DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc62B and Dnah3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995958.2 Gene:Dhc62B / 38226 FlyBaseID:FBgn0013811 Length:3964 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414569.1 Gene:Dnah3 / 117249 RGDID:1305855 Length:4069 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4174 Identity:1724/4174 - (41%)
Similarity:2489/4174 - (59%) Gaps:406/4174 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    63 QPEPDMRLLPQSHYEDNLRREVRKIVV-----PPMLRRTEAKI-LSF--------ASERLKNKY- 112
            |..|::..||.|..|:  ..|:.|.|:     ||:::||...: :.|        .|:.:.|.| 
  Rat    24 QARPELPPLPVSANEE--PSEIYKTVMSHSFYPPLMQRTSWTLAVPFKEQDQHRGPSDSIGNNYS 86

  Fly   113 --------PELVQAYM-------------------HDVHEEFNRLMKV----------------- 133
                    .:||:.|.                   ....|...:.||:                 
  Rat    87 LTARDMKLKDLVKVYQPVTISVPRDKASQGLPLASKTSTEPSKKKMKLCIKGKDDATGTPLACKH 151

  Fly   134 ---YSMKNI----LRHPEFSDEDPAQFELPRPDIGFRRPGRTQNYSN------------FLENRR 179
               .:|||.    |.:||.....|.|    :.|:..::....::..|            :|.|..
  Rat   152 SSSSNMKNATDSSLTYPESRPMSPEQ----QMDVMLQQEMEVESKENKPSELDLERYYYYLTNGI 212

  Fly   180 R---IA----------QKLL---ILQLPLRAILNISVGELPK-------LACIFNYVLATGAMQQ 221
            |   ||          .||:   :|..|....|.:|:....:       :..|.:|:|.....::
  Rat   213 RKDMIAPEDEDVMVRIYKLIPKTLLTTPALEPLQVSLRSEKESDYYYSLMKSIVDYILMDPLEKK 277

  Fly   222 QLGLGGREALSYKFYHKYIQNQLDKVNTFLRWTWYPKIVQVLRKLMRKR---VMPMS-TWKRSWN 282
            :|.:   :::...|.|:.|:..:         .|: .|.|.::|...:.   |.||. |.|..|.
  Rat   278 RLFI---KSIPRLFPHRVIRAPV---------PWH-NIYQSVKKWNEEHLHTVNPMMYTLKELWF 329

  Fly   283 AMEALMNREMTNMK-IRTF---------------EEMYRMCSHPRTMPMMR-----------MSL 320
            :       |..::: |||.               ||:.:.|...|.:.:.:           ...
  Rat   330 S-------EFKDLRFIRTADLLAGKLPLLPHEYQEEIQKHCLDARQVLLSKWIPTCAQLFVTQKE 387

  Fly   321 EWSEFS--SDLDTRPNAWSILRTFAEIATEISMVGYRMEPLQPQVQTLTSMAAYAKV----NDY- 378
            .|..|:  :|.|:..|   |...||.:|:.:|:   ::..|  .:::|..:.::..:    ||: 
  Rat   388 RWVHFAPKNDYDSSRN---IEEYFASVASFMSL---QLREL--VIKSLGDLVSFFMIHKDGNDFN 444

  Fly   379 ---------------LKIEMND------------------NFLKDV-----IDKVQNII---LRT 402
                           :|:|::|                  :||:.:     |.||::|:   |:.
  Rat   445 EPYQEMDFFIPQLITIKLEVDDPVIVFNPTFDDCWQLIKESFLEIIKNSNGIPKVESILFPDLKG 509

  Fly   403 YQEVI---------------QYVEGFR------DKYYALY--------SWQERDALNQFLSEPHE 438
            |..::               |.:|.|.      .||..:|        :..|:| ::.||::.|:
  Rat   510 YNMILGTVDPEENLVADFLNQTLEVFNKNQVGPHKYLNVYKKYDDLLDNTAEQD-ISTFLNDKHD 573

  Fly   439 FEEYFARIDMYYGFIQMLRSE--------PATEYFVMAVIHNEPAIFGLRTLAENLIHEITTIII 495
            .:::...|:.    |:..|:|        |...:.:.||:.|.    .|...|:||...:....:
  Rat   574 IDDFVTSINS----IKKRRNEIASMHITVPLAMFCLDAVLLNH----DLCERAQNLKDRLIQYQV 630

