DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Klp61F and Kif11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_476818.1 Gene:Klp61F / 38135 FlyBaseID:FBgn0004378 Length:1066 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001162583.1 Gene:Kif11 / 171304 RGDID:621258 Length:1056 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1141 Identity:399/1141 - (34%)
Similarity:602/1141 - (52%) Gaps:187/1141 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 NTSRQPQKKSNQNIQVYVRVRPLNSRERCIRSAEVVDVVGPREVVTRHT--LDSKLTKK-FTFDR 68
            ::|.:.:::..:||||.||.||.|..||...:..||:....|:.|:..|  |..|.::| :|||.
  Rat     6 SSSSKKKEEKGKNIQVVVRCRPFNLAERKANAHSVVECDHARKEVSVRTAGLTDKTSRKTYTFDM 70

  Fly    69 SFGPESKQCDVYSVVVSPLIEEVLNGYNCTVFAYGQTGTGKTHTMVGNETAELKSSWEDDSDIGI 133
            .||..:||.|||..||.|:::||:.|||||:|||||||||||.||.|..:.....:||:|...||
  Rat    71 VFGASTKQIDVYRSVVCPILDEVIMGYNCTIFAYGQTGTGKTFTMEGERSPNEVYTWEEDPLAGI 135

  Fly   134 IPRALSHLFDELRMMEVEYTMRISYLELYNEELCDLL--STDDTTKIRIFDDSTKKGSVIIQGLE 196
            |||.|..:|::|.....|:::::|.||:|||||.|||  |:|.:.::::|||...|..|||:|||
  Rat   136 IPRTLHQIFEKLTDNGTEFSVKVSLLEIYNEELFDLLSPSSDVSERLQMFDDPRNKRGVIIKGLE 200

  Fly   197 EIPVHSKDDVYKLLEKGKERRKTATTLMNAQSSRSHTVFSIVVHIRENGIEGEDMLKIGKLNLVD 261
            ||.||:||:||::||||..:|.||.|||||.|||||:|||:.:|::|..|:||:::|||||||||
  Rat   201 EITVHNKDEVYQILEKGAAKRTTAATLMNAYSSRSHSVFSVTIHMKETTIDGEELVKIGKLNLVD 265

  Fly   262 LAGSENVSKAGN-EKGIRVRETVNINQSLLTLGRVITALVDRAPHVPYRESKLTRLLQESLGGRT 325
            ||||||:.::|. :|  |.||..|||||||||||||||||:|.||:|||||||||:||:||||||
  Rat   266 LAGSENIGRSGAVDK--RAREAGNINQSLLTLGRVITALVERTPHIPYRESKLTRILQDSLGGRT 328

  Fly   326 KTSIIATISPGHKDIEETLSTLEYAHRAKNIQNKPEVNQKLTKKTVLKEYTEEIDKLKRDLMAAR 390
            :|||||||||...::||||||||||||||||.||||||||||||.::|||||||::|||||.|||
  Rat   329 RTSIIATISPASLNLEETLSTLEYAHRAKNIMNKPEVNQKLTKKALIKEYTEEIERLKRDLAAAR 393

  Fly   391 DKNGIYLAEETY----GEITLKLESQNRELNEKMLLLKALKDELQ-------NKEKIFSEVSMSL 444
            :|||:|::||::    |::|:: |.|..||.||   :..|::||.       :.||..::....|
  Rat   394 EKNGVYISEESFRAMNGKVTVQ-EEQIAELAEK---IGVLEEELSKAAELFTDSEKELNQCKSDL 454

  Fly   445 VEKTQELKKTEENLLNTKGTLLLTKKVLTKTKRRYKEKKELVASHM-KTEQVLTTQAQEILAAAD 508
            ..|||||:.|:::|..||..|:               |:|.|:|.: :||:.|...|.::|....
  Rat   455 QTKTQELETTQKHLQETKLQLV---------------KEEYVSSALERTEKKLHETASKLLNTVK 504

  Fly   509 LATDDTHQLHGTIERRRELD-------EKIRRSCDQFKDRMQDNLEMIGGSLNLYQDQQAALKEQ 566
            ..|.|...||..::|:|.:|       |...||.....:.|::          |.:|.....|..
  Rat   505 ETTRDVSGLHSKLDRKRAIDAHNAEAQESFGRSLSSLFNNMEE----------LIRDGSEKQKAM 559

