DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Atg2 and Atg2a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647748.1 Gene:Atg2 / 38344 FlyBaseID:FBgn0044452 Length:1906 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001103015.1 Gene:Atg2a / 689688 RGDID:1589890 Length:1916 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2108 Identity:618/2108 - (29%)
Similarity:954/2108 - (45%) Gaps:405/2108 - (19%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 WFNPWDG-LKTKMCRYLLQRYLGQFFENNLNLEQLKVDLYNGKAVVEDIFLKVNAFNDLFEDQGW 66
            |..||.. :|.::||||||.|||.||:.:|:|:||.:|||.|..|:.||.|:..:.|::......
  Rat     4 WLWPWSNCVKERVCRYLLQHYLGHFFQEHLSLDQLSLDLYKGSVVLRDIHLETWSVNEVLRSMES 68

  Fly    67 AFEVVSGHIGRLTVVVPWNALMTNDSSLEIHNLTITLRPVTRYQSGTTMLESM-WSS-VSSSMQM 129
            ..|:|.|.:..:.|.|||.||:|:..::.:..|.:.|:|  |..||....:|. |:| :::|:|:
  Rat    69 PLELVEGFVSSIEVAVPWAALLTDHCTVCVSGLQLILQP--RQGSGPEAADSQTWASCMTTSLQL 131

  Fly   130 AEECMKQ---VDDDVPFLNHNNALIGLEKFAETIDNVLNRIRAKLTNTTLNIEYILPRSDRKLVL 191
            |:||:::   ...:.|     ..|.|||.||:||:.||.||:....||.:.:|:.|...:|.:.:
  Rat   132 AQECLREGLPEPSEPP-----QPLEGLEMFAQTIETVLRRIKVTFLNTVVRVEHSLGDEERSVAV 191

  Fly   192 SFQASHVEYKNKTGYEMPMSTSQDTETEEDPNSSFNALPMIAKHN--------LVIEGLSLHTSE 248
            ..:...:||.:              |...||:.:    |.:..|.        |.:.|:.|:..|
  Rat   192 EVRVQRLEYCD--------------EAVRDPSQA----PPVDVHQPPAFLHKLLQLTGVCLYFEE 238

  Fly   249 VLDVMDHQFGPTPYEQLCKIVELKGAQNIQINIKQTENIVGPKVSLELSLDDIYFMLTPRQIHLL 313
            :...:|      |.:...:|....|...:.:.:||.|...|||:.:...|..::.:|||||:..|
  Rat   239 LPSQVD------PPKPPLQIGSCTGYMELMVKLKQNEAFPGPKLEVSGQLGSLHLLLTPRQLQQL 297

  Fly   314 IEFSKGFNC---GGQQERPKKGRSL-----------------KSAPPSEYQMHSLQQPTRMT--- 355
            .:.....|.   ||..::..|.|.|                 ..|......:|.:..|..:.   
  Rat   298 QKLLSAINLADPGGLADKLNKSRPLGAEDLWLIEQDLNQQLQAGAVAESLSLHPITSPLNLDSAD 362

  Fly   356 ---GILGQNADWCTGMSEADPSEYSV-YGNPPRSGYARSRKMSESTNSMVTSCTNTLQQELGYTE 416
               .:.|..:...:|:||.  |.||| .|:...|..|..|..:.:.:...|:.|..|.     |.
  Rat   363 LFFSMAGLTSSVTSGVSEL--SVYSVDLGSSVHSNMALHRPSTPTHSGGKTAPTPLLD-----TM 420

  Fly   417 KSGEILKFKVQISKIYGIALHQDILIQNTANIDSCSTVFDHASYLRYSDTASGFFLGTLLENHIP 481
            :...::|.     .:.|::|   .|:| ||:..|.|           .|..:.||.........|
  Rat   421 RPDSLVKM-----TLGGLSL---TLLQ-TASPSSGS-----------PDLTTHFFAEFDAAKDGP 465

  Fly   482 LQNQQYLLL-----RAAP---IIVSGSQQRYFQELT----SRTTLSATAVDL--IEVLD------ 526
            ..::.:..|     ||.|   :.::|:..:...||.    ||.| |:|.|..  :|||:      
  Rat   466 FGSRDFYHLRPRFQRACPCSHVRLTGTAVQLSWELRTGGHSRRT-SSTEVHFGQLEVLECLWPRA 529

  Fly   527 -NSKEH--LLQFD-------RQRNCPDGYHIRPEIVLTQSSSFMFKQNHNR-----CSNKIECSL 576
             :..|:  :|.|.       ..|.|.   |:|.    ||:...:.|....|     |.:::...|
  Rat   530 ASEPEYTEILSFPSYSGSEASARPCA---HLRH----TQTFRRVLKSRSRRSTACHCHSELSLDL 587

  Fly   577 DECTAELDISIYDRLGALF-----GSSPFSGDSASSTPYPDDPNQTEFVVKSENLRLHLRFPVVD 636
            .:..|::::...|||..|.     .|.|.:|  ..:.|......||.|.:.:....|.||||:.|
  Rat   588 ADFQADVELGSLDRLAVLLRQITTPSEPPAG--LLTEPPQATEQQTVFRLSAPRATLRLRFPIPD 650

