DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc62B and dnah3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995958.2 Gene:Dhc62B / 38226 FlyBaseID:FBgn0013811 Length:3964 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_009295934.1 Gene:dnah3 / 100334351 ZFINID:ZDB-GENE-091112-7 Length:4007 Species:Danio rerio


Alignment Length:4067 Identity:1697/4067 - (41%)
Similarity:2483/4067 - (61%) Gaps:228/4067 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 KKLERMHRPASDITKYDNEPYMKNPLLKFRISEVHERRHYQF-----LKQKAADV-KVRVARQQW 62
            |:|:. ||..|:....:..|..:|    .:|:.::.|.|.:.     |...:|.| :::...|:.
Zfish    57 KELQH-HRSPSESIGNNYSPGGQN----LKITHLNRRHHSRHCPSTPLHSDSALVRRLQPLTQRG 116

  Fly    63 QP-EPDMRLLPQSHYEDNLRRE---------------VRKIVVPPMLRRTEAKILSFASERLKNK 111
            :| .|:.:|....|.|...:|.               |.:.:...||....:|.:|...:.|.::
Zfish   117 RPLSPNQQLEIIRHEEKQRQRTQTEPTETDLERYLYYVTEGIYGHMLAPQPSKQISSILKLLPSR 181

  Fly   112 Y---PELVQAYMHDVHEEFNRLMKVYSMKNILRHPEFSDEDPAQFE------LPR--PDIGFRRP 165
            :   .|.::....|:.||..|..:....|:|:   ::...|||:.|      :|:  |....|.|
Zfish   182 FQGDEEEMERMREDLLEEVQRDYEFSLRKSIV---DYILLDPAERERLSISAVPQQFPSRVIRAP 243

  Fly   166 -GRTQNYSNFLENRRRIAQKLLILQLPLRAILNISVGELPKLACIFNYVLATGAMQQQLGLGGRE 229
             ..:::|.   |.|....:.|..:...|..:.::.:.....|    .:|.:...:...|.|...|
Zfish   244 VPWSESYQ---EARSWQTENLFTVNPMLLHLEDLWMSSFSSL----RFVNSDSLLSADLPLLPGE 301

  Fly   230 ALSYKFYHKYIQNQLDKVNTFLRWTWYPKIVQVLRKLMRKRVMPMSTWKRSW------------- 281
                  :.:.:|.|.......|..||.|:...:           ..|:|.:|             
Zfish   302 ------FEELVQRQCQNTKDELLNTWLPRCASL-----------FVTFKDAWLPLLPKSSSIAPE 349

  Fly   282 ------NAMEALMNREMTNMKIRTFEEMYR-----------------MCSHPRTMPMMRMSLEWS 323
                  ..:.|||:.::.::.|.:.:::.:                 |....|.:.::::.||..
Zfish   350 KVEKLFRCVAALMSLQLRSLVIASLQDLLQFFQLHQDGNDFGERFDEMQYTQRPVLLVKLKLEDP 414

  Fly   324 EFSSDLDTRPNAWSIL-RTFAEIATEISMVGYRMEPLQPQVQTLTSMAAYAKVNDYL---KIEMN 384
            ..|.: .:....|.:: :.|.:|.:....:        |:|:    ...:.::.:.|   .::.:
Zfish   415 RISFE-PSLQGCWELIQQAFTQIISSAHNI--------PRVE----CKLFPEIGETLMLRSVQAD 466

  Fly   385 DNFLKDVIDKVQNIILRTYQEVIQYVEGFRDKYYALYSWQERDALNQFLSEPHEFEEYFARI--- 446
            :..:||:|:..:....|......:|:|.:: ||..|...|  |.:| ||...|..:.:..:|   
Zfish   467 EMLVKDIINTARETFQRNTIGPQRYLEVYK-KYTHLLDHQ--DIVN-FLKTKHSQQGFTKKITAV 527

  Fly   447 -DMYYGFIQMLRSEPATEYFVMAVIHNEPAIFGLRTLAENLIHEITTIIIREHIKAEVDICDEFE 510
             :::.....:..:.|.:.:.:.||..|:    .|...||:||..:||.::.|:.:....||..::
Zfish   528 QNVWKDIASLHATVPLSLFCLDAVNLNQ----DLCDKAEHLIELLTTFVMEENRELNKSICHRYD 588

