Protein Alignment promL and prom

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_647770.1
• Gene: promL / 38372
• FlyBaseID: FBgn0026189
• Length: 1013
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001137754.1
• Gene: prom / 246493
• FlyBaseID: FBgn0259210
• Length: 1235
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1069
• Identity: 220/1069 - (20%)
• Similarity: 367/1069 - (34%)
• Gaps: 239/1069 - (22%)

  Fly    33 AYLAICGLSVAIFGFALATLIRPTTAQADADPGSWRKGYVGHGTTHEQLGQPHWPPVQYTVYRPT 97
            |...|...|.|......|:|..|||:   |..||    .:...||....     ||..    .|.
  Fly    12 AATTIMSSSSAAMSAGFASLGGPTTS---ALTGS----TIALATTTTTA-----PPTT----TPA 60

  Fly    98 TNYTKAPPPPTSAMNPIFNFTHFLYDKVLYRDEPIPEGYI---VVKNSDTLSLGP---KVEENDW 156
            |.:|.:.|....|..| |.||:......|...|.:|...|   :.||:..|....   |:|..
  Fly    61 TFFTYSIPGMDIAPGP-FIFTYVSEFLSLITPEELPLDSIRDVLHKNTSLLDFASNAIKIESG-- 122

  Fly   157 RDLLAHYWMVLIWVVILVVLIIVIPFIAVCYCCFCCCRRCRQ------GCPPCTSKQDAQ----- 210
                      .|.::.:..::.::|.||.  |.:||.||..|      ...||..:.::.
  Fly   123 ----------FIALMSVFAILALVPLIAT--CAWCCGRRSTQEEVDHIRNAPCHIRDESLEESLR 175

  Fly   211 -RRFCCGICLLILIIGLIFGIIIAFVTNKMIDSGFAETSETMKRGSEDTCTYLKDV-------AD 267
             |:....:.|.::.|.|.......|..|..:.:|...|.|.:|....|...:|||.       .|
  Fly   176 CRKSAGLVTLWVVFILLTLSDFSIFYANSRLSAGIEMTPEMVKSAVHDVEVFLKDTHLQIKQKLD 240

  Fly   268 HVHHL----MMYNYEEMETHVLDQLTHAH--RHIFLDLS-DTSESNSLAEME---RVL---ENMP 319
            :..|:    ::.:.|:::. :|.:...|.  .|..|:|: |:..:.|||..|   |||   |.:.
  Fly   241 NGFHVSVERVVKDLEDVDV-LLGEPIQAEISAHTGLELAYDSLTTLSLANAELIYRVLMLQETVG 304

  Fly   320 EALELMRQVEKMEKDLRFYGSQLRDGVRGIKRDVNFAVANLCQLQMCQKFL---ISSNIEHIDSS 381
            .||:|.::.....::|:...|.|       :|...:....||.....:.|.   :...::.:...
  Fly   305 RALKLSQEAAARMEELQIQLSVL-------QRQCTYRDRPLCDTLRIRSFEENGVVDALKTLQED 362

  Fly   382 QCLHFDNLPNTKEFVEGMENIVASEYYAIPQRGLSR--LKKVSDKVKTQLSFVVPPMMRDLTKGR 444
            |.:.........||...::|:.:       :.|:||  ......:||...::.....:..|...|
  Fly   363 QSIFRMRYLGEIEFGATVKNLTS-------EVGVSRSIFSNFPQQVKHDTAYERNYTLEQLASIR 420

  Fly   445 TIFREHATNVRNIVEGVLSDIHIKTLHST-----------KSFEDVYERFGHDRNVVSLIVCLLI 498
            .....:|..:.:.|.|:|     :.|..|           |.:.|.|...|.....|
  Fly   421 HRTTANAQQLTSTVNGLL-----RRLEDTWSSLQPAYNELKEWADAYWSVGWIAGTV-------- 472

