Protein Alignment Pask and Mark2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_611864.1
• Gene: Pask / 37824
• FlyBaseID: FBgn0034950
• Length: 985
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_006230941.1
• Gene: Mark2 / 60328
• RGDID: 708483
• Length: 841
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 493
• Identity: 123/493 - (24%)
• Similarity: 219/493 - (44%)
• Gaps: 89/493 - (18%)

  Fly   534 TVEQSLGQVIKTTAAQNSSRPNSL---SLVSKYEDELYLGDYSKYYTSIRQIGRGAYGYVNMAFR 595
            |.:.:||.:    .::.||:.|.|   :..:..:::.::|:    |..::.||:|.:..|.:|..
  Rat    16 TEQPTLGHL----DSKPSSKSNMLRGRNSATSADEQPHIGN----YRLLKTIGKGNFAKVKLARH 72

  Fly   596 NSDRLLVITKFILKEKLCSQFMVKSRDCKEVPIEIHLLQTLNHKNIVSVLDVFENDLFYQLVMEK 660
                  ::|...:..|:..:..:.|...:::..|:.:::.|||.|||.:.:|.|.:....||||
  Rat    73 ------ILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVME- 130

  Fly   661 HGSGMDLWTFIERRPLMDEKLGSYIFRQVADAVNYLHEQKILHRDIKDENIIIDQNFTIKLIDFG 725
            :.||.:::.::.....|.||.....|||:..||.|.|::.|:|||:|.||:::|.:..||:.|||
  Rat   131 YASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFG 195

  Fly   726 SATFMEEGKFFSTFYGTTEYCSPEVLAGNRYVGPELEIWALGVTLYVLMFFENPFIDV------E 784
            .:.....|....||.|:..|.:||:..|.:|.|||:::|:|||.||.|:....||...      |
  Rat   196 FSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRE 260

  Fly   785 ETLKAEIQIPKAVSEQLSRLLSSMLNKDPKYRCTMHQLITDPWLT-----QEVNPSTFSFSWIVP 844
            ..|:.:.:||..:|.....||...|..:|..|.|:.|::.|.|:.     .|:.|      ::.|
  Rat   261 RVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKP------YVEP 319

  Fly   845 CKAHEANP-------------------------NLYFSGYL---YSSTSV---LSTISPQESFSH 878
            ...:: :|                         |...:.||   |.|:.:   ..|:.|:.| :.
  Rat   320 LPDYK-DPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTITLKPRPS-AD 382

  Fly   879 IEESSIGGSDDARLASHRTGHKLCVNEAKHNKMD---------TLYAKQFQLNTSVSNH-ELRVS 933
            :..||      |...||:....:..|..:....|         ..|:|:.|.|.:.:.. |....
  Rat   383 LTNSS------APSPSHKVQRSVSANPKQRRSSDQAVPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEETG 441

  Fly   934 LPDSSHTEIGGSICSSKSENDIFKNKLQPCVSTYNVVS 971
            ...||..::..|....     :.:.|..|..||.:|:|
  Rat   442 RKASSTAKVPASPLPG-----LDRKKTTPTPSTNSVLS 474

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Pask	NP_611864.1	PAS	70..171	CDD:473914
		PAS	182..350	CDD:441804
		PAS	286..>325	CDD:238075
		STKc_PASK	575..828	CDD:270906	81/258 (31%)
Mark2	XP_006230941.1	STKc_MARK	52..304	CDD:270974	81/262 (31%)
		UBA_MARK2	322..363	CDD:270589	4/41 (10%)
		MARK2_C	742..840	CDD:213386