DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc62B and Dnah11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995958.2 Gene:Dhc62B / 38226 FlyBaseID:FBgn0013811 Length:3964 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4175 Identity:1219/4175 - (29%)
Similarity:1943/4175 - (46%) Gaps:571/4175 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   109 KNKYPELVQAYMHDVHEEFN------------------RLMKVYSMKNILRH--PEFSDEDPA-- 151
            |..|.|.::...|. ||..|                  ||...:|....|.:  |:..||...  
  Rat   588 KRLYDEHMKQIEHG-HEILNKNMPFTSGNIKWARMLLERLQMFWSNFTSLHYLFPDSPDEAAVCQ 651

  Fly   152 ----------QFELPRPDIGFRRPGRTQNYSNFLENRRRIAQ----KLLILQLPLRAILNISVGE 202
                      |||             ::.||.:..|..:..:    :.|:...|:..:|:::.. 
  Rat   652 KYAEMTTLLDQFE-------------SRIYSEWRRNVDKTCEFNLNQPLVKFSPINGLLSVNFD- 702

  Fly   203 LPKLACIF---NYVL----------ATGAMQQQ----LGLGGREAL--------------SYKFY 236
             |||..:.   .|:|          |.|..|::    ..:|..|.|              .|...
  Rat   703 -PKLVAVLREVKYLLMLKKSNIPDSALGIFQKKNIILKHIGNLELLVQGYNKLKQTLLEVEYPLI 766

  Fly   237 HK---YIQNQLDKVNTFLRWT---W-YPKIVQVLRKLMRKR-------VMPMSTWKRSWNAMEAL 287
            .|   .|..||....|:|.|.   | |.:.|||....:.:|       |..:....::|.....|
  Rat   767 EKELGAIDEQLRVAATWLTWQDDFWVYMEKVQVATAELERRVSQTQSNVQTIQQTMQAWAEWPLL 831

  Fly   288 MNREMTNMKIRT-------FEEMYRMCSHP--RTMPMMRMSLEWSEFSSDLDTRPNAWSILRTFA 343
            ..||.......|       |.:.|::....  :...::..:.:.......||    :|.|   :.
  Rat   832 PRRETRREAALTLDDKGDLFAKKYKLIREDGYKIHNLVEENRKLFRADPSLD----SWKI---YV 889

  Fly   344 EIATEISMVGY-----------------RMEP----------LQPQV------------------ 363
            |...:|.:.|:                 :::|          :.|::                  
  Rat   890 EFIDDIVVEGFFQTILHDLDFFLRNTEKQLKPAPFFQAQMLLMPPEIVFKPPLEREAGDGFYNLV 954

  Fly   364 -----------QTLTSMAAYAKVNDYLKIEMND---------------NFLKDVIDKVQNI--IL 400
                       ..:..:||:..:.||    .||               |.:.||||||...  .|
  Rat   955 EAMLCGSFKVSAQMGRVAAHLDIPDY----QNDMDNMLGLAEVRQEIMNRVADVIDKVLEFRSSL 1015

  Fly   401 RTYQEVIQYVEGFRDKYYALYSWQER--DALNQFLSEPH-------------------EFEEYFA 444
            .||.                |.|.:.  :.|.|||...|                   ..|::..
  Rat  1016 ETYS----------------YLWVDDRVEILRQFLLYGHAVPSEEIDAPAGEDILQSPTLEQFKE 1064

  Fly   445 RIDMYYG-FIQMLRSEPATEYFVMAVIHNEPAIFGLRTLAENLIHEITTIIIREHIKAEVDICDE 508
            :||:|.. ::||.:.:....:.....|...|  |.|..|  |:|.:.:.:.....::..||...|
  Rat  1065 QIDIYEALYVQMSKFDDFRVFNSWFKIDMRP--FKLSML--NVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSE 1125

  Fly   509 FEK-IKYRALEIPKSTEE-----LLESAEYMIHVKKDKIAELTDRIQYCLQVGTNIVELTEMSKY 567
            .:. ||.....:.:...|     |::...:::.|:..:.|  ||             ||.|..| 
  Rat  1126 LQGFIKQTNAGLQRQPHEGDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRA--TD-------------ELFEPLK- 1174

  Fly   568 HFDLTIKTINWIKDINDICDYNASQQEQFKFTFEE--HLQEVIKKL------------NSDIDEL 618
                  :||..::      .|.....||.....||  ...|..||:            |:::..|
  Rat  1175 ------ETIMLLE------SYGQKMPEQVYAQLEELPERWETTKKIAAVVRHEVSPLQNAEVTLL 1227