  Fly   511 KIKYRALEIPKSTEELLESAEYMIHVKKDKIAELTDRIQYCLQVGTNIVELTEMSKYHFDLTIKT 575
            :|..|....|.|||||:|..:|:.|..:..|.:|...|:..::....:::.|.:......|....
Zfish   589 EITDRITSKPSSTEELVELNKYLKHTSEVTIHKLRHEIEEAVKRLDFLLDYTTIQAEDMKLFSTV 653

  Fly   576 INWIKDINDICDYNASQQEQFKFTFEEH-------LQEVIKKLNSDID--ELLPKLTVIDDMSRP 631
            |:|.:.|....:::..:....|...|.|       |:|.:|.|:.::|  ::..|:|:.:.....
Zfish   654 IHWPELILSSLEFSRDKLNNQKDEAEIHLMKRIGQLEETLKGLDKEVDIFKIKEKITLEEIKHNV 718

  Fly   632 DKFRDSYIILQNFIDQLKTFDDYVAWINKEEKLFKVALTEYPKLDIIKTFVYPFAELMKCCIEWQ 696
            :|..:..|.|:..:.:::|       .||||.|.....:::|.|..|.....|:.:|....:::|
Zfish   719 EKLNNIGISLEAALKEIET-------SNKEESLLDKEQSQFPVLQTIIAKKQPYDQLWITALDFQ 776

  Fly   697 RYLSVWNDGPFEYLEPQFVERTTDDYLKEFQKNQKYYRVKIKQDLIDNPVCKFKGQTEDPDPAKH 761
            ....:|.:|||:.|..:.|.....:..:...|..|.:                         .:.
Zfish   777 TKSEMWMNGPFQQLNAETVSEDLGNMWRTMYKLAKSF-------------------------PER 816

  Fly   762 PVPLRLCTSMIQSIKDFTTGVFIVNTMCNPALRKRHWKEMSEIAGFDVTPDAGTTLRKILNSGLD 826
            ..|.|:..:..:.|..|...:.|:.|:|||.|:.|||:.:|...||||.||..|.|.|::..||.
Zfish   817 TAPGRVTENFKKKIDKFKQHLPILTTICNPGLKDRHWEMISNTVGFDVKPDENTPLIKMVELGLS 881

  Fly   827 PILDQFEIISIGANKELQLWNALQAMIKEWETRVFPYGPYKETGVQILSSLDDIQALLDDHILKT 891
            ...||.|.|...|:||..|..:|:.|.:||....|.:.|||:||..:||::||||.||||||:||
Zfish   882 KYSDQLEEIGASASKEYSLEKSLEKMTREWAELHFMFAPYKDTGTSVLSAVDDIQLLLDDHIIKT 946

  Fly   892 LVMRGSAFMKPCEEEVRAWYEKIMRVNETLDQWGKVQANYLYLLPIFSSKDIVAQMPEEGRLFVI 956
            ..||||.|:||.|.|.:||.||:.|:.:.||...:.|:.::||.|||||:||:|||||.||.|.|
Zfish   947 QTMRGSPFIKPIEAEAKAWEEKLQRMQDILDGMLQCQSMWMYLEPIFSSEDIIAQMPENGRKFAI 1011

  Fly   957 VEQTYTRNMGLVLRQPLVMETAPVSGLLESLQKANELLEDIATGVSNYLEKKRLYFPRFFFLAND 1021
            |:..:...:...|:...|:.......:|..||::|..||:|..|:::|||.|||:|||||||:||
Zfish  1012 VDSYWKNIVAESLKDTHVLVATEQPNMLGRLQESNTFLEEIQQGLNSYLETKRLFFPRFFFLSND 1076

  Fly  1022 EMLEILSETKDPLRVLPHLSKCFEGINSLEFDAAKNVLAMISSDKETIEFIEQVSTAAAGGSVEK 1086
            |||||||||||||||.|||.||||||..|||.....:..||||:||.:..||.:....|.|.|||
Zfish  1077 EMLEILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFTPDLEITGMISSEKEIVPLIETIYPVKAKGMVEK 1141

  Fly  1087 WLIGVEDEMLKAVRYQNELSFAHYPKVKRHEWVLEWPQMTVLAISQVYWASRVHGCLRRTFGGNM 1151
            ||:.||:.||.::|...:.....|.::.|.:|||.||...|:..|.::|.|.|...::     |.
Zfish  1142 WLLQVENTMLMSIRAVIKQGMEQYSEMPRKKWVLLWPGQVVICASCIFWTSEVSDAIQ-----NN 1201

