DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment IntS1 and ints-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611875.1 Gene:IntS1 / 37840 FlyBaseID:FBgn0034964 Length:2053 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_491739.2 Gene:ints-1 / 182280 WormBaseID:WBGene00015499 Length:1884 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2102 Identity:402/2102 - (19%)
Similarity:774/2102 - (36%) Gaps:555/2102 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MDRGKGSGSN------RSQKKVPL-----------GGELFALGKSVRDDSKSK--ILPIKGMSSS 46
            |:|.|....|      ...||..|           ||...:.|...:.|.:||  |.|...:|:|
 Worm     1 MERKKHKRLNDTIMKPEDMKKAKLNHKLPTTSGGTGGPSTSGGVKAKLDFRSKTCIPPKPTLSNS 65

  Fly    47 DRKREASTALASSSKRFRGNLKDAGAPDMSSGSSQCETWEQF--AVDCDLDTVVETIYAALEQND 109
                 |:.:| .||...|.||.|              .|:.|  .::.:::|..:::..|:....
 Worm    66 -----ANPSL-QSSHLVRPNLDD--------------QWKDFGDTINLNIETFQKSVQEAILAGH 110

  Fly   110 SETVGRLVCGVIKQ------------------TTTSSSRSKVDNIAL-LALIYVAKVQPSIFCTD 155
            ...:.::....:|.                  .|..:...|::.|.| .||::|       .|. 
 Worm   111 FTKIAKMFVAALKSFFVGEKLKVELRIMGTIAETVKNHGDKLNQIPLHRALLFV-------ICN- 167

  Fly   156 IVACALLSFLRREANVKMRYNTNLHILFANLLTRGFMEISQWPEVL----LRIYIDDAV------ 210
                            ...|..|:..||.:::|    .:::...:|    |..::.|::      
 Worm   168 ----------------SRSYPDNILELFISIIT----SLARQQPILDKCYLTAFLHDSIGMSVGL 212

  Fly   211 ---NERYWADNELCAPLVKNICAAFKTRTPHISLLRWDVSSSLPSGQAHRDSMTVDDDSGDNSTQ 272
               |...|.:.|..|.|||.|...|:|..|..::.          .|...::..:.:      ..
 Worm   213 GTMNRCSWIEKECSAELVKMILDPFETVYPFPAMY----------AQCQVENFAISE------FL 261

  Fly   273 SLDASPLNTESEPIPDAMCTTKSRFSDAVVQ--KHVSDAIRDQLNKRQQQDNYTRNFLKFLCTTS 335
            |..:..:....|..|.:....|.  .|..::  |...|.||.::        ..:...:.||...
 Worm   262 SFFSEKVGKSREKSPRSNLHQKQ--LDVFLEFLKPWFDTIRGEV--------LPKPLFRALCLLC 316

  Fly   336 GIAEVRCLSISRLELWIHNGKLVKFAQQLLSYICFNIKGRNTQ-DNEVLLVLVKM---RLKTKPL 396
            |...:|....:|||:||...|..:...:||..|..||...|.: |.|::.:|:|:   .:||:.:
 Worm   317 GYEHIRLFIANRLEIWITLQKFHREISELLLVIGSNINAENHELDKEIIDILLKLNTKNMKTRTV 381

  Fly   397 INHYMSCLKEMIFLQPEILSTVMKLVVQNEL--SNTRNPNNMGMLATMFQTSADQSAATLAEIY- 458
            :..:...:|.:..:...: ..|:..:..||.  :..|:|.|:..:..:.|....::...||.|. 
 Worm   382 VGPFTQAIKTICEVSRNV-EIVLDSLFINETGPAQNRSPTNLQTIYMILQNQPTEATKALAVIIS 445

  Fly   459 QEFLLQRDDCLRTLRVFLRELVRMLRFDVNLVKFCKTFLSEREDLTPQIEMFEFKERIFNSM--- 520
            :|...::::|::.||.|:|||:|..            :.|:..|....:    |.|.:||.:   
 Worm   446 KELFKEKENCVKMLRAFMRELIRGF------------YHSKSGDFPFSV----FAETLFNKVQRR 494

  Fly   521 ----------VDIVCLCMF--LSATPQAREASLSLKTNRDTKNNHALL-----KLYNQMSQIQLD 568
                      ||::.....  :|:....||.:.|:|.:..|......|     :|..|  :.:.:
 Worm   495 GEPDEILSYAVDLIAQLPLATISSLLTTRENAFSIKFSVPTGTGDVPLIPVEARLARQ--KFECE 557

  Fly   569 TVSWMYETVPTLFK-----IPAAEYHQALHKLLLLDSP-EQYSRCDQWP-SEPERGAILRIISET 626
            .:|:..:.:..|.|     .....:.::...||.|::. :.|:..:... ::.|....:||..|.
 Worm   558 FISYCEKVIEQLLKSRNLFFDEQVFIRSFSILLYLETQRDVYTGIEMAAVTDSEISNCIRIFGEC 622