  Fly   619 LPKLTVIDDMSRP--DKFR----------DSYIILQNFIDQLKTFDDYVAWINKEEKLFKVALTE 671
            ..|..:.|:....  ::||          :.|.:|.....:|:..::.|..:....:||:|.|.|
  Rat  1228 RKKCILFDEKQAEFRERFRSYAPLGFKAENPYSVLDKANQELEALEEEVVQMQNCARLFEVVLPE 1292

  Fly   672 YPKLDIIKTFVYPFAELMKCCIEWQRYLSVWNDGPFEYLEPQFVERTTDDYLKEFQKNQKYYRVK 736
            |.::...:..|....||....:..:|.:..|.:..:..:..:.::.....:.||.....|..||.
  Rat  1293 YKQMKQCRREVRLLKELWDIIVYVRRSIDNWTETRWRQVNMEQMDLELRRFAKEIWSLDKAVRVW 1357

  Fly   737 IKQDLIDNPVCKFKGQTEDPDPAKHPVPLRLCTSMIQSIKDFTTGVFIVNTMCNPALRKRHWKEM 801
            .....::.                             ::||.||.:..|..:.|||||.|||:::
  Rat  1358 DAYSGLEG-----------------------------TVKDMTTSLRAVAELQNPALRDRHWQQL 1393

  Fly   802 SEIAGFDVTPDAGTTLRKILNSGLDPILDQFEIISIGANKELQLWNALQAMIKEWETRVFPYGPY 866
            :...|...:.:..|||..:|...|..:.:....|...|.|||.....:..:...||...|.|..:
  Rat  1394 TNAIGVRFSINDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVITDVSHTWEALEFSYEVH 1458

  Fly   867 KETGVQILSSLDDIQALLD-----------------------DHI------LKTLVMRGSAFMKP 902
            ..||..:|.|.:.:...|:                       .|.      |:||:.  |.:::.
  Rat  1459 HRTGTPLLKSDEQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLLQ--SKYVEY 1521

  Fly   903 CEEEVRAWYEKIMRVNETLDQWGKVQANYLYLLPIF-SSKDIVAQMPEEGRLFVIVEQTYTRNMG 966
            ..::|.:|..|:...:..:..|.:||..:.:|..|| .|:||..|:.|:.:.|..|:..:     
  Rat  1522 FIDQVLSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDAEF----- 1581

  Fly   967 LVLRQPLVMETAPVSGLLESLQKAN--ELLEDI-------ATGVSNYLEKKRLYFPRFFFLANDE 1022
                :.|:.:||.:..:||:..:.:  |.|:|.       ...::.|||.||:.|.||:|:::.:
  Rat  1582 ----KELMFKTAKIKNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTFSRFYFISSAD 1642

  Fly  1023 MLEILSETKDPLRVLPHLSKCFEGINSLEFDAAKNV-----LAMISSDKETIEFIEQVSTAAAG- 1081
            :|::||:...|.:|..||.|.|:.|:.|:|:....|     :.|.|.:||.:.|       .|| 
  Rat  1643 LLDLLSKGAQPKQVTRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSF-------QAGC 1700

  Fly  1082 ---GSVEKWLIGVEDEMLKAVRYQNELSFAHYPKVKRHEWVLEWPQMTVLAISQVYWASRVHGCL 1143
               |.||.||:.:|..|.:.||.....:.|.|.:..|..|:.::|....|..||::|.:.|....
  Rat  1701 ECIGHVESWLLQLEQTMKETVRLAIAEAIAAYEEKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTTDVGIAF 1765

  Fly  1144 RRTFGGNMTIMMNFFQELSKELNDIVTLVRSPKISNLNRITIKSLIVIDVHAKDVSEDLIKNKVS 1208
            .|...|..|.:.:|.::...:||.::||:.. ::|..:|..:.::..|||||:||...||..||.
  Rat  1766 SRLEEGYETALKDFHKKQISQLNTLITLLLG-ELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKLISQKVV 1829

  Fly  1209 SEFDFQWLAQMRYYWEDDKTW--VRIINATVPFANEYLGNSDRLVITPLTDRCYRTLVGAYQLHL 1271
            |...|.||:|:|:.||:.:..  |.|.:|...:..||||||.||||||||||||.||..:..|.:
  Rat  1830 SPRAFTWLSQLRHEWEESRKHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLTM 1894

