DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Msp300 and Syne2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001188695.1 Gene:Msp300 / 3771968 FlyBaseID:FBgn0261836 Length:13540 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038969186.1 Gene:Syne2 / 366669 RGDID:1305248 Length:6909 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:7542 Identity:1391/7542 - (18%)
Similarity:2657/7542 - (35%) Gaps:2022/7542 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  7239 QPEPTPVSEVAPSQPLSWSSIVSQTTEVTTNVTETRFTEEPEDKKPLEEKPKKQKPKKEKKTKVV 7303
            ||.|..|| ||.|.|                      |..|..||..:.:.:.:.....||..:.
  Rat   150 QPSPEVVS-VADSSP----------------------TSSPPAKKCSKAQAQARWQWSAKKALLQ 191

  Fly  7304 EAPE------------------------PIVESAVPEDVVEPTVEVTFVEEPVVEVTTVVQ-EVK 7343
            .|.|                        .::.|..|:.:...:|.....::.:.|...:.: |:|
  Rat   192 WAQEQCAGLGSVSVTDFKSSWRNGLAFLAVIHSLRPDLIDMDSVRHRSNQDNLKEAFRIAEHELK 256

  Fly  7344 PETQPEPTPVSEVAPSQPLSWSSIVSQTTEVTTNVTETRFTEEPEDKK-----PLEEKPKKQKPK 7403
            .....||..|..|.|.:. |..:.|:|..:.:.:......:.:.:.|.     .|:||..:|..|
  Rat   257 IPKLLEPEDVDVVNPDEK-SIMTYVAQFLKYSKDAPGPGGSSQAKVKDAVVWLTLQEKRLQQMLK 320

  Fly  7404 KEKKTKVVEAPEPIVESAVPEDVVEPTVEVTFVEEPVVEVTTVVEEVTPETQPEPTSVSEVAPSQ 7468
            ..:..........:               ::|:|....|..:..:.::|..:.|..|..|:...|
  Rat   321 DSESETYCNNYHSL---------------LSFMESLNEEQKSFTDVLSPRERMEEWSEDELQLRQ 370

  Fly  7469 PLLWSSIVSQTTEDVAE--ALITDVAEDQKPLMEKPKKLKAGKEKKSKVQNVEESILESDVPLS- 7530
            .  |:|:    |:.|||  |.:.|..  ..||.|....|||           .|.::|..||.| 
  Rat   371 G--WTSL----TQQVAEWKAQLDDAL--PSPLKEMEAWLKA-----------VEGLVEEGVPTSQ 416

  Fly  7531 -------VVEPIIGFTTVQKDVPPKTESHTFSWSSIVAQSVE------VPRTIPKHVESKTGGIQ 7582
                   :::..|...        |:...:|.:.|.:..|.|      :|...|..:|..|..|.
  Rat   417 NYSEARTLIQGKISLF--------KSLMDSFDYHSNILLSFENRAEKNLPLVPPAKLEEMTRRIN 473

  Fly  7583 NFIAQEQNYSTVV--NDS-------VKKPKPK----------KEKKIV------------QPIQQ 7616
            |.:.  :|:.:::  :||       :.:.|.|          ||..:|            |.:.|
  Rat   474 NVLG--KNFISLLEFHDSKCSVLALLDEAKAKLDVWNGAYGSKESVVVLLEDWHKFTGERQFLAQ 536

  Fly  7617 ---------------------------PTGESVPVRKDHMREGVTKAVPEPQTLSWS------SI 7648
                                       ..|::|...:.|:.:  |||..:....||:      ||
  Rat   537 LDTSFRKCEEMYKSLARECGSIKEEYVTLGKNVHRCRQHIHD--TKATLQRVLASWATYEEDLSI 599

  Fly  7649 VSHNIDLTPTFTENRV-IEAVDEINPDDSSSNQEGELPIHVDERKRKPKKDKKRDQNIETSVVYE 7712
            |..:::.|.......| ||.:.:.|...:|.|:.|...|.|..|:            :.:||..|
  Rat   600 VKASLEATKKEQIKEVPIETLSQWNAKCTSLNEVGSFLIDVSSRE------------VGSSVSKE 652

  Fly  7713 --EIPETERVAVSSTPEFSIQLP---APTKPSVWSSSDTYAE---VVKKSGYNNNTNIK-YQKIE 7768
              .:.:..|..::.|| ..::||   ...:|||.||..:.::   :..:.|.:::.:|| .:|.|
  Rat   653 LRRLNKRWRKFITKTP-LELKLPLMRVQDQPSVNSSGTSLSKESAMSAEPGRSHDEDIKAVEKQE 716

  Fly  7769 AREPIKSEPKH------------TFVEV--------------QTHE-----DLLEFPDPIIPAIE 7802
            |.|...:.|.:            |.||:              |.||     |:|::  .|....|
  Rat   717 AEEEESAGPLNVSKVSEEVEGLLTQVEIWGSDTKSILDLLRHQDHEDGSSSDILQY--LIAKGSE 779

  Fly  7803 RDEALEKPSQLSWKDLVDEDD--VDPLESWHKGETDSVEIKTQKPIQERHSRVSVKPEIQITEVV 7865
            .:|.|.:.     :|.:...|  ...|||:.    :.:....|..|||      .|..:|:|.|.
  Rat   780 HEELLART-----EDALQRHDQSASNLESFQ----NVLRAGLQAKIQE------AKKGVQMTVVE 829

  Fly  7866 TETQSQSETDQEFLEITSKKRNRSRSRSQQSQASNIDEKHQKKK-----SKKPKNTVPKAPAQQP 7925
            .....::.:|.. ||:..:.:.....|..:|..:..::...:::     :.|.|..:....|...
  Rat   830 LSAALRNLSDGP-LELDLRLKVEEAQRELESSIARAEQLLGQRERPGGLTSKYKEALEIFNANSL 893

  Fly  7926 TEAPEDVQPPKESVP-----SVEEPSPPPAPSPNTSGMSWAAIAAHNVPEPVQ-----HIRPLQA 7980
            .:..:.|:..|.:||     .:||.|       ..:...|         ||::     :::.|:.
  Rat   894 AKYLQAVEELKCTVPGGVKLQLEEQS-------RDACAKW---------EPLRQEISLYLQQLKI 942

  Fly  7981 EAKPTVVED----VRKSTN-------------------------------EHTVNI--PITFETT 8008
            :.:...:.|    :.|..|                               ||.|.:  .:..|..
  Rat   943 DIEEGKLRDNIAKLEKQINKEKKLIGRGRTRGLRKEHEACFSPESIECQLEHHVGVLRVLCEELA 1007

