DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment zip and Myh14

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_523860.2 Gene:zip / 38001 FlyBaseID:FBgn0265434 Length:2056 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038967907.1 Gene:Myh14 / 308572 RGDID:1306821 Length:2041 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1988 Identity:1106/1988 - (55%)
Similarity:1461/1988 - (73%) Gaps:85/1988 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    73 QAEWTQKRLVWVPHENQGFVAASIKREHGDEVEVELAETGKRVMILRDDIQKMNPPKFDKVEDMA 137
            |.|||.:|:||||.|..||.||:::.|..:|.||||||:|:|:.:.||.||:||||||.|.||||
  Rat    43 QVEWTARRMVWVPSELHGFEAAALRDEGEEEAEVELAESGRRLRLPRDQIQRMNPPKFSKAEDMA 107

  Fly   138 ELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCVVVNPYKKLPIYTEKIMERYKGIKRHEVPPHVFA 202
            |||||||||||||:::|||||||||||||||||:||||:||||||.|:|.|:|.||||||||::|
  Rat   108 ELTCLNEASVLHNLRERYYSGLIYTYSGLFCVVINPYKQLPIYTEAIVEMYRGKKRHEVPPHIYA 172

  Fly   203 ITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQFLAYVAASKPKGSGAVPHPAVLINFSVN 267
            :|:.|||:||.||||||||||||||||||||||||||:||:||:| |||......||     ||:
  Rat   173 VTEGAYRSMLQDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASS-PKGRKEPGVPA-----SVS 231

  Fly   268 TNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSNCQEGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSR 332
            |..|                               ||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   232 TMSY-------------------------------GELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSR 265

  Fly   333 FGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIRQAKDERTFHIFYQLLAGATPEQREKFILDDVKS 397
            ||||||||||.:|:|.|||||||||||||||||||||.:||||||||.||..:.:...:|:....
  Rat   266 FGKFIRINFDIAGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKDECSFHIFYQLLGGAGEQLKADLLLEPYSH 330

  Fly   398 YAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIMGMTSEDFNSIFRIVSAVLLFGSMKFRQERNNDQAT 462
            |.||:||....|| .:...||.|::|:.::|:..|:..::.|.|||||.||::..::|||.||||
  Rat   331 YRFLTNGPSSSPG-QERELFQETLESLRVLGLLPEEITAMLRTVSAVLQFGNIVLKKERNTDQAT 394

  Fly   463 LPDNTVAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRIKVGRDFVTKAQTKEQVEFAVEAIAKACYERMFKWL 527
            :||||.|||:..||||.|||.:||.||||||||||:|.|||||||.:||:||:|||.|||:|:||
  Rat   395 MPDNTAAQKLCRLLGLGVTDFSRALLTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFALEALAKATYERLFRWL 459

  Fly   528 VNRINRSLDRTKRQGASFIGILDMAGFEIFELNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQR 592
            |.|:||:|||:.||||||:||||:||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   460 VLRLNRALDRSPRQGASFLGILDIAGFEIFQLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFVLEQEEYQR 524

  Fly   593 EGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPG---GIMALLDEECWFPKATDKTFVDKLVSAHSMHPKFMK- 653
            |||.|.|:||||||||.||||::|.   |::|||||||||||||||:||:|:......||||.: 
  Rat   525 EGIPWTFLDFGLDLQPCIDLIERPANPPGLLALLDEECWFPKATDKSFVEKVAQEQGSHPKFQRP 589

  Fly   654 TDFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWLMKNMDPLNENIVSLLQGSQDPFVVNIWKDAE-------- 710
            .:.|..|||:::||||:|||.|.:||||||||||:|:.:||..|.|.....||||.:        
  Rat   590 RNLRDQADFSVLHYAGKVDYKANEWLMKNMDPLNDNVAALLHQSTDRLTAEIWKDEQGGLQQFTF 654

  Fly   711 ----------------------------------IVGMAQ-QALTDTQFGARTRKGMFRTVSHLY 740
                                              |||:.| .:|.|...|.|.|:||||||..||
  Rat   655 LGSFPSPSPGPAGGLSSGASPPGLGSLCAPTVEGIVGLEQVSSLGDGPPGGRPRRGMFRTVGQLY 719

  Fly   741 KEQLAKLMDTLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQ 805
            ||.|::||.||.||||:|||||:|||||||||::..||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   720 KESLSRLMATLSNTNPSFVRCIVPNHEKRAGKLEPRLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRILFQ 784