  Fly  1272 NGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCKVFNCSDGLDYKAMGKFFKGLASCGAWACFDEFNRIEL 1336
            :|||.||||||||||||||.:||.:...|||||:.:||:::|..:|||...|||.||||||||.:
  Rat  1895 SGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWGCFDEFNRIAV 1959

  Fly  1337 EVLSVVAQQILLIIQAVRSNATKFMFEGTELTLNPACYVCITMNPGYAGRSELPDNLKVLFRSVA 1401
            |||||||.|:.:|..|:||...:|:|.|..:.|.|:..:.||:|||||||:|||:|||.|||..|
  Rat  1960 EVLSVVAVQVKMIHDAIRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPENLKALFRPCA 2024

  Fly  1402 MMVPDYAMIGEISLYSYGFVDARKLAVKIVTTYRLCSEQLSSQNHYDYGMRAVKTVLSACGNIKK 1466
            |:.||..:|.||.|.:.||||||.||.|.::.|.||.|.||.|:|||:|:||:|:||...|::|:
  Rat  2025 MVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKR 2089

  Fly  1467 QYPDEVEDILLLRSLIDVNLPKFLSFDVPLFEGIISDIFPGIKLPHIDYSLVESEFKRVCLEEVL 1531
            ...:..||.:|:|:|.|.|:||.::.|||:|.|::||:||.:.:|.......|...|:..||..|
  Rat  2090 GDKNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQMVKQSTLELRL 2154

  Fly  1532 EPAPSFLLKVIQTYEMIIVRHGFMLVGEPLAGKSKTLQVLAKVLSALKIKAPQKSNYFQHVQMGI 1596
            :|..||:|||:|..|::.|||...:||....||||.|:.|.:....:|.|.....          
  Rat  2155 QPEESFILKVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVNMKQKPVWND---------- 2209

  Fly  1597 MNPKSITMNQLYGSFDPISYEWTDGLVAKIFRDFAMTPTPDRKWVIFDGPVDAVWIENMNTVLDD 1661
            :|||::|.::|:|.....:.||.|||::.|.|:.|........|::.||.:|.:|||::|||:||
  Rat  2210 LNPKAVTTDELFGFIHHATREWKDGLLSSILREQANLTHDGPTWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDD 2274

  Fly  1662 NKKLCLTSGEVITMSNEMSMVFEVMDLAQASPATVSRCGMIYMEPSTLGWRAFAKSWL------- 1719
            ||.|.|.|.|.:.::..|.::||...|..|:||||||.|::|:.|..|||..:..||:       
  Rat  2275 NKVLTLASNERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNPYVASWIDRRRHQS 2339

  Fly  1720 KKADPRWADEEGVPYVMALMQWLLP-----PCQTFVRRFCSQFIKPGEFNCMLTTFDLFDMQIAE 1779
            :||:.....::.:|..:..::....     |..:.|:..|:.      ..|:||.          
  Rat  2340 EKANLTILFDKYIPVCLEKLRTSFKAITSVPESSLVQTICTL------LECLLTP---------- 2388

  Fly  1780 AIEENPEDYQKYLQTYFQAAILFALIWGVGGVLDTASREKFDVFLKKLWDTDPPPPEPLGKMEIT 1844
              |..|.|..|  :|| :...:||.:|..||.|.......:.....:.|..:        ...:.
  Rat  2389 --ENIPSDSPK--ETY-EVYFVFACVWTFGGTLLRDQLSDYQADFSRWWHKE--------MKAVK 2440

  Fly  1845 PPTEGLLVDYVFLYKQRGAWRYWPDLAKR--MDVEETKTGVIVPTVDTARYIHLLKMHVEHKKRM 1907
            .|::|.:.||...:|.: .:..|.|...:  ||.:.....|:|.|.:|.|..:..::.:...|.:
  Rat  2441 FPSQGTIFDYYLDHKTK-KFLPWTDKVPQFTMDADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPL 2504

  Fly  1908 LLVGPTGTGKTVYVQNYLMNKLDKEVFETGFITFTVMISANQCQDLLISKLQKWKRGIYGPPKGM 1972
            :|||..|.||||::.:.|.:  ..|.:....:.|....::...|.:|...|:|.....|||....
  Rat  2505 MLVGNAGVGKTVFLSDTLAS--ISEDYIVSRVPFNYYTTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNK 2567