  Fly  1152 TIMMNFFQELSKELNDIVTLVRSPKISNLNRITIKSLIVIDVHAKDVSEDLIKNKVSSEFDFQWL 1216
            | :.::.::.:.::.|||.|||. |:|...|:|:.:||||||||:||...|.::.|||..||||:
Zfish  1202 T-LPSYVEQSNAQITDIVELVRG-KLSGGARMTLGALIVIDVHARDVVCKLAQDGVSSLNDFQWI 1264

  Fly  1217 AQMRYYWEDDKTWVRIINATVPFANEYLGNSDRLVITPLTDRCYRTLVGAYQLHLNGAPEGPAGT 1281
            :|:||:|||.:..:|:|...:.:..||||||.|||||||||||||||:||.:|:|.|||||||||
Zfish  1265 SQLRYFWEDGEVMLRMITTAIRYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLMGALKLNLGGAPEGPAGT 1329

  Fly  1282 GKTETTKDLAKALAVQCKVFNCSDGLDYKAMGKFFKGLASCGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQI 1346
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||..|||||||||||||:||||||||||
Zfish  1330 GKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKAMSKFFKGLAQSGAWACFDEFNRIEVEVLSVVAQQI 1394

  Fly  1347 LLIIQAVRSNATKFMFEGTELTLNPACYVCITMNPGYAGRSELPDNLKVLFRSVAMMVPDYAMIG 1411
            |.|.|||..|...||||||||:|||.|.|.||||||||||:|||||||.|||:||||||||.:||
Zfish  1395 LSIQQAVMRNMKTFMFEGTELSLNPTCCVFITMNPGYAGRAELPDNLKALFRTVAMMVPDYGLIG 1459

  Fly  1412 EISLYSYGFVDARKLAVKIVTTYRLCSEQLSSQNHYDYGMRAVKTVLSACGNIKKQYPDEVEDIL 1476
            ||||||.||..:|.||.|||.||||||||||||.||||||||||:||:|.||:|.:||:|.|.:|
Zfish  1460 EISLYSMGFTASRSLAQKIVATYRLCSEQLSSQPHYDYGMRAVKSVLTAAGNLKLKYPEEDEIVL 1524

  Fly  1477 LLRSLIDVNLPKFLSFDVPLFEGIISDIFPGIKLPHIDYSLVESEFKRVCLEEVLEPAPSFLLKV 1541
            |||:|:|||:.||::.|:|||:|||:|:|||:.|...||.|:.........:..|:|.|.|:.|:
Zfish  1525 LLRALMDVNMAKFVAQDLPLFQGIITDLFPGVVLAKPDYELLLKALHDNIGKMKLQPVPWFISKI 1589

  Fly  1542 IQTYEMIIVRHGFMLVGEPLAGKSKTLQVLAKVLSALKIKAPQKSNYFQH--VQMGIMNPKSITM 1604
            ||.|||::||||||:||||:.||:...:|||..|..|     .|....:.  |...|:|||::||
Zfish  1590 IQVYEMMLVRHGFMIVGEPMGGKTSAYKVLAGALGDL-----YKEGLIEEFAVDFRIINPKAVTM 1649

  Fly  1605 NQLYGSFDPISYEWTDGLVAKIFRDFAMTPTPDRKWVIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLTS 1669
            .||||.|||:|:||:||::|..||..|.....||:|:|||||:||||||||||||||||||||.|
Zfish  1650 GQLYGCFDPVSHEWSDGVLATSFRQQAQCTNDDRQWIIFDGPIDAVWIENMNTVLDDNKKLCLMS 1714

  Fly  1670 GEVITMSNEMSMVFEVMDLAQASPATVSRCGMIYMEPSTLGWRAFAKSWLKKADPRWADEEGVPY 1734
            ||:|.||.:||::||..||.|||||||||||||||||..|||.....|::.......|||... .
Zfish  1715 GEIIQMSPKMSLIFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPHQLGWTPLRDSYMNTLPESLADEHRT-L 1778

  Fly  1735 VMALMQWLLPPCQTFVRRFCSQFIKPGEFNCMLTTFDLFDMQIAEAIEENPEDYQKYLQT-YFQA 1798
            :..|..||:.||..|:...|...::....:...:...|:...:.|..:|..|.......| :.|:
Zfish  1779 IADLFNWLVQPCLDFIYHECGFLVQTSPIHLAYSLMRLYTCLLDEIFQEGAESMTSQQMTLWLQS 1843

