DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc62B and Dnah7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995958.2 Gene:Dhc62B / 38226 FlyBaseID:FBgn0013811 Length:3964 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001406479.1 Gene:Dnah7 / 252893 RGDID:621798 Length:4023 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3977 Identity:1693/3977 - (42%)
Similarity:2438/3977 - (61%) Gaps:236/3977 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    89 VPPMLRRTEAKILSFASERLKNKYPELVQAYMHDVHEEFNRLMKVYSMKNILRHPEFSDEDP--- 150
            |.||.......:|....:.|| .....:.....::.|::...:|...:..:|:.|...::|.   
  Rat   176 VAPMEDSWLEHVLQLVPQHLK-VLTNSITVLSDEMREDYLLSVKKSIVDFVLKDPREKEDDTKIT 239

  Fly   151 ------AQFE-LPRPDIGFRRPGRTQNYSNFLENRRRIAQKLLILQLPLRAILNISVGELPKLAC 208
                  |:.| ||:|   :||        :||.....|...|..:...:.|:|::......||..
  Rat   240 ELPPHRAEMEVLPKP---WRR--------SFLSACSYIRDHLNAMNPTMLAVLDLWHSTFKKLRL 293

  Fly   209 I----FNYVLATGAMQQQLGLGGREALSYKFYHKYIQNQLDKVNTFLRWTWYPKIVQVLRKLMRK 269
            :    |:              ..::||....:...:...::.....|..||:|::..:..:..:|
  Rat   294 VDIEEFH--------------NRQDALELSGFQNIVIKHMESAKETLLKTWFPEVQNIYYQGNKK 344

  Fly   270 RVMP----MSTWKRSWNAMEALMNREMTNMKIRTFE----------EMYRMCSHPRTMPMMRMSL 320
            :.:|    .:..:..:|....||..::.::.:.:.:          |..|...||..  :||:.|
  Rat   345 KQLPTGDSSAKLESFFNCAATLMTLQLQDLILVSMQDFTDLIAQPPESIRAFEHPGF--IMRLVL 407

  Fly   321 EWS------EFSSDLDTRPNAWSILRTFAEIATEISMVGYRMEPLQPQVQTLTSMAAYAKVNDYL 379
            :..      ||:..:|...|.:.|:         |..|.:     .|:|:|    ..|:|.....
  Rat   408 DKKAVKFEPEFTDYIDILVNVYEIM---------IKAVSF-----VPRVET----KLYSKWESKS 454

  Fly   380 K-IEMNDNFLKDVID----KVQNIILRTYQEVIQYVEGFRDKYYALYSWQERDALNQFLSEPHEF 439
            | ..:....|.::||    |::.::||......::::.: |||..|.:.|....:.:||::...:
  Rat   455 KPTTLKPIILDEIIDAHKEKIREVVLRESVAPTEHLKMY-DKYQFLITRQAEQDIEEFLTQSQNY 518

  Fly   440 EEYFARIDMYYGFIQMLRSE-----PATEYFVMAVIHNEPAIFGLRTLAENLIHEITTIIIREHI 499
            |.....|..|    |.|..|     ..|....|..:|.|..|..|...|:.:..::...:.|:|.
  Rat   519 ERLIEEIRKY----QKLGEEIQYTSRKTVRLGMFEMHCEELIRSLVKRADIICGKLIAKMFRDHQ 579

  Fly   500 KAEVDICDEFEKIKYRALEIPKSTEELLESAEYMIHVKKDKIAELTDRI---QYCLQVGTNIVEL 561
            :....:|:|||||..:||..|.:|.||:|...::..|:...:.:|..|:   :.||..   ::|.
  Rat   580 EVNTMLCEEFEKIAEKALSTPPNTAELMEMKAHIQKVETTDMLDLGQRLVDSKNCLAF---LIEC 641

  Fly   562 TEMSKYHFDLTIKTINWIKDINDICDYN----ASQQEQFKFTFEEHLQEVIKKLNS--------- 613
            ...|.....|......|...:.:|.|.:    ..:.||::...:...:..:::|.|         
  Rat   642 VNFSPADIRLNNSVFQWYGRMGEIFDEHRKIIKDKTEQYQEGLKLRCERFVEELESYAKQAEEFY 706

