DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cana and cmet

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001027247.1 Gene:cana / 3771934 FlyBaseID:FBgn0040233 Length:1931 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_524993.3 Gene:cmet / 53561 FlyBaseID:FBgn0040232 Length:2189 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:2146 Identity:941/2146 - (43%)
Similarity:1277/2146 - (59%) Gaps:400/2146 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSTKNASSIQVCIKVRPCEPGLTSLWQVKEGRSIQLADSHAEPYVFDYVFDEGASNQEVFDRMAK 65
            ||.|||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly     1 MSAKNASSIQVCIKVRPCEPGLTSLWQVKERRSIHLADSHAEPYVFDYVFDEGASNQEVFDRMAK 65

  Fly    66 HIVHACMQGSNGTIFAYGQTSSGKTYTMMGDEQNPGVMVLAAKEIFQQISSETERDFLLRVGYIE 130
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly    66 HIVHACMQGFNGTIFAYGQTSSGKTYTMMGDEQNPGVMVLAAKEIFQQISSETERDFLLRVGYIE 130

  Fly   131 IYNEKIYDLLNKKNQDLKIHESGNGIVNVNCKESIVTSEDDLLRQLYMGNKERVVGETNMNERSS 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|.|:|||.||||.|.:|||||.|||||||||||
  Fly   131 IYNEKIYDLLNKKNQDLKIHESGNGIVNVNCEECIITSEVDLLRLLCLGNKERTVGETNMNERSS 195

  Fly   196 RSHAIFRIIIESRKSDHSDNDTVKQSVLSLVDLAGSEQVD----------PADHAS-SLMIFRNL 249
            ||||||:||||||||||||:|.|.||||:||||||||:.|          ...|.: ||:...|:
  Fly   196 RSHAIFKIIIESRKSDHSDDDAVIQSVLNLVDLAGSERADQTGARGARLKEGGHINKSLLFLSNV 260

  Fly   250 VKSLSESVDSKPNSFRDSKLPRIMLPSLGGNVLTSIICTITPSFVEESSSTISFGTCAKKIRCKP 314
            :|||||:.|::..::|||||.||:..|||||..|||||||.||.:|||.||:||.|.|||||.||
  Fly   261 IKSLSENADNRFTNYRDSKLTRILQASLGGNAFTSIICTIKPSIMEESQSTLSFATRAKKIRIKP 325

  Fly   315 QVCKIDSETTMMRQLDRGISMLKDKLAKKKIKNESQLVLQELEGRIKRDMLKIVSSASLDDYRLQ 379
            ||.::.|:.|||::|:|.|.:||||||:::.|||:|..::.||.:||.||.||:...||.|...|
  Fly   326 QVNEMVSDATMMKRLEREIKVLKDKLAEEERKNENQQKVEHLERQIKHDMHKIICGHSLSDKGQQ 390

  Fly   380 KRRRTWTLTASGSEGDAPVLALPEPEESRLPRPSKLTNLPKPLF-------QRRGIAPKA----- 432
            ||||||..|||||..:   ||.....|.|:.:..|:::||||:|       :|....||.     
  Fly   391 KRRRTWCPTASGSHLE---LAETGTTEDRIDQFPKVSHLPKPVFFHTSNAGKRWDNIPKTINILG 452

  Fly   433 -----------------------------------------------KGICKTLK-EKRLQTDNM 449
                                                           ||...|.| :|.:|...|
  Fly   453 SLDIGTESNSISEEFLPAECIDFGSPRPDVLKPMLTIRQLPDLPLTPKGPLTTDKIKKEIQDLQM 517

  Fly   450 DT------------MPGRAKQLGRETASRIPSVMMSKKYQESV---PNCDAPQTEISALTASNQV 499
            .|            :.|..::|...||.|      ....|||:   ...||.:.|:::|.|.|:.
  Fly   518 FTSLEKHFEVECEEVQGLKEKLAEVTAQR------DNLEQESLAEKERYDALEKEVTSLRADNEA 576

