DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment zip and nmy-2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523860.2 Gene:zip / 38001 FlyBaseID:FBgn0287873 Length:2056 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_492186.3 Gene:nmy-2 / 172562 WormBaseID:WBGene00003777 Length:2003 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1993 Identity:930/1993 - (46%)
Similarity:1366/1993 - (68%) Gaps:54/1993 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    52 RNDPELKYLSVERNQFNDPATQAEWTQKRLVWVPHENQGF-VAASIKREHGD-EVEVELAETGKR 114
            :.|.|:..|.. :..|.:|:..|:|.:|:|:|||.|..|| :.|.|...|.| .:::||.|||:|
 Worm     6 QKDDEIDQLRA-KTDFLNPSISADWAKKKLMWVPSEKDGFALGAVIGEPHADGTIDIELMETGER 69

  Fly   115 VMILRDDIQKMNPPKFDKVEDMAELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCVVVNPYKKLPI 179
            ..:..||.||.||||:||.|||:.||||||||||||:|.||:|.|.||||||||||:||||::||
 Worm    70 QRVSSDDCQKPNPPKYDKCEDMSMLTCLNEASVLHNLKQRYFSNLYYTYSGLFCVVINPYKRIPI 134

  Fly   180 YTEKIMERYKGIKRHEVPPHVFAITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQFLAYV 244
            ||:.|.|::|..||.|:|||:||:.|.|||:||.:|:|||||||||||||||||||||||:||||
 Worm   135 YTDTIAEQFKCKKRKEMPPHIFAVADEAYRSMLQERDDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQYLAYV 199

  Fly   245 AASKPKGSGAVPHPAVLINFSVNTNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSNCQEGELEQQL 309
            |.                            :.|.:|:..:::       ::.::|...|:||:||
 Worm   200 AN----------------------------RSMVKNRKTSVD-------LDTSTNRIMGQLEEQL 229

  Fly   310 LQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIRQAKDERTFHI 374
            ||||||||||||:||||||||||||||||::||::|.|||||||.|||||||.::||.:||:|||
 Worm   230 LQANPILEAFGNSKTVKNDNSSRFGKFIRVHFDSTGCISGANIEFYLLEKSRVLKQAPNERSFHI 294

  Fly   375 FYQLLAGATPEQREKFILDD-VKSYAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIMGMTSEDFNSIF 438
            |||||.|.:..|||.::|:| :..|.|:|||...:.||||.||.:.|:.:|:|||:..|:...|.
 Worm   295 FYQLLKGLSKVQREHYLLEDSLSKYKFVSNGDSKLAGVDDGAEMKETLNAMSIMGLNDEEIGGIL 359

  Fly   439 RIVSAVLLFGSMKFRQE-RNNDQATLPDNTVAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRIKVGRDFVTKA 502
            |:||||:|||:::|..| :|||||.|.::.||||||.|||::||::.||||.|:|||.||.|.:|
 Worm   360 RVVSAVMLFGNLEFSHENKNNDQAVLLNDAVAQKIASLLGVNVTELMRAFLKPKIKVQRDLVHRA 424

  Fly   503 QTKEQVEFAVEAIAKACYERMFKWLVNRINRSLDRTKRQGASFIGILDMAGFEIFELNSFEQLCI 567
            |:.:||.|:|.|||||.|||:|:|||:|:|:|||||::|..|||||||:|||||||.||||||||
 Worm   425 QSVDQVNFSVGAIAKASYERLFRWLVHRLNKSLDRTRQQSVSFIGILDIAGFEIFETNSFEQLCI 489

  Fly   568 NYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPGGIMALLDEECWFPKA 632
            ||||||||||||:|||:.||:||..||:||||:||||:|||||||||||.|||:.||:.|.||:.
 Worm   490 NYTNEKLQQLFNNTMFVREQQEYLDEGLEWKFLDFGLNLQPTIDLIDKPMGIMSTLDDVCLFPQG 554

  Fly   633 TDKTFVDKLVSAHSMHPKFMKTDFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWLMKNMDPLNENIVSLLQGS 697
            .|::||.:|.:.||.|||::..:.|..:|||:|||||||||.:..|.:|||||||||::.:|:.|
 Worm   555 NDQSFVQRLNNTHSQHPKYVVPEIRSRSDFAVVHYAGRVDYQSEGWRVKNMDPLNENVIDVLKTS 619

  Fly   698 QDPFVVNIWKD-AEIVGM-AQQALTDT-QFGART-RKGMFRTVSHLYKEQLAKLMDTLRNTNPNF 758
            ::..:|::||| |::..: |..:.:|| .||:|. :||||||||.|||||||:||.||.||||:|
 Worm   620 KESLIVDMWKDIADVCSLSAADSTSDTGVFGSRVPKKGMFRTVSQLYKEQLARLMSTLNNTNPHF 684

