DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment gek and Cdc42bpa

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_523837.2 Gene:gek / 37858 FlyBaseID:FBgn0023081 Length:1637 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038946162.1 Gene:Cdc42bpa / 114116 RGDID:621406 Length:1849 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1788 Identity:757/1788 - (42%)
Similarity:1072/1788 - (59%) Gaps:253/1788 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    44 TEGHQFSLDYLLDTFIVLYDECSNSSLRREKGVSDFLKLSKPFVHIVRKLRLSRDDFDILKIIGR 108
            |.|..||::.|||..|.|||||:||.|||||.:.::|:.:|||...|:::||.|:||:|||:|||
  Rat    21 TNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGR 85

  Fly   109 GAFGEVCVVQMISTEKVYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVFGDRQWITNLHYAFQDNINL 173
            ||||||.||::.:.:||:|||||||||||||||||||||||||||.||.:|||.|||||||:.||
  Rat    86 GAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDSKWITTLHYAFQDDNNL 150

  Fly   174 YLVMDYYCGGDLLTLLSKFEDKLPEDMAKFYITEMILAINSIHQIRYVHRDIKPDNVLLDKRGHV 238
            |||||||.|||||||||||||:|||:||:||:.||::||:|:||:.||||||||||:|:|..||:
  Rat   151 YLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEEMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHI 215

  Fly   239 RLADFGSCLRLDKDGTVQSNVAVGTPDYISPEILRAMEDGKGRYGTECDWWSLGVCMYEMLYGET 303
            |||||||||:|.:||||||:||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   216 RLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGET 280

  Fly   304 PFYAESLVETYGKIMNHQNCFNLPSQETLNYKVSETSQDLLCKLICIPENRLGQNGIQDFMDHPW 368
            |||||||||||||||||:..|..|:|.|   .|||.::||:.:|||..|:|||||||:||..||:
  Rat   281 PFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPTQVT---DVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPF 342

  Fly   369 FVGIDWKNIRQGPAPYVPEVSSPTDTSNFDVDDNDVRLTDSIPPSANPAFSGFHLPFIGFTFSLT 433
            |.||||.|||...|||:||||||||||||||||:.::.::::||..:.||||.||||:|||:  |
  Rat   343 FSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTY--T 405

  Fly   434 SSSTLDSKKNQSSGFGDDTLD-------------------------------------------- 454
            ||..|..:.......|..:||                                            
  Rat   406 SSCVLSDRSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELTRKLQESTQTVQ 470

  Fly   455 -----TISSPQLA-------------------ILPSNNSETPVDSV------------QLKALND 483
                 |:..|..|                   :...|:.|..::..            |:||...
  Rat   471 ALQYSTVDGPLTASKDLEIKSLKEEIEKLRKQVAEVNHLEQQLEEANSVRRELDDAFRQIKAFEK 535

  Fly   484 QLAALKQEKAELSKQHNEVFERLKTQDSELQDAISQRNIAMMEYSEVTEKLSELRNQKQKLSRQV 548
            |:..|:||:.||:|:..:..||||.|..||:||..||.:||.|:.|:.|:|:||..|||||:|.|
  Rat   536 QIKTLQQEREELNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV 600

  Fly   549 RDKEEELDGAMQKNDSLRNELRKSDKTRRELELHIEDAVIEAAKEKKLREHAEDCCRQLQMELRK 613
            ||||||:|..|||.:|||.|||::::.::|||:|.|..:.||:|::||||.:|...:||:.|| :
  Rat   601 RDKEEEVDLVMQKAESLRQELRRAERAKKELEVHTEALIAEASKDRKLREQSEHYSKQLENEL-E 664

  Fly   614 GSSSVETTMPLSISSEMSSYEIERLE-------LQFSEKLSHQQTRHNMELEALREQFSELENAN 671
            |....:.:....|.|.....||.:|:       :.:.|::|.::..|..|::.|:::..:.|...
  Rat   665 GLKQKQISYSPGICSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEEISKREGIHASEIKNLKKELHDSEGQQ 729