  Fly   496 REHIKAEVDICDEFEKIKYRALEIPKSTEELLESAEYM-------IHVKKDKIAELTDRIQYCLQ 553
            ..:.:....||:::..|..:..|.|.:|.||:...||:       :...:.::.:.::|:::   
  Rat   631 DVNRETNTSICNQYSTIADKVSETPANTAELVALIEYLKKSSDVTVFKLRRQLRDASERLEF--- 692

  Fly   554 VGTNIVELTEMSKYHFDLTIKTINWIKDINDICDYN----ASQQEQFKF-------TFEEHLQEV 607
                :::..::......|......|...|.|:.:.:    .|:::|.:.       .||..|:..
  Rat   693 ----LMDYADLPNEDIKLNSNLFLWPDQIEDVFENSRNLLLSKRDQAEMDLIKRCSEFETRLEGY 753

  Fly   608 IKKLNSDIDELLPK---LTVIDDMSRPDKFRDSYIILQNFIDQLKTFDDYVAWINKEEKLFKVAL 669
            .|:|     |:..|   :|..:..:..:|..|   :.:|....|..|:    .|||||:|.:...
  Rat   754 SKEL-----EMFRKREVMTTEEMKNNVEKLND---LSKNLDLALTEFE----LINKEEELLEKEK 806

  Fly   670 TEYPKLDIIKTFVYPFAELMKCCIEWQRYLSVWNDGPFEYLEPQFVE-------RTTDDYLKEFQ 727
            :.:|.|.::.....|:.:|.....|:......|.:||...|..:.:.       |||        
  Rat   807 SSFPLLQVLMVNKIPYEQLWVTAYEFSTKSEEWMNGPLFLLNAEEIAEDIGNMWRTT-------- 863

  Fly   728 KNQKYYRVKIKQDLIDNPVCKFKGQTEDPDPAKHPVPLRLCTSMIQSIKDFTTGVFIVNTMCNPA 792
                   .|:.:.|||                 .|.|.||..::...|:.|...:.::...|||.
  Rat   864 -------YKLTKTLID-----------------VPAPRRLAENVKLKIEKFRQHIPVLTIACNPG 904

  Fly   793 LRKRHWKEMSEIAGFDVTPDAGTTLRKILNSGLDPILDQFEIISIGANKELQLWNALQAMIKEWE 857
            ::.|||:::|:|.|:::.|...|.|..:|..|....:|:.|.|...|:||..|...|:.|..:|.
  Rat   905 MKDRHWQQISDIVGYEIKPTETTCLANMLEFGFSKFVDKLEPIGAAASKEYSLEKNLEKMKSDWV 969

  Fly   858 TRVFPYGPYKETGVQILSSLDDIQALLDDHILKTLVMRGSAFMKPCEEEVRAWYEKIMRVNETLD 922
            ...|.:..|::|...||.::||||.|||||::||..|.||.|:||.|.|.|.|.||::||.|.||
  Rat   970 NMCFSFVKYRDTDTSILCAVDDIQLLLDDHVIKTQTMCGSVFIKPIEAECRKWEEKLVRVQENLD 1034

  Fly   923 QWGKVQANYLYLLPIFSSKDIVAQMPEEGRLFVIVEQTYTRNMGLVLRQPLVMETAPVSGLLESL 987
            .|.|.||.:|||.|||||:||:|||||||:.|.||:..:...|...:....|:..|....:.|.|
  Rat  1035 AWLKCQATWLYLEPIFSSEDIIAQMPEEGKKFGIVDSYWKSLMAQAVNDTRVLVAADQPRMTEKL 1099

  Fly   988 QKANELLEDIATGVSNYLEKKRLYFPRFFFLANDEMLEILSETKDPLRVLPHLSKCFEGINSLEF 1052
            |:||.|||||..|:::|||||||:|||||||:|||:|||||||||||||.|||.||||||..|||
  Rat  1100 QEANVLLEDIQRGLNDYLEKKRLFFPRFFFLSNDELLEILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEF 1164

  Fly  1053 DAAKNVLAMISSDKETIEFIEQVSTAAAGGSVEKWLIGVEDEMLKAVRYQNELSFAHYPKVKRHE 1117
            .....:..||||:||.:.||:.:....|.|.|||||..||..|:.::|...|.....|.||.|:.
  Rat  1165 TDNLEIKGMISSEKEIVPFIQTIYPVKAKGMVEKWLQQVEQVMVASMRQVIEDGIEAYLKVPRNA 1229

