DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ItgaPS5 and scb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_611808.2 Gene:ItgaPS5 / 37732 FlyBaseID:FBgn0034880 Length:1018 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_523750.2 Gene:scb / 36692 FlyBaseID:FBgn0286785 Length:1115 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1108 Identity:587/1108 - (52%)
Similarity:761/1108 - (68%) Gaps:112/1108 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 LFLIFLALKYQSNAMNFSPLPNRVIDAPKHLKTRMIQVRSSYFGYSLVIRPTSIFVGAPRAQSTL 69
            :||..|||.....|.||.|.|:|||::|||||..:.|.|||||||:||||.|||.||||||||||
  Fly    11 IFLALLALISHIEAFNFMPRPSRVINSPKHLKFHINQTRSSYFGYTLVIRQTSIIVGAPRAQSTL 75

  Fly    70 ESQGSINETGAVYRCPLASGSCSHYVLNDKLN--------------KQFQWLGGSMDGGTKDTDK 120
            |||.:||||||:|||.|.:|.||.|||:.:.|              |.|||||||||||||||||
  Fly    76 ESQRTINETGAIYRCSLTNGVCSPYVLDSRGNVDAPYSEYTFDSERKDFQWLGGSMDGGTKDTDK 140

  Fly   121 LLVCAPRFFVPKNKNYGQMRGICYWVRDTVADTPP-LSDVRTISLIPSQAEE----------HFM 174
            ||||||||:.|.::: ..:.|:||||.:|||.||. ::.:..:.|...|.:|          :.|
  Fly   141 LLVCAPRFYAPSSRD-NHLHGVCYWVNNTVASTPQHVTRISPLRLKSEQVKEEDNGNKASFFYIM 204

  Fly   175 LELGLSAHVTDDNSGFLIGAPGVRSWKGSVLVHRGED-------------LAAQGSYAVKMLDSW 226
            .||||||||.|||:.|||||||:.:|:|||:::|..|             .|.:.:|  :.:||.
  Fly   205 GELGLSAHVADDNTKFLIGAPGINTWRGSVILYRQVDPVDNPTASRRDTSKALRRTY--RDVDSN 267

  Fly   227 DWVKNHF---------------TYVGYALSSGYFSSNNRTSLLYVTTAPSSVLNTGKAYIFDVVG 276
            |:...|:               :|.|||:|||:|.|:|.|.||||.|||.:...:|:||||||.|
  Fly   268 DYTPEHYAPEIPTPGLWGQEEDSYFGYAVSSGFFDSSNPTKLLYVATAPQANKQSGEAYIFDVRG 332

  Fly   277 EIVRKLHVFHGEQLGEYFGYSVVAEDLNGDGLTDVVVSAPLNALGDSYDVGAIYVFINKGLFKFE 341
            :.:.|.|||.|||.||||||||:||||||||.|||:||||.:||.||:|.||||||||||.|.||
  Fly   333 KSIHKYHVFRGEQFGEYFGYSVLAEDLNGDGKTDVIVSAPQHALEDSHDNGAIYVFINKGFFNFE 397

  Fly   342 KKIIRLPLSSGARFGSSLSKVGDINHDGYNDLAVGAPFAGNGAVFIFLGSEHGLRDEPSQRLDAP 406
            ::|:|.|:.:.||||::||::||||||||||:||||||||||.|||:||||:||||:||||||||
  Fly   398 RQILRSPVETMARFGTALSRLGDINHDGYNDVAVGAPFAGNGTVFIYLGSENGLRDQPSQRLDAP 462

  Fly   407 SREPGPYGAHMFGQGLSRGSDIDGNGFNDLAIGAPGAEAVYLYRAYPVVKIHATVRSESRAIRPE 471
            |::|..||:||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||:||||:||||.|:||
  Fly   463 SQQPSKYGSHMFGHGLSRGSDIDGNGFNDFAIGAPNAEAVYLYRAYPVVKVHATVKSESREIKPE 527

  Fly   472 QETITVTACYRLETTSKARQMQQQELTFRMTIDELLQRVSFAPMRTNEVSFQAQAGLSGSCRNFS 536
            ||.:.:||||||.|||..:.:|:|||..|:.:|:.|:||.|...:|||:||:..|.....||:|.
  Fly   528 QEKVKITACYRLSTTSTDKLVQEQELAIRIAMDKQLKRVKFTQTQTNEISFKVNANFGEQCRDFE 592