  Fly  8009 EPKTKKPKQKSKRKLPTDVVDFINAEKSIHQVI-ASKPEIVEEPGSIIVEDVNNTLTSWEIKTPL 8072
            .|:.::..:::.|.....:...:.....||..: :|:...::|..::|..:........|.....
  Rat  1008 SPEDQQELKRALRDYEQKIERLLKCASEIHTTLQSSQGGALKERAALITTENGGRDAHGEAAHGK 1072

  Fly  8073 APFE-----FVAESEVEPVSE-SHMEDLPVEKVLKTEPIVESTAVDESKTTTTVTTTTTTTETTS 8131
            ||.|     ...|..:||:.. |...:|   |..:.|.|:|....|.|.:...:.....|.....
  Rat  1073 APLEIPDNQLSTEKAMEPIKNFSQTSEL---KPQQEESILEKEGKDCSASLNDLQERYDTQRAIL 1134

  Fly  8132 NVSIPEEPKKVVEPEKKPEEPKKPAYAGLPVDDSSNSWMDVLDEPMNFSDDEEEPVPEPLKEETL 8196
            ...:.:...:|........|.......|...|      :.||....:...||.|.....||  :|
  Rat  1135 ERHLQDSESRVTSDFPGETERSSACLQGKLTD------LQVLQADTDACWDEFEVTSLNLK--SL 1191

  Fly  8197 VEEVVEEKPIV--EVSVVDDSKSITTV--TTTTTTTETISELPIPEEPK------------KVVE 8245
            |.:.  |||::  |..::..|:....|  .|...:.|...::.:|.|.:            .|..
  Rat  1192 VSDT--EKPVLAQERDLLKGSEQALHVLLNTRMESLEMALQIVLPLEKECSLLCASDLSLCTVAV 1254

  Fly  8246 PEKKPEEPKKPAYAGLPVDESSSSWMDVLD---EPMNFSDDEEEP-VPEPVKEETLVEEVVEEKP 8306
            .:..|          |.:|....:..|:.|   :.:....:.||| |..|.:..||.:.::::  
  Rat  1255 QDLHP----------LEIDGVYQNLRDIQDSIAKQIRICTNLEEPSVSVPRELHTLDQCMIQD-- 1307

  Fly  8307 IVEVSVVDDSKSITTVTTTTTTTETIS-KLPISEEPKKVVE--------PEKKPEEPKKPAYAGL 8362
                          .|.......||:: |:.:.|:....:|        .:...|.|..|..:..
  Rat  1308 --------------IVLKCRLQLETMNQKVEMREDALDALEGFLASLRAAKLSAELPANPPASKT 1358

  Fly  8363 PVDDSSNSWMD-----------VLDEPM-----NFSDDEEEPVPEPVKEETLVEEVV-------- 8403
            |.|..:.|..:           :|||.:     |..|.||       .|.|..|.:|        
  Rat  1359 PEDTPAVSSAEEDILLMKEKARLLDERLRTLGINIKDAEE-------GESTTCERLVGALSVNLA 1416

  Fly  8404 -------EEKPIVEVSVVD--DSKSITTVTTTTTTTETISELPIPEEPKKVVEPEKKP------- 8452
                   ||.|..:..:::  .||:.............||::.:.:.....|:..||.       
  Rat  1417 AMGGQRKEEGPTEDKKLLEACSSKTHELFKNIQDIQNQISKIGLKDPTAPAVKHRKKSLLRLDKD 1481

  Fly  8453 ----EEP----KKPAYAGLP-------------VDDSSNSW-----------------MDVLDEP 8479
                ||.    :|.| :.||             .:|::..|                 :::|.:.
  Rat  1482 LDGFEEEMVHIQKMA-SSLPQFKDGSEKVVIQQCEDTAALWENMKASVTESLEQCGSVLELLRQY 1545

  Fly  8480 MNFSDD------EEEPV---------PEPVKEETLVEEVVEEKPIVEVSVVDDSKSI-TTVTTTT 8528
            .|..::      :||.:         .:.:|::....|.|:|:....:.|||....| ..:....
  Rat  1546 QNIKNNLTALIQKEEGIISQQASYMGKDNLKKKKAEIETVKEEFSNHLEVVDKINQICKNLQYHL 1610

  Fly  8529 TTTETISELPIPEEPKKVVEPEKKPEEPKKPAYAGLPVDESSSSWMDVLDEPMNFSDDEEEPVPE 8593
            ...:|..:.|..:|...:|:                       .|:|:        :::.|...|
  Rat  1611 NKMKTFEDPPFEKEANAIVD-----------------------RWLDI--------NEKTEEYGE 1644

  Fly  8594 PLKEETVVEEVVEKKPIVEVSVVDDSKTITTVTTTTTTTETISELPIPEEPEKVEQAVVKVEEPK 8658
            .|.....   :.:|...::.::.:.:|.:...|.:...||        |:.|::::. :||.|.:
  Rat  1645 NLGRALA---LWDKLSNIKNNIDEWTKKVLGKTGSHELTE--------EDRERLKEE-LKVHEEQ 1697

  Fly  8659 KPAYAGLPVDASSSSWMDVLDEPMNFSDSEEEPVPESQTEVTPLAPFKDV------AVDKVQKPV 8717
            ...::....|..|            ...|.|:|:.....|.:.|:..||:      |.:..:...
  Rat  1698 TAEFSRRVADIQS------------LLQSNEKPLELQVMESSVLSKMKDIKAHVTGASNSSRPRG 1750

  Fly  8718 ETANISID-------SGNTEAEKTPLAP---------FEEIPDSPLDDAFICETSYWSATLKPGQ 8766
            .||.:..|       .|.||:....|:|         .|||....|....       |.|:...|
  Rat  1751 NTAELREDLDQAKTQMGMTESLLNALSPSDSLEIFTKLEEIQQQILQQKH-------SMTILENQ 1808

  Fly  8767 KPASTVETTETKQEESQPIKVTIPDDEGIDEVAVKSPTDQP---TTWSAIVQTE-TTVFPTPDVQ 8827
            ....|.|.:|.|::.:....:.......:.:.......:|.   ..|.:.::|. ...|..|:.:
  Rat  1809 IGCLTPELSELKKQYASVSNLFNTKKNALQDHFATFLNEQCKNFNDWFSNIKTNLKECFEPPETK 1873