  Fly  1118 WVLEWPQMTVLAISQVYWASRVHGCLRRTFGGNMTIMMNFFQELSKELNDIVTLVRSPKISNLNR 1182
            |||:||...|:.:|.::|...|...|..      ..:.:|.::.:.::..||.|||. |:|:..|
  Rat  1230 WVLQWPGQVVICVSSIFWTREVSEALVE------YTLTDFLKKSNDQIAQIVELVRG-KLSSGAR 1287

  Fly  1183 ITIKSLIVIDVHAKDVSEDLIKNKVSSEFDFQWLAQMRYYWEDDKTWVRIINATVPFANEYLGNS 1247
            :|:.:|.||||||:||...|.::.::|..||||::|:||||.:....|::|.....:..||||||
  Rat  1288 LTLGALTVIDVHARDVVAKLEQDNINSLNDFQWISQLRYYWVESNVQVQMITTQALYGYEYLGNS 1352

  Fly  1248 DRLVITPLTDRCYRTLVGAYQLHLNGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCKVFNCSDGLDYKAM 1312
            .|||||||||||||||:||.:|:|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
  Rat  1353 PRLVITPLTDRCYRTLMGALKLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKAM 1417

  Fly  1313 GKFFKGLASCGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILLIIQAVRSNATKFMFEGTELTLNPACYVCI 1377
            ||||||||..|||||||||||||:|||||||||||.|.||:......|:||||||:|||.|.|.|
  Rat  1418 GKFFKGLAQAGAWACFDEFNRIEVEVLSVVAQQILSIQQAIIRKLKMFIFEGTELSLNPTCAVFI 1482

  Fly  1378 TMNPGYAGRSELPDNLKVLFRSVAMMVPDYAMIGEISLYSYGFVDARKLAVKIVTTYRLCSEQLS 1442
            |||||||||:|||||||.|||:|||||||||:||||||||.||:|:|.||.|||.||||||||||
  Rat  1483 TMNPGYAGRAELPDNLKALFRTVAMMVPDYALIGEISLYSMGFLDSRSLAQKIVATYRLCSEQLS 1547

  Fly  1443 SQNHYDYGMRAVKTVLSACGNIKKQYPDEVEDILLLRSLIDVNLPKFLSFDVPLFEGIISDIFPG 1507
            ||:||||||||||:||:|.||:|.:||:|.|.:||||:|:||||.|||:.|||||:|||||:|||
  Rat  1548 SQHHYDYGMRAVKSVLTAAGNLKLKYPEENESVLLLRALLDVNLAKFLAQDVPLFQGIISDLFPG 1612

  Fly  1508 IKLPHIDYSLVESEFKRVCLEEVLEPAPSFLLKVIQTYEMIIVRHGFMLVGEPLAGKSKTLQVLA 1572
            :.||..||.:.............|:|.|.|:.|:||.|||::||||:|:||:|:.||:...:|||
  Rat  1613 VVLPKPDYEVFLEALNNNIRNMKLQPVPWFIGKIIQIYEMMLVRHGYMIVGDPMGGKTSAYKVLA 1677

  Fly  1573 KVLSALKIKAPQKSNYFQHVQMGIMNPKSITMNQLYGSFDPISYEWTDGLVAKIFRDFAMTPTPD 1637
            ..|..|. .|.|...:  .|:..|:|||:|||.||||.||.:|:|||||::|..||:.|.:.|.:
  Rat  1678 AALGDLH-AANQMEEF--AVEFKIINPKAITMGQLYGYFDAVSHEWTDGVLANAFREQASSVTDE 1739

  Fly  1638 RKWVIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLTSGEVITMSNEMSMVFEVMDLAQASPATVSRCGMI 1702
            |||:||||||||||||||||||||||||||.|||:|.||::||::||..||.|||||||||||||
  Rat  1740 RKWIIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSSKMSLIFEPADLEQASPATVSRCGMI 1804

  Fly  1703 YMEPSTLGWRAFAKSWLKKADPRWADEEGVPYVMALMQWLLPPCQTFVRRFCSQFIKPGEFNCML 1767
            ||||..|||:....|::....| ..::|....|..:..||:.||..|.|......::....:...
  Rat  1805 YMEPHQLGWKPLKDSYMDTLPP-CLNKEHTELVEDMFTWLVQPCLDFNRLHSKFVVQTSPIHLAF 1868