  Fly   614 ------DIDELLPKLTVIDDMSRPDKFRDSYIILQNFIDQLKTFDDYVAWINKEEKLFKVALTEY 672
                  |:...|.|..|::                   .:|....|.:...|.||:.|....:.|
  Rat   707 TFGDLQDVQRYLKKAQVLN-------------------SKLDAAADKIEQFNAEEEAFGWIPSVY 752

  Fly   673 PKLDIIKTFVYPFAELMKCCIEWQRYLSVWNDGPFEYLEPQFVERTTDDYLKEFQKNQKYYRVKI 737
            |:...|:..:.|:..|.:..:|:......|.:||:..:.|..||....:|.:...|.:|.:.   
  Rat   753 PQRKKIQDGLNPYLRLYETAVEFSTKHRAWTEGPYHKVNPDQVEADVGNYWRGLYKLEKAFH--- 814

  Fly   738 KQDLIDNPVCKFKGQTEDPDPAKHPVPLRLCTSMIQSIKDFTTGVFIVNTMCNPALRKRHWKEMS 802
                 |:|..                 |.:...:...::||...:.:|..:|||.||.|||:.||
  Rat   815 -----DSPNA-----------------LAMTKKVRARVEDFKQYIPLVQVICNPGLRPRHWEAMS 857

  Fly   803 EIAGFDVTPDAGTTLRKILNSGLDPILDQFEIISIGANKELQLWNALQAMIKEWETRVFPYGPYK 867
            .|.|:.:.|...:|:...::..|:|.||:||.||..|:||..|..::..|:.|||...|...||:
  Rat   858 AIVGYPLQPSDDSTVFSFIDMNLEPFLDRFEGISEAASKEYSLEKSMDKMMTEWEAMEFVIHPYR 922

  Fly   868 ETGVQILSSLDDIQALLDDHILKTLVMRGSAFMKPCEEEVRAWYEKIMRVNETLDQWGKVQANYL 932
            |:|..|||::||||.||||||:||..||||.|:||.|:::|.|..|::.:.|.||:|.||||.:|
  Rat   923 ESGTFILSAVDDIQMLLDDHIIKTQTMRGSPFIKPYEKQMREWEGKLLLLQEILDEWLKVQATWL 987

  Fly   933 YLLPIFSSKDIVAQMPEEGRLFVIVEQTYTRNMGLVLRQPLVMETAPVSGLLESLQKANELLEDI 997
            ||.|||||.||::|||||||.|..|::|:...|.:|::...|:....:..:||.::|:|||||.|
  Rat   988 YLEPIFSSPDIMSQMPEEGRRFTAVDKTWRDVMKMVVQNKHVLAVVTIERMLERMKKSNELLELI 1052

  Fly   998 ATGVSNYLEKKRLYFPRFFFLANDEMLEILSETKDPLRVLPHLSKCFEGINSLEFDAAKNVLAMI 1062
            ..|::.|||||||:|||||||:|||:||||||||||.||.|||.||||||..:||....::..|.
  Rat  1053 LKGLNEYLEKKRLFFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQPHLKKCFEGIARVEFTETLDITHMK 1117

  Fly  1063 SSDKETIEFIEQVSTAAAGGSVEKWLIGVEDEMLKAVRYQNELSFAHYPKVKRHEWVLEWPQMTV 1127
            ||:.|.:|.::.:||..|.|.|||||:.:|..|:|::......:...|.|..|..||.:||..||
  Rat  1118 SSEGEVVELVDTISTTKARGQVEKWLVELERIMIKSIHKVIGDAITAYTKNARINWVRDWPGQTV 1182

  Fly  1128 LAISQVYWASRV-------HGCLRRTFGGNMTIMMNFFQELSKELNDIVTLVRSPKISNLNRITI 1185
            |.:||.:|...|       |..|.           ::..:.:.:::|||||||. |:|..||:|:
  Rat  1183 LCVSQTFWTVEVQVAIPMGHKALE-----------DYLGKCNHQIDDIVTLVRG-KLSKQNRVTL 1235