  Fly   759 VRCIIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQEFRQRYE-LLTPNVIPKG 822
            ||||||||||:.|.::|.|||||||||||||||||||||||.|:|||||||||| ||.|:|.|.|
 Worm   685 VRCIIPNHEKKHGVLNAHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPTRLPFQEFRQRYEKLLAPDVNPAG 749

  Fly   823 FMDGKKACEKMIQALELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKISDLIVNFQAFCRGFLARR 887
            |||||.|..:::|.||:|:||:|:||||||||:||:|..||.||.|:|.||.:|||.|||:|.||
 Worm   750 FMDGKNAVYRIVQYLEVDANLFRIGQSKIFFRSGVIAEFEEMRDQKLSALIESFQAQCRGWLGRR 814

  Fly   888 NYQKRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLLEVTKQEEKLVQKEDELKQVREKLD 952
            ...:|.:|..||:|:|||..|:::||.||||||.||||||||||.::|.:.::|.|||...|||.
 Worm   815 VMVRRREQEVAIKILQRNGLAWMRLREWQWWRLLTKVKPLLEVTNKDELIAEREQELKVTAEKLR 879

  Fly   953 TLAKNTQEYERKYQQALVEKTTLAEQLQAEIELCAEAEESRSRLMARKQELEDMMQELETRIEEE 1017
            .......:|:::.::...|:..|..:|.||....||..|.|||:.||:.|||.:::|:..|:|.|
 Worm   880 RSEVFISDYKQQMEKMDEERLVLKTRLDAESSERAEIFEERSRMAARRDELEGILEEVSKRLEIE 944

  Fly  1018 EERVLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQLDAKIKKYEEDLALTDDQNQKLLK 1082
            |::......|.:||...::.|||.||:||.:||||.|||..:::::|:.|......:|...||.|
 Worm   945 EQKAKKADSESRKLTEMVRHLEENLEDEERSRQKLLLEKNSIESRLKELEAQGLELEDSGNKLSK 1009

  Fly  1083 EKKLLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKLKAKHEATISELEERLHKDQQQRQESDRSKRKIETEV 1147
            |||.||||..|||..|.:|.|::|.|.|.||:.|||::|:.:.|.|::|||..::.::|..||::
 Worm  1010 EKKALEERCEDLSSRLIDEVERSKQLVKAKARLEATVAEINDELEKEKQQRHNAETARRAAETQL 1074

  Fly  1148 ADLKEQLNERRVQVDEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQKAQRELESQLAEIQEDLEA 1212
            .:.:|...|:..:.:|:..||.::|.||:|..:|.|||.|.:...::..||:.:||.:..|:...
 Worm  1075 REEQESCLEKTRKAEELTNQLMRKESELSQISIRNDEELAARQQLEREIREIRAQLDDAIEETNK 1139

  Fly  1213 EKAARAKAEKVRRDLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQELATLKKSLEEETVNHEGVL 1277
            |||||.||||.|||::||||:.|.||.:|.|.|....:|::||::|.|.|:|.|||...:.|.|:
 Worm  1140 EKAARQKAEKARRDMAEELESYKQELEESNDKTVLHSQLKAKRDEEYAHLQKQLEETVKSSEEVV 1204

  Fly  1278 ADMRHKHSQELNSINDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELRSVNSSRQENDRRRKQAES 1342
            .:|:.::.:::..:|:.::.|::.|...:|||.:.|::|.:...||.::.|:|.|.:::||.||:
 Worm  1205 EEMKAQNQKKIEELNETIDQLKRQKISADKAKSSAESDNENFRAELSNIASARLEAEKKRKAAET 1269

  Fly  1343 QIAELQVKLAEIERARSELQEKCTKLQQEAENITNQLEEAELKASAAVKSASNMESQLTEAQQLL 1407
            .:.|...|:.|::....:|..|.:|:..|.|:|.......|...|..:|..::::.||:|..:..
 Worm  1270 SLMEKDHKMREMQSNLDDLMAKLSKMNNELESIQKAKSADETLNSNLLKKNASLDMQLSELTEAS 1334

  Fly  1408 EEETRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTTQMQEIKKKAEEDADLAKE 1472
            ||:.|.:..|::|:||:|.:.....|..::..:|:...|:::.||.:.:.|.:||.:|:.  .:.
 Worm  1335 EEDRRTRATLNNKIRQLEEDLAVAVEARDDALDAQEKIEKEVKEVKSLLAEARKKLDEEN--REV 1397

