Protein Alignment Girdin and ccdc88c

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002933247.3
• Gene: ccdc88c / 100485260
• XenbaseID: XB-GENE-1033686
• Length: 2058
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1660
• Identity: 446/1660 - (26%)
• Similarity: 731/1660 - (44%)
• Gaps: 372/1660 - (22%)

  Fly    12 IDEFVNSSIISWLESCLP----RAELLAGYTSLLDGHIIHSVWLQIDPEPQN---NPSELNDLNG 69
            :|:|::|.:::|:::..|    ....|..|..|:||..::.:.:||||.|.|   |....|::|
 Frog     9 MDQFLDSPLVTWVKTFGPCGNENESKLDIYMELVDGVFLNKIMVQIDPRPSNQRVNKHVNNEVN- 72

  Fly    70 KSLSIARAKNFECVVRNLKSFFEEELGQTILV-LPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLLGAAV 133
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 Frog    73 -----LRVQNLTILVRHIKAYYQEVLQQLIVMNLPNVFLISKDPLTGKSMEELKKLLLLMLGCAV 132

  Fly   134 QCPNKELFIARIKELDLETQHAIVGLIKQVTDSHSLV----------LTEDSLERLTPQSMYTHI 188
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 Frog   133 QCDRKEEYIERIKQLDIETQAGIVSHIQEVTHNQENVFDLQWLELPDMAPEELDSLS-RNMALHL 196

  Fly   189 LRLTKERDVMYLKWIDLACVE--TEMTASDNLVECGQGVSVTRSPSNGTATSTPSSSSNSESNHL 251
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 Frog   197 KRLIDERD---------ECKEVIVDLTQERDYLQFQNPPSPLKSSSPDTSTNMVSHLATENKKHL 252

  Fly   252 AVECADLRSKNRKLRQELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQESQEWFTEAKRASAYRDEVDI 316
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 Frog   253 AVELAESKAKLRRIRQELEEKSELLLDTKHEVDRLNLELQKIKQENFQLAAEARTARTYRDEIDS 317

  Fly   317 LRERAERADRLEVEVQKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEEQLQRYRKRSEHAIS 381
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 Frog   318 LKEKASRVDRLENDLARCKEKLHDVDFYKARMDELREDNMILIETKSMLEEQLAAARTRTDKLHE 382

  Fly   382 LESEIIKYKQKINDMALERDVDRSKLEELLEENSQLQLVAR-NLNSTMDLDKSFSE--NEDDCNS 443
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 Frog   383 LEKENLQLKSKIHDLELDRYSDKNRIEELLEENMVLEIAQKQSMNESAQLGWELEQLSRSTDLSD 447

  Fly   444 GDNSLSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTAALEQLKESS--FHESTSKMLELEKEKKKLSLKIEQM 506
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 Frog   448 VRKSFVFELNETASSKILKLEKENQSLQNIIQELREASLILEEGNLKGQELEKENQQLNKVIENL 512

  Fly   507 QENINRLTQQNVELEGVFKNALEENKKLQDAVDNRQKSYDRQSLEREADRQKLS----------- 560
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 Frog   513 NKQIERENQSSSDLESLSEDLLKEKDLLSQAVENIKSEKERQIKELEQENKHLSQTLEAVRQRSQ 577

  Fly   561 -------------------------------------------DAEQHVETLNK---EKQRIQTL 579
                                                       .|::.||.::|   |..|::..
 Frog   578 VSTEARVKDIEMENKILHETIKDTSSKLNELEYEKKQLQKAFDQAKEQVEKVDKMENEVHRLEKQ 642

  Fly   580 NESIQRRADDLERLAESKTKELEQ----------YLEKS-----------------------RQY 611
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 Frog   643 NEILTKKVTSI-TIVEEKMQALEKENGVLEEENIVLKKSLDTLQNVTIRLEVLENENKQLDEENF 706

  Fly   612 ELTKQKLYEIEA------RVSTYERENASLLKEVSKLKEGSE------QKSVQLDDSI------- 657
            ||.:    .:||      :::..||||..||||..:|::..|      :||.:|:.|.
 Frog   707 ELRR----AVEAMRFSCTKITQIERENNELLKEKEELQKNVELLKALGKKSERLEVSYQGLSDEN 767

  Fly   658 ----NRLDVQSKELQKLGKALEDSEQVH---QKLVE----------------------------- 686
                ..||..:|::..|.|.|:|:|:.:   ||.:|
 Frog   768 WRLQQMLDNGNKKIDDLQKELQDTEKENKDLQKTLEELKICNKRLERMEEENKAKDQEMAQVEKD 832

  Fly   687 -------------------------------------------------------LEKQNQELAS 696
                                                                   ||::|::|..
 Frog   833 NKTLQKESKRLWQQVELKDAILDDNTVKLADLEKEKRTLEKEVSKLRDLSTKTRDLERENKDLLQ 897