  Fly  1768 TTFDLFDMQIAE--AI-EENPEDYQ----KYLQTYFQAAILFALIWGVGGVLDTASREKFDVFLK 1825
            :...|:...:.|  || ||..|.|:    :.:..:.|...||:|:|.|.|.::..||:|||||.:
  Rat  1869 SMMRLYSSLLDELWAIQEEEMEIYEGLSSQQIFLWLQGLFLFSLVWTVAGTINAESRKKFDVFFR 1933

  Fly  1826 KL---WDTDPPPPEPLGKMEITP----PTEGLLVDYVFLYKQRGAWRYWPDLAKRMDVEET---- 1879
            .|   .|...|.|:   .:::|.    |..|.:.|:.||.:..|.|..|.:...:  .|||    
  Rat  1934 NLIMGMDDHNPRPK---SVKLTKNNIFPERGSIYDFYFLKQGGGHWNAWTEYITK--EEETIPAN 1993

  Fly  1880 --KTGVIVPTVDTARYIHLLKMHVEHKKRMLLVGPTGTGKTVYVQNYLMNKLDKEVFETGFITFT 1942
              .:.:|:||::|||....||.:::|:..:|.||||||||:....|:|:: |.|.|::..||.|:
  Rat  1994 AKVSDLIIPTMETARQTFFLKTYLDHEIPILFVGPTGTGKSAITNNFLLH-LPKNVYQPNFINFS 2057

  Fly  1943 VMISANQCQDLLISKLQKWKRGIYGPPKGMQSVLFVDDMNMPVKEVYGAQPPLELLRQFFDYGHV 2007
            ...||||.||:::|||.:.::|::|||.|.::|:||||:|||.|||||||||:|||||:.|:|:.
  Rat  2058 ARTSANQTQDIIMSKLDRRRKGLFGPPIGKKAVVFVDDLNMPAKEVYGAQPPIELLRQWIDHGYW 2122

  Fly  2008 YDLKDSSKVYIHNVLIMAACGLPGGSRQDVYARFLNHFNVYSINTFSDDSMFRIFLNVALNGFRR 2072
            :|.||::::.|.:||::.|.|.|||.|.|:..||..|.|:.|||.|.|:.:.:||.::|...|  
  Rat  2123 FDKKDTNRLDIVDVLLVTAMGPPGGGRNDITGRFTRHLNLLSINAFEDEILTKIFSSIADWHF-- 2185

  Fly  2073 AGHGQDVFVVT--NQIVSATQSIYKSVQSEIRATPSKSHYIFNLRDISRVVTGCTLVRKESVSDK 2135
             |.|.||..:.  ..:|.|||.||::.......|||||||:|||||.|||:.|..|.....:.|.
  Rat  2186 -GKGFDVMFLRYGRMLVQATQIIYRAAVENFLPTPSKSHYVFNLRDFSRVIQGVLLCPHTHLQDL 2249

  Fly  2136 KIFVRVWYHEAMRVFYDRLVDDVDRKWMFDKLNECLKANFKDKVETVFERYCVQGPDEAVFTMEA 2200
            :.|:|:|.||..|||||||:|:.||:..|:.:.|.....||..||.|.......|.    .|.|.
  Rat  2250 EKFIRLWIHEVYRVFYDRLIDNDDRQTFFNLVKETTSNCFKQTVEKVLIHLSPTGK----ITDEN 2310

  Fly  2201 ASNILFGVYFDEDSVPDERRYEEVPSVEVFLNLALTS---LDDYNSTRRNKMDITLFTFALQHLN 2262
            ..::.||.:...:|  |::.|:|:..:.   ||.:..   ||::||..:..|.:.:|.||::|::
  Rat  2311 IRSLFFGDFLKPES--DQKIYDEIIDLR---NLTVVMEYYLDEFNSVSKAPMSLVMFKFAIEHIS 2370

  Fly  2263 RICRIISIQGASALIIGLGGSGRQSLTKLATNMVQTSFFQPEITKNYGANDWHDDIKAILKEAGG 2327
            ||||::.......|::|:|||||||.|||:|.|.....:|.||||||..|||.:|:|.|:.::|.
  Rat  2371 RICRVLKQNKGHLLLVGIGGSGRQSATKLSTFMNSYELYQIEITKNYTGNDWREDLKKIMLQSGV 2435