  Fly   500 AKETIEKYEEQVKRLKETIERLEMENGKAVNLGEQFETHKAKSKQMEEELLSSISEKDSTIVSLQ 564
            |...|.:.||::..||:|:..:|:||..||.|..:||.||..||...::|||::.||:|||.|||
  Fly   577 ANSKISELEEKLSTLKQTMRIMEVENQVAVGLEFEFEAHKKSSKLRVDDLLSALLEKESTIESLQ 641

  Fly   565 QSLEELSRDVLRNSKEDQMRSMCPELES-SCERICNKCLELERLLPLASASGLDSV--ACQFDQL 626
            :||:.|:|||||||||..|.|:.||.|. :.:.|||||.|||:|:     :.|:|.  :|:.|||
  Fly   642 KSLDNLTRDVLRNSKEGHMLSIAPEQEDIAGDSICNKCEELEKLI-----ADLESKKNSCECDQL 701

  Fly   627 RSEIAATRMKLESMLSTFSHASCEVSQKTTDCKRLSEQISTAHDDFGQLQEKYNNLKHKWSSQKL 691
            |.||.:.|.||||:.|.|:.||.|:.||.|||:|||:::||:.:.||||||:|:.|..:|.:|:.
  Fly   702 RLEIVSVRDKLESVESAFNLASSEIIQKATDCERLSKELSTSQNAFGQLQERYDALDQQWQAQQA 766

  Fly   692 AIDTMQVDYNTIQQKYLQLQDEYRHLELR----SDEQCQQLQDENSKLQAEIGTLKERVEEIHSE 752
            .|.|:...:..:|:||.:||:||..||.|    |..:.|:||::|:|.||:|.:|.||:||..:.
  Fly   767 GITTLHEKHEHVQEKYQKLQEEYEQLESRARSASSAEFQRLQNDNTKFQADIASLNERLEEAQNM 831

  Fly   753 LLEVPNPDTHPEDMELQNQELKKRLSKLQWEFDEIQLNYECLSNELMSTIQECDALREEHKQRTT 817
            |.||.|.::..|.:.:||.||..::.:|:..|:|:|..|:||||:||.::||.||||||.|||.|
  Fly   832 LTEVQNSESTVEKLRIQNHELTAKIKELETNFEEMQREYDCLSNQLMESVQENDALREEIKQRPT 896

  Fly   818 NSDLESMKSSGVGTECSDPENELDTDLLQQFTKLSKSIQQIELTDYSGGRRLFIYNHAEQDQSVP 882
            :...|||:|||:.::..  |.:.|.:||.||.:||:|:|||||..:||..|||..|..:.|||.|
  Fly   897 SHVEESMRSSGISSDFD--EQKQDINLLHQFVQLSESVQQIELQHHSGISRLFRANQMKLDQSEP 959

  Fly   883 SLKLCLEPAKYLEGDGKQHDASDSVFLKGFLKCQRFQIVKINQEQNLVKEEDRMRDIIFQLKQEV 947
            .||||||.|:|:|.|.:|.||::.:.||||||..||||.:::||...:.||.|:.|||.||:||:
  Fly   960 GLKLCLESAEYIEEDNRQSDATEPICLKGFLKRHRFQIKRLSQEHVDMGEEKRLLDIISQLEQEI 1024

  Fly   948 DGKKNLIEEEKEVINNLRAQITSL------------------NQIETIKNQNAKTKILCEELQTK 994
            :.|..|:|..:..||.:|.|:|:|                  .|||:::.|||:..::.||||.:
  Fly  1025 EEKSALMEATEATINEMREQMTNLESALLEKSVIINKVEDYQRQIESLEKQNAEMTMVYEELQDR 1089