  Fly  1186 KSLIVIDVHAKDVSEDLIKNKVSSEFDFQWLAQMRYYWEDDKTWVRIINATVPFANEYLGNSDRL 1250
            .:|:|:||||:||..:|:|.::|.:.||:||:|:||||.::....::|||.:.:..||||||.||
  Rat  1236 GALVVLDVHARDVLANLVKKRISDDTDFEWLSQLRYYWHENNLETKMINAGLRYGYEYLGNSPRL 1300

  Fly  1251 VITPLTDRCYRTLVGAYQLHLNGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCKVFNCSDGLDYKAMGKF 1315
            |||||||||||||.||..|||.|||||||||||||||||||||:|.||.||||||||||.|:|||
  Rat  1301 VITPLTDRCYRTLFGALHLHLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKF 1365

  Fly  1316 FKGLASCGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILLIIQAVRSNATKFMFEGTELTLNPACYVCITMN 1380
            ||||.||||||||||||||:||||||||||||.|...:.|.....:||||||.|:|.|.|.||||
  Rat  1366 FKGLLSCGAWACFDEFNRIDLEVLSVVAQQILTIQIGINSGTELLVFEGTELKLDPTCAVFITMN 1430

  Fly  1381 PGYAGRSELPDNLKVLFRSVAMMVPDYAMIGEISLYSYGFVDARKLAVKIVTTYRLCSEQLSSQN 1445
            ||||||||||||||.|||:|||||||||||.||.|||.|||.||.|::|||.||||||||||||:
  Rat  1431 PGYAGRSELPDNLKALFRTVAMMVPDYAMIAEIVLYSCGFVTARPLSIKIVATYRLCSEQLSSQH 1495

  Fly  1446 HYDYGMRAVKTVLSACGNIKKQYPDEVEDILLLRSLIDVNLPKFLSFDVPLFEGIISDIFPGIKL 1510
            ||||||||||:||:|.||:|.:||:|.|:||||||:||||||||||.|:||||||.||:|||:||
  Rat  1496 HYDYGMRAVKSVLTAAGNLKLKYPNENEEILLLRSIIDVNLPKFLSHDLPLFEGITSDLFPGVKL 1560

  Fly  1511 PHIDYSLVESEFKRVCLEEVLEPAPSFLLKVIQTYEMIIVRHGFMLVGEPLAGKSKTLQVLAKVL 1575
            |..||:.:.:..:..|....|:....|..|::|.|||:|||||||:||||..||:...:|||..|
  Rat  1561 PKPDYNDLLAAIRENCHSMNLQMTNFFSEKILQIYEMMIVRHGFMIVGEPFGGKTSAYRVLAGAL 1625

  Fly  1576 SALKIKAPQKSNYFQHVQMGIMNPKSITMNQLYGSFDPISYEWTDGLVAKIFRDFAMTPTPDRKW 1640
            ..:..|...:.|   .||:.::||||:||.||||.||.:|:||:||::|..||.||.:.||||||
  Rat  1626 GDICEKGLMEEN---KVQITVLNPKSVTMGQLYGQFDLVSHEWSDGILAVSFRAFAASSTPDRKW 1687

  Fly  1641 VIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLTSGEVITMSNEMSMVFEVMDLAQASPATVSRCGMIYME 1705
            :||||||||||||||||||||||||||.|||:|.||.:|:::||.|||..|||||||||||||||
  Rat  1688 LIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMNLIFEPMDLEVASPATVSRCGMIYME 1752

  Fly  1706 PSTLGWRAFAKSWLKKADPRWADEEGVPYVMALMQWLLPPCQTFVRRFCSQFIKPGEFNCMLTTF 1770
            |..||||....||:... |:........::..|...::|....|:||...:.....:.|.:.:..
  Rat  1753 PQMLGWRPLMVSWINTL-PQSVSIIQKEFIEGLFDRMVPLSVEFIRRHTKELSPTSDTNLVRSLM 1816

  Fly  1771 DLFDMQIAEAIEENPEDYQKYLQTY--FQAAILFALIWGVGGVLDTASREKFDVFLKKLWDTDPP 1833
            :|.|..:.:..:||.:..:...:.:  .:...||:|||.||.......|.|::..|::|.:   .
  Rat  1817 NLIDCFMDDFADENKQKERNDRENFSLLEGIFLFSLIWSVGASCTADDRIKYNKILRELME---G 1878

