DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc62B and Dnah17

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_995958.2 Gene:Dhc62B / 38226 FlyBaseID:FBgn0013811 Length:3964 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943439.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4160 Identity:1242/4160 - (29%)
Similarity:2019/4160 - (48%) Gaps:538/4160 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    57 VARQ-QWQPEPDMRLLPQSHYEDNLRREVRKIVVPPMLRRTEAKILSFASERLKNKYPELVQAYM 120
            ||.| :|..|...||.....|        .|.:..|::...|||:                   :
  Rat   582 VAGQLKWSLELQERLEVSMKY--------LKHIDHPVMSSVEAKL-------------------V 619

  Fly   121 HDVHEEFNRLMKVYSMKNILRHPEFSDEDPAQFELPRP-----------DIGFRRP----GRTQN 170
            :|.::|...|:|.|..|...:..|..|:| ..|.|.:|           .:.|.:.    .|...
  Rat   620 YDKYDEMIGLLKGYREKKYQQWVEGVDQD-CHFNLGQPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLREVK 683

  Fly   171 YSNFLENRR--RIAQKLLILQLPLRAILNISVGELPKLACIFNYVLATGAMQQQLGLGGREALSY 233
            |.||.:.:.  ..|:||    .....|....||.|..:...:|.:..| .|:.:..|        
  Rat   684 YLNFQQQKEIPSSAEKL----FSENEIFRKFVGNLELIVGWYNEIKTT-VMEVEFPL-------- 735

  Fly   234 KFYHKYIQNQLDKVN-------TFLRWTW--YPKIVQVLRKL---MRKRV-----------MPMS 275
                  |:::|::::       |.|.|..  ..:.:|.:|::   ::.|:           ..|.
  Rat   736 ------IKSELEEIDVKLMSAETTLFWNGENVMEYIQEMREILHNLQNRIQKTKQNIEGITQAMQ 794

  Fly   276 TW------KRSWNAMEALMNREMTNMKIRTFEEMYRMCSHP--RTMPMMRMSLEWSEFSSDLDTR 332
            .|      :|..|..|||::   .:.::....:.|......  |...|:..:.|.  |.:|..::
  Rat   795 EWSANPLFERKDNKKEALLD---LDGRVANLNKRYAAVKDAGVRIQAMVTENAEL--FKADTTSQ 854

  Fly   333 PNAWS---------ILRTF------------------------AEIATEISMVGYRMEP------ 358
            |  |.         :|..|                        .||..|:...|....|      
  Rat   855 P--WKDYVNYIDAMVLDEFDRFIRKSLNYLMDNMTMDENIAPLFEIRMELDEDGLTFNPTLEMGD 917

  Fly   359 -------LQPQVQTLTSMA------AYAKVNDYLKIEMNDNFLKDVI---DKVQNIILRTYQEVI 407
                   ::..:..|.::|      |..::|  .|.::.|  :.|:|   :::.::::...:...
  Rat   918 EDSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRLAKGRIN--YKSDLED--ITDLIEMREELSSLVIGAMKVAE 978

  Fly   408 QYVEGFRDKYYALYSWQERDALNQFLSE---------PHEFE---------------EYFARIDM 448
            :|.:.| ::|  .|.|.  |.|.:|:..         |.|.:               ::..:||.
  Rat   979 EYQDSF-ERY--SYLWV--DDLQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTKIDDTIPKTQPTLAQFQQQIDS 1038

  Fly   449 YYGFIQMLRSEPATEYF--------------VMAVIHNEPAIFGLRTLAENLIHEITTI-----I 494
            |....:.:.....|:.|              ::..|.....:| .|.|::::|:.:..:     :
  Rat  1039 YEKLYEEVSRCENTKVFHGWLQCDCRPFKQALLNTIKRWSLLF-KRYLSDHVINSLADLESFMGV 1102

  Fly   495 IREHIKAE---------VDICDEFEKIKYRAL------EIPKSTEELLES-AEYMIHVKKDKIAE 543
            .|..:|..         |::.....|:|.|.:      |..|.|.|||:| .|.|......|:.|
  Rat  1103 TRTGLKKPLKEGDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATDSMFEPLKQTIELLKSYGEEMPEETYLKLQE 1167

  Fly   544 L----TDRIQYCLQVGTNIVELTEMSKYHFDLTIKTINWIKDINDICDYNASQQEQFK------- 597
            |    |:..:..:||..|:..|             ..|.:..:...|.....:|.:|:       
  Rat  1168 LPEQWTNTKKLAIQVKQNVAPL-------------QANEVNILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDA 1219

