DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment zip and myo-2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523860.2 Gene:zip / 38001 FlyBaseID:FBgn0287873 Length:2056 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_510092.2 Gene:myo-2 / 181404 WormBaseID:WBGene00003514 Length:1947 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1990 Identity:710/1990 - (35%)
Similarity:1121/1990 - (56%) Gaps:83/1990 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    53 NDPELKYLSVERNQFNDPATQAEWTQKRLVWVPHENQGFVAASIKREHGDEVEVELAETGKRVMI 117
            |||..|||...|.:.....::| :..|:.||:|....|::...|.:..||.|.|.:.: |....:
 Worm     5 NDPGWKYLRRSREEMLQDQSRA-YDSKKNVWIPDSEDGYIEGVITKTAGDNVTVSIGQ-GAEKTV 67

  Fly   118 LRDDIQKMNPPKFDKVEDMAELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCVVVNPYKKLPIYTE 182
            .:|.:|:||||||:|.|||:.||.||:||||:|:|.||.:.||||||||||||:||||:|||||:
 Worm    68 KKDVVQEMNPPKFEKTEDMSNLTFLNDASVLYNLKARYAAMLIYTYSGLFCVVINPYKRLPIYTD 132

  Fly   183 KIMERYKGIKRHEVPPHVFAITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQFLAYVAAS 247
            .:...:.|.:|.|:|||:||::|.||||||.:.|:||:|.||||||||||||||||.:.|.|.|:
 Worm   133 SVARMFMGKRRTEMPPHLFAVSDEAYRNMLQNHENQSMLITGESGAGKTENTKKVISYFAAVGAA 197

  Fly   248 KPKGSGAVPHPAVLINFSVNTNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSNCQEGELEQQLLQA 312
            :.:..||                    |..|               .|.:.|.::..||.|::|.
 Worm   198 QQETFGA--------------------KKAA---------------TEEDKNKKKVTLEDQIVQT 227

  Fly   313 NPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIRQAKDERTFHIFYQ 377
            ||:||||||||||:|:|||||||||||:|...|.::..:||.|||||||.||||..||.:|||||
 Worm   228 NPVLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFIRIHFSKQGRVASCDIEHYLLEKSRVIRQAPGERCYHIFYQ 292

  Fly   378 LLAGATPEQREKFILD-DVKSYAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIMGMTSEDFNSIFRIV 441
            :.:...|..::..:|: .||.|.|::...|.:.|::|..|.|.|.::.:|:..|..:....:|:|
 Worm   293 VFSDYLPNLKKDLLLNKPVKDYWFIAQAELIIDGINDKEEHQLTDEAFDILKFTPTEKMECYRLV 357

  Fly   442 SAVLLFGSMKFRQERNNDQATLPDNT-VAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRIKVGRDFVTKAQTK 505
            :|::..|:|||:|....:||. ||.| .|::.|...|:...:..:|...||:|||.::|.|.|..
 Worm   358 AAMMHMGNMKFKQRPREEQAE-PDGTDDAERAAKCFGIDSEEFLKALTRPRVKVGNEWVNKGQNI 421

  Fly   506 EQVEFAVEAIAKACYERMFKWLVNRINRSLDRTKRQGASFIGILDMAGFEIFELNSFEQLCINYT 570
            |||.:||.|:||..|.|:|.|||.:.|::||:.......|||:||:||||||:.||||||.||:.
 Worm   422 EQVNWAVGAMAKGLYSRIFNWLVKKCNQTLDQKGISRDHFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLWINFV 486

  Fly   571 NEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPGGIMALLDEECWFPKATDK 635
            ||||||.|||.||:||||||.||||:|.|||||||||..|:||:||.||:|:|||||..|||||.
 Worm   487 NEKLQQFFNHHMFVLEQEEYAREGIQWTFIDFGLDLQACIELIEKPLGIIAMLDEECIVPKATDL 551

  Fly   636 TFVDKLVSAH-SMHPKFMK----TDFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWLMKNMDPLNENIVSLLQ 695
            |...||:..| ..||.|.|    ...:..|.||:.||||.|.|:...||.||.||||:.:|::::
 Worm   552 TLAQKLIDQHLGKHPNFEKPKPPKGKQAEAHFAMRHYAGTVRYNCLNWLEKNKDPLNDTVVTVMK 616

  Fly   696 GSQD-PFVVNIWKDAEIVGMAQQALTDTQFGART--RKGMFRTVSHLYKEQLAKLMDTLRNTNPN 757
            .|:: ..:|.:|:|......|..|......||:.  :.|.|.|||.||:|.|.|||..|.:|:|:
 Worm   617 ASKEHALIVEVWQDYTTQEEAAAAAAKGTAGAKKKGKSGSFMTVSMLYRESLNKLMTMLHSTHPH 681