  Fly  8828 KDNEKTPDWSTHVVSKTTDF----------QE------------PKPLKNVVDS---------EN 8861
            ...|:.       :.|.:||          |:            ||.....:||         ||
  Rat  1874 LSMEQK-------LQKLSDFLTLGGGNSKIQQVETVLQHVKMLLPKAHVKELDSWLRSQELELEN 1931

  Fly  8862 ITTT--------TTTY------------VTTTVTTHKDT-SIVENESPATSYVSTVVTSHKNELD 8905
            :.:.        |:::            ::..:|.|::. ..||.....|...|.|:|..:.:.:
  Rat  1932 MESVCQARAGELTSSFQQLLRLEDDCRSLSKWLTNHEENWKEVEASGERTDLFSQVLTRKREQFE 1996

  Fly  8906 LEPEPFELTKPDNLIENLN--REAFKVHPQYEFLQGQYQQLKVVNITKEPYLEEPKEDVPLVED- 8967
            ...:..:..|...|.|...  :|:..:..:|:.|..|.:::            |.:.::|..|| 
  Rat  1997 TVAQLTDSLKELGLTEGEETIKESTHLIDRYQTLLRQLREI------------EEESNLPAAEDQ 2049

  Fly  8968 ------YVIIEPEAIPEINSEILALNLYLDQTNILPKTRIDVDTISQLLTLQKSSDPIVEKETVQ 9026
                  :.:|  ..|.||...::|||....|..:..:    :..|.:::.|:           .:
  Rat  2050 SFNDLAHDVI--HWIKEIKESLMALNSSEGQMPLEER----IQKIKEIIALK-----------AE 2097

  Fly  9027 GETKSVEILVKKSIVESPI--EPIAD-------------------EPLVIETS---QSPPEPSKL 9067
            |:.|...::.:....|:|:  |.:.|                   |.||:|..   ||..:...:
  Rat  2098 GDAKIQTVMRRAEHCETPLGQETLGDLSKQWDSTLLLANAYLSHQEKLVLEGEKYLQSKEDLRLV 2162

  Fly  9068 LWNLSQDN---------------FLKLINHYKQTAGDAFALLPRTTTD----------------- 9100
            |..|.:..               .||:...:.|.|.|..:||....:.                 
  Rat  2163 LTELKKQQEAGFALQPGLPEKQAQLKIYKKFLQKAQDLTSLLEELKSQGNYLLECTKNPSFSEEP 2227

  Fly  9101 --------TTIAQETQDDKQKTDGIT------ETVVTTTTTTITDRVVEKTEPDASSLPIIPTAQ 9151
                    .::.|:.||..||.:|..      :..:.....|:.|  :.|   :..||......|
  Rat  2228 WLEVKHLHESLLQQLQDSVQKLEGHVQEHSSYQVCLADLNATLDD--ISK---EYFSLCDGSKNQ 2287

  Fly  9152 PLTAPTLGNLDQLRLNLYLD--------------DWQPASVDAHLADDLFDGLK--------RVD 9194
            .:....:..|.:|...|...              ....:||...:..|....||        |:.
  Rat  2288 IMVKERMQKLQELESRLCFQGSALKKASALAKSIKQNTSSVGQKIIKDDIKSLKYKQKDLENRIK 2352

  Fly  9195 VAGSEAE--LDKDKNQEQQPDGDAKKPDGVTGIPDKDDHDSDDDDDDDDDDDDEGGKPTVPEIRK 9257
            .|..|.|  |:.....:...:...|     ..:|.::...:.|                |||   
  Rat  2353 TAKQETENGLNSILKSKSSAEKHVK-----FSLPAEEMLATCD----------------VPE--- 2393

  Fly  9258 PNDDDDKPNDKDPGSGSSGN----------VTPTPEHDAQYGQNRSCSSEYRSTDLPGGV----- 9307
            |..:.....:...|..:|.|          ::...:...|..|:....:|.|:..|...:     
  Rat  2394 PTRESAAVGESQGGRETSTNSAVEMILSKQLSLNVQESMQNAQDEREVNELRNQPLELDIMLRNE 2458

  Fly  9308 GHWRDDSTYLALEAEQPQVKLESVPLAPTISGVESVLTETNTTSPAPAPDPVTAPETSPSTTTSS 9372
            ...|.:..|..|||.:...:|..          .|.|.:|...:..|           |:..:|.
  Rat  2459 QLERMEELYTHLEARRAATELLE----------HSQLNQTEEQAAVP-----------PTARSSG 2502

  Fly  9373 LNVANALIQL-----------------------ASATTHTL-----SAKANAAATATHAAAL--- 9406
            .::.:...:|                       |.|:.:|.     |.|..:..:||:...:   
  Rat  2503 CHLGSLQQELLTLKKIKEKQHGLLSGFQDQLVVAEASLNTFLTEVESFKIGSLDSATYLGKIKKF 2567

  Fly  9407 --------AATSALLPVATAVVDKLTTTTTAAAETP--------------------AATSDVAAV 9443
                    .:.|.|....|.:...||.......|:.                    ...::.:.:
  Rat  2568 LGSVEKQKGSLSKLRMEWTCLSSLLTAADRKLVESQLRQLELGWELVEHLAHRKCFQQATEHSEL 2632

  Fly  9444 NPYVARATPAATTVAEAATAAAAEIPPAATHTETTTTSSSSGEVVALPTENTGAVRRTTTTTTTV 9508
            ...:.||.....::.|........: .||...|.....:.:.|:..:..|.:|..|:.......:
  Rat  2633 THLLKRAQDLTVSLHEQQQCLTLSL-NAAEQAEVVDMVTPAAELQTIKYEFSGLKRQAELRMKRL 2696

  Fly  9509 ---TTTTTVETPSTTSNTTTTTTTTSSNELQEQRQK-DL-----------------ITQEL---- 9548
               ....|::...:..|.........:.|::.:.:| ||                 :|..:    
  Rat  2697 WGEKDKETLDDAISNLNKQLEALEPLNREVENRVKKCDLQNKVKETLSWVKNTLADLTAPIALLP 2761

  Fly  9549 DELLQSLSS---VEDGIANMNQSSLDGMLHGLKLIQSNLEVHERDAI-----ELKNQAKKLPTDP 9605
            |::|..:..   :.|||.. .|.:::.::..::.|..:|...|||.:     :|:||.:.|    
  Rat  2762 DDILSQIRKCKLIHDGILG-KQQAVELLVEEVRGIAPSLATSERDGLNTLLEDLQNQHQAL---- 2821