  Fly   537 VGVHYT-GGIFTPIDLELHYELAKKIPHSHEAFCESCAVVDPLEPKYATGTLSFMTGCAAHVCVS 600
            ..|.|: ..||||||||:||||.||:|.|.| |||:||:|||.|||.:|..:.|.||||..||.:
  Fly   593 TQVRYSEKDIFTPIDLEMHYELTKKVPDSEE-FCETCAIVDPTEPKVSTQNIIFSTGCATDVCTA 656

  Fly   601 DLQLSSKDVNSSFIFGSLEVLSFSYEITNSGEPAYVAQFNVTSSARLPFAKVPGNCRVRHEVMLC 665
            ||||.||||:.::|.||.:.|..:|||||.||.||:.||||||::||.||:|||||:|...||:|
  Fly   657 DLQLRSKDVSPTYILGSADTLRLNYEITNIGETAYLPQFNVTSTSRLAFAQVPGNCKVVDAVMVC 721

  Fly   666 DLNGGRALARGDSESLTIIFDVTQLSGQSLTIEAAVSSAGMDQNPKDNTMSTTISLREYAEIDAS 730
            |||.||.||:||::|:||.|||:|||||||.|.|.|.|.|.:|||.||..:..|.|:|:.|||||
  Fly   722 DLNRGRPLAKGDTDSVTISFDVSQLSGQSLIIHAEVFSTGYEQNPTDNRQTNVIGLKEFTEIDAS 786

  Fly   731 GGPIDGHIALKEYPYSAEVNNSYEFKSHGPSIIDELTVYVDVPIAYTVTGSAGIKSIFNISSLQM 795
            ||..:..|.|:.|..|||:.|:||.||:|||:|::|||...:||||.|.||..|..|.|::||:|
  Fly   787 GGQTNSQIDLEHYSNSAEIVNNYEIKSNGPSVIEQLTVSFYIPIAYKVAGSTAIIPIINVTSLKM 851

  Fly   796 QATHGSELVPIKLYDQTNTLAKEYPLE------------------------------------DS 824
            ||::.|:|:.|.||||.||:....|:|                                    |:
  Fly   852 QASYDSQLLSIDLYDQNNTMLVVDPVEVTTTLSGGLERTVITQNRQSYDIHTSGHVHQTMEVLDT 916

  Fly   825 SRRA----NRKRRELQ-----QDQYAIMPDVNISDILT---KENLPANRTLVLDCLRGNWTICVR 877
            |..|    :||||:|:     ::|||.:.:|...|:|:   |..||.|||:|.:|.....|||||
  Fly   917 SMVATASMSRKRRDLKALTANREQYARISNVKAHDLLSDDFKGKLPVNRTIVFNCRDPEMTICVR 981

  Fly   878 SQMRVQLKPEQPIDLRISFKVDLND----FVNTFDYLVIFTNVEMFKEGD--STSIALKRNLKPN 936
            ::|||..:||:.|:|.:.:.||||:    .|:.::|.||.|::::.|:||  |||.::.|.::||
  Fly   982 AEMRVHFRPEKSINLNMRYSVDLNEVNAILVDPWEYFVILTDLKLQKKGDPTSTSFSINRRIEPN 1046

  Fly   937 VIFNYSETPLPIWYIILSLIAGHLLLGAMTYILYKLRFFKRGKKEELKRLLEEHRSETKEPATDC 1001
            :|..:.||.||||.||:|:|.|.|||.|::|:|||..||.|.||:||.||::::..|.:....:.
  Fly  1047 IISKHQETGLPIWIIIVSVIGGLLLLSAISYLLYKFGFFNRTKKDELDRLVQQNPVEPEAENLNS 1111

  Fly  1002 EGN 1004
            .||
  Fly  1112 GGN 1114

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ItgaPS5NP_611808.2 FG-GAP 294..332 CDD:460357 29/37 (78%)
Int_alpha 351..403 CDD:214549 40/51 (78%)
Int_alpha 417..463 CDD:214549 41/45 (91%)
Integrin_alpha2 453..837 CDD:462478 217/429 (51%)
scbNP_523750.2 Int_alpha 51..103 CDD:214549 40/51 (78%)
FG-GAP 350..388 CDD:460357 29/37 (78%)
Int_alpha 409..459 CDD:214549 40/49 (82%)
Int_alpha 473..>515 CDD:214549 37/41 (90%)
Integrin_alpha2 509..829 CDD:462478 183/320 (57%)

Return to query results.
Submit another query.