Protein Alignment RhoGEF3 and tiam1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_612024.4
• Gene: RhoGEF3 / 38050
• FlyBaseID: FBgn0264707
• Length: 3519
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_001924044.4
• Gene: tiam1a / 567621
• ZFINID: ZDB-GENE-080325-1
• Length: 1621
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1873
• Identity: 366/1873 - (19%)
• Similarity: 611/1873 - (32%)
• Gaps: 613/1873 - (32%)

  Fly  1880 KYSPRSRFERTTERSKTHALGRSRKSQFSRVGSAGPLIAHPNTANVGVSRFRSFDTSKS------ 1938
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Zfish    35 KQSRRSRHAST---SKV----EHRNSESSTKSSSTPSIPQSLSEN-GLEPFSEKNALESYGGTIW 91

  Fly  1939 ---QRLNSCDSGARSDL--------SND--ELDN--EDGGLNDFLSAGSHKF-------PKIGTS 1981
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Zfish    92 VDRMAMNLRPMSFHDNIGDPTITPGSEDGVEMDTVVPDGCDDDGLFTGEDTYLQRTRDGPREGGS 156

  Fly  1982 SVSVSPFKMQRQRSLTPDRNDSHSSTSSLRKQRSNTPESRSLTPEERRKKGSQLSLGGARQSSSS 2046
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Zfish   157 ------FKKKRSKSADMWRDDSMEFSLSDLSQEHLTSTEEIIGTNEDEDKGF-ANCGGRRRTSSP 214

  Fly  2047 R---SNTFEGRQRHDD----KTPP--------NISRSSSSSSYSGGE----SHEPLNGTGSTTV- 2091
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Zfish   215 RTLESHSGERANSLDELCTQRLPPLRGSHHLYNGHNTERTEGIMNGEILSPAEEEGNGYGAYTLP 279

  Fly  2092 ---TPSAGSGSTSHRRALTAKQAEQEHRIRRSRSLQLTERSPNRAHKSIVNVGALVPQQRSVGVP 2153
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Zfish   280 CRRSHCLSEGLSNHQTTICSRM--QGRRAQTTHDITAGE-----------------------GSE 319

  Fly  2154 YQQSRVPGGG--VFPPTIRTSPAGAKIHVNSPAPPNSSVRVRHNETDKARSFDFDYNNFSRGGGA 2216
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Zfish   320 YGDSGIDGGAAEVEHSSRRCKAMSASFSVYSTA----------SESIFAGS---DSGSSSGGGGD 371

  Fly  2217 KGSSRTAHTSGSGGDSGSNQNLRVE-----RESRSFDDEICEAVLNNNNGSNGSVSGLRFLQPAT 2276
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Zfish   372 R---------QQGGDQGVYENFRQELDMNSRQTRECLEEASSAASDERS---------------- 411

  Fly  2277 DSGQVSMASTSSSRLRKSNSPVSASGMEASRSPQSSGSSTNNLHQQARQSGSP------QSYGTR 2335
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Zfish   412 -SGTLSSIYPSDILLTAVQGTVRKAGMLAVK---------NFLVHKKNKRVEPAAKRKWKQYWVS 466

  Fly  2336 LCDHELTYEMLRKSPIMNFRRGDSGDYELPVMLRNRETINSGGNSELNFMSNETRIYEHPTTVLK 2400
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Zfish   467 LKGCTLFF------------------YE------------TDGRSGIDHNS----IHKHAVWVEN 497

  Fly  2401 S-QRSLRQSPGSRDDLNLEVAVGVGGDYIYRQPANQPRSSSVKAEFLTTATTKSCTKTL------ 2458
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Zfish   498 SIVQAVPEHP--KKDFVFCLSNALGDAFLFQ------TSGQTELENWITAIHSACAAAVARQHHR 554