  Fly  9606 ATERLLNDT--VDRIDLLLRRTQQGITMIANA-------------MHGQKKRQQEID-------E 9648
                ||..|  ..:::|.|....:...:|..|             |..:...:.|::       .
  Rat  2822 ----LLKSTQRSQQLELKLEERSKLFAIIGKAHLTLEESETLMSPMRERASTEAELEPRHATLKA 2882

  Fly  9649 YQQHLLELEQWIIEVSAELASF-EPTSDSST------DEQV--LKSQVERSQQLLRT----LKDR 9700
            :||.|.::|.   .:||.|... ....|::.      |:|:  ||::..|:|:.|::    |:.:
  Rat  2883 FQQQLQDMES---SISAHLQELTNAYKDANVFERLFLDDQLKALKTRTNRTQRSLQSNCNELEHK 2944

  Fly  9701 QQSMEDLVEQTRQLQ------SHPDVSPLADTLMEQLQSIITILREQVTV---ATKRIFTIEKRI 9756
            .:|..:|.::|..||      .|....|....|.:..:..::..|:::..   :..::.|.|: :
  Rat  2945 IKSYRELHKKTALLQKEAESIQHGGRLPPHQELKQDAKEQLSHFRDKLAAIRGSISQVLTSEE-V 3008

  Fly  9757 VD----------LRKAKSEEAQRQRVL----------------------------------ADSL 9777
            .|          |.:.:::..:|:|.|                                  |:||
  Rat  3009 FDSIGLSWDSSLLERLQTQVCERERELEERVRQLDTWLIARDRYQALLSKVRAVDLQIKKGAESL 3073

  Fly  9778 IKPPTEAP---------------ASPEAHESI-------ESNENTIDSSSMPEEEI--KPTGVYV 9818
            .|.|:.:|               .|...|..|       |:.:::...|.||:.::  :......
  Rat  3074 QKTPSTSPENTLLKAQTLIQKIEKSKRLHGEIIRKLSNNEAFDDSFKESEMPQLKLSAEENSRLQ 3138

  Fly  9819 ETQTSLSLQQPPVQVVTTTTVEAQTSFKEPAVETAEV--ALQTQKERSPTENIMVTQTVHHGQET 9881
            |...::.|:..|.::       .:.:|::....:..|  .::::.|:....|:.| |.:.|.|||
  Rat  3139 EALQNMLLELQPKEM-------GEKAFQDKLENSLHVLKQIKSRLEQPLCVNLGV-QHIQHEQET 3195

  Fly  9882 IQI------------------------DTTRNKDVPDEPEDVQ---------IEAR-------YH 9906
            .:.                        :.:.|.|:..:..|::         |:.|       |.
  Rat  3196 WEAFGEQVEAEMCGLRAMSVTGEQREENASGNGDMEAKLRDIEGLHMELSKSIDLRTGVLNDAYE 3260

  Fly  9907 QRPKGD--VDRATELI--LKNVPQAFETTFVEPDETTTEVIVGPDGTKHIVLKKVTRTRQQVVQ- 9966
            ...:.|  |.||..:|  |:....:|......|.|:..:                .|.:|:.:| 
  Rat  3261 SATRYDELVTRAARIITTLEATLSSFRVDLHNPRESLEQ----------------ARLQQKELQL 3309

  Fly  9967 -----QQQISSIETISDSDGNIEVHSTGQINLENVHTTDTKADPEEGSVHTVITQQTRGAVVDST 10026
                 |....::..||..:...::|.|.|....|                            :|.
  Rat  3310 VVADLQGLTEALGAISSPEAKEQLHCTSQALATN----------------------------NSA 3346

  Fly 10027 QPEGVILQEFETEPTIETY-------EEVIA----------------PGSQAQ-LIPMQPGDVQT 10067
            ...|:..||.|.|..:|.|       ||:.:                |.|..: |..::...|.|
  Rat  3347 MKAGLQAQEAEEERCLENYKCYRKMKEEICSQLRKMEAELGQSIFPLPRSYKEALARLEQSKVLT 3411

  Fly 10068 QGTIRAVVQQVTRKVIRKTRKIIKRVVIIDGKEHITEE-------VVEEPEEVEITEEETA---P 10122
            ...:.      |::.:.|.|:.::|:     :...||.       |.....|..:...|.|   .
  Rat  3412 SNLLS------TKEDLVKLRQALRRL-----RRRCTENDATRMLGVASALWETWLGLLEAAREWQ 3465

  Fly 10123 HINVNIVRTVDGKVVSEEEFQRMMQEPGVLIEEVATDL-----QKPTAEPQQEVFDIESTQVTTT 10182
            ..|..:.|  :.|.:|||     ::...:::|::..||     .|.|| |.:|:     .|:..:
  Rat  3466 QWNGELKR--EWKFISEE-----IEREAIILEDLQEDLPEVSKAKDTA-PTEEL-----CQLLDS 3517

  Fly 10183 TRTTTATTQEQE-------QPEQQTQ--PTTTETTKEAPV--ELPAPQVDVEQPVVVATTSPVHV 10236
            .|....:.:||:       |..:..|  |..:|..:..|.  |:.:.|....:.:..|..:    
  Rat  3518 LRQHEESVEEQQLLLVLLLQRVRNIQNIPEGSEAEETIPAREEIRSMQERCNRLLQTAQKN---- 3578

  Fly 10237 PTADVVEPKDSSPTSTTAAVVDVEAVVEDINEIW---PLEHH-------------LKPTNIDFSQ 10285
              .:.::.:..:..:....:.||:.:.|.|:..:   |||.|             |:...:.|..
  Rat  3579 --KEAIQTEIQARHTLIKEIRDVKHLFEQISASFPNLPLEDHPERAEQFEELRSILQKGKLTFES 3641

  Fly 10286 HVEEL---------AAPAAVTAETE------------ASMPVEEIWPTSPETG------------ 10317
            .:|:|         ..||.|.::.|            .|..|.:..|:|...|            
  Rat  3642 IMEKLRIKYSEMYSIVPAEVESQAEECRRALEDADEKVSSEVSKSSPSSVMRGKIQRINNGLQCI 3706

  Fly 10318 --------------------------------NSLTLEQYEFEPQSPHEESTKSD-LVKPQETEP 10349
                                            |.|..|..:...|.|.:.....| |:.|.:...
  Rat  3707 EKMLQQKSRNIEEAHEIQKKIWDELDIWHSELNELDSEVQDLVEQDPGQSQEWMDNLMAPFQQHQ 3771