  Fly   758 FVRCIIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQEFRQRYELLTPNVIPKG 822
            |:||||||.:|.:|.|||.|||:||.||||||||||||:|||||....:|.|||.||..:....|
 Worm   682 FIRCIIPNEKKASGVIDAGLVLNQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRTLHPDFVQRYALLAADESIIG 746

  Fly   823 FMDGKKACEKMIQAL----ELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKISDLIVNFQAFCRGF 883
            ..|.||....|:..|    :|:...:|||.:|:||:||::||||:.||..::.||...||..|.:
 Worm   747 KTDAKKGSALMLARLVKEKKLEEENFRVGLTKVFFKAGIVAHLEDLRDQSLAQLITGLQAQIRWY 811

  Fly   884 LARRNYQKRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLL---EVTKQEEKL-------- 937
            ......::|::::.|::|||||..::.:||.|.|::||.|||||:   ::..|.|||        
 Worm   812 YQTIERKRRVEKITALKIIQRNIRSWAELRTWVWFKLYGKVKPLVNSGKIEAQYEKLQETVATLK 876

  Fly   938 ---VQKEDELKQVREKLDTLAKNTQEYERKYQQALVEKTTLAEQLQAEIELCAEAEESRSRLMAR 999
               ||:|::.:|::|..:.|.|.|.:              |..||:|......|.||..:.:..:
 Worm   877 DTVVQEEEKKRQLQEGAERLNKETAD--------------LLAQLEASKGSTREVEERMTAMNEQ 927

  Fly  1000 KQELEDMMQELETRIEEEEERVLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQLDAKIK 1064
            |..||..:.:...::|.||.|.:.:..:||.:|....||::..::.:.:.:|::.||...:.:|:
 Worm   928 KVALEGKLADASKKLEVEEARAVEINKQKKLVEAECADLKKNCQDVDLSLRKVEAEKNAKEHQIR 992

  Fly  1065 KYEEDLALTDDQNQKLLKEKKLLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKLKAKHEATISELEERLHKD 1129
            ..::::...|:...||.||:|..||:...|::.|...||:.....|||||...::.:.|:.:.::
 Worm   993 ALQDEMRQQDENISKLNKERKNQEEQNKKLTEDLQAAEEQNLAANKLKAKLMQSLEDSEQTMERE 1057

  Fly  1130 QQQRQESDRSKRKIETEVADLKEQLNERRVQVDEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQK 1194
            ::.|.:.|::|||.|.|:...:|.|.|......:.:..|.::|.||....:::::|.|..|..||
 Worm  1058 KRNRADMDKNKRKAEGELKIAQETLEELNKSKSDAENALRRKETELHTLGMKLEDEQAAVAKLQK 1122

  Fly  1195 AQRELESQLAEIQEDLEAEKAARAKAEKVRRDLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQEL 1259
            ..::.|:::.::.:.|..||.||.:|::.|.|...|.:.|..:|.|....||||.||..|::.||
 Worm  1123 GIQQDEARVKDLHDQLADEKDARQRADRSRADQQAEYDELTEQLEDQARATAAQIELGKKKDAEL 1187

  Fly  1260 ATLKKSLEEETVNHEGVLADMRHKHSQELNSINDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELR 1324
            ..|::.|||..:.....|..::.|.|..:..::||:|.|:|.|..:||.||.::.|..:.:..|.
 Worm  1188 TKLRRDLEESGLKFGEQLTVLKKKGSDAIQELSDQIEQLQKQKGRIEKEKGHMQREFDESSAALD 1252

  Fly  1325 SVNSSRQENDRRRKQAESQIAELQVKLAEIERARSELQEKCTKLQQEAENITNQLEEAELKASAA 1389
            .....|.:.:|..|..|.::.||::|..|..|...:......:|..|..::..|:||.|.|..||
 Worm  1253 QEAKLRADQERIAKGYEVRLLELRLKADEQSRQLQDFVSSKGRLNSENSDLARQVEELEAKIQAA 1317

  Fly  1390 VKSASNMESQLTEAQQLLEEETRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTT 1454
            .:......::|..|::..|||:|::..||:..:.:..|.|.|:|.:|::...|....|:|::.:.
 Worm  1318 NRLKLQFSNELDHAKRQAEEESRERQNLSNLSKNLARELEQLKESIEDEVAGKNEASRQLSKASV 1382