  Fly  1473 LEEGKKRLNKDIEALERQVKELIAQ-NDRLDKSKKKIQSELEDATIELEAQRTKVLELEKKQKNF 1536
            :||.:|:..|::.| |::..::..| .|:.:::|||...|.||...||........|:|:|.:.|
 Worm  1398 MEELRKKKEKELSA-EKERADMAEQARDKAERAKKKAIQEAEDVQKELTDVVAATREMERKMRKF 1461

  Fly  1537 DKILAEEKAISEQIAQERDTAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIEDLENKRKTLQNELDDLAN 1601
            |:.||||:..:....||||.|.:..|:.|||.|.:|.||.|..|.::.||..::||:.|:|:||:
 Worm  1462 DQQLAEERNNTLLAQQERDMAHQMLRDAETKALVLSNELSEKKDIVDQLEKDKRTLKLEIDNLAS 1526

  Fly  1602 TQGTADKNVHELEKAKRALESQLAELKAQNEELEDDLQLTEDAKLRLEVNMQALRSQFERDLLAK 1666
            |:..|.|||:||||.||.|:.:|:..:.|..||||.|||.:||:.|:||||||:||:|||.|.::
 Worm  1527 TKDDAGKNVYELEKTKRRLDEELSRAEQQIIELEDALQLADDARSRVEVNMQAMRSEFERQLASR 1591

  Fly  1667 EEGAEEKRRGLVKQLRDLETELDEERKQRTAAVASKKKLEGDLKEIETTMEMHNKVKEDALKHAK 1731
            ||..:::::||..::|:|..||:.|::.|.||:|:|||:|..:.|:....|...:..||..:..:
 Worm  1592 EEDEDDRKKGLTSKIRNLTEELESEQRARQAAIANKKKIESQISELTEKNEASLRQIEDLSRQLR 1656

  Fly  1732 KLQAQVKDALRDAEEAKAAKEELQALSKEAERKVKALEAEVLQLTEDLASSERARRAAETERDEL 1796
            |.|...||...|..||:||.|:..|..::||::.:|.|.|:.:||.|:.:...::|.||.|||||
 Worm  1657 KAQLGWKDLQLDVTEARAAMEDALAGQRDAEKRARASEDEIKRLTADIQAVSSSKRKAEAERDEL 1721

  Fly  1797 AEEIANNANKGSLMIDEKRRLEARIATLEEELEEEQSNSEVLLDRSRKAQLQIEQLTTELANEKS 1861
            .||: ::....|...:|||||||::..||::|:||.|.:|:..::.||:|.|:||:|.:||.|:|
 Worm  1722 IEEV-SSLRASSFSNEEKRRLEAKVIDLEDQLDEEASANELAQEKVRKSQQQLEQMTADLAMERS 1785

  Fly  1862 NSQKNENGRALLERQNKELKAKLAEIETAQRTKVKATIATLEAKIANLEEQLENEGKERLLQQKA 1926
            ..::.|:.:..|||.|::||.:|.:.|.....:::..|...|||:::||:||..|.::::.|.:.
 Worm  1786 VCERTESDKIALERANRDLKQQLQDAENTAVARLRTQINVAEAKVSSLEQQLSLEEQDKMRQGRT 1850

  Fly  1927 NRKMDKKIKELTMNIEDERRHVDQHKEQMDKLNSRIKLLKRNLDETEEELQKEKTQKRKYQRECE 1991
            .|:|:.|:.|:...:|:|:|..:.:::.:|:.|:||:.|:..|::||.|..:...:.:..:|..|
 Worm  1851 LRRMETKMAEMQQMLEEEKRQGESNRQAVDRQNARIRQLRTQLEDTEAERDRLTNKLKDERRRAE 1915

  Fly  1992 DMIESQEAMNREINSLK---TKLRRTGG-IGLSSSRLTGTPSS 2030
            :|.:..|.::|:::.||   |..|||.| ||...||..|:.:|
 Worm  1916 EMTDLNETLSRDVSLLKQRETTARRTPGLIGHRESRRFGSNTS 1958

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
zipNP_523860.2 Myosin_N 79..122 CDD:460670 19/44 (43%)
MYSc_Myh2_insects_mollusks 145..854 CDD:276876 438/715 (61%)
Myosin_tail_1 931..2011 CDD:460256 390/1083 (36%)
nmy-2NP_492186.3 MYSc_class_II 100..781 CDD:276951 438/715 (61%)
Myosin_tail_1 858..1934 CDD:460256 389/1079 (36%)

Return to query results.
Submit another query.