DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment zip and Myh8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523860.2 Gene:zip / 38001 FlyBaseID:FBgn0287873 Length:2056 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001093955.1 Gene:Myh8 / 252942 RGDID:620356 Length:1937 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1975 Identity:767/1975 - (38%)
Similarity:1200/1975 - (60%) Gaps:80/1975 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    55 PELKYLSVERNQFNDPATQAEWTQKRLVWVPHENQGFVAASIKREHGDEVEVELAETGKRVMILR 119
            |.|:....||.:    |....:..|..|:|....:.:|.:.|:.:.|.:|.|: .|:|..:.:..
  Rat    17 PYLRKSEKERIE----AQNKPFDAKTSVFVAEPKESYVKSVIQSKEGGKVTVK-TESGATLTVKE 76

  Fly   120 DDIQKMNPPKFDKVEDMAELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCVVVNPYKKLPIYTEKI 184
            |.:..|||||:||:||||.:|.|:|..||:|:|:||.:.:||||||||||.|||||.||:|..::
  Rat    77 DQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPGVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEV 141

  Fly   185 MERYKGIKRHEVPPHVFAITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQFLAYVAASKP 249
            :..|:|.||.|.|||:|:|:|:||:.||.|||:||||.|||||||||.|||:|||:.|.:|    
  Rat   142 VAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIA---- 202

  Fly   250 KGSGAVPHPAVLINFSVNTNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSNCQEGELEQQLLQANP 314
                                                  |.|.|..| .|...:|.||.|::.|||
  Rat   203 --------------------------------------VTGEKKKE-ESGKMQGTLEDQIISANP 228

  Fly   315 ILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIRQAKDERTFHIFYQLL 379
            :||||||||||:|||||||||||||:|..:|.::.|:||||||||||...|.|.||::|||||:.
  Rat   229 LLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQIT 293

  Fly   380 AGATPEQREKFIL-DDVKSYAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIMGMTSEDFNSIFRIVSA 443
            :...||..|..:: .:...|||:|.|.:.||.:||..|..||..:::|:|.:.|:..||:::..|
  Rat   294 SNKKPELIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPSIDDQEELMATDSAIDILGFSPEEKVSIYKLTGA 358

  Fly   444 VLLFGSMKFRQERNNDQATLPDNT-VAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRIKVGRDFVTKAQTKEQ 507
            |:.:|:|||:|::..:||. ||.| ||.|.|:|..|:..|:.:|...||:|||.::|||.||.:|
  Rat   359 VMHYGNMKFKQKQREEQAE-PDGTEVADKAAYLQSLNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQ 422

  Fly   508 VEFAVEAIAKACYERMFKWLVNRINRSLDRTKRQGASFIGILDMAGFEIFELNSFEQLCINYTNE 572
            |..||.|:|||.||:||.|:|.|||:.|| ||:....|||:||:||||||:.||.||||||:|||
  Rat   423 VYNAVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLD-TKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNE 486

  Fly   573 KLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPGGIMALLDEECWFPKATDKTF 637
            ||||.|||.||:||||||::|||||.|||||:||...|:||:||.||.::|:|||.||||||.:|
  Rat   487 KLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLAACIELIEKPLGIFSILEEECMFPKATDTSF 551

  Fly   638 VDKLVSAH-SMHPKFMK---TDFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWLMKNMDPLNENIVSLLQGSQ 698
            .:||...| .....|.|   |..:..|.|:::||||.|||:...||.||.||||:.:|.|.|.|.
  Rat   552 KNKLYDQHLGKSNNFQKPKPTKGKAEAHFSLIHYAGTVDYNITGWLDKNKDPLNDTVVGLYQKSA 616

  Fly   699 DPFVVNI---WKDAEIVGMAQQALTDTQFGARTRKGMFRTVSHLYKEQLAKLMDTLRNTNPNFVR 760
            ...:.::   :..||..|.|::       ||:.:...|:|||.|::|.|.|||..||:|:|:|||
  Rat   617 MKTLASLFSTYASAEADGGAKK-------GAKKKGSSFQTVSALFRENLNKLMTNLRSTHPHFVR 674