  Fly   627 PIHEETLLRIILIGITKDIPFSIANTFDVLLLVIKRVS--GMKATNIPAVQANK-FDIIDFLFSM 688
            .:.|..|| :|....|..:|..  :..|::..:.:|.:  ..|.|..|.::..: |.:||....|
 Worm   623 GVSENMLL-MICREETTQLPQK--SQIDLISALTQRAALFHPKITTNPLIRITEPFKLIDSYLKM 684

  Fly   689 SEYHHPENIRLPAEYEPPKLAIIAFYWKAW-LILLMISAHNP-SSFGAFCWDHYPTMKMMMEICI 751
            :.:...|..||    :|| :....|||.|| .|:|.|:|... .||....:..||.::.::. ||
 Worm   685 TIFPRKEAPRL----DPP-ICNRKFYWTAWTTIILWIAAGTEIISFFEEIYSEYPILRYLIH-CI 743

  Fly   752 TNQFNNSSATKDELQIITMERDHILQFETYLAAQTSPHAVITEETAILI---TQLMLMDPMGTPR 813
            ..|                      :||..|..:....|::.:|.|:.:   |:::.|......|
 Worm   744 LCQ----------------------KFEFPLEFEGKSVAMMNDEEAVAVDVETRVIEMYEKNMKR 786

  Fly   814 KVPSM--------------VLDQLKFLNQTYKLGHLFCRCRKPDLLLDIIQRQGTTQSMPWLSDL 864
            .||:|              :||.:......:||...|.||..|.||..:|...|:..|:..:.::
 Worm   787 AVPAMSMEFPNRNSFRAPPLLDDIHLFADKFKLASRFSRCTSPPLLSRLISNVGSENSLFAVREM 851

  Fly   865 VQNSEGDFSHLPVQCLCEFLLF------------NAHIINEENSRDAELVNFLRNL--IFDGNLS 915
            :.:.......|..:|:...|::            |:.::.:...|.|| || |:::  |....|.
 Worm   852 LSSDSTTAKILTAECIFHALMYYFDNQRIRDSDQNSTVVVKALIRQAE-VN-LKSIEPIEQDFLL 914

  Fly   916 HQIVCELLDYIFRRLSSTVKQSRVAALSGLKIIFRHSGDFENEWLLKSLQQIPHFYEVKPFIIPQ 980
            |..:..|       .||.: .:|.||::....:| .|.:.:..:.|..|..:|.|...|...:..
 Worm   915 HSFISSL-------ASSNI-STRSAAVNTCSRLF-PSSEEDKAFDLVKLSNVPRFNARKLKYMEI 970

  Fly   981 LRAACQVENCPELIMAYIQFITAHTLNDPVNEMLDHVIDMAQLIVERSTMFQHIIISQEDYDYVP 1045
            :.:|..||:...|..:|:||:|.:::|...    ||.:             .|.|......|.: 
 Worm   971 IASAVLVESDSHLSNSYLQFLTINSMNTSD----DHTV-------------AHAICQTLSIDCI- 1017

  Fly  1046 DENRIQTLKCLFVMFNNYIIKLREYHEPYEWTEY-PDLLMVQFDDGVQLPLHINIIHAFIILLT- 1108
               ::.|..|.:  |..|:....:.|:....|.. ..|..::|.: .::.|...:..|.:.||: 
 Worm  1018 ---QLHTSLCEY--FLQYVDTCLKNHQIKNITSLDTSLTCIEFGN-QKIALSNEVPSAIVKLLSK 1076

  Fly  1109 YSNSNMPE---SIP----ILDYWFPPGRPAPVAFLPSMPQEQV----QLLPDWLKLKMIRSSVDR 1162
            |.|....|   |.|    :|:.:..|..      :|::...:.    |.|...::.:|::|...|
 Worm  1077 YDNLQTAEKGISDPSFEGLLELFLSPNA------IPNIIDRETGASNQFLSLQMRKEMLKSVEQR 1135

  Fly  1163 LIEAALNDLTPDQIVLFVQNFGTPVNSMSKLLAMLDTAVLEQFDLVKNAILNKAYLAQLIEIQQA 1227
            :::|||..|:......|:........:..|::.|.:...|::.|   :..|:..||  ||...:.
 Worm  1136 VVDAALIGLSEHDAQEFILVSRMSKETAEKVIKMAENMPLDRID---HQSLSNMYL--LIRGYRM 1195