  Fly  1834 PPEPLGK----------------MEITPPTEGLLVDYVFLYKQRGAWRYW-------PDLAKRMD 1875
            |...|.:                :.:..|.:|.:.||.|:.:..|.|..|       |.:.|.:.
  Rat  1879 PISDLTRNKFKLLSGTEQTSSKALTVPFPEKGTIYDYQFIPEGLGRWDQWIKKLADTPPIPKDVQ 1943

  Fly  1876 VEETKTGVIVPTVDTARYIHLLKMHVEHKKRMLLVGPTGTGKTVYVQNYLMNKLDKEVFETGFIT 1940
            ..|    :||||:||.||..|:.:...|:|..:.||||||||:||:.|:|:|:|:|::::...:.
  Rat  1944 FNE----IIVPTLDTVRYSALMSLLTTHQKPSIFVGPTGTGKSVYIINFLLNQLNKDIYKPLIVN 2004

  Fly  1941 FTVMISANQCQDLLISKLQKWKRGIYGPPKGMQSVLFVDDMNMPVKEVYGAQPPLELLRQFFDYG 2005
            |:...:|.|.|::::|||.|.::|::|||.|.:.::||||:|||.:||||||||:|||||:.|:.
  Rat  2005 FSAQTTAAQTQNIIMSKLDKRRKGVFGPPLGKRMIVFVDDVNMPAREVYGAQPPIELLRQWLDHW 2069

  Fly  2006 HVYDLKDSSKVYIHNVLIMAACGLPGGSRQDVYARFLNHFNVYSINTFSDDSMFRIFLNVALNGF 2070
            :.|||||.|.:.:.::.||.|.|.|||.|..:..|::.|||:.:||.|||.|||.||..:.....
  Rat  2070 NWYDLKDCSMIKLVDIQIMCAMGPPGGGRNPITPRYMRHFNIITINEFSDKSMFTIFSRILTWHL 2134

  Fly  2071 RRAGHGQDVFV-VTNQIVSATQSIYKSVQSEIRATPSKSHYIFNLRDISRVVTGCTLVRKESVSD 2134
            |......|.|: :|.|||:.|.::||.....:..||:||||:|||||.|||:.|..|.|.|:..:
  Rat  2135 RTCYKFPDDFLDLTTQIVNGTMTLYKDAMKNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVCLSRPETAEN 2199

  Fly  2135 KKIFVRVWYHEAMRVFYDRLVDDVDRKWMFDKLNECLKANFKDKVETVFERYCVQGPDEAVFTME 2199
            |:...|:|.||.:||:||||:|:.||.|:.:.:.|.|:...::....:|:.  :...::.:...:
  Rat  2200 KEAIKRLWVHEVLRVYYDRLLDNADRSWLVNYIQEILRNYMQEDFHDLFKN--LDFDNDGIVEED 2262

  Fly  2200 AASNILFGVYFDEDSVPDERRYEEVPSVEVFLNLALTSLDDYNSTRRNKMDITLFTFALQHLNRI 2264
            ...:::|..:.|...  ::..|.|:|:|:....:....||:||:..:..|::.||.||::|::||
  Rat  2263 DLRSLMFCDFHDPKR--EDFGYREIPNVDALRVIVEGHLDEYNNMSKKPMNLVLFRFAIEHISRI 2325

  Fly  2265 CRIISIQGASALIIGLGGSGRQSLTKLATNMVQTSFFQPEITKNYGANDWHDDIKAILKEAGGMN 2329
            .||:....:.||::|:|||||||:|:||.:|...|.||.||:|.||:::||:|:|.||::....:
  Rat  2326 SRILKQPRSHALLVGVGGSGRQSVTRLAAHMADYSLFQVEISKGYGSHEWHEDLKVILRKCAEGD 2390

  Fly  2330 KHTTFLITENQIKMELFLQDIDCLLNQGEVPNIFPIDEKQEVLEMVRL--AAQGGNRNIDVSALQ 2392
            ....||.|:.|||.|.||:|::.|||.|||||:|.:|||||:.|.:|.  ..:...:..|.|.:.
  Rat  2391 MQGVFLFTDTQIKRESFLEDVNNLLNAGEVPNLFALDEKQEICEKMRQLDRQRDKTKQTDGSPIA 2455

