Protein Alignment Srrm234 and srrm2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001097475.2
• Gene: Srrm234 / 38206
• FlyBaseID: FBgn0035253
• Length: 1655
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001025246.3
• Gene: srrm2 / 553531
• ZFINID: ZDB-GENE-050522-399
• Length: 1282
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1794
• Identity: 398/1794 - (22%)
• Similarity: 642/1794 - (35%)
• Gaps: 662/1794 - (36%)

  Fly     1 MYNGIGLTTPRGSGTNGHVQRNWACVRPGKKDKDYRA----EDDTKKLDAQLNRPPNKEILDHDR 61
            |||||||||||||||||:||||.:.:|. |:::|.|.    |.|.::|::||||.||.:||:|.|
Zfish     1 MYNGIGLTTPRGSGTNGYVQRNLSSIRV-KRNRDERGGERDEKDKERLESQLNRQPNADILEHQR 64

  Fly    62 KRKIEVKCLELEDILEKQGRTPEEIKSQVDSFRQKLMGQGKTDLAKDEFGRVANTTTSTATAAVR 126
            ||::||||.||:|::|:||.:.|||:.:|::||..|
Zfish    65 KRQLEVKCAELQDMMEEQGYSAEEIEEKVNTFRLML----------------------------- 100

  Fly   127 TTATASAATASTMTTTTEATTVKVAKPKKRRKRRKRAGHAITTTTTEKSAAISTPGSKTSSPRTQ 191
                                                                             
Zfish   101 ----------------------------------------------------------------- 100

  Fly   192 TGEPASSAPSATSNGARKTKAPYFQHDNREYLAKYESFRLTAHTWNYAAVARKFKPLRPALASGA 256
                                                                             
Zfish   101 ----------------------------------------------------------------- 100

  Fly   257 NKTRRPAVSKRTHPDCACACQQKDPEPALEPAHRTAEHSIQKELPSSQMKINIDGSVLLELLKYS 321
                                 |:..|||..|..:||
Zfish   101 ---------------------QERQEPAPPPTEKTA----------------------------- 115

  Fly   322 SSSLLGTLLGAGSAVATSARDTHQIAEAQQQKNARLREAFNISEYFVEGSSFDGDRKAKEDLAKS 386
                              ..:||.:|.|.||||.|||:||.||..:|:||||:.|||.:|   |.
Zfish   116 ------------------VTETHALAAANQQKNDRLRQAFGISSDYVDGSSFNPDRKERE---KE 159

  Fly   387 VALQKELDAQRESLAAAAAAAAAGKDKETGKRYALVRTPSRERDRDAGDAAANGDERDHVSKTDK 451
            ...|:.|:                ::|:..::|.::     |.|        :.|......|:.|
Zfish   160 KREQERLE----------------REKQQQQQYQII-----ESD--------DSDSSTEPKKSRK 195

  Fly   452 KKRKK-RARESSASPERKKKKKSKKHKKESKSKKKRSRKRKHSESGRDSDRDSDEEDDSSEEERR 515
            ||:|| ::||||.||.....::.||.||:   ||||       |...:||.:|     ||.:|:.
Zfish   196 KKKKKNKSRESSESPSPSPHREKKKDKKK---KKKR-------EESVNSDTES-----SSSDEKE 245

  Fly   516 ESKNVRKKAKKDKKKRDKKLKKKSRARASSSDSERTNSPSRKENKSDRSRGAKASKSDEKAPQQE 580
            .||..||::..:...     ..|||.|.|:|     :||:|.::.   .||.:..|:|.:   .|
Zfish   246 TSKGKRKRSDNEAPP-----PSKSRRRQSAS-----SSPARSQSP---QRGKQQKKTDSR---PE 294

  Fly   581 NVMRSRSRERKDTRSSRPLEASIDSRQRKPRERSAATPPRKEPERHRERSKDRQRSKEKHRSRDR 645
            .|.:.||.:                  |:.|.||..:|.|.|   .||||..|.|:.|::: ||:
Zfish   295 EVRKGRSPD------------------RRRRGRSQESPKRME---IRERSPRRSRTPEQNK-RDK 337