  Fly  1228 RGAKNGHYTVQALDLHSHSQTVPDLPKISVVIQEAVEIDDYDSSDSDDRPTNFL-ATKEVAQ--T 1289
            .|.::|...:..:      ::..|.....:..:|.:||.:.   :::|.||.|| .:..:|:  :
 Worm  1196 IGVQSGETLINRI------KSQMDNLDAFIAKEEPMEIVEV---NTNDMPTEFLIESMRIAESSS 1251

  Fly  1290 ILTQPDQ-------LTESRSDCRSLIQKLLDMLASPNSNR---------ADVVNAIT-EVLAVGC 1337
            ...|.::       .|..:::|         .||:...|:         |.:.:|:. |..::.|
 Worm  1252 FSNQKEEKMDPNVIATWLKTNC---------SLAASTKNKETSIFSLPAAFIQSAMNDETSSIAC 1307

  Fly  1338 SVTMSRHACTFL--RTFFSCML-----HSDKYHILENALQKNLSMFKHTFADSSLLQKSELYHES 1395
            ...:..:...||  .|.|..::     .::|::.:.|.|: ||         ::.|.||....||
 Worm  1308 LAHIEANLKFFLSFETAFQTLIVIIDSAANKFNFVRNRLE-NL---------ATRLLKSVTPPES 1362

  Fly  1396 LVFMLRN--------------------------SREIYAQQFKANTALVARKRIVRAIVQSFDQT 1434
            :..:|:.                          |:.|...:..||::.:..||:|...:..|.:.
 Worm  1363 VAGILQKHAANSIKSVQKSIKPTPIKISTFAEFSKSIKNLKSSANSSEIKEKRLVDEFMIQFVED 1427

  Fly  1435 K----DSKTV---------------AKSKSDQLFHNGLFIDWLSEMDPEIVSTQLMKERFLFSKS 1480
            |    ||..:               |:..:::...|    .|.:::...:.||.|.|   .:::.
 Worm  1428 KGEVIDSDDILIFIASIQSVYSGENAEITAERCLSN----RWSAQLRKVVSSTILEK---YYTQL 1485

  Fly  1481 CSEFRFYLLSLINHQTNWDTIERIAEYLFKNFHEDYDYATVLNYFEALTTNPKLWKGRDKYMSKN 1545
            ||.|.|.|:|.                    :.:.|..|   :|.|..|            :.:.
 Worm  1486 CSIFVFRLISA--------------------YCKKYPLA---SYSEMFT------------LREP 1515

  Fly  1546 VRPDAFFMLRTSELEPFSHFILHEGLSEVKLDSKNYDFKL------------------------- 1585
            ...:.|.:.|.:    |.:.||:  ..:|..||..||.::                         
 Worm  1516 GNKEEFVLNRRA----FDNCILY--FCDVAADSHEYDLQIINLIAGLESQGGTDTGFYFGRALLE 1574

  Fly  1586 --CSRMNLLFKLTEKR-----RDLM------------VKVMEHVEKSSVSDYLKLQVLQQMYIMY 1631
              |:....:.::|.||     ||.:            ::|:.:|| |..|...:.:.:....:..
 Worm  1575 TACANPKSVTRITAKRLLELLRDRLPYLSYRNGISSSIRVLTNVE-SRESCIRRCEQIVDRIVEM 1638

  Fly  1632 P---------------RIKFLKPGKTGEQAYKLQNLKGCQA--DKVSNNLITCLGSLVGKKDF-- 1677
            |               |||..:..:..|:|.:.....|.::  |:.........|..:..||.  
 Worm  1639 PIDLKMALSEDICEEERIKKDRIREKSEEAAENSKFGGKRSAGDRRGGGPPPKKGRFISAKDLPV 1703

  Fly  1678 --------------------ETLSTDTEL-----LLRKLAASHPLLFLRQLGVLSSIMQGRAQLS 1717
                                |.:.|...:     |||:    ||.....:..||::.:.....::
 Worm  1704 PLGQQNDEDSINAEDVPVKREWIDTSHAMTRFVSLLRE----HPNFLKMKFPVLANYVSRVNAMN 1764

  Fly  1718 MKALREEHHFHRFVQILRTLELLQPTIFEEAYKNEIQNTLSCYFNFFKHHSN-----VKEACQML 1777
            .|.|.||:...:...||:::.:|.|.:..:. .:.:...||....|::.|.:     :||.....
 Worm  1765 RKELAEENRVGKIELILQSVIVLCPHMAPDE-MSSVDTALSNCLEFYEKHIDEGGFGIKEQTAFA 1828

  Fly  1778 NKFVQMLQAYINYNPSSALLFI 1799
            ...::....|:|::...|..|:
 Worm  1829 ELTIRACAEYLNHSFVEARSFL 1850

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
IntS1NP_611875.1 DUF3677 327..407 CDD:463578 23/83 (28%)
ints-1NP_491739.2 DUF3677 308..392 CDD:463578 23/83 (28%)

Return to query results.
Submit another query.