  Fly 10350 QVV--AETKPEGITTGSITITKTTTTITSSTEVPEET--LVQNVPA--DEQQPPANKIKTDIQSF 10408
            ||.  ||::...:...::.:.:.:..:.|:....|:|  |:.| ||  |..:..:::..| :|..
  Rat  3772 QVSQRAESRTSQLNKATVKMEEYSDLLKSTEAWIEKTSHLLAN-PACYDSSRTLSHRAST-LQMA 3834

  Fly 10409 LEAEQTLAAALKEQSSTPTGASVAEDVQT-----QPEEIV--LEERTVEISTIKTEENQQEPVIV 10466
            ||..:...:.|.         |:..|::.     :.::::  ::|.:.::||:     ||:  ||
  Rat  3835 LEDSEQKHSLLH---------SIFTDLEDLSIIFETDDLIQTIQELSEQVSTL-----QQQ--IV 3883

  Fly 10467 EEVKSLPVEPEPVEPELEEVAIAIVE-QTEEKPEEPVIEKQPASGPIDLRAATQLFISGEAAAST 10530
            |.:           |..::||..:|. ::|.|..|..:.|..|     :..:.::|       ..
  Rat  3884 EAL-----------PHAQQVADDVVAIESEVKSMEKKVAKIKA-----ILLSKEIF-------DF 3925

  Fly 10531 APQKTFQISAPSLEDNGAGVLKVVLGKESTNEEDTAAPTTGKVSMTIIETAAAPAADAKRRRKKK 10595
            .|::..:.....||:  ...:|..:.:..|.:.:...|.||...:.:.:..:....|.|......
  Rat  3926 PPEEHLKHGEVILEN--IHPMKKTIAEIMTYQVELRLPQTGTRPLPVFQRTSQLLQDVKLLENVT 3988

  Fly 10596 KRRDTKHEEELEQEQETEPEPVAAVKEPEVSSDVPVSPEDSPRDTVRHESIVEISPDSDLSSIEI 10660
            :.::...:..::|..|.: |.:..:|:...:|....|||.:.:|.|           :||.|:: 
  Rat  3989 QEQNELLKVVIKQTAECD-EEIDNLKQILANSSAEDSPERTSQDQV-----------ADLPSLQ- 4040

  Fly 10661 DTKVKIVEDAVVSSPSESPRTPMVELVIPTEVVELALVEDEEQQTTPRIPSP----TEKSEVEQD 10721
             .:|:.:|:.:::...:..     :|::..:...|.|.|..:|: .|....|    :|.:..|:|
  Rat  4041 -GEVERLEEQILNLNQKKE-----DLLVDLKAAVLNLHEHLKQE-RPGGERPSAGTSECTVAERD 4098

  Fly 10722 IKSVQ----TSPQHQPKLDETAVQTSLEVQPDNQENESQTLI----VEITETEAQTTPRSEEQSV 10778
            ....:    .|....|.:.|.|.::|::....::..|..:|:    .::...||.::..:..|..
  Rat  4099 ASERKLNRTNSMSFLPAVKEEAEESSVKSDDGHRRTELPSLLWKHSQDLEGDEASSSSATIVQDA 4163

  Fly 10779 AVEISTTEIQTDVSGQPAETVEISSQTTVTTTIEKELQTTPKDSPR--APEAGSSDVVESLVQDL 10841
            ...|||.:               ||...:........:..|:.|||  ..|.|.:..:|:.:.|.
  Rat  4164 GGRISTCD---------------SSMVHIIAPDSGSTEPGPEPSPRLSRTEEGDTPPIEAALLDF 4213

  Fly 10842 VKDMTTDLPVRTSEQSTVTETTTTTETHVQTTTPEPRE-----QTEVIKPETAHEETSTVELVQF 10901
            .:           ||..:       |..|:.:.|:|.:     :|:|.|.|...::.|.....:.
  Rat  4214 PR-----------EQEAL-------EATVERSRPQPADVLRVCKTQVAKLELWLQQASVAFEPET 4260

  Fly 10902 ADGEMQTTPPGDQQPASLDDSSLTATSISVSEPYELEVKTTVAIPADSDTSVAEPTVYEYTQTMQ 10966
            .|.:||          .:.:..|......::   |:|.|....:....|..:.:      ..|.|
  Rat  4261 LDTDMQ----------QVVEEELAGCQAMLT---EIEHKVASLLETCKDQGLGD------CGTTQ 4306

  Fly 10967 LPKQEKKSKKDKKKKQK-NVPEVEQQL----PEDQQISVTVE-------IAPELLSESGIVVSTN 11019
               ||.::...|.|..| |:.:|:..|    .||||.:...:       :.|...||...|::..
  Rat  4307 ---QEAEALSWKLKTVKCNLEKVQMMLQEKYSEDQQPTTLKKPSEPHDVLLPASFSELESVITER 4368

  Fly 11020 QQI---EDVPHVTPVVDTPIESEEVETPKAQRVQLQITKTTV--YDEYPDLPVHITEQNKVLIAS 11079
            .|.   :|||....:...|:|.:::    .:..:|...||.:  |.|..|             |:
  Rat  4369 PQFSRQKDVPQPQILELKPLEQKDL----IKFTELNAKKTWLQCYPEDKD-------------AN 4416

  Fly 11080 QQSKRSGAGPTSSAVTIEEVGSPTEELVVPITPGPDNLSGEPHNIWFSATTSVDKTP----IELS 11140
            :||..|...|:..     ...|.|.:..:|    |:..||:.........||....|    :|..
  Rat  4417 RQSASSSEVPSPG-----NSDSETSDSALP----PEGQSGDKWQYLHHELTSRPNPPAPQLVEPQ 4472

  Fly 11141 QALIMS---------------ESLQHYPGQ-QKLTQEPILISTKEAIGDRI-----KQLKQASPQ 11184
            .|:.:|               :.||.|..| ::|.||...|.|:.::.:..     |:|.:....
  Rat  4473 VAITLSTLPSVSVYNFRCPTADELQAYTTQLEELRQEANTIQTQGSMTEETYISLDKRLFELFLS 4537