  Fly  1455 QMQEIKKKAEEDADL-AKELEEGKKRLNKDIEALERQVKELIAQNDRLDKSKKKIQSELEDATIE 1518
            ::.:.:.|.|.:..: |.|.:|.|||.|:....::..:....|:...|:.::.::.:|.:...:|
 Worm  1383 ELDQWRTKFETEGLIGADEFDEVKKRQNQKTSEIQDALDACNAKIVALENARSRLTAEADANRLE 1447

  Fly  1519 LEAQRTKVLELEKKQKNFDKILAEEKAISEQIAQERDTAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIE 1583
            .|.....|..||||||.|||::.|.|...:.:..|.|.|:|:||:...:...:..:.|...|::|
 Worm  1448 AEHHAQAVSSLEKKQKAFDKVIDEWKKKVDDLYLELDGAQRDARQLSGEAHKLRGQHDTLADQVE 1512

  Fly  1584 DLENKRKTLQNELDDLANTQGTADKNVHELEKAKRALESQLAELKAQNEELEDDLQLTEDAKLRL 1648
            .|..:.|:|.:|..||..:.....:..|.|.|..|.||.:..||:...:|.|..|:..|...||.
 Worm  1513 GLRRENKSLSDETRDLTESLSEGGRATHALSKNLRRLEMEKEELQRGLDEAEAALESEESKALRC 1577

  Fly  1649 EVNMQALRSQFERDLLAKEEGAEEKRRGLVKQLRDLETELDEERKQRTAAVASKKKLEGDLKEIE 1713
            ::.:..:|::.|:.:..|||..|..|:...:.:..::..||.|.|.::.....|||||.|:.|:|
 Worm  1578 QIEVSQIRAEIEKRIAEKEEEFENHRKVHQQTIDSIQATLDSETKAKSELFRVKKKLEADINELE 1642

  Fly  1714 TTMEMHNKVKEDALKHAKKLQAQVKDALRDAEEAKAAKEELQALSKEAERKVKALEAEVLQLTED 1778
            ..::..||..|||.|:.::...|:::..:..:|.:..:||.:.....||||:...:.|..:|...
 Worm  1643 IALDHANKANEDAQKNIRRYLDQIRELQQTVDEEQKRREEFREHLLAAERKLAVAKQEQEELIVK 1707

  Fly  1779 LASSERARRAAETERDELAEEIANNANKGSL-MIDEKRRLEARIATLEEELEEEQSNSEVLLDRS 1842
            |.:.|||||..|:...| .:|..|..|..:: :...|.:|:..||.|..::.|..:......||.
 Worm  1708 LEALERARRVVESSVKE-HQEHNNELNSQNVALAAAKSQLDNEIALLNSDIAEAHTELSASEDRG 1771

  Fly  1843 RKAQLQIEQLTTELANEKSNSQKNENGRALLERQNKELKAKLAEIETAQRTKVKATIATLEAKIA 1907
            |:|.....:|..:|.:|:..||:.|..:..||...|:|:.:....|.|........|...|.::.
 Worm  1772 RRAASDAAKLAEDLRHEQEQSQQLERFKKQLESAVKDLQERADAAEAAVMKGGAKAIQKAEQRLK 1836

  Fly  1908 NLEEQLENEGKERLLQQKANRKMDKKIKELTMNIEDERRHVDQHKEQMDKLNSRIKLLKRNLDET 1972
            ..:..||.|.:......|...:.|:|::|....:.:::::.|:.:|.::||.:::||.|:.|:|.
 Worm  1837 AFQSDLETESRRAGEASKTLARADRKVREFEFQVAEDKKNYDKLQELVEKLTAKLKLQKKQLEEA 1901

  Fly  1973 EEELQKEKTQKRKYQRECEDMIESQEAMNREINSLKTKLR 2012
            ||:.....::.|..|...|...|..::..:.:..::::.|
 Worm  1902 EEQANSHLSKYRTVQLSLETAEERADSAEQCLVRIRSRTR 1941

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
zipNP_523860.2 Myosin_N 79..122 CDD:460670 12/42 (29%)
MYSc_Myh2_insects_mollusks 145..854 CDD:276876 348/722 (48%)
Myosin_tail_1 931..2011 CDD:460256 294/1092 (27%)
myo-2NP_510092.2 COG5022 27..1478 CDD:227355 580/1501 (39%)
MYSc_class_II 95..782 CDD:276951 348/722 (48%)
SMC_prok_B 1097..1936 CDD:274008 230/839 (27%)

Return to query results.
Submit another query.