DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment gek and Cdc42bpb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523837.2 Gene:gek / 37858 FlyBaseID:FBgn0023081 Length:1637 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006240624.1 Gene:Cdc42bpb / 113960 RGDID:621753 Length:1730 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1758 Identity:743/1758 - (42%)
Similarity:1049/1758 - (59%) Gaps:228/1758 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    15 SCKKRLTFLKCILSDTTSDQKWAAEFGEDTEGHQFSLDYLLDTFIVLYDECSNSSLRREKGVSDF 79
            |.|.||..|:.:|    .|..|..|       ...|::.|||..:.||.|||:|:|||:|.|::|
  Rat     2 SAKVRLKKLEQLL----LDGPWRNE-------SSLSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEF 55

  Fly    80 LKLSKPFVHIVRKLRLSRDDFDILKIIGRGAFGEVCVVQMISTEKVYAMKILNKWEMLKRAETAC 144
            |:.:|||..:|:.::|.|:||:|:|:|||||||||.||:|.:||::|||||||||||||||||||
  Rat    56 LEWAKPFTQLVKDMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETAC 120

  Fly   145 FREERDVLVFGDRQWITNLHYAFQDNINLYLVMDYYCGGDLLTLLSKFEDKLPEDMAKFYITEMI 209
            |||||||||.||.||||.|||||||...||||||||.||||||||||||||||||||:|||.||:
  Rat   121 FREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENYLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMV 185

  Fly   210 LAINSIHQIRYVHRDIKPDNVLLDKRGHVRLADFGSCLRLDKDGTVQSNVAVGTPDYISPEILRA 274
            |||:||||:.||||||||||||||..||:|||||||||:::.||||||:||||||||||||||:|
  Rat   186 LAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQA 250

  Fly   275 MEDGKGRYGTECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHQNCFNLPSQETLNYKVSET 339
            ||||.|:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:..|..||..|   .|||.
  Rat   251 MEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVT---DVSEE 312

  Fly   340 SQDLLCKLICIPENRLGQNGIQDFMDHPWFVGIDWKNIRQGPAPYVPEVSSPTDTSNFDVDDNDV 404
            ::||:.:|||..|.|||||||:||..|.:|.|::|:|||...|||:|:||||:|||||||||:.:
  Rat   313 AKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNFDVDDDVL 377

  Fly   405 RLTDSIPPSANPAFSGFHLPFIGFTF-------------SLTSSSTLD----------------- 439
            |..:.:||.::..|||.|||||||||             |:..|:||.                 
  Rat   378 RNIEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSMIQSNTLTKDEDVQRDLENSLQIEA 442

  Fly   440 ---------------SKKNQSS------------GFGDDTLD--------TISSPQLAILPSNNS 469
                           |:|.|.|            ..|:...|        .:...:..:..||..
  Rat   443 YERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSTRALGNSNRDKEIKRLNEELERMKSKMADSNRL 507

  Fly   470 ETPV-----------DSVQ-LKALNDQLAALKQEKAELSKQHNEVFERLKTQDSELQDAISQRNI 522
            |..:           ||.| ||.|..|....:|||.||.||..|..||||:|..||:||..||..
  Rat   508 ERQLEDTVTLRQEHEDSTQRLKGLEKQYRLARQEKEELHKQLVEASERLKSQTKELKDAHQQRKR 572

  Fly   523 AMMEYSEVTEKLSELRNQKQKLSRQVRDKEEELDGAMQKNDSLRNELRKSDKTRRELELHIEDAV 587
            |:.|:||:.|:::|||:||||:|||:||||||::.||||.||:|.::|||:|:|:|||..:||||
  Rat   573 ALQEFSELNERMAELRSQKQKVSRQLRDKEEEMEVAMQKIDSMRQDIRKSEKSRKELEARLEDAV 637

  Fly   588 IEAAKEKKLREHAEDCCRQLQMEL-----RKGSSSVETTMPLSISSEMSSY--EIERLELQFSEK 645
            .||:||:|||||:|...:|::.||     ::|......|  |....|:|..  |:|:..|.:.|:
  Rat   638 AEASKERKLREHSESFSKQMERELETLKVKQGGRGPGAT--LEHQQEISKIRSELEKKVLFYEEE 700

