DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF5C and Kif5c

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004513.1 Gene:KIF5C / 3800 HGNCID:6325 Length:957 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_032475.2 Gene:Kif5c / 16574 MGIID:1098269 Length:956 Species:Mus musculus


Alignment Length:957 Identity:940/957 - (98%)
Similarity:951/957 - (99%) Gaps:1/957 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQEQVYNA 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGEETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQEQVYNA 65

Human    66 CAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDHIYSMDENLEFH 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 CAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDHIYSMDENLEFH 130

Human   131 IKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEEVMDVIDEGKANRHVAV 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 IKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEEVMDVIDEGKANRHVAV 195

Human   196 TNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLS 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 TNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLS 260

Human   261 ALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAK 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 ALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAK 325

Human   326 TIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNVIQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQKNL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||.||:|:||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   326 TIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKALKSVLQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQKSL 390

Human   391 EPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYDEEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDEL 455
            ||||||||||||.|||.|||. |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 EPCDNTPIIDNITPVVDGISA-EKEKYDEEITSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDEL 454

Human   456 LASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELA 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   455 LASTRRDYEKIQEELTRLQIENEAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELA 519

Human   521 QKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFT 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   520 QKTTTLTTTQRELSQLQELSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFT 584

Human   586 MARLYISKMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNM 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   585 MARLYISKMKSEVKSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNM 649

Human   651 EQKRRQLEESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQ 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
Mouse   650 EQKRRQLEESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEVKKALEQQMESHREAHQ 714

Human   716 KQLSRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKREQA 780
            ||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||:|||||||||||||||
Mouse   715 KQLSRLRDEIEEKQRIIDEIRDLNQKLQLEQERLSSDYNKLKIEDQEREVKLEKLLLLNDKREQA 779

Human   781 REDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLT 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Mouse   780 REDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDSDDGGGSAAQKQKISFLENNLEQLT 844

Human   846 KVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRA 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   845 KVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQQEVDRIKEAVRA 909

Human   911 KNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK 957
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.|||||||||
Mouse   910 KNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAVRGGGGGSSNSTHYQK 956

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF5CNP_004513.1 KISc_KHC_KIF5 6..327 CDD:276820 319/320 (100%)
Microtubule-binding 174..315 140/140 (100%)
PRK03918 <412..907 CDD:235175 487/494 (99%)
Khc_CBD_cc 836..905 CDD:467880 68/68 (100%)
Globular 859..956 94/96 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 911..957 43/45 (96%)
Kif5cNP_032475.2 KISc_KHC_KIF5 6..327 CDD:276820 319/320 (100%)
Microtubule-binding 174..315 140/140 (100%)
YhaN 407..>751 CDD:443752 337/344 (98%)
Smc 616..>923 CDD:440809 301/306 (98%)
Khc_CBD_cc 835..904 CDD:467880 68/68 (100%)
Globular 859..956 94/96 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 910..956 43/45 (96%)

Return to query results.
Submit another query.