  Fly   598 -FTFEEHLQEVIKKLNSDIDELLPKLTVIDDMSRPDKFRDSYIILQNFIDQLKTFDDYVAWINKE 661
             |||                            |.||.::.    |......:...:..:..:.|.
  Rat  1220 PFTF----------------------------SDPDPYKS----LNKQQKSISAMEGVMEALCKS 1252

  Fly   662 EKLFKVALTEYPKLDIIKTFVYPFAELMKCCIEWQRYL-SVWNDGPFEYLEPQFVERTTDDYLKE 725
            ..||:|.:.:|.:|              |.|.:..|.| .:|:       ....|..:.||:   
  Rat  1253 GSLFEVTVPDYKQL--------------KACHKEVRLLKELWD-------MIVMVNTSIDDW--- 1293

  Fly   726 FQKNQKYYRVKIKQDLIDNPVC-KFKGQTEDPDPAKHPVPLRLCTSMIQSIKDFTTGVFIVNTMC 789
              |..|:..:.::|..||   | ||.......|  |..........:..::|:..|.:..|:.:.
  Rat  1294 --KTTKWKDINVEQMDID---CKKFAKDVRSLD--KEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAVSELQ 1351

  Fly   790 NPALRKRHWKEMSEIAGFDVTPDAGTTLRKILNSGLDPILDQFEIISIGANKELQLWNALQAMIK 854
            |||:|:|||:::.:...........|||..:|...|....|:...|...|.||..:...|:.:..
  Rat  1352 NPAIRERHWQQLMQATQVKFEMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLKTLDS 1416

  Fly   855 EWETRVFPYGPYKETGVQILSSLDD--IQALLDDHI-LKTLVMRGSAFMKPCEEEVRAWYEKIMR 916
            .|.|..|.:..:..||..:|.| |:  ::.|.|:.: |:.|:|  |.::....:||.:|.:|:..
  Rat  1417 TWSTMEFEHELHPRTGTMLLKS-DELLVETLEDNQVQLQNLMM--SKYLSHFLKEVTSWQQKLST 1478

  Fly   917 VNETLDQWGKVQANYLYLLPIF-SSKDIVAQMPEEGRLFVIVEQTYTRNMGLVLRQPLVMETAPV 980
            .:..:..|.:||..:.:|..|| .|:||.||:||:.|.|..::|.:...|...::.|.|:|....
  Rat  1479 ADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEATNK 1543

  Fly   981 SGLLESLQKANELLEDIATGVSNYLEKKRLYFPRFFFLANDEMLEILSETKDPLRVLPHLSKCFE 1045
            .||.:.|::..:.|......::.|||.|||.||||:|:::.::|:|||...||:.|..||||.|:
  Rat  1544 PGLYDKLERLKKSLAVCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSKLFD 1608

  Fly  1046 GINSLEF--DAAKNV----LAMISSDKETIEFIEQVSTAAAGGSVEKWLIGVEDEMLKAVRYQNE 1104
            .:..|:|  ||:.|.    |.|.|.:.|.::|.::...:   |.||.||..|.|.|...:|::..
  Rat  1609 SLCKLKFRLDASGNPIKVGLGMYSKEDEYMDFDKECDLS---GQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIP 1670

  Fly  1105 LSFAHYPKVKRHEWVLEWPQMTVLAISQVYWASRVHGCLRRTFGGNMTIMMNFFQELSKELNDIV 1169
            .:...|.:..|.:|:.::|....|..:|::|.:.|.....|...|....:.::.::...:||.::
  Rat  1671 EAVVTYEEKPREQWIFDYPAQVALTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYENAIKDYNKKQISQLNALI 1735

  Fly  1170 TLVRSPKISNL---NRITIKSLIVIDVHAKDVSEDLIKNKVSSEFDFQWLAQMRYYWEDDK--TW 1229
            ||:    |.||   :|:.|.::..|||||:||...:|..||.|...|.|.:|:|:.|:::|  .:
  Rat  1736 TLL----IGNLSAGDRMKIMTICTIDVHARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKHCF 1796

  Fly  1230 VRIINATVPFANEYLGNSDRLVITPLTDRCYRTLVGAYQLHLNGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAL 1294
            ..|.:|.:.::.|||||:.||||||||||||.||..:..|.:.|||.||||||||||||||.:||
  Rat  1797 ANICDAQIQYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAL 1861