  Fly   806 EFRQRYELLTPNVIPKGFMDGKKACEKMIQALELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKIS 870
            |||||||:||||.|||||||||:||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.|::
  Rat   785 EFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACEKMIQALELDPNLYRVGQSKIFFRAGVLAQLEEERDLKVT 849

  Fly   871 DLIVNFQAFCRGFLARRNYQKRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLLEVTKQEE 935
            |:||:|||..||:||||.:|:|.||.:|:|::||||||||||||||||||:.||||||:||:|:|
  Rat   850 DIIVSFQAAARGYLARRAFQRRQQQQSALRVMQRNCAAYLKLRNWQWWRLFIKVKPLLQVTRQDE 914

  Fly   936 KLVQKEDELKQVREKLDTLAKNTQEYERKYQQALVEKTTLAEQLQAEIELCAEAEESRSRLMARK 1000
            .|..:..||::|:|.....|:...|.:.:..|...|:..|||||:||.|||:||||:|:||.|||
  Rat   915 VLQARAQELQKVQELQQQSAREVGELQGRVAQLEEERARLAEQLRAEAELCSEAEETRARLAARK 979

  Fly  1001 QELEDMMQELETRIEEEEERVLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQLDAKIKK 1065
            ||||.::.|||.|:.||||....|..|||:|:.:||:||..||.||.||||||||||..:||:||
  Rat   980 QELELVVTELEARVGEEEECSRQLQSEKKRLQQHIQELETHLEAEEGARQKLQLEKVTTEAKMKK 1044

  Fly  1066 YEEDLALTDDQNQKLLKEKKLLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKLKAKHEATISELEERLHKDQ 1130
            :||||.|.:|||.||.||::|||||..:.|...||||||.|.|.||:.|:||||:::|:||.|::
  Rat  1045 FEEDLLLLEDQNSKLSKERRLLEERLAEFSSQAAEEEEKVKSLNKLRVKYEATIADMEDRLKKEE 1109

  Fly  1131 QQRQESDRSKRKIETEVADLKEQLNERRVQVDEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQKA 1195
            :.|||.::.||:::.|.::|:||:.|::.:.:|:..||.::||||...|:|.:||...:|...|:
  Rat  1110 KGRQELEKLKRRLDGESSELQEQMMEQKQRAEELLIQLGRKEEELQSALVRAEEEGGARAQLLKS 1174

  Fly  1196 QRELESQLAEIQEDLEAEKAARAKAEKVRRDLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQELA 1260
            .||.::.|||.|||||||:.|||||||.||||.||||||:.||.|:||:|.||||||||||||:.
  Rat  1175 LREAQAGLAEAQEDLEAERVARAKAEKQRRDLGEELEALRGELEDTLDSTNAQQELRSKREQEVT 1239

  Fly  1261 TLKKSLEEETVNHEGVLADMRHKHSQELNSINDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELRS 1325
            .|||:||||...||..:.::|.:|||.|..:.:|||..|:.|:|.||.:.:||||.::|.|||.|
  Rat  1240 ELKKTLEEEARTHEVAMQELRQRHSQALVELTEQLEQARRGKSVWEKTRLSLEAEVSELKTELSS 1304

  Fly  1326 VNSSRQENDRRRKQAESQIAELQVKLAEIERARSELQEKCTKLQQEAENITNQLEEAELKASAAV 1390
            :.:||||.:::|::.|||:.|:|.:.::.||||:|..||..:.|.|.|:::..|.|||.||....
  Rat  1305 LQTSRQEGEQKRRRLESQLQEVQGRSSDSERARAEAAEKLQRAQVELESVSTALSEAESKAIRLS 1369

  Fly  1391 KSASNMESQLTEAQQLLEEETRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTTQ 1455
            |..|:.||||.:.|:||:||||.||.|.|::|.:|:|...|:||:||:..|:....|:|.....|
  Rat  1370 KELSSAESQLHDTQELLQEETRAKLALGSRVRALEAEAAGLREQMEEEVVARERAGRELQTTQAQ 1434

  Fly  1456 MQEIKKKAEEDADLAKELEEGKKRLNKDIEALERQVKELIAQNDRLDKSKKKIQSELEDATIELE 1520
            :.|.:::.||:|.:.:..||.::|..::.|.|.:::.|.....:||:::::::|.||:|||::|.
  Rat  1435 LSEWRRRQEEEAAVLEAGEEARRRAAREAETLAQRLAEKTEAVERLERARRRLQQELDDATVDLG 1499