  Fly 11185 QATPLSNVLHLATLSEQIKELPTEQRI------LEVNEGLKDLDVAI--KNGDKTVIQTTVITVI 11241
            .:..|.:|..|......::|..:.|::      ||    ||.|.:|:  |.||           :
  Rat  4538 LSRCLGSVEELLQRPGLLQEDASAQQVFFQKLALE----LKKLCLALGDKKGD-----------L 4587

  Fly 11242 EKVSTWLETIEYRVYLIRQNSNEGPSEEKLDNYNQLNDELSTIKQNVVQLERQLSKAEPEPQLLQ 11306
            .|..||                  |.:..:    .|.:....:|   |.||...|||....    
  Rat  4588 LKAVTW------------------PGKGAM----LLPECFDALK---VSLESTQSKAAWRS---- 4623

  Fly 11307 CVDSLKEHVDAVEQVTQQNQVQDSNDLDKWHNFEVLLYN--VSSVLADLQQSYDLLINQEYPLSA 11369
              .|||..:|  ..::.||:|:             .|||  |...:| ||||.:.:..|......
  Rat  4624 --SSLKAGLD--HSLSYQNEVK-------------RLYNQLVKKKMA-LQQSLNEISGQSIGKQL 4670

  Fly 11370 KLAQLDELEQQHEAAQQQLAHLCQNARAFQRDFPGKKMPQDVHNAFETSKNIANNIQAERERVLQ 11434
            :.|.:...|.|:  :::|:|.|.....  :..|| ..:.|||:...:...::...::|   |.|:
  Rat  4671 QKADVHTAELQN--SERQVAKLRNEGE--RLSFP-HGLLQDVYKLEDVLDSMWGLLRA---RYLE 4727

  Fly 11435 LQS--LAEEYEQTLKE--FTKITVLADKLVESPI-VSSSLEQLNNEVQKQRKFFVNLSHCRAMLE 11494
            |.|  |:|..:..|.:  ...:::..:||...|: .:.|...|..|:|..:.||..|.....:::
  Rat  4728 LSSPFLSESQQDALLQGMAELVSIGKEKLAADPLHQAKSRAALQAELQDHKGFFQKLVADMLLIQ 4792

  Fly 11495 SLEENIDSETREKHSELHKELYNRATSLLDKASERSSKLVQAASRWTVLEKGMRDELQWLQVAQQ 11559
            :....:...:.:|......|......:|.::|..|.::|.....:|...:.......:.|:|...
  Rat  4793 TYSATMFPPSLQKGEGFGAEQVAEVRALEEEACLRGAQLQSLLQKWEEFDDNCASLEKDLEVLIS 4857

  Fly 11560 RVPDLSAV--TSADYDQYTTLYQSLSNDISHHYVKMTQLSGIANKLQLLVQAPNLVEETNEALIV 11622
            .:|.||.|  |.....:..:.||.:..:|...:.::.|......:|...|..|.     .||.|.
  Rat  4858 SLPSLSLVEETEERLLERISFYQQIKRNIDAKHARLCQTLNEGRQLAASVSCPE-----PEAQIA 4917

  Fly 11623 LLK-----LREEVALYLHRLLVFKEIWVQYEQQTDKLEAFVREAEQELRNIQIPSQPTHQPIEHM 11682
            .|:     |.:.:...||||....:..:.|.:.:|:|..::..::|.|...:..|....|.:..:
  Rat  4918 KLEEQWLSLNKRIDQELHRLQTLLKHLLSYSRDSDELTRWLESSQQTLNYWKEQSLNVSQDLNTI 4982

  Fly 11683 R----QFWEIKARFELHNNVRTDTGLSFEKSLQVIPLADEMLQRQFHAQLEDRWQAVAQAIELIQ 11743
            |    :|::.....:..:::::.. :|....|..:..||....|...||.|.:|..:...:..||
  Rat  4983 RSNIDRFFKFSKEVDEKSSLKSAV-MSTGNQLLHLKEADTATLRASLAQFEQKWTVLITQLPDIQ 5046

  Fly 11744 HNIVECLSSEDVPADEKL------------KMVERELQEIYLTMTSMKGVIKNEEELCLYIERVQ 11796
            ..:.: |..|.:|:.|.:            ::|..:.:....:::.:|.:::..:|..:.::..|
  Rat  5047 EKLHQ-LQMEKLPSREAISEMISWMNTVEPQVVGEDAELPPSSVSLVKRLLQKLKEFRMEMDYKQ 5110

  Fly 11797 VLRTRVGFIGNELGRIGLQEPAIEPEKVGELFSLSHKISTQIAEELEGAS--------VLRDQLQ 11853
            .:   |.|:...|  :.|....:|.::...         |:.||.|...:        .|..::|
  Rat  5111 WI---VDFVNQSL--LQLSTCDVESKRYER---------TEFAEHLGEMNRQWQRVHGTLNRKIQ 5161

  Fly 11854 AIQEGISNQRKHQAKISVILDECEAAER--------QGADVLEKAVADCQAAGEELVISWQEIMR 11910
            .:::.:.:..:::.||..:....||.|:        :.|..:||.:.|||....:|.:..:.:..
  Rat  5162 YLEQLLESITENENKIQNVNSWLEAQEKRLKTLQKPESAVSMEKLLLDCQDVENQLAVKSKALDE 5226

  Fly 11911 IRQMLHTL-----PMRLKMSVSPVKLERDISQLQDDHAFLESKCTNIMAILRSRLAVWLRYERQL 11970
            :||...|:     |:...|:       ..|::|......:.|:...:.|.:::.|..|...::..
  Rat  5227 LRQSSLTMDGGDRPLLEDMA-------SGINELCQKRNSVTSQVHQLRASVQTVLQEWKACDKLY 5284

  Fly 11971 ELVHGSVQETDFMMELIRVHGQ---VDYERLRKATERLEGLAGDLHNREQLIDELKGAAKPLIES 12032
            :..|....:..:.||    |.:   :..:.|....:.||.|..:..|.|:..::|......|.:|
  Rat  5285 DEAHMKTAQLTYSME----HSKPAVLSLQALDCQVQNLEALQDEAENGERSWEKLLEVIGRLKDS 5345

  Fly 12033 CDVQIVEQIESAVQEAVVAW----NDTSENLQQLRTRYQRAVELWDKYRNASAAVKNSIDQQ--- 12090
            |. .|...||...|:|...|    .|.::.||:.|.:.|    ||....||.......:.||   
  Rat  5346 CP-SIAGIIEEKYQDAHARWTQVNRDLADQLQEARAQLQ----LWKAPHNAHTEAAAWLRQQEAK 5405

