Protein Alignment RhoGEF3 and arhgef4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_612024.4
• Gene: RhoGEF3 / 38050
• FlyBaseID: FBgn0264707
• Length: 3519
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_004917856.1
• Gene: arhgef4 / 100487089
• XenbaseID: XB-GENE-960463
• Length: 1808
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 2216
• Identity: 470/2216 - (21%)
• Similarity: 763/2216 - (34%)
• Gaps: 680/2216 - (30%)

  Fly  1311 KTGNTDSETPAVAHSDPTSDVPACGTAENPTHLRALTRQDYACIDSSE----AQSDDSHLTRDSI 1371
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 Frog    53 ETRSNFSDCPSELKSEVFESISDAESVASEANGELIRRSDCLFLEKEEPLYSLNNDDNCLSSNIV 117

  Fly  1372 TRESQNDELSSSTLEKLDVSTLPLPALPKRRRTRSRTSPSKHRQQQQQQQQQQQQRHEVIEDANA 1436
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 Frog   118 --ESSHEECSKNA-----------PA-----ETASESNVLHHALTYDQEHL------DIIND-NE 157

  Fly  1437 VDASTAAAGQQHPKPRQGAASPESQKPEISGAKNNAAGEQQKQPQSQQQQTHLSAFQQYVAKRRE 1501
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 Frog   158 V---TQLTDLFSPDSKQIGVS--SNIIDISGSESN-------------RSSHKDVFQ-----CQA 199

  Fly  1502 SLEASNRCFNEKLEARRMHYHMGGSAANG------NATASHLTAG----SNGVPTYLFGENFYGV 1556
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 Frog   200 GLQLTGTLISAKLH---------GEIANSKSENCLNCTESERSIGTGVSSQSLPNISFDISHYS- 254

  Fly  1557 PATGRKSISP--TTKKEEIFLNKSGWVQVNTTRGVNKDDNGGGYRSLSYAQQNGGGRVAAMLTDP 1619
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 Frog   255 DVSSKHGIASALTQSSQQTCLKTSSLEEINLDCYLN-----------SVSQDVG----------- 297

  Fly  1620 GRRSDLARKSFILQHQQQHQSNISMTEPKFVGSKVEELIQRNEARLSG--CSIRYPSLRPGHRII 1682
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 Frog   298 -----------LLIHTET-EKHIS-----------KDIVHLQDSYLSSQLCEEEHLLSPAGHNEF 339

  Fly  1683 DPQLANILNER---PGFLPVKGPTDLDSPLTPILSPPPAFQDNSRSARRQERRNPGRQQGPLPLP 1744
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 Frog   340 QSTLCVLADDRKETKGCMPEMDMKNSKEKVGGILS--DSFQDIFKGYWEEDRHS----------- 391

  Fly  1745 VPFRSEPQMDPQNPINGSAKGMVFSRSFEYDTRRHTPTDNYVETFSRSFD--GNLSDRLLNLAVL 1807
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 Frog   392 ---RSSESEEKQNMTLGSIKNSSLLR--KQVSRQEPMSTGHFEDFQAIGDSSSSLQDRSPVIVLS 451

  Fly  1808 AGQRERSPNFSTLTGNSPNYLTKRESGGGS--------SGSLRSRDSSPKYLHPQATTAYLNAAV 1864
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 Frog   452 AHQPRTQTAWKEIEQNT----YKHENGHSSHSNSDENLSGSRESLNQDLVY-----KARYSMGCV 507

  Fly  1865 KEAPPVYSVPTGSQA-KYSPRSRFERTTE----RSKTHALGRS------RKSQFSRVGSAGPLIA 1918
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 Frog   508 EQEEDEQNGPTFVDINRETP--LFQKDSETIFVQEHTEAHGRHLWDILLDKEQH----------- 559

  Fly  1919 HPNTANVGVSRFRSFDTSKSQRLNSCDSGARSDLSNDELDNEDGGLNDFLSAGSHKFPKIGTSSV 1983
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 Frog   560 NPSQISIQTAKIKSLKQKSYKDPNYHSNG---NMEDSNLDHGD---------------------- 599

  Fly  1984 SVSPFKMQRQRSLTPDRNDSHSSTSSLRKQRSNTPESRS---LTPEERRKKGSQLSLGGARQSSS 2045
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 Frog   600 --SVFSAQRRYLTAPQDSDGDESDFEV----SSSEENRNHCLATVEESRD-------GMCYYSTI 651