  Fly  2393 VFSFFVDRCKQKLHMILSFSPIGDALRTRVRLYPSLVNCCTIDWYDSWPEEALQMIAKMSLVDVN 2457
            :|:.|:|||:.:||::|:.||||||.|.|:|.:|:|||||||||:.||||:||:.:|...|.|:.
  Rat  2456 LFNMFIDRCRNQLHVVLAMSPIGDAFRIRLRKFPALVNCCTIDWFQSWPEDALEAVASRFLEDIE 2520

  Fly  2458 VPSEDIKLAIMDTCQYFHTTAARSTRAFCQMTGRHIYQTNASFIELIRSFQTLIERKQSETMLAK 2522
            : ||:|:...:|.|:.|||:....:..|.....|:.|.|..|::|||.:|:.|:|:|::|.|..|
  Rat  2521 M-SEEIREGCIDMCKSFHTSTINLSTTFHNELQRYNYVTPTSYLELISTFKLLLEKKRNEVMKMK 2584

  Fly  2523 MRYIGGLDTLAQAAAAISIMQRDLNALQPKLVALAESSRKMMLEINKETLAASAAAEQVKRDEEV 2587
            .||..|||.|..|::.::.||.:|.||.|:|...:.....||:.|.||::..:...:.||.||.|
  Rat  2585 RRYEVGLDKLDSASSQVATMQGELEALHPQLKVASRQVDDMMIMIEKESIEVAKTEKIVKADETV 2649

  Fly  2588 ASVQAEAAQVLKQDCERDLAKAIPVLEDALAALNTLKPADITLVKSMKNPPPVIKLVMAAVCVIK 2652
            |:.||.||:.:|.:|:.|||:|:|:||.|||||:||...|||:|||||:||..:||||.|:|::|
  Rat  2650 ANDQAMAAKAIKDECDADLAEALPILESALAALDTLTAQDITVVKSMKSPPAGVKLVMEAICILK 2714

  Fly  2653 GIPPERIPDP-ASGKMVQDYWGPSKRLLGEMNFLPGLKEFDKDNIPTEIVKRIHKEFIPNKDFDP 2716
            ||..::|||| .|||.::|:|||:|||||::.||..|.|:||||||...:..|.|.:|||.||.|
  Rat  2715 GIKADKIPDPTGSGKKIEDFWGPAKRLLGDIRFLQSLHEYDKDNIPPAYMNIIRKSYIPNPDFVP 2779

  Fly  2717 KVVAKASSAAKGLCQWIIAMMMYDEVAKVVAPKKAKLAGAEKEYADTMEFLAQKRALALALEEKV 2781
            :.:..||:||:|||:|:|||..||:|||:|||||.|||.||.|....||.|.:|:|....:::|:
  Rat  2780 EKIRNASTAAEGLCKWVIAMDSYDKVAKIVAPKKIKLAAAEGELRIAMEGLRKKQAALREVQDKL 2844

  Fly  2782 ALLNIELDKANAEMQKTEEHAESCRNKLLRAEALIGGLGGEKSRWNKAAEDLQELYDHLPGDVLI 2846
            |.|...|:....:....|...:.|..||.|||.|||||||||:||:.:|.:|..||.:|.||:||
  Rat  2845 AKLQDTLELNKQKKADLENQVDLCSKKLERAEQLIGGLGGEKTRWSNSALELGHLYVNLTGDILI 2909

  Fly  2847 SCGIIAYLSAVNLQYRSECVKDWFKKVTDLKIPCSSHYSITDVLGLEVTIQNWQLDGLPNDEFSS 2911
            |.|::|||.|....||....|:|.....:..||||..||:...||..|||:.|.:.|||:|.||.
  Rat  2910 SSGVVAYLGAFTSNYRQHQTKEWSHSCKERDIPCSDDYSLMGTLGEAVTIRAWNIAGLPSDLFSI 2974

  Fly  2912 ENAIISANSSRYSLFIDPQAQANNWLKNMERKNRLNCVKFNQSNYMKVIAEALEYGTPVIIENVQ 2976
            :|.||..|:.|:.|.||||.|||.|:||||:.|.|..:|.:..:|::.:...:::||||::|||.
  Rat  2975 DNGIIIMNARRWPLMIDPQGQANKWIKNMEKTNSLQLIKLSDPDYVRTLENCIQFGTPVLLENVG 3039