  Fly   697 QRIIDQEMISTLRNDLVTGTLVTKKVRNNLEKLGLADEEPGELNVEHVVEKLVRNPE-------- 753
            |..:|:..::|||.|||...|.|:::.:.||||.|..|:.| ||.|.:::....|.|
 Frog   898 QMTVDKRTLATLREDLVLEKLKTQQMSSELEKLSLELEKIG-LNKELMLQDENSNAEKKYKLLES 961

  Fly   754 ----TFKTVREIMLN-------------VTREQLEEE-------------EREGGVKSDMCVL-- 786
                |.|:...:..|             ...:||:.|             ..:|..::....|
 Frog   962 KIESTLKSTLAVKENKILDLEMKIEETSSLNQQLQNELNSIKKDNIASKQNLKGAAQNSYTQLNN 1026

  Fly   787 ---CHRQ---------EIFTV-EKNIELAATPAPAPAQP----------SSQELRFEHKVRLSPA 828
               |:.|         |:... ::.|||....|...|:.          .||.|...:::    .
 Frog  1027 KPECNSQINGQRETIVELLKFKDRTIELERNNAALQAEKQLFREQLHHLESQNLNLSNQM----G 1087

  Fly   829 RESAELTRIKDSNTQLQTENARLSVDVAALGSQITSLNTQHVALQLANSQLAAEKDSLLKEIDSL 893
            ....::|.:::.||.|||:.|.|.|:.|...||:.||.:|...||...|...:|.:.|.::.:.|
 Frog  1088 TLQKQVTFLQEHNTALQTQTANLQVENATATSQVASLKSQISQLQNQLSARESENEILQQKKEHL 1152

  Fly   894 QQEHKHALQDQVTLQCLHDQLSAEYESLNKDKEQLKAAVRDLRQELRDTREQQSALEQRIEELTI 958
            :..|:..|||...|..||:..|:|||.|......||:..:.|.|......|..:.|.:..|||..
 Frog  1153 RVTHESLLQDHEQLGSLHEHQSSEYEGLISQHSSLKSQYKSLEQAHHSLEESYTTLMKHKEELEN 1217

  Fly   959 QNSNMKTCSEDLSILR-------TEHSKLTDDFRNLFATSDRFKNEYKNIQEQYKMVRMEHSSLK 1016
            .::.:|...|.|...|       .|:.||..|...|.......:.||.::.:..|.|:...::.:
 Frog  1218 LDAILKKEQEVLQQERRKNFAAMEENQKLKTDLERLNFLHGELQTEYSSLHKHTKEVKTSLNNAQ 1282

  Fly  1017 LQNTELSGELNAKSDQVRCLQMEYSKVQQRCEMLIQNNAELDSERKALMDNVSQLLSQYQELLAI 1081
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 Frog  1283 MELNRWQARFDELKEQHQTMDISLTKLDNHCELLTRLKSNLEEENHHLLSQIQMLSQQNQMLLEQ 1347

  Fly  1082 SLEDKKHFHEEEKNYTERVHSLKRQKEKLEEKIMEHYKKSETTVHKK------KPFASMLVRRVK 1140
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 Frog  1348 SMETKEQYHEEQKQYIDKLHDLRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPTPKKKSHWSGAKAFAKLI--KPK 1410

  Fly  1141 KASSDLMNKVPSRNRRSWVDDARTNSQFVIGSESGGN--ESDNSNEEPLSIASD----THLLQRN 1199
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 Frog  1411 KEPSRESVKSPTDVHSQPMDNAE-----MVASPSSMRPLRFQQENLDSSSLGSDEKGSPKVLSSK 1470

  Fly  1200 VPLRQSLQRDLLDNSIQRGGAVRSSLQAQKRTD----LNNSRR----------NSVHGSLEAPDV 1250
            | |.:..||.  :....|||::       ::||    |:.|||          .::|  |.||..
 Frog  1471 V-LVEVAQRQ--NRMSYRGGSI-------EQTDGLEHLSRSRRMESGSRASSTTAIH--LTAPAH 1523

  Fly  1251 TGSSLTL-GTAGSRRTVYLIDEHQKLPD--GSTPGATQSQSVGGSGSVNAAPPTPAEPQTPQKST 1312
            ...:|.| .|.|......|.|:.|:...  ||:.....|...|...:..::.|...:.:....|:
 Frog  1524 NAKALHLPRTKGCNSDDNLSDQLQEAESHTGSSRVPWTSSLEGSRSASQSSSPLTLKGRPESLSS 1588

  Fly  1313 ENNAPVGPATFLMYN--RINTTIGGASNSGDQSPL 1345
            |:..|......|..|  |.|..:.||:.| .:||:
 Frog  1589 EDMIPTKEIATLPSNLYRPNAVMPGATKS-RESPV 1622

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	57/157 (36%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	267/1069 (25%)
ccdc88c	XP_002933247.3	HkD_SF	12..164	CDD:425405	57/157 (36%)
		SMC_prok_B	<247..>880	CDD:274008	171/637 (27%)
		SMC_prok_B	688..1376	CDD:274008	156/696 (22%)