  Fly  2046 SRSNTFEGRQRHDDKTPPNISRSSSSSSYSGGESHEPLNGTGSTTVTPSAGSGSTSHRRALTAKQ 2110
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 Frog   652 KKIDTI-------DTVDDNESNCSSSNS-EGTEGNMGYNWKSEINKIEDIKSDVKASESQKDSKI 708

  Fly  2111 AEQEHRIRRSRSLQLTERSPNRAHKSIVNVGALVPQQRSVGVPYQQSRVPGGG--VFPPTIRTSP 2173
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 Frog   709 AE----LKDSRT-EIKEEPNNKIKRMNIKNSDIFKKYLSVKTP-----VPNGSQLAAKPTGETSD 763

  Fly  2174 AGAKIHVNSPAPPNSSVRVRHNETDKARSFDFDYNNFSRGGGAKGSSRTAHTSGSGGDSGSNQNL 2238
                                .::.|...| .|.||.         |.|.|  ||||
 Frog   764 --------------------FSDEDSYES-SFLYNR---------SMRKA--SGSG--------- 787

  Fly  2239 RVERESRSFDDEICEAVLNNNN--GSNGSVSGLRFLQPATDSGQV-SMASTSSSRLRKSNSPVSA 2300
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 Frog   788 RIDLD--NFTRLRCGVAPSNTNDKSDNGQSQG--FSKPPTENCETKSERNTESKRLKERL----- 843

  Fly  2301 SGMEASRSPQSSGSSTNNLHQQARQS--GSPQSYGTRLCDHELTYEMLRKSPIMNFRRGDSGDYE 2363
              |.|.:|..|.....||....|.||  |:|:....:....:.:::.||     |.:..|...::
 Frog   844 --MWAHKSFSSMFDFKNNDKDSAAQSSEGTPREEKKKSRPLQSSWKTLR-----NSKNKDKDSFK 901

  Fly  2364 -LPVMLRNRETINSG---GNSELNFMSNETRIYEHPTTVLKSQRSLRQSPGSRDDLNLEVAVGVG 2424
             |.|:..:...||:.   |.|:.|  .|     ||...:|
 Frog   902 RLSVLNLSAHIINTNMPRGASKEN--GN-----EHLPPIL------------------------- 934

  Fly  2425 GDYIYRQPANQPRSSSVKAEFLTTATTKSCTKTLDTCDYWPRCAACQHKSVSGELKKGPSASGKP 2489
                  .|..||.|..:|....|...|:|        |..|..|...||..|  |:...|..
 Frog   935 ------DPIKQPSSMEIKPCMTTDTNTES--------DLEPLEAKENHKKWS--LENDDSLQ--- 980

  Fly  2490 LTVLD----------------NVQPHVTSVI----VNEDNAVPGPQLRSLEKSNPSWTFLCSGIA 2534
             |..|                |.||.:|::.    .:|.|.:|
 Frog   981 -TTCDDSAFFSQFDSNESHSLNKQPSITTLFNPFSNSEINPMP---------------------- 1022

  Fly  2535 SICQPVQQTETDHSTAQEAAEEDIVIRKVKPNKSRRTGRSRSLPSVMLRRLYLAGMPKPGSNEM- 2598
              |:|:..                     ||        ....||...|.|:.:.:.......:
 Frog  1023 --CRPMSP---------------------KP--------FSQWPSFQRRGLHNSRISATSMTSLA 1056

  Fly  2599 --GTTSDCAASLSQQIKAVSSPTLSEPCLEEQPQKGTESTDVANTGSSAGSGGLGVLQKFKRTLN 2661
              .|...|..|....:|............::.....::|....||.||.    :.:|:.
 Frog  1057 NSSTVDGCPDSPETAVKTWGGYLTDRSSQKDDSSASSQSKPSLNTASSV----MDILRD------ 1111

  Fly  2662 NFNNKNQLHISPLSPAAVGNNAPKTKTSPTTTTASIAPMITTTT--------ASDPGSEAGDTSS 2718
              .:..||..|.:.......||...|..||..|||....|.|.:        ||.......:.:.
 Frog  1112 --EDSRQLVPSSILKMQRERNALLYKKRPTDLTASQYLPINTESRTLTLPQMASMGHKRDSEPTR 1174

  Fly  2719 GKYRFGPL------IWRSSKERRKTKYNRRDKCNSGDSGIQIELEQDEQYSRATMAVSRQDEPRA 2777
            .|..|..|      ::..::||:..|        |.|:|   :|.:::  |:|:|:||
 Frog  1175 PKALFKSLSCDNLWVYERNQERKLDK--------SIDAG---DLMRNQ--SKASMSVS------- 1219

