DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment dre4 and supt16h

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_476610.2 Gene:dre4 / 38248 FlyBaseID:FBgn0002183 Length:1122 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001362206.1 Gene:supt16h / 549984 XenbaseID:XB-GENE-979305 Length:1035 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1041 Identity:627/1041 - (60%)
Similarity:801/1041 - (76%) Gaps:19/1041 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 LDKEAFVRRVKRLYTEWRAPSIGHDDALRNLDCIMSIVGVEEDVMYSKSMALQLWLLGYELTDTI 70
            |||||:.||:||.|..|:.    .:|...|:|.|:..|||:|:::|:||.|||.||.||||||||
 Frog     5 LDKEAYYRRIKRFYGNWKK----GEDEFANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTI 65

  Fly    71 SVFCSDAVYFLTSKKKIEFLKQTQNI----TEEGFPEINLLVRDR-TDKDQGNFEKLIKALQNSK 130
            .|||.:.:.|:.||||:|||||..|.    ...|.|.|.||||:: .:.::.||||:|:|::.||
 Frog    66 MVFCEEKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGTPAITLLVREKQNEANKANFEKVIEAIKGSK 130

  Fly   131 KGKRLGVFAKDAYPGEFSEAWKKSLTASKFEHVDISTIIAYLMCPKDESEINNIRKASLVSMDIF 195
            |||.:|||.||.:||::.::|..:|....|:.||||..:||.:..|::.|:|.::||:.::.|:|
 Frog   131 KGKYIGVFIKDKFPGDYMKSWYDTLNKEGFDKVDISASLAYTIAVKEDGELNLMKKAATITSDVF 195

  Fly   196 NKYLKDEIMDIIDSDRKVKHNKLSDGCEAAIGEKKYTSGLDPRLLDMAYPPIIQSGGAYSLKFSA 260
            :|:.||.:|:|:|:|.||:|:||::..|.||.:|||..|.||..::|.|||||||||.|:||||.
 Frog   196 SKFFKDRVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEDKKYLGGTDPSTIEMCYPPIIQSGGNYNLKFSV 260

  Fly   261 VADKNPLHFGVIVCSLGARYKSYCSNISRTFLVNPTEAMQENYTFLVSVQEEILKLLVPGTKLCD 325
            |:|||.:|||.|.|::|.||||||||:.||.:|:||:.||:||.||:.:|||:||.|..|.|:||
 Frog   261 VSDKNHMHFGAITCAMGIRYKSYCSNLVRTLMVDPTQEMQDNYNFLLQLQEELLKELKHGAKICD 325

  Fly   326 VYEKTLDFVKKEKPSMVDNLPKSFGFAMGLEFRENSIVIGPKCQALLKKNMVFNLHVGISNLTNP 390
            .|...:|.|||:||.::..:.|:.|||||:||||.|:||..|.|..|||.|||::|:|:|.|.|.
 Frog   326 AYHIIMDQVKKQKPDLLSKITKNLGFAMGIEFREGSLVINNKNQYKLKKGMVFSVHLGLSELNNK 390

  Fly   391 EATDKEGKNYALFIGDTVLVGEQSPASVMTPSKKKIKNVGIFIKDDSDEEDVDDKKTAKEDQGTE 455
            .....|.|.||||:||||||.|:..|:|:|..|||:||||||:|.:.|||:.:||     |:..:
 Frog   391 AGKKPEEKTYALFVGDTVLVNEEGAATVLTHVKKKVKNVGIFLKKEDDEEEEEDK-----DEAQD 450

  Fly   456 ILGRSKRN-AVLESKLRNEINTEEKRKEHQRELAQQLNERAKDRLARQGNSKEVEKVRKNTVSYK 519
            ||||..|: |:|..:.|||:..||||:.||:|||.|||:.||.||..|...::..|.||:.||||
 Frog   451 ILGRGARSAALLTERTRNEMTAEEKRRTHQKELATQLNDEAKRRLTEQKGEQQTLKARKSNVSYK 515

  Fly   520 SISQMPREPEVKELKLYVDKKYETVIMPVFGIQVPFHISTIKNISQSVEGEYTYLRINFFHPGAT 584
            :.||||:|.|::|:|:|:||||||||||||||..||||:||||||.||||:|||||||||.||:.
 Frog   516 NASQMPKESEIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFFCPGSA 580

  Fly   585 MGRNEGGLYPQPEATFVKEVTYRSSNVKEHGEVGAPSANLNNAFRLIKEVQKRFKTREAEEREKE 649
            :|||||.::|.||||||||:|||:||||..|:...||.||.||||:|||||||:|||||||:|||
 Frog   581 LGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNVKTPGDPSVPSLNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKE 645

  Fly   650 DLVKQDTLILSQNKGNPKLKDLYIRPNIVTKRMTGSLEAHSNGFRYISVRGDKVDILYNNIKSAF 714
            .:||||:|:::.|:.|||||||||||||..|||.||||||.||||:.|||||||||||||||.|.
 Frog   646 GIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHAI 710

  Fly   715 FQPCDGEMIILLHFHLKYAIMFGKKKHVDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLAAEQAERELR 779
            ||||||||||:||||||.|||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||.|||.|||:|
 Frog   711 FQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQLEREMR 775

  Fly   780 HKLKTAFKSFCEKVETMTKSVVEFDTPFRELGFPGAPFRSTVTLQPTSGSLVNLTEWPPFVITLD 844
            ||||||||:|.||||::||..:||:.|||:|||.|||:|||..|||||.:|||.|||||||:|||
 Frog   776 HKLKTAFKNFIEKVESLTKEDLEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNTTEWPPFVVTLD 840

  Fly   845 DVELVHFERVQFHLRNFDMIFVFKEYNKKVAMVNAIPMNMLDHVKEWLNSCDIRYSEGVQSLNWQ 909
            :|||||||||||||:||||:.|:|||.|||.|:||||:..||.:|||||||||:|:||||||||.
 Frog   841 EVELVHFERVQFHLKNFDMVIVYKEYGKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDIKYTEGVQSLNWT 905

  Fly   910 KIMKTITDDPEGFFEQGGWTFLDPE-SGSEGENETAESE-EDEAYNPTDAE-SDEESDEDSEYSE 971
            ||||||.||||||||||||:||:|| .||..|...:||| |||.:||::.| .:||.|.|.:||:
 Frog   906 KIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSGAEEGESESEMEDETFNPSEDEYEEEEEDSDEDYSD 970

  Fly   972 ASEDSEESDEDLGSDEESGKDWSDLEREAAEEDRNHDYAADDKPRNGKFDSKKHGKSSKHSRRDR 1036
            .:|:|..|:|.||:||||||||.:||.||.:.||...|..:::.:.|| ..|.|..:...|::.:
 Frog   971 ETEESVGSEESLGTDEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQKGGK-KRKVHAPAPNPSKKRK 1034

  Fly  1037 E 1037
            :
 Frog  1035 K 1035

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
dre4NP_476610.2 COG5406 1..1005 CDD:227693 619/1007 (61%)
supt16hNP_001362206.1 COG5406 5..1021 CDD:227693 624/1025 (61%)

Return to query results.
Submit another query.