  Fly   499 LLVLFILIFALL--CGCFGRRRTGYGDECCSKSTGATCLLLAILLIFCVFSF-IALVGLFYFMLG 560
              ::::::|.|:  | ||         .|.|.:.......:|::|| |:.|. :.:.|:|...:|
  Fly   473 --IVWVMLFMLMSYC-CF---------LCESNAKSGVVFFIAVMLI-CLASICLTIFGVFSLAVG 524

  Fly   561 MVTYQGACAPLRDQENNTLFRQLD-----------ASIDLNHYLPPSESNKEVVQPLKMSSAIKA 614
            .......|..|.|::.|.|.:.||           ..| :...|.|...|:.||. :.:..|::.
  Fly   525 GNAEVFVCRSLYDEDYNMLGKLLDKPGYAYAREPQTGI-IGELLRPVGVNRSVVN-VGLGQALRG 587

  Fly   615 CHANQ---TIFDMMRQHNIYDINDLTRIKVMSHSQENTDSIKVFDEDLSTVVLLTKEERDELKTA 676
            |..||   .:|.:....|...|.||.:...:|.:   .|:|.|....|.::....:...|.:...
  Fly   588 CEQNQASYNVFQLDAFVNTSKIADLRQFPKVSTA---IDAISVSGRTLLSLTQSVQNILDNMLQT 649

  Fly   677 GESKLAKYHSSLYMPS----LCTQFTPMNLNALSEQLYKLSNDLEYPAYG------WAKVSFWNE 731
            ....|..|.||:..|:    |.|....|...||  |:..::........|      .|.:....|
  Fly   650 SSFNLTTYRSSVGAPTPEKDLATFIDQMQRVAL--QIQDVATSSRMTTLGSRSKRLQASILQPLE 712

  Fly   732 GLNTKAFYRNFVPKLTSLVEKMKANLKKIDELISYENHDFTNTIKILTATAIN-SEQFIQTRGKD 795
            .|..:..|.     ||:|..:.....|::::.:   ||     :|.:.:...| :.:......:|
  Fly   713 NLQNEILYH-----LTALELQRDPWAKQVNQTL---NH-----LKSIQSYLENKAGEICHNMTRD 764

  Fly   796 YINALGGNLTNSIDQMIDDYIDMIIKEANESVGHCAPLSYIYYRGVDLICHRIVDPINGFWVGIL 860
            |.:.|...||.|...|.....|...|        |.|....:......:|..:||.|||....|.
  Fly   765 YRDRLKAYLTTSKATMESQLGDTTTK--------CRPFYDTFDASRTFLCRNMVDFINGLTFFIF 821

  Fly   861 LCALLF-------LPILFVAHRLMCLYKKIYPYLATVGAAGVVEGGSDYLYDAYSERDREHVPLA 918
            |..||:       |.::.|..||..:
  Fly   822 LTLLLWAIGTPVGLNLITVQTRLNVM--------------------------------------- 847

  Fly   919 NVPKKRRKAYERRREQQDYFEDASPSVSRGNRSGGDRGGGGGDGAPGSSSMRYNDMAPTHWDHEP 983
            ...:.|.|...||.::....|..|.|..|..:........|..|....|  |....:.|.....|
  Fly   848 QAAQARSKGRHRRSDRSPEHEQRSGSRGRKKQRTSSSATSGRSGKRDQS--RERSTSSTARPKPP 910

  Fly   984 PR---------YHNPPAAPPSSEYERPPP 1003
            .|         ..:..:.|...:.::|||
  Fly   911 LRRTATEETLDLADEESTPSRQQQQQPPP 939

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
promL	NP_647770.1	Prominin	76..881	CDD:461660	189/893 (21%)
prom	NP_001137754.1	Prominin	73..826	CDD:461660	175/836 (21%)
		PRK12678	848..>1009	CDD:237171	19/94 (20%)
		U2AF_lg	944..>1034	CDD:273727