||.:||:.:|:||::.::||||||||.|||...|||.|||:.||||||.|:|||||||||||||
Mosquito    70 AARTRNFDAIVKNLRNLYDEELGQTILTLPDCSVLGHSPESRAGLEQMKLLITLLLGAAVQCPNK 134

  Fly   139 ELFIARIKELDLETQHAIVGLIKQVTDSHSLVLTEDSLERLTPQSMYTHILRLTKERDVMYLKWI 203
            |:|||||||||:.||||||.:|||||||.:||||:::|::|.|:.|..|::||.||||..:.||:
Mosquito   135 EIFIARIKELDVNTQHAIVEVIKQVTDSQTLVLTQEALDQLAPELMCKHLVRLAKERDQYHGKWM 199

  Fly   204 DLACVETEMTASDNLVECGQGVSVTRSPSNGTATSTPSS-SSNSESNHLAVECADLRSKNRKLRQ 267
            .....::|..|..| ....:| |:..:..:..:|||.:: |:.|||||||||.||.:||.|||||
Mosquito   200 SSFITDSEQQALVN-SSSSKG-SLHNAALSSASTSTANTPSTTSESNHLAVELADYKSKLRKLRQ 262

  Fly   268 ELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAKRASAYRDEVDILRERAERADRLEVEVQ 332
            |||||||.|:|::||||.|..:::|||.|||:|::|::||:|||||||:||||:|||||||||||
Mosquito   263 ELEEKSELLMEVKEELDHKCNQYEKLRTESQDWYSESRRAAAYRDEVDVLRERSERADRLEVEVQ 327

  Fly   333 KYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEEQLQRYRKRSEHAISLESEIIKYKQKINDMA 397
            |.||||.|::|||:||||||||||:|||:||||||||.|.||||:..::||:||||:||.:|||.
Mosquito   328 KLREKLSDAEFYKTRVEELREDNRMLLETKEMLEEQLARSRKRSDQVMTLEAEIIKFKQMMNDMT 392

  Fly   398 LERDVDRSKLEELLEENSQLQLVARNLNSTMD---LDKSFSENE-DDCNSGDNSLSEQLTNNAQT 458
            ||||||:|||:||||||.||||..:||.:..|   .:::.|:.: ||..|.|||||||||.||||
Mosquito   393 LERDVDKSKLQELLEENVQLQLATKNLMAGPDANVANQAQSDTDTDDLPSNDNSLSEQLTTNAQT 457

  Fly   459 RALKLELENRRLTAALEQLKESSFHESTSKMLELEKEKKKLSLKIEQMQENINRLTQQNVELEGV 523
            ||||||||||||.|||:.||||||||:::|:|||||:||||||::||.|||.|||.|||.|||.|
Mosquito   458 RALKLELENRRLLAALDSLKESSFHENSNKILELEKDKKKLSLRLEQTQENCNRLVQQNSELENV 522

  Fly   524 FKNALEENKKLQDAVDNRQKSYDRQSLEREADRQKLSDAEQHVETLNKEKQRIQTLNESIQRRAD 588
            ||||||||||||||:|::|:..|||:.:||.||.:..|.|:.:|:|.|:|||:|.|.||||||..
Mosquito   523 FKNALEENKKLQDAIDSKQQMIDRQTHDRELDRIRQIDLEKQIESLTKDKQRVQNLFESIQRRTI 587

  Fly   589 DLERLAESKTKELEQYLEKSRQYELTKQKLYEIEARVSTYERENASLLKEVSKLKEGSEQKSVQL 653
            ||||..::|:||..|..|:.::.|..:::||::..:.||.||||.:|.||:.|.||..|:....|
Mosquito   588 DLERSIDTKSKESVQLNERLKELEDVRKELYDVRGKCSTVERENVNLAKELVKYKEVLEKCEHDL 652

  Fly   654 DDSINRLDVQSKELQKLGKALEDSEQVHQKLVELEKQNQELASQRIIDQEMISTLRNDLVTGTLV 718
            |.....|:.:.||:::|.|.:::...|..||.||||:||||.||:.:..:.|:||:.||..||:.
Mosquito   653 DRVGGELETKEKEIEQLAKQVDEGSSVLVKLQELEKENQELLSQQKMHTDTIATLQKDLYDGTMA 717

  Fly   719 TKKVRNNLEKLGLADE--EPGELNVEHVVEKLVRNPETFKTVREIMLNVT-REQLEEEEREGGVK 780
            ||||:.|||:|||.|.  |..|:|||..||||.:|||:|||||||:|||. ..........||.|
Mosquito   718 TKKVKQNLERLGLNDTELERNEMNVEVFVEKLCKNPESFKTVREIVLNVAGSRDAGSTGAGGGTK 782