  Fly   637 GRAANDPLKIPWWKKNVRRDFLAVE-----FRSLVVS-----SRSQISIVSDELDVFYCDADKQS 691
            .|...|    ||..:.||.:.|.:|     |||.:.|     :.:::.:...:|...|.|.:| .
  Rat   651 LRPERD----PWAGQAVRTEQLRLELSEPQFRSELNSGPGPPAPTRLELTCLDLQGIYEDGEK-P 710

  Fly   692 AVHLLKCQQKMQPNKK-----IQIDVLQLKDTSDG------QKKAR----------------KSP 729
            .|..|:..:.:.|...     :...|:.|...|.|      .:|.|                .||
  Rat   711 PVPCLRVSKALDPRSTEAKYFLPQVVVTLNPQSSGTQWETASEKGRDLELSTESPCELQQPEPSP 775

  Fly   730 FSSKCTFGYTSHVEGLDGSVDKTDSLLPGETEEINEFCDSCTQSSKLKIFAFIPHVKVVLESKSM 794
            ||||.|...|.            :.::||:.||:..|.:.....|:..:...:|...:.|.||.:
  Rat   776 FSSKRTMYETE------------EMVIPGDPEEMRAFQNRTLALSRCTLDVIMPSAHIFLPSKEV 828

  Fly   795 YELIYNRLNGDLFMWEPRSPHYDISPDNEVPESKDLYAEPQLEEFR----RNLLLSTSAMESSIY 855
            ||.||||:|.||.||||.    |:     :|.|......|....|:    ...|.|.|..|.:.:
  Rat   829 YESIYNRINNDLLMWEPA----DL-----LPTSTTAARPPGSSGFKMCKSAFKLDSDSDEEDTQF 884

  Fly   856 FSMAEPTASAP-PAPPVRNEAFSFELFVE--QGTLILFSHLLDPETNQR-SKECGKFQVNLKELR 916
            ||||......| |.|..|....:|...|.  :|.:.......| ||.:| ....|:..:::::..
  Rat   885 FSMASGAPQTPAPEPSHRQSQSTFSTLVTVLKGRITALCEAKD-ETGKRLDATHGELVLDVEQGT 948

  Fly   917 LFTVNGLDNDSTRSFFSIQLGEIDALHCGNTLQD------LELAWSDLADEKLLPTIYNFASVHQ 975
            :|:|..........:|.:: .|...|:....::|      ||:. |.....:|.||||  .|...
  Rat   949 IFSVAQYRGQPGLGYFCLE-AEKATLYHRAAIEDYLLPTHLEVP-SFAPPAQLAPTIY--PSEEG 1009

  Fly   976 QQDRKRM-------EVLSLVAEIKKQPEQRIKRMKMSFGICGAILQHHSCHSEHSWLNQLIDFMD 1033
            ..:|..:       .:||....|...|.:.:|...::..:..|.|:|:....|.||.:||:||:|
  Rat  1010 VTERGTLGRKSQGPPMLSAAVRIHLDPHKNVKEFLVTIRLHKATLRHYMAPPEQSWHSQLLDFLD 1074

  Fly  1034 VADFPIEEYEPFALVSELQLHVWNAGIDYRPKFFPQRAFLDLGYCTLSSNIISSMSGCTLRLLAE 1098
            |.|.|:..|.|..:::.|..|:::..:||||.:.|.|..:.....||||||:...|...||.:.:
  Rat  1075 VLDDPVLGYLPPTVITILHTHLFSCAVDYRPLYLPVRVLITAETFTLSSNIVMDTSTFLLRFILD 1139

  Fly  1099 DCVLQLGLVKEESNDSL----IPVLNLGLLNI---SFRLNAEGS-GQPRVDLRSSIHDMHLKTCY 1155
            |..|.|....|..|..|    :.||::.||.:   :::.:.||. .||..:||.|.:.:|:.:|.
  Rat  1140 DSALYLSDKCEVENLDLRRDYVCVLDIDLLELVIKTWKGSTEGRLSQPLFELRCSNNVVHVHSCA 1204

  Fly  1156 DSAAALAQLIAYVANDRDLCPPEEPILNEDTKPAEPKPNE--EHEMSDHTQNHVSKL-------- 1210
            ||.|.|..|:.||.:..||.||.:|          |.|.|  ..::|:...:..|.|        
  Rat  1205 DSCALLVNLLQYVTSSGDLHPPPQP----------PSPTEIAGQKLSESPASLPSCLPVETALIN 1259

  Fly  1211 ---MADAVIDVESSPNLRAMKSPGG---REEGIEIFYFPDEPKEKRKSTSAKLQTKSLMVESPSV 1269
               :.||::|.|........:|.||   :...:.::.||.|    |....|.|         |..
  Rat  1260 QRDLTDALLDTERRSLRELAQSSGGPLPQASPVSVYLFPGE----RSGAQAPL---------PPP 1311

