DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF5C and Kif5c

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004513.1 Gene:KIF5C / 3800 HGNCID:6325 Length:957 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001101200.1 Gene:Kif5c / 311024 RGDID:1308539 Length:955 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:957 Identity:940/957 - (98%)
Similarity:950/957 - (99%) Gaps:2/957 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQEQVYNA 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGEETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQEQVYNA 65

Human    66 CAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDHIYSMDENLEFH 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 CAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDHIYSMDENLEFH 130

Human   131 IKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEEVMDVIDEGKANRHVAV 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 IKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEEVMDVIDEGKANRHVAV 195

Human   196 TNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLS 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 TNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLS 260

Human   261 ALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAK 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 ALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAK 325

Human   326 TIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNVIQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQKNL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||.||:||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 TIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKALKSVIQHLEVELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQKNL 390

Human   391 EPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYDEEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDEL 455
            ||||||||||||.|||.|||. |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 EPCDNTPIIDNITPVVDGISA-EKEKYDEEITSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDEL 454

Human   456 LASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELA 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 LASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELA 519

Human   521 QKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFT 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   520 QKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFT 584

Human   586 MARLYISKMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNM 650
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   585 MARLYISKMKSEVKSLVNRSKQLESAQTDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNM 649

Human   651 EQKRRQLEESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQ 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat   650 EQKRRQLEESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEVKKALEQQMESHREAHQ 714

Human   716 KQLSRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKREQA 780
            ||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   715 KQLSRLRDEIEEKQRIIDEIRDLNQKLQLEQERLSSDYNKLKIEDQEREVKLEKLLLLNDKREQA 779

Human   781 REDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLT 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   780 REDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDSDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLT 844

Human   846 KVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRA 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   845 KVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRA 909

Human   911 KNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK 957
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||| |||||||||
  Rat   910 KNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAVRGGGG-SSNSTHYQK 955

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF5CNP_004513.1 KISc_KHC_KIF5 6..327 CDD:276820 319/320 (100%)
Microtubule-binding 174..315 140/140 (100%)
PRK03918 <412..907 CDD:235175 486/494 (98%)
Khc_CBD_cc 836..905 CDD:467880 68/68 (100%)
Globular 859..956 94/96 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 911..957 43/45 (96%)
Kif5cNP_001101200.1 KISc_KHC_KIF5 6..327 CDD:276820 319/320 (100%)
Microtubule-binding 174..315 140/140 (100%)
YhaN 407..>751 CDD:443752 336/344 (98%)
Smc 616..>923 CDD:440809 301/306 (98%)
Khc_CBD_cc 835..904 CDD:467880 68/68 (100%)
Globular 859..955 94/96 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 909..955 44/46 (96%)

Return to query results.
Submit another query.