  Fly   672 LALTKELQQTQERLKYTQMESITDSAETLLELKKQHDLEKSSWFEEKQRLSSEVN-----LKSKS 731
            |||.||:...:::|:.|:.||.::..|...|.|:|::.||....||.::|:||::     .:|.|
  Rat   730 LALNKEIMVLKDKLEKTRRESQSEREEFENEFKQQYEREKVLLTEENKKLTSELDKLTSLYESLS 794

  Fly   732 LKELQAEDDEIFKELRMKREAITLWERQMAEIIQWVSDEKDARGYLQALATKMTEELEYLKH--V 794
            |:....|::  .|:|..|:|::..||.|:.||||||||||||||||||||:|||||||.|::  :
  Rat   795 LRNQHLEEE--VKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQALASKMTEELEALRNSSL 857

  Fly   795 GTFNNNGVDNKNWRNRRSQKLDKMELLNLQSALQREIQAKNMISDELSQTRSDLISTQKEVRDYK 859
            ||    ...:..|:.||..|||....|.|||||..||:||..|.:||::.::..|.|:.:::|.:
  Rat   858 GT----RATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNIITECKLKDSE 918

  Fly   860 KRYDSILHDFQK--KETELRDLQKGGLEYSES------FLNKSTHHGLSSAFFRD--MSKNSEII 914
            |:...:|.:.::  |:||....:| |:|:.:|      |||..| ..|..  |.|  .|.:|.:|
  Rat   919 KKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEK-GVEHRDSQHSFLAFLNTPT-DALDQ--FEDSFSSSSSSLI 979

  Fly   915 DSAESFGNESGDNFTPNFFQSGNSGMLFNYEPKYAGKNNK----DHSSMKEASV----------- 964
            |..:....:...:.||                  |||..:    |::.::..||           
  Rat   980 DFLDDLFLDRSPSCTP------------------AGKGRRTEPVDNTYIRNPSVKLYIQQRPTSP 1026

  Fly   965 SDLSREESDQLVKES---------QKK-------VPGNTAIHQFLVRTFSSPTKCNHCTSLMVGL 1013
            |..|..|..::...:         :||       .|.....|||.|::|::||||:.||||||||
  Rat  1027 STPSEAEPVKIADSAPLPVHTPTLRKKGCPASAGFPPKRKTHQFFVKSFTAPTKCHQCTSLMVGL 1091

  Fly  1014 TRQGVVCEICGFACHTICCQKVPTTCPVPMDQTKRPLGIDPTRGIGTAYEGYVKVPKSGVIKRGW 1078
            .|||..||:|||:||..|..|.|||||||.:|||.||||||.:|:||||||:|::||...:|:||
  Rat  1092 IRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGVGTAYEGHVRIPKPAGVKKGW 1156

  Fly  1079 IRQFVVVCDFKLFLYDISPDRCALPSVSVSQVLDMRDPEFSVGSVRESDVIHAAKKDVPCIFKIK 1143
            .|...||||||||||||:..:.:.||..:|||:||||.||||.||..||||||::||:||||::.
  Rat  1157 QRALAVVCDFKLFLYDIAEGKASQPSSVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVT 1221

  Fly  1144 TALIDG-GLSLNTLMLADNESEKSKWVIALGELHRILKRNSLPNTAIFKVNEILDNTLSLIRNAL 1207
            .:.:.. ....:.|||||:|:|:||||..|.|||::||:|...:.:::...|..|:||.||:...
  Rat  1222 ASQLSAPSDKCSILMLADSETERSKWVGVLSELHKVLKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQ 1286

  Fly  1208 CSVIIYPNQILLGTEDGLFYINLDQYEIARIGESKKILQLWYIEEEQILVILCGKQRNLRLLPIR 1272
            .:.||...::.||.|:|||.:::.:.||.|:|::|||.|:..|..:|::.::.|:.|::||.|:.
  Rat  1287 AAAIIDHERVALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPSDQLVAVISGRNRHVRLFPMS 1351

