Protein Alignment KCNMA1 and Kcnma1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: XP_016871696.1
• Gene: KCNMA1 / 3778
• HGNCID: 6284
• Length: 1311
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_063130769.1
• Gene: Kcnma1 / 83731
• RGDID: 620715
• Length: 1320
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1313
• Identity: 1247/1313 - (94%)
• Similarity: 1249/1313 - (95%)
• Gaps: 54/1313 - (4%)

Human     1 MANGGGGGGG-----SSGGGGGGGGSSLRMSSNIHANHLSLDASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 60
            ||||||||||     |.|||||||||.||||||||||||||||     |||||||||||||||||
  Rat     1 MANGGGGGGGGSSGSSGGGGGGGGGSGLRMSSNIHANHLSLDA-----SSSSSSSSSSSSSSSSS 60

Human    61 VHEPKMDALIIPVTMEVPCDSRGQRMWWAFLASSMVTFFGGLFIILLWRTLKYLWTVCCHCGGKT 125
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    61 VHEPKMDALIIPVTMEVPCDSRGQRMWWAFLASSMVTFFGGLFIILLWRTLKYLWTVCCHCGGKT 125

Human   126 KGRKPRLQGGVIGCMFHLQPREAQKSSSALEVHKKYGDSTGTTLEEAQKINNGSSQADGTLKPVD 190
            |                                            ||||||||||||||||||||
  Rat   126 K--------------------------------------------EAQKINNGSSQADGTLKPVD 146

Human   191 EKEEAVAAEVGWMTSVKDWAGVMISAQTLTGRVLVVLVFALSIGALVIYFIDSSNPIESCQNFYK 255
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   147 EKEEVVAAEVGWMTSVKDWAGVMISAQTLTGRVLVVLVFALSIGALVIYFIDSSNPIESCQNFYK 211

Human   256 DFTLQIDMAFNVFFLLYFGLRFIAANDKLWFWLEVNSVVDFFTVPPVFVSVYLNRSWLGLRFLRA 320
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   212 DFTLQIDMAFNVFFLLYFGLRFIAANDKLWFWLEVNSVVDFFTVPPVFVSVYLNRSWLGLRFLRA 276

Human   321 LRLIQFSEILQFLNILKTSNSIKLVNLLSIFISTWLTAAGFIHLVENSGDPWENFQNNQALTYWE 385
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   277 LRLIQFSEILQFLNILKTSNSIKLVNLLSIFISTWLTAAGFIHLVENSGDPWENFQNNQALTYWE 341

Human   386 CVYLLMVTMSTVGYGDVYAKTTLGRLFMVFFILGGLAMFASYVPEIIELIGNRKKYGGSYSAVSG 450
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   342 CVYLLMVTMSTVGYGDVYAKTTLGRLFMVFFILGGLAMFASYVPEIIELIGNRKKYGGSYSAVSG 406

Human   451 RKHIVVCGHITLESVSNFLKDFLHKDRDDVNVEIVFLHNISPNLELEALFKRHFTQVEFYQGSVL 515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   407 RKHIVVCGHITLESVSNFLKDFLHKDRDDVNVEIVFLHNISPNLELEALFKRHFTQVEFYQGSVL 471

Human   516 NPHDLARVKIESADACLILANKYCADPDAEDASNIMRVISIKNYHPKIRIITQMLQYHNKAHLLN 580
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   472 NPHDLARVKIESADACLILANKYCADPDAEDASNIMRVISIKNYHPKIRIITQMLQYHNKAHLLN 536

Human   581 IPSWNWKEGDDAICLAELKLGFIAQSCLAQGLSTMLANLFSMRSFIKIEEDTWQKYYLEGVSNEM 645
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   537 IPSWNWKEGDDAICLAELKLGFIAQSCLAQGLSTMLANLFSMRSFIKIEEDTWQKYYLEGVSNEM 601