  Fly  2328 MNKHTTFLITENQIKMELFLQDIDCLLNQGEVPNIFPIDEKQEVLEMVRLAAQGGNRNIDVSALQ 2392
            ..|.|.||..:||||.|.|::||:.|||.|:||||||.|||.:::|.::.||:.|...|:|:.|.
  Rat  2436 ATKSTVFLFADNQIKDESFVEDINMLLNTGDVPNIFPADEKADLVEKMQTAARTGGEKIEVTPLS 2500

  Fly  2393 VFSFFVDRCKQKLHMILSFSPIGDALRTRVRLYPSLVNCCTIDWYDSWPEEALQMIAKMSLVDVN 2457
            :::||::|.::.||::|:.||||||.|||:|::|||:|||||||:.|||.:||:::|...|.||.
  Rat  2501 MYNFFIERVRKNLHIVLAMSPIGDAFRTRLRMFPSLINCCTIDWFQSWPTDALELVANKFLEDVE 2565

  Fly  2458 VPSEDIKLAIMDTCQYFHTTAARSTRAFCQMTGRHIYQTNASFIELIRSFQTLIERKQSETMLAK 2522
            : .::|:..::..|:||..:|.:.:..:.....||.|.|..|::|||.:|:||:..|:.|..|.:
  Rat  2566 L-DDNIRAEVVSMCKYFQESAKKLSVDYYNTLLRHNYVTPTSYLELILTFKTLLNSKRHEVDLMR 2629

  Fly  2523 MRYIGGLDTLAQAAAAISIMQRDLNALQPKLVALAESSRKMMLEINKETLAASAAAEQVKRDEEV 2587
            .||:.||..|..|::.:::||.:|.||||:|:..:|::..||::|..||..|.|....|:.||:.
  Rat  2630 NRYLAGLQKLEFASSQVAVMQVELTALQPQLIQTSENTAMMMVKIEMETKEADAKKLLVQADEKE 2694

  Fly  2588 ASVQAEAAQVLKQDCERDLAKAIPVLEDALAALNTLKPADITLVKSMKNPPPVIKLVMAAVCVIK 2652
            |:..|..||.:|.:||.|||:|:|.||.|||||:||.||||||||||:|||..:||||.::||:|
  Rat  2695 ANAAAAVAQAIKNECEGDLAEAMPALEAALAALDTLNPADITLVKSMQNPPGPVKLVMESICVMK 2759

  Fly  2653 GIPPERIPDPA-SGKMVQDYWGPSKRLLGEMNFLPGLKEFDKDNIPTEIVKRIHKEFIPNKDFDP 2716
            |:.|||.|||: ||||::||||.|:::||::.||..||.:|||||...|:|||.:.||.:.||.|
  Rat  2760 GLKPERKPDPSGSGKMIEDYWGVSRKILGDLKFLESLKTYDKDNISPVIMKRIRERFIDHPDFQP 2824

  Fly  2717 KVVAKASSAAKGLCQWIIAMMMYDEVAKVVAPKKAKLAGAEKEYADTMEFLAQKRALALALEEKV 2781
            .|:...|||.:|||:|:.||.:||.||||||||:.:|..||.:....|..|.||||....:|:::
  Rat  2825 AVIKNVSSACEGLCKWVRAMEVYDRVAKVVAPKRERLREAEGKLEIQMHKLNQKRAELKLVEDRL 2889

  Fly  2782 ALLNIELDKANAEMQKTEEHAESCRNKLLRAEALIGGLGGEKSRWNKAAEDLQELYDHLPGDVLI 2846
            ..||.|.:..|::....||:.|.|..||:|||.||.||||||.||.:||..|...||:|.||||:
  Rat  2890 QALNDEFELMNSKKNMLEENIEICSQKLIRAEKLISGLGGEKDRWTEAARLLGIRYDNLTGDVLL 2954

  Fly  2847 SCGIIAYLSAVNLQYRSECVKDWFKKVTDLKIPCSSHYSITDVLGLEVTIQNWQLDGLPNDEFSS 2911
            |.|.:|||.|..:.||::|..:|.....|..||.|..:|:::.||..:.|:.||:.|||.|.||.
  Rat  2955 SSGTVAYLGAFTVDYRAQCQTEWLISCKDKVIPGSVDFSLSNTLGDPIKIRAWQIAGLPVDSFSV 3019

