DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment zip and Myh13

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523860.2 Gene:zip / 38001 FlyBaseID:FBgn0287873 Length:2056 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414391.1 Gene:Myh13 / 103693367 RGDID:3137 Length:1938 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1975 Identity:736/1975 - (37%)
Similarity:1171/1975 - (59%) Gaps:74/1975 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    55 PELKYLSVERNQFNDPATQAEWTQKRLVWVPHENQGFVAASIKREHGDEVEVELAETGKRVMILR 119
            ||.:.:..:...|:         .|:..:...:.:.:|...|:....|:|.|:..: .:.:.:..
  Rat    20 PEKERIEAQNRPFD---------SKKACFAVDDKEMYVKGMIQSRENDKVIVKTLD-DRELTLNS 74

  Fly   120 DDIQKMNPPKFDKVEDMAELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCVVVNPYKKLPIYTEKI 184
            |.:..||||||||:||||.:|.|:|.:||:|:|:||.:.:||||||||||.|||||.||:|..::
  Rat    75 DQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEV 139

  Fly   185 MERYKGIKRHEVPPHVFAITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQFLAYVAASKP 249
            :..|:|.||.|.|||:|:|:|:||:.||.||::||||.|||||||||.|||:|||:.|.:|    
  Rat   140 VTAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRDNQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIA---- 200

  Fly   250 KGSGAVPHPAVLINFSVNTNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSNCQEGELEQQLLQANP 314
                                                  |.|.|..|......:|.||.|::||||
  Rat   201 --------------------------------------VTGEKKKEQQPGKMQGTLEDQIIQANP 227

  Fly   315 ILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIRQAKDERTFHIFYQLL 379
            :||||||||||:|||||||||||||:|.|:|.::.|:||||||||||...|...||::|||||::
  Rat   228 LLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVTFQLSSERSYHIFYQIM 292

  Fly   380 AGATPEQREKFILD-DVKSYAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIMGMTSEDFNSIFRIVSA 443
            :...||..:..::. :...:.|:|.|.:.|..:||..|..||..:::|:|.:.|:...|:::..|
  Rat   293 SNKKPELIDLLLISTNPFDFPFVSQGEVTVASIDDSEELLATDNAIDILGFSPEEKVGIYKLTGA 357

  Fly   444 VLLFGSMKFRQERNNDQATLPDNT-VAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRIKVGRDFVTKAQTKEQ 507
            |:.:|:|||:|::..:||. ||.| ||.|..:|:||:..:|.:....||:|||.::|||.|..:|
  Rat   358 VMHYGNMKFKQKQREEQAE-PDGTEVADKAGYLMGLNSAEMLKGLCCPRVKVGNEYVTKGQNVQQ 421

  Fly   508 VEFAVEAIAKACYERMFKWLVNRINRSLDRTKRQGASFIGILDMAGFEIFELNSFEQLCINYTNE 572
            |..:|.|:|||.||:||.|:|.|||:.|| ||:....|||:||:||||||:.||.||||||:|||
  Rat   422 VTNSVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLD-TKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNE 485

  Fly   573 KLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPGGIMALLDEECWFPKATDKTF 637
            ||||.|||.||:||||||::|||||:|||||:||...|:||:||.||.::|:|||.||||||.:|
  Rat   486 KLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSF 550

  Fly   638 VDKLVSAH------SMHPKFMKTDFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWLMKNMDPLNENIVSLLQG 696
            .:||...|      ...||..|.  :..|.|::|||||.|||:.|.||.||.|||||.:|.|.|.
  Rat   551 KNKLYDQHLGKSNNFQKPKPAKG--KAEAHFSLVHYAGTVDYNIAGWLDKNKDPLNETVVGLYQK 613

  Fly   697 SQDPFVVNIWKDAEIVGMAQQALTDTQFGARTRKGMFRTVSHLYKEQLAKLMDTLRNTNPNFVRC 761
            |....:..::  :...|......|..:.|.:.:...|:|||.:::|.|.|||..||:|:|:||||
  Rat   614 SSLKLLSFLF--SNYAGAEAGDSTGGKKGGKKKGSSFQTVSAVFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRC 676