  Fly  2459 -DTCDYWPRCAACQHKSVS------------GELKKGPSASGKP-LTVLDNV------------- 2496
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Zfish   555 EDTV----RLLRSEIKKLEQKIDMDEKMKKMGEMQLSAVTDGKKRKTILDQIFLWEQNLEQFHMD 615

  Fly  2497 ----QPHVTSVIVNEDNAVPGPQLRSLEKSNPSWTFLCSGIASICQPVQQTETDHSTAQEAAEED 2557
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Zfish   616 LFRYRCYLSSL---QGGELPNPKRLLAVASRP--TKLSMGRLGIF----SVSSFH--ALVAARTD 669

  Fly  2558 IVIRKVKPNKSRRTGRSRSLPSVMLRRLYLAGMPKPGSNEMGTTSDCAASLSQQIKAVSSPTLSE 2622
            ..||:.....||.:.:.:|      |...|.|        :.|||        :.|....|::::
Zfish   670 GGIRRRTQALSRSSSKRKS------RFSSLWG--------LDTTS--------KKKTKGRPSINQ 712

  Fly  2623 PCLE-EQPQKGTESTDVANTGSSAGSGGLGVLQKFKRTLNNFNNKNQLHISPLSPAAVGNNAPKT 2686
            ..:: |||.|........:||                       ||.||....|..   .:.|:.
Zfish   713 VFVDGEQPVKRNLEHMFEDTG-----------------------KNTLHKDKESSL---KSLPQH 751

  Fly  2687 KTS-----PTTTTASIA------PMITTTTASDPGSEAGDTSSGKYRFGPLIWRSSKERRKTKY- 2739
            ||.     |...|.|..      |::......:...||.:.....::.     ..||...:.|:
Zfish   752 KTDNEVWVPDYLTPSWVSLPDDRPVLAIIQPGETAMEALEALCKVHKL-----ELSKHYIRLKFL 811

  Fly  2740 -----------NRRDKCNSGDSGIQ--------IELEQDEQYSRA---TMAVSRQDEPRAFALTN 2782
                       ...|.|:....||:        |:.::||..:..   ::||..:|..:...:|:
Zfish   812 IDNQVQLYVPRPEEDLCDLLYKGIEICAKTTKVIQFDRDESCAIGYGFSVAVVEEDGGQQLHITD 876

  Fly  2783 GSC-GVALSK-MRA---IRRTNSAKASSILGPFIVKTKIAKHLNIGESDKAERKAPESLPTRSLS 2842
            ... |:|.:| :||   |.:.|| |.:|:|                  :.|:.:|..:||:.:|:
Zfish   877 VKAGGLAFAKGLRAGDEILKLNS-KPASVL------------------ELADMQAAFALPSLTLT 922

  Fly  2843 QPNGLESYGMGRPDLEDSDSDSVASNEEAISFYPTTYAEVLYNFTAGGPQELGLERGMLIEILRK 2907
            .                  |...|::...:...|...::        |.|:|      ..:|..:
Zfish   923 V------------------STLPAADPHQLCQLPPRRSD--------GAQDL------CTDIFSQ 955

  Fly  2908 EVGPWWFGRIKKEETNLVEDILGPELGWFPKEFVRIIHCPE---TDNFFIAHRAAAD-------- 2961
            .                .||||...||       .::|.|:   .|...:...:.||
Zfish   956 S----------------QEDILDEGLG-------LVLHSPDDTGDDRVNLMAESPADSLEDEIDS 997

  Fly  2962 -EAAAEEATA--------RAEEGSVPVPVAAFAEDTDVTVTTDQSNVTLIVIESPPTPSAPSVDF 3017
             ..:.|:.||        .:.||    ||:..:..:    |:..|:..:      |:|.:|....
Zfish   998 AHKSTEQVTAFCRNLHDMNSNEG----PVSCSSSSS----TSSSSSSCM------PSPISPLPGL 1048

