Protein Alignment Girdin and hook1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647780.1
• Gene: Girdin / 38385
• FlyBaseID: FBgn0283724
• Length: 1381
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_012815933.1
• Gene: hook1 / 100125063
• XenbaseID: XB-GENE-975863
• Length: 717
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 765
• Identity: 170/765 - (22%)
• Similarity: 324/765 - (42%)
• Gaps: 175/765 - (22%)

  Fly    19 SIISWLES------CLPRAELLAGYTSLLDGHIIHSV--------WLQIDPEPQNNPSELNDLNG 69
            |:|.||::      |....:|..|...   ..|:|.:        ||          |.:.|..|
 Frog    11 SLIIWLQTFNTAAPCQTIQDLTNGVAM---AQILHEIDYTWFDVSWL----------SRIKDDVG 62

  Fly    70 KSLSIARAKNFECVVRNLKSFFEEELGQTIL--VLPDAFTLGHHPESKNGLEQMKTLLTLLLGAA 132
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 Frog    63 DNKRI-KIHNLKKILQGIVDYYREFLDQHILEFLLPNLNLIADHSDA----TEMGRLLQLILGCA 122

  Fly   133 VQCPNKELFIARIKELDLETQHAIVGLIKQVTDSHSLVLTEDSLERLT---PQSMYTHILRLTKE 194
            |.|..|:..|..|..|:...||.::..|::       ::::|:|:..|   |..:.:.:.|.
 Frog   123 VNCEKKQEHIQVIMTLEESVQHVVMTAIQE-------LMSKDTLDSPTSDLPGDLESQLRRT--- 177

  Fly   195 RDVMYLKWIDLACVETEMTASDNLVECGQ---GVSVTRSPSNGTATSTPSSSSNSESNHLAVECA 256
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 Frog   178 --------ID-ALHEAQAEQEELKQRCEELDLQVAALQDERNCLIAET--ELQNERLNQL--DTF 229

  Fly   257 D-----LRSKNRKLRQELEEKSENLLELREELDDKKARFDKLRQ---ESQ----EWFTEAKRASA 309
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 Frog   230 DEPSIMVSKKYSQMQMQLEQMKEDNYRLEAAKEDYRIHCEELEKQLVETQNRNVELASLAEESRA 294

  Fly   310 YRDEVDILRERAERADRLEVEVQKYREKLGDSDFYKSRVEELREDNRVLLESKEMLEE------- 367
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 Frog   295 LKDEIDILRATADKASKLESTVETYRRKLEDLADLRRQVKSLEDTNLVYMHNTVSLEEDLKKANA 359

  Fly   368 ---QLQRYRKRSE---HAISLESEIIKYKQKINDMALERDVDRSKLEELLEENSQLQLVARNLNS 426
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 Frog   360 ARVQLESYKRQVQELHNKLSLES------KRADTLAYEMKRLQEKEDALLKEKERLLVQCTTLKE 418

  Fly   427 TMD------LDKSFSENEDDCNSGDNSLSEQLTNNAQTRALKLELENRRLTAALEQLKESSFHES 485
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 Frog   419 TNEELRCSMIQQDHLNLSDGVKNVDNLAAELLPAEYREMFIRLHHENKMLRL---QQEGSENQKI 480

  Fly   486 TSKMLELEKEKKKLS-LKIEQMQENINRLTQQNVELEGVFKNALEENKKLQDAVDNRQKSYDRQS 549
            |....:||::::|:| |:.|      |||..:.||             :||..|.:.||:...:.
 Frog   481 TDLQTQLEEKQRKMSELETE------NRLNTERVE-------------ELQLQVGDLQKTLQNEG 526

  Fly   550 LER------------EADRQKLSDAEQHVET-----------LNKEKQRIQTLNESIQRRADDLE 591
            .|.            ||..:||.:..:.:||           :|:..|||:.|..::|::.:|::
 Frog   527 TEAETVGSSTLKKTIEAQMEKLKEVHEAIETKRELLEDLQPDVNQNTQRIEELEAALQKKDEDMK 591

  Fly   592 RLAESKTKELEQYLEKSRQYELTKQKLYEIEARVSTYERENASLLKEVSKLKEGSEQKSVQLDDS 656
            .:.:    ..:.||||:      |..:..::.:::....|...|.|::::     :.|.::|.:|
 Frog   592 AMED----RYKVYLEKA------KNVIKTLDPKLNPASAEIMLLRKQLTE-----KDKKIELLES 641

  Fly   657 INRLDVQSKELQKLGKALEDSEQVHQKLVELEKQNQELASQRIIDQEMIS 706
                :.|..:|:          :..:||:.....|:.||.|::..:..:|
 Frog   642 ----ECQQAKLR----------EYEEKLIVTAWYNKSLAHQKLAMESRLS 677

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Girdin	NP_647780.1	HkD_HkRP	15..165	CDD:411794	40/161 (25%)
		SMC_prok_B	315..1110	CDD:274008	99/435 (23%)
hook1	XP_012815933.1	HkD_Hook1	8..157	CDD:411796	40/170 (24%)
		HOOK	181..707	CDD:461694	122/558 (22%)