  Fly 12091 ---------------------MDAVKSLEQPLDALQHAKVCQDNLTTQNDRILE---------LR 12125
                                 :|.:|.|.:.|...:.|.:....|:.|..:..|         .|
  Rat  5406 FQQLANTNMSGNNLADILPRALDDIKGLHRDLQKTKEAFLENSTLSDQLPQPAERSTPGLHSGQR 5470

  Fly 12126 DIVAKIAADVGLDASALMQGELDALGQRLAECKDAITTLANVAETQDKERKELDK----EVTLAK 12186
            ..:..:|.     ...::..:|:.....||:.||....||:..:....|.:.|:|    |..:..
  Rat  5471 HSLQTVAC-----LEKMLLAKLNEFEIVLAQFKDFADRLAHSKDLIMHEEENLNKLHHEEKEVPD 5530

  Fly 12187 AYFNNVQQDISREAPQNPKESEEQLAALRAHLQTLARTEEQLRQLKERHQNSEVAPSVASSDDDG 12251
            .:.|:|.. ::.::|...:.:||   :||..|..:  |.:.|:.:..:                 
  Rat  5531 LFLNHVLA-LTAQSPDIERLNEE---SLRLPLSDI--TMKTLQNVNRQ----------------- 5572

  Fly 12252 ILEVLALWQKIFQDTFQEYHRLSTRLARSQNSSEALRLWRQYLQHVQSFLSCAIPEDYSSLREQQ 12316
                   |.:........|.:|... ..::........|.|.|:.:|..|:..:.....:|.|||
  Rat  5573 -------WIRATATALDHYSKLQGN-GLNEKFLHYCEKWIQVLEKIQESLTEDVAHSLPALLEQQ 5629

  Fly 12317 QL-------CAIHQNL---LISQQSVLSET-------------PLESELSEQYKALTNLHNETLS 12358
            :.       .:|:|.:   .::|...|.:|             | .||...::..|:....:...
  Rat  5630 KTYEILEAEVSINQTVADAYVAQSLQLLDTAEVEKRNLSPWFFP-RSEFVSEFSKLSEQWQKAAQ 5693

  Fly 12359 RIMQRNGELERRVSGWNAYRQQLAALLDWL----------RQREAERNALQLRYIH-LK-RVPHL 12411
            .:.||..::.|.|:.|..:...:..||.:|          ::::........|.|| || :..|:
  Rat  5694 GVRQRKCDIGRLVTQWRFFTTSVEDLLRFLTDTGHLLSAVKEQDCYSLCQTRRLIHELKSKEIHV 5758

  Fly 12412 KHRLDAMIQQLDQGEQQSKALQEQQQELARHCDDALATAMRMEQASIGQRISNLRAALKTWQGFL 12476
            :.........|:.||:.......:.:|........|....:..:.|:|:.||.|::..:||    
  Rat  5759 QRWRTTYELALETGERLRDTPNPETREFIDGQAGRLQDTWKDTELSLGETISRLQSTAETW---- 5819

  Fly 12477 QRVTQLSESYEQRVNQLQQEFGAAQKLLDANSESLPTQPAAIEQLLGSLRAQRVQLGAQVSALES 12541
                   :..|:::..|::..   |.|...:::.||....|:::....::.....|......|:.
  Rat  5820 -------DQCEKKIKMLKKRL---QGLKAQSTDPLPELHEALQEERELIKEVETSLANWTHNLKE 5874

  Fly 12542 LTVTQEELKECISPHDMKTIRQRNWLLWQQHADLDYQLANLINSIEERLSLLSNYQIRYDRISQW 12606
            |...:.:|.:.|...||..::::..||.:|..||..::|.....||:||:....:..:...:..|
  Rat  5875 LQTMKADLSQHILAEDMTVLKEQIELLHRQWEDLCLRVAVRKQEIEDRLNSWIMFNEKNKELCAW 5939

  Fly 12607 LQRLEQRVEKDADVTAMTNPEQAAKQLEQQVNSELQLRDKEREWLLSTSRELLTLYSEPEVRSQV 12671
            |.::|.:|.:.|||:.    |:..::|::....|:.|..:.:..|.....:|:...|:.:. :::
  Rat  5940 LVQMENKVLQTADVSI----EEMIEKLQKDCMEEISLFTENKLQLRQMGEQLMKASSKAKA-AEM 5999

  Fly 12672 QQQSDSLIDRWQRLKYLAKQKATKIGELKMTLLRLEERIALIRAWLFEVESQLDKPLNFESYTPN 12736
            :::...:.||||.|..:...:..|:.|....:.:|::.::.:|.||..:||:|.||:.::.....
  Rat  6000 EEKLSKINDRWQHLFDVIGSRVKKLKETFAFIQQLDKNMSNLRTWLARIESELSKPVVYDVCDNQ 6064

  Fly 12737 VIEAKLKEHEQIQRSIEHHSSNVGEVLNLVEMLLNDADSWRTQVNTSGLAASAQNLEQRWKNVCS 12801
            .|:.:|.|.:.:||.||.||:.|..|.|:.::||:|:|:...:.....:..:.::|::||:|:|:
  Rat  6065 EIQKRLAEQQDLQRDIEQHSAGVESVFNICDVLLHDSDACANETECDSIQQTTRSLDRRWRNICA 6129

  Fly 12802 QSAERKARILTIWNLLQQLIKLTAEHKNWLGKQESQIAGFERDQKSHSKHKLEERQMELRAKLEE 12866
            .|.||:.:|...|.|.|:.:...:..::||...|...|.....:..::..|.|.::.|  |...:
  Rat  6130 MSMERRMKIEETWRLWQKFLDDYSRFEDWLKSAERTAACPNSSEVLYTNAKEELKRFE--AFQRQ 6192

  Fly 12867 LESQSVNLRQLEQIYAKLAMSAGVEPENIQKLTLPTKVMV----SMWRQLTPRCHALL------- 12920
            :..:...|..:.:.|.:||.      ||........|.||    ..|..|..|..|:|       
  Rat  6193 IHERLTQLELINKQYRRLAR------ENRTDTASKLKQMVHEGNQRWDNLQKRVTAILRRLRYFT 6251

  Fly 12921 ---------------------------------DAIDKDAKLMREFNNAQLEATNSLNAIQKALE 12952
                                             ||.||    ||:.|..|.|.|.:.|.|    :
  Rat  6252 NQREEFEGTRESILVWLTEMDLQLTNVEHFSESDAEDK----MRQLNGFQQEITLNTNKI----D 6308