  Fly  2977 EELEVPLDPILMRQTFVQGGIKHISLGESVVPVNPNFRLYMTCNLRNPHFLPETFNKVTVINFAL 3041
            |||:..|:|:|::|||.|||...|.||:|.:...|:||.|:|..|||||:||||..|||::||.:
  Rat  3040 EELDPILEPLLLKQTFKQGGSTCIRLGDSTIEYAPDFRFYITTKLRNPHYLPETSVKVTLLNFMI 3104

  Fly  3042 TQNALMDQLLSIVVAKERPDLQELRITLTTEAAANKGALRDAENMILKTLSAG-GDILENEAAIQ 3105
            |...:.||||.||||:|||||:|.:..|..:.|.||..|::.|:.||:.||:. |:|||:|.||:
  Rat  3105 TPEGMQDQLLGIVVARERPDLEEEKQALILQGAENKRQLKEIEDKILEVLSSSEGNILEDETAIK 3169

  Fly  3106 ILADSKGLSKDIVEKQEAAKETVAKIEAFRLNYKPVAVHSSILYYSITDLPNIDPMYQFSLNWYI 3170
            ||:.||.|:.:|.:|||.|:||..||:..|:.|:|:|||||||::||.||.||:||||:||.|:|
  Rat  3170 ILSSSKALANEISQKQEVAEETEKKIDNTRMGYRPIAVHSSILFFSIADLANIEPMYQYSLTWFI 3234

  Fly  3171 NLYMYSIETANKSKDLPRRIKFLVDGFTRNLYNNVCRSIFEKDKLLYSFILTARILLGTGQVEMR 3235
            ||::.|||.:.||..|.:|:..|.|.||.:||.|:|||:|||||:|:||.||..:|:....:...
  Rat  3235 NLFILSIENSEKSDILSQRLHILRDHFTYSLYVNICRSLFEKDKMLFSFCLTVNLLIHENAINKA 3299

  Fly  3236 HFAHLVTNAKESTNIPPNPDPTWITETVWLNVLRLEELKELRGIVDHFKSHLHAWQAIYDHSSPE 3300
            .:..|:|......|...|| .||:.:..|..:.||:||...:.|...|......|:.:||...|.
  Rat  3300 EWRFLLTGGIGLDNPYTNP-CTWLPQKSWDEICRLDELHAFKTIRREFMRLKEGWKKVYDSMEPH 3363

  Fly  3301 KQPLPPPWQDKTTAFEKIIVLKALRPDSVFLAVRLFIAESIGDQYVTPPEFDISKSYADSTALTP 3365
            .:..|..|::|...|:::::::.||||.|...::.||.:.:|..::.||.||::|::.||....|
  Rat  3364 HEIFPEEWENKANDFQRMLIIRCLRPDKVIPMLQEFIIKKLGRSFIEPPPFDLAKAFGDSNCCAP 3428

  Fly  3366 LVFILSPGADPLGSLLAFAEKMGQ-EETFQSISLGQGQGPIATALIKNAQEMGYWVCLQNCHLAA 3429
            |:|:|||||||:.:||.||:..|. .....|:||||||||||..:::.|.:.|.||.|||||||.
  Rat  3429 LIFVLSPGADPMNALLKFADDQGYGGSKLSSLSLGQGQGPIAMKMLEKAVKDGTWVVLQNCHLAT 3493

  Fly  3430 SWMPYLEYLWENMDTFNTTPNFRIWLTAYPTPQFPVTILQNGVKMTNEPPTGLKENLMRSYNSEP 3494
            ||||.||.:.|.:...:|.|:||||||:||:|.|||::||||||||||.|.||:.|::|||..:|
  Rat  3494 SWMPTLEKVCEELSPESTHPDFRIWLTSYPSPNFPVSVLQNGVKMTNEAPKGLRANIIRSYLMDP 3558

  Fly  3495 INDYEFYTGCAKQDRAFTRLLYGICFFHAVVQERRKYGPLGWNIAYGFNESDLQISVLQLSMLLN 3559
            |:|.||:..|.|.:. |.:||||:|||||:||||||:|||||||.|.|||:||:|||.||.|.||
  Rat  3559 ISDPEFFGSCRKPEE-FKKLLYGLCFFHALVQERRKFGPLGWNIPYEFNETDLRISVQQLHMFLN 3622