  Fly  1799 AILFALIWGVGGVLDTASREKFDVFLKK-LWDTDPPPPEPLGKMEITP----PTEGLLVDYVFLY 1858
            ..|||::|.:||.::..||.|||.|.:. |..|....|.|: .:::|.    |..|.:.||.|..
Zfish  1844 LFLFAVVWSLGGTVNGNSRNKFDTFYRNLLMGTITDHPRPM-SVKLTKNNGFPERGTVYDYYFHK 1907

  Fly  1859 KQRGAWRYWPDLAKRMD----VEETKTGVIVPTVDTARYIHLLKMHVEHKKRMLLVGPTGTGKTV 1919
            :..|.|..|.:...:.|    .....:.:|:||.:|:|.:..|:.::.|:..:|:||||||||:|
Zfish  1908 QGPGQWNNWTESIAKEDRVIPAGAKVSDLIIPTAETSRQLFFLRTYLSHEVPVLIVGPTGTGKSV 1972

  Fly  1920 YVQNYLMNKLDKEVFETGFITFTVMISANQCQDLLISKLQKWKRGIYGPPKGMQSVLFVDDMNMP 1984
            ...|:||: |.||.:....|.|:...||||.||:::|||.:.::|::|||.|.:.:::|||:|||
Zfish  1973 INNNFLMS-LSKERYTPICINFSARTSANQTQDIIMSKLDRRRKGVFGPPVGKKCIIYVDDLNMP 2036

  Fly  1985 VKEVYGAQPPLELLRQFFDYGHVYDLKDSSKVYIHNVLIMAACGLPGGSRQDVYARFLNHFNVYS 2049
            .||:||||||:|||||:.|:.|.||.||:|::.|.:||.|:|.|.|||.|.|:..||..|.|:.|
Zfish  2037 AKEIYGAQPPIELLRQWIDHHHWYDKKDTSRLDIEDVLYMSAMGPPGGGRNDITGRFTRHLNILS 2101

  Fly  2050 INTFSDDSMFRIFLNVA----LNGFRRAGHGQDVFVVTNQIVSATQSIYKSVQSEIRATPSKSHY 2110
            |:||.|:::..||.::.    .|||     ....:.:...:|.||.::||........|||||||
Zfish  2102 IDTFDDETLSNIFTSITDWHFSNGF-----DASFYRLGKIMVQATMAVYKDAIESFLPTPSKSHY 2161

  Fly  2111 IFNLRDISRVVTGCTLVRKESVSDKKIFVRVWYHEAMRVFYDRLVDDVDRKWMFDKLNECLKANF 2175
            ||||||.:||:.|..|.....:.:....:|:|.||..|||||||||:.||...|:.:.|...|.|
Zfish  2162 IFNLRDFARVIRGVMLCPSTHMQEGDKVIRLWIHEVYRVFYDRLVDNDDRGKFFNIVKERTSAYF 2226

  Fly  2176 KDKVETVFERYCVQGPDEAVFTMEAASNILFGVYFDEDSVPDERRYEEVPSVEVFLNLALTSLDD 2240
            |..::.:.....:.|..|.    ::..::.||.|...||.  .::|:|:..:.....:....|.:
Zfish  2227 KLSLDKLLGHLTLSGKVED----DSIRSLFFGDYSKPDSA--NKQYDEITDLSTLTEVMDFYLRE 2285

  Fly  2241 YNSTRRNKMDITLFTFALQHLNRICRIISIQGASALIIGLGGSGRQSLTKLATNMVQTSFFQPEI 2305
            :|:..:..|::.:|.||::|::||||::.......|::|:|||||||.|||||.:.....||.|:
Zfish  2286 FNNISKAPMNLVMFQFAIEHISRICRVLKQDNGHLLLVGIGGSGRQSATKLATFINDYELFQIEL 2350

  Fly  2306 TKNYGANDWHDDIKAILKEAGGMNKHTTFLITENQIKMELFLQDIDCLLNQGEVPNIFPIDEKQE 2370
            ||||..:||.|::|.::.::|...|.||||.:::|||.|.|::||:.|||.|:||||||:||:.:
Zfish  2351 TKNYSMSDWRDNLKHLMLKSGIEGKKTTFLFSDSQIKDEAFVEDINMLLNTGDVPNIFPLDERAD 2415