Human   646 YTEYLSSAFVGLSFPTVCELCFVKLKLLMIAIEYKSANRESRSRKRILINPGNHLKIQEGTLGFF 710
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   602 YTEYLSSAFVGLSFPTVCELCFVKLKLLMIAIEYKSANRESRSRKRILINPGNHLKIQEGTLGFF 666

Human   711 IASDAKEVKRAFFYCKACHDDITDPKRIKKCGCKRPKMSIYKRMRRACCFDCGRSERDCSCMSGR 775
            |||||||||||||||||||||:|||||||||||:||||||||||.||||||||||||||||||||
  Rat   667 IASDAKEVKRAFFYCKACHDDVTDPKRIKKCGCRRPKMSIYKRMSRACCFDCGRSERDCSCMSGR 731

Human   776 VRGNVDTLERAFPLSSVSVNDCSTSFRAFEDEQPSTLSPKKKQRNGGMRNSPNTSPKLMRHDPLL 840
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   732 VRGNVDTLERNFPLSSVSVNDCSTSFRAFEDEQPPTLSPKKKQRNGGMRNSPNTSPKLMRHDPLL 796

Human   841 IPGNDQIDNMDSNVKKYDSTGMFHWCAPKEIEKVILTRSEAAMTVLSGHVVVCIFGDVSSALIGL 905
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   797 IPGNDQIDNMDSNVKKYDSTGMFHWCAPKEIEKVILTRSEAAMTVLSGHVVVCIFGDVSSALIGL 861

Human   906 RNLVMPLRASNFHYHELKHIVFVGSIEYLKREWETLHNFPKVSILPGTPLSRADLRAVNINLCDM 970
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   862 RNLVMPLRASNFHYHELKHIVFVGSIEYLKREWETLHNFPKVSILPGTPLSRADLRAVNINLCDM 926

Human   971 CVILSANQNNIDDTSLQDKECILASLNIKSMQFDDSIGVLQANSQGFTPPGMDRSSPDNSPVHGM 1035
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   927 CVILSANQNNIDDTSLQDKECILASLNIKSMQFDDSIGVLQANSQGFTPPGMDRSSPDNSPVHGM 991

Human  1036 LRQPSITTGVNIPIITELAKPGKLPLVSVNQEKNSGTHILMITELVNDTNVQFLDQDDDDDPDTE 1100
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   992 LRQPSITTGVNIPIITELAKPGKLPLVSVNQEKNSGTHILMITELVNDTNVQFLDQDDDDDPDTE 1056

Human  1101 LYLTQPFACGTAFAVSVLDSLMSATYFNDNILTLIRTLVTGGATPELEALIAEENALRGGYSTPQ 1165
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1057 LYLTQPFACGTAFAVSVLDSLMSATYFNDNILTLIRTLVTGGATPELEALIAEENALRGGYSTPQ 1121

Human  1166 TLANRDRCRVAQLALLDGPFADLGDGGCYGDLFCKALKTYNMLCFGIYRLRDAHLSTPSQCTKRY 1230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1122 TLANRDRCRVAQLALLDGPFADLGDGGCYGDLFCKALKTYNMLCFGIYRLRDAHLSTPSQCTKRY 1186

Human  1231 VITNPPYEFELVPTDLIFCLMQFDHNAGQSRASLSHSSHSSQSSSKKSSSVHSIPSTANRQNRPK 1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1187 VITNPPYEFELVPTDLIFCLMQFDHNAGQSRASLSHSSHSSQSSSKKSSSVHSIPSTANRPNRPK 1251

Human  1296 SRESRDKQNRKEM 1308
            |||||||||...|
  Rat  1252 SRESRDKQNATRM 1264

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
KCNMA1	XP_016871696.1	Ion_trans	223..440	CDD:459842	216/216 (100%)
		TrkA	387..>567	CDD:440335	179/179 (100%)
		BK_channel_a	590..677	CDD:460947	86/86 (100%)
Kcnma1	XP_063130769.1	None