Protein Alignment zip and nmy-3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523860.2
• Gene: zip / 38001
• FlyBaseID: FBgn0287873
• Length: 2056
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_501620.2
• Gene: nmy-3 / 177750
• WormBaseID: WBGene00012437
• Length: 1464
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1615
• Identity: 463/1615 - (28%)
• Similarity: 796/1615 - (49%)
• Gaps: 224/1615 - (13%)

  Fly    47 SEEVDRNDPELKYLSVER--NQFNDPATQAEWTQKRLVWVPHENQGFVAASIKREHGDEVEVELA 109
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 Worm     4 SSGIDLEPNILRHLQTKKVEERIEDLNNQ--------IWIEDDLYGYRMVTVIDEGLSDLLVGFR 60

  Fly   110 -ETG----KRVMILRDDIQKMNPPKFDKVEDMAELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCV 169
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 Worm    61 DEQGFFEKKRIEKTKCEVPSLN----NYSEDLCTLTQPNAATVLNALKIRYTSNVIHTFCGLFCV 121

  Fly   170 VVNPYKKLPIYTEKIMERYKGIKRHEVPPHVFAITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENT 234
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 Worm   122 VINPWRNIPIYSDEVKQLYQ--LQNDLPPHVYSVAQNAFHGILKGGRNQSILITGESGAGKTENT 184

  Fly   235 KKVIQFLAYVAASKPKGSGAVPHPAVLINFSVNTNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSN 299
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 Worm   185 KKIIDF--------------------ILSSSVS--------------NNTI------------GD 203

  Fly   300 CQEGELEQQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIR 364
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 Worm   204 C--------VVTSGVLLEAMGNARTTHNSNSSRFGKFIRIEFDENSKLIGAKIECYLLEKSRVVF 260

  Fly   365 QAKDERTFHIFYQLLAGATPEQREKF--ILDDVKSYAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIM 427
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 Worm   261 QSDGDRNFHIFYQMLSNYFDNPHKSFLKLSKKVNEYKYLRNDD---SMIDDAETAKMTDEAFTRI 322

  Fly   428 GMTSEDFNSIFRIVSAVLLFGSMKFRQERNNDQATLPDNTVAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRI 492
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 Worm   323 GLSEEEKIWIFQILSAVLWIGDIKFGERSGLDVSFVESMQEVDNIAELLEMKSSKLVDALTQPTI 387

  Fly   493 KVGRDFVTKAQTKEQVEFAVEAIAKACYERMFKWLVNRINR--SLDRTKR--QGASFIGILDMAG 553
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 Worm   388 KVHDKLIRKNQNLAKTLSSASAMAKILYERLFGWIVKRCNDAFSVDDTESTCRLSRFIAVLDIAG 452

  Fly   554 FEIFELNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPGG 618
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 Worm   453 FEIIEKNSFEQFCINYTNEKLQQFFNHFMFAKEQSDYLEEGIKWTQVNFANHLQPTIDLIEKPMG 517

  Fly   619 IMALLDEECWFPKATDKTFVDKLVSAHSMHPKFMKT----DFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWL 679
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 Worm   518 ILSFLEEECVVPNGSEKSLLEKLCSNLSNDSSFKKSKQTQKCSTIRHFYVQHYAGEVHYNIDGWL 582

  Fly   680 MKNMDPLNENIVSLLQGSQDPFVVNIWKDAEIVGMAQQALTDTQFGARTRKGMF--RTVSHLYKE 742
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 Worm   583 DKNRDNVETSVLDILSQSTHPLLKLLFPPVPVNNL------------KTRRGTITNSTVSFLYKN 635

  Fly   743 QLAKLMDTLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQEF 807
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 Worm   636 QLQCLLDTLNSSSAHFIRCVVSNYEKLPGKIDAPLVLAQLKCNGVLEGIRICREGYPSRLSHSEF 700

  Fly   808 RQRYELLTPNVIPKGFMDGKKACEKMIQALELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKISDL 872
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 Worm   701 IERYSLLMKNKEQSKGASEKEKCTLICQDAQVRKERYAVGKTKLFCKVGVISELETKRNNYISSF 765

  Fly   873 IVNFQAFCRGFLARRNYQKRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLLEVTKQEEKL 937
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 Worm   766 IILIQANIRYLNIQKDLIERRKKLEAVVTIQDNVRQFAELSQWPWYRIYHLTRGLIPRNRDKERI 830