  Fly  2912 ENAIISANSSRYSLFIDPQAQANNWLKNMERKNRLNCVKFNQSNYMKVIAEALEYGTPVIIENVQ 2976
            :|.||.:||.|:.|.||||.|||.|:||||:.|:|:.:||:.:||::.:..||::||||::|||.
  Rat  3020 DNGIIVSNSRRWPLMIDPQGQANKWVKNMEKTNKLSVIKFSDTNYVRTLENALQFGTPVLLENVG 3084

  Fly  2977 EELEVPLDPILMRQTFVQGGIKHISLGESVVPVNPNFRLYMTCNLRNPHFLPETFNKVTVINFAL 3041
            |||:..::|||::.||.|.|::::.|||:::..:..|:.|:|..|||||:|||...||.::||.:
  Rat  3085 EELDAFIEPILLKATFKQQGVEYMRLGENIIEYSREFKFYITTRLRNPHYLPEVAVKVCLLNFMI 3149

  Fly  3042 TQNALMDQLLSIVVAKERPDLQELRITLTTEAAANKGALRDAENMILKTLS-AGGDILENEAAIQ 3105
            |...|.||||.||.|||:|:|:|.:..|..|:|.||..|::.|:.||:.|| :.|:|||:|.||:
  Rat  3150 TPLGLQDQLLGIVAAKEKPELEEKKNKLILESAENKKQLKEIEDKILEVLSLSEGNILEDETAIK 3214

  Fly  3106 ILADSKGLSKDIVEKQEAAKETVAKIEAFRLNYKPVAVHSSILYYSITDLPNIDPMYQFSLNWYI 3170
            :|:.||.||::|.||||.|..|..:|:..|:.|||||:||:.:::.|:||.:|:||||:||.|:|
  Rat  3215 VLSSSKILSEEISEKQEIASVTETQIDETRMGYKPVAIHSAAIFFCISDLAHIEPMYQYSLTWFI 3279

  Fly  3171 NLYMYSIETANKSKDLPRRIKFLVDGFTRNLYNNVCRSIFEKDKLLYSFILTARILLGTGQVEMR 3235
            |||:.|:..:|||.:|..||:::::.||.::|||||||:|||||||:|.:||..:|.....::..
  Rat  3280 NLYVLSLANSNKSDELDLRIEYIIEHFTLSIYNNVCRSLFEKDKLLFSLLLTIGLLKEKKAIDEE 3344

  Fly  3236 HFAHLVTNAKESTNIPPNPDPTWITETVWLNVLRLEELKELRGIVDHFKSHLHAWQAIYDHSSPE 3300
            .:..|:|......|..|||.|.|::|..|..::|...|.:|:|::|....:|..|:||||.:.|:
  Rat  3345 VWYFLLTGGVALDNPFPNPAPEWLSEKSWGEIVRASSLPKLKGLMDDLSRNLTEWKAIYDSAWPQ 3409

  Fly  3301 KQPLPPPWQDKTTAFEKIIVLKALRPDSVFLAVRLFIAESIGDQYVTPPEFDISKSYADSTALTP 3365
            .:.||.||. ...|.||:.:|:.||||.:..|::.||:|::|..::..|.||:..||.||:...|
  Rat  3410 DESLPSPWV-FLQALEKMAILRCLRPDKIVPAIQDFISETMGKVFIEAPTFDLQGSYNDSSCCAP 3473

  Fly  3366 LVFILSPGADPLGSLLAFAEKMGQEET-FQSISLGQGQGPIATALIKNAQEMGYWVCLQNCHLAA 3429
            |:|||||||||:..||.||:.:|...| .|:|||||||||||..:|..|...|.||.|||||||.
  Rat  3474 LIFILSPGADPMAGLLKFADDLGMGGTKTQTISLGQGQGPIAAKMIHKAIHEGTWVVLQNCHLAT 3538

  Fly  3430 SWMPYLEYLWEN-MDTFNTTPNFRIWLTAYPTPQFPVTILQNGVKMTNEPPTGLKENLMRSYNSE 3493
            ||||.||.:.|. :...||..:||:|||:||:.:|||:|||||:|||||||.||:.||:|||.::
  Rat  3539 SWMPALEKICEEVIIPENTNRDFRLWLTSYPSEKFPVSILQNGIKMTNEPPKGLRANLLRSYLND 3603