  Fly  1270 IGDILDFESNVILQSYYHQSQVQPQTSLGSQVQQELGSLGNASLEERDFDIIHDEEISRMDKFG- 1333
            .|                     |..:|||..:.:    .:...||.|.|.:..:|...:|..| 
  Rat  1312 GG---------------------PSHTLGSCSEAK----EHDKEEEGDGDTLDSDEFCILDAPGL 1351

  Fly  1334 ----------VKQIYISEDPLQIVDNHFELPHEKVDLLRPPSNFPVAESTYTLCEMTFTWHLYGG 1388
                      |.|::  ..|:.:.|.||..|....||||.|::|||..|...|.|::|.||||||
  Rat  1352 GIAPRDGEPIVTQLH--PGPIVVHDGHFSQPLGSTDLLRAPAHFPVPSSRVVLREVSFIWHLYGG 1414

  Fly  1389 RDFPDEPLKKSSSSATSGFGMSDTYKYGVSQAQEQDKQDKKGSKKGLLKQPKGSQRNL------- 1446
            ||                ||:..||:..|..|..:....:....    .:|:.|.|..       
  Rat  1415 RD----------------FGLHPTYRARVGLAGPRVSPSRSSGP----NRPQNSWRTQGGIGRQH 1459

  Fly  1447 EVLVEMQLSKIRFSYETYPLTSMYS------------SRQVLLVSEIEIRDRLRSSDINKFLYHP 1499
            :||:|:||||:.|.:|.||..|..:            |||||:|.|:||||||.:|.|||||:..
  Rat  1460 QVLMEIQLSKVSFQHEVYPEESAIAGGLDQELDERPLSRQVLIVQELEIRDRLATSKINKFLHLH 1524

  Fly  1500 TGNNLSHKPDENMVIVKALNVRPNPQKSSAEECSLRVSILPIKLNIDQDTLLFLEDFFSGMFRNS 1564
            |...|..:...||:.:|||:|.|. ......||.||||::|::||:|||.|.||:|||:     |
  Rat  1525 TSERLPRRTHSNMLTIKALHVAPT-GSVGGPECCLRVSMMPLRLNVDQDALFFLKDFFT-----S 1583

  Fly  1565 ASAAGGTKTEGSSSSATDMPVMSVSKMPEELSDKLPDSEVKEMVERNLNVLIEENSLDVELEEDP 1629
            .:|:......|.:..|            ...:...|.|..            |..|...|....|
  Rat  1584 LAASINPMVPGDTFEA------------HRETHSRPSSPQ------------EGQSEGTETASSP 1624

  Fly  1630 ATAP----------PVFFREVIFSPALPICFDYHGRRIELSR-GPVTGLIMGLAQLQGSGINLRE 1683
            ..||          |::|||..|:..:|||.||||:.:.:.: |...||::|||||..|.:.|:.
  Rat  1625 QEAPGSSHSSSDQQPIYFREFRFTSEVPICLDYHGKHVTVDQVGTFMGLLIGLAQLNCSELKLKR 1689

  Fly  1684 IVNRRGILGWNKLCEFLAKEWLKDIKRNQLPNILSGIGPTNAVLQLFQGIYDLFRLPIEQYNKDG 1748
            :..|.|:||.:|:..:...|||:||::||||.:|.|:||.::|:|||||..||..||||||.|||
  Rat  1690 LCCRHGLLGVDKVLGYALNEWLQDIRKNQLPGLLGGVGPMHSVVQLFQGFRDLLWLPIEQYRKDG 1754

  Fly  1749 RIIRGFQLGAQSFTARTALAALEITSRIIHLLQFTAETTFDMLS-AGPSMKKRKGGRQGKRRRQG 1812
            |:|||.|.||.||.:.||.||||:::|::..:|.||||.:|:|| |.|..:..:..|..::.|:|
  Rat  1755 RLIRGLQRGAASFGSSTASAALELSNRLVQAIQATAETVYDILSPASPISRSLQDKRSSRKLRRG 1819

  Fly  1813 -RPKDLREGVANAYTIVREGINESANTLIEAAITEHDQKGYSGAVGAVVRQIPQLVVCPAVLATQ 1876
             :|.|||||:|.||..|||||.::|.|:.:.|...|:|||.:||||.|:||:|..||.|.::||:
  Rat  1820 QQPADLREGMAKAYDAVREGILDTAQTICDVASRGHEQKGLTGAVGGVIRQLPPTVVKPIIVATE 1884

  Fly  1877 ATTNILGGAKSSLIPEAKLEARDKWKQE 1904
            ||:|:|||.::.::|:|..:...||:.|
  Rat  1885 ATSNVLGGMRNQILPDAHKDHALKWRLE 1912

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Atg2NP_647748.1 Chorein_N 13..117 CDD:463646 40/103 (39%)
ATG2_CAD <1116..1185 CDD:433120 25/72 (35%)
ATG_C 1814..1902 CDD:462761 43/87 (49%)
Atg2aNP_001103015.1 Chorein_N 14..111 CDD:463646 38/98 (39%)
MRS6 43..>244 CDD:227376 60/225 (27%)
ATG_C 1817..1910 CDD:462761 45/92 (49%)

Return to query results.
Submit another query.