  Fly  2371 VLEMVRLAAQGGNRNIDVSALQVFSFFVDRCKQKLHMILSFSPIGDALRTRVRLYPSLVNCCTID 2435
            ::|.::..||...:.|||:.|.:::||:||.|..||::|:.||||:..|.|:|::|||:||||||
Zfish  2416 IIEKMQGIAQMEGKKIDVTPLSMYNFFIDRVKTNLHIVLAMSPIGEDFRNRLRMFPSLINCCTID 2480

  Fly  2436 WYDSWPEEALQMIAKMSLVDVNVPSEDIKLAIMDTCQYFHTTAARSTRAFCQMTGRHIYQTNASF 2500
            |:.:||::||:|:|...|.|::: .:||::.:::.|:.|..:....:..:.....||.|.|..|:
Zfish  2481 WFQAWPKDALEMVANKFLEDLDL-EDDIRIEVVEMCKTFQESVRELSERYYSQLRRHNYVTPTSY 2544

  Fly  2501 IELIRSFQTLIERKQSETMLAKMRYIGGLDTLAQAAAAISIMQRDLNALQPKLVALAESSRKMML 2565
            :|||.:|:.|:..|:||....:.|||.||..|..|::.:::||::|.||||:|:..|:.:.:||:
Zfish  2545 LELILTFKALLNSKRSEVNELRNRYIVGLQKLDFASSQVAVMQQELTALQPELIETAKQTDQMMV 2609

  Fly  2566 EINKETLAASAAAEQVKRDEEVASVQAEAAQVLKQDCERDLAKAIPVLEDALAALNTLKPADITL 2630
            :|.|||:...|..|.|..||:||:..|.||:.:|.:||.|||:|:|.||.|||||:||||||||:
Zfish  2610 KIEKETVEVDAKKELVSADEKVANEAAAAAKAIKDECEGDLAEAMPALEAALAALDTLKPADITV 2674

  Fly  2631 VKSMKNPPPVIKLVMAAVCVIKGIPPERIPDP-ASGKMVQDYWGPSKRLLGEMNFLPGLKEFDKD 2694
            :|:|:|||..:||||.::||:|||.|||..|| .||||::|:|||||::||:|.||..||.|:||
Zfish  2675 LKTMQNPPGPVKLVMESICVMKGIKPERKQDPGGSGKMIEDFWGPSKKILGDMKFLESLKTFNKD 2739

  Fly  2695 NIPTEIVKRIHKEFIPNKDFDPKVVAKASSAAKGLCQWIIAMMMYDEVAKVVAPKKAKLAGAEKE 2759
            |||...:|:|.::||.:.||.|.|:...|||.:|||:|:.||.:|:.|||||||||.||..||:|
Zfish  2740 NIPPASIKKIREKFIDHPDFQPSVIKSVSSACEGLCKWVRAMEVYERVAKVVAPKKEKLKEAEEE 2804

  Fly  2760 YADTMEFLAQKRALALALEEKVALLNIELDKANAEMQKTEEHAESCRNKLLRAEALIGGLGGEKS 2824
            .|..|:.|..|||....:|:::..||...:....:.:..|.:.|.|..||:|||.|||||||||.
Zfish  2805 LAVQMQKLNVKRAELKEVEDRLQALNDTFEGMIQKKKDLEANIELCSQKLVRAEKLIGGLGGEKD 2869

  Fly  2825 RWNKAAEDLQELYDHLPGDVLISCGIIAYLSAVNLQYRSECVKDWFKKVTDLKIPCSSHYSITDV 2889
            ||.:||..|...|::|.||||:|...::||.|..:.||.||.:.|.:.....|||.|..:::.:.
Zfish  2870 RWTEAARLLGIKYNNLTGDVLLSSATVSYLGAFTVDYRVECQQQWLELCNRKKIPYSEDFTLGNT 2934

  Fly  2890 LGLEVTIQNWQLDGLPNDEFSSENAIISANSSRYSLFIDPQAQANNWLKNMERKNRLNCVKFNQS 2954
            ||.:|.|::||:.|||.|.||::|.||.:||.|:.|.||||.|||.|:|||.:.|:|:.:|.:.|
Zfish  2935 LGNQVLIRSWQIAGLPVDLFSTDNGIIVSNSRRWPLMIDPQGQANKWIKNMNKANKLSVIKLSDS 2999