  Fly   995 ------------------DTV---QTANKQESQEVLTLKTSLAHLKSKVCELQKKLEK-----QS 1033
                              ||:   .|:..:..|||.|||||:..|:|:|.:|:.:||.     |.
  Fly  1090 VTRESSMSESLLRVPPDEDTLPGCPTSPSRREQEVATLKTSITELQSQVSDLKAELENHLRQIQL 1154

  Fly  1034 EDEKISELQSDIGEISECCLSMELKLA----------DIVNWQAEELRP----LDQLQESGVEL- 1083
            :|..|:.||:|..|:||.|||||::||          ::::.||::|..    :||||:...:| 
  Fly  1155 KDGNIARLQTDFEEMSERCLSMEVRLAELDEDTKQKQELLDRQAQKLSDDLCLIDQLQKKNAQLV 1219

  Fly  1084 -QHHSTTAEESLNVEKPIQEQTERTLTTEYERRIEQLEESLQRAQEELSILEKRKTDENKSLQLE 1147
             |:|..|...||...||.|    ..|:::|:.:||:|.:.|..|::||..:.:.|.||..:|::|
  Fly  1220 EQYHKATESLSLADAKPDQ----ILLSSQYDSQIEKLNQLLNAAKDELHDVRRIKDDEISALRME 1280

  Fly  1148 YMAKIETSENENRSKFRAYCLDLKETQKRYE-------EQLQQTNEKLASVTTQCQVHLDVIKRS 1205
            ::.:|||:|.||::||.|   :|:||:.|||       |:|.|..|.|:|||.:||..|:.:|.:
  Fly  1281 FLLQIETNEKENQAKFYA---ELQETKDRYESNVAELKEKLLQVEETLSSVTVRCQAELEALKSA 1342

  Fly  1206 LQEKITQAEKERNELAVRHKAELEKIRETLKEK-----------ESSYK-----------EKLRQ 1248
            .:|.|:||.:|||.|.|:|:||:|.||||||.|           |.:::           |:|.|
  Fly  1343 HKENISQAVEERNNLIVQHQAEMETIRETLKNKLAEASTQQSKMEDAFRAEINEVRATLMEQLNQ 1407

  Fly  1249 AEEERDKEISRLE--------------VMRNTIAELHKTNSDREVELEGVKMEKCQLKKLYDKSM 1299
            .:|:|||..|:||              ||.:|||||.||.:::::.:..:..:..:|:|...|:.
  Fly  1408 TKEDRDKGASKLEEVKKTLEQMINGGRVMSDTIAELEKTKAEQDLAVNKLTKDNIELEKQCSKTQ 1472

  Fly  1300 LELEQLQCTADQ---------KSSDLLPGSSNENIDDLQKKCDQYVQDLELLRGEKAELLSEIQK 1355
            .:|:....|.||         |..:|:..||.:.|.:|::||||.|.:|:..|.||..|.|||||
  Fly  1473 EQLQMESLTRDQISFEIEAHIKKLELIVASSKKRIIELEEKCDQQVLELDKCRLEKLSLESEIQK 1537

  Fly  1356 INGQHSNTIKKLEEIEAEMITLTTQKELERCEIAEKLETFKSKEADIKEALHCAQLRLHAYDKLV 1420
            .|.:||.|::||:|::|||..|:.:.|.|:|:...|||||..|..|::|.|..||.::..||.||
  Fly  1538 ANSEHSCTMEKLQELQAEMKVLSNRNEKEKCDFETKLETFTFKITDLEEVLKEAQHKVILYDDLV 1602

  Fly  1421 CEYERLKGCLSDSNKLSENLQKKVERLHAEQLALQEGISGRDSEIKQLRSELKDAIDENKTVREA 1485
            .::||||.||:::|:||.||||||..||.|.:..|:|||.||.||.:||.|||.|:|...|....
  Fly  1603 SQHERLKICLAEANELSSNLQKKVMSLHTELIDSQKGISSRDVEINELREELKAAMDAKATASAE 1667