  Fly  1973 QSVLFVDDMNMPVKEVYGAQPPLELLRQFFDYGHVYDLKDSSKVYIHNVLI-------MAACGLP 2030
            :.|.|:||:|||..::||...|..||||..||||.||.        |.|::       ..||..|
  Rat  2568 KLVYFIDDLNMPEVDLYGTVQPHALLRQHIDYGHWYDR--------HKVMLKEIRNCQYVACMNP 2624

  Fly  2031 GGSRQDVYARFLNHFNVYSINTFSDDSMFRIFLNVALNGFRRAGHGQDVFVVTNQIVSATQSIYK 2095
            ......|..|...||.|.:.|..|.|::..|:..:.....::......|......::.||.:.::
  Rat  2625 MAGSFTVDPRLKRHFTVLAFNFPSLDTLTTIYGQIFSFYLQQQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQ 2689

  Fly  2096 SVQSEIRATPSKSHYIFNLRDISRVVTGCTLVRKESVSDKKIFVRVWYHEAMRVFYDRLVDDVDR 2160
            ::......|..|.||.|||||:|.:..|......|.:...:...|:|.||..||:.|||||..|.
  Rat  2690 TMAENFVPTAIKFHYNFNLRDLSNIFQGILFASPECLKCPEDLARLWLHETSRVYGDRLVDANDS 2754

  Fly  2161 KWMFDKLNECLKANFKDKVETVFERYCVQGPDEAVFTMEAASNILFGVYFDEDSVPDERRYEEVP 2225
            .....|:.|.....||             |.|......:..      ||....|..::..||.|.
  Rat  2755 DLFQRKMLEAAHKYFK-------------GADANTLQQQPL------VYCHFASGREDPCYEPVK 2800

  Fly  2226 SVEVFLNLALTSLDDYNSTRRNKMDITLFTFALQHLNRICRIISIQGASALIIGLGGSGRQSLTK 2290
            ..|....:....:.:||.. .::|.:.||..|:||:.||.||:......||::|:||||:|||::
  Rat  2801 DWEGLKAVLTEMMGNYNEL-HSEMHLVLFEDAMQHVCRISRILRTPQGHALLVGVGGSGKQSLSR 2864

  Fly  2291 LATNMVQTSFFQPEITKNYGANDWHDDIKAILKEAGGMNKHTTFLITENQIKMELFLQDIDCLLN 2355
            ||..:.....||..:|:.||..|...|:..:....|..|..|.||:|:..:..|.||..|:.||.
  Rat  2865 LAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFLLTDAHVLDESFLVLINDLLA 2929

  Fly  2356 QGEVPNIFPIDEKQEVLEMVRLAAQGGNRNIDVSALQVFSFFVDRCKQKLHMILSFSPIGDALRT 2420
            .|::|.:|..::..:::..:|...:|  ..|..|....::||:.|.:.:|.|:..|||:|..||.
  Rat  2930 SGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRG--LGITDSRENCWAFFLARVRLQLKMVFCFSPVGHTLRV 2992

  Fly  2421 RVRLYPSLVNCCTIDWYDSWPEEALQMIAKMSLVDVNVPSEDIKLAIMDTCQYFHTTAARSTRAF 2485
            |.|.:|:||||..|||:.:||:|||..:::..:.::.......|.:|.....|.||:....:..:
  Rat  2993 RARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFIEEIEGIEPQHKDSISLFMAYVHTSVKEVSAWY 3057

  Fly  2486 CQMTGRHIYQTNASFIELIRSFQTLIERKQSETMLAKMRYIGGLDTLAQAAAAISIMQRDLNALQ 2550
            .|...|:.|.|..||:|.|..|::|:::|:.|....|.....|:..|...|:.:..::..|.:.:
  Rat  3058 YQNERRYNYTTPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGIQKLQTTASQVGNLKARLASQE 3122

  Fly  2551 PKLVALAESSRKMMLEINKETLAASAAAEQVKRDE--------EVASVQAEAAQVLKQDCERDLA 2607
            .:|....:.:..::.:|..:|       |:|.|::        :||::|.||:| .:::||.||.
  Rat  3123 AELQLRNQDAEALITKIGLQT-------EKVSREKAIADAEERKVAAIQTEASQ-KQRECEADLL 3179

  Fly  2608 KAIPVLEDALAALNTLKPADITLVKSMKNPPPVIKLVMAAVCVIKGIPPERIPDPASGKMVQDYW 2672
            ||.|.|..|.||||||...::|.:|:..|||..:..|.|||.|:.. |..|:|...|       |
  Rat  3180 KAEPALVAATAALNTLNRVNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLA-PRGRVPKDRS-------W 3236