  Fly   781 S-DMCVLCHRQEIFTVEKNIEL------------AATPAPAPAQPSSQELRFEHKVRLSPARESA 832
            | |:|||||||||:||||:||.            |||.|....:...::||.||...|: |::| 
Mosquito   783 SADICVLCHRQEIYTVEKSIEFSNCDETAAPDSSAATNAVPELEQKLEQLRQEHTALLA-AQDS- 845

  Fly   833 ELTRIKDSNTQLQTENARLSVDVAALGSQITSLNTQHVALQLANSQLAAEKDSLLKEIDSLQQEH 897
                       ||.||||..|.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|:|::::.:|::
Mosquito   846 -----------LQEENARQKVKVATLGSQIASLNTQHVALQLANSQLAVEKDMLVKQVEAKRQQY 899

  Fly   898 KHALQDQVTLQCLHDQLSAEYESLNKDKEQLKAAVRDLRQELRDTREQQSALEQRIEELTIQNSN 962
            :....|.|.|||||:|||::|::||.:||.||..:|||:.|.||.||:..|||::||||..:..:
Mosquito   900 ESLQHDYVALQCLHEQLSSDYDALNGEKELLKNTIRDLKTENRDHRERTVALERKIEELQAELHS 964

  Fly   963 MKTCSEDLSILRTEHSKLTDDFRNLFATSDRFKNEYKNIQEQYKMVRMEHSSLKLQNTELSGELN 1027
            ||....:|:.||.|||||.||||.||.||:|.|.:|||..:||:..|.|:|.|||:||||||||.
Mosquito   965 MKDGLTNLNNLRAEHSKLKDDFRCLFTTSERLKQDYKNCHDQYRAFRTENSRLKLRNTELSGELT 1029

  Fly  1028 AKSDQVRCLQMEYSKVQQRCEMLIQNNAELDSERKALMDNVSQLLSQYQELLAISLEDKKHFHEE 1092
            .|.:|:..|::||:|:.||||||:..||.||.:|:.|||:|||:|:|||||||.|||||:|:|:|
Mosquito  1030 NKKEQINNLEIEYTKINQRCEMLLNMNASLDIDRRTLMDHVSQILAQYQELLAHSLEDKQHYHDE 1094

  Fly  1093 EKNYTERVHSLKRQKEKLEEKIMEHYKKSETTVHKKKPFASMLVRRVKKASSDLMNKVPSRNRRS 1157
            ||::|:::::|.||||||||||||||:|.::...|||||...||:::::|.|:|||:||:|||||
Mosquito  1095 EKSFTDKLNNLNRQKEKLEEKIMEHYRKLDSCSPKKKPFGLNLVKKMRRAGSELMNRVPNRNRRS 1159

  Fly  1158 WVDDAR-TNSQFV-IGSESGGNESDNSNEEPLSIASDTHLLQRNVPLRQSLQR----DLLDNSIQ 1216
            ||::.| |.||.: :||||||||||||.|||.|:||||:||||...|||||||    :.|:.::.
Mosquito  1160 WVEEQRLTQSQCLSMGSESGGNESDNSIEEPNSVASDTNLLQRGSQLRQSLQRKPNNEALNATLL 1224

  Fly  1217 RGGAVRSSLQAQKRTDLNNSRRNSVHGSLEAPDVTGSSLTLGTAGSRRTVYLIDEHQKLPD--GS 1279
            ||| :||||||.:|.::|.:.|||..|.    |....:|.|||||:||||||.|   |:.:  .|
Mosquito  1225 RGG-IRSSLQASRRDEVNPAHRNSFQGF----DTATDALNLGTAGTRRTVYLDD---KIVNSGSS 1281

  Fly  1280 TPGATQSQSVGGSGSVNAAPP----TPAEPQTPQ--------KSTENNAPVGPATFLMYNRINTT 1332
            ||        .|.|:||.:||    ||..|..|:        .::::|:|..| ||::.|||:||
Mosquito  1282 TP--------TGGGAVNPSPPPSVSTPPPPPPPRTDQSAGAATTSQSNSPAEP-TFVLLNRISTT 1337

  Fly  1333 -----IGGASN--SGDQSPLLQASGSVSGTT---------MQDD-------KSARKRTEDKS--N 1372
                 ....||  .|....|.:.||:.||..         |:|.       .:::|:.|.|:  :
Mosquito  1338 TTTLKTETTSNLLPGSPQQLNEVSGNPSGAPNAGTNSLCGMEDSNKKDSNGNNSKKKPEPKNRDS 1402

  Fly  1373 SIWYEYGCV 1381
            :||||||||
Mosquito  1403 AIWYEYGCV 1411

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GirdinNP_647780.1 HkD_HkRP 15..165 CDD:411794 98/151 (65%)
SMC_prok_B 315..1110 CDD:274008 461/814 (57%)
GirdinXP_312411.5 None

Return to query results.
Submit another query.