  Fly  1295 AVQCKVFNCSDGLDYKAMGKFFKGLASCGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILLIIQAVRSNATK 1359
            .....|||||:.:|||:.|..:||||..|||.||||||||.:|||||:|.|:..:..|:|:...|
  Rat  1862 GTMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKK 1926

  Fly  1360 FMFEGTELTLNPACYVCITMNPGYAGRSELPDNLKVLFRSVAMMVPDYAMIGEISLYSYGFVDAR 1424
            |.|.|..::|.|...:.||||||||||:|||:|||.|||..||:|||:.:|.||.|.:.||::||
  Rat  1927 FNFLGEMISLIPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEAR 1991

  Fly  1425 KLAVKIVTTYRLCSEQLSSQNHYDYGMRAVKTVLSACGNIKKQYPDEVEDILLLRSLIDVNLPKF 1489
            .||.|.:|.|.||.|.||.|:|||:|:||:|:||...|::|:..|...||.:|:|:|.|.|:||.
  Rat  1992 LLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKI 2056

  Fly  1490 LSFDVPLFEGIISDIFPGIKLPHIDYSLVESEFKRVCLEEVLEPAPSFLLKVIQTYEMIIVRHGF 1554
            ::.|:|:|.|:|.|:||.:.:|.......|...|:..:|..|:...||:|||:|..|::.|||..
  Rat  2057 VTDDLPVFMGLIGDLFPALDVPRKRDLNFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSV 2121

  Fly  1555 MLVGEPLAGKSKTLQVLAKVLSALKIKAPQKSNYFQHVQMGIMNPKSITMNQLYGSFDPISYEWT 1619
            .::|...:|||:.|:.|.|....:|.|.....          ::||::|.::|:|..:|.:.||.
  Rat  2122 FVIGNAGSGKSQVLKSLNKTYQNMKRKPVAVD----------LDPKAVTCDELFGIINPATREWK 2176

  Fly  1620 DGLVAKIFRDFAMTPTPDRKWVIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLTSGEVITMSNEMSMVFE 1684
            |||.:.|.||.|.......||::.||.:|.:|||::|||:||||.|.|.|.|.|.::..|.:|||
  Rat  2177 DGLFSTIMRDLANITHDGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFE 2241

  Fly  1685 VMDLAQASPATVSRCGMIYMEPSTLGWRAFAKSWLKKADPRWADEEGVPYVMALMQWLLPPCQTF 1749
            :..|..|:||||||.|::|:.|:.|||.....||:::   |....|....:: |....||.|...
  Rat  2242 ISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPVVSSWIER---RKVQSEKANLII-LFDKYLPTCLDK 2302

  Fly  1750 VRRFCSQFIKPGEFNCMLTTFDLFDMQIAEAIEENPEDYQKYL-QTYFQAAILFALIWGVGGVLD 1813
            :|....:.....|...:.|...|.:..:.|  :..|.|..|.| :.||    :||..|..||.:.
  Rat  2303 LRFGFKRITPVPEITVIQTILYLLECLLTE--KNAPPDSPKELYELYF----VFACFWAFGGAMF 2361

  Fly  1814 TASREKFDVFLKKLWDTDPPPPEPLGKMEITPPTEGLLVDYVFLYKQRGAWRYWPDLAK--RMDV 1876
            ......:.|...|.|..:        ...|..|::|.:.|| ::..:...:..|.|...  .:|.
  Rat  2362 QDQLIDYRVEFSKWWINE--------FKTIKLPSQGTIFDY-YIDPETKKFLPWTDKVPNFELDP 2417

  Fly  1877 EETKTGVIVPTVDTARYIHLLKMHVEHKKRMLLVGPTGTGKTVYVQNYLMNKLDKEVFETGFITF 1941
            :......:|.|.:|.|..:.:.:.:.....::|||..||||:|.:.:.|.| |..:.:....:.|
  Rat  2418 DIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPVMLVGNAGTGKSVLMGDKLEN-LSTDDYLVQAVPF 2481

  Fly  1942 TVMISANQCQDLLISKLQKWKRGIYGPPKGMQSVLFVDDMNMPVKEVYGAQPPLELLRQFFDYGH 2006
            ....::...|.:|...|:|.....||||...:.:.|:||||||..:.||...|..|:||..|:.|
  Rat  2482 NFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKKLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHRH 2546