  Fly  2673 GPSKRLLGEM-NFLPGLKEFDKDNIPTEIVKRIHKEFIPNKDFDPKVVAKASSAAKGLCQWIIAM 2736
            ..::..:|:: :||..|..:||::||...:|.::::::.:.:|:|.::...|.||.|||.|:|.:
  Rat  3237 KAARIFMGKVDDFLQALINYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLCAWVINI 3301

  Fly  2737 MMYDEVAKVVAPKKAKLAGAEKEYADTMEFLAQKRALALALEEKVALLNIELDKANAEMQKTEEH 2801
            :.:.||...|.||:..||....:.|...|.|...|...:.|:..:..|....:||.||..:.:|.
  Rat  3302 IKFYEVYCDVEPKRQALAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEKVRCQEE 3366

  Fly  2802 AESCRNKLLRAEALIGGLGGEKSRWNKAAEDLQELYDHLPGDVLISCGIIAYLSAVNLQYRSECV 2866
            .......:..|..|:..|..||.||.::.:..:.....|.||||::...::|:.:...|||.|.|
  Rat  3367 VNQTNKTIDLANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQYRQELV 3431

  Fly  2867 K-DWF----KKVTDLKIPCSSHYSITDVLGLEVTIQNWQLDGLPNDEFSSENAIISANSSRYSLF 2926
            . .|.    :||:   ||.:....:...|..:.||..|...|||:|..|:|||.|..:..|:.|.
  Rat  3432 DCKWIPFLQQKVS---IPIAEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRWPLM 3493

  Fly  2927 IDPQAQANNWLKNMERKNRLNCVKFNQSNYMKVIAEALEYGTPVIIENVQEELEVPLDPILMRQT 2991
            ||||.|...|:||....: |......|..::..|..||.:|..::|||::|.::..|.|:|.|.|
  Rat  3494 IDPQQQGIKWIKNKYGPD-LKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLGRNT 3557

  Fly  2992 FVQGGIKHISLGESVVPVNPNFRLYMTCNLRNPHFLPETFNKVTVINFALTQNALMDQLLSIVVA 3056
            ..:|  |:|.:|:.....|.||||.:...|.|||:.||...:.|::||.:|::.|..|||:.||:
  Rat  3558 IKKG--KYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAEVVS 3620

  Fly  3057 KERPDLQELRITLTTEAAANKGALRDAENMILKTLSAG-GDILENEAAIQILADSKGLSKDIVEK 3120
            .|||||:.|::.||......|..||..|..:|..|||. |..|::...::.|..:|..:.:|..|
  Rat  3621 VERPDLERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEIEHK 3685

  Fly  3121 QEAAKETVAKIEAFRLNYKPVAVHSSILYYSITDLPNIDPMYQFSLNWYINLYMYSIETANKSKD 3185
            ...|:|...||...|..|:|||..:|::|:.|:||..|:|:|||||..:..|:..:||.|:|.:|
  Rat  3686 VIEARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADKVED 3750

  Fly  3186 LPRRIKFLVDGFTRNLYNNVCRSIFEKDKLLYSFILTARILLGTGQVEMRHFAHLVTNAKESTNI 3250
            ...||..|::..|...:.:..:::||||||.:...:..:|||...::.......|:....|.|..
  Rat  3751 TQERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTVEHTYS 3815

  Fly  3251 PPNPDPTWITETVWLNVLRLEELKELRGIVDHFKSHLHAWQAIYDHSSPEKQPLPPPWQDKTTAF 3315
            .|   ..::|...|..|..:..::|.||:....:.....|:...:...|||:.||..|: |.:..
  Rat  3816 SP---VDFLTAQSWSAVKAVALMEEFRGLDRDVEGSAKQWRKWVESECPEKEKLPQEWK-KKSLI 3876

  Fly  3316 EKIIVLKALRPDSVFLAVRLFIAESIGDQYVTPPEFDISKSYADSTALTPLVFILSPGADPLGSL 3380
            :|:|:|:|:|||.:..|:|.|:.|.:|.:||.....|:.|::.:|:..||:.||||||.|.|..|
  Rat  3877 QKLIILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFILSPGVDALKDL 3941

  Fly  3381 LAFAEKMG---QEETFQSISLGQGQGPIATALIKNAQEMGYWVCLQNCHLAASWMPYLEYLWENM 3442
            ....:::|   ....|.::||||||..:|...::.|...|:||.|||.||.|.|:..||.|.|..
  Rat  3942 EVLGKRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQELVAEMALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKWLGTLEKLLEKF 4006

  Fly  3443 DTFNTTPNFRIWLTAYPTPQ-----FPVTILQNGVKMTNEPPTGLKENLMRS-YNSEPINDYEFY 3501
            .. .:..::|::|:|...|.     .|..:|:|.:|:|||||||:..||..: ||.    |.:..
  Rat  4007 SQ-GSHRDYRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYNF----DQDTL 4066

  Fly  3502 TGCAKQDRAFTRLLYGICFFHAVVQERRKYGPLGWNIAYGFNESDLQISVLQLSMLLNQYDHVPY 3566
            ..|:| |:.|..:|:.:|:||..|..|.::||.||:.:|.|:..||.|....|...|....|||:
  Rat  4067 EMCSK-DQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLEANPHVPW 4130

  Fly  3567 DAISYLTSECNYGGRVTDNWDRRLIVTILADFCNAQAVTDNRY---RFASDDRYILPRKTEHREI 3628
            :.:.||..|..|||.:||.|||:|....|.:|.|...:.|...   .||:      |..:::...
  Rat  4131 EDLRYLFGEIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDELMLAPGFAA------PPYSDYSGY 4189

  Fly  3629 LRYLDENLPSLAPPEVYGLHANSGITRDLQTTKTLLDSMILLLGSEAAGSAGAGVSVEQVILDTI 3693
            .:|:::.||. ..|.:||||.|:.|.....|:..|..:::.:....|..:...|.|.|..:.:.:
  Rat  4190 HQYIEDMLPP-ESPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEMQPRNAVSNEEQGQSTEDKVKNIL 4253

  Fly  3694 KQIEREMPADMDIEAAAEKYPVDYNESMNTVV-VQEMERFLKLQKEIRTTCRDLAMGIKGIIVMT 3757
            ..|...:|.:.::....:|.|   |.|...:| .||.||...|.:|||.:.:.|.:|:||.:.::
  Rat  4254 DDILERLPEEFNMAEIMQKNP---NRSPYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQHLDLGLKGELTLS 4315

  Fly  3758 PDLENVMTAMKFNRIPTKWMSKSYPCLKPLGSYVQDLYKRLNWLHDWHHH-GKPPTFWLSGFFFT 3821
            ||:|..::|:.::|:|..|...:||....|..:..||..|...|..|... ..|...||||.|..
  Rat  4316 PDVETQLSALSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLTLPAVVWLSGLFNP 4380

  Fly  3822 QAFLTGAMQNFARKYKIPIDTLTFDYDVLKVETKTS---PPDDGVYCNGLYLEGARWEWRENTLV 3883
            |:|||..||..|||.:.|:|.:....||.| :||..   ||.:|.|.:||:||||||:.:...||
  Rat  4381 QSFLTAIMQTMARKNEWPLDRMCLTIDVTK-KTKEDYGHPPREGAYLHGLHLEGARWDIQSGALV 4444

  Fly  3884 EQFPKVLIYAMPVIFFR--PVGLVDVVEGSRYRCPLYKTAERKGTLSTTGHSTNYVVPLLLNTHV 3946
            :...|.|...|||||.:  |....:|...  |.||:|||..|         ...||....|.:..
  Rat  4445 DARLKELTSTMPVIFAKAIPADRQEVKHA--YECPVYKTKAR---------GLTYVWTFRLRSKD 4498

  Fly  3947 KASHWVKRSVALICQ 3961
            :.:.||...|||:.:
  Rat  4499 RIAKWVLAGVALLLE 4513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc62BNP_995958.2 DHC_N2 675..1102 CDD:462462 110/474 (23%)
DYN1 <994..3604 CDD:227570 893/2672 (33%)
AAA_6 1239..1565 CDD:463697 170/325 (52%)
AAA_7 1883..2053 CDD:463698 55/176 (31%)
AAA_8 2249..2510 CDD:463701 88/260 (34%)
AAA_9 2897..3117 CDD:463702 80/220 (36%)
Dynein_C 3657..3960 CDD:465677 100/309 (32%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..791 CDD:462457 42/218 (19%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:462462 108/472 (23%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 908/2734 (33%)
AAA_6 1862..2188 CDD:463697 170/325 (52%)
MT 3095..3439 CDD:463699 102/359 (28%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:465677 100/309 (32%)

Return to query results.
Submit another query.