  Fly 12953 QLPSAENQQTSKAEP-KAVL--QRLESL---------------------------EKKLQDAQQH 12987
            ||.....|...|:|| .|||  ..||.|                           ||:..:.:..
  Rat  6309 QLIVFGEQLIQKSEPLDAVLIEDELEELHRYCQEVFGRVSRFHRRLTSHTPGLDDEKEASENETD 6373

  Fly 12988 VQQADNLAQEA--KTRTKQQPQLKQ-LLELV--------SAYTTLWQTVQTRIVTLKTTWLTRAA 13041
            ::....:..::  |.|..::|...| |..||        |...|     ...:.::...|.....
  Rat  6374 IEDPREIPADSWRKRRESEEPASSQSLCHLVPPALGHERSGCET-----PVSVDSIPLEWDHTGD 6433

  Fly 13042 QAAASLPVSE------AANAAVQVNTLSQRKLRQ-AQQMQRETSITAKDAYIMELQTAITECQNN 13099
            ...:|....|      :|.:.|::....:..|:. .:.::..:..:..:.:...:..:.:..:::
  Rat  6434 VGGSSSHEDEEEGPFYSALSDVEIPENPEAYLKMTTKSLKASSGKSISEGHPWHVPDSPSHSKHH 6498

  Fly 13100 LDELQRTVVDKTRKPGPQKIAKLLGNAQSSTELVKHLSHLLLTECKADDQAAEVDTVAELTLRFD 13164
            ...:..   |:|..|.|         |.:||........|||.:...|.:....|...:...:..
  Rat  6499 YKHMGG---DRTVAPVP---------ADASTPYKPAYVKLLLHQGTDDSKEGSKDGTQQGDEQLA 6551

  Fly 13165 TLQSQ-------WKARQQHDQNASEVGRLTCPLCTQRNWQQIDNDLWRLEQWLQ--FAESTQKAQ 13220
            ||..|       |:..|..:.:    |:|.....|    ||:::|:..:..||:  .||......
  Rat  6552 TLTGQQPGAFDRWELIQAQELH----GKLRLKQTT----QQLNSDIGSIASWLEKTGAELEALKS 6608

  Fly 13221 SAPPSNIELLEDVTQDHREFLLDLESHKSIISSLNVVGDHLATHTLDTEKARQLRSRLEADNERW 13285
            :.|||||:.:....:..:|.|...|::|:::.|:||  .|.......:.::.:||:||...:..|
  Rat  6609 AEPPSNIQEMALRVKRLQEILKAFETYKALMVSVNV--SHKEYLPSQSPESTELRNRLHQLSLSW 6671

  Fly 13286 NNVCINATKWQGLLQTALMGNSEFHQTIGELVEWLQRTEQNIKASEPVDLTEERSVLETKFKKFK 13350
            :.|......|:|.|:.:||...:|||...:|:.||...|...:.:.......::.||....|:..
  Rat  6672 DKVQGVMDSWRGDLRQSLMQCQDFHQLSQDLLLWLASAESRRQKAHITSPEADQHVLLECQKELM 6736

  Fly 13351 DLRAELERCEPRVVSLQDAADQLLRSVEGSE----QQSQHTYERTLSRLTDLRLRLQSLRRLSGI 13411
            .|..||...:|:|.|||:.:..||....|.:    ::..|..|:.|.:|.:  ...|.|..|.| 
  Rat  6737 KLEKELIDRQPQVSSLQEISSSLLVKGHGEDYIEAEEKVHVIEKKLKQLRE--QVAQDLMSLQG- 6798

  Fly 13412 YIVKLGAVLGYEGDNLGVPLHMLSSELLDN-TTLSTSSMQAAAPNTENANNTDGGDAVDGDVINT 13475
                          :|.....:.|.:.:|: ..|:|:..   ....|....||...    ..:::
  Rat  6799 --------------SLNPDASLTSFDDVDSGERLATAKF---GEEEEKEEETDSRT----PHLDS 6842

  Fly 13476 TVLARGAR-FLGRVARASLPIQALMLLLLGVATLVPHGE-DYTCMFSNTFARSLEPMLSYPHGPP 13538
            ..:::..| ||.||.||:||:|.|:||||.:|.|:|..| ||:|..:|.||||..|||.|.:|||
  Rat  6843 PGISQPRRSFLSRVIRAALPLQLLLLLLLLLACLLPASEDDYSCTQANNFARSFYPMLRYTNGPP 6907

  Fly 13539 PT 13540
            ||
  Rat  6908 PT 6909

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Msp300NP_001188695.1 SPEC 17..220 CDD:238103
SPEC 9546..9732 CDD:295325 48/238 (20%)
sbcc 11187..12008 CDD:129705 171/882 (19%)
SMC_prok_B 11614..12442 CDD:274008 172/948 (18%)
SPEC 11994..12156 CDD:295325 39/198 (20%)
SPEC 12374..12564 CDD:295325 36/201 (18%)
Lipase_chap 12376..12529 CDD:281297 28/164 (17%)
SPEC 12703..12923 CDD:238103 60/263 (23%)
SPEC 12816..13032 CDD:295325 59/300 (20%)
SPEC 13196..13374 CDD:238103 49/179 (27%)
KASH 13484..13540 CDD:287506 33/56 (59%)
Syne2XP_038969186.1 CH_SYNE2_rpt1 28..138 CDD:409091
CH_SYNE2_rpt2 180..288 CDD:409093 18/108 (17%)
PRK03918 <1429..2015 CDD:235175 103/655 (16%)
SPEC 1949..2129 CDD:413338 35/208 (17%)
SMC_prok_B 2162..3001 CDD:274008 141/901 (16%)
Smc 2685..>3388 CDD:224117 125/767 (16%)
Smc <3457..3750 CDD:224117 52/311 (17%)
SMC_prok_B <3710..4053 CDD:274008 70/399 (18%)
SPEC 4943..5167 CDD:238103 39/239 (16%)
SPEC 5061..5288 CDD:238103 39/247 (16%)
Smc 5131..6031 CDD:224117 183/980 (19%)
SPEC 5926..6140 CDD:238103 55/218 (25%)
SPEC 6144..6354 CDD:238103 48/225 (21%)
SPEC 6583..6791 CDD:238103 56/211 (27%)
KASH <6880..6909 CDD:402255 16/28 (57%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D46at33208
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
11.010

Return to query results.
Submit another query.