  Fly   762 IIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQEFRQRYELLTPNVIPKG-FMD 825
            :|||..|..|.:|..||:.|||||||||||||||:|||:||.:.:|:|||.:|..:.||:| |:|
  Rat   677 LIPNETKTPGVMDHYLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYADFKQRYRILNASAIPEGQFID 741

  Fly   826 GKKACEKMIQALELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKISDLIVNFQAFCRGFLARRNYQ 890
            .|.|.||::.::::|...:|.|.:|:||:||:|..|||.||.|:..|:...||.|||:|.|..::
  Rat   742 SKNASEKLLNSIDVDREQFRFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDEKLVTLMTRTQAVCRGYLMRVEFK 806

  Fly   891 KRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLLEVTKQEEKLVQKEDELKQVREKLDTLA 955
            |.:::..||..||.|..:::.:::|.|..|:.|:||||:..:.|:::...:::.::.:|:|....
  Rat   807 KMMERREAIFCIQYNVRSFMNVKHWPWMNLFFKIKPLLKSAEAEKEMATMKEDFERAKEELARSE 871

  Fly   956 KNTQEYERKYQQALVEKTTLAEQLQAEIELCAEAEESRSRLMARKQELEDMMQELETRIEEEEER 1020
            ...:|.|.|....|.||..|..|:|:|.|...:|||....|:..|.:||..::||..|:|||||.
  Rat   872 ARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQSETENLMDAEERCEGLIKSKIQLEAKVKELNERLEEEEET 936

  Fly  1021 VLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQLDAKIKKYEEDLALTDDQNQKLLKEKK 1085
            ...|..:|:.||.....|:..:::.|....|::.||...:.|:|...|::...::...||.||||
  Rat   937 NSELVAKKRNLEDKCSSLKRDIDDLELTLTKVEKEKHATENKVKNLSEEMTALEETISKLTKEKK 1001

  Fly  1086 LLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKLKAKHEATISELEERLHKDQQQRQESDRSKRKIETEVADL 1150
            .|:|........|..||:|...|.|:..|.|....:||..|.::::.|.:.:|.|||:|.::...
  Rat  1002 SLQEAHQQTLDDLQVEEDKVNGLMKINVKLEQQTDDLEGSLEQEKKLRADLERVKRKLEGDLKMS 1066

  Fly  1151 KEQLNERRVQVDEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQKAQRELESQLAEIQEDLEAEKA 1215
            :|.:.:......:::.:|.|:|.|::|...|||:|.......||..:||:::..|::|::|||..
  Rat  1067 QESIMDLENDAQQLEEKLKKKEFEMSQLQTRIDDEQILSLQLQKKIKELQARTEELEEEIEAEHT 1131

  Fly  1216 ARAKAEKVRRDLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQELATLKKSLEEETVNHEGVLADM 1280
            .|||.||.|.||:.|||.:...|.::...|:||.|:..|||.|...|::.|||.|:.||...|.:
  Rat  1132 VRAKIEKQRSDLARELEEISERLEEASGATSAQIEMNKKREAEFQKLRRDLEEATLQHEATAATL 1196

  Fly  1281 RHKHSQELNSINDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELRSVNSSRQENDRRRKQAESQIA 1345
            |.||:..:..:.:|::||::.|..|||.|..|:.|..|:|:.:.:|:.|:...:|..:..|.|..
  Rat  1197 RKKHADTVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDMASNIEAVSKSKSNMERMCRSVEDQFN 1261

  Fly  1346 ELQVKLAEIERARSELQEKCTKLQQEAENITNQLEEAELKASAAVKSASNMESQLTEAQQLLEEE 1410
            |::.|..:..:...:|..:..:||.:...:.:|:||.|...|...||...:..||.|.::.||||
  Rat  1262 EIKAKDDQQTQLIHDLNMQKARLQTQNGELNHQVEEKESLVSQLTKSKQALTQQLEELKRQLEEE 1326

  Fly  1411 TRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTTQMQEIKKKAEEDA-DLAKELE 1474
            |:.|..|:..|:....:.:.|:||.||:.|.|...:|.|::..:::.:.:.|.|.|| ...:|||
  Rat  1327 TKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQRALSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELE 1391