  Fly  2955 NYMKVIAEALEYGTPVIIENVQEELEVPLDPILMRQTFVQGGIKHISLGESVVPVNPNFRLYMTC 3019
            ||::.:..|:::||||::|||.|||:..|:|:|::|||.|.|::::.|||:.:..:.:||.|:|.
Zfish  3000 NYVRSLENAIQFGTPVLLENVGEELDAVLEPVLLKQTFKQQGVEYMKLGENTIEYSRDFRFYITT 3064

  Fly  3020 NLRNPHFLPETFNKVTVINFALTQNALMDQLLSIVVAKERPDLQELRITLTTEAAANKGALRDAE 3084
            .|||||:|||...||.::||.:|...|.||||.||..||:|:|:|.:..|..|:|||...|::.|
Zfish  3065 GLRNPHYLPEVAVKVCLLNFMITPLGLEDQLLGIVATKEKPELEEKKNQLILESAANNKQLKEIE 3129

  Fly  3085 NMILKTLSAG-GDILENEAAIQILADSKGLSKDIVEKQEAAKETVAKIEAFRLNYKPVAVHSSIL 3148
            |.||:.||:. |:|||:|.||.:|:.||.||::|.|||:.|..|.::|:..|:.|:|||.|||||
Zfish  3130 NQILQVLSSSEGNILEDETAITVLSSSKLLSEEISEKQKIASVTESEIDETRMGYRPVAEHSSIL 3194

  Fly  3149 YYSITDLPNIDPMYQFSLNWYINLYMYSIETANKSKDLPRRIKFLVDGFTRNLYNNVCRSIFEKD 3213
            ::.|:||.|||||||:||.|:||||:.||..:..|.||..||..::|.||..:|.|||||:||||
Zfish  3195 FFCISDLANIDPMYQYSLTWFINLYLQSIAHSVPSDDLQIRIANILDHFTLRVYYNVCRSLFEKD 3259

  Fly  3214 KLLYSFILTARILLGTGQVEMRHFAHLVTNAKESTNIPPNPDPTWITETVWLNVLRLEELKELRG 3278
            |||:|.:||..|:.|.|||:...:..|:|......|..|||.|.|:::..|..|:|..:|..|.|
Zfish  3260 KLLFSLLLTVGIMQGKGQVDDIVWRFLLTGGVALENPHPNPAPEWLSDKSWSEVVRASQLSRLEG 3324

  Fly  3279 IVDHFKSHLHAWQAIYDHSSPEKQPLPPPWQDKTTAFEKIIVLKALRPDSVFLAVRLFIAESIGD 3343
            :.:|.:.::..|:.|||...|:.:.||..|. .....|:::||:..|||.:..||:.||.::||.
Zfish  3325 LFEHVQENIALWKQIYDSGHPQDEELPGKWH-TVVGMERMVVLRCFRPDKLVPAVQKFIVDNIGR 3388

  Fly  3344 QYVTPPEFDISKSYADSTALTPLVFILSPGADPLGSLLAFAEK--MGQEETFQSISLGQGQGPIA 3406
            .|:.||.||:::||:||...:||:|:||||:||...||.||:.  ||...| |:|||||||||:|
Zfish  3389 AYIEPPTFDLAESYSDSNCCSPLIFVLSPGSDPTAGLLKFADDLGMGGSRT-QTISLGQGQGPVA 3452

  Fly  3407 TALIKNAQEMGYWVCLQNCHLAASWMPYLEYLWENMDT-FNTTPNFRIWLTAYPTPQFPVTILQN 3470
            ..|||.|..:|:||.|||||||.||||.||.:.|.:.| .||..:||:|||:.|:.:|||::|||
Zfish  3453 EQLIKAALSVGHWVVLQNCHLATSWMPTLEKICEEVITPENTHTSFRLWLTSQPSDKFPVSVLQN 3517

  Fly  3471 GVKMTNEPPTGLKENLMRSYNSEPINDYEFYTGCAKQDRAFTRLLYGICFFHAVVQERRKYGPLG 3535
            |||||||||.||:.||:|||.|:||:|..|:...|:|: .:.:||:|:|||||:|||||.:||||
Zfish  3518 GVKMTNEPPKGLRANLLRSYLSDPISDPTFFNSSARQE-IWQKLLFGLCFFHALVQERRTFGPLG 3581