  Fly  2007 VYD-----LKDSSKVYIHNVLIMAACGLPGGSRQDVYARFLNHFNVYSINTFSDDSMFRIFLNVA 2066
            .||     |||     :||...: ||..|......:..|...||.|::::....:::..|:..:.
  Rat  2547 WYDRQKLTLKD-----VHNCQYV-ACMNPTSGSFTIDPRLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNTIL 2605

  Fly  2067 LNGFRRAGHGQDVFVVTNQIVSATQSIYKSVQSEIRATPSKSHYIFNLRDISRVVTGCTLVRKES 2131
            ............:..:.:.:|:|..::::.|.:....|..|.||||||||:|.:..|......|.
  Rat  2606 AQHLSYRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLPTAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFSTLEI 2670

  Fly  2132 VSDKKIFVRVWYHEAMRVFYDRLVDDVDR-----------KWMFDKLNECLKANFKDKVETVFER 2185
            :......||:|.|||.||:.|::||:.|:           |..||.|.|          |.:|.:
  Rat  2671 LRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVTMASTKKFFDDLGE----------EHLFAK 2725

  Fly  2186 ---YCVQGPDEAVFTMEAASNILFGVYFDEDSVPDERRYEEVPSVEVFLNLALTSLDDYNSTRRN 2247
               :|       .||.        |:        .:.:|..|..|.....|....||.||.... 
  Rat  2726 PNIFC-------HFTQ--------GI--------GDPKYFPVTDVAHLNKLLKDVLDSYNEVNA- 2766

  Fly  2248 KMDITLFTFALQHLNRICRIISIQGASALIIGLGGSGRQSLTKLATNMVQTSFFQPEITKNYGAN 2312
            .|::.||..|:.|:.||.||:.....:||::|:||||:|||::||..:.....||..:.|.|...
  Rat  2767 VMNLVLFEDAVAHICRINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIP 2831

  Fly  2313 DWHDDIKAILKEAGGMNKHTTFLITENQIKMELFLQDIDCLLNQGEVPNIFPIDEKQEVLEMVRL 2377
            |...|:.|...::...|..:.||:|::|:..|.||..|:.||..||:|.:|..|:.:.::..:| 
  Rat  2832 DLKMDLAAQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDDLENIISSMR- 2895

  Fly  2378 AAQGGNRNIDVSALQVFSFFVDRCKQKLHMILSFSPIGDALRTRVRLYPSLVNCCTIDWYDSWPE 2442
             .|..:..:..:....:.||:::.:::|.:||.|||:|..||.|.|.:|::|||..|||:..|||
  Rat  2896 -PQVKSLGMTDTREACWKFFIEKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAIDWFHEWPE 2959

  Fly  2443 EALQMIAKMSLVDVNVPSEDIKLAIMDTCQYFHTTAARSTRAFCQMTGRHIYQTNASFIELIRSF 2507
            :||..::...|.:......::|.:|.....|.|||....::.:.....|:.|.|..:|:|.|:.:
  Rat  2960 DALVSVSARFLQETQGIQPEVKTSISLFMSYVHTTVNEMSKTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLY 3024

  Fly  2508 QTLIERKQSETMLAKMRYIGGLDTLAQAAAAISIMQRDLNALQPKLVALAESSRKMMLEINKETL 2572
            |.|:.:|:.|.:....|...||..|...|:.:..::..|...:.:|....|::.|::..:..|| 
  Rat  3025 QNLLAKKRMELVAKIERLENGLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVET- 3088

  Fly  2573 AASAAAEQVKRDEEVASVQAEAAQVLKQD-------CERDLAKAIPVLEDALAALNTLKPADITL 2630
                  |:|.:::.:|..:....:|:.::       ||.|||||.|.|..|..||:||...::|.
  Rat  3089 ------EKVSKEKAIADEEEIKVEVINKNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTE 3147

  Fly  2631 VKSMKNPPPVIKLVMAAVCVIKGIPPERIPDPASGKMVQDYWGPSKRLLGEMN-FLPGLKEFDKD 2694
            :||..:||..:..|.|||.::.. |..:||...|       |..:|.::|::: ||..||.|||:
  Rat  3148 LKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTA-PGGKIPKDKS-------WKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKE 3204

  Fly  2695 NIPTEIVKRIHKEFIPNKDFDPKVVAKASSAAKGLCQWIIAMMMYDEVAKVVAPKKAKLAGAEKE 2759
            :||...:|.. |.:..|..|||:.:...|:||.|||.|.|.::.:.||...||||:..|..|..|
  Rat  3205 HIPEACLKAF-KPYQGNPTFDPEFIRSKSTAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVAPKRQALEEANAE 3268

