DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KCNMA1 and Kcnma1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016871696.1 Gene:KCNMA1 / 3778 HGNCID:6284 Length:1311 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006518654.1 Gene:Kcnma1 / 16531 MGIID:99923 Length:1323 Species:Mus musculus


Alignment Length:1312 Identity:1252/1312 - (95%)
Similarity:1254/1312 - (95%) Gaps:49/1312 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MANGGGGGGGSS-GGGGGGGGSSLRMSSNIHANHLSLDASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSVHEP 64
            |||||||||||| |||||||||.|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MANGGGGGGGSSGGGGGGGGGSGLRMSSNIHANHLSLDA-SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSVHEP 64

Human    65 KMDALIIPVTMEVPCDSRGQRMWWAFLASSMVTFFGGLFIILLWRTLKYLWTVCCHCGGKTKGRK 129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Mouse    65 KMDALIIPVTMEVPCDSRGQRMWWAFLASSMVTFFGGLFIILLWRTLKYLWTVCCHCGGKTK--- 126

Human   130 PRLQGGVIGCMFHLQPREAQKSSSALEVHKKYGDSTGTTLEEAQKINNGSSQADGTLKPVDEKEE 194
                                                     ||||||||||||||||||||||||
Mouse   127 -----------------------------------------EAQKINNGSSQADGTLKPVDEKEE 150

Human   195 AVAAEVGWMTSVKDWAGVMISAQTLTGRVLVVLVFALSIGALVIYFIDSSNPIESCQNFYKDFTL 259
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   151 VVAAEVGWMTSVKDWAGVMISAQTLTGRVLVVLVFALSIGALVIYFIDSSNPIESCQNFYKDFTL 215

Human   260 QIDMAFNVFFLLYFGLRFIAANDKLWFWLEVNSVVDFFTVPPVFVSVYLNRSWLGLRFLRALRLI 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   216 QIDMAFNVFFLLYFGLRFIAANDKLWFWLEVNSVVDFFTVPPVFVSVYLNRSWLGLRFLRALRLI 280

Human   325 QFSEILQFLNILKTSNSIKLVNLLSIFISTWLTAAGFIHLVENSGDPWENFQNNQALTYWECVYL 389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   281 QFSEILQFLNILKTSNSIKLVNLLSIFISTWLTAAGFIHLVENSGDPWENFQNNQALTYWECVYL 345

Human   390 LMVTMSTVGYGDVYAKTTLGRLFMVFFILGGLAMFASYVPEIIELIGNRKKYGGSYSAVSGRKHI 454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   346 LMVTMSTVGYGDVYAKTTLGRLFMVFFILGGLAMFASYVPEIIELIGNRKKYGGSYSAVSGRKHI 410

Human   455 VVCGHITLESVSNFLKDFLHKDRDDVNVEIVFLHNISPNLELEALFKRHFTQVEFYQGSVLNPHD 519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   411 VVCGHITLESVSNFLKDFLHKDRDDVNVEIVFLHNISPNLELEALFKRHFTQVEFYQGSVLNPHD 475

Human   520 LARVKIESADACLILANKYCADPDAEDASNIMRVISIKNYHPKIRIITQMLQYHNKAHLLNIPSW 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   476 LARVKIESADACLILANKYCADPDAEDASNIMRVISIKNYHPKIRIITQMLQYHNKAHLLNIPSW 540

Human   585 NWKEGDDAICLAELKLGFIAQSCLAQGLSTMLANLFSMRSFIKIEEDTWQKYYLEGVSNEMYTEY 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   541 NWKEGDDAICLAELKLGFIAQSCLAQGLSTMLANLFSMRSFIKIEEDTWQKYYLEGVSNEMYTEY 605

Human   650 LSSAFVGLSFPTVCELCFVKLKLLMIAIEYKSANRESRSRKRILINPGNHLKIQEGTLGFFIASD 714
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   606 LSSAFVGLSFPTVCELCFVKLKLLMIAIEYKSANRESRSRKRILINPGNHLKIQEGTLGFFIASD 670