  Fly   938 VQKEDELKQVREKLDTLAKNTQEYERKYQQALVEKTTL--------AEQLQAEIELCAEAEESRS 994
            .:.|:|..::.|::       ||.|.|.::||.|...|        :|:::.:.||....::.|.
 Worm   831 EELENEKLKLEEEI-------QEMEIKNEEALKENLKLSMLLDREKSEKVKVQKELEEVEKQGRE 888

  Fly   995 RLMARKQELEDMMQELETRIEEEEERVLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQL 1059
            :|:.:::|....|:|:    |:.||....|..:..:....:..:.:.|.|.|...::|.:||..|
 Worm   889 KLLEKEREFRKTMEEM----EQNEEIFNVLERKYNEQHKKVMKMNDVLREYERKIEQLNMEKTDL 949

  Fly  1060 DAKIKKYEEDLALTDDQNQKLLKE----KKLLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKL-------KA 1113
            :.:.:|..|.....|.....|.||    ..|::|..|.:.:...|..|:...:|||       ||
 Worm   950 ENENQKLRETQNRQDSHYSNLEKEVMEKSSLIDELQNQIQKLSDENNEQRLTIAKLETALEDEKA 1014

  Fly  1114 KH----------EATISELEERLHK-------DQQQRQESDRSKRKIETEVADLKEQLNERRVQV 1161
            :.          :..||||.|::.:       ::...::.:|.|.|:..|:...||.:.::..::
 Worm  1015 RFARQNNTIGDMQKLISELNEKIARFDNIALNERNSTRKIEREKEKLNEELTTAKEIIQKQAKKI 1079

  Fly  1162 DEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQKAQREL-ESQLAEIQEDLEAEKAARAKAEKVRR 1225
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 Worm  1080 DELKEECRKRKNEASRLERKLEDKEAMMADCVKELKDSHKERLKEMEQKVEDVKRKNSKLENENS 1144

  Fly  1226 DLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQELATLKKSLEEETVNHEGVLADMRHKHSQELNS 1290
            ....::|..:.|  .|:|:...:..     ...|:||.:.....::   |..:.:|   :..|.|
 Worm  1145 TQKSQIETFQRE--SSVDSDYGRSS-----SGRLSTLGRQYSLTSI---GSFSSIR---TVGLGS 1196

  Fly  1291 INDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELRSVNSSRQENDRRRKQAESQIAELQVKLAEIE 1355
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 Worm  1197 RKDSISDMTSSMYSLRRRDSTYDMTSSTIGLQRSPSTSQVMEKERRILELEKEKAAINTDLQLVK 1261

  Fly  1356 RARSELQEKCTKLQQEAENI-------TNQLEEAELKASAAVKSASNMESQLTEAQQLLEEETRQ 1413
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 Worm  1262 RELDVYKSQLSAVESEKESLQTANRKQSNQLQETTRQLNSAQKNADNLALRLKKA---------- 1316

  Fly  1414 KLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTTQMQEIKKKAEEDADLAKELEEGKK 1478
                                 |.:.||.|:.:|..:.|..|::...:|:|.:.|
 Worm  1317 ---------------------LADCDEWKKKHEESIVESKTEILMERKRAMDRA----------- 1349

  Fly  1479 RLNKDIEALERQVKELIAQNDRLDKSKKKIQSELEDATIELEAQRTKVLELE---KKQKNFDKIL 1540
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 Worm  1350 ------EACEKETELKQSRMATIESARMELGGELARTQSELDRCRQIIIQLEENLKSQESLGNSF 1408

  Fly  1541 AEEKA-ISEQIAQERD--TAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIEDLENKRKTL 1592
            ...:. ::.:|...||  .|.:....::.|.:.:..:.||..|::...|||.:.|
 Worm  1409 GRHQTNLNFEIENLRDENCALKAKIRRQYKQIELLTQQDETNDELNHFENKVERL 1463

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
zip	NP_523860.2	Myosin_N	79..122	CDD:460670	8/47 (17%)
		MYSc_Myh2_insects_mollusks	145..854	CDD:276876	280/720 (39%)
		Myosin_tail_1	931..2011	CDD:460256	140/712 (20%)
nmy-3	NP_501620.2	MYSc_class_II	97..747	CDD:276951	280/720 (39%)
		SMC_prok_B	848..>1463	CDD:274008	133/679 (20%)