  Fly  1521 AQRTKVLELEKKQKNFDKILAEEKAISEQIAQERDTAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIEDL 1585
            .|:..:..|||||:.||::||||||...:..::|:..|.|.||:|.:.||::|.|:|..:..|:|
  Rat  1500 QQKQLLSTLEKKQRKFDQLLAEEKAAVLRAVEDRERVEAEGREREARALSLTRALEEEQEAREEL 1564

  Fly  1586 ENKRKTLQNELDDLANTQGTADKNVHELEKAKRALESQLAELKAQNEELEDDLQLTEDAKLRLEV 1650
            |.:.:.|:.||:.|.:::....|||||||:|:|..|...::|:.|..||||:|...|||||||||
  Rat  1565 ERQNRALRAELEALLSSKDDVGKNVHELERARRVAEQAASDLRTQVTELEDELTAAEDAKLRLEV 1629

  Fly  1651 NMQALRSQFERDLLAKEEGAEEKRRGLVKQLRDLETELDEERKQRTAAVASKKKLEGDLKEIETT 1715
            .:|||::|.||||..:::..||:||.|.|||||.|.|.|||||||..|:|::||||.:|:|::..
  Rat  1630 TVQALKAQHERDLQGRDDAGEERRRQLAKQLRDAEVERDEERKQRALAMAARKKLELELEELKAQ 1694

  Fly  1716 MEMHNKVKEDALKHAKKLQAQVKDALRDAEEAKAAKEELQALSKEAERKVKALEAEVLQLTEDLA 1780
            .....:.||:|:|..||:|||:|:..|:.||.::::||:..||:|:|:::|.||||||:|.|:||
  Rat  1695 TSAAGQGKEEAVKQLKKMQAQMKELWREVEETRSSREEMFTLSRESEKRLKGLEAEVLRLQEELA 1759

  Fly  1781 SSERARRAAETERDELAEEIANNANKGSLMIDEKRRLEARIATLEEELEEEQSNSEVLLDRSRKA 1845
            :|:||||.|:.:|||:|||:|:.....:..::|||:||.|:..|||||||||:|||:|.|..||.
  Rat  1760 ASDRARRQAQQDRDEMAEEVASGNLSKAATLEEKRQLEGRLGQLEEELEEEQNNSELLKDHYRKL 1824

  Fly  1846 QLQIEQLTTELANEKSNSQKNENGRALLERQNKELKAKLAEIETAQRTKVKATIATLEAKIANLE 1910
            .||:|.|||||:.|:|.|.|.|:||..||||.:||:|:|.|.:...|.:.|..||.||:|:|..|
  Rat  1825 VLQVETLTTELSAERSFSAKAESGRQQLERQIQELRARLGEEDAGARARQKMLIAALESKLAQAE 1889

  Fly  1911 EQLENEGKERLLQQKANRKMDKKIKELTMNIEDERRHVDQHKEQMDKLNSRIKLLKRNLDETEEE 1975
            ||||.|.:||:|..|..|:.:|::||:.:.:::|||..||.::|::|.|.|:|.|||.|:|.|||
  Rat  1890 EQLEQESRERILSGKLVRRAEKRLKEVVLQVDEERRVADQLRDQLEKSNLRLKQLKRQLEEAEEE 1954

  Fly  1976 LQKEKTQKRKYQRECEDMIESQEAMNREINSLKTKLRR 2013
            ..:.:..:|:.|||.||:.||.|:||||:.:|:.:|||
  Rat  1955 ASRAQAGRRRLQRELEDVTESAESMNREVTTLRNRLRR 1992

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
zipNP_523860.2 Myosin_N 80..117 CDD:280832 20/36 (56%)
Myosin_head 133..854 CDD:278492 492/767 (64%)
MYSc_Myh2_insects_mollusks 145..854 CDD:276876 481/755 (64%)
Myosin_tail_1 931..2011 CDD:279860 519/1079 (48%)
Prefoldin 1431..1515 CDD:298833 24/83 (29%)
FAM76 <1847..1926 CDD:292665 41/78 (53%)
Myh14XP_038967907.1 Motor_domain 115..833 CDD:419868 481/755 (64%)
Myosin_tail_1 910..1990 CDD:396244 519/1079 (48%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 990 1.000 Domainoid score I27
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0161
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 2335 1.000 Inparanoid score I31
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D40305at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000014
OrthoInspector 1 1.000 - - otm46459
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100110
Panther 1 1.100 - - O PTHR45615
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X58
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1110.870

Return to query results.
Submit another query.