  Fly  2778 FALTNGSCGVALSKMRAIRRTNSAKASSILGPFIVKTKIAKHLNIGESDKAERKAPESLPTRSLS 2842
                                         :||                .:..|..|..:.:.|.|
 Frog  1220 -----------------------------IGP----------------PEIFRSFPMKVHSFSRS 1239

  Fly  2843 QPNGLESYG--------------MGRPDLED---SDSD-----------------SVASNEEAIS 2873
            .|:.|:..|              ..||.|.|   ||.|                 .:|.| |.||
 Frog  1240 TPSRLDLVGCVRRTSLSVFNDGSTNRPSLFDDLGSDEDFYEELHVSGHRFVGGGEQLAIN-ELIS 1303

  Fly  2874 FYPTTYAEVLYNFTAGGPQELGLERGMLIEILRKEVGPWWFGRIKKEETNLVEDILGPELGWFPK 2938
            .....|||.|::......:|||.:.|.:||::......||:|||...|            ||||.
 Frog  1304 DGSVVYAEALWDHVTMDDEELGFKAGSVIEVMDATNKEWWWGRILDSE------------GWFPA 1356

  Fly  2939 EFVRIIHCPETDNFFIAHRAAADEAAAEEATARAEEGSVPVPVAAFAEDTDVTVTTDQSNVTLIV 3003
            .|||:             |...||...:.||...::                  ..|..||
 Frog  1357 SFVRL-------------RVNQDEPMEDCATKAGDK------------------EQDSRNV---- 1386

  Fly  3004 IESPPTPSAPSVDFVAQPDHSTIIRRSAVRELLDTEVNYVKLLAAICDGYLPAMSKRIDIFSPNS 3068
                     |..:...| ::...:|.:.:.|:|:||.:|:|.|..||:||:....||.|:|:.:.
 Frog  1387 ---------PRRNGFGQ-NNKDQMRTNVINEILNTEKHYIKHLKDICEGYIKQCRKRDDMFTEDQ 1441

  Fly  3069 IRLIFSNITAIYKFQRKFLEALRRGIEQ-----NQVAKVFLKMHKGFLCYSTYCNAYPRALIELE 3128
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 Frog  1442 LWTIFGNIEEIYKFQKKFLKTLEKRINKDSPHLSEIGSCFLEYQTDFQIYSEYCNNHPNACTELS 1506

  Fly  3129 TYDRVKDARTILENCRESQNLAELPLSAHLLAPVQRICRYPLHLNEIIKSALEKGAKEGNDTDGA 3193
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 Frog  1507 KLTKVKKYVHFFETCRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELL----------------- 1554

  Fly  3194 KSAGKTTDYEQLDVTELDIPDSQDTVNLALEAMRGITEAVNEGKRHSET---IARHQASFQNFKG 3255
                |.|:.:..|.|         .|..||:||:.:...:||.||..|.   ||..|:|.::::|
 Frog  1555 ----KYTNSQHRDYT---------NVEAALDAMKNVARLINERKRRLENIDKIAHWQSSIEDWEG 1606

  Fly  3256 PPLHLHSARFFLQVDAT-------RQKQNLWNSSYTLFLFDNQLVYCKRDIIKRSHFIYKGRIFL 3313
            ..:...|:......:.|       :.:|.::      ||||:|:|:||:|:::|....|||:|.:
 Frog  1607 EDILARSSELIHSGELTKISHLQPKGQQRIF------FLFDHQIVFCKKDLLRRDILYYKGKIDM 1665

  Fly  3314 DRCRVVNVRDG--KMFGHTIKNSLRIYSESRDKWYDFSFRSANRKHRFLSTLALERQFGGKALYV 3376
            |...|:||.||  |.|..|:||:.::..:..::.:.|..:....|.|:|.....||    |.:.:
 Frog  1666 DDMEVLNVEDGKDKDFNITVKNAFKLQGKVSEEIHLFLAKKPEHKQRWLQAFEEER----KQVLL 1726

  Fly  3377 SEMTGF 3382
            .:.|||
 Frog  1727 DKETGF 1732

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
RhoGEF3	NP_612024.4	SH3	2876..2942	CDD:214620	21/65 (32%)
		RhoGEF	3028..3234	CDD:238091	70/210 (33%)
		PH_Collybistin_ASEF	3240..3373	CDD:269931	40/144 (28%)
arhgef4	XP_004917856.1	SH3_ASEF	1291..1363	CDD:212906	28/97 (29%)
		RhoGEF	1404..1583	CDD:214619	69/208 (33%)
		PH_Collybistin_ASEF	1588..1727	CDD:269931	41/148 (28%)