  Fly   567 LSQEMVNSSYVSQRLALN-SSKSIEMLKEMCAQSLQDQTNLHNKLIGEVMKISDQ--HSQAFVAK 628
            |.        |.:.|..| .|.|:..|..:...:|:...::...::..|.:|||.  ..|:..| 
  Rat   560 LD--------VHKALFGNLMSSSVSALDTISTTALESLMSIPENVLARVSQISDMILEEQSLAA- 615

  Fly   629 LMEQMQQQQLLMSK--EIQTNL-------------QVIEENNQ-RH--KAMLDSMQEK------- 668
                 |.:.:|...  |:.|||             .::..|.| :|  :|.: :|.||       
  Rat   616 -----QSKTVLQGSIDELVTNLFTSLKTIIAPGVVSILNINRQLQHIFRASV-TMAEKVEDQKRE 674

  Fly   669 ---FATIIDSSLQSVEEHAKQMHKKLEQLGAMSLPDAEEL-QNLQEELANERALAQQEDALLESM 729
               |.:|:.::|..:.|:.           ..||.::::| .||.|:|...:....||...|.|.
  Rat   675 IDSFLSILCNNLHELRENT-----------VSSLVESQKLCGNLTEDLKTIKETHSQELCQLSSS 728

  Fly   730 MMQMEQIKNLRSKNSISMSVHLNKMEESRLTRNHRIDDIKSGIQDYQKLGIEASQSAQAELTSQM 794
            .  .|:...|..|.: ::...||.::|:   ...:..||.:....:.|..:..|.....||....
  Rat   729 W--AERFCALEKKYA-NIQKPLNSIQEN---TERKSTDIINKTTVHSKKILADSDGLLQELRHFN 787

  Fly   795 EAGMLCLDQGVANCSMLQVHMKNLNQKYEKETNENVGSVR---VHHNQVEIIC-QESKQQLEAVQ 855
            |.|...::..|.:|..|..:::.::|    |..:..|::.   ||.:.....| .:.|::|:   
  Rat   788 EEGTQLVEDSVGHCGSLSSNLETVSQ----EITQRCGTLNTSTVHFSDQWASCLSKRKEELQ--- 845

  Fly   856 EKTEVNLEQMV----DARQQLITEDRQRFIGHATVATDLVQESNRQFSEHAEHQRQQLQICEQEL 916
                 ||.:.|    :|....|||   :..||...    ::..:..|........::.:....||
  Rat   846 -----NLMEFVNGCCEASSSEITE---KIRGHRAA----IESQHSSFVVQITSDEEKFKAGSLEL 898

  Fly   917 VR-----------FQQSELKTYAPTGTTPSKRDFVYPRTLVATSPHQEIVRRYRQELDWSDLDTT 970
            .:           |.|.:||...|||.||.:::::||.|||.|.|.::::.:.:::     ....
  Rat   899 DKTIKTGLTKLNCFLQQDLKLDIPTGMTPERKNYLYPSTLVRTEPREQLLDQLQKK-----QPKP 958

  Fly   971 ATIDECSEGEHDVS--MHSVQELSE--TETIMNSTPIEPVDGVTVKRGCGTT------------- 1018
            ..:..|||...:.|  |...:|:.|  ||.:::..|.     |.....|.::             
  Rat   959 LMMLNCSESSKETSQDMEEDREVLEQSTEELVSQEPC-----VHTSADCSSSGGVPFFQHKKPHG 1018

  Fly  1019 RNSNSNALKPPVATGGKRSSSLSRSLTPSKTSPRGS 1054
            ::..:..|.|  ...||...:...|::.|:...|.|
  Rat  1019 KDKENRGLNP--VEKGKVEEASEHSISKSRLPLRAS 1052

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Klp61FNP_476818.1 KISc_BimC_Eg5 17..365 CDD:276815 209/353 (59%)
SMC_prok_B <408..728 CDD:274008 86/366 (23%)
SMC_prok_B <651..>921 CDD:274008 60/302 (20%)
Microtub_bind 923..>1004 CDD:464048 24/84 (29%)
Kif11NP_001162583.1 KISc_BimC_Eg5 16..368 CDD:276815 209/353 (59%)
PRK12704 350..>508 CDD:237177 76/176 (43%)
YhaN 380..>785 CDD:443752 118/465 (25%)
Microtub_bind 916..1052 CDD:464048 33/147 (22%)

Return to query results.
Submit another query.