  Fly  3018 VAQPDHSTIIR-RSAVRELLDTEVNYVKLLAAICDGYLPAMSKRIDIFSPNSIRLIFSNITAIYK 3081
            ......|...: |..:.||:|||..|||.|..:.:.||..:.|. ...:.:.:.::|.|:..:.:
Zfish  1049 FTPRQLSDADKLRKVISELVDTERTYVKDLNILIERYLNPLQKE-SFLTQDELDVLFGNLAEMVE 1112

  Fly  3082 FQRKFLEALRRG---------IEQ-NQVAKVFLKMHKGFL-------CYSTYCNAY---PRALIE 3126
            ||.:||:.|..|         :|: :|..||...:...||       .||.:|.::   |:.|.:
Zfish  1113 FQVEFLKTLEDGTRLVPDLDKLERVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKIYSAFCASHTKVPKVLTK 1177

  Fly  3127 LETYDRVKDARTILENCRESQNLAELPLSAHLLAPVQRICRYPLHLNEIIKSALEKGAKEGNDTD 3191
            .:|....| |.....|.|:..:..   |.::|:.|:||:.:|||.|.|:
Zfish  1178 AKTDPEFK-AFLAERNPRQQHSST---LESYLIKPIQRVLKYPLLLREL---------------- 1222

  Fly  3192 GAKSAGKTTDYEQLDVTELDIPDSQDTVNL--ALEAMRGITEAVNE-GKRHSE------TIARHQ 3247
                      |...|      |||::..:|  |::||..:...:|| .|.|.|      .:...|
Zfish  1223 ----------YSLTD------PDSEEHYHLDVAMKAMNKVASHINEMQKIHEEYGAVFDQLISEQ 1271

  Fly  3248 ASFQN-----------------FKGPPLHL--------------HSARFFLQVDATRQKQNLWNS 3281
            :|.:.                 :..||..|              .:|..|:..|.::||:.: ..
Zfish  1272 SSEKKEVADLSMGDLLLYDTVVWINPPSSLMKGKRDPELAAFVFRTAVVFVCKDCSKQKKKI-GG 1335

  Fly  3282 SYTLFLFDNQLVYCKRDIIKRSHFIYKGRIFLDR---------CRVVNVRDGKMFGHTIKNSLRI 3337
            .:.:...|      :||..:..|.|....:.:..         |.:|:||  ..|....:.:..|
Zfish  1336 PHRVSTLD------ERDPFRFRHMISTDALQVRNLPNSEGSAMCEIVHVR--SEFEGRPERTFHI 1392

  Fly  3338 YSESRDKWYDF-----SFRSANRKHRFLSTLALERQ-----FGGKALYVSEMTGFEYNYE-ERPG 3391
            ...|.:...||     |.....::.:.:.|.:|...     ||||.|...:.:....|.. ..|.
Zfish  1393 CCSSPESKKDFLKTVHSILRDKQRRQLMKTESLPPNQQYIPFGGKRLCALKGSRPTMNRAVSAPS 1457

  Fly  3392 DYSDQSDYDAQDFELATGVTSGESS---------------LPESPAKSTSRLCETLPKKSQSRDG 3441
            ....|.........:.|||...:.|               .|:.|.:.|.|..|       .:..
Zfish  1458 RTLGQRKLIRNRITIDTGVIFDDDSSQDLSPITPTEPPFHKPQQPIRDTDRWVE-------DQFD 1515

  Fly  3442 ISSAENSQIVTTTSTGSLGRRHFGNWFRKPKSANC----TPSQSPTHKPSFDA 3490
            :...||...|..|...|            .....|    .||..|:.:.||:|
Zfish  1516 LQIYENQDDVKETDILS------------DDDEYCQSVRAPSSDPSLEESFEA 1556

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
RhoGEF3	NP_612024.4	SH3	2876..2942	CDD:214620	11/65 (17%)
		RhoGEF	3028..3234	CDD:238091	56/228 (25%)
		PH_Collybistin_ASEF	3240..3373	CDD:269931	31/188 (16%)
tiam1a	XP_001924044.4	None