DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF5B and Kif5b

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_004512.1 Gene:KIF5B / 3799 HGNCID:6324 Length:963 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_476550.1 Gene:Kif5b / 117550 RGDID:621559 Length:963 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:962 Identity:937/962 - (97%)
Similarity:951/962 - (98%) Gaps:0/962 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MADLAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYIAKFQGEDTVVIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDC 65
            |||.|||||||||||||||||||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MADPAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYVAKFQGEDTVMIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDC 65

Human    66 AKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 AKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHI 130

Human   131 KVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVT 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 KVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVT 195

Human   196 NMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 NMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSA 260

Human   261 LGNVISALAEGSTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTI 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 LGNVISALAEGSTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTI 325

Human   326 KNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTIQWLENELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAF 390
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 KNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKTLRNTIQWLENELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAF 390

Human   391 TVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAERRKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLD 455
            |.|||:.:||||||.|||:.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 TADKDVAITNDKPAAAIGMAGSFTDAERRKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLD 455

Human   456 QEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLS 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 QEELLASTRRDQDNMQAELNRLQAENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLS 520

Human   521 DELNQKSATLASIDAELQKLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQPEGTGMIDE 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 DELNQKSATLASIDAELQKLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQPEGTGMIDE 585

Human   586 EFTVARLYISKMKSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYL 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 EFTVARLYISKMKSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYL 650

Human   651 QNVEQKKRQLEESVDALSEELVQLRAQEKVHEMEKEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQ 715
            |||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 QNVEQKKRQLEESVDSLGEELVQLRAQEKVHEMEKEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQ 715

Human   716 ISSLRDEVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRREQARQ 780
            |||||||||||.|||||||||||||:|||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||
  Rat   716 ISSLRDEVEAKEKLITDLQDQNQKMVLEQERLRVEHERLKAVDQEKSRKLHELTVMQDRREQARQ 780

Human   781 DLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKV 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 DLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEVDSDDTGGSAAQKQKISFLENNLEQLTKV 845

Human   846 HKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQQEVDRIKEAVRSKN 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 HKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQQEVDRIKEAVRSKN 910

Human   911 MARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVRGGGGKQ 962
            |||||||||||||||||||||||||||.|:||||:||||:|||.:|||||||
  Rat   911 MARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPGAVRGGGSFVQNNQPVGLRGGGGKQ 962

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF5BNP_004512.1 KISc_KHC_KIF5 6..325 CDD:276820 316/318 (99%)
KISc 8..332 CDD:214526 321/323 (99%)
DUF4337 <462..>538 CDD:290935 75/75 (100%)
TACC 467..662 CDD:282818 194/194 (100%)
TMPIT 598..>686 CDD:285135 85/87 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 908..963 49/55 (89%)
Globular 915..963 42/48 (88%)
Kif5bNP_476550.1 KISc_KHC_KIF5 6..325 CDD:276820 316/318 (99%)
KISc 8..332 CDD:214526 321/323 (99%)
DUF4337 <462..>538 CDD:290935 75/75 (100%)
TACC 467..662 CDD:282818 194/194 (100%)
TMPIT 598..>686 CDD:285135 85/87 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 908..963 49/55 (89%)
Globular. /evidence=ECO:0000255 915..963 42/48 (88%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83696850
Domainoid 1 1.000 1200 1.000 Domainoid score I1011
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0240
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H55829
Inparanoid 1 1.050 1841 1.000 Inparanoid score I1763
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG52972
OrthoDB 1 1.010 - - D11359at314146
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000669
OrthoInspector 1 1.000 - - oto142705
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100344
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24115
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X952
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.