  Fly   646 LSHQQTRHNMELEALREQFSELENANLALTKELQQTQERLKYTQMESITDSAETLLELKKQHDLE 710
            |..::..|.:|::.::::..|.|:..|||.||:...:::|:.::.|..::..|.:..:|.:::.|
  Rat   701 LVRREASHVLEVKNVKKEVHESESHQLALQKEVLMLKDKLEKSKRERHSEMEEAIGAMKDKYERE 765

  Fly   711 KSSWFEEKQRLSSEVNLKSKSLKELQAE----DDEIFKELRMKREAITLWERQMAEIIQWVSDEK 771
            ::..|:|.::|::|.......:.:|.|:    :||: ::|..|:|::..||.|:|||||||||||
  Rat   766 RAMLFDENKKLTAENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDEL-QDLASKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEK 829

  Fly   772 DARGYLQALATKMTEELEYLKHVGTFNNNGVDNKNWRNRRSQKLDKMELLNLQSALQREIQAKNM 836
            ||||||||||:|||||||.|:. .:..:..:| ..|:.|||||||....|.|||||:.||:||.:
  Rat   830 DARGYLQALASKMTEELETLRS-SSLGSRTLD-PLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQL 892

  Fly   837 ISDELSQTRSDLISTQKEVRDYKKRYDSILHDFQ--KKETE----------LRDLQKGGLEYSES 889
            :.:||.:.:...::.:.::::.:.:...:|.:.|  ||..|          |.|.|....||   
  Rat   893 VHEELRKVKDTSLAFESKLKESEAKNRELLEEMQSLKKRMEEKFRADTGLKLPDFQDPIFEY--- 954

  Fly   890 FLNKSTHHGLSSAFFRDMSKNSEIIDSAESFGNESGDNFTPNFFQSGNSGMLFNYEPKYAGKNNK 954
            |......|.|:   |||                        :...|..|.:|..:|...:..:.:
  Rat   955 FNTAPLAHDLT---FRD------------------------SLSSSSASSLLALWEDTSSASDQE 992

  Fly   955 DHSSMKEASVS---DLSREESDQLVKESQK----KVPGNTAI---------HQFLVRTFSSPTKC 1003
            ..:|..:.|.|   ..|.|:.:...:..|:    .:|...|:         |||.:::|.|||:|
  Rat   993 TQASKLDLSPSVSVATSTEQQEDAARSQQRPSTVPLPNTQALAMAGPKPKAHQFSIKSFPSPTQC 1057

  Fly  1004 NHCTSLMVGLTRQGVVCEICGFACHTICCQKVPTTCPVPMDQTKRPLGIDPTRGIGTAYEGYVKV 1068
            :|||||||||.|||..||:|.|:||..|....|..||:|.:|:|||||:|..|||||||:|||||
  Rat  1058 SHCTSLMVGLIRQGYACEVCAFSCHVSCKDSAPQVCPIPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGYVKV 1122

  Fly  1069 PKSGVIKRGWIRQFVVVCDFKLFLYDISPDRCALPSVSVSQVLDMRDPEFSVGSVRESDVIHAAK 1133
            ||...:|:||.|.:.||||.||||||:...:...|.|..|||||:||.||:|.||..||||||.:
  Rat  1123 PKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGKSTQPGVIASQVLDLRDDEFAVSSVLASDVIHATR 1187

  Fly  1134 KDVPCIFKIKTALIDGGLSLNTLM-LADNESEKSKWVIALGELHRILKRNSLPNTAIFKVNEILD 1197
            :|:||||::..:|:......::|: |.:||:||.|||..|..|..||.:|.|.:..:....|..|
  Rat  1188 RDIPCIFRVTASLLGSPSKTSSLLILTENENEKRKWVGILEGLQAILHKNRLRSQVVHVAQEAYD 1252