  Fly  3536 WNIAYGFNESDLQISVLQLSMLLNQYDHVPYDAISYLTSECNYGGRVTDNWDRRLIVTILADFCN 3600
            |||.|.||||||:||:.|:.|.|::|:.||.:|::|||.||||||||||:.||||::::|:.|.:
Zfish  3582 WNIPYEFNESDLRISIRQIQMFLDEYEEVPLEALTYLTGECNYGGRVTDDKDRRLLMSLLSIFYS 3646

  Fly  3601 AQAVTDNRYRFASDDRYILPRKTEHREILRYLDENLPSLAPPEVYGLHANSGITRDLQTTKTLLD 3665
            .|.:..::||....|.|.:|....::..:.|: .|||..|.|||:|||:|:.||:|.|.|..|||
Zfish  3647 WQLIQQDQYRVCEGDLYYVPSHAPYQSYVDYI-RNLPISAEPEVFGLHSNANITKDNQETNQLLD 3710

  Fly  3666 SMILLLGSEAAGSAGAGVSVEQVILDTIKQIEREMPADMDIEAAAEKYPVDYNESMNTVVVQEME 3730
            .::|.|..:.  ::|| .|.::|:.:..:.:..::|.|.|||....|||:.|.||||||:.||:.
Zfish  3711 GVLLTLPRQT--NSGA-KSPQEVVDELAEGMLAKLPCDFDIEMVTNKYPLLYEESMNTVLRQELI 3772

  Fly  3731 RFLKLQKEIRTTCRDLAMGIKGIIVMTPDLENVMTAMKFNRIPTKWMSKSYPCLKPLGSYVQDLY 3795
            ||.:|.|.:|::..:....::|.:||:.:||||..::...::|..|.:||||.||||||||.|..
Zfish  3773 RFNRLSKVVRSSLLNTQKALRGQVVMSSELENVFNSLLVGKVPAMWAAKSYPSLKPLGSYVSDFL 3837

  Fly  3796 KRLNWLHDWHHHGKPPTFWLSGFFFTQAFLTGAMQNFARKYKIPIDTLTFDYDVLKVET-KTSPP 3859
            .||.:|.||..:|.|..||:|.|:|||:||||..|||||||.||||.:.|:::|.|.|| ....|
Zfish  3838 ARLQFLQDWIDNGPPSVFWVSAFYFTQSFLTGVSQNFARKYTIPIDYIGFEFEVCKQETHMEEKP 3902

  Fly  3860 DDGVYCNGLYLEGARWEWRENTLVEQFPKVLIYAMPVIFFRPVGLVDVVEGSRYRCPLYKTAERK 3924
            :||.|..||:||||||......:.|..||||..::|:|:.:|......:..:.|.||:|||:.|:
Zfish  3903 EDGAYIRGLFLEGARWNREHMVIGESVPKVLFDSLPIIWLKPGESATFLHQNVYVCPVYKTSARR 3967

  Fly  3925 GTLSTTGHSTNYVVPLLLNTHVKASHWVKRSVALICQ 3961
            |||||||||||||:.:.|.:.....|||.|.||.:||
Zfish  3968 GTLSTTGHSTNYVLSIELPSDQPQKHWVNRGVACLCQ 4004

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc62BNP_995958.2 DHC_N2 675..1102 CDD:462462 178/426 (42%)
DYN1 <994..3604 CDD:227570 1283/2630 (49%)
AAA_6 1239..1565 CDD:463697 234/325 (72%)
AAA_7 1883..2053 CDD:463698 82/169 (49%)
AAA_8 2249..2510 CDD:463701 112/260 (43%)
AAA_9 2897..3117 CDD:463702 107/220 (49%)
Dynein_C 3657..3960 CDD:465677 136/303 (45%)
dnah3XP_009295934.1 PRK04778 <548..741 CDD:179877 47/203 (23%)
rad50 660..>837 CDD:129694 38/208 (18%)
DHC_N2 755..1161 CDD:462462 178/430 (41%)
DYN1 <994..3641 CDD:227570 1300/2676 (49%)
AAA_6 1287..1613 CDD:463697 234/325 (72%)
AAA_8 2294..2554 CDD:463701 112/260 (43%)
AAA_9 2942..3163 CDD:463702 107/220 (49%)
Dynein_C 3702..4003 CDD:465677 136/303 (45%)

Return to query results.
Submit another query.