  Fly  2760 YADTMEFLAQKRALALALEEKVALLNIEL-------DKANAEMQKTEEHAESCRNKLLRAEALIG 2817
            .|:..:.|::       ::.|:|.||..|       :||.||..|.::.|::....:..|..|:|
  Rat  3269 LAEAQDKLSR-------IKNKIAELNANLNNLTSAFEKATAEKIKCQQEADATNRVISLANRLVG 3326

  Fly  2818 GLGGEKSRWNKAAEDLQELYDHLPGDVLISCGIIAYLSAVNLQYRSECV-KDWFKKVTDLKIPCS 2881
            ||..|..||.::.|:.:.....|.||||:....::|:.....:||:|.: |.|...|.:||:|  
  Rat  3327 GLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLLISAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIPYVNNLKVP-- 3389

  Fly  2882 SHYSITD------VLGLEVTIQNWQLDGLPNDEFSSENAIISANSSRYSLFIDPQAQANNWLKNM 2940
              ..||:      :|..:..:..|...|||:|..|:|||.|..|:.|:.|.:|.|.|...|:|| 
  Rat  3390 --IPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSDRMSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGIKWIKN- 3451

  Fly  2941 ERKNRLNCVKFNQSNYMKVIAEALEYGTPVIIENVQEELEVPLDPILMRQTFVQGGIKHISLGES 3005
            :..:.|..::..|.:|:.:|.:|:..|..::|||:.|.::..|||:|.|.|..:|  :.|.:|:.
  Rat  3452 KYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLIENIGETVDPVLDPLLGRNTIKKG--RFIKIGDK 3514

  Fly  3006 VVPVNPNFRLYMTCNLRNPHFLPETFNKVTVINFALTQNALMDQLLSIVVAKERPDLQELRITLT 3070
            .|..:|:|||.:.....|||:.||...:.|:|||.:|::.|.||||:.|||||||||::|:..||
  Rat  3515 EVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLINFLVTRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLT 3579

  Fly  3071 TEAAANKGALRDAENMILKTLS-AGGDILENEAAIQILADSKGLSKDIVEKQEAAKETVAKIEAF 3134
            ......|..|::.|:.:|..|| |.|:.|.:.|.::.|..:|..:.:|.||.:.||.|..||...
  Rat  3580 KSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDTALVENLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKINEA 3644

  Fly  3135 RLNYKPVAVHSSILYYSITDLPNIDPMYQFSLNWYINLYMYSIETANKSKDLPRRIKFLVDGFTR 3199
            |.||:|.|..:|:||:.:.||..|:|:|||||..:..::..:|:....::::.:|:..|.|..|.
  Rat  3645 RENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSLKAFNVVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITY 3709

  Fly  3200 NLYNNVCRSIFEKDKLLYSFILTARILLGTGQVEMRHFAHLVTNAKESTNIPPNPDPTWITETVW 3264
            ::|....|.:||:|||::...:|.::|....::.......|:....::..:.|   ..::....|
  Rat  3710 SVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKELNPVELDFLLRFPFKAGVVSP---VDFLQHQSW 3771

  Fly  3265 LNVLRLEELKELRGIVDHFKSHLHAWQAIYDHSSPEKQPLPPPWQDKTTAFEKIIVLKALRPDSV 3329
            ..:..|.|:.|.:.:....:.....|:.:.:..:|||:..|..|::| ||.:|:.:::.:|||.:
  Rat  3772 GGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRWKKLVESEAPEKEIFPKEWKNK-TALQKLCMVRCMRPDRM 3835

  Fly  3330 FLAVRLFIAESIGDQYVTPPEFDISKSYADSTALTPLVFILSPGADPLGSLLAFAEKMG---QEE 3391
            ..||:.|:.|.:|.::|.....:.||||.:|:..||:.||||||.|||..:.|..:|:|   ...
  Rat  3836 TYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKSYEESSPSTPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNG 3900

  Fly  3392 TFQSISLGQGQGPIATALIKNAQEMGYWVCLQNCHLAASWMPYLEYLWENMDTFNTTPNFRIWLT 3456
            ...::||||||..:|...:..|.|.|:||.|||.||.|.|:..|:...|...: .:..::|::::
  Rat  3901 KLHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKGHWVILQNIHLVARWLSILDKKVERYSS-GSHEDYRVFIS 3964