  Fly   761 CIIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQEFRQRYELLTPNVIPKG-FM 824
            |||||..|..|.::..|||.|||||||||||||||:|||:||.:.:|:|||::|..:.||:| |:
  Rat   675 CIIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRYKVLNASAIPEGQFI 739

  Fly   825 DGKKACEKMIQALELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKISDLIVNFQAFCRGFLARRNY 889
            |.|||.||::.::::|...|:.|.:|:||:||:|..|||.||.|::.:|...||.|||:|.|..|
  Rat   740 DSKKASEKLLGSIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDEKLAQIITRTQAVCRGYLMRVEY 804

  Fly   890 QKRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLLEVTKQEEKLVQKEDELKQVREKLDTL 954
            ||.|.:..:|..||.|..|::.:::|.|.:|:.|:||||:..:.|:::...::|.::.:::|...
  Rat   805 QKMLLRRESIFCIQYNIRAFMNVKHWPWMKLFFKIKPLLKSAETEKEMATMKEEFQKTKDELAKS 869

  Fly   955 AKNTQEYERKYQQALVEKTTLAEQLQAEIELCAEAEESRSRLMARKQELEDMMQELETRIEEEEE 1019
            ....:|.|.|....|.||..|..|:|:|.:..|:|||...:|:..|.:||..::|:..|.|:|||
  Rat   870 EAKRKELEEKMVTLLKEKNDLQLQVQSEADSLADAEERCEQLIKNKIQLEAKIKEVTERAEDEEE 934

  Fly  1020 RVLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQLDAKIKKYEEDLALTDDQNQKLLKEK 1084
            ....|..:|:|||....:|::.:::.|....|::.||...:.|:|...|::|..|:...||.|||
  Rat   935 INAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAGLDETIAKLTKEK 999

  Fly  1085 KLLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKLKAKHEATISELEERLHKDQQQRQESDRSKRKIETEVAD 1149
            |.|:|........|..||:|...|.|.|.|.|..:.:||..|.::::.|.:.:|:|||:|.::..
  Rat  1000 KALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKTKLEQQVDDLEGSLEQEKKLRMDLERAKRKLEGDLKL 1064

  Fly  1150 LKE---QLNERRVQVDEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQKAQRELESQLAEIQEDLE 1211
            .:|   .:...:.|:||   :|.|:|.|::..:.:|::|.|.:...||..:||::::.|::|::|
  Rat  1065 AQESTMDIENDKQQLDE---KLKKKEFEISNLISKIEDEQAVEIQLQKKIKELQARIEELEEEIE 1126

  Fly  1212 AEKAARAKAEKVRRDLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQELATLKKSLEEETVNHEGV 1276
            ||:|:||||||.|.|||.|||.:...|.::...|:||.||..|||.|...|::.|||.|:.||..
  Rat  1127 AERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQVELNKKRETEFQKLRRDLEEATLQHEAT 1191

  Fly  1277 LADMRHKHSQELNSINDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELRSVNSSRQENDRRRKQAE 1341
            .|.:|.||:..:..:.:|::||::.|..|||.|..|:.|..||::...::..::...::..:..|
  Rat  1192 SAALRKKHADSMAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDLSSNAEAIAKAKGNLEKMCRTLE 1256

  Fly  1342 SQIAELQVKLAEIERARSELQEKCTKLQQEAENITNQLEEAELKASAAVKSASNMESQLTEAQQL 1406
            .|::||:.|..|.:|..:||..:..:||.||...:.||:|.:...|...:|......|:.|.::.
  Rat  1257 DQVSELKSKEEEQQRLINELTAQRARLQTEAGEYSRQLDEKDALVSQLSRSKQASTQQIEELKRQ 1321

  Fly  1407 LEEETRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTTQMQEIKKKAEEDA-DLA 1470
            |||||:.|..|:..|:....:.:.|:||.||:.|.|...:|.|::..:::.:.:.|.|.|| ...
  Rat  1322 LEEETKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQRALSKANSEVAQWRTKYETDAIQRT 1386