  Fly  1273 ALEASDVEWIKVVESKNCISACTGIIRRFPNIVYSFIIALKRPNNHTQIVVYEINRTRTRHQKTC 1337
            ||:..:.::.|:.|:|.|.:...|.:|.  ..:....:|:||     |::.||:.:::|||:|..
  Rat  1352 ALDGRETDFYKLAETKGCQTIAAGKVRH--GALSCLCVAMKR-----QVLCYELFQSKTRHRKFK 1409

  Fly  1338 EFTIGYMAQHLQILSDMRLVVAHQSGFTAYFLRGEATAMSLVHPENQLCAFLNYSGVDAVRVIEI 1402
            |..:....|.:.|.|: .|.|..||||..|.|.||.:..:::|..:...||:.:..:||:..:||
  Rat  1410 EIQVPCNVQWMAIFSE-HLCVGFQSGFLRYPLNGEGSPCNMLHSNDHTLAFITHQPMDAICAVEI 1473

  Fly  1403 LCPSGGNFGEYLLVFQTLAIYVDLQGRKSRDREIMYPAFPTYITFCDGHLLVFSDTHLDIFNTQT 1467
                  :..||||.|.::.||.|.|||:||.:|:|:||.|:...:...:|.::|:..:|||:..:
  Rat  1474 ------SNKEYLLCFSSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSIYSENAVDIFDVNS 1532

  Fly  1468 AEWVQSIGLKQSLPLNNLGNVVLSSVNDTPLIVYLSNIHTKG----LLQYRDGNRKGLP---SIK 1525
            .||:|::.||:..|||..|::.|..: :|..::|..|...:|    :.:..|.:||.:.   :.|
  Rat  1533 MEWIQTLPLKKVRPLNTEGSLNLLGL-ETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNK 1596

  Fly  1526 RRFSIREINKTIKSDR---------RSKMISAPTNFNHISHMGPGDGIQNQRLLDLP-------- 1573
            ||:|.|...:.....|         |:|:||.|||||||:|||||||||..:.|.:|        
  Rat  1597 RRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMPGFPYSPPP 1661

  Fly  1574 -----------------TTLETADQACSP----------------IIHSLSC---IPQSRKSNFL 1602
                             .|:.:|:|..||                ..||::.   .||..::.|.
  Rat  1662 HHSGLISSPSNFEHIYHMTVNSAEQFLSPDSINPGYPPSLRSAPGSPHSVTLRNPRPQESRTVFS 1726

  Fly  1603 EQVDANSDDYGNDNIISRTPSPMAS-SFMDGLS 1634
            ..|...|       |....|.|..| |...|||
  Rat  1727 GSVSIPS-------ITKSRPEPGRSMSASSGLS 1752

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
gekNP_523837.2 STKc_DMPK_like 98..430 CDD:270748 246/331 (74%)
S_TKc 100..369 CDD:214567 206/268 (77%)
KELK 478..556 CDD:292424 41/77 (53%)
CEP63 492..749 CDD:293650 100/268 (37%)
CEP63 652..880 CDD:293650 92/236 (39%)
C1_1 990..1040 CDD:278556 32/49 (65%)
PH_MRCK 1049..1182 CDD:269949 76/133 (57%)
CNH 1211..1486 CDD:279162 93/274 (34%)
CRIB 1544..1580 CDD:238077 22/60 (37%)
Cdc42bpaXP_038946162.1 STKc_MRCK_alpha 4..412 CDD:270773 279/395 (71%)
SbcC <442..958 CDD:223496 179/523 (34%)
KELK 530..608 CDD:406277 41/77 (53%)
C1 1066..1125 CDD:412127 37/58 (64%)
PH_MRCK 1127..1261 CDD:269949 76/133 (57%)
CNH 1287..1551 CDD:395630 93/277 (34%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166336828
Domainoid 1 1.000 439 1.000 Domainoid score I533
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0612
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H55765
Inparanoid 1 1.050 1157 1.000 Inparanoid score I196
OMA 1 1.010 - - QHG52599
OrthoDB 1 1.010 - - D117302at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001346
OrthoInspector 1 1.000 - - otm46258
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103075
Panther 1 1.100 - - O PTHR22988
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1218
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1514.810

Return to query results.
Submit another query.