Human   715 AKEVKRAFFYCKACHDDITDPKRIKKCGCKR---PKMSIYKRMRRACCFDCGRSERDCSCMSGRV 776
            |||||||||||||||||:|||||||||||:|   .||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   671 AKEVKRAFFYCKACHDDVTDPKRIKKCGCRRLIYSKMSIYKRMRRACCFDCGRSERDCSCMSGRV 735

Human   777 RGNVDTLERAFPLSSVSVNDCSTSFRAFEDEQPSTLSPKKKQRNGGMRNSPNTSPKLMRHDPLLI 841
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   736 RGNVDTLERTFPLSSVSVNDCSTSFRAFEDEQPPTLSPKKKQRNGGMRNSPNTSPKLMRHDPLLI 800

Human   842 PGNDQIDNMDSNVKKYDSTGMFHWCAPKEIEKVILTRSEAAMTVLSGHVVVCIFGDVSSALIGLR 906
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   801 PGNDQIDNMDSNVKKYDSTGMFHWCAPKEIEKVILTRSEAAMTVLSGHVVVCIFGDVSSALIGLR 865

Human   907 NLVMPLRASNFHYHELKHIVFVGSIEYLKREWETLHNFPKVSILPGTPLSRADLRAVNINLCDMC 971
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   866 NLVMPLRASNFHYHELKHIVFVGSIEYLKREWETLHNFPKVSILPGTPLSRADLRAVNINLCDMC 930

Human   972 VILSANQNNIDDTSLQDKECILASLNIKSMQFDDSIGVLQANSQGFTPPGMDRSSPDNSPVHGML 1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   931 VILSANQNNIDDTSLQDKECILASLNIKSMQFDDSIGVLQANSQGFTPPGMDRSSPDNSPVHGML 995

Human  1037 RQPSITTGVNIPIITELAKPGKLPLVSVNQEKNSGTHILMITELVNDTNVQFLDQDDDDDPDTEL 1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   996 RQPSITTGVNIPIITELAKPGKLPLVSVNQEKNSGTHILMITELVNDTNVQFLDQDDDDDPDTEL 1060

Human  1102 YLTQPFACGTAFAVSVLDSLMSATYFNDNILTLIRTLVTGGATPELEALIAEENALRGGYSTPQT 1166
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1061 YLTQPFACGTAFAVSVLDSLMSATYFNDNILTLIRTLVTGGATPELEALIAEENALRGGYSTPQT 1125

Human  1167 LANRDRCRVAQLALLDGPFADLGDGGCYGDLFCKALKTYNMLCFGIYRLRDAHLSTPSQCTKRYV 1231
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1126 LANRDRCRVAQLALLDGPFADLGDGGCYGDLFCKALKTYNMLCFGIYRLRDAHLSTPSQCTKRYV 1190

Human  1232 ITNPPYEFELVPTDLIFCLMQFDHNAGQSRASLSHSSHSSQSSSKKSSSVHSIPSTANRQNRPKS 1296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Mouse  1191 ITNPPYEFELVPTDLIFCLMQFDHNAGQSRASLSHSSHSSQSSSKKSSSVHSIPSTANRPNRPKS 1255

Human  1297 RESRDKQNRKEM 1308
            ||||||||...|
Mouse  1256 RESRDKQNATRM 1267

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KCNMA1XP_016871696.1 Ion_trans 223..440 CDD:459842 216/216 (100%)
TrkA 387..>567 CDD:440335 179/179 (100%)
BK_channel_a 590..677 CDD:460947 86/86 (100%)
Kcnma1XP_006518654.1 Ion_trans 179..396 CDD:459842 216/216 (100%)
TrkA 343..>523 CDD:440335 179/179 (100%)
BK_channel_a 546..633 CDD:460947 86/86 (100%)

Return to query results.
Submit another query.