DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ABCB7 and Abcb7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_728642.2 Gene:ABCB7 / 38193 FlyBaseID:FBgn0035244 Length:743 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_997683.1 Gene:Abcb7 / 302395 RGDID:1303086 Length:752 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:705 Identity:384/705 - (54%)
Similarity:504/705 - (71%) Gaps:39/705 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    68 GSKLLGGVFGKKAKGGA---PAAAAAKTTTLQRQRPYRPQQQ-------------QSRLC-HVHI 115
            ||.|....:...|.|.|   ....:.:.:|.||......:|.             :.|.| |.|.
  Rat    36 GSGLRWSSYQSGASGSARLSQTTESLRNSTQQRWEKNNSRQLLDASKVLQAWPLIEKRTCWHGHA 100

  Fly   116 GGG--SDGGSGLGKLDAPEVTSKDMLRAMMAYIWPKEDPLVRKRVGISLGLLAGSKLLTVCVPFL 178
            |||  :|...||     .:|.::.:::||::|:|||:.|.:|.||.||||.|.|:|.:.:.|||:
  Rat   101 GGGLHTDPKEGL-----KDVDTRKIIKAMLSYVWPKDRPDLRARVAISLGFLGGAKAMNIVVPFM 160

  Fly   179 FKGAVDTM-----TTLNMDTAPDAVLSAATALMLGYGIARASAAGFNELRNAVFAKVAHHSIRKI 238
            ||.|||::     ..||:..||:.|.:.|||:::|||::||.||.|||:|||||.|||.:|||:|
  Rat   161 FKYAVDSLNQMSGNMLNLSDAPNTVATMATAVLIGYGVSRAGAAFFNEVRNAVFGKVAQNSIRRI 225

  Fly   239 ASNVFLHLHNLDLAFHLNKQTGALSKTIDRGSRGINFVLSAMVFNIVPTIFELALVSSILGVKCG 303
            |.|||||||||||.|||::|||||||.||||:|||:|||||:|||::|.:||:.||||:|..|||
  Rat   226 AKNVFLHLHNLDLGFHLSRQTGALSKAIDRGTRGISFVLSALVFNLLPIVFEMTLVSSVLYYKCG 290

  Fly   304 LAFAGVSMGCVGIYAAYTLSVTQWRTQFRVFMNQAENEAGNKAVDSLINYETVKYFNNEKYEAGC 368
            ..||.|::|.:|.|.|:|::||:|||:||:.||:|:|:|||.|:|||:|||||||||||||||..
  Rat   291 AQFALVTLGTLGAYTAFTVAVTRWRTRFRIEMNKADNDAGNAAIDSLLNYETVKYFNNEKYEAQR 355

  Fly   369 YNEVLKKYEAASLKTSSSLALLNFGQNAIFSSALSLIMVLAAKEIAQGNMTVGDLVMVNALLFQL 433
            |:..||.||.||||::|:||:|||||:||||..|:.|||||::.|..|.:|||||||||.|||||
  Rat   356 YDGFLKTYETASLKSTSTLAMLNFGQSAIFSVGLTAIMVLASQGIVAGALTVGDLVMVNGLLFQL 420

  Fly   434 SIPLGFLGSVYREVRQALLDMRAMFTLMNVDSSIQTAANAQPLFVDTTNSSIEFRNVSFEYEPGK 498
            |:||.|||:||||.||||:||..:|||:.||:.|:..|.|.||.:....:::.|.||.|||..|:
  Rat   421 SLPLNFLGTVYRETRQALIDMNTLFTLLKVDTRIKDKAMASPLQITPQTATVAFDNVHFEYIEGQ 485

  Fly   499 PIFRDLSFTIPAGKNVAIVGGSGSGKSSMVRLLFRFFEPNSGKVLIGGQDISAVDLESLRKVIAV 563
            .:...:||.:||||.||||||||||||::|||||||:||..|.:.:.||:|..|.|||||:.:.|
  Rat   486 KVLSGVSFEVPAGKKVAIVGGSGSGKSTIVRLLFRFYEPQKGSIYLAGQNIQDVSLESLRRAVGV 550

  Fly   564 VPQDSVLFHNTIEHNIHYGNLSKSHAEVQNAARMADLHDSIMSWPGQYSTQVGERGLKLSGGEKQ 628
            ||||:|||||||.:|:.|||::.|..||...|::|.|||:|:..|..|.||||||||||||||||
  Rat   551 VPQDAVLFHNTIYYNLLYGNINASPEEVYAVAKLAGLHDAILRMPHGYDTQVGERGLKLSGGEKQ 615

  Fly   629 RVAIARAILKNTPILIFDEATSSLDSITEHNILQALTRATSGRTSICIAHRLSTVKDADEILVLE 693
            ||||||||||:.|::::||||||||||||..||.|:......||||.||||||||.|||||:||.
  Rat   616 RVAIARAILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMRDVVKHRTSIFIAHRLSTVVDADEIIVLS 680

  Fly   694 NGRVGERGTHSELL-RQNGLYARLWETQTQQ--------FDPSRE-INEEVAAKK 738
            .|:|.|||||..|| ..:.:|:.:|.||:.:        :|..:| :::|...||
  Rat   681 QGKVAERGTHYGLLANSSSIYSEMWHTQSTRIQNHDNLGWDAKKESLSKEEERKK 735

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ABCB7NP_728642.2 ATM1 147..732 CDD:444078 357/599 (60%)
Abcb7NP_997683.1 ATM1 125..709 CDD:444078 355/583 (61%)

Return to query results.
Submit another query.