  Fly  1475 EGKKRLNKDIEALERQVKELIAQNDRLDKSKKKIQSELEDATIELEAQRTKVLELEKKQKNFDKI 1539
            |.||:|.:.::..|...:...::...|:|:|:::|.|::|..::||...|....|:|||:||||:
  Rat  1392 EAKKKLAQRLQEAEENTEASNSKCASLEKTKQRLQGEVDDLMLDLEKANTACATLDKKQRNFDKV 1456

  Fly  1540 LAEEKAISEQIAQERDTAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIEDLENKRKTLQNELDDLANTQG 1604
            |||.|...::...|.:.|::|:|...|::..:....:|..|::|.|..:.|.||.|:.||.....
  Rat  1457 LAEWKQKLDESQAELEAAQKESRSLSTEIFKMRNAYEEVVDQLETLRRENKNLQEEISDLTEQIA 1521

  Fly  1605 TADKNVHELEKAKRALESQLAELKAQNEELEDDLQLTEDAKLRLEVNMQALRSQFERDLLAKEEG 1669
            ...||:.|:||.|:.:|.:.::|:|..||:|..|:..|...||:::.:..::|:.:|.:..|:|.
  Rat  1522 ETGKNLQEVEKTKKQMEQEKSDLQAALEEVEGSLEHEESKILRVQLELSQVKSELDRKVTEKDEE 1586

  Fly  1670 AEEKRRGLVKQLRDLETELDEERKQRTAAVASKKKLEGDLKEIETTMEMHNKVKEDALKHAKKLQ 1734
            .|:.:|...:.:..:::.||.|.:.|..|:..|||:||||.|:|..:...|:...:..||.:.:|
  Rat  1587 IEQIKRNSQRAVEAMQSVLDAEIRSRNDALRLKKKMEGDLNEMEIQLSHANRQVAETQKHLRTVQ 1651

  Fly  1735 AQVKDALRDAEEAKAAKEELQALSKEAERKVKALEAEVLQLTEDLASSERARRAAETERDELAEE 1799
            .|:||:....::|:.:.|:|:......||:...|:.|:.::...|..:||.||.:|.|..:.::.
  Rat  1652 GQLKDSQLHLDDAQRSNEDLKEQLAIVERRNGLLQEELEEMKVALEQTERTRRLSEQELLDSSDR 1716

  Fly  1800 IANNANKGSLMIDEKRRLEARIATLEEELE---EEQSNSEVLLDRSRKAQLQIEQLTTELANEKS 1861
            :....::.:.:|:.|::|||.:|..:.|:|   :|..|:|   ::::||......:..||..|:.
  Rat  1717 VQLLHSQNTSLINTKKKLEADLAQCQAEVENSIQESRNAE---EKAKKAITDAAMMAEELKKEQD 1778

  Fly  1862 NSQKNENGRALLERQNKELKAKLAEIETAQRTKVKATIATLEAKIANLEEQLENEGKERLLQQKA 1926
            .|...|..:..||:..|:|:.:|.|.|.......|..|..|||::..||.:|:.|.|......|.
  Rat  1779 TSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELESELDAEQKRGAEALKG 1843

  Fly  1927 NRKMDKKIKELTMNIEDERRHVDQHKEQMDKLNSRIKLLKRNLDETEEELQKEKTQKRKYQRECE 1991
            ..|.::|:||:|...|::|:::.:.::.:|||.:::|..||..:|.||:...:.::.|:.|.|.|
  Rat  1844 AHKYERKVKEMTYQAEEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQANTQLSRCRRVQHELE 1908

  Fly  1992 DMIESQEAMNREINSLKTKLRRTGG 2016
            :..|..:....::|.|:.|.|..||
  Rat  1909 EAEERADIAESQVNKLRAKSRDVGG 1933

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
zipNP_523860.2 Myosin_N 79..122 CDD:460670 7/42 (17%)
MYSc_Myh2_insects_mollusks 145..854 CDD:276876 346/717 (48%)
Myosin_tail_1 931..2011 CDD:460256 329/1083 (30%)
Myh13NP_001414391.1 None

Return to query results.
Submit another query.