  Fly  1198 NTLSLIRNALCSVIIYPNQILLGTEDGLFYINLDQYEIARIGESKKILQLWYIEEEQILVILCGK 1262
            ::|.||:..|.:.|:..::|.:|.|:||:.|.|.:..|.|..:.||:.|:....:|:::::|||:
  Rat  1253 SSLPLIKTVLAAAIVDGDRIAVGLEEGLYVIELTRDVIVRAADCKKVYQIELAPKEKLILLLCGR 1317

  Fly  1263 QRNLRLLP---IRALEASDVEWIKVVESKNCISACTGIIRRFPNIVYSFIIALKRPNNHTQIVVY 1324
            ..::.|.|   ....|||:.: ||:.|:|.|....||.:|:..:.  ...:|:||     .::.|
  Rat  1318 NHHVHLYPWTSFDGAEASNFD-IKLPETKGCQLIATGTLRKSSST--CLFVAVKR-----LVLCY 1374

  Fly  1325 EINRTRTRHQKTCEFTIGYMAQHLQILSDMRLVVAHQSGFTAYFLRGEATAMSLVHPENQLCAFL 1389
            ||.||:..|:|..|.......|.:.:..| ||.|.:.|||:...::|:...:.||:|.:...|||
  Rat  1375 EIQRTKPFHRKFNEIVAPGHVQWMAMFKD-RLCVGYPSGFSLLSIQGDGQPLDLVNPADPSLAFL 1438

  Fly  1390 NYSGVDAVRVIEILCPSGGNFGEYLLVFQTLAIYVDLQGRKSRDREIMYPAFPTYITFCDGHLLV 1454
            :....||:..:|:      ...||||.|..:.:|||.|||:||.:|:|:||.|...:....|:.|
  Rat  1439 SQQSFDALCAVEL------KSEEYLLCFSHMGLYVDPQGRRSRTQELMWPAAPVACSCSSSHVTV 1497

  Fly  1455 FSDTHLDIFNTQTAEWVQSIGLKQSLPLNNLGNVVLSSVNDTPLIVYLSNIHTKGLLQY---RDG 1516
            :|:..:|:|:.:|.||||:|||::..|||:.|::.|... :.|.::|..|..:..:|..   .|.
  Rat  1498 YSEYGVDVFDVRTMEWVQTIGLRRIRPLNSDGSLNLLGC-EPPRLIYFKNKFSGTVLNVPDTSDN 1561

  Fly  1517 NRKGL--PSIKRRFSIREINKTIKSDR-------------RSKMISAPTNFNHISHMGPGDGIQN 1566
            ::|.:  ...||||    :.|..:.:|             ||||||.||||||::|||||||:  
  Rat  1562 SKKQMLRTRSKRRF----VFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGM-- 1620

  Fly  1567 QRLLDLP----TTLETADQACSPIIHSLSCIPQ---SRKSNFLEQVDANSDDYGNDNIISRTPSP 1624
            |.|:|||    .|.:...|..:|     :.:|:   ||...::....:...:.|       .|.|
  Rat  1621 QVLMDLPLSAAPTAQEEKQGPAP-----TGLPRQLPSRNKPYVSWPSSGGSEPG-------VPVP 1673

  Fly  1625 MAS 1627
            :.|
  Rat  1674 LRS 1676

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
gekNP_523837.2 STKc_DMPK_like 98..430 CDD:270748 247/331 (75%)
KELK 477..556 CDD:464876 45/79 (57%)
CCDC158 <481..>894 CDD:464943 173/435 (40%)
C1_MRCK 990..1042 CDD:410359 30/51 (59%)
PH_MRCK 1049..1182 CDD:269949 71/133 (53%)
CNH 1215..1484 CDD:459938 91/271 (34%)
CRIB 1544..1580 CDD:238077 23/39 (59%)
Cdc42bpbXP_006240624.1 STKc_MRCK_beta 3..411 CDD:270774 280/421 (67%)
Myosin_tail_1 426..>934 CDD:460256 180/512 (35%)
KELK 527..606 CDD:464876 44/78 (56%)
C1_MRCKbeta 1044..1096 CDD:410415 30/51 (59%)
PH_MRCK 1103..1237 CDD:269949 71/133 (53%)
CNH 1268..1527 CDD:459938 91/273 (33%)

Return to query results.
Submit another query.