  Fly  1486 KVGLENSLKAVQENMSAQEGQFKQKIADIKGSVDELQIKLKSLQEVRDHLESRNEELKRKLKDAQ 1550
            ::.|...||.|:|.|:.|..:|.::.|::|||::||.:||.|:||.:|.|||.|||||.:|:::|
  Fly  1668 QMTLVTQLKDVEERMANQAEKFTREAANLKGSINELLLKLNSMQETKDMLESGNEELKEQLRNSQ 1732

  Fly  1551 ELQNMVDKERKLNSSLREDFDKLEQTKLDLEEQLRAKKVEIDRRSKEL-----------GEVTKD 1604
            .|:||:|:|.|:..||:|...|||..|..||:|||..|.||.:|..||           ||:||.
  Fly  1733 NLRNMLDEESKMCISLKEKLVKLEDAKTSLEQQLRDNKSEIYQRHTELTKEVELGRNRIGELTKK 1797

  Fly  1605 CENIRSDLEAQTNDFLKERETLNLTISDLRLHNEQLLETSKNYLSDITAANNLNLEMKKNLHDLT 1669
            ||.:.||||  .:|.::         .||:...|||.:|.:|           ||..::.:.::|
  Fly  1798 CEELCSDLE--NSDQIR---------LDLQETKEQLKKTLEN-----------NLGWQQKVDEVT 1840

  Fly  1670 KECKSLRSDLQSKEEYFQTQKQLLDETISNLKEENRKMEEKLSSGNKALKEDCEKLRSTLESKEL 1734
            :||:.||.|:||||                                                   
  Fly  1841 RECEKLRFDMQSKE--------------------------------------------------- 1854

  Fly  1735 ILQQNKQELEERLTVINEKNGKNALLDAQLKSNETAFTSLRKAWIKQSLAIEAANKRSLEMEQKV 1799
                                                                      ::.|.||
  Fly  1855 ----------------------------------------------------------VQNESKV 1861

  Fly  1800 DKRTREYEELRSTLKTREINFRSEKERMDGTISSLLEDKRNLEEKLCTVTELLAKLKRELPALHT 1864
            .:...|.||||||||::|.:|:||||.||.|||||||||||||||||:..:::|||:.|:.||. 
  Fly  1862 QELISECEELRSTLKSKEASFQSEKESMDRTISSLLEDKRNLEEKLCSANDIVAKLETEIAALR- 1925

  Fly  1865 QKVNGGDVSIELNSSNGSPTPAAVPATKKPLDCNSAECVPKKSSSLETAERKNRRMTAYDENRKQ 1929
                                      .:|.||.|.   ||:||.:.|:..|||||::.:||.|:.
  Fly  1926 --------------------------PRKSLDRNP---VPRKSITFESEIRKNRRISVHDERRQS 1961

  Fly  1930 F 1930
            :
  Fly  1962 Y 1962

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
canaNP_001027247.1 KISc 8..316 CDD:214526 256/318 (81%)
Motor_domain 8..310 CDD:277568 251/312 (80%)
SMC_prok_B <471..1270 CDD:274008 372/911 (41%)
Mplasa_alph_rch 924..1647 CDD:275316 323/845 (38%)
CENP-H 1204..>1266 CDD:283493 33/97 (34%)
CALCOCO1 <1489..1850 CDD:285171 121/371 (33%)
cmetNP_524993.3 KISc 8..328 CDD:214526 257/319 (81%)
Motor_domain 8..321 CDD:277568 251/312 (80%)
Smc <680..1449 CDD:224117 315/782 (40%)
TMPIT 779..>867 CDD:285135 36/87 (41%)
Smc 1042..1910 CDD:224117 356/1005 (35%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C45438277
Domainoid 1 1.000 287 1.000 Domainoid score I372
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG0242
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 349 1.000 Inparanoid score I619
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG53505
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000669
OrthoInspector 1 1.000 - - otm26081
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101662
Panther 1 1.100 - - P PTHR47968
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X5166
1110.800

Return to query results.
Submit another query.