  Fly  3560 QYDHVPYDAISYLTSECNYGGRVTDNWDRRLIVTILADFCNAQAVTDNRYRFASDDRYILPRKTE 3624
            ||:.:||||:.|:|.||||||||||:||||.:.:||..|...:.|.:.:|:|.|...|.:|...:
  Rat  3623 QYEELPYDALRYMTGECNYGGRVTDDWDRRTLRSILNKFFCTELVENPQYKFDSSGIYFVPPSGD 3687

  Fly  3625 HREILRYLDENLPSLAPPEVYGLHANSGITRDLQTTKTLLDSMILLLGSEAAGSAGAGVSVEQVI 3689
            |:..:.| .:.||.:..||::|::||:.||:|...|:.|.|: |||..|.::||...  |.::|:
  Rat  3688 HKSYIEY-TKTLPLIPDPEIFGMNANADITKDQSETQLLFDN-ILLTQSRSSGSGAK--SSDEVV 3748

  Fly  3690 LDTIKQIEREMPADMDIEAAAEKYPVDYNESMNTVVVQEMERFLKLQKEIRTTCRDLAMGIKGII 3754
            .:....|..::|.:.|||:|..:||..|.:|||||:||||.||.||...||.:|.::...|||::
  Rat  3749 NEVAGDILGKLPNNFDIESAMRRYPTTYTQSMNTVLVQEMGRFNKLLITIRESCINIQKAIKGLV 3813

  Fly  3755 VMTPDLENVMTAMKFNRIPTKWMSKSYPCLKPLGSYVQDLYKRLNWLHDWHHHGKPPTFWLSGFF 3819
            ||:.:||.|::::...:||..||.||||.||||||||.|...||.:|..|:..|.||.|||||||
  Rat  3814 VMSTELEEVVSSILNVKIPGMWMGKSYPSLKPLGSYVNDFLARLKFLQQWYEVGPPPVFWLSGFF 3878

  Fly  3820 FTQAFLTGAMQNFARKYKIPIDTLTFDYDVLKVETKTSPPDDGVYCNGLYLEGARWEWRENTLVE 3884
            |||||||||.||:|||:.||||.|.|||:|:..:...:.|:||||.:||:|:||.|..:...|.|
  Rat  3879 FTQAFLTGAQQNYARKFTIPIDLLGFDYEVMDDKEYKNAPEDGVYIHGLFLDGASWNRKTKKLAE 3943

  Fly  3885 QFPKVLIYAMPVIFFRPVGLVDVVEGSRYRCPLYKTAERKGTLSTTGHSTNYVVPLLLNTHVKAS 3949
            ..||||...:||::.:|....|:.:...|..|||||:||:|||||||||||:|:.::|.:.....
  Rat  3944 SHPKVLYDTVPVMWLKPCKKSDIPKRPSYVAPLYKTSERRGTLSTTGHSTNFVIAMILPSDQPKE 4008

  Fly  3950 HWVKRSVALICQ 3961
            ||:.|.|||:||
  Rat  4009 HWIGRGVALLCQ 4020

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc62BNP_995958.2 DHC_N2 675..1102 CDD:462462 178/426 (42%)
DYN1 <994..3604 CDD:227570 1284/2647 (49%)
AAA_6 1239..1565 CDD:463697 237/325 (73%)
AAA_7 1883..2053 CDD:463698 80/169 (47%)
AAA_8 2249..2510 CDD:463701 119/262 (45%)
AAA_9 2897..3117 CDD:463702 108/220 (49%)
Dynein_C 3657..3960 CDD:465677 146/302 (48%)
Dnah7NP_001406479.1 DHC_N2 756..1161 CDD:462462 178/429 (41%)
DYN1 958..3665 CDD:227570 1325/2736 (48%)
AAA_6 1289..1615 CDD:463697 237/325 (73%)
AAA_8 2310..2572 CDD:463701 119/262 (45%)
AAA_9 2960..3181 CDD:463702 108/220 (49%)
Dynein_C 3719..4019 CDD:465677 146/302 (48%)

Return to query results.
Submit another query.