  Fly  3494 PINDYEFYTGCAKQDRAFTRLLYGICFFHAVVQERRKYGPLGWNIAYGFNESDLQISVLQLSMLL 3558
            ||:|..|:..|.| ...:.:||:|:|||||:|||||.||.|||||.|.||||||:||:.|:.|.|
  Rat  3604 PISDPVFFQSCTK-PVIWQKLLFGLCFFHAIVQERRNYGALGWNIPYEFNESDLRISMRQIQMFL 3667

  Fly  3559 NQYDHVPYDAISYLTSECNYGGRVTDNWDRRLIVTILADFCNAQAVTDNRYRFASDDRYILPRKT 3623
            |.|..||::|::|||.||||||||||:.||||::::|:.|...:..||: |..|....|.:|...
  Rat  3668 NDYKEVPFEALTYLTGECNYGGRVTDDKDRRLLLSLLSTFYCKEIETDH-YYIAPGQPYFIPPHG 3731

  Fly  3624 EHREILRYLDENLPSLAPPEVYGLHANSGITRDLQTTKTLLDSMILLLGSEAAGSAGAGVSVEQV 3688
            .::..:.|| ..||..|.|.|:|||.|:.||:|.|.|..|...::|.|..:   |.|:|.|.::|
  Rat  3732 SYQSYIEYL-RTLPITAHPGVFGLHENADITKDNQETNQLFQGVLLTLPRQ---SGGSGKSPQEV 3792

  Fly  3689 ILDTIKQIEREMPADMDIEAAAEKYPVDYNESMNTVVVQEMERFLKLQKEIRTTCRDLAMGIKGI 3753
            :.:..:.|..::|.|.::|...:.|||.|.||||||:.||:.||.:|.|.:|.:..||...|||.
  Rat  3793 VEELAQDILSKLPKDFNLEEVMKLYPVVYEESMNTVLRQELIRFNRLTKVVRRSLIDLGRAIKGQ 3857

  Fly  3754 IVMTPDLENVMTAMKFNRIPTKWMSKSYPCLKPLGSYVQDLYKRLNWLHDWHHHGKPPTFWLSGF 3818
            ::|:.:||.|..:|...::|..|.:||||.|||||.||.||..||.:..:|.:.|.|..||:|||
  Rat  3858 VLMSSELEEVFNSMIVGKVPAMWAAKSYPSLKPLGGYVADLLARLAFFQEWINKGPPVVFWISGF 3922

  Fly  3819 FFTQAFLTGAMQNFARKYKIPIDTLTFDYDVLKVE-TKTSPPDDGVYCNGLYLEGARWEWRENTL 3882
            :|||:||||..||:||||.||||.:.|:::|...| |..:.|:||.|..||:||||||:.....:
  Rat  3923 YFTQSFLTGVSQNYARKYTIPIDHIGFEFEVTSKETTMENIPEDGAYIKGLFLEGARWDRTIRQI 3987

  Fly  3883 VEQFPKVLIYAMPVIFFRPVGLVDVVEGSRYRCPLYKTAERKGTLSTTGHSTNYVVPLLLNTHVK 3947
            .|..||:|...:|:|:.:|......:....|.||:|||:.|:|||||||||||||:.:.|.|.:.
  Rat  3988 GESLPKILYDPLPIIWLKPGESASFLHQDIYVCPVYKTSARRGTLSTTGHSTNYVLSIELPTDMP 4052

  Fly  3948 ASHWVKRSVALICQ 3961
            ..||:.|.||.:||
  Rat  4053 QKHWINRGVASLCQ 4066

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc62BNP_995958.2 DHC_N2 675..1102 CDD:462462 177/433 (41%)
DYN1 <994..3604 CDD:227570 1304/2638 (49%)
AAA_6 1239..1565 CDD:463697 236/325 (73%)
AAA_7 1883..2053 CDD:463698 84/169 (50%)
AAA_8 2249..2510 CDD:463701 118/260 (45%)
AAA_9 2897..3117 CDD:463702 107/220 (49%)
Dynein_C 3657..3960 CDD:465677 133/303 (44%)
Dnah3NP_001414569.1 None

Return to query results.
Submit another query.