DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF3C and Kif3c

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002245.4 Gene:KIF3C / 3797 HGNCID:6321 Length:793 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_445938.1 Gene:Kif3c / 85248 RGDID:621538 Length:796 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:796 Identity:764/796 - (95%)
Similarity:778/796 - (97%) Gaps:3/796 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTFDAVYD 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTFDAVYD 65

Human    66 ASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVIPNAFEHIFTH 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 ASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVIPNAFEHIFTH 130

Human   131 ISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVM 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 ISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVM 195

Human   196 NLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNT 260
            |||||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 NLGNQARAVGSTHMNEVSSRSHAIFVITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNT 260

Human   261 AGGAATPSSGGGGGGGG--SGGGAGGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLT 323
            .||.||.|:.|||||||  ||.|:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 PGGPATQSTAGGGGGGGGTSGSGSSGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLT 325

Human   324 RLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIA 388
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 RLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIA 390

Human   389 RLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPGYPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESAL 453
            ||||||||:|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||.||:||
  Rat   391 RLKAQLEKKGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPAGYPEGAVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPTLEAAL 455

Human   454 EKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAME 518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   456 EKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLKREQQATELLAAKYKAME 520

Human   519 SKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEV 583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||
  Rat   521 SKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMLLRDEETMELRGTYSSLQQEVEV 585

Human   584 KTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMN 648
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 KTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHEEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMN 650

Human   649 RLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLE 713
            |||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 RLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVNNSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLE 715

Human   714 LDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQR-PPPSTTHA 777
            |||||||:||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||.||
  Rat   716 LDVSPPAIFEMEFSHDQEQDPRVLHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPPSTVHA 780

Human   778 SLASASLRPATVADHE 793
            |:|||.|.||||.||:
  Rat   781 SMASAPLHPATVVDHD 796

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF3CNP_002245.4 KISc_KIF3 9..365 CDD:276822 345/357 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 251..288 28/38 (74%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 394..424 27/29 (93%)
Smc <452..>635 CDD:440809 178/182 (98%)
Globular. /evidence=ECO:0000255 630..793 153/163 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 750..793 37/43 (86%)
Kif3cNP_445938.1 KISc_KIF3 9..367 CDD:276822 345/357 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 251..292 30/40 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 397..421 22/23 (96%)
Smc <452..>637 CDD:440809 179/184 (97%)
Globular. /evidence=ECO:0000255 633..793 150/159 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 754..796 35/41 (85%)

Return to query results.
Submit another query.