  Fly  1471 KELEEGKKRLNKDIEALERQVKELIAQNDRLDKSKKKIQSELEDATIELEAQRTKVLELEKKQKN 1535
            :||||.||:|.:.::|.|..|:.:.|:...|:|:|:::|:|:||..:::|........|:|||:|
  Rat  1387 EELEEAKKKLAQRLQAAEEHVEAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMLDVERTNAACAALDKKQRN 1451

  Fly  1536 FDKILAEEKAISEQIAQERDTAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIEDLENKRKTLQNELDDLA 1600
            |||:|:|.:...|:...|.::.::|:|...|::..|....:|:.|::|.|..:.|.||.|:.||.
  Rat  1452 FDKVLSEWRQKYEETQAELESCQKESRTLSTELFKVKNAYEESLDQLETLRRENKNLQQEISDLT 1516

  Fly  1601 NTQGTADKNVHELEKAKRALESQLAELKAQNEELEDDLQLTEDAKLRLEVNMQALRSQFERDLLA 1665
            .......|::|||||.|:.:|.:..|::|..||.|..|:..|...||:::.:..::|:.:|.:..
  Rat  1517 EQIAEGGKHIHELEKIKKQVEQEKCEIQAALEEAEASLEHEEGKILRIQLELNQVKSEIDRKIAE 1581

  Fly  1666 KEEGAEEKRRGLVKQLRDLETELDEERKQRTAAVASKKKLEGDLKEIETTMEMHNKVKEDALKHA 1730
            |:|..::.:|..::.:..:::.||.|.:.|..|:..|||:||||.|:|..:...|::..::|::.
  Rat  1582 KDEEIDQLKRNHIRVVETMQSTLDAEIRSRNDALRVKKKMEGDLNEMEIQLNHANRLAAESLRNY 1646

  Fly  1731 KKLQAQVKDALRDAEEAKAAKEELQALSKEAERKVKALEAEVLQLTEDLASSERARRAAETERDE 1795
            :..|..:||.....::|...:|:|:......||:...|:||:.:|...|..:||:|:.||.|..:
  Rat  1647 RNTQGILKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAIVERRANLLQAEIEELRATLEQTERSRKIAEQELLD 1711

  Fly  1796 LAEEIANNANKGSLMIDEKRRLEARIATLEEELEE---EQSNSEVLLDRSRKAQLQIEQLTTELA 1857
            .:|.:.....:.:.:|:.|::||..::.|:.|:||   |..|:|   ::::||......:..||.
  Rat  1712 ASERVQLLHTQNTSLINTKKKLENDVSQLQSEVEEVIQESRNAE---EKAKKAITDAAMMAEELK 1773

  Fly  1858 NEKSNSQKNENGRALLERQNKELKAKLAEIETAQRTKVKATIATLEAKIANLEEQLENEGKERLL 1922
            .|:..|...|..:..||:..|:|:.:|.|.|.......|..|..|||::..||.::|||.|....
  Rat  1774 KEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELEGEVENEQKRNAE 1838

  Fly  1923 QQKANRKMDKKIKELTMNIEDERRHVDQHKEQMDKLNSRIKLLKRNLDETEEELQKEKTQKRKYQ 1987
            ..|..||.::::||||...|::|::|.:.::.:|||.:::|..||..:|.||:......:.||.|
  Rat  1839 AVKGLRKHERRVKELTYQTEEDRKNVLRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQSNVNLAKFRKLQ 1903

  Fly  1988 RECEDMIESQEAMNREINSLKTKLR 2012
            .|.|:..|..:....::|.|:.|.|
  Rat  1904 HELEEAEERADIAESQVNKLRVKSR 1928

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
zipNP_523860.2 Myosin_N 79..122 CDD:460670 11/42 (26%)
MYSc_Myh2_insects_mollusks 145..854 CDD:276876 358/718 (50%)
Myosin_tail_1 931..2011 CDD:460256 342/1086 (31%)
Myh8NP_001093955.1 Myosin_N 35..79 CDD:460670 11/44 (25%)
Motor_domain 102..769 CDD:473979 358/718 (50%)
Myosin_tail_1 849..1926 CDD:460256 342/1082 (32%)

Return to query results.
Submit another query.