  Fly  3457 AYPTPQ-----FPVTILQNGVKMTNEPPTGLKENLMRSYNSEPINDYEFYTGCAKQDRAFTRLLY 3516
            |.|.|.     .|..||:|.:|:|||||||:..||.::.:....:..|.   |.|:.. |..:|:
  Rat  3965 AEPAPSVETHIIPQGILENAIKITNEPPTGMYANLHKALDLFTQDTLEM---CTKEIE-FKCILF 4025

  Fly  3517 GICFFHAVVQERRKYGPLGWNIAYGFNESDLQISVLQLSMLLNQYDHVPYDAISYLTSECNYGGR 3581
            .:|:|||||.||||:|..|||.:|.||..||.||:..|...|.....||:|.:.||..|..|||.
  Rat  4026 ALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRSYPFNNGDLTISINVLYNYLEANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGH 4090

  Fly  3582 VTDNWDRRLIVTILADFCNAQAVTDNRYRFASDDRYILPRKTEHREILRYLDENLPSLAPPEVYG 3646
            :||:|||||..|.|.:|...: :.:.....|..  :.:|...:::....|:|||||. ..|.:||
  Rat  4091 ITDDWDRRLCRTYLIEFIRVE-MLEGEVLLAPG--FQIPPNLDYKGYHEYIDENLPP-ESPYLYG 4151

  Fly  3647 LHANSGITRDLQTTKTLLDSMILLLGSEAAGSAGAGVSVEQVILDTIKQIEREMPADMD----IE 3707
            ||.|:.|.....|::.|..:::.:...|....||.|||.|:.:...:..|..::|...:    :.
  Rat  4152 LHPNAEIGFLTVTSEKLFRTVLEMQPKETDSGAGTGVSREEKVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMA 4216

  Fly  3708 AAAEKYPVDYNESMNTVVV--QEMERFLKLQKEIRTTCRDLAMGIKGIIVMTPDLENVMTAMKFN 3770
            .||||.|.        |||  ||.||...|..|:|.:.::|.:|:||.:.:|.|:|::.||:.::
  Rat  4217 KAAEKTPY--------VVVAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYD 4273

  Fly  3771 RIPTKWMSKSYPCLKPLGSYVQDLYKRLNWLHDW-HHHGKPPTFWLSGFFFTQAFLTGAMQNFAR 3834
            .:|..|::::||.:..|.::..||.:|:..|..| .....|.|.||:|||..|:|||..||:.||
  Rat  4274 TVPETWVARAYPSMMGLAAWYSDLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSMAR 4338

  Fly  3835 KYKIPIDTLTFDYDVLKV--ETKTSPPDDGVYCNGLYLEGARWEWRENTLVEQFPKVLIYAMPVI 3897
            |.:.|:|.:....:|.|.  |..|:||.:|.|..||::|||||:.:...:.|...|.|...||||
  Rat  4339 KNEWPLDKMCLSVEVTKKTREDMTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVI 4403

  Fly  3898 FFRPVGLVDVVEGSR-YRCPLYKTAERKGTLSTTGHSTNYVVPLLLNTHVKASHWVKRSVALICQ 3961
            |.:.:. ||.:|... |.||:|||..|..|         ||....|.|..||:.|:..:|||:.|
  Rat  4404 FIKAIP-VDRMETKNIYECPVYKTRIRGPT---------YVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLLQ 4458

  Fly  3962  3961
              Rat  4459  4458

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc62BNP_995958.2 DHC_N2 678..1102 CDD:285579 123/435 (28%)
P-loop_NTPase 1239..1469 CDD:304359 132/229 (58%)
P-loop_NTPase 1553..1699 CDD:304359 55/145 (38%)
P-loop_NTPase 1874..2145 CDD:304359 74/275 (27%)
P-loop_NTPase 2249..2511 CDD:304359 85/261 (33%)
MT 2524..2864 CDD:289543 107/354 (30%)
AAA_9 2898..3111 CDD:289547 81/213 (38%)
Dynein_heavy 3253..3952 CDD:281078 246/716 (34%)
Dnah17XP_038943439.1 DHC_N1 187..764 CDD:400611 46/228 (20%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:400618 124/442 (28%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 921/2751 (33%)
AAA_6 1806..2132 CDD:403853 167/325 (51%)
MT 3040..3383 CDD:289543 110/365 (30%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:408026 107/312 (34%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.