  Fly   646 LRSRERQRSRER-QRSRE---------RQRSKERQRSKERQRSIERQR----------SKERQRS 690
            .|.|||::.:|: ||.|.         :|:...|.||:||::..:.:|          :|:||..
Zfish   338 GREREREQLQEKPQRKRNDSSSRSPPPKQQLDRRPRSEEREKPPQTRRHDSSSPSPPPNKQRQDR 402

  Fly   691 KERQRSRSKDALRCKEKPQCNEKERSRERRRSKSKDRQRSKEKHRPKDEQQSVDKRRDRSTDRSK 755
            ::|...|.|..||  ::|..:.:..|.:::|.:..|.:::|.:.|......|.......|....|
Zfish   403 RQRSEERLKAPLR--KRPDSSPRSPSPKQQRDRRDDGKKNKVQSRHDSSSSSSTSSPSPSPSPRK 465

  Fly   756 ENQR---SNERQRS-----KERQRSKERERSKDRQRSRERRRSKEGQLSKDRQGLKERQRSNER- 811
            :..|   |.|:.|:     :|::|::..||..||.:||:..|.::|..:|:    :.|.||::.
Zfish   466 DRMRRGHSGEKARAPSPRDREKERARGGERISDRDKSRKEDRGRDGDKAKE----QARNRSSDSV 526

  Fly   812 --KRS-------KERQPSKEKQRSRERQRSREPLQSKDRQRSKERQRSRERPAKEARPTRSPRER 867
              |||       |||:..||:|..|:|::.||             :..||...::||.:...:||
Zfish   527 SPKRSPFANGRQKERELEKERQEQRDREKRRE-------------EEMREEALRKARESDREKER 578

  Fly   868 SSKSRDDRRHRSPTNASRKQKDDTK-----------LSRNARFKSPAHSPEAPPKKSVPTPAFNP 921
            :...|::..|...|::||.|.::.:           |.::.|.:......::||.:.:...|...
Zfish   579 NRSRREEVSHSDRTSSSRCQPENRRGIRGSEAEQEVLKKDRRMEEDKRQEKSPPHQKMEKLAQKE 643

  Fly   922 FKAAEDTVNDILGTKSVMVALEQTKRQRAASSSSSDSDSSGSSSTSSRTPSPKPT------PRKQ 980
            ....:|        |:..|:...:....::|:|.||||||.|||:||.:.|...:      .:||
Zfish   644 KTGQKD--------KAKAVSSSSSSSSSSSSNSESDSDSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDDDKKKKQ 700

  Fly   981 KKRSKTPELKEVKKEISPR------KESRV-------------SVKREQSNSPQKSKSKSKVD-- 1024
            ..:..|...|.|...:..:      ||:||             .::| ||:.|:....:..|:
Zfish   701 SSKDSTSASKSVPNAVIAQAIARREKENRVRNGESDEGRKTYPPIQR-QSSPPEPQSKRDDVEKK 764

  Fly  1025 ESSPKRTSRRSRSISSELRYSPAERHPERYHDIVQDKKRPSKVREAHSTKPAPVVRLRAQSDD-- 1087
            :..|:|..|..:|.||....:..||..|||        .|::......:.|..|:...||..:
Zfish   765 QRDPERERRPGQSSSSFTVMNDRERGKERY--------TPTETSSPPLSPPQRVLDRAAQVGERY 821

  Fly  1088 --GSDAETGVDGAALEEFQQSRREREEQQEL------RMLEQLKSGIAAKAKQKIKIMEKDPAKE 1144
              ..::::...|...|.:..|..|:|..:..      |..:|.|.......::|.:|       :
Zfish   822 MPSGESQSQSRGRGGERYSPSELEQESSRPSPSRGRDRQSDQRKEAPPLSPREKGRI-------D 879

  Fly  1145 GSEVSGSDQVTATKRNSLSEFLVANNVTALINTLTTTTVTLTTTPPPPLAVVVPLEQRQEQPQQR 1209
            ..:|..:....:.||.                              ||.....|  ||...|..|
Zfish   880 APQVKQAASRPSPKRT------------------------------PPRQYQDP--QRSLSPSPR 912

  Fly  1210 DPDRELSVPVEDTVKKRDTSTPPICKTPQV----------------TANGDAKSPTLVHKNHVHH 1258
            ...|.||.|...:..:||.|...:.:..:.                |.|..::||
Zfish   913 RGVRRLSPPRNYSPSRRDRSRERLRERDRFRARPADRDRERSRERRTRNSRSRSP---------- 967

  Fly  1259 NRPPPQHMHHHSQQQQHHQHPPGKRIFHNRTLN-------------NNPNSRHSTNNPHACGGGG 1310
            .||.|.:....|..       |.:|...:|:|:             .....|.............
Zfish   968 RRPSPPYRSRRSPS-------PARRRRSSRSLSREREREQERRRNRERDRQREQEREKEREQRTR 1025

  Fly  1311 VP--------HSNSNSSNSGGNNNNAAMLPFLAGTPGTYNRTTNR------LNHGPLLTATHYNI 1361
            ||        .|.|:||:|..:::.:...|.....|...::..:|      .|..|..|:.|
Zfish  1026 VPPKDLTPPRRSPSSSSSSSSSSSPSPQRPMRGVKPTDTDKDRSREANEQARNKQPERTSKH--- 1087

  Fly  1362 CKNHQHSLQQQQAHHLARGLVYNSALFGHGQRHPGLLSLTGAGVGMSGPGAPLLGHPSHVRGGGG 1426
                 .|....:...|:..|.|..           :.:.:.:.:....||..|
Zfish  1088 -----RSPSPPRESRLSLPLSYRD-----------VPARSKSPISTDPPGGRL------------ 1124

  Fly  1427 PISFNAAAAAAAVAANSISYLHHHHQHQQKPKIVIKPFKIHDPQPLVAALADSSLVDAIVSKVST 1491
                                      .:|.|.      .:|:|.
Zfish  1125 --------------------------RRQSPT------SVHEPS--------------------- 1136

  Fly  1492 ATVAAAESAARRSRSRERRSRSKRRTSTSHHRHDSSSESRSRYSSSSSRSGSHSSRSGSHSSRTS 1556
               |..::|......:|..::.::|:|:|.....|||.|.|  |||||.|.|..|.:....:...
Zfish  1137 ---ARGKTAVNGKSEKESSAKQQKRSSSSSSSSSSSSSSSS--SSSSSSSDSSDSEAEKEKAGVK 1196

  Fly  1557 CSTNSSSGSSSSGSGSGSSQSG-------SRSPSIPRRRGSPSFLDRRRIT---SARKRPIPYHH 1611
            .|||.::|.::.|..|.||.|.       ::||..|:|..:.|..|.|.::   .||:|. |.|
Zfish  1197 ASTNKNAGKTAKGRASSSSSSSESEKEKKTKSPPRPKRVPADSLRDSRSLSYSPPARQRR-PAH- 1259

  Fly  1612 KANAEGEVEDASSCCSSCFSRASSPATPLLTPLRNSRSP 1650
                                  |.|:..:.:....||||
Zfish  1260 ----------------------SPPSRRVASRKSRSRSP 1276

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Srrm234	NP_001097475.2	cwf21_SRRM2-like	52..100	CDD:410600	25/47 (53%)
		PTZ00121	<560..1154	CDD:173412	162/679 (24%)
		U2AF_lg	747..>876	CDD:273727	40/146 (27%)
		SRRM_C	<1584..1612	CDD:464573